王亞楠,袁莉,汪莉,徐志遠,阮華,程向東,董昌武
1.安徽中醫(yī)藥大學,安徽 合肥 230000;2.中國科學院大學附屬腫瘤醫(yī)院,浙江 杭州 310022;3.杭州市余杭區(qū)中醫(yī)院,浙江 杭州 310022
慢性胃炎(chronic gastritis,CG)是由多種因素引起的黏膜炎癥性疾病,臨床表現(xiàn)以上腹部疼痛、胃脘部脹滿、反酸嘈雜為主,且易反復發(fā)作,嚴重影響患者的生活質量。CG屬中醫(yī)學“胃脘痛”“痞滿”“泛酸”等范疇。胃炎的發(fā)展是一個多步驟、多因素的過程,可分為淺表性胃炎、萎縮性胃炎、腸化生和異型增生。研究表明,胃炎的發(fā)展會增加患胃癌的風險。目前,臨床主要通過胃鏡和病理組織學檢查進行胃炎診斷,中醫(yī)通過望舌可以了解機體內在氣血盛衰與陰陽虛實,《臨癥驗舌法》所謂“凡內外雜癥,無一不呈其形,著其色于舌”,故在胃炎防治中可通過觀察舌象進行疾病的監(jiān)測和控制。
舌苔微生物是口腔菌群的重要組成部分,舌苔菌群的變化可以為疾病的診斷和治療提供幫助。本研究采用橫斷面研究方法,通過中醫(yī)舌診AI開放平臺系統(tǒng)對167例CG患者的舌象進行分析,同時采用高通量測序技術對樣本中的16S rDNA基因進行測序分析,以研究舌苔微生物群。
選取2021年1-9月杭州市余杭區(qū)中醫(yī)院消化內科經電子內鏡和病理組織學檢查確診的慢性萎縮性胃炎(CAG)患者86例、慢性淺表性胃炎(CSG)患者81例,同時收集其舌象圖片、舌苔樣本及病歷資料。本研究經中國科學院大學附屬腫瘤醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會批準(IRB-2019-56)。
參照《中國慢性胃炎共識意見(2017年,上海)》,CG的內鏡診斷系指肉眼或特殊成像方法所見的黏膜炎性變化,需與病理學檢查結果結合做出最終判斷。CSG患者內鏡結果顯示斑點和條狀紅斑,黏膜粗糙不均勻,出血點,糜爛和膽汁反流。CAG患者內鏡結果顯示胃黏膜以白色為主,褶皺變平,黏膜血管暴露,存在黏膜結節(jié),同時,病理活檢顯示固有腺體萎縮。
①年齡40~80歲,性別不限;②無明顯口腔疾??;③3個月內未使用過影響舌面顏色的藥物;④新診斷且未經治療;⑤有完整的舌面圖像(入組時舌象收集完成);⑥患者均對本研究知情,并簽署知情同意書。
①無法耐受胃鏡檢查;②合并胃癌、胃出血等腸道疾??;③合并嚴重臟器疾病及精神類疾病,語言障礙不能溝通;④哺乳期、孕期婦女;⑤不會伸舌或伸舌困難者;⑥DNA提取量不足,無法進行測序工作。
1.5.1 采集時間與方法
于清晨患者未進食狀態(tài)下采集舌象。拍攝時囑患者放松自然地伸出舌頭,保持舌面展平、舌體放松、舌尖朝下的狀態(tài)。
1.5.2 設備和軟件
采用配備高清攝像頭的移動智能手機,支持自然光源拍攝。采用安徽中醫(yī)藥大學與合肥云診信息科技有限公司聯(lián)合研發(fā)的中醫(yī)舌診AI開放平臺系統(tǒng),通過捕捉舌象,自動提取特征,以輔助中醫(yī)診斷。系統(tǒng)的價值取決于其校準亮度和顏色的能力,以補償來自光源和成像硬件的強度和色溫的變化。舌體區(qū)域圖像被自動分割以獲得相關的舌體特征。系統(tǒng)提取中醫(yī)舌診的主要特征,進一步生成有關長度、面積、濕度和舌部特征數(shù)量的詳細信息。結合人工判斷,形成最終分類,提取5類舌象。①舌色:淡紅舌、紅舌、絳舌;②苔色:白色、黃色;③苔的厚?。汉瘛⒈?、剝落;④苔的腐膩:腐、膩、正常;⑤舌質潤燥:即唾液面積占舌體總面積的比例(燥或潤)。
1.6.1 主要試劑與儀器
Pusion Hot start flex 2X Master Mix,上海儀濤生物儀器有限公司(M0536L);DL2000 DNA Maker,Takara(3427A);Stool DNA Kit(200),OMEGA bio-tek(D4015-02);AMPure XT beads,Beckman(A63880);Gene colour,北京 金博益(GBY-1);Qubit dsDNA HS Assay Kit(500次),Invitrogen,Life technologies(Q32854);生工50×TAE Buffer,上海 生 工(B548101-500);Biowest Agarose G-10,BIOWEST(111860)。
常溫離心機(Eppendorf Centrifuge 5424),旋渦震蕩儀(華利達,WH-861 Vortex Shaker),三溫三控恒溫水浴鍋(上海博迅實業(yè)有限公司,DK-8D),PCR儀(杭州朗基科學儀器有限公司,A200基因擴增儀),電泳儀(Tanon天能,EPS300),凝膠成像儀(Tanon-2500),超低溫冷凍儲存箱(中科美菱低溫科技有限責任公司,DW-HL388)。
1.6.2 樣本采集
隨機收集CAG、CSG各30例舌苔樣本,取樣前漱口,使用一次性無菌拭子刮取患者舌面3~5次,將其置于1.5 mL舌苔樣本收集小管(含保存液)中,12000 r/min離心5 min,去除上清液,置于超低溫冷凍儲存箱中備用。
1.6.3 DNA抽取與PCR擴增
對樣本舌苔進行微生物組總DNA提取,并通過瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA提取質量,同時采用紫外分光光度計對DNA進行定量。利用細菌16S rDNA基因V3~V4可變區(qū)進行PCR擴增,引物序列:341F(5"-CCTACGGGNGGCWGCAG-3")805R(5"-GACTACHVGGGTATCTAATCC-3"),PCR產物經2%瓊脂糖凝膠電泳確證,PCR產物由AMPure XT beads(Beckman Coulter Genomics,Danvers,MA,USA)純化,Qubit(Invitrogen,USA)定量。擴增子池用于測序,擴增子文庫的大小和數(shù)量分別在Agilent2100生物分析儀(Agilent,美國)和Illumina(Kapa Biosciences,Woburn,MA,美國)的文庫定量試劑盒上進行評估,樣品在Illumina NovaSeq平臺上進行測序。
CAG組、CSG組性別、吸煙、飲酒比較差異無統(tǒng)計學意義(>0.05),具有可比性。見表1。
表1 CAG組和CSG組一般資料比較
舌色方面,CAG患者以紅舌為主,CSG患者以淡紅舌為主;苔色方面,CAG患者以黃苔為主,CSG患者白苔為主;苔的厚薄方面,CAG患者厚苔居多,CSG患者薄苔較多;苔的腐膩方面,CAG患者以膩苔為主,CSG患者以正常為主;舌質潤燥方面,2組均以潤為主,CAG較CSG患者燥舌增加。2組舌色、苔色、苔的厚薄及腐膩、舌質潤燥差異有統(tǒng)計學意義(<0.01)。見表2。
表2 CAG組和CSG組舌象比較[例(%)]
對原始下機數(shù)據(jù)進行雙端拼接、質量控制、嵌合體過濾后,進行高質量數(shù)據(jù)統(tǒng)計,見表3。2組在有效片段數(shù)(=0.124)、片段長度(=0.525)、Q20%(=0.220)、Q30%(=0.160)、GC%(=0.695)等方面比較差異無統(tǒng)計學意義。
表3 舌苔高通量測序2組比較(xˉ±s,n=30)
Alpha多樣性是指一個特定環(huán)境或生態(tài)系統(tǒng)內的多樣性,主要反映物種豐富度和均勻度及測序深度。Alpha多 樣 性 主 要 通 過Chao1、Observed species、Goods_coverage、Shannon、Simpson等指數(shù)反映豐富度和均勻性。Chao1、Observed_species指數(shù)主要反映樣本的物種豐富度信息;Goods_coverage反映樣本的低豐度feature覆蓋情況;Simpson/Shannon主要綜合體現(xiàn)物種的豐富度(Richness)和均勻度(Eveness)。由圖1可知,CAG與CSG舌苔微生物Alpha多樣性指數(shù)差異有統(tǒng)計學意義(<0.05),說明2組舌苔微生物群落差異顯著,CAG組的菌群多樣性明顯高于CSG組。
圖1 CAG組和CSG組舌苔菌群多樣性比較
Venn分析可知,2組共有菌群1213種,其中CAG組特有菌群1880種,CSG組特有菌群1264種。根據(jù)物種豐度表和物種注釋表,選取豐度最高的30個物種分類,將每個分組的相對豐度以堆疊柱狀圖形式展現(xiàn),從而比較樣品豐度。結果顯示,在門水平,菌群分布以擬桿菌門、變形桿菌門、厚壁菌門、梭桿菌門為主,其中CAG組梭桿菌門的分布高于CSG組,擬桿菌門、變形桿菌門的分布低于CSG組,見圖2a;在屬水平,菌群分布以奈瑟菌屬、普雷沃氏菌屬_7、嗜血桿菌屬、卟啉單胞菌屬為主,其中CAG組奈瑟菌屬分布低于CSG組,卟啉單胞菌屬分布高于CSG組,見圖2b。
圖2 CAG組與CSG組舌苔菌群平均相對豐度
根據(jù)樣品物種豐度表,采用Mann-Whitney檢驗(適用于有生物學重復2組樣品差異比較)進行物種差異檢驗。在門水平影響分組的2種菌是梭桿菌門、Candidatus_Saccharibacteria(見圖3a),在屬水平影響分組的18種菌是鏈桿菌屬、普雷沃氏菌屬ceae_UCG-001、Ruminococcus_gnavus_group、、等(見圖3b)。
圖3 CAG組與CSG組舌苔菌群顯著性差異分析
LEfSe(LDA effect size)分析主要目的是比較不同組間在豐度上有顯著差異的物種,能夠更加直觀展現(xiàn)組間所有層級的差異物種。圖4顯示,2組門水平的梭桿菌門、屬水平的有顯著差異,且在CAG組中的豐度更高。
圖4 CAG組與CSG組舌苔菌群LEfSe差異分析
相關性網絡圖(SparCC)是通過計算屬水平豐度top30的微生物豐度,獲得兩兩優(yōu)勢菌群間的相關性及顯著性(值),再用相關性繪制網絡圖。由圖5可見,普雷沃氏菌屬_7與普雷沃氏菌屬、韋榮氏球菌屬呈正相關,與卟啉單胞菌屬、嗜血桿菌屬呈負相關,嗜血桿菌屬與卟啉單胞菌屬、奈瑟菌屬呈正相關。與其他菌的數(shù)目關聯(lián)最多的細菌是普雷沃氏菌屬_7、嗜血桿菌屬。
圖5 CAG組與CSG組屬水平豐度top30的舌苔菌群相關性網絡
舌象可反映機體內在氣血盛衰與陰陽虛實,近年來舌診研究在客觀化、標準化方面取得一定進步。目前大多數(shù)學者認同正常胃黏膜-CSG-CAG-癌前病變-胃癌的發(fā)展模式,認為CSG病情程度較CAG輕。中醫(yī)學認為,正常人多表現(xiàn)為淡紅舌、薄白苔,病情越發(fā)展舌象變化越明顯。本研究中,我們發(fā)現(xiàn)CAG患者舌象以紅舌、黃苔、厚苔、膩苔為主,CSG患者以淡紅舌、白苔、薄苔為主?!秱噼b》有“夫紅舌者,伏熱內蓄于心胃,自里而達于表也”。CAG患者舌色以紅為主,認為內有熱象。西醫(yī)學認為舌色發(fā)紅多見于感染發(fā)熱患者或慢性消耗性患者。《辨舌指南》有“黃苔主里……全舌黃苔者,臟腑俱熱”。研究發(fā)現(xiàn),苔色受細胞生長分化和溶解退化間動態(tài)平衡影響。研究發(fā)現(xiàn),舌苔隨細胞代謝速率改變產生敏感變化,體現(xiàn)在舌苔厚薄與細胞生長分化和溶解退化的動態(tài)改變。《溫熱經緯》有“舌苔厚而有根,濁邪瘀結”。以上均表明中醫(yī)舌診可為疾病提供潛在的篩查和早期診斷方法,欲獲得更科學的結論仍需調查更大樣本量及更精確的生物組學證據(jù)。
解剖學認為,舌與消化系統(tǒng)密切相關。脫落上皮、唾液、食物碎屑、透出的白細胞等共同組成舌苔,飲食習慣、生活方式和微生態(tài)環(huán)境等多種因素影響舌苔變化。1984年,Marshall等發(fā)現(xiàn)胃幽門螺桿菌在CG中發(fā)揮重要作用,表明細菌是導致胃炎的因素。但既往研究發(fā)現(xiàn),約25%的CG患者沒有感染幽門螺桿菌,表明其他能夠引起炎癥的細菌參與了該過程。此后,眾多研究者證實了除幽門螺桿菌以外的細菌在胃病中的作用?,F(xiàn)代研究表明,16S rDNA基因的高通量測序在鑒定口腔微生物群中的綜合細菌方面發(fā)揮著至關重要的作用,目前已有研究者利用該技術調查了口腔細菌群落與胃炎發(fā)展的潛在關系。本研究對CAG組和CSG組舌苔微生物菌群進行檢測和分析,以探討特定圖像產生的深層原因,發(fā)現(xiàn)2組樣本中盡管存在大量相同物種,但其微生物組成、多樣性和功能存在一定差異。
本研究與既往研究結果一致,認為擬桿菌門、變形桿菌門、厚壁菌門、梭桿菌門是鑒定出的4個最具優(yōu)勢的門。在屬水平上,奈瑟菌屬、普雷沃氏菌屬_7是最豐富的屬。充分說明這些菌群在CG人群的舌苔微生物中占據(jù)重要地位,是構成口腔中舌苔微生物群落結構的最基礎成分。此外,門水平上,CAG組梭桿菌門的分布高于CSG組,梭桿菌門是口腔微生物群的常見成員。有研究發(fā)現(xiàn)梭桿菌屬m能夠引起炎癥,更有學者發(fā)現(xiàn)梭桿菌屬m可能與結直腸癌有關。擬桿菌門屬于口腔正常菌群,而擬桿菌門在CAG組的分布低于CSG組,證明梭桿菌屬m、擬桿菌門可能與胃炎的病變程度有關。屬水平上,CAG組卟啉單胞菌屬分布高于CSG組。卟啉單胞菌屬已被證明具有致癌潛力,可抑制細胞凋亡,激活細胞增殖,促進細胞入侵,誘導慢性炎癥,并直接產生致癌物。奈瑟菌屬分布低于CSG組,本結果與既往研究不一致,考慮舌苔菌群的組成和與疾病癥狀有關,如CAG患者癥狀表現(xiàn)以吐酸、噯氣為主,而CSG患者癥狀不明顯,這些癥狀表現(xiàn)都會影響舌苔菌群變化。LEfSe差異分析發(fā)現(xiàn),梭桿菌門在2組差異有統(tǒng)計學意義,且在CAG組的豐度更高,表明CAG患者舌苔菌群結構更加豐富且存在較多優(yōu)勢菌群,口腔菌群失調程度加重。這些菌屬的改變提示CG的發(fā)展可能與炎性因子有關,由于菌群改變,導致代謝物甚至一系列全身系統(tǒng)變化。雖然目前研究缺乏關于特定細菌種類在CG發(fā)生發(fā)展過程中的確切致炎機制,但在CG患者中觀察到的微生物區(qū)系變化豐富了對口腔細菌與CG相關性的認識。
門、屬水平的特定微生物可能為舌診研究指明方向,但仍需更多研究確認特定微生物與舌質和舌苔圖像特征間的關系?;蚩赏ㄟ^觀察舌象、調整舌苔菌群的方式對胃腸道進行干預和調控,從而干預CG疾病的發(fā)展進程。此外,如何將中醫(yī)舌診與開發(fā)新的生物標志物相結合,用以預測疾病的轉歸、進行辨證論治也是需要關注的問題。