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        RNAm6A去甲基化酶FTO在體外培養(yǎng)肝細(xì)胞中的脂肪代謝作用研究

        2022-12-12 06:24:08折瑞蓮沙文瓊林湖濱
        中國醫(yī)藥科學(xué) 2022年21期
        關(guān)鍵詞:水平研究

        王 倩 折瑞蓮 沙文瓊 林湖濱

        深圳市人民醫(yī)院產(chǎn)科,廣東深圳 518020

        代謝性疾病是肥胖人群健康的主要威脅,通過多種方法尋找克服肥胖問題仍然不能有效合理調(diào)控肥胖人群肝臟細(xì)胞代謝平衡[1-2]。脂肪與肥胖相關(guān)基因(fat mass and obesity-associated,F(xiàn)TO)于1999年被發(fā)現(xiàn),2007年經(jīng)鑒定其編碼為去甲基化酶[3-4]。隨著研究的深入,發(fā)現(xiàn)FTO 與多種疾病有關(guān),如代謝紊亂、腫瘤、肥胖、心腦血管疾病等[5-7]。FTO 編碼去甲基化酶,其底物是RNA,催化RNA 上的6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)發(fā)生去甲基化,調(diào)控基因表達(dá),參與細(xì)胞的多種生命活動[8]。FTO 在不同組織中的功能不同,如在黑色素瘤、宮頸癌、乳腺癌、急性髓性白血病中具有癌基因的功能;在肝內(nèi)膽管癌、卵巢癌、腎癌則發(fā)現(xiàn)其具有抑癌基因的作用[9-10]。對于正常肝細(xì)胞的代謝調(diào)控作用尚不清楚,本研究采用正常肝細(xì)胞HL-7702,研究FTO 如何通過m6A 調(diào)控肝細(xì)胞增殖、脂肪代謝相關(guān)基因水平變化,為脂肪肝等肝臟疾病提供治療與指導(dǎo)。

        1 材料與方法

        1.1 一般材料

        RPMI-1640 培養(yǎng)基(KGM31800)、CCK-8 試劑(KGA317)、TMG、cycloleucine 均購自南京凱基;m6A甲基化檢測試劑盒(ab233488)、甘油(ab133130)均購自Abcam;甘油檢測試劑盒購自Elabscience(E-BCK261-M);胎牛血清購自杭州四季青(11011-8611);FTO-OE 過表達(dá)載體購自廣州基旦生物;FTO-sh干擾載體購自廣州艾基生物;RT-qPCR 反轉(zhuǎn)錄試劑盒購自Bio-Rad(1725121);qPCR 引物購自上海生工。抗體購自CST 公司;人肝正常細(xì)胞HL-7702 購自武漢普諾賽公司(CL-0111);293T 細(xì)胞購自中國科學(xué)院上海細(xì)胞庫(GNHuh7);SDSPAGE 凝膠試劑盒(P0012A)、蛋白裂解液RIPA(P0013C)均購自碧云天;lipofectamine 2000(11668030)、TRIzol(1590618)均購自Invitrogen。

        1.2 儀器與設(shè)備

        qPCR 儀器(Bio-Rad,M400)、酶標(biāo)儀(博璐騰,型號DC220)、超凈臺(蘇州超凈,型號WT-2ND)、二氧化碳培養(yǎng)箱(Thermo,型號BB150)。

        1.3 方法

        1.3.1 細(xì)胞培養(yǎng) 使用RPMI-1640 培養(yǎng)基培養(yǎng)人肝正常細(xì)胞HL-7702、293T 細(xì)胞,并置于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱。

        1.3.2 FTO-OE 及FTO-sh 載體構(gòu)建 構(gòu)建FTO 過表達(dá)及干擾載體,使用293T 細(xì)胞。DNA(帶有綠色熒光蛋白標(biāo)簽)與轉(zhuǎn)染試劑的比例為1∶2~1∶3。250 μl Opti-MEM 稀釋2 μg 目的基因載體,室溫靜置5 min。將脂質(zhì)體混合液慢慢滴加到質(zhì)?;旌弦汗苤屑尤爰?xì)胞。4~6 h 后,棄掉培養(yǎng)基,補(bǔ)入含10%胎牛血清的正常培養(yǎng)基。

        1.3.3 外源性甲基化激活劑三甲基甘氨酸與外源性甲基化抑制劑環(huán)亮氨酸分別對細(xì)胞增殖的影響 不同濃度的TMG 對肝細(xì)胞增殖的影響:HL-7702細(xì)胞貼滿96 孔板后進(jìn)行處理,試驗(yàn)分為7 組,三甲基甘氨酸終濃度分別為0、1、2、4、8、16、32 mmol,處理48 min 后CCK-8 法檢測細(xì)胞增殖情況,并使用Graphpad Prism 6.0 計(jì)算IC50。不同濃度的cycloleucine 對肝細(xì)胞增殖的影響:HL-7702 細(xì)胞貼滿96 孔板后進(jìn)行處理,隨機(jī)分為4 組,cycloleucine終濃度分別為0、10、20、40 mmol,處理24 min 后采用CCK-8 法檢測細(xì)胞增殖情況。

        1.3.4 qPCR 分析 收集藥物作用后48 h 的細(xì)胞,加入200 μl Trizol。加入0.2 ml氯仿,輕微振蕩15 s,靜置2 min。4℃離心,12 000 g,離心15 min,取上清。加入0.5 ml 異丙醇,室溫靜置10 min。4℃離心,12 000 g,離心10 min,棄上清。加入1ml 75%乙醇,洗滌沉淀。4℃離心,7500 g,離心5 min,棄上清,加入DEPC水溶解。反轉(zhuǎn)錄條件:37℃,15 min;85℃,5 s。qPCR 體系:模板,1 μl;F 引物,0.4 μl,R 引物(10 μmol),0.4 μl;2x PerfecStar qPCR SuperMix,10 μl;Nuclease free-Water,8.2 μl。使用兩步法分析基因表達(dá),程序如下,95℃ 5 s,60℃ 5 s,然后42 個(gè)循環(huán)擴(kuò)增分析基因表達(dá)(95℃,15 s;60℃,1 min)。使用2-ΔΔCt方法計(jì)算基因相對表達(dá),以GAPDH 表達(dá)為對照。

        1.3.5 Western blot 實(shí)驗(yàn) 收集藥物作用后的細(xì)胞,蛋白裂解變性,BCA 法測定蛋白濃度。SDSPAGE 膠電泳分離樣品,并通過濕轉(zhuǎn)法將蛋白轉(zhuǎn)移到PVDF 上。5%脫脂牛奶室溫封閉1.5 h,TBST 洗膜3 次,將稀釋好的一抗浸沒PVDF 膜,4℃孵育過夜。第2 天,TBST 洗膜3 次,然后加入相應(yīng)的二抗,室溫孵育1 h,化學(xué)發(fā)光法進(jìn)行顯影。

        1.3.6 m6A 甲基化定量檢測 細(xì)胞加藥處理后48 h收集細(xì)胞。RNA 結(jié)合:加80 μl 結(jié)合液到酶標(biāo)板。m6A RNA 捕獲:加50 μl 稀釋的捕獲抗體液。50 μl 稀釋的抗體檢測液,孵育30 min。50 μl 稀釋的增強(qiáng)液,孵育30 min。標(biāo)準(zhǔn)曲線制作,使用1x TE 緩沖液稀釋陽性對照物,濃度為0.5 ng/μl。洗脫緩沖液以1∶2000 比例稀釋抗體檢測液。根據(jù)使用0.5 ng/μl 陽性對照液和1×TE 緩沖液制備6 種不同濃度,分別為0、0.2、0.4、0.8、1.6 和3.2 ng/μl,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。

        1.3.7 甘油水平檢測 甘油水平檢測按照試劑盒說明書進(jìn)行。細(xì)胞加藥處理,48 h 后收集細(xì)胞。按比例每(1~2)×106細(xì)胞加100 μl 裂解液,混勻裂解。65℃左右加熱10 min 滅活脂肪酶,可見絮狀沉淀出現(xiàn)。5000 r/min 離心5 min。工作溶液的配制,按R1∶R2=4∶1 比例,即取4 ml 試劑R1 試劑與1 ml 試劑R2 試劑混合。標(biāo)準(zhǔn)品稀釋,用蒸餾水、生理鹽水或與樣品緩沖液一致的液體,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        采用SPSS 19.0 統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)量資料用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,行t檢驗(yàn),計(jì)數(shù)資料用[n(%)]表示,行χ2檢驗(yàn),P< 0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。使用Graphpad Prism 6.0 軟件作圖。

        2 結(jié)果

        2.1 Western blot及qPCR分析FTO表達(dá)水平

        在人正常肝細(xì)胞HL-7702 過表達(dá)FTO,Western blot 及qPCR 分析其表達(dá),發(fā)現(xiàn)FTO 的mRNA 與蛋白表達(dá)水平皆有提高(圖1A~B)。接下來,使用同樣的方法干擾FTO 表達(dá),發(fā)現(xiàn)FTO 的mRNA 與蛋白表達(dá)水平皆有降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P< 0.05)(圖1C~D)。這些結(jié)果表明,構(gòu)建的FTO 過表達(dá)載體(FTO-OE)及干擾載體(FTO-sh)均有效果。

        2.2 三甲基甘氨酸與cycloleucine對肝細(xì)胞活性影響

        參考相關(guān)研究報(bào)道[11-12],TMG 具有抑制細(xì)胞活性的效果,細(xì)胞經(jīng)過TMG 作用后,經(jīng)計(jì)算其IC50 為8.32 mmol,為了便于藥物濃度計(jì)算,在后續(xù)的實(shí)驗(yàn)里TMG 濃度均為8.5 mmol(圖2A)。cycloleucine具有促進(jìn)細(xì)胞衰老的效果,在一定的濃度范圍內(nèi)具有促進(jìn)細(xì)胞增殖的效果,結(jié)合圖2B,本研究選定其濃度為10 mmol 開展后續(xù)研究。

        2.3 FTO對肝細(xì)胞增殖活性效果

        與NC-OE 對照組相比,當(dāng)FTO 過表達(dá)后,F(xiàn)TO-OE 組增殖活性變化顯著增高(圖3A);細(xì)胞增殖活性受到TMG 抑制(圖3A);當(dāng)細(xì)胞過表達(dá)FTO 時(shí),其增殖活性受到TMG 抑制(圖3A)。與NC-sh 對照組相比,加入cycloleucine 后,其本身增殖活性變化差異不明顯(圖3B);與NC-sh 對比,F(xiàn)TO-sh 增殖活性顯著降低(圖3B);但加入cycloleucine 后,F(xiàn)TO-sh 增殖活性降低得到緩解(圖3B),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P< 0.05)。

        2.4 FTO對肝細(xì)胞產(chǎn)生甘油效果影響

        與NC-OE 對照組相比,當(dāng)FTO 過表達(dá),細(xì)胞甘油產(chǎn)生水平顯著提高(圖4A);甲基激活劑TMG 藥物降低了細(xì)胞甘油水平(圖4A);FTO 過表達(dá)逆轉(zhuǎn)了TMG 的效果,導(dǎo)致細(xì)胞甘油水平提高(圖4A),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P< 0.05)。與NC-sh 對照組相比,干擾FTO 的表達(dá),細(xì)胞甘油產(chǎn)生水平降低(圖4B);抑制劑cycloleucine 藥物顯著提高細(xì)胞甘油水平(圖4B),且FTO-sh 逆轉(zhuǎn)了cycloleucine 對甘油水平的提高,導(dǎo)致細(xì)胞甘油水平降低(圖4B),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P< 0.05)。

        2.5 FTO對肝細(xì)胞代謝基因表達(dá)水平分析

        FTO 調(diào)控脂肪分解相關(guān)基因(ATGL)、成脂分化基因(c/EBPβ)、脂肪酸從頭合成相關(guān)基因(FAS)等脂肪代謝基因水平[13-15]。當(dāng)FTO 過表達(dá),ATGL 表達(dá)水平顯著降低,c/EBPβ、FAS 水平顯著提高(圖5A);當(dāng)被TMG 藥物作用后,ATGL 表達(dá)水平有所提高,仍然低于NC-OE 對照組(圖5A);c/EBPβ 與FAS 表達(dá)水平顯著提高(圖5A),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P< 0.05)。FTO-OE 逆轉(zhuǎn)了TMG 藥物的效果,導(dǎo)致ATGL 表達(dá)水平降低,c/EBPβ 與FAS 水平顯著提高(圖5A)。

        當(dāng)干擾FTO 表達(dá)時(shí),ATGL 水平升高(圖5B),c/EBPβ 與FAS 水平降低(圖5B)。當(dāng)細(xì)胞被cycloleucine 藥物作用后,ATGL 水平進(jìn)一步升高(圖5B),c/EBPβ 與FAS 水平顯著性降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P< 0.05)(圖5B)。接下來進(jìn)一步研究,當(dāng)干擾FTO 表達(dá),細(xì)胞受到cycloleucine 作用后,本應(yīng)該出現(xiàn)ATGL 水平升高、c/EBPβ 水平降低。但是,ATGL 水平卻降低,c/EBPβ 水平差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P> 0.05)(圖5B)。只有FAS 的實(shí)驗(yàn)結(jié)果符合預(yù)期(圖5B)。

        2.6 甲基化m6A水平變化

        FTO 編碼去甲基化酶,影響細(xì)胞m6A 的甲基化水平。為了進(jìn)一步研究FTO 如何調(diào)控以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果,進(jìn)一步研究細(xì)胞RNA 甲基化水平變化。當(dāng)細(xì)胞FTO 過表達(dá),m6A 甲基化水平降低;當(dāng)干擾FTO 的表達(dá),m6A 甲基化水平升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P< 0.05)。見圖6。

        3 討論

        FTO 是脂肪與肥胖相關(guān)基因,編碼m6A 去甲基化酶,調(diào)控RNA 甲基化水平,參與細(xì)胞增殖、存活,與代謝病存在深度關(guān)系,如糖尿病、肥胖、腎病等[13]。RNA 的m6A 修飾功能很重要,目前關(guān)于m6A 在腫瘤發(fā)生、肥胖、脂肪代謝等疾病中愈發(fā)明確[14]。FTO 通過多種途徑調(diào)節(jié)脂肪代謝,如通過過氧化物酶體、與脂肪相關(guān)的促生成因子等,從而調(diào)控肥胖的發(fā)生發(fā)展。新的研究表明,m6A 與2 型糖尿病關(guān)系十分密切,F(xiàn)TO 作為m6A 去甲基化酶廣泛參與2 型糖尿病的發(fā)生發(fā)展。有研究表明,在2 型糖尿病模型研究中,發(fā)現(xiàn)高糖高脂飲食促進(jìn)FTO 表達(dá)而導(dǎo)致m6A 甲基化水平顯著降低[15]。

        另外,還有研究表明,在大鼠高糖高脂飲食實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),F(xiàn)TO 過表達(dá)而導(dǎo)致甘油及三酰甘油表達(dá)水平提高,進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),與代謝緊密相關(guān)的基因,如ATGL、c/EBPβ 與FAS 表達(dá)水平皆有顯著性的變化[16]。本研究利用CCK-8、Western blot、qPCR 等方法,分析FTO 與正常肝細(xì)胞HL-7702 增殖、甘油、代謝基因等變化研究,發(fā)現(xiàn)FTO 過表達(dá)促進(jìn)肝細(xì)胞增殖、甘油水平提高,ATGL 水平降低、c/EBPβ 與FAS 水平升高,m6A 甲基化水平降低。當(dāng)干擾FTO 表達(dá)時(shí),肝細(xì)胞增殖水平減慢,甘油水平降低,F(xiàn)AS 水平升高。

        FTO 通過多種信號通路調(diào)節(jié)脂肪代謝,如FTO基因通過改變m6A 水平可調(diào)節(jié)RUNX1T1 基因的表達(dá),其存在2 種不同的異構(gòu)體。有研究表明RUNX1T1 基因能夠調(diào)節(jié)c/EBPβ 的活性[17]。有研究發(fā)現(xiàn)缺失FTO 基因并不會影響c/EBPβ 的表達(dá)水平,推測FTO 基因有可能通過一條獨(dú)立于c/EBPβ 之外的路徑來發(fā)揮作用[18]。本研究中,F(xiàn)TO 調(diào)控c/EBPβ的表達(dá),F(xiàn)TO 過表達(dá)促進(jìn)c/EBPβ 的表達(dá),提示FTO可能通過調(diào)節(jié)RUNX1T1 基因的表達(dá)調(diào)控脂肪代謝。

        除此之外,本研究還發(fā)現(xiàn)一個(gè)異常的現(xiàn)象,當(dāng)干擾FTO 表達(dá)時(shí),細(xì)胞受到cycloleucine 作用后,ATGL 水平降低、c/EBPβ 沒有顯著性差異。值得進(jìn)一步關(guān)注與研究。

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