韓蕾 李俊林 高愛(ài)平 黃建峰 李建召 宋志忠,,4
(1.魯東大學(xué)農(nóng)林工程研究院 山東省高校作物高產(chǎn)抗逆分子模塊育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,煙臺(tái) 264025;2.中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物品種資源研究所,???571100;3.南京林業(yè)大學(xué)林學(xué)院,南京 210037;4.劍橋大學(xué)植物系,劍橋,英國(guó) CB2 3EA)
鉀(K+)在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中占有重要地位,土壤缺鉀制約作物產(chǎn)量和品質(zhì),如何提高作物鉀素營(yíng)養(yǎng)高效利用是亟待解決和攻關(guān)的關(guān)鍵科學(xué)問(wèn)題。果樹(shù)栽培中,控釋鉀肥能有效促進(jìn)花的開(kāi)放,改善果實(shí)品質(zhì)和產(chǎn)量,增強(qiáng)采后貯藏性能[1-4],相關(guān)研究集中在生理生化層面,而果樹(shù)鉀素營(yíng)養(yǎng)高效與利用的分子機(jī)制尚不清楚。植物中,Shaker類K+通道介導(dǎo)K+吸收、地上部長(zhǎng)距離運(yùn)輸、分配和動(dòng)態(tài)平衡,在植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要功能[2,5-10]。然而,該家族通道功能研究集中在一年生模式作物,果樹(shù)中Shaker類K+通道的生物學(xué)功能依然未知。因此,研究果樹(shù)Shaker類K+通道的生物學(xué)功能,聚焦果樹(shù)研究前沿,具有重要的科學(xué)意義。
Shaker類型K+通道于1992年首次在擬南芥中報(bào)道,隨后陸續(xù)在不同植物中鑒定了30多個(gè)Shaker類型K+通道[11-12]。模式作物擬南芥中Shaker類型K+通道研究最為透徹,目前至少鑒定了9個(gè)Shaker類型K+通道,包括內(nèi)向整流型(AtKAT1、AtKAT2、AtAKT1、AtAKT5和AtSPIK)、外向整流型(AtSKOR和AtGORK)、弱整流型AtAKT2和調(diào)節(jié)組件類型AtKC1[11-17]。其中AtSPIK主要在擬南芥花粉中表達(dá),電生理功能研究證實(shí)其為內(nèi)向整流型K+通道,在花粉萌發(fā)和花粉管形成中發(fā)揮作用,并通過(guò)SnRK1復(fù)合物調(diào)控進(jìn)而參與柱頭上花粉的干燥過(guò)程[14,17]。AtSKOR主要在擬南芥根中表達(dá),介導(dǎo)韌皮部K+分泌至木質(zhì)部并經(jīng)由“根-莖”的長(zhǎng)距離運(yùn)輸,該基因缺失突變后導(dǎo)致植株地上部K+含量降低約50%,電生理功能研究表明AtSKOR是一個(gè)電壓依賴型的外向整流型K+通道[16]。AtGORK在擬南芥保衛(wèi)細(xì)胞中特異表達(dá),該基因缺失突變后導(dǎo)致氣孔關(guān)閉受抑制,電生理研究表明AtGORK是電壓依賴型的外向整流型K+通道,其通道活性受蛋白激酶CPK33調(diào)節(jié)[13,15]。近年來(lái),國(guó)內(nèi)外學(xué)者在水稻[18]、荒漠植物霸王[19]、甜瓜[20]、山新楊[21]、紫皮柳[22]、沙冬青[23]等植物中陸續(xù)鑒定了Shaker類型K+通道蛋白。然而,果樹(shù)中有關(guān)Shaker類型K+通道的功能研究較少,近期研究表明梨PbrKAT1是一個(gè)內(nèi)向整流型K+通道[7],葡萄ViSKOR是一個(gè)主要在根中表達(dá)的外向整流型K+通道[24]。
杧果(Mangifera indica)是典型的熱帶果樹(shù)之一,其生長(zhǎng)發(fā)育對(duì)K+的需求量較大,特別是花分化過(guò)程中對(duì)K+的依賴性最大[25-26]。然而杧果鉀素營(yíng)養(yǎng)高效與利用的分子基礎(chǔ)尚未見(jiàn)報(bào)道,Shaker類型K+通道的生物學(xué)功能依然未知。
本研究以‘桂熱82’杧果為材料,克隆并鑒定了一個(gè)Shaker類型K+通道基因MiSPIK,分析其表達(dá)模式并初步明確其生物學(xué)功能,為研究杧果Shaker類型K+通道的生物學(xué)功能和熱帶作物鉀素營(yíng)養(yǎng)與高效利用機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。
五年生‘桂熱82’杧果和一年生嫁接幼苗材料均由中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物品種資源研究所提供,野生型擬南芥(Arabidopsis thaliana)Col-0、農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)GV3101菌株和植物表達(dá)載體pHB為魯東大學(xué)農(nóng)林作物遺傳改良中心實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2.1 試驗(yàn)處理 利用一年生‘桂熱82’嫁接幼苗,按照李俊林等[23]和Song等[27]方法,以1/2 MS液體培養(yǎng)基為對(duì)照,進(jìn)行缺鉀、50 mmol/L高鉀脅迫、4℃低溫脅迫、200 mmol/L NaCl和10% PEG處理。
1.2.2 植物總RNA提取和cDNA反轉(zhuǎn)錄 利用RNAiso Plus Kit(TaKaRa,中國(guó)大連)試劑盒提取杧果不同組織材料的總RNA,微量紫外分光光度計(jì)檢測(cè)RNA質(zhì)量和濃度;根據(jù)Primescript 1stStrand cDNA Synthesis Kit(TaKaRa,中國(guó)大連)試劑盒,使用2 μg總RNA作為模板,使用oligo(dT)18作為錨定引物合成第一鏈cDNA。
1.2.3 利用RACE-PCR技術(shù)擴(kuò)增MiSPIK 借鑒Song等[27]方 法 進(jìn) 行 RACE-PCR(rapid amplification of cDNA ends-PCR)克隆目的基因MiSPIK。根據(jù)已報(bào)道植物Shaker類型鉀通道保守區(qū)域,設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物GP1-F和GP1-R(表1),以杧果花朵總RNA反轉(zhuǎn)錄的第一鏈cDNA為模板,擴(kuò)增目的基因的保守區(qū)域序列。測(cè)序驗(yàn)證正確后,分別設(shè)計(jì)用于3′-RACE和5′-RACE的特異性引物GP2-out/in和GP3-out/in(表1), 利 用 SMARTerTMRACE cDNA Amplification Kit(TaKaRa,中國(guó)大連)開(kāi)展 3′-RACE 和 5′-RACE 的巢氏PCR,然后拼接獲得目的基因MiSPIK的完整編碼區(qū)CDS序列;然后設(shè)計(jì)上下游引物,利用高保真酶High-Fidelity PCR(TaKaRa,中國(guó)大連)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物連到pMD19-T(TaKaRa,大連,中國(guó))載體上,送往生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證。
表1 本文所用引物序列Table 1 Primers used in study
1.2.4 生物信息學(xué)特征分析 通過(guò)TMpredict在線工具(http://ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html)預(yù)測(cè)MiSPIK蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域。利用ProtParam在線服務(wù)器(http://expasy.org/tools/protparam.html)分析MiSPIK蛋白的化學(xué)公式、理論等電點(diǎn)(pI)、穩(wěn)定性(instability index,不穩(wěn)定指數(shù)> 40為不穩(wěn)定蛋白),脂肪系數(shù)(aliphatic index,<100為親水蛋白質(zhì))、總平均親水性GRAVY(grand average of hydropathicity,<0為親水蛋白質(zhì))等理化性質(zhì)。運(yùn)用SignalP5.0在線服務(wù)器(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-5.0/)預(yù)測(cè)MiSPIK蛋白的信號(hào)肽情況。利用Phyre2在線軟件(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index)分析MiSPIK蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)。根據(jù)王力敏等[21]和Chen等[22]方法,利用ClustalX 2.0軟件對(duì)杧果、擬南芥、水稻、玉米、高粱、棉花、短柄草、大豆、番茄、黃瓜、桃、梨、葡萄、草莓、蘋(píng)果、番木瓜、克萊門(mén)柚、甜橙、香蕉、鳳梨、白楊、紅皮柳、巨桉和木薯24種已報(bào)道植物Shaker類型K+通道同源蛋白進(jìn)行氨基酸序列比對(duì)[7,21-22,24],利用 MEGA 13.0 中的最大相似法(maximum-likelihood)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),分析遺傳進(jìn)化關(guān)系。
1.2.5 表達(dá)模式分析 分別采集五年生‘桂熱82’杧果一年生新葉(4月1日)、新生韌皮部(4月1日)、新生根(4月1日)、盛開(kāi)期花朵(4月1日,分為花瓣、花粉、花柱和花托)、幼果(5月1日)和成熟果實(shí)(8月1日)等材料,液氮冷凍后用于組織特異性表達(dá)特征分析。分別采集缺鉀、50 mmol/L高鉀脅迫、4℃低溫、200 mmol/L NaCl和10% PEG處理0、6、24和48 h時(shí)的葉片和根部材料,用于轉(zhuǎn)錄水平脅迫響應(yīng)差異分析。
利用NCBI/Primer-BLAST在線服務(wù)器設(shè)計(jì)MiSPIK特異性表達(dá)引物(表1),以杧果MiActin為內(nèi)參基因,利用SYBR Green熒光染料(TaKaRa,大連),通過(guò)ABI 7500實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀分析該基因的表達(dá)模式,反應(yīng)程序?yàn)?5℃ 30 s;95℃5 s,58℃ 30 s,72℃ 30 s,35 個(gè) 循 環(huán) ;72℃ 10 s。在ABI 7500 PCR儀獲得相應(yīng)的Ct值,經(jīng)內(nèi)參基因Actin 均一化處理,采用 2-ΔCt法計(jì)算相對(duì)表達(dá)量[21-24]。試驗(yàn)共設(shè)置3次生物學(xué)重復(fù),每次重復(fù)每個(gè)處理選用6棵幼苗。
1.2.6 超表達(dá)載體構(gòu)建 設(shè)計(jì)特異性引物(表1),上下游分別引入Sac I和Xba I限制性酶切位點(diǎn),PCR擴(kuò)增帶有酶切位點(diǎn)的MiSPIK CDS片段,利用T4 DNA Ligase(TaKaRa,大連,中國(guó))將MiSPIK構(gòu)建到植物表達(dá)載體pHB,獲得重組質(zhì)粒pHBMiSPIK,并進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證。
1.2.7 異源超表達(dá)的擬南芥轉(zhuǎn)基因株系創(chuàng)制 利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的花序侵染法,將重組質(zhì)粒pHB-MiSPIK轉(zhuǎn)化野生型擬南芥Col-0,將收獲的T0代種子在含有10 mg/L潮霉素的1/2 MS固體培養(yǎng)基平板上,篩選能夠長(zhǎng)出綠色真葉、根系較長(zhǎng)的陽(yáng)性抗性苗并移栽到基質(zhì)中,通過(guò)RT-PCR驗(yàn)證擴(kuò)增獲得一條2.4 kb的MiSPIK條帶。收獲T1代轉(zhuǎn)基因株系種子,在1/2 MS固體培養(yǎng)基平板播種10 d后觀察生長(zhǎng)情況。
根據(jù)Song等[27]方法,利用電子天平稱量擬南芥生物鮮重,借助Epson Rhizo scanner(Seiko Epson,日本)掃描擬南芥的根系,并利用Epson WinRHIZO(Seiko Epson,日本)軟件分析總根長(zhǎng)。利用HNO3-HClO4法消解植物組織材料,運(yùn)用電感耦合等離子體原子發(fā)射光譜儀(ICP-AES)測(cè)定K+含量。
1.2.8 數(shù) 據(jù) 分 析 采 用SPSS 13.0軟 件(SPSS Chicago,美國(guó))對(duì)全文數(shù)據(jù)進(jìn)行顯著性分析,在對(duì)照和脅迫處理?xiàng)l件下2個(gè)獨(dú)立樣品間進(jìn)行t檢驗(yàn)(檢驗(yàn)水平 *P<0.05,**P<0.01)。
從杧果盛花期花朵里擴(kuò)增得到一條485 bp的保守區(qū)片段(圖1-A),測(cè)序獲得堿基序列,其翻譯蛋白經(jīng)BLAST比對(duì),顯示是與擬南芥AtSPIK同源性最高的基因片段。根據(jù)已獲得的保守區(qū)序列(485 bp),開(kāi)展 3′-RACE 和 5′-RACE,分別擴(kuò)增獲得 3′端1 836 bp和5′端1 217 bp的產(chǎn)物(圖1-B),拼接獲得一條2 415 bp的全長(zhǎng)CDS序列(圖1-C),將其命名為杧果MiSPIK。利用PCR擴(kuò)增該基因的CDS序列并經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證,功能域分析表明MiSPIK蛋白含有cAMP結(jié)合域(PF00027)、離子跨膜域(PF00520)和KHA(PF11834)等功能域,均屬于Shaker類型K+通道的典型功能域(圖2),提交NCBI獲得登錄號(hào)GenBank ID為OM179914。
圖1 MiSPIK RACE克隆過(guò)程Fig.1 RACE cloning process of MiSPIK
圖2 功能域分析Fig.2 Functional domain analysis
理化性質(zhì)分析表明MiSPIK分子量為90 006.83 kD,pI為7.59,屬于含堿性氨基酸較多的蛋白。跨膜域預(yù)測(cè)結(jié)果表明,MiSPIK含有6個(gè)典型的跨膜結(jié)構(gòu)域,不穩(wěn)定指數(shù)為49.12,GRAVY值為-0.221,脂肪系數(shù)為88.91,表明MiSPIK屬于親水的不穩(wěn)定膜蛋白。
系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建結(jié)果表明,24種已報(bào)道植物Shaker類型K+通道同源蛋白可以分為兩大亞族,其中,SKOR和GORK兩種外向整流型通道屬于GroupI,其余類型的通道均屬于Group II(圖3)。相較于Shaker類型其他通道蛋白,MiSPIK與梨PbrSPIK和擬南芥AtSPIK在進(jìn)化關(guān)系上的遺傳距離最近(圖3),三者的氨基酸序列一致性最高,達(dá)到了59.46%(圖4),且擁有相似但仍有略微差異的三級(jí)結(jié)構(gòu)(圖5),相較于擬南芥AtSPIK,杧果MiSPIK與梨PbrSPIK的三級(jí)結(jié)構(gòu)更為相似。此外,同屬于禾本科(玉米、水稻、高粱和短柄草)、薔薇科(梨、蘋(píng)果和草莓)、楊柳科(楊樹(shù)和紫皮柳)或蕓香科(甜橙和克萊門(mén)柚)的SKOR同源蛋白傾向于緊密聚在一起。而禾本科(玉米、水稻和高粱)KAT同源蛋白傾向于緊密聚在一起(圖5)。
圖3 24種植物Shaker類型通道同源蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)建立Fig.3 Phylogenetic tree construction of Shaker type channel homologs from 24 plant species
圖4 3種植物SPIK同源蛋白氨基酸序列一致性分析Fig.4 Identity analysis of amino acid sequence of SPIK homologs from 3 plant species
圖5 3種植物SPIK同源蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Fig.5 Tertiary structure prediction of SPIK homologs from 3 plant species
RT-qPCR結(jié)果(圖6)表明,MiSPIK在花粉中特異表達(dá),其轉(zhuǎn)錄水平的表達(dá)量最高,其次是盛花期整花中,而在一年生新葉、韌皮、根、盛開(kāi)期花朵、花瓣、花柱、花托、幼果和成熟果實(shí)中的表達(dá)量相對(duì)較低,暗示該通道蛋白可能在杧果花粉發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要作用。
圖6 組織特異性表達(dá)分析Fig.6 Tissue specific expression analysis
此外,MiSPIK在轉(zhuǎn)錄水平對(duì)不同非生物脅迫的響應(yīng)情況存在差異。其中,缺鉀和NaCl脅迫在不同處理時(shí)間均顯著降低MiSPIK在幼苗根部的表達(dá)水平,高鉀脅迫在短期處理時(shí)間內(nèi)(4 h時(shí))顯著增強(qiáng)MiSPIK在幼苗根部的表達(dá)量,且在處理24 h時(shí)增強(qiáng)倍數(shù)最高,在處理48 h時(shí)的增加倍數(shù)則有所降低,而低溫和PEG脅迫則隨著處理時(shí)間的延長(zhǎng)而持續(xù)增強(qiáng)MiSPIK在幼苗根部的表達(dá)水平(圖7)。
圖7 MiSPIK對(duì)非生物脅迫差異響應(yīng)的熱圖分析Fig.7 Heat map analysis of differential responses of MiSPIK to different abiotic stresses
根據(jù)圖8-A所示,構(gòu)建重組表達(dá)載體pHBMiSPIK,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)侵染法獲得T0代陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因株系,RT-PCR驗(yàn)證顯示轉(zhuǎn)基因株系地上部和地下部均擴(kuò)增獲得一條2.4 kb大小的MiSPIK的條帶(圖8-B),表明MiSPIK在轉(zhuǎn)基因擬南芥整株組織中均可穩(wěn)定表達(dá)。
圖8 異源超表達(dá)轉(zhuǎn)基因創(chuàng)制Fig.8 Generation of heterologous over-expression transgenic seedlings
T1代種子在1/2 MS固體培養(yǎng)基平板上播種10 d后觀察生長(zhǎng)情況。發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化MiSPIK的擬南芥地上部的生物量顯著高于野生型Col-0(表2),且提前抽薹和開(kāi)花(圖9),然而,根系的生物鮮重和總根長(zhǎng)均無(wú)顯著差異。T1轉(zhuǎn)基因擬南芥在整株(地上部和根部)的K+含量顯著高于野生型對(duì)照(表2)。
圖9 T1代轉(zhuǎn)基因株系表型分析Fig.9 Phenotype analysis of T1 transgenic lines
表2 T1代轉(zhuǎn)基因株系生理指標(biāo)分析Table 2 Physiological indicator analysis of T1 transgenic lines
K+是植物細(xì)胞中含量最為豐富的金屬元素,與植物的生長(zhǎng)發(fā)育密切相關(guān),土壤缺鉀將影響作物生長(zhǎng)和發(fā)育,降低果實(shí)品質(zhì)和產(chǎn)量[1-6]。目前,果樹(shù)中有關(guān)Shaker類型K+通道功能的報(bào)道極少,在梨[7]和葡萄[24,28]中有單個(gè)通道基因的功能研究。然而,SPIK通道的功能研究?jī)H在模式作物擬南芥中有報(bào)道,果樹(shù)SPIK基因的生物學(xué)功能依然未知。
本研究通過(guò)同源克隆和RACE擴(kuò)增技術(shù),從杧果中克隆了一個(gè)在花粉中特異表達(dá)的Shaker類型K+通道基因MiSPIK,其編碼蛋白和梨PbrSPIK的三級(jí)結(jié)構(gòu)較為相似,且具有較高的氨基酸序列一致性,兩者在在進(jìn)化關(guān)系上遺傳距離最為相近,暗示二者可能具有類似的生物學(xué)功能。因此,解析杧果MiSPIK通道的功能,為研究梨和其他近屬植物SPIK同源基因的生物學(xué)功能提供了理論依據(jù)。
在生物學(xué)功能層面,SPIK通道屬于典型的Shaker類內(nèi)向整流型K+通道,在擬南芥中介導(dǎo)花粉中K+的內(nèi)流,與花粉萌發(fā)、花粉管形成和花粉表面干燥密切相關(guān),這一生命過(guò)程受鈣調(diào)磷酸激酶CPK11 和 CPK24 的調(diào)控[14-15,17]。本研究借助轉(zhuǎn)基因擬南芥創(chuàng)制,初步證實(shí)異源超表達(dá)MiSPIK增強(qiáng)轉(zhuǎn)基因擬南芥整株K+的含量,促進(jìn)轉(zhuǎn)基因株系提早抽薹和開(kāi)花,但對(duì)根系發(fā)育無(wú)顯著影響,這些結(jié)果表明MiSPIK通道蛋白可能通過(guò)調(diào)節(jié)K+狀況參與花朵發(fā)育過(guò)程。盡管MiSPIK通道運(yùn)輸?shù)孜颣+的電生理功能及其調(diào)控機(jī)制還尚未清晰,但是轉(zhuǎn)基因株系中K+富集狀況的增強(qiáng)可能在一定程度上解釋了提早抽薹和開(kāi)花的現(xiàn)象,即花朵中K+的富集可有效促進(jìn)植物開(kāi)花,這與宋志忠等[29]結(jié)果相吻合。
盡管在根中的相對(duì)表達(dá)量很低,但是MiSPIK的表達(dá)水平對(duì)不同非生物脅迫極為敏感且響應(yīng)情況存在差異,缺鉀和NaCl脅迫顯著降低其表達(dá)量,而高鉀、低溫和PEG脅迫則顯著增強(qiáng)其表達(dá)量,這一發(fā)現(xiàn)與SPIK在其他物種中的報(bào)道結(jié)果相一致。這些結(jié)果暗示MiSPIK通道傾向于在較為適宜的K+供應(yīng)環(huán)境中發(fā)揮作用(低鉀抑制,高鉀誘導(dǎo)),其生物學(xué)活性且在轉(zhuǎn)錄水平易受外界K+供應(yīng)水平和低溫、PEG、NaCl等非生物脅迫的調(diào)控。這些發(fā)現(xiàn)與前人對(duì)于SKOR、GORK和KAT1等其他Shaker類型通道的研究結(jié)果相一致[7,18-24],再次印證植物Shaker類型通道在K+動(dòng)態(tài)平衡、質(zhì)子調(diào)控和滲透調(diào)節(jié)中起關(guān)鍵作用。
綜上可知,花藥特異表達(dá)的K+通道基因MiSPIK可能通過(guò)維持K+動(dòng)態(tài)平衡進(jìn)而調(diào)控杧果花粉發(fā)育過(guò)程,借助本研究工作可為研究果樹(shù)SPIK同源蛋白的生物學(xué)功能提供理論支撐和技術(shù)借鑒。
從杧果中分離并鑒定了一個(gè)Shaker類型的K+通道蛋白MiSPIK,與梨PbrSPIK和擬南芥AtSPIK具有高度同源性。MiSPIK在杧果花藥中特異表達(dá),受缺鉀或NaCl處理的抑制均顯著降低,受高鉀、PEG和低溫脅迫誘導(dǎo)而顯著增強(qiáng)。超表達(dá)MiSPIK促進(jìn)轉(zhuǎn)基因植株提早抽薹和開(kāi)花。