宋思源 舒 鵬
(1 南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院,南京,210029; 2 南京中醫(yī)藥大學(xué),南京,210029; 3 江蘇省中醫(yī)院,南京,210029)
胃癌是指發(fā)生于胃黏膜的惡性腫瘤,是全球第三大最常見的癌癥死亡原因,僅次于肺癌和肝癌[1]。早期胃癌五年生存率可達(dá)90%以上,術(shù)后1年復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移率約為50%,而2年率則高達(dá)70%[2],而進(jìn)展期胃癌五年生存率低于30%[3]。目前,進(jìn)展期胃癌治療方法主要包括化療、免疫治療和靶向治療[4]。中醫(yī)藥以“辨證論治”“標(biāo)本兼顧”等在控制胃癌發(fā)生發(fā)展及轉(zhuǎn)移方面具有獨(dú)特優(yōu)勢。中藥可調(diào)節(jié)腫瘤微環(huán)境,抗腫瘤[5]。
茯苓味甘、淡,性平,具有利水滲濕,健脾寧心功效?,F(xiàn)代藥理學(xué)研究表明,茯苓中的主要活性成分茯苓多聚糖通過調(diào)節(jié)細(xì)胞免疫反應(yīng),激活T淋巴細(xì)胞等免疫細(xì)胞對腫瘤細(xì)胞的免疫監(jiān)督[6],從而抑制胃癌細(xì)胞的侵襲、轉(zhuǎn)移[7]。白術(shù)味甘、苦,性溫,具有健脾益氣、燥濕利水、止汗、安胎功效。現(xiàn)代藥理學(xué)研究發(fā)現(xiàn),白術(shù)中主要成分白術(shù)內(nèi)酯成分具有抗腫瘤、鎮(zhèn)痛等藥理學(xué)效應(yīng)[8]。李小芳等[9]研究發(fā)現(xiàn)白術(shù)內(nèi)酯Ⅰ對胃癌細(xì)胞有促凋亡作用。
茯苓-白術(shù)藥對配伍始見于張機(jī)《傷寒論》和《金匱要略》[10]。喬陽等[11]通過構(gòu)建中醫(yī)方劑治療胃癌復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)發(fā)現(xiàn)茯苓、白術(shù)是胃癌治療方劑配伍網(wǎng)絡(luò)的核心藥物。盡管已有諸多案例證實(shí)了茯苓-白術(shù)藥對抗胃癌效果,但其具體機(jī)制尚未明確。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的發(fā)展為研究中藥配伍治療疾病提供了新的途徑。因此,本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法闡述了茯苓-白術(shù)藥對化合物的靶標(biāo)及與胃癌相關(guān)的通路,系統(tǒng)分析了預(yù)期的靶標(biāo)和分子機(jī)制,為新藥開發(fā)及臨床應(yīng)用提供新的策略。
1.1 有效活性成分的獲取 在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)分別搜索“茯苓”“白術(shù)”,口服生物利用度(Oral Bioavailability,OB)和類藥性(Drug Likeness,DL)是藥物吸收、分布、代謝、排泄(Absorption,Distribution,Excretion,Metabolism,ADME)性質(zhì)的關(guān)鍵指標(biāo)[12],本研究以O(shè)B≥30%和DL≥0.05進(jìn)行篩選,獲取茯苓-白術(shù)藥對有效活性成分信息。
1.2 藥物預(yù)測靶點(diǎn)篩選及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 使用Swiss Target Prediction(http://www.swisstargetprediction.ch/)網(wǎng)站,獲取茯苓-白術(shù)藥對Probability TOP50的預(yù)測靶點(diǎn)。通過Cytoscape構(gòu)建“成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖。
1.3 疾病靶點(diǎn)獲取 利用疾病相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫(DisGeNET,https://www.disgenet.org/home/)數(shù)據(jù)庫獲取胃癌相關(guān)靶點(diǎn)。
1.4 核心靶點(diǎn)集篩選 將茯苓-白術(shù)藥對化合物預(yù)測靶點(diǎn)與胃癌疾病靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape做交集,以Degree值、介度中心性(Betweeness Centrality,BC)、接近中心性(Closeness Centrality,CC)為標(biāo)準(zhǔn)篩選核心靶點(diǎn),獲得茯苓-白術(shù)藥對治療胃癌的核心靶點(diǎn)集。
1.5 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(Protein-protein Interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將核心靶點(diǎn)上傳到String數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/cgi/input.pl)構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),然后將TSV文件導(dǎo)入Cytoscape進(jìn)行可視化,按Degree值進(jìn)行排序。
1.6 基因本體(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析 將藥物治療疾病的核心靶點(diǎn)集導(dǎo)入DAVID數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/),使用R軟包進(jìn)行GO富集分析和KEGG富集分析,獲取茯苓-白術(shù)藥對治療胃癌的相關(guān)生物學(xué)過程及代謝通路信息。
1.7 結(jié)果驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)
1.7.1 材料
1.7.1.1 細(xì)胞 人胃癌AGS細(xì)胞(南京凱基生物公司,貨號:KG187),使用1640完全培養(yǎng)基(含有10%FBS和1%雙抗)置于細(xì)胞培養(yǎng)箱(恒溫37 ℃,含5% CO2)中常規(guī)培養(yǎng)。
1.7.1.2 藥物 中藥飲片茯苓、白術(shù)由江蘇省中醫(yī)院提供。批號分別為C0311104110、C2542032003。
1.7.1.3 試劑與儀器 磷脂酰肌醇3激酶(Phosphoinositide 3-kinase,PI3K)、蛋白激酶B(AKT)、促分裂原活化的蛋白激酶3(Mitogenactivated Protein Kinase 3,MAPK3)引物(上海生工生物工程有限公司,貨號:250162676)、總RNA提取試劑盒(江蘇凱基生物有限公司,貨號:KGA1206)、HiscriptⅢ qRT SuperMix for qPCR(南京諾唯贊生物科技有限公司,貨號:R122-01)、ChamQ Universal SYBR qPCR Master Mix(南京諾唯贊生物科技有限公司,貨號:Q411-02/03);PCR儀(Thermo Fisher公司,美國,型號:ABI2720),低溫高速離心機(jī)(Eppendorf公司,德國,型號:5810R)。
1.7.2 方法
1.7.2.1 分組 使用完全培養(yǎng)基培養(yǎng)AGS細(xì)胞,待細(xì)胞量長至70%~80%時(shí),將細(xì)胞分為空白組和中藥組。
1.7.2.2 給藥方法 空白組繼續(xù)原方法培養(yǎng),中藥組中加入茯苓-白術(shù)藥物(終濃度為4.6 mg/mL)繼續(xù)培養(yǎng)48 h。
1.7.2.3 檢測指標(biāo)與方法 使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測AGS細(xì)胞中PI3K、AKT、MAPK3相關(guān)基因表達(dá)。
1.7.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 實(shí)驗(yàn)結(jié)果通過GraphPad Prism軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。組間顯著性檢驗(yàn)采用單因素方差分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 藥物篩選結(jié)果 通過TCMSP數(shù)據(jù)庫篩選,最終獲取36個(gè)茯苓-白術(shù)藥對滿足OB和DL要求,其中茯苓16個(gè)、白術(shù)20個(gè)。見表1。
2.2 藥物疾病靶點(diǎn)篩選及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 經(jīng)過數(shù)據(jù)庫預(yù)測與篩選,共得到藥物活性化合物預(yù)測靶點(diǎn)1 554個(gè),構(gòu)建成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖。DisGeNET數(shù)據(jù)庫獲取胃癌靶點(diǎn)3 168個(gè)。見圖1。
2.3 茯苓-白術(shù)藥對治療胃癌核心靶點(diǎn)篩選 選擇“Degree≥58(2倍中位數(shù)值)”的節(jié)點(diǎn)作為候選靶點(diǎn),對候選靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行提取分析,以“BC≥0.000 066 05、CC≥0.511 9”為標(biāo)準(zhǔn)篩選出核心靶點(diǎn)418個(gè)。見圖2。
2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 其中MAPK3、PTGS2、EGFR、MAPK8、MAPK14、PPARG、ESR1在網(wǎng)絡(luò)中處于核心位置。見圖3。
2.5 GO與KEGG富集分析 GO富集分析顯示,茯苓-白術(shù)藥對活性成分預(yù)測的作用靶基因富集主要涉及RNA Positive regulation of RNA polymerase Ⅱ promoter transcription、DNA transcription等生物學(xué)過程,nucleus、cell membrane等細(xì)胞組分以及Protein binding、DNA binding等分子功能。KEGG富集分析選出89條顯著富集通路。按照Count值進(jìn)行排序,前15個(gè)結(jié)果被可視化。見圖4。
2.6 驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)結(jié)果 通過PCR驗(yàn)證了空白組和中藥組AGS細(xì)胞中PI3K、AKT、MAPK3的mRNA表達(dá)水平差異。發(fā)現(xiàn)中藥組可降低PI3K、AKT、MAPK3的 mRNA表達(dá)水平。見圖5。實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明,茯苓-白術(shù)藥對可能通過抑制PI3K-AKT通路表達(dá)進(jìn)而抑制MAPK3的表達(dá)從而抑制胃癌的發(fā)生發(fā)展。
胃癌可歸屬于中醫(yī)學(xué)“胃脘痛”“積聚”“癥瘕”等范疇。胃癌的病機(jī)多由痰瘀毒等病理因素等積聚于胃,相互作用形成癌腫。本研究結(jié)果顯示,茯苓-白術(shù)藥對活性成分“一對多”發(fā)揮多靶點(diǎn)調(diào)控胃癌作用。MAPK3、PTGS2、EGFR、MAPK8、MAPK14、PPARG、ESR1在PPI網(wǎng)絡(luò)中處于核心位置,是茯苓-白術(shù)藥對治療胃癌的重要靶點(diǎn)。MAPK3、MAPK8、MAPK14是MAPK家族成員,MAPK通路是參與細(xì)胞增殖、凋亡、侵襲關(guān)鍵信號通路之一,故當(dāng)MAPK通路受到破壞時(shí),可出現(xiàn)自身免疫性疾病、癌癥等[13],MAPK通路可調(diào)控胃癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移侵襲[14]。Lin等[15]研究發(fā)現(xiàn)前列腺素內(nèi)過氧化物合酶(Prostaglandin Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)在胃癌中表達(dá)豐富且與患者生存不良有關(guān),PTGS2通過介導(dǎo)順鉑對B細(xì)胞淋巴瘤2表達(dá)的抑制作用,參與了順鉑耐藥性的發(fā)展過程。此外,PTGS2通過PGE2/前列腺素E受體亞型4(Prostaglandin E Receptor Subtype 4,EP4)/MAPKs[胞外信號調(diào)節(jié)激酶(Extracellular Signal-regulated Kinase,ERK)1/2,P38]軸介導(dǎo)順鉑誘導(dǎo)的B細(xì)胞淋巴瘤2表達(dá)和隨后的對細(xì)胞凋亡的抗性。研究表明表皮生長因子受體(Epidermal Growth Factor Receptor,EFGR)在胃癌組織中高表達(dá)[16]。Cheng等[17]發(fā)現(xiàn)在胃癌患者組織中觀察到趨化因子CXC亞家族受體(CXC Subfamily Receptor,CXCR)4和EGFR表達(dá)之間顯著正相關(guān),趨化因子12/CXCR4和EGFR軸可以通過核因子κB通路相互調(diào)節(jié)表達(dá),促進(jìn)轉(zhuǎn)移。因此EGFR和CXCR4的同時(shí)抑制可能是胃癌的潛在治療策略。過氧化物酶體增殖物激活受體(Peroxisome Proliferator-activated Receptor,PPARγ)與炎癥有關(guān),并且在癌癥的發(fā)展中起重要作用[18]。Liu等[19]研究發(fā)現(xiàn)通過激活人胃癌細(xì)胞PPARγ信號,可以誘導(dǎo)胃癌BGC-823細(xì)胞凋亡。此外,胃癌的發(fā)病與雌激素水平有關(guān)[20],二者負(fù)相關(guān)[21],雌激素與雌激素受體1(Estrogen Receptor,ER)1結(jié)合,通過Src等信號通路刺激胃癌細(xì)胞的生長[22]。
KEGG富集分析排除與胃癌無關(guān)的“Hepatitis B”“Alcoholism”等通路,得出胃癌的發(fā)病機(jī)制與“Viral Carcinogenesis”“PI3K-AKT Signaling Pathway”“Proteoglycans In Cancer”等信號通路相關(guān)。研究發(fā)現(xiàn),部分胃癌的發(fā)病與病毒感染有關(guān),Tokunaga等[23]將存在EB病毒(Epstein-Barr Virus,EBV)感染的胃癌定義為EBV相關(guān)胃癌,其余為EBV非相關(guān)胃癌,EB病毒編碼小RNAs(EBV-encoded small RNAs,EBERs)是潛伏性EBV感染細(xì)胞中表達(dá)數(shù)量最多的病毒轉(zhuǎn)錄物,EBERs通過上調(diào)白細(xì)胞介素-6的表達(dá)并激活其下游調(diào)節(jié)因子信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子(Signal Transduction and Activator of Transcription,STAT)3[24],使細(xì)胞周期抑制劑P21和P27在胃癌細(xì)胞中的表達(dá)下調(diào),促進(jìn)胃癌的發(fā)生[25]。在腫瘤細(xì)胞中,PI3K-AKT信號通路是調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移的主要信號通路之一[26],當(dāng)該通路激活后,可以抑制胃癌細(xì)胞凋亡,促進(jìn)血管形成,參與胃癌細(xì)胞的侵襲和轉(zhuǎn)移[27]。蛋白聚糖通路參與了腫瘤細(xì)胞的遷移、增殖等過程[28],核心蛋白聚糖具有抑制腫瘤細(xì)胞生長作用,未來將成為腫瘤治療的一個(gè)新靶點(diǎn)[29]。Jiang等[30]發(fā)現(xiàn)多功能蛋白聚糖在胃癌組織中高表達(dá),可能是胃癌患者預(yù)后指標(biāo)[31]。轉(zhuǎn)錄失調(diào)參與人的生長發(fā)育、細(xì)胞分化、癌癥等多種生物學(xué)過程,已證實(shí)長鏈非編碼RNA失調(diào)與胃癌發(fā)生有關(guān)[32]。
本研究將網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)果與已知實(shí)驗(yàn)結(jié)果對比,預(yù)測茯苓-白術(shù)藥對可通過靶向于PI3K-AKT信號通路及MAPK3蛋白表達(dá)調(diào)控胃癌細(xì)胞的增殖、凋亡、轉(zhuǎn)移、血管再生等生物學(xué)過程。但僅僅是初步的預(yù)測,結(jié)果尚未在動物實(shí)驗(yàn)及臨床得到證實(shí),因此后期還需要更多的實(shí)驗(yàn)去驗(yàn)證,從而為進(jìn)一步闡明其作用機(jī)制奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。