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        分層分析影像組學(xué)模型在肺腺癌診斷中的價(jià)值

        2022-12-01 08:53:16黃雪梅孫英麗高盼譚明瑜段紹峰李銘
        放射學(xué)實(shí)踐 2022年2期
        關(guān)鍵詞:融合模型

        黃雪梅,孫英麗,高盼,譚明瑜,段紹峰,李銘

        肺癌是全球范圍內(nèi)除女性乳腺癌外最常見的癌癥(占總病例的11.6%),也是癌癥相關(guān)死亡的主要原因(占總癌癥死亡的18.4%),在中國,分別占11.4%和18.0%[1]。美國一項(xiàng)大型篩查試驗(yàn)(NLST)[2]表明相比于普通胸部X射線,低劑量胸部CT可明顯降低肺癌死亡率(20%)及全因死亡率(6.7%)。低劑量胸部CT已逐步成為肺癌篩查的常規(guī)手段。在高危人群的首次篩查中,肺結(jié)節(jié)的檢出率約為79.79%,其中實(shí)性結(jié)節(jié)為71.43%,部分磨玻璃結(jié)節(jié)為22.98%[3]。大量肺結(jié)節(jié)的檢出不僅給患者造成巨大心理壓力,也給臨床增加了極大的工作負(fù)擔(dān),尤其是肺結(jié)節(jié)的良惡性及浸潤程度的判斷,因?yàn)樵\斷結(jié)果將直接決定患者干預(yù)方式的選擇。浸潤性肺腺癌與非浸潤性肺腺癌在治療策略、生存率、手術(shù)方式以及預(yù)后方面均有極大的差異[4-5]。因此,早期、準(zhǔn)確地獲知肺結(jié)節(jié)/腫塊良惡性及浸潤程度對臨床醫(yī)師制定適宜的處置策略、提升患者生活質(zhì)量、節(jié)約社會醫(yī)療資源都意義重大。傳統(tǒng)影像診斷模式[6-8]主觀性強(qiáng),診斷耗時(shí),對經(jīng)驗(yàn)要求較高,難以普及到大量的篩查群體。肺癌影像組學(xué),是人工智能在醫(yī)療領(lǐng)域的應(yīng)用之一,通過定量提取瘤灶大量因肉眼局限而無法捕捉到的特征,隨后進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,最終構(gòu)建出預(yù)測模型,協(xié)助判斷疾病性質(zhì)[9-10]、預(yù)后[11]、基因突變狀態(tài)[12]、治療反應(yīng)[13-14]等。它具有無創(chuàng)、客觀、可重復(fù)性高等優(yōu)勢,極大地彌補(bǔ)了傳統(tǒng)診斷模式的不足。

        本研究納入大量病例,首次對肺結(jié)節(jié)/腫塊進(jìn)行分層、分組的建模分析,旨在探索影像組學(xué)模型在不同性質(zhì)的肺結(jié)節(jié)/腫塊中適用性差異,優(yōu)化模型應(yīng)用場景,提高應(yīng)用效能。

        材料與方法

        1.患者的選擇與資料的收集

        本回顧性研究經(jīng)機(jī)構(gòu)審查委員會批準(zhǔn),豁免了患者的知情同意要求。

        工作流程如圖1所示。檢索本院2011年10月-2018年12月的肺結(jié)節(jié)/腫塊病例。納入標(biāo)準(zhǔn):①胸部CT檢查時(shí)間在術(shù)前1個(gè)月內(nèi);②CT圖像層厚≤1.5 mm;③有明確的病理報(bào)告的肺結(jié)節(jié)/腫塊患者;④術(shù)前未做過其他治療(放化療或射頻消融治療)。排除標(biāo)準(zhǔn):①存在嚴(yán)重的運(yùn)動偽影;②既往有肺部手術(shù)史/肺部腫瘤病史或其他臟器惡性腫瘤病史。最終納入2105例肺結(jié)節(jié)/腫塊患者。根據(jù)肺結(jié)節(jié)/腫塊的密度,將病例分為磨玻璃組(A組)及實(shí)性組(B組),在A和B組內(nèi)分別以2017年10月為界分為訓(xùn)練集與測試集。外部驗(yàn)證集選取了來自上海市華東醫(yī)院張國楨肺小結(jié)節(jié)診斷中心的病例,共296例,男123例,女173例,磨玻璃肺結(jié)節(jié)/腫塊235例(A組的外部驗(yàn)證集),實(shí)性肺結(jié)節(jié)/腫塊61例(B組的外部驗(yàn)證集)。

        圖1 流程圖。

        本研究任務(wù):①A組,建立預(yù)測浸潤性肺腺癌/非浸潤性肺腺癌模型。②B組,建立預(yù)測良惡性的模型(肺腺癌/肺良性腫瘤)。

        2.病理狀態(tài)的確診

        所有的病理診斷均由一位低年資病理診斷醫(yī)師進(jìn)行初步診斷,再由一位高年資診斷專家進(jìn)行二次評估,兩者有異議時(shí),討論確定最終病理診斷結(jié)果,診斷規(guī)范為2011年國際肺癌研究協(xié)會/美國胸科學(xué)會/歐洲呼吸學(xué)會提出的國際多學(xué)科肺腺癌分類[15]。

        3.圖像的獲取及相關(guān)儀器參數(shù)設(shè)置

        本研究采用LightSpeed VCT、Somatom Definition Flash、Somatom Sensation 16三臺CT儀,檢查體位為仰臥位,采集期相為深吸氣相。管電壓120 kVp,管電流200 mA,重建算法STND/medium sharp,重建層厚1.00/1.25/1.5 mm。所有圖像均在肺窗下進(jìn)行觀察(窗位-500 HU;窗寬1500 HU)。具體參數(shù)設(shè)置見表1。

        表1 掃描儀器詳細(xì)參數(shù)

        4.ROI勾畫及傳統(tǒng)影像特征獲取

        首先由一名有5年胸部CT診斷經(jīng)驗(yàn)的放射科醫(yī)師采用3D Slicer對瘤灶進(jìn)行像素級手動勾畫,排除掉大的血管、胸膜、纖維條索等無關(guān)結(jié)構(gòu),記錄瘤灶的形態(tài)學(xué)特點(diǎn)包括密度、位置、邊界是否清晰,是否有暈征、分葉征、毛刺征、顆粒征、血管改變、空泡征、蜂窩征、是否合并瘢痕、胸膜凹陷征,記錄臨床特征包括性別及年齡;隨后由一位具有10年胸部CT診斷經(jīng)驗(yàn)的高年資放射科醫(yī)師進(jìn)行二次評估,若二者持有不同意見,討論達(dá)成一致后并記錄最終結(jié)果。

        5.模型的建立及性能評估

        采用Pyraodiomics軟件(Version 3.7)進(jìn)行影像組學(xué)特征的提取,隨后使用最小冗余最大相關(guān)性算法和最小絕對收縮選擇算法對組學(xué)特征進(jìn)行篩選、降維,最終選取最有意義的組學(xué)特征進(jìn)行求和、加權(quán),建立獨(dú)立組學(xué)模型,最后將有意義的臨床-傳統(tǒng)影像特征及組學(xué)特征納入多變量回歸分析,隨后建立融合組學(xué)模型,并在測試集及外部驗(yàn)證集上評估模型效能。預(yù)測效能采受試者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線下面積(area under curve,AUC)表示,并采用De-Long檢驗(yàn)來評價(jià)AUC值的差異,同時(shí)采用校準(zhǔn)曲線、擬合優(yōu)度檢驗(yàn)和臨床決策曲線分別評價(jià)模型的校準(zhǔn)度及臨床實(shí)用性。

        6.統(tǒng)計(jì)分析

        連續(xù)變量采用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)或Wilcoxon秩和檢驗(yàn);分類變量采用卡方檢驗(yàn)或費(fèi)希爾精確檢驗(yàn)。所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均采用R統(tǒng)計(jì)軟件(R version 3.6.3)及SPSS統(tǒng)計(jì)軟件(version 23版)。最大相關(guān)-最小冗余(max-relevance and min-redundancy,mRMR)采用“mRMRe”包,最小絕對收縮選擇算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)采用“glmnet”包。ROC曲線采用“pROC”包,nomogram使用“rms”包;Hosmer-Lemeshow檢驗(yàn)采用“hosle”包;決策曲線采用“dca.R.”包。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        結(jié) 果

        1.A組

        本組共納入磨玻璃肺結(jié)節(jié)/腫塊1711例,浸潤性肺腺癌885例,非浸潤性肺腺癌826例,病灶平均直徑為(20.5±17.9)mm。訓(xùn)練集1075例,男393例,女682例;純磨玻璃結(jié)節(jié)241例,部分磨玻璃結(jié)節(jié)834例;浸潤性腺癌/非浸潤性腺癌(553/518)。測試集643例,男性/女性(233/410);純磨玻璃/部分磨玻璃(135/508);浸潤性腺癌/非浸潤性腺癌(332/308)。

        ①傳統(tǒng)模型的建立:將臨床及傳統(tǒng)影像形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行單因素分析及多因素logistic回歸分析后(表2),最終篩選出9個(gè)可鑒別肺腺癌浸潤性的有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的獨(dú)立預(yù)測因素:性別、年齡、邊界、暈征、分葉征、毛刺征、血管改變、蜂窩征、胸膜凹陷征,最后建立了傳統(tǒng)模型。

        表2 各組訓(xùn)練集特征分布

        ②獨(dú)立組學(xué)模型的建立:Pyradiomics最終獲取1018個(gè)影像組學(xué)特征,篩選、降維(圖2)后,獲得出9個(gè)有意義的組學(xué)特征,計(jì)算R-score,建立組學(xué)模型。獨(dú)立組學(xué)特征模型的預(yù)測效能較高,AUC值為0.91(P值<0.05),能有效區(qū)分浸潤性肺腺癌與非浸潤性肺腺癌。

        圖2 特征篩選系數(shù)-λ函數(shù)值的計(jì)算。注:λ函數(shù)值使用的算法為mRMR算法及LASSO算法,λ函數(shù)值的作用為確認(rèn)相關(guān)的組學(xué)特征系數(shù)及特征數(shù)。

        ③融合組學(xué)模型的建立:將篩選出的臨床及傳統(tǒng)影像相關(guān)的獨(dú)立預(yù)測因素及組學(xué)特征納入多因素logistic回歸分析,最終納入性別、邊界、暈征、毛刺征、蜂窩征、胸膜凹陷征及組學(xué)特征,共7項(xiàng)有意義的特征來建立融合組學(xué)模型,得到Nomogram(圖3)。

        圖3 融合組學(xué)模型(Nomogram)的公式構(gòu)成。a)年齡、毛刺征、蜂窩征、Rad-score是經(jīng)多因素邏輯回歸分析后篩選出的惡性肺結(jié)節(jié)/腫塊的獨(dú)立預(yù)測因素;b)性別、邊界、暈征、毛刺征、蜂窩征、胸膜凹陷征,Rad-score是經(jīng)多因素邏輯回歸分析后篩選出浸潤性肺腺癌的獨(dú)立預(yù)測因素。

        ④預(yù)測效能、校準(zhǔn)度及臨床實(shí)用性的評估:各個(gè)模型均可高效預(yù)測浸潤性肺腺癌與非浸潤性肺腺癌,其中融合組學(xué)模型性能最高。AUC值分別為:訓(xùn)練集中獨(dú)立組學(xué)模型0.91(0.89~0.93)、傳統(tǒng)模型0.83(0.81~0.85)、融合組學(xué)模型0.92(0.90~0.93),測試集中獨(dú)立組學(xué)模型0.95(0.93~0.96)、傳統(tǒng)模型0.80(0.76~0.83)、融合組學(xué)模型0.94(0.93~0.96)。校準(zhǔn)曲線及決策曲線也進(jìn)一步表明融合模型有很好的校準(zhǔn)度及臨床實(shí)用性,見圖4。

        圖4 各模型預(yù)測準(zhǔn)確性、校準(zhǔn)度、臨床實(shí)用性評估。a~e為A組;f~j為B組。a、f)訓(xùn)練集的ROC曲線,顯示模型的預(yù)測準(zhǔn)確性;b、g)測試集的ROC曲線;c、h)訓(xùn)練集的校準(zhǔn)曲線,顯示模型的校準(zhǔn)度;d、i)測試集的校準(zhǔn)曲線;e、j)決策曲線,顯示模型的臨床實(shí)用性。a、b、f、g的紅線代表融合組學(xué)模型(Nomogram),藍(lán)線代表獨(dú)立組學(xué)模型(Radiomics),綠線代表傳統(tǒng)模型(Clinics)。c、d、h、i僅顯示各模型中最佳模型(融合組學(xué)模型)的校準(zhǔn)度,對角線(灰線)代表預(yù)測值與實(shí)際值百分之百一致,越靠近中線代表校準(zhǔn)度越高。e、j圖紅線代表融合組學(xué)模型(Nomogram),藍(lán)線代表傳統(tǒng)模型(Clinics)。橫坐標(biāo)為閾值概率,縱坐標(biāo)為模型的凈利潤率。水平灰線和綠線代表兩條極值曲線。

        各個(gè)模型之間的效能差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(融合組學(xué)模型與傳統(tǒng)模型之間Z=9.2364,P<0.01;獨(dú)立組學(xué)模型與傳統(tǒng)模型之間Z=7.0059,P<0.01)。

        外部驗(yàn)證集也再一次驗(yàn)證預(yù)測模型有較強(qiáng)的泛化能力,融合組學(xué)模型、傳統(tǒng)模型AUC分別為0.87(0.82~0.91)、0.68(0.61~0.75),見圖5。校準(zhǔn)曲線:預(yù)測可能性在0%~70%范圍內(nèi),融合組學(xué)模型預(yù)測值與實(shí)際觀察值之間的相關(guān)性很高,在70%~100%范圍內(nèi),預(yù)測值與實(shí)際觀察值之間的相關(guān)性降低。Hosmer-Lemeshow檢驗(yàn)提示預(yù)測值與實(shí)際觀察值之間擬合優(yōu)度較差(P<0.01)。

        圖5 A組外部驗(yàn)證集融合組學(xué)模型與傳統(tǒng)模型診斷效能ROC曲線。

        2.B組

        本組共納入實(shí)性肺結(jié)節(jié)/腫塊394例,良性115例,腺癌269例,平均直徑為(34.1±23.9)mm。訓(xùn)練集270例,其中男154例,女116例;良性89例,腺癌181例。測試集共124例,男75例,女49例;良性36例,腺癌88例。良性結(jié)節(jié)包括硬化性肺細(xì)胞瘤、炎性肉芽腫、錯(cuò)構(gòu)瘤、機(jī)化性炎癥。

        ①傳統(tǒng)模型的建立:將臨床及傳統(tǒng)影像形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行單因素分析及多因素logistic回歸分析后(表2),最終發(fā)現(xiàn)年齡、毛刺征、蜂窩征是區(qū)分腺癌與良性肺結(jié)節(jié)/腫塊的獨(dú)立預(yù)測因素;基于這三個(gè)特征建立了臨床-傳統(tǒng)影像模型。

        ②獨(dú)立組學(xué)模型的建立:經(jīng)過mRMR及LASSO進(jìn)行特征降維、篩選(圖2)后,最終獲得了7個(gè)有意義的組學(xué)特征,計(jì)算R-score,建立組學(xué)模型。

        獨(dú)立組學(xué)特征模型的預(yù)測性能好,AUC值為0.80(0.73~0.86),P<0.05,可高效區(qū)分腺癌與良性肺結(jié)節(jié)/腫塊。

        ③融合組學(xué)模型的建立:將年齡、毛刺征、蜂窩征及組學(xué)特征(R-score)納入多因素logistic回歸分析,最終建立一個(gè)融合組學(xué)模型,即Nomogram(圖3)。

        ④預(yù)測效能、校準(zhǔn)度及臨床實(shí)用性的評估:比較分析三種模型(獨(dú)立組學(xué)模型、臨床-傳統(tǒng)影像模型、融合組學(xué)模型)的AUC值,訓(xùn)練集分別為0.80(0.73~0.86)、0.83(0.78~0.88)、0.85(0.80~0.90);測試集分別為0.62(0.51~0.73)、0.83(0.74~0.91)、0.80(0.72~0.89),見圖4。結(jié)果顯示:融合組學(xué)模型與臨床-傳統(tǒng)影像模型之間(Z=1.5587,P=0.1191)、獨(dú)立組學(xué)模型與臨床-傳統(tǒng)影像模型之間(Z=1.0535,P=0.2921),性能無差異。組學(xué)模型并未提高傳統(tǒng)診斷模型對實(shí)性肺結(jié)節(jié)/腫塊良惡性的區(qū)分效能。

        融合組學(xué)模型的預(yù)測結(jié)果與實(shí)際觀察結(jié)果有較好的一致性。在預(yù)測肺癌危險(xiǎn)度的8%~82%范圍內(nèi),融合組學(xué)模型有更好的優(yōu)勢,在82%~100%范圍內(nèi),臨床-傳統(tǒng)影像模型的表現(xiàn)優(yōu)于融合組學(xué)模型。外部驗(yàn)證集中,雖然融合組學(xué)模型及傳統(tǒng)模型的預(yù)測性能,均未超過0.75,校準(zhǔn)度及臨床實(shí)用性性能未能達(dá)到優(yōu)秀水平,但仍可看出融合組學(xué)模型的性能明顯優(yōu)于臨床-傳統(tǒng)影像模型AUC分別為0.70(0.54~0.85)、0.62(0.46~0.79),見圖6。

        3.組學(xué)預(yù)測模型的分層分析

        A組結(jié)果顯示組學(xué)特征較傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)特征更能高效預(yù)測肺腺癌的浸潤程度,且校準(zhǔn)度、臨床實(shí)用性方面表現(xiàn)都較好。

        B組結(jié)果表明相比于傳統(tǒng)影像模型,融合模型更能有效區(qū)分肺腺癌與良性結(jié)節(jié)/腫塊。

        基于影像組學(xué)的預(yù)測模型,無論是預(yù)測肺肺癌良惡性或浸潤程度方面,都可以有一個(gè)較高的性能,并且更適用于磨玻璃肺結(jié)節(jié)/腫塊,磨玻璃組vs.實(shí)性組分別為:訓(xùn)練集0.919 vs.0.851;測試集0.944 vs.0.805;外部驗(yàn)證集0.869 vs.0.696(圖7)。

        圖7 組學(xué)預(yù)測模型在A、B組的預(yù)測準(zhǔn)確性的ROC曲線。a)訓(xùn)練集;b測試集);c)外部驗(yàn)證集。紅線為A組融合組學(xué)模型;藍(lán)線為B組融合組學(xué)模型。

        討 論

        本研究分析了1641例病例,建立了預(yù)測肺結(jié)節(jié)/腫塊良惡性及肺腺癌浸潤程度的多個(gè)模型,并分層分析,發(fā)現(xiàn)預(yù)測模型無論是在肺結(jié)節(jié)/腫塊良惡性或肺腺癌浸潤程度診斷方面,都有一個(gè)令人滿意的表現(xiàn)。通過分層分析,組學(xué)預(yù)測模型在磨玻璃肺結(jié)節(jié)/腫塊的應(yīng)用,不管是預(yù)測準(zhǔn)確性、校準(zhǔn)度,還是臨床實(shí)用性方面,明顯優(yōu)于實(shí)性肺結(jié)節(jié)/腫塊。

        Wu等[16]、Feng等[17]及Luo等[18]建立的多個(gè)可預(yù)測部分磨玻璃結(jié)節(jié)的浸潤程度的影像組學(xué)模型均表現(xiàn)出優(yōu)異的性能,AUC值分別為0.98、0.94、0.90,且泛化力強(qiáng);而預(yù)測實(shí)性肺結(jié)節(jié)良惡性的相關(guān)模型研究[19-21]的性能則較磨玻璃結(jié)節(jié)模型遜色,AUC值為0.88~0.90,均低于0.9。盡管部分研究存在例如樣本量較少(100左右)、病例來自不同的機(jī)構(gòu)、存在過擬合等問題,但仍可看出既往多數(shù)磨玻璃影像組學(xué)模型優(yōu)于實(shí)性模型。本研究采取多種方式,避免了既往研究存在的局限性:通過納入同一醫(yī)療機(jī)構(gòu)的實(shí)性及磨玻璃結(jié)節(jié)的病例,避免了選擇偏移;納入可觀的病例數(shù),采用同一種影像組學(xué)方法建立模型,進(jìn)一步減小模型過擬合的問題,最終對影像組學(xué)在不同性質(zhì)結(jié)節(jié)中的確存在效能差異有了進(jìn)一步的清晰、客觀的認(rèn)識。

        影像組學(xué)在不同性質(zhì)的肺結(jié)節(jié)/腫塊中的性能差異,或許是由于機(jī)器學(xué)習(xí)算法在肺結(jié)節(jié)/腫塊的浸潤程度不斷進(jìn)展過程中,磨玻璃區(qū)域的細(xì)胞生長更為活躍,不同區(qū)域的差異較大,故在磨玻璃區(qū)域內(nèi)能獲取到更多的信息,從而評價(jià)腫瘤的侵襲性。Wu等[16]研究中通過磨玻璃成分建立的組學(xué)模型性能,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于實(shí)性成分建立的組學(xué)模型,AUC值分別為0.96、0.82,本研究也進(jìn)一步證實(shí)了這一結(jié)論。影像組學(xué)模型在不同性質(zhì)的成分中,獲取的信息量存在明顯差異,從而導(dǎo)致了組學(xué)模型的適用性差異,為后續(xù)的組學(xué)研究做出了提示:需考慮肺結(jié)節(jié)/腫塊性質(zhì)對組學(xué)模型的影響,從而進(jìn)一步優(yōu)化影像組學(xué)的應(yīng)用,提高組學(xué)的可重復(fù)性。

        本研究不僅僅是發(fā)現(xiàn)了組學(xué)模型的適用性差異,也是對影像組學(xué)模型在肺結(jié)節(jié)/腫塊的良惡性鑒別[22]及浸潤程度[23]有很強(qiáng)的應(yīng)用潛能的有力驗(yàn)證。

        部分磨玻璃、邊界清晰、血管扭曲擴(kuò)張或復(fù)雜、性別、年齡、暈征、毛刺征、分葉、胸膜凹陷都是浸潤性肺腺癌的獨(dú)立預(yù)測因素,這與團(tuán)隊(duì)既往研究[24]的發(fā)現(xiàn)一致?;颊叩哪挲g及傳統(tǒng)影像特征-毛刺征不僅僅與肺腺癌的浸潤性密切相關(guān),并且還是惡性肺實(shí)性結(jié)節(jié)/腫塊的獨(dú)立預(yù)測因素。Feng等[21]和Shen等[25]的研究在實(shí)性肺癌與炎性肉芽腫的鑒別診斷中也分別揭示了它們的相關(guān)性。與此同時(shí),多因素logistic回歸分析發(fā)現(xiàn)蜂窩征與惡性實(shí)性肺癌密切相關(guān),并且與肺癌浸潤性有關(guān)。蜂窩征是指腫瘤瘤體內(nèi)多個(gè)直徑小于5 mm的透亮影,可能是由于腫瘤壞死排除或不完全阻塞導(dǎo)致的,與疾病的性質(zhì)轉(zhuǎn)化及浸潤程度有關(guān)。

        本研究仍存在一些局限性。首先本研究屬于回顧性研究,在病例納入方面可能存在選擇偏倚,未來需要進(jìn)行前瞻性研究來證實(shí)本研究的發(fā)現(xiàn)。其次本研究可能存在數(shù)據(jù)偏倚,病例納入大量肺腺癌的病例,良性病例相對較少,未來需要擴(kuò)大對良性病例的收集。

        影像組學(xué)在肺結(jié)節(jié)/腫塊良惡性及浸潤程度有宏遠(yuǎn)的應(yīng)用前景,且更適用于磨玻璃肺結(jié)節(jié)/腫塊,預(yù)測準(zhǔn)確性、校準(zhǔn)度及臨床實(shí)用性方面的表現(xiàn)較實(shí)性肺結(jié)節(jié)/腫塊都更為優(yōu)異。

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