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        基于MaxEnt模型的甘肅省牛蒡子生態(tài)適宜性分布研究

        2022-11-15 03:32:50楊春師立偉王莉魏琴芳焦旭升
        中國(guó)野生植物資源 2022年10期
        關(guān)鍵詞:牛蒡子掩膜牛蒡

        楊春,師立偉,王莉,魏琴芳*,焦旭升

        (1.定西市經(jīng)濟(jì)作物技術(shù)推廣站,甘肅 定西 743000;2.甘肅中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,甘肅 蘭州 730000)

        牛蒡子為菊科植物牛蒡(ArctiumlappaL.)的干燥成熟果實(shí),具有疏散風(fēng)熱,宣肺透疹,解毒利咽的功效[1]?,F(xiàn)代藥理學(xué)證明牛蒡子具有抗炎、抗病毒和抗糖尿病等多種藥理作用,其有效成分的微生物轉(zhuǎn)化產(chǎn)物具有較高的生物學(xué)活性[2],牛蒡子提取物還具有較好的抗癌作用[3]。甘肅省轄12個(gè)地級(jí)市、2個(gè)自治州,從南向北包含多個(gè)氣候類(lèi)型,地形多樣,復(fù)雜的地理和氣候環(huán)境造就了甘肅省中藥材資源的多樣性。李宗梅等[4]通過(guò)運(yùn)用GIS分析的方法得出全國(guó)最適宜牛蒡子生長(zhǎng)的區(qū)域主要包括東北地區(qū)、華南地區(qū)和四川、云南、西北部分地區(qū)。目前在中藥材引種過(guò)程中由于對(duì)中藥材特性及其適宜的種植環(huán)境缺乏了解,使得有部分中藥材引種后由于環(huán)境達(dá)不到其生長(zhǎng)需求,導(dǎo)致生產(chǎn)的中藥材質(zhì)量不盡人意[5],因此在研究物種分布過(guò)程中開(kāi)始廣泛應(yīng)用多種生態(tài)模型,其中Maxent有較高的準(zhǔn)確度[6],并已經(jīng)廣泛用于生態(tài)學(xué)研究[7-8],目前關(guān)于牛蒡子大多研究其有效成分和藥理作用[9-11]以及其有效成分的提取方法[12-14]。牛蒡子在甘肅分布甚廣,屬于“十大隴藥”之一,但關(guān)于牛蒡子在甘肅省生態(tài)適宜性的研究鮮有報(bào)道,因此研究甘肅牛蒡子分布情況及其生態(tài)適宜性迫在眉睫。

        本研究利用MaxEnt模型和ArcGIS相結(jié)合的方式,進(jìn)行適宜性區(qū)劃預(yù)測(cè),尋找適宜生長(zhǎng)區(qū)域,為牛蒡合理種植提供理論基礎(chǔ),同時(shí)對(duì)牛蒡分布及生產(chǎn)的合理布局具有重要的指導(dǎo)意義。

        1 材料與方法

        1.1 樣本信息采集

        結(jié)合查閱文獻(xiàn)和實(shí)地考察的方法,采用便攜式衛(wèi)星導(dǎo)航儀(Rino 530HCx型)實(shí)地定位獲取,共采集定西市包含甘肅省內(nèi)47個(gè)縣(區(qū))牛蒡樣本信息270組,基本覆蓋甘肅省牛蒡分布的有效范圍,經(jīng)甘肅中醫(yī)藥大學(xué)晉琳教授鑒定為菊科牛蒡?qū)僦参锱]颉?/p>

        圖1 甘肅省牛蒡采樣分布圖Fig.1 Sampling distribution of A.lappa in Gansu Province

        1.2 環(huán)境變量

        環(huán)境變量數(shù)據(jù)(氣候變量、地貌變量、土壤變量和植被類(lèi)型等)來(lái)源于“中藥資源空間信息網(wǎng)格數(shù)據(jù)庫(kù)”。

        2 方法

        2.1 生態(tài)適宜區(qū)預(yù)測(cè)

        由于樣本量達(dá)270份,有足夠數(shù)據(jù)進(jìn)行模型復(fù)核,MaxEnt模型中用75%的牛蒡樣本數(shù)據(jù)設(shè)定訓(xùn)練集,25%的牛蒡樣本數(shù)據(jù)設(shè)定為測(cè)試集,將牛蒡樣本信息和環(huán)境變量導(dǎo)入MaxEnt軟件,其余設(shè)置均為默認(rèn)值,程序重復(fù)運(yùn)行4次,運(yùn)行時(shí)每次去除貢獻(xiàn)率為0的生態(tài)因子,最終獲取貢獻(xiàn)率大于0的因子30個(gè)。

        2.2 精確性驗(yàn)證

        利用刀切法[15]和受試者的工作特征曲線分析法(Receiver operating characteristic curve,ROC)[16]來(lái)檢驗(yàn)權(quán)重,用ROC曲線下面的面積(Area under the ROC curve,AUC)數(shù)據(jù)值對(duì)該模型的精確度進(jìn)行預(yù)測(cè)。對(duì)MaxEnt軟件中所預(yù)測(cè)的牛蒡分布結(jié)果進(jìn)行了精確性驗(yàn)證,得到平均訓(xùn)練集AUC值,作為該模型關(guān)于牛蒡分布的精確性指標(biāo)。AUC值所取的范圍一般為0.50~1.00,數(shù)值越接近1.00說(shuō)明該模型預(yù)測(cè)的結(jié)果越準(zhǔn)確。當(dāng)AUC值小于0.60該模型預(yù)測(cè)結(jié)果不可用,AUC值在0.60~0.90之間表示該模型預(yù)測(cè)一般,AUC值大于0.90說(shuō)明該模型預(yù)測(cè)結(jié)果良好。

        2.3 定西市牛蒡子適宜區(qū)劃分標(biāo)準(zhǔn)

        在Arctoolbox模塊中ConversionTools將MaxEnt最后運(yùn)行得到的ASC文件轉(zhuǎn)換為柵格數(shù)據(jù),在此基礎(chǔ)上以甘肅省為提取范圍進(jìn)行掩膜提取,牛蒡的.csv文件中的點(diǎn)數(shù)據(jù)在多點(diǎn)提取后與掩膜提取結(jié)果進(jìn)行疊加分析。在屬性表中對(duì)得到的掩膜提取分析結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì),得到最大值(max)、最小值(min)、平均值(μ)、標(biāo)準(zhǔn)差(σ)、平均值與標(biāo)準(zhǔn)差相加(μ+σ)、平均值與標(biāo)準(zhǔn)差相減的數(shù)值(μ-σ),在掩膜提取分類(lèi)中輸入限定值,預(yù)測(cè)牛蒡在甘肅省的生態(tài)適宜區(qū)范圍。

        3 結(jié)果與分析

        3.1 MaxEnt模型預(yù)測(cè)結(jié)果

        MaxEnt模型重復(fù)運(yùn)行4次后,最終得到的訓(xùn)練數(shù)據(jù)集AUC值為0.991,測(cè)試數(shù)據(jù)集為0.989,表明MaxEnt模型對(duì)甘肅省牛蒡的生態(tài)適宜區(qū)預(yù)測(cè)效果良好。ROC曲線見(jiàn)圖2。

        圖2 牛蒡適宜區(qū)預(yù)測(cè)ROC曲線Fig.2 ROC curve of A.lappa suitable area

        3.2 主要生態(tài)因子確定

        圖3表明,生態(tài)因子貢獻(xiàn)率大小會(huì)影響物種分布,本次參與MaxEnt模型建立的生態(tài)指標(biāo)因子總共55個(gè),連續(xù)4次運(yùn)行結(jié)束后,挑選貢獻(xiàn)率不為0的生態(tài)因子共30個(gè),其中排名前7的生態(tài)因子貢獻(xiàn)率總和達(dá)到了76.26%。分別為4月降水量(21.96%)、海拔(20.89%)、5月降水量(9.23%)、年平均溫度(6.61%)、12月 降 水 量(6.01%)、3月 降 水 量(5.91%)、土壤酸堿度(5.65%)。上述生態(tài)因子對(duì)于牛蒡生長(zhǎng)適宜的范圍分別為4月降水量35~60 mm、海拔2000~2600 m、5月降水量65~90 mm、年平均溫度5~12℃、12月降水量2~5 mm、3月降水量17~21 mm、土壤酸堿度pH 6~8,說(shuō)明以上7個(gè)生態(tài)因子對(duì)牛蒡生長(zhǎng)環(huán)境的適宜性及其分布狀況有重要影響。

        圖3 影響牛蒡的7種主要生態(tài)因子響應(yīng)圖Fig.3 Response diagram of 7 main ecological factors affecting A.lappa

        3.3 適宜性區(qū)劃

        掩膜提取分類(lèi)區(qū)間為0~1,對(duì)牛蒡生態(tài)適宜區(qū)的綜合評(píng)價(jià)后分為3類(lèi):以0~0.012為不適宜區(qū)、0.012~0.409為次適宜區(qū)、0.409~0.711為適宜區(qū)。結(jié)果顯示,牛蒡適宜生長(zhǎng)分布區(qū)與其實(shí)地樣點(diǎn)和中國(guó)數(shù)字標(biāo)本館標(biāo)本信息記載相一致。在甘肅省內(nèi)牛蒡主要分布于東南部地區(qū),詳見(jiàn)圖4。

        圖4 牛蒡生態(tài)適宜性區(qū)劃圖Fig.4 Ecological suitability zoning map of A.lappa

        4 討論

        通過(guò)MaxEnt進(jìn)行運(yùn)算,此次測(cè)試的模型AUC大于0.9,與實(shí)際情況非常接近,可信度高。在55個(gè)模擬生態(tài)因子中進(jìn)行運(yùn)算,分別得到30個(gè)貢獻(xiàn)率值不為0的生態(tài)因子,選取7個(gè)模擬生態(tài)因子對(duì)于模擬結(jié)果的影響較大,從大到小依次為4月降水量(21.96%)>海拔(20.89%)>5月降水量(9.23%)>年平均氣溫(6.61%)>12月降水量(6.01%)>3月平均降水量(5.91%)>土壤酸堿度(5.65%),其中累計(jì)貢獻(xiàn)率為76.26%,最后用ArcGIS分析得到牛蒡在甘肅省內(nèi)的生態(tài)適宜區(qū)劃結(jié)果。結(jié)果顯示,在3、4、5月牛蒡的生長(zhǎng)期需要大量水分,提供根、莖、葉的正常生長(zhǎng),在12月休眠期需要較多水分維持生命活動(dòng);海拔在2000 m~2600m的地區(qū)更適宜繁殖生長(zhǎng),溫度而隨著海拔的上升逐漸降低,溫度過(guò)低不適宜牛蒡生長(zhǎng);牛蒡?qū)}堿不耐受,對(duì)土壤酸堿度要求接近中性。甘肅北部,西北部降水減少,溫度變化較大,且有些地區(qū)主要為鹽堿地,不利于牛蒡生長(zhǎng)。

        5 結(jié)論

        本研究結(jié)果表明:嘉峪關(guān)市、金昌市、白銀市、酒泉市、酒泉市、張掖市、武威市、隴南市、慶陽(yáng)市、甘南藏族自治州等地區(qū)降雨少、海拔較高的地區(qū)不一定適宜生長(zhǎng)牛蒡,蘭州市、金昌市、白銀市、天水市、張掖市、武威市、定西市、隴南市、平?jīng)鍪小⑴R夏回族自治州、甘南藏族自治州等地區(qū)降雨多、海拔較低的地區(qū)都是生長(zhǎng)牛蒡最為適宜的地區(qū),這也與它的地理科學(xué)考證吻合。

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