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        耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌的基因型和同源性分析

        2022-11-15 05:41:39賈磊陸錦琪馮勤麗蔡瑩高雯潔
        關(guān)鍵詞:康復(fù)科醫(yī)學(xué)科基因型

        賈磊 陸錦琪 馮勤麗 蔡瑩 高雯潔

        1 嘉興市第一醫(yī)院感控與公共衛(wèi)生部,嘉興 314001;2 嘉興市疾病預(yù)防控制中心微生物檢驗(yàn)科,嘉興341001

        肺炎克雷伯菌是醫(yī)院感染常見的病原微生物之一,而耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌(CRKP)是引起醫(yī)院感染的一個(gè)重要致病菌,CRKP 感染是引起患者死亡的危險(xiǎn)因素之一[1]。 有關(guān)研究表明患者使用的機(jī)械通氣設(shè)備、留置導(dǎo)尿、動(dòng)靜脈插管、 氣管插管、 床頭桌、 監(jiān)護(hù)儀表面以及輸液泵分離出的CRKP 與患者感染的CRKP 具有同源性[2-3],但是因果關(guān)系尚不明確。 本研究采用前瞻性的分析,于 2021 年1—8 月對(duì)某醫(yī)院內(nèi)患者體內(nèi)和環(huán)境樣本中檢測(cè)到的CRKP 進(jìn)行同源性分析,探求二者之間的因果關(guān)系,并檢測(cè)了CRKP 的耐藥基因型,現(xiàn)報(bào)告如下。

        材料與方法

        一、材料來(lái)源

        收集 2021 年 1—8 月,在某醫(yī)院 ICU、急診 ICU、神經(jīng)外科和呼吸科就診患者的痰液、血液、尿液、創(chuàng)面等樣本中檢測(cè)出的CRKP。 同時(shí)監(jiān)測(cè)CRKP 住院患者所在病房中可能交叉?zhèn)鞑^(qū)域的物體表面、醫(yī)療器材、醫(yī)用織物以及醫(yī)務(wù)人員的手等。 物體表面包括門把手、床欄、床頭桌、治療車臺(tái)面、呼吸機(jī)面板、監(jiān)護(hù)儀面板、監(jiān)護(hù)使用的相關(guān)導(dǎo)線、輸液泵/微量泵面板、護(hù)理桌面、聽診器、血壓器袖帶、呼吸機(jī)進(jìn)/出氣口、簡(jiǎn)易呼吸器和濕化罐等。

        二、樣本采集

        對(duì)CRKP 感染的住院患者周圍環(huán)境進(jìn)行清潔消毒前采樣,采樣類別以物體表面和醫(yī)療器材為主以及患者所在科室工作人員的手指。 患者的臨床樣本為當(dāng)患者發(fā)生感染時(shí)送檢的臨床微生物樣本。 按照《醫(yī)院消毒隔離技術(shù)規(guī)范》要求,使用500 mg/L 的含氯消毒液對(duì)地面進(jìn)行終末消毒1 周后,繼續(xù)篩查患者分離出的CRKP。 本研究通過(guò)嘉興市第一醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(倫理審批號(hào):LS2018-179)。

        三、儀器及試劑

        Phoenix-100 全自動(dòng)微生物分析儀及配套革蘭陰性菌的鑒定、藥敏卡片購(gòu)自美國(guó)BD 公司。 藥敏紙片為英國(guó)OXOID公司產(chǎn)品,脈沖場(chǎng)凝膠電泳(PFGE)及相關(guān)試劑購(gòu)自美國(guó) Bio Rad 公司。 碳青霉烯酶檢測(cè)試劑盒(膠體金免疫層析法)為購(gòu)長(zhǎng)沙眾捷物技術(shù)有限公司, 檢測(cè)結(jié)果與PCR 檢測(cè)結(jié)果對(duì)比,靈敏度與特異性均為100%。

        四、藥物敏感性實(shí)驗(yàn)

        抗菌藥物敏感性實(shí)驗(yàn)采用MIC 法,其中美羅培南的藥敏試驗(yàn)使用紙片擴(kuò)散法。 質(zhì)控菌株采用衛(wèi)生部生物制品鑒定所生產(chǎn)的大腸埃希菌ATCC25922、銅綠假單胞菌ATCC27853。根據(jù)2019 年美國(guó)臨床實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)(CLSI)標(biāo)準(zhǔn)判讀菌株對(duì)抗菌藥物的敏感性[4]。

        五、耐藥基因型檢測(cè)

        使用碳青霉烯酶檢測(cè)試劑盒(膠體金免疫層析法),檢測(cè)常見的產(chǎn) KPC、OXA-48、VIM、IMP 和 NDM 等 5 類碳青霉烯酶耐藥酶型。

        六、PFGE

        按肺炎克雷伯菌PFGE 標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程進(jìn)行, 用XbaⅠ內(nèi)切酶37 ℃酶切4 h 后上機(jī)電泳19 h,初始轉(zhuǎn)換時(shí)間6 s,終末轉(zhuǎn)換時(shí)間36 s,電壓梯度6 V/cm,夾角:120°線性,起始電流:140 mA,電泳 20 h。 成像后用 BioNumerics 6.6 軟件分析。 根據(jù)相關(guān)研究在解釋PFGE 結(jié)果時(shí),將具有85%以上相同條帶的菌株認(rèn)為是基因型別相同的菌株[5]。

        結(jié) 果

        一、一般情況

        2021 年 1—8 月,共分離出 40 株 CRKP 菌株(排除重復(fù)分離出的菌株),其中35 株分離自患者的臨床樣本(27 株為消毒前,8 株為消毒后),5 株分離自重癥醫(yī)學(xué)科和重癥康復(fù)科的環(huán)境和物體表面(均為消毒前),工作人員手上以及清潔消毒后患者周圍環(huán)境中均未檢測(cè)出CRKP。

        35 株分離自患者的CRKP 臨床樣本分布: 痰液26 株、引流液3 株、創(chuàng)面2 株、血液4 株;重癥醫(yī)學(xué)科25 株、重癥康復(fù)科4 株、神經(jīng)外科 3 株、呼吸科 2 株、肝膽胰外科 1 株。 35 例患者中,男性 21 人,女性 14 人;年齡最大 91 歲,最小 29 歲,中位年齡為71 歲;腦外傷及腦出血13 例,重癥肺炎9 例,惡性腫瘤7例。

        5 株分離自環(huán)境的CRKP 中,2 株來(lái)自重癥康復(fù)科,分別為吸氧面罩和床頭柜;3 株來(lái)自重癥醫(yī)學(xué)科,分別為呼吸機(jī)管路、微泵以及吸痰管接頭。

        二、CRKP 耐藥基因型別

        40 株 CRKP 的耐藥基因型分別為:KPC 型 36 株,OXA-48 型 3 株,NDM 型 1 株,其中環(huán)境和物體表面分離出的 5 株CRKP 耐藥基因型均為KPC 型。

        三、CRKP 的同源性分析及藥物敏感性

        對(duì)11 株CRKP 藥敏結(jié)果高度一致的菌株進(jìn)行PFGE 同源性分析,結(jié)果見圖1,11 株CRKP 耐藥基因型均為KPC 型。PFGE 分子分型聚類分析顯示,3 株來(lái)自消毒前重癥醫(yī)學(xué)科、1 株來(lái)自重癥康復(fù)科、5 株來(lái)自環(huán)境和物體表面(床頭柜、呼吸機(jī)管路接口、微泵、吸痰管接頭、吸氧面罩),以上9 株CRKP的條帶相似性為100%。

        環(huán)境清潔消毒前,4 株從患者體內(nèi)分離出的CRKP、5 株從環(huán)境中分離出的CRKP,PFGE 分析條帶100%相同。 在常規(guī)的環(huán)境清潔消毒前,雖然采樣時(shí)間不同,但是重癥醫(yī)學(xué)科的3 株來(lái)自患者痰液和引流液的CRKP 與重癥康復(fù)科的1株來(lái)自患者創(chuàng)面的CRKP, 與周圍的環(huán)境和物體表面檢出的CRKP 具有同源性。

        在對(duì)重癥醫(yī)學(xué)科環(huán)境和物體表面消毒后, 菌株編號(hào)為8和11 的患者體內(nèi)分離出的CRKP,與加強(qiáng)環(huán)境清潔消毒前4株從患者分離出的CRKP、5 株從環(huán)境中分離出的CRKP 的條帶相似性在90%以上,具有高度同源性。

        11 株CRKP 的藥敏結(jié)果:除對(duì)替加環(huán)素和復(fù)方磺胺甲噁唑敏感外,對(duì)其他抗菌藥物均耐藥。

        四、CRKP 感染患者的治療和預(yù)后

        6 例患者在進(jìn)行微生物培養(yǎng)前均進(jìn)行了經(jīng)驗(yàn)性用藥,后根據(jù)藥敏結(jié)果及時(shí)調(diào)整用藥,5 例患者治愈出院,1 例患者因住院時(shí)重型顱腦損傷而死亡。

        討 論

        有關(guān)研究表明,CRKP 在環(huán)境中存活時(shí)間較長(zhǎng),表明環(huán)境清潔在預(yù)防 CRKP 院內(nèi)傳播方面具有重要作用[6]。 本次研究發(fā)現(xiàn),在重癥康復(fù)科病房CRKP 感染患者的吸氧面罩、床頭柜,重癥醫(yī)學(xué)科病房患者的呼吸機(jī)管路、微泵以及吸痰管接頭中均分離出CRKP。 相關(guān)研究顯示,病房?jī)?nèi)的床單位(包括病床、床墊、床欄、床頭柜等)一旦被CRKP 污染,會(huì)極大增加下一位患者感染的風(fēng)險(xiǎn)[7]。 本研究也證實(shí)了這一觀點(diǎn),患者4在2021 年2 月份住重癥醫(yī)學(xué)科29 床, 經(jīng)過(guò)合理治療出院后, 可能是由于終末消毒不到位, 導(dǎo)致患者1 同樣感染了CRKP。 同時(shí),當(dāng)患者感染CRKP 后,治療需要進(jìn)行吸痰等操作,導(dǎo)致患者周邊的環(huán)境也會(huì)分離出CRKP。 本研究中,患者使用的醫(yī)療器械以及家具均分離出了CRKP, 而且和患者體內(nèi)分離出的CRKP 具有同源性。 因此,應(yīng)加強(qiáng)對(duì)患者周圍環(huán)境、床單元清潔消毒工作,這對(duì)預(yù)防 CRKP 院內(nèi)傳播方面起著重要作用[6]。 雖然本次研究未從相關(guān)科室的工作人員的手上檢測(cè)出CRKP,但仍需引起重視,von Lengerke 等[8]的研究表明,提高手衛(wèi)生依從性,可以有效降低多重耐藥菌的傳播。

        本文分離出的40 株CRKP 耐藥基因型以KPC 型為主,占比高達(dá)90%,這和邵春紅研究結(jié)果類似[9]。 11 株藥敏結(jié)果高度一致的CRKP 菌株除對(duì)替加環(huán)素和復(fù)方磺胺甲噁唑敏感外,對(duì)其他抗菌藥物均耐藥。 相關(guān)研究表明,KPC 耐藥基因型以及不同種類抗菌藥物的使用是影響CRKP 耐藥率的重要因素[10-11]。

        另外,本文結(jié)果還顯示,雖然加強(qiáng)了環(huán)境的清潔消毒,但消毒后患者體內(nèi)分離出的2 株CRKP 與消毒前4 株患者體內(nèi)、5 株環(huán)境中分離出的CRKP 條帶相似性仍在90%以上,具有高度的同源性,說(shuō)明CRKP 可能通過(guò)其他途徑傳播,因此,需要采取集束化干預(yù)措施,包括抗菌藥物管理、提高手衛(wèi)生依從性、加強(qiáng)環(huán)境的清潔消毒等,以上措施對(duì)減少CRKP 在醫(yī)院內(nèi)的傳播會(huì)起到關(guān)鍵作用。

        本次研究的局限性為單中心研究, 只能說(shuō)明本單位的CRKP 耐藥基因型。 另外,本研究使用的是傳統(tǒng)經(jīng)典的PFGE鑒定CRKP 的同源性,存在一定的局限,今后計(jì)劃使用二代基因測(cè)序鑒定,提高結(jié)果的精準(zhǔn)度。

        利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

        作者貢獻(xiàn)聲明賈磊:論文撰寫,數(shù)據(jù)收集;陸錦琪:論文指導(dǎo),學(xué)術(shù)指導(dǎo);馮勤麗、蔡瑩:環(huán)境樣本采樣;高雯潔:實(shí)驗(yàn)分析

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