肖貞林
早在20世紀(jì)七八十年代就曾有人預(yù)言,21世紀(jì)是屬于生命科學(xué)的世紀(jì),誰掌握了生命科學(xué),誰就主宰了人類的未來命運。這句話引領(lǐng)著無數(shù)英才走上了探索人類基因密碼的科研道路,40歲的南京大學(xué)教授、博士生導(dǎo)師陳熹正是其中之一。
歷經(jīng)18年系統(tǒng)性研究,陳熹及其導(dǎo)師張辰宇教授以微小核糖核酸(microRNA,簡稱miRNA)特別是細胞外miRNA為研究對象,破解了生命科學(xué)領(lǐng)域的一個又一個前沿難題。他發(fā)現(xiàn)了miRNA在細胞外的“超穩(wěn)定性”,通過鑒定一系列重大疾病的循環(huán)miRNA指紋圖譜,為許多臨床上長期以來的診斷難題提供了新的解決方案。一系列的成果不僅揭示了循環(huán)miRNA的特異性變化模式和高度穩(wěn)定性,也確立了循環(huán)miRNA作為新型疾病標(biāo)志物的應(yīng)用價值。近5年來,他通過探索miRNA穩(wěn)定的分子基礎(chǔ)及其跨越空間平行傳遞的分子機制,致力于發(fā)展基于miRNA超穩(wěn)定性的分子診斷技術(shù)方法和疾病治療新策略。
作為南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院年輕教授、博師生導(dǎo)師中的佼佼者,陳熹沿承其導(dǎo)師張辰宇教授的“科研育人”理念和“科研報國”精神,致力于為國家培養(yǎng)生命科學(xué)領(lǐng)域的高層次創(chuàng)新人才。他說,在關(guān)鍵時刻響應(yīng)國家的召喚,是生命科學(xué)研究者的使命所在。
早在高中時期,陳熹就喜歡從書本上獲取關(guān)于生命科學(xué)的知識,甚至動手研究、實驗關(guān)于生物學(xué)的一些奇妙現(xiàn)象?!?1世紀(jì)是生物科學(xué)的世紀(jì)”成為他心中很早就樹立的信念,冥冥之中引導(dǎo)他走上生命科學(xué)的探究之路。由于成績優(yōu)異,他如愿以償?shù)乜既肓藝鴥?nèi)生物化學(xué)學(xué)科排名前列的南京大學(xué)。進入南京大學(xué)后,陳熹對生物學(xué)的熱愛更是一發(fā)不可收,本科、碩士、博士……陳熹不斷向前攀登。十年求學(xué)生涯,讓他的命運與生命科學(xué)緊密地聯(lián)系在一起。
陳熹和其指導(dǎo)的本科生在2013年獲得國際遺傳工程機器大賽(iGEM)金牌
從2004年開始的碩士、博士研究生階段,包括此后從事教學(xué)和科研的十多年時間里,陳熹一直專注研究的領(lǐng)域是一項注定要打破傳統(tǒng)認知意義的基礎(chǔ)研究——揭秘RNA分子的基因密碼。
在生物科學(xué)經(jīng)典的中心法則中,DNA是遺傳信息的載體,蛋白質(zhì)行使具體功能,RNA的作用僅僅是DNA到蛋白質(zhì)之間的媒介。但隨著近代生物學(xué)的發(fā)展,到21世紀(jì)初,人們對RNA在生命進程中扮演的角色重新進行了定義,發(fā)現(xiàn)人體內(nèi)存在數(shù)量龐大、功能繁復(fù)的非編碼RNA分子。這些RNA分子廣泛參與生物學(xué)過程的調(diào)控與調(diào)節(jié),發(fā)揮著不可或缺的功能和作用。作為RNA家族的其中一員,miRNA是一種長約22個核苷酸的小分子單鏈非編碼RNA,在轉(zhuǎn)錄后水平對基因表達進行調(diào)控,廣泛參與機體的各種生理和病理過程。
在導(dǎo)師張辰宇教授帶領(lǐng)下,陳熹成為國內(nèi)最早的miRNA分子研究者之一,整個研究生階段,他不分寒暑地泡在實驗室里,長期研究細胞內(nèi)miRNA的生物學(xué)功能。
不鳴則已,一鳴驚人。陳熹在miRNA研究領(lǐng)域堅持不懈的努力最終沒有白費。經(jīng)過多年努力,他開發(fā)出了miRNA的檢測分析新技術(shù)和功能鑒定新方法,搭建了系統(tǒng)研究miRNA的實驗平臺,進而陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了一系列miRNA及其靶基因構(gòu)成的分子調(diào)控通路,這在一定程度上揭示了miRNA在生理和病理過程中的功能及作用機制。博士畢業(yè)前,陳熹陸續(xù)在《生物化學(xué)雜志》(J Biol Chem)、《基因組生物學(xué)》(Genome Biol)、《癌基因》(Oncogene)等期刊發(fā)表論文。
不斷取得的創(chuàng)新成果,讓陳熹與諸多國際同行一道,站在了更多前沿課題的面前。這些研究經(jīng)驗的積累和實驗技術(shù)的磨煉,為此后發(fā)現(xiàn)細胞外miRNA的超穩(wěn)定性打下了堅實基礎(chǔ)。
傳統(tǒng)生化概念認為,RNA會被細胞外廣泛存在的RNA酶迅速降解成無功能的碎片。學(xué)術(shù)界普遍認定RNA是不穩(wěn)定的,也不可能在充滿RNA酶的細胞外環(huán)境存在,學(xué)術(shù)界的研究也多聚焦于細胞內(nèi)的RNA及其作用。
陳熹打破了這一傳統(tǒng)認知。他通過細致分析正常人和腫瘤、糖尿病患者的血清miRNA表達譜,發(fā)現(xiàn)血清中的循環(huán)miRNA在疾病狀態(tài)下出現(xiàn)特異性變化,其組合能反映患者疾病的特征和發(fā)展階段。這項研究突破了“RNA在細胞外環(huán)境不穩(wěn)定、易降解”的傳統(tǒng)概念,揭示了循環(huán)miRNA作為新型疾病標(biāo)志物的應(yīng)用潛力?!斑@意味著,通過檢測血漿、血清中的miRNA就可以診斷疾病,或?qū)υ\療效果進行評估?!标愳湔f。
2008年,此成果發(fā)表在《細胞研究》(Cell Research)上,研究領(lǐng)域內(nèi)的權(quán)威弗蘭克·斯萊克(Frank Slack)教授同步在期刊中做了專題評述,指出“血清miRNA有望作為不同疾病的檢測印記,具有巨大的臨床應(yīng)用價值”。國際學(xué)術(shù)界也紛紛給予高度評價,《自然綜述:藥物發(fā)現(xiàn)》(Nature Reviews Drug Discovery)發(fā)表的綜述重點引用和評價了這一發(fā)現(xiàn),認為“循環(huán)miRNA之所以能成為生物標(biāo)志物,主要依賴于其高度的穩(wěn)定性,以及對于儲存和操作過程中可能損害的抗性,因此循環(huán)miRNA可以為多種疾病提供分子指紋”?!蹲匀痪C述:臨床腫瘤學(xué)》(Nature Reviews Clinical Oncology)的綜述則認為,陳熹的研究成果“是一項系統(tǒng)而全面的研究,其結(jié)果提示腫瘤特異的血清miRNA不僅僅來源于血細胞,也來自于癌細胞”。
在此之后的多年里,這篇論文被他引3296次,連續(xù)10年入選ESI全球Top1%高被引論文,并被寫入牛津大學(xué)出版社系列教科書、科學(xué)出版社《基因組學(xué)》等國內(nèi)外教科書。
檢驗基礎(chǔ)科學(xué)研究的最好方式,是成果的轉(zhuǎn)化應(yīng)用。在傳統(tǒng)生物技術(shù)的基礎(chǔ)上,陳熹建立了標(biāo)準(zhǔn)化、規(guī)范化的循環(huán)miRNA檢測策略。這一策略克服了低豐度的循環(huán)miRNA難提取、難鑒定、難檢測、難定量的技術(shù)問題。他發(fā)現(xiàn),miRNA可以廣泛分布于血清、血漿、乳汁、精漿等多種體液,據(jù)此鑒定了一系列重大疾病的循環(huán)miRNA表達譜,并發(fā)現(xiàn)循環(huán)miRNA分子指紋比傳統(tǒng)蛋白標(biāo)志物更加靈敏、特異。
在一系列成果的支撐下,陳熹還參與研制了國際首例以血清miRNA為生物標(biāo)志物的產(chǎn)品——胰腺癌血清miRNA診斷試劑盒,臨床試驗顯示準(zhǔn)確率達88%,獲得了國家三類醫(yī)療器械注冊證,相關(guān)成果“血清miRNA生物標(biāo)志物的鑒定及診斷試劑盒研發(fā)”獲高等學(xué)??茖W(xué)研究優(yōu)秀成果獎技術(shù)發(fā)明獎一等獎。作為負責(zé)人,陳熹主導(dǎo)的項目“胃癌血清miRNA早期精準(zhǔn)診斷技術(shù)”也獲得了中國江蘇創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽一等獎。
在基礎(chǔ)研究方向,陳熹圍繞著循環(huán)miRNA的穩(wěn)定機制和生物功能等問題進一步展開研究,發(fā)現(xiàn)了血液循環(huán)中的miRNA主要存在于細胞外囊泡中,這些囊泡隔絕了RNA酶對miRNA的不利作用,使細胞分泌的miRNA在體內(nèi)穩(wěn)定循環(huán);同時,細胞外囊泡包裹的miRNA能進入靶細胞調(diào)控靶細胞功能,因此分泌miRNA成為一種新型的介導(dǎo)細胞間通信交流的媒介。
在研究過程中,一個重要疑問擺在了陳熹面前:既然miRNA具有超穩(wěn)定性,能夠跨越細胞屏障在機體內(nèi)傳輸,這是否意味著,miRNA的作用范疇能夠更進一步跨越代際的隔閡發(fā)揮表觀遺傳調(diào)控作用?假如這一設(shè)想成立,生殖細胞內(nèi)的miRNA可能就成為基本的“代際表觀遺傳因子”,其可能介導(dǎo)了表觀遺傳信息的存儲、傳遞和轉(zhuǎn)化,調(diào)控了親本和子代之間的遺傳信息交流。
“代際表觀遺傳”是指在不改變DNA序列的前提下將某種遺傳性狀由一代傳遞到下一代的現(xiàn)象。隨著遺傳學(xué)研究領(lǐng)域的發(fā)展,“以DNA為遺傳信息載體”的經(jīng)典遺傳學(xué)并不能全面地闡釋所觀察到的遺傳學(xué)現(xiàn)象。作為遺傳學(xué)研究的新興領(lǐng)域,代際表觀遺傳越來越受到研究者的重視。
陳熹和團隊著眼于抑郁癥等性狀的代際遺傳,以小鼠為模型,結(jié)合遺傳學(xué)、發(fā)育生物學(xué)、分子生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、生物信息學(xué)等領(lǐng)域的研究手段,以生殖細胞內(nèi)miRNA對子代表型的調(diào)控作用為研究切入點,探索生殖細胞內(nèi)miRNA響應(yīng)環(huán)境刺激和介導(dǎo)代際表觀遺傳的分子機制和作用機理。他們發(fā)現(xiàn)精子miRNA是一種新的“遺傳物質(zhì)”,介導(dǎo)了抑郁相關(guān)表型的代際遺傳,論文于2021年發(fā)表于《科學(xué)進展》(Science Advances);發(fā)現(xiàn)高齡雄鼠精子中的miRNA通過引發(fā)早期胚胎雌二醇信號通路功能紊亂導(dǎo)致子代出現(xiàn)焦慮和社交障礙等精神癥狀表型,論文于2022年發(fā)表于《細胞發(fā)現(xiàn)》(Cell Discovery)。
“未來,我們將繼續(xù)探索miRNA或其他類型小RNA在腫瘤、肥胖、藥物成癮等性狀的代際傳遞中的作用。”陳熹說。在陳熹看來,研究生殖細胞miRNA介導(dǎo)的代際表觀遺傳,不僅是基礎(chǔ)研究領(lǐng)域的重要探索,也具有重大的臨床應(yīng)用價值,將為理解親代表型的遺傳現(xiàn)象提供新的視角,為闡釋疾病性狀的遺傳規(guī)律提供新的思路,并有潛能在未來產(chǎn)生新的藥物作用靶點和新的治療方式。
南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院歷史悠久,生物系建系已有百年,生化分子專業(yè)也在全國領(lǐng)先于其他高校開設(shè),是全國重點院系、學(xué)科。基于南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院的優(yōu)良傳統(tǒng)和學(xué)科優(yōu)勢,陳熹在科研上得到了扎實的訓(xùn)練。近年來,除了申報國家、省市的各類科研項目外,他和研究團隊也得到了學(xué)校在經(jīng)費、設(shè)備等方面的支持和資助。
作為張辰宇教授全職回國后的第一批學(xué)生,目前擔(dān)任生物化學(xué)與分子生物學(xué)系主任的陳熹在科研上深得導(dǎo)師“真?zhèn)鳌?,在科研精神和教學(xué)思維上也深受導(dǎo)師的熏陶,既要“科研育人”,也要“立德樹人”?!皬乃砩细惺茏钌畹氖?,基于自己在研究領(lǐng)域深入探索和思考下的‘大膽猜想’,往往就是科研取得突破創(chuàng)新的重要起點。”陳熹說。
沿承導(dǎo)師的理念,陳熹在教學(xué)中注重因材施教,致力于引導(dǎo)學(xué)生養(yǎng)成勇于創(chuàng)新、大膽猜想、不懈探索、嚴(yán)謹(jǐn)求實的科學(xué)精神與學(xué)術(shù)修養(yǎng),鍛煉學(xué)生提出問題、分析問題和解決問題的能力?!耙鶕?jù)學(xué)生的自身特點和知識結(jié)構(gòu),設(shè)計針對性的課題,以確保每一名研究生都能發(fā)揮出最大潛能,并學(xué)有所成?!蓖瑫r,在日常教學(xué)中,他不忘時時促進學(xué)生感知學(xué)習(xí)和科研過程的深層次意義,助其樹立長遠的科研觀和人生觀,保持持久的創(chuàng)新熱情。
為了打破原來傳統(tǒng)的偏重講授的“填鴨式”教學(xué)方式,陳熹在自己開設(shè)的“微小核糖核酸的功能及應(yīng)用”本科課程中,以講述miRNA領(lǐng)域的最新發(fā)現(xiàn)為主,穿插一些實驗技術(shù)的培訓(xùn)及優(yōu)秀論文評述,開闊學(xué)生的思路和眼界。因教學(xué)工作成效突出,陳熹獲得了2020年度南京大學(xué)“魅力導(dǎo)師”獎。
導(dǎo)師張辰宇是歸國科學(xué)家,有著強烈的科研報國情懷,受到導(dǎo)師的影響,陳熹同樣身懷“報國夢”。2020年春節(jié)前夕,新冠肺炎疫情暴發(fā),陳熹和實驗室團隊人員響應(yīng)號召,立刻回到崗位上,為疫情防控貢獻科研力量。團隊融合多年在miRNA領(lǐng)域中的研究成果,與新冠肺炎病患診治相結(jié)合。他們研究發(fā)現(xiàn),通過檢測新冠肺炎患者血清中的病毒miRNA,可以提前預(yù)判重癥的發(fā)生;以及發(fā)現(xiàn)中藥金銀花湯劑中穩(wěn)定存在的一類特殊的miRNA分子,可以對抗新冠病毒。這些研究成果被成功地用于臨床治療,并被評為“2020年中醫(yī)藥十大科技進展”之一。“關(guān)鍵時刻等待國家的召喚、響應(yīng)國家的召喚,是作為中國生命科學(xué)研究者的使命?!标愳湔f。