趙家更,曾慶云,祝木星
(山東中醫(yī)藥大學(xué),山東濟(jì)南 250355)
川芎-延胡索藥對(duì)選自曹貽訓(xùn)名老中醫(yī)治療腰椎間盤(pán)突出癥的經(jīng)典驗(yàn)方“腎痹湯”,在曹老多年治療腰椎間盤(pán)突出的過(guò)程當(dāng)中,發(fā)現(xiàn)其對(duì)腰椎間盤(pán)突出癥的療效顯著。方中延胡索能夠活血、行氣、止痛,川芎則在此基礎(chǔ)上具有祛風(fēng)除濕之效?,F(xiàn)代科學(xué)研究表明,川芎主要由揮發(fā)性油類、苯酞內(nèi)酯、有機(jī)酚酸和板栗多糖等物質(zhì)所構(gòu)成;到目前為止,川芎中共記載有149個(gè)化合物,其已報(bào)道的生物學(xué)活性主要涉及對(duì)心血管疾病的療效、作用于中樞神經(jīng)系統(tǒng)的抗炎和抗氧化等功能,對(duì)細(xì)胞發(fā)炎因子和凋亡因子的控制也是川芎中表達(dá)這些生物學(xué)活性物質(zhì)的主要機(jī)制[1]。延胡索所具有的各種化學(xué)成份在中樞神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)、消化吸收網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)、人體心血管網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)和垂體腎上腺皮層網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)中均能形成影響,從而起到鎮(zhèn)定、抗緊張、催眠現(xiàn)象、止痛、抗心律失常、耐潰瘍、抗缺氧性心肌等功效[2]。傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)中,藥物的配伍一般遵循君臣佐使等觀念,而現(xiàn)代藥理研究多關(guān)注于單個(gè)藥物或單個(gè)成分對(duì)于相關(guān)疾病或靶點(diǎn)的作用。本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)多層次、多角度網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的特點(diǎn),通過(guò)分析川芎-延胡索藥對(duì)的有效成分和藥效靶點(diǎn),進(jìn)一步篩選并進(jìn)行富集分析,為臨床研究和應(yīng)用提供相關(guān)依據(jù)。
1.1 化學(xué)成分的獲取與篩選 在TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)(中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)數(shù)據(jù)庫(kù),Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/tcmspsearch.php)中輸入川芎、北紫堇等進(jìn)行檢索,并以生物有效利用量(OB)≥30%和類藥性(DL)≥0.18的條件,篩選出潛在的生物活性成份。
1.2 潛在有效成分對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)的獲取與整理 從TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)一步檢測(cè)出川芎、北紫堇等潛在有效成分及其所對(duì)應(yīng)的靶位,并于Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)(http://lsp.nwu.edu.cn/tcm-spsearch.php)中找到對(duì)應(yīng)的人類基因,將其導(dǎo)出至Excel以備后續(xù)進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。
1.3 腰椎間盤(pán)突出癥靶點(diǎn)獲取 登錄GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.genecards.org/),并以Lumbar Disc Herniation、Lumbar Disc Protrusion、Lumbar Intervertebral Disc Protrusion和Prolapse of Lumbar Intervertebral Disc等關(guān)鍵詞進(jìn)行搜索,以獲取有關(guān)腰椎間盤(pán)突出癥的各種關(guān)鍵靶點(diǎn)信息,并導(dǎo)出至Excel中,為后期數(shù)據(jù)處理做好準(zhǔn)備。
1.4 繪制韋恩圖并獲取交集靶點(diǎn) 運(yùn)用Venny網(wǎng)站,通過(guò)上傳川芎、北紫堇藥物相對(duì)的相互作用靶位和腰椎間盤(pán)突出癥的相關(guān)靶位,完成韋恩圖的描繪并獲得藥物和患者的交集靶位。
1.5 藥物-成分-疾病-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 通過(guò)Cytoscape軟件對(duì)收集到的藥品潛在活性成份和藥品與患者的交叉靶位進(jìn)行分類處理,形成藥品-成分-病變-靶點(diǎn)系絡(luò)圖。
1.6 富集分析利用David數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)(https://David.ncifcrf.gov/)對(duì)交集靶基因?qū)崿F(xiàn)go解析和KEGG解析。
2.1 潛在有效成分篩選結(jié)果 利用TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行搜索,并在以生物有效利用量(OB)≥30%和類藥性(DL)≥0.18的條件下進(jìn)行篩選,川芎的化學(xué)成分組成中有7個(gè)潛在有效成分,延胡索有49個(gè)潛在有效成分,其中谷甾醇(sitosterol)是二者中共同的重復(fù)成份,故總共得到了55個(gè)潛在活性成份,即谷甾醇、槲皮素、大豆甾醇、黃連素、延胡索堿等,詳見(jiàn)表1。
表1 川芎-延胡索藥對(duì)的潛在有效成分
續(xù)表
2.2 藥物、疾病交集靶點(diǎn)篩選 在TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中共發(fā)現(xiàn)與川芎、北紫堇等潛在活性成份對(duì)應(yīng)的靶位共858個(gè),將上述靶位信息輸入U(xiǎn)niprot數(shù)據(jù)庫(kù)中可以找到相應(yīng)的人類基因;從GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)中,搜索得到的腰椎間盤(pán)突出癥相關(guān)靶位共396個(gè),在利用Venny網(wǎng)站進(jìn)行大數(shù)據(jù)分析之后,得出藥物與病變所共同的靶位共46個(gè),并進(jìn)行韋恩圖的繪制,見(jiàn)圖1。
圖1 藥物-疾病靶點(diǎn)韋恩圖
2.3 藥物-成分-疾病-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖繪制 將藥品活性成份和靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)信息輸入Cytoscape軟件,得到構(gòu)成藥品-成份-病情-靶點(diǎn)的網(wǎng)路圖,見(jiàn)圖2。圖中節(jié)點(diǎn)分為病癥、藥品、藥品成份、靶位,連線說(shuō)明了病癥、藥品、藥品成份和靶位之間所存在的交叉關(guān)聯(lián)(其中紅色六邊形代表病癥,綠色六邊形代表藥品,藍(lán)色六邊形代表藥品成份,黃色圓圈代表交集靶點(diǎn))。此圖可以明確顯示川芎-延胡索藥對(duì)通過(guò)多種成分、多種靶點(diǎn)對(duì)腰椎間盤(pán)突出癥發(fā)揮治療作用,其中度值(Degree值及節(jié)點(diǎn)連線數(shù)量)最高的5種成分為:槲皮素、二氫血根堿、荷包牡丹堿、13-甲基棕櫚酸酯、Izoteolin,說(shuō)明這些成分為川芎-延胡索藥對(duì)治療腰椎間盤(pán)突出癥的主要成分。
圖2 藥物-疾病-活性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖
2.4 GO分析 將藥物與疾病交集靶點(diǎn)的相關(guān)數(shù)據(jù)導(dǎo)入David數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行富集分析,以P Value≤0.05為條件篩選出靠前的分子功能、生物學(xué)過(guò)程及細(xì)胞組分,繪制成柱形圖,見(jiàn)圖3~圖5。其中BP分析(圖3)排名靠前的有核糖核酸聚合酶ii啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄正調(diào)控(positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter,18個(gè)靶點(diǎn),39.13%)、信號(hào)傳導(dǎo)(signal transduction,15個(gè)靶點(diǎn),32.61%)、基因表達(dá)的正向調(diào)節(jié)(positive regulation of gene expression,13個(gè)靶點(diǎn),28.26%)、炎癥應(yīng)答(inflammatory response,13個(gè)靶點(diǎn),28.26%)、細(xì)胞增殖的負(fù)調(diào)節(jié)(negative regulation of cell proliferation,13個(gè)靶點(diǎn),28.26%)等生物學(xué)過(guò)程。MF分析(圖4)排名靠前的有蛋白活性(cytokine activity,39個(gè)靶點(diǎn),84.78%)、酶 結(jié) 合(enzyme binding,10個(gè) 靶 點(diǎn),21.74%)、蛋 白 結(jié) 合(protein binding,10個(gè) 靶 點(diǎn),21.74%)、細(xì)胞因子活性(cytokine activity,9個(gè)靶點(diǎn),19.57%)、絲氨酸型內(nèi)肽酶活性(7個(gè)靶點(diǎn),15.22%)等分子功能。CC分析(圖5)中排名靠前的有細(xì)胞外空間(extracellular space,26個(gè)靶點(diǎn),56.52%)、細(xì)胞外區(qū)域(extracellular region,22個(gè)靶點(diǎn),47.82%)、細(xì)胞溶質(zhì)(cytosol,19個(gè)靶點(diǎn),41.30%)、質(zhì)膜(plasma membrane,17個(gè)靶點(diǎn),36.96%)、細(xì)胞外外體(extracellular exosome,13個(gè)靶點(diǎn),28.26%)等細(xì)胞組分。
圖3 GO分析生物學(xué)過(guò)程
圖4 GO分析分子功能
圖5 GO分析細(xì)胞組分
2.5 KEGG通路分析 使用David數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)川芎-延胡索藥對(duì)與腰椎間盤(pán)突出癥的46個(gè)交集靶點(diǎn)進(jìn)行分析,得到P Value≤0.05的通路共84個(gè),篩選其P Value最小的10條通路制成表格,見(jiàn)表2。結(jié)果顯示,川芎-延胡索藥對(duì)治療腰椎間盤(pán)突出癥的機(jī)制主要涉及腫瘤壞死因子信號(hào)通路(TNF signaling pathway)、恰加斯?。–hagas disease)、癌癥通路(pathways in cancer)、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(rheumatoid arthritis)、百日咳(pertussis)、膀胱癌(bladder cancer)、缺氧誘導(dǎo)因子-1信號(hào)通路(HIF-1 signaling pathway)、利什曼病(Leishmaniasis)、甲型流感(influenza A)、Toll樣受體信號(hào)通路(Toll-like receptor signaling pathway)等通路。因此,推測(cè)川芎-延胡索藥對(duì)治療腰椎間盤(pán)突出癥可能與上述通路關(guān)系密切。
表2 P Value最小的10條通路
腰椎間盤(pán)突出癥是脊柱外科的常見(jiàn)病之一,近年久坐、缺乏鍛煉已成為現(xiàn)代人普遍的行為習(xí)慣,這也導(dǎo)致了腰椎間盤(pán)突出癥發(fā)病率日益增長(zhǎng),患病年齡也在不斷減小。腰椎間盤(pán)突出癥主要表現(xiàn)為腰痛、下肢麻木及放射痛、肌力下降、活動(dòng)受限、感覺(jué)減退等,中醫(yī)學(xué)將其歸為“腰腿痛”范疇,主要治療大法為活血化瘀、行氣止痛、祛風(fēng)散寒、補(bǔ)益肝腎等。腎痹湯是曹貽訓(xùn)名老中醫(yī)的經(jīng)典驗(yàn)方,由芥子、獨(dú)活、三七、川芎、延胡索、白術(shù)、穿山龍、黃芪、黨參、全蝎、地龍、桂枝、茯苓、牛膝、丹參、當(dāng)歸、白芍、赤芍、續(xù)斷、杜仲、槲寄生、巴戟天、狗脊、葛根、木瓜、甘草等26味中藥組成。方中川芎、延胡索配伍發(fā)揮活血行氣、散瘀止痛的功效,在多年的臨床用藥中,通過(guò)加減化裁應(yīng)對(duì)不同腰椎間盤(pán)突出癥病例,配合其他藥物及鍛煉,在保守治療過(guò)程中療效顯著,但川芎-延胡索藥對(duì)治療腰椎間盤(pán)突出癥的作用機(jī)制尚不明確。
本研究通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,從川芎-延胡索藥對(duì)中檢索出55個(gè)有效成分,對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)858個(gè),其中與腰椎間盤(pán)突出癥致病靶點(diǎn)重合者共46個(gè)。在Cytoscape軟件構(gòu)成的藥物-成分-疾病-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖中,共有101個(gè)節(jié)點(diǎn)、301個(gè)邊,證明川芎-延胡索從多個(gè)靶點(diǎn)、利用多種成分對(duì)腰椎間盤(pán)突出癥進(jìn)行治療。延胡索中的槲皮素作用于40個(gè)靶點(diǎn),在所有成分中排名第一。槲皮素是一種天然的黃酮類物質(zhì),具有抗腫瘤、抗氧化、抗感染、免疫抑制、心血管保護(hù)和血糖調(diào)節(jié)等多種藥理作用[3]。王業(yè)楊等[4]研究表明,槲皮素可以抑制TLR4/NF-κB信號(hào)通路介導(dǎo)的炎癥反應(yīng)和細(xì)胞凋亡從而減輕脊髓損傷。盧桃利等[5]研究表明,槲皮素可以促進(jìn)小鼠脊髓損傷后巨噬細(xì)胞表型由M1向M2表型轉(zhuǎn)變,抑制炎性因子的表達(dá),對(duì)炎性反應(yīng)的調(diào)控是其發(fā)揮神經(jīng)保護(hù)作用的可能機(jī)制之一。二氫血根堿存在于多種植物的提取物中,具有廣泛的藥理作用。張乙濤等[6]研究表明,血根堿(sanguinarine)作為一種苯菲啶異喹啉類生物堿,具有抗菌、抗炎、抗氧化、抗腫瘤、改善肝功能及誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡等作用。馬寧寧等[7]研究表明,二氫血根堿通過(guò)作用于ERK2、IKKβ、JAK1、PKC,影響下游蛋白表達(dá),阻礙抗炎信號(hào)的傳遞,從而發(fā)揮抗炎作用。荷包牡丹堿,別名山烏龜堿,具有陣痛、鎮(zhèn)靜等功效。郭錳等[8]研究表明,荷包牡丹堿可以抑制人肝癌MHCC97-H細(xì)胞的轉(zhuǎn)移及侵襲,該作用與下調(diào)VEGF、MMP-2、MMP-9基因表達(dá)及抑制JAK2/STAT3信號(hào)通路的活化有關(guān)。汪詩(shī)卉等[9]研究表明,荷包牡丹堿在體外對(duì)胃癌細(xì)胞的增殖與生長(zhǎng)具有抑制作用,可促進(jìn)其凋亡,其作用可能與Bcl-2/Bax降低導(dǎo)致Caspase-3活化有關(guān)。劉巖等[10]研究表明,荷包牡丹堿能有效抑制人肺腺癌細(xì)胞A549的生長(zhǎng),使細(xì)胞周期阻滯在S期,進(jìn)一步誘導(dǎo)其凋亡,并使caspase-3蛋白活化。由此可見(jiàn),川芎-延胡索藥對(duì)中的槲皮素、二氫血根堿、荷包牡丹堿等有效成分,具有抗炎、抗氧化、改善肝功能、抗腫瘤等功效,可能是治療LDH的有效成分。
從藥物-疾病-活性成分-靶點(diǎn)圖上可知,前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、μ型阿片受體(OPRM1)、雄激素受體(AR)、鈉依賴性血清素轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(SLC6A4)、雌激素受體蛋白(ESR1)、誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(NOS2)、乙酰膽堿酯酶(ACHE)、絲裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、縫隙連接α-1蛋白(GJA1)、原癌基因c-Fos(FOS)等可能是川芎-延胡索治療LDH的主要靶蛋白。GO富集分析得出,川芎-延胡索藥對(duì)治療腰椎間盤(pán)突出癥主要涉及核糖核酸聚合酶ⅱ啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄正調(diào)控、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因表達(dá)的正向調(diào)節(jié)、炎癥應(yīng)答、細(xì)胞增殖的負(fù)調(diào)節(jié)、凋亡過(guò)程的負(fù)調(diào)控、轉(zhuǎn)錄的正向調(diào)節(jié),DNA模板、血管生成、一氧化氮生物合成過(guò)程的正向調(diào)節(jié)、對(duì)脂多糖的細(xì)胞反應(yīng)等生物學(xué)過(guò)程;涉及蛋白質(zhì)異二聚活性、受體結(jié)合、蛋白質(zhì)同二聚活性、染色質(zhì)結(jié)合、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、絲氨酸內(nèi)肽酶活性、細(xì)胞因子活性、相同蛋白質(zhì)結(jié)合、酶結(jié)合、蛋白結(jié)合等分子功能;涉及細(xì)胞外空間、細(xì)胞外區(qū)域、細(xì)胞溶質(zhì)、質(zhì)膜、細(xì)胞外外體、線粒體、薄膜筏、細(xì)胞表面、細(xì)胞質(zhì)核周區(qū)、神經(jīng)元投射等細(xì)胞組分,其過(guò)程較為復(fù)雜。
經(jīng)過(guò)KEGG富集分析得出,被明顯富集的信號(hào)通路共有10條。其中腫瘤壞死因子信號(hào)通路(TNF signaling pathway)可誘導(dǎo)多種細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳導(dǎo),包括凋亡、細(xì)胞存活、炎癥和免疫。黃蓓等[11]研究發(fā)現(xiàn),TNF信號(hào)通路中的TNF-α不僅可以使其信號(hào)通路發(fā)生異常,還可以與其他促炎性細(xì)胞因子刺激破骨細(xì)胞分化和活化,而引起骨丟失,刺激滑膜成纖維細(xì)胞和軟骨細(xì)胞產(chǎn)生降解軟骨的蛋白酶,最終導(dǎo)致關(guān)節(jié)和軟骨的破壞。張丹等[12]研究發(fā)現(xiàn),HIF-1在成血管-成骨耦連反應(yīng)中發(fā)揮關(guān)鍵作用,作為上游基因調(diào)控著體內(nèi)多種成血管、成骨基因的表達(dá),促進(jìn)血管形成的同時(shí),協(xié)同促進(jìn)骨的再生。劉莉菲等[13]研究發(fā)現(xiàn),HIF-1α通過(guò)直接調(diào)節(jié)多種骨組織細(xì)胞、促進(jìn)骨血管生成、改變糖酵解途徑等方式對(duì)骨組織的生長(zhǎng)和重塑過(guò)程進(jìn)行調(diào)控,從而對(duì)骨相關(guān)腫瘤、股骨頭壞死、HO等病理過(guò)程產(chǎn)生重要影響。此外,癌癥、恰加斯病、甲型流感等信號(hào)通路也富集了較多的基因,因此推斷川芎-延胡索藥對(duì)可能通過(guò)以上信號(hào)通路發(fā)揮治療腰椎間盤(pán)突出癥的作用。
綜上所述,川芎-延胡索在治療腰椎間盤(pán)突出癥上具有多成分、多靶點(diǎn)、多途徑的特點(diǎn)。本研究通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法初步預(yù)測(cè)了川芎-延胡索治療LDH的核心靶點(diǎn),以期為進(jìn)一步的分子生物學(xué)和藥理學(xué)研究提供理論基礎(chǔ)。