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        基于TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)分析SLC5A1 在胰腺癌中的表達(dá)及潛在促癌作用

        2022-09-21 02:06:58陳譜袁黎玥雷雨陽(yáng)張曈欣袁佳郭輝施秉銀強(qiáng)薇
        海軍醫(yī)學(xué)雜志 2022年7期
        關(guān)鍵詞:糖酵解胰腺癌胰腺

        陳譜,袁黎玥,雷雨陽(yáng),張曈欣,袁佳,郭輝,施秉銀,強(qiáng)薇

        胰腺癌以胰腺導(dǎo)管癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)最為常見,是惡性程度最高的消化系統(tǒng)實(shí)體腫瘤,近年來其發(fā)病率在全球范圍內(nèi)持續(xù)上升。胰腺癌預(yù)后極差,5 年生存率僅約6%[1-2]。分析主要原因是:疾病早期缺乏典型癥狀,確診時(shí)往往已喪失根治性手術(shù)的機(jī)會(huì);同時(shí),其具有高侵襲轉(zhuǎn)移特性,易于復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移;對(duì)現(xiàn)有化療藥物產(chǎn)生耐藥,缺乏有效的化療及靶向藥物。因此,尋找胰腺癌轉(zhuǎn)移之前的診斷方法以及胰腺癌治療的有效靶點(diǎn)尤為重要。

        葡萄糖是哺乳動(dòng)物細(xì)胞的基本能量來源。截至目前,哺乳動(dòng)物中葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)體(glucose transporter,GLUT)和鈉-葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)體(sodium-glucose cotransporter,SGLT)2 個(gè)家族的葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)體已被鑒定[3-4]。人類GLUT 家族在所有的組織中均有表達(dá),以順濃度梯度(易化擴(kuò)散)的形式轉(zhuǎn)運(yùn)葡萄糖。而SGLTs 表達(dá)于人體代謝活躍的細(xì)胞,借助細(xì)胞膜兩側(cè)的鈉離子濃度梯度實(shí)現(xiàn)葡萄糖的逆濃度梯度轉(zhuǎn)運(yùn)。SGLT 家族成員研究最多的是溶質(zhì)載體家族5-成員1(solute carrier family 5-member 1,SLC5A1)和鈉-葡萄糖協(xié)同轉(zhuǎn)運(yùn)蛋 白2(sodium - dependent glucose transporters 2,SGLT2)。SGLT2 由溶質(zhì)載體家族5-成員2(solute carrier family 5-member 2,SLC5A2)基因編碼,主要分布于腎皮質(zhì),是腎臟葡萄糖重吸收的關(guān)鍵分子[5]。SGLT1 由SLC5A1 基因編碼,在小腸和腎近端小管細(xì)胞負(fù)責(zé)葡萄糖攝取。腫瘤細(xì)胞需要大量的葡萄糖來維持其增殖,代謝重編程已被認(rèn)為是腫瘤的特征之一[6]。而SLC5A1 和SLC5A2 的高表達(dá)在結(jié)腸/結(jié)直腸、肺、卵巢、頭部、頸部和口腔鱗狀上皮癌中已有相關(guān)報(bào)道[4]。靶向代謝治療癌癥被認(rèn)為極具前景。葡萄糖攝取增高也是胰腺癌代謝重編程的重要環(huán)節(jié)。新近研究發(fā)現(xiàn),SLC5A2 在胰腺癌中表達(dá)亦增高,而其抑制劑可抑制小鼠胰腺癌移植瘤生長(zhǎng)[7]。本課題組的另一篇文章已對(duì)SLC5A2 進(jìn)行了分析研究。本研究通過對(duì)癌癥基因組圖譜(the cancer genome atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)中胰腺癌患者的數(shù)據(jù)與臨床病理資料進(jìn)行分析,明確SLC5A1 在胰腺癌中的表達(dá)情況,探討其異常表達(dá)與臨床病理及腫瘤發(fā)生、發(fā)展的相關(guān)性。

        1 資料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)來源 胰腺癌的RNA 測(cè)序數(shù)據(jù)是從TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga)中獲取,正常胰腺組織的RNA 測(cè)序數(shù)據(jù)是從TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)及基因組織表達(dá)(genotype-tissue expression,GTEx)數(shù)據(jù)庫(kù)中共同獲取的。

        1.2 基因共表達(dá)、信號(hào)通路富集及數(shù)據(jù)分析cBioPortal(http://www.cbioportal.org/)是一個(gè)開放獲取資源,可進(jìn)行多維癌癥基因組學(xué)交互分析,LinkedOmics(http://www.linkedomics.orglogin.php)是一個(gè)包含32 種TCGA 癌癥多組學(xué)數(shù)據(jù)的開放資源網(wǎng)站。利用cBioPortal 和LinkedOmics 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行胰腺癌中SLC5A1 共表達(dá)基因的分析。利用可視化注釋和集成探索在線數(shù)據(jù)庫(kù)DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)及KEGG(https://www.kegg.jp/)進(jìn)行功能注釋和通路富集分析。通過基因表達(dá)譜交互分析在線數(shù)據(jù)庫(kù)GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)獲取TCGA 及GTEx 數(shù)據(jù)庫(kù)中的RNA 測(cè)序數(shù)據(jù),并比較SLC5A1 在胰腺癌(179 例)與正常胰腺組織(171 例)中mRNA 的表達(dá),并分析SLC5A1 mRNA 表達(dá)水平與不同臨床特征的相關(guān)性,如患者的種族、腫瘤的病理分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、組織學(xué)分型等。胰腺癌根據(jù)基因分型可分為4 種類型:(1)鱗狀型;(2)胰腺祖細(xì)胞型;(3)免疫原性型;(4)異常分化的內(nèi)分泌外分泌型(aberrantly differentiated endocrine exocrine,ADEX)。本研究對(duì)4 種亞型相關(guān)基因胰島素(insulin,INS)、核受體亞家族5-組A-成員2(nuclear receptor subfamily 5-group A-member 2,NR5A2)、蛋白酶-絲氨酸-3(protease-serine-3,PRSS3)、叉頭框A3(forkhead box A3,F(xiàn)OXA3)、肝細(xì)胞核因子1α(hepatocyte nuclear factor 1-alpha,HNF1A)、叉頭框A2(forkhead box A2,F(xiàn)OXA2)、肝細(xì)胞核因子1β(hepatocyte nuclear factor1β,HNF1B)、胰十二指腸同源框因子-1(pancreatic and duodenal homeobox 1,PDX1)、肝細(xì)胞核因子4-γ(hepatocyte nuclear factor 4-gamma,HNF4G)、肝細(xì)胞核因子4-α(hepatocyte nuclear factor 4-alpha,HNF4A)、多毛和增強(qiáng)子斷裂1(hairy and enhancer of split 1,HES1)等與SLC5A1 的表達(dá)進(jìn)行相關(guān)性分析。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 17.0 軟件(Chicago,IL,USA)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。計(jì)量資料采用±s表示,2 組數(shù)據(jù)間的比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)。相關(guān)性分析采用Spearman 分析。采用Log rank 檢驗(yàn)進(jìn)行生存分析。P<0.05 表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 SLC5A1 在胰腺癌的表達(dá)及其與臨床病理特征的相關(guān)性 如圖1A 所示,對(duì)TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),在胰腺癌組織中的SLC5A1 mRNA表達(dá)高于正常胰腺組織(P<0.05)。SLC5A1 的表達(dá)與患者的種族相關(guān)(P=0.002),但與年齡、臨床病理階段、病理TNM 分期、組織學(xué)分型、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等無相關(guān)性。見表1。如圖1B 所示,相較于SLC5A1低表達(dá)的患者,SLC5A1 高表達(dá)的患者總生存時(shí)間雖呈現(xiàn)減低趨勢(shì),但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.075)。而如圖1C 所示,SLC5A1 高表達(dá)及低表達(dá)患者的無病生存時(shí)間比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.870)。

        表1 SLC5A1 的表達(dá)與胰腺癌臨床病理特征的相關(guān)性

        圖1 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)分析在胰腺癌組織中的SLC5A1 mRNA 表達(dá)

        2.2 與SLC5A1 表達(dá)相關(guān)的基因 進(jìn)一步用cBioPortal 分析胰腺癌中與SLC5A1 表達(dá)呈正相關(guān)以及負(fù)相關(guān)的基因,見圖2A;GO 分析顯示大多數(shù)與SLC5A1 相關(guān)的基因位于細(xì)胞膜和細(xì)胞核,負(fù)責(zé)蛋白和離子的結(jié)合,參與細(xì)胞生物功能和代謝調(diào)節(jié),見圖2B。KEGG 分析進(jìn)一步提示,SLC5A1 的高表達(dá)與包括葡萄糖攝取、糖酵解信號(hào)通路等細(xì)胞代謝相關(guān)的通路以及細(xì)胞色素P450 介導(dǎo)的藥物代謝激活呈正相關(guān)。SLC5A1 的高表達(dá)還與青少年發(fā)病的成年型糖尿病的信號(hào)通路激活呈正相關(guān),見表2。

        表2 胰腺癌中與SLC5A1 表達(dá)正相關(guān)及負(fù)相關(guān)的信號(hào)通路

        圖2 胰腺癌中SLC5A1 相關(guān)基因

        2.3 SLC5A1 表達(dá)與胰腺癌不同亞型基因的相關(guān)性分析 本研究對(duì)胰腺癌4 種亞型相關(guān)基因與SLC5A1 的表達(dá)進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)SLC5A1的表達(dá)與ADEX 型胰腺癌相關(guān)基因中的INS(r=0.174 8,P<0.05)、NR5A2(r=0.331 7,P<0.001)、PRSS3(r=0.207 7,P<0.05)表達(dá)呈正相關(guān)。見圖3。SLC5A1 表達(dá)與胰腺祖型胰腺癌中糖代謝關(guān)鍵基因FOXA3(r=0.294 4,P<0.001)、HNF1A(r=0.234 0,P<0.05)、FOXA2(r=0.193 5,P<0.05)、HNF1B(r=0.545 4,P<0.001)、PDX1(r=0.370 1,P<0.001)、HNF4G(r=0.628 3,P<0.001)、HNF4A(r=0.473 2,P<0.001)、HES1(r=0.300 1,P<0.001)表達(dá)呈正相關(guān)。見圖4。與鱗狀型、免疫原性型無明顯相關(guān)性。

        圖3 SLC5A1 表達(dá)與ADEX 型胰腺癌相關(guān)性分析

        圖4 SLC5A1 表達(dá)與胰腺祖細(xì)胞亞型胰腺癌相關(guān)性分析

        3 討論

        葡萄糖攝取增高是胰腺癌代謝重編程的重要特征之一,由介導(dǎo)葡萄糖順梯度異化擴(kuò)散的GLUT家族和介導(dǎo)葡萄糖逆濃度梯度主動(dòng)攝取的SGLT 家族介導(dǎo)。SGLT1 是由SLC5A1 編碼的,本研究分析TCGA 中的數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),SLC5A1 在胰腺癌組織中的表達(dá)顯著高于正常胰腺組織,遺憾的是本研究未能有臨床樣本進(jìn)行進(jìn)一步的組織學(xué)驗(yàn)證,但這一結(jié)果與其他研究結(jié)果一致[8-9],均提示其可能作為潛在治療靶點(diǎn),有待后續(xù)進(jìn)一步研究。

        本研究進(jìn)行GO 分析發(fā)現(xiàn),大多數(shù)與SLC5A1相關(guān)的基因位于細(xì)胞膜和細(xì)胞核,負(fù)責(zé)蛋白和離子的結(jié)合,參與細(xì)胞生物功能、代謝及應(yīng)激反應(yīng)調(diào)節(jié)。利用KEGG 分析發(fā)現(xiàn),SLC5A1 高表達(dá)除與葡萄糖攝取信號(hào)通路呈正相關(guān),也與糖酵解信號(hào)通路正相關(guān)。糖酵解改變被認(rèn)為是胰腺癌的主要代謝改變。許多糖酵解酶與PDAC 預(yù)后不良有關(guān),而通過遺傳學(xué)途徑或用藥抑制糖酵解關(guān)鍵因子如己糖激酶2(hexokinaseⅡ,HK2)、磷酸果糖激酶1(phosphofructokinase-1,PFK1)和乳酸脫氫酶A(lactate dehydrogenase A,LDHA)等已被證明能抑制胰腺癌惡性程度。最近,糖酵解增強(qiáng)還被發(fā)現(xiàn)與胰腺癌對(duì)吉西他濱喪失敏感性有關(guān)[10]。此外,本研究還發(fā)現(xiàn)SLC5A1 高表達(dá)與胰腺分泌、青少年的成年型糖尿病發(fā)病的信號(hào)通路激活呈正相關(guān)。2 型糖尿病患者并發(fā)腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)增加,其中胰腺癌的風(fēng)險(xiǎn)增加了1.5~2.0 倍[11],合并糖尿病的胰腺癌患者的死亡率顯著高于無糖尿病的患者[1]。此外,患有糖尿病的胰腺癌患者的腫瘤常較大,中位生存期短[13]。高胰島素血癥和高糖已被證明能促進(jìn)胰腺癌的增殖、上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)換及轉(zhuǎn)移潛能[5]。SLC5A1 表達(dá)與葡萄糖攝取、糖酵解等信號(hào)通路的正相關(guān)提示其所編碼的SGLT1 可能參與胰腺癌發(fā)生、進(jìn)展的機(jī)制。通過對(duì)SGLT1 的抑制有望降低腫瘤對(duì)葡萄糖的吸收,進(jìn)而抑制胰腺癌的代謝、生長(zhǎng),具有臨床前景。

        胰腺癌是胰源性糖尿病的重要病因,一項(xiàng)對(duì)PDAC 患者的對(duì)照研究發(fā)現(xiàn),高血糖出現(xiàn)可能早于PDAC 診斷,提示新發(fā)糖尿病可作為胰腺癌的早期預(yù)警指標(biāo)[11]。同時(shí),靶向高血糖也可能有利于胰腺癌防治,經(jīng)典降糖藥物二甲雙胍已被證明與PDAC合并糖尿病患者生存延長(zhǎng)有關(guān),而現(xiàn)今SGLT2 抑制劑及部分SGLT1 及SGLT2 雙抑制劑被作為降糖藥物廣泛應(yīng)用于臨床[14]。此類藥物對(duì)糖尿病患者心衰及慢性腎臟病的改善作用確切,具有減重、低血糖風(fēng)險(xiǎn)低等優(yōu)勢(shì)[11],被美國(guó)、歐洲及我國(guó)等國(guó)家的2 型糖尿病指南推薦[15-17]。與慢性胰腺炎導(dǎo)致的胰源性糖尿病相比,胰腺癌相關(guān)胰源性糖尿病的胰島素水平相對(duì)較高,且外周胰島素抵抗更為顯著[18]。如SGLT1 及SGLT2 雙抑制劑對(duì)胰腺癌有抑制作用,那么在胰腺癌所致胰源性糖尿病患者中應(yīng)用此類藥物有望達(dá)到降糖及抗腫瘤的雙重效果。

        精準(zhǔn)治療是腫瘤治療的重要發(fā)展趨勢(shì)。PDAC 具有高度異質(zhì)性,最近的大規(guī)模轉(zhuǎn)錄分析將其劃分為不同亞型,每種亞型表現(xiàn)為不同臨床特征及代謝特征[11]。本研究分析發(fā)現(xiàn),SLC5A1 的表達(dá)與胰腺祖細(xì)胞型和ADEX 型胰腺癌的關(guān)系更為密切,在胰腺祖細(xì)胞型胰腺癌中SLC5A1 的表達(dá)與FOXA3、HNF1A、FOXA2、HNF1B、PDX1、HNF4G、HNF4A 及HES1 表達(dá)均呈正相關(guān),其大多與肝臟及胰島β 細(xì)胞的調(diào)節(jié)相關(guān);同時(shí),SLC5A1 的表達(dá)與ADEX 型胰腺癌相關(guān)基因中的INS、NR5A2、PRSS3 表達(dá)呈正相關(guān)。NR5A2 調(diào)控炎癥基因的表達(dá),增加胰腺癌的風(fēng)險(xiǎn)[19];PRSS3 在胰腺癌等消化道腫瘤中高表達(dá),促進(jìn)人胰腺癌腫瘤的生長(zhǎng)與轉(zhuǎn)移,認(rèn)為其可能在腫瘤的進(jìn)展過程中參與了腫瘤的侵襲與轉(zhuǎn)移[20],同時(shí),有研究表明在結(jié)直腸癌患者中PRSS表達(dá)水平與癌細(xì)胞對(duì)西妥昔單抗的敏感性呈顯著負(fù)相關(guān)[20],提示在上述亞型胰腺癌中抑制SLC5A1 可能達(dá)到更好的效果,這一發(fā)現(xiàn)需要后續(xù)進(jìn)一步的研究以探討其作用的靶點(diǎn)。

        綜上所述,本研究基于TCGA 胰腺癌數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)SLC5A1 在胰腺癌中高表達(dá),其高表達(dá)與葡萄糖攝取、糖酵解、胰腺分泌的基因信號(hào)通路呈正相關(guān);SLC5A1 高表達(dá)與胰腺祖細(xì)胞型及ADEX 胰腺癌型密切相關(guān),有可能成為胰腺癌代謝治療的新靶點(diǎn)。

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