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        基于HIS數(shù)據(jù)的住院人群癲癇發(fā)作自動監(jiān)測模塊的建立與優(yōu)化

        2022-09-20 08:38:34盧京川郭代紅郭海麗王天琳石廷永解放軍總醫(yī)院醫(yī)療保障中心藥劑科北京0085重慶醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院重慶40006北京康聯(lián)達(dá)軟件有限公司北京00028
        關(guān)鍵詞:癲癇設(shè)置

        盧京川,郭代紅,高 奧,伏 安,李 超,郭海麗,王天琳,石廷永(.解放軍總醫(yī)院醫(yī)療保障中心藥劑科,北京 0085;2.重慶醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院,重慶 40006;.北京康聯(lián)達(dá)軟件有限公司,北京 00028)

        癲癇發(fā)作是腦部異常的神經(jīng)元過度化或同步化活動引起的發(fā)作性事件。全球超過5000萬人受癲癇困擾,癲癇發(fā)作給患者造成巨大的生理及心理傷害,嚴(yán)重影響患者及其家庭的生活質(zhì)量[1]。隨著現(xiàn)代計(jì)算技術(shù)的發(fā)展,大數(shù)據(jù)技術(shù)已廣泛應(yīng)用于癲癇發(fā)作的診斷、預(yù)測及遺傳學(xué)等臨床研究[2]。醫(yī)院信息系統(tǒng)(hospital information system,HIS)中包含大量與癲癇發(fā)作相關(guān)的數(shù)據(jù),包括癥狀描述、腦電圖檢查、神經(jīng)影像檢查、抗癲癇藥物用藥記錄等可供研究的臨床信息。但由于數(shù)據(jù)類型多樣,提取難度大,國內(nèi)鮮有對癲癇發(fā)作的大樣本真實(shí)世界研究[3]。本研究基于團(tuán)隊(duì)自主研發(fā)的“臨床ADE主動監(jiān)測與智能評估警示系統(tǒng)-Ⅱ[4](adverse drug events active surveillance and assessment system-Ⅱ,ADE-ASAS-Ⅱ)”構(gòu)建住院患者癲癇發(fā)作自動監(jiān)測模塊,旨為住院人群癲癇發(fā)作的大樣本真實(shí)世界研究提供高效、全面、可靠的研究工具。

        1 資料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)資料

        數(shù)據(jù)來源于某三甲醫(yī)院HIS數(shù)據(jù)庫,監(jiān)測對象為有醫(yī)囑記錄的住院患者。收集信息包括患者人口學(xué)資料、診斷記錄、病程記錄、醫(yī)囑信息等。

        1.2 陽性病例判斷標(biāo)準(zhǔn)及模塊評價(jià)指標(biāo)

        參照中國抗癲癇協(xié)會編著的《臨床診療指南癲癇病分冊》(2015修訂版)[5]中各類癲癇發(fā)作的典型臨床表現(xiàn)及發(fā)作特點(diǎn),評估住院患者的發(fā)作表現(xiàn)及癥狀持續(xù)時(shí)間是否符合癲癇發(fā)作短暫性、刻板性、重復(fù)性的特點(diǎn)。符合癲癇發(fā)作特點(diǎn)的患者若滿足以下任意一條納入標(biāo)準(zhǔn),則判定為陽性病例。納入標(biāo)準(zhǔn):①經(jīng)醫(yī)生診斷為“癲癇發(fā)作”或“癲癇持續(xù)狀態(tài)”;②使用抗癲癇藥物;③腦電圖檢查顯示有癲癇樣放電。排除標(biāo)準(zhǔn):電子病歷信息不全的患者。

        自動監(jiān)測模塊評價(jià)指標(biāo):陽性預(yù)測值(positive predictive value,PPV):報(bào)警病例中的真陽性病例數(shù)占報(bào)警病例總數(shù)的比值;召回率(recall rate,R):報(bào)警病例中的真陽性病例數(shù)占陽性病例總數(shù)的百分比。

        1.3 癲癇發(fā)作自動監(jiān)測規(guī)則建立與驗(yàn)證

        首先建立癲癇發(fā)作相關(guān)的初始關(guān)鍵詞集,依托ADE-ASAS-Ⅱ的文本分類技術(shù)高效識別HIS電子病歷中的上述詞集[6],開展預(yù)實(shí)驗(yàn)。將初始關(guān)鍵詞集篩分為不同屬性的關(guān)鍵詞集,作為決策樹各分支的分類標(biāo)準(zhǔn)。通過ADE-ASAS-Ⅱ中的文本分類技術(shù)和決策樹的分類功能將癲癇發(fā)作病例與其他病例進(jìn)行拆分,從而得到目標(biāo)病例。利用ADE-ASAS-Ⅱ自定義功能和標(biāo)題屏蔽功能對模塊的報(bào)警規(guī)則進(jìn)行優(yōu)化,確定能夠獲得相對理想PPV和R的模塊最佳設(shè)置;再擴(kuò)大監(jiān)測樣本量,驗(yàn)證模塊的穩(wěn)定性,具體流程見圖1。

        圖1 癲癇發(fā)作模塊建立流程圖A – 初始關(guān)鍵詞集,B – 決策樹報(bào)警關(guān)鍵詞設(shè)置示意圖Fig 1 Flowchart of the seizure module establishmentA – initial keywords, B – diagram of decision tree with arm keyword setting

        1.4 數(shù)據(jù)處理

        采用SPSS 22.0軟件對癲癇發(fā)作人口學(xué)特征、發(fā)作類型及發(fā)作原因進(jìn)行統(tǒng)計(jì)描述,使用單向K-S檢驗(yàn)確定連續(xù)變量的分布模式,符合正態(tài)分布的連續(xù)變量采用均值±標(biāo)準(zhǔn)差描述,非正態(tài)分布數(shù)據(jù)采用中位數(shù)和四分位數(shù)描述,計(jì)數(shù)資料采用頻數(shù)及百分比描述;癲癇發(fā)作病因采用MedDRA 24.0首選術(shù)語(preferred term,PT)進(jìn)行整理,癲癇發(fā)作類型按照2017國際抗癲癇聯(lián)盟提出的方法進(jìn)行分類[7]。當(dāng)同一患者多次入院時(shí),分別計(jì)算例次;入院后多次發(fā)作,以首次發(fā)作為準(zhǔn)。

        2 模塊報(bào)警規(guī)則的建立與優(yōu)化

        2.1 預(yù)實(shí)驗(yàn)

        參考國內(nèi)外指南共識、自發(fā)報(bào)告數(shù)據(jù)庫、期刊文獻(xiàn)等,收集到90個(gè)初始關(guān)鍵詞(圖1),利用ADEASAS-Ⅱ的文本分類功能提取2021年11月2日3357例住院患者病歷中包含上述關(guān)鍵詞的電子病歷,得到報(bào)警病例1428例,經(jīng)人工逐例評估,得到癲癇發(fā)作陽性病例38例。

        根據(jù)38例陽性病例電子病歷中與癲癇發(fā)作相關(guān)的診斷記錄、癥狀描述、腦電圖檢查報(bào)告及抗癲癇藥物使用記錄,對初始關(guān)鍵詞進(jìn)行初篩,刪除出現(xiàn)頻率低、納入出現(xiàn)頻率高的詞語。將初篩后的關(guān)鍵詞分類歸納為4個(gè)不同屬性的子詞集:①藥物關(guān)鍵詞集;②診斷關(guān)鍵詞集;③癥狀關(guān)鍵詞集;④腦電圖關(guān)鍵詞集。詳見表1。

        表1 決策樹各分支報(bào)警關(guān)鍵詞初始設(shè)置Tab 1 Initial setting of alarm keywords in each branch of decision tree

        模塊報(bào)警規(guī)則主要基于文本分類技術(shù)與決策樹模型,將不同詞集作為各分支監(jiān)測單元的報(bào)警關(guān)鍵詞,分支1設(shè)置藥物關(guān)鍵詞集;分支2設(shè)置診斷關(guān)鍵詞集;分支3與分支4分別設(shè)置癥狀關(guān)鍵詞集和腦電圖關(guān)鍵詞集,決策樹結(jié)構(gòu)見圖1。自動掃描各分支監(jiān)測單元,若出現(xiàn)報(bào)警關(guān)鍵詞,即報(bào)警。決策樹各分支關(guān)鍵詞初始設(shè)置及監(jiān)測單元可見表1。

        2.2 模塊報(bào)警規(guī)則的初始設(shè)置與優(yōu)化

        為更有效地檢驗(yàn)關(guān)鍵詞集的敏感性,研究選擇不同時(shí)段的住院人群進(jìn)行模塊建立、優(yōu)化和驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)。對2021年8月1日 – 7日期間的5557例住院患者病歷逐一進(jìn)行人工審閱,最終得到陽性病例51例。以此作為模塊報(bào)警規(guī)則優(yōu)化的測試數(shù)據(jù),計(jì)算PPV和R評估模塊報(bào)警規(guī)則的準(zhǔn)確性[8]。

        2.2.1 藥物關(guān)鍵詞集優(yōu)化方案參考癲癇診療相關(guān)指南[5],結(jié)合醫(yī)院實(shí)際用藥情況,將左乙拉西坦等10種抗癲癇藥物作為藥物關(guān)鍵詞設(shè)置的初始方案。將是否納入咪達(dá)唑侖注射液、卡馬西平、苯妥英鈉作為三種優(yōu)化方案,詳見表2。結(jié)果顯示,在刪除上述三種藥物后,陽性病例未丟失,報(bào)警人數(shù)減少59例,陽性預(yù)測值從6.39%提升至6.90%,詳見表3。

        表2 藥物關(guān)鍵詞集設(shè)置方案Tab 2 Drug keywords setting scheme

        表3 藥物關(guān)鍵詞集優(yōu)化測試結(jié)果Tab 3 Optimization test results of drug keywords setting

        2.2.2 診斷關(guān)鍵詞集優(yōu)化方案由于癲癇發(fā)作類型多樣,故將不同的診斷關(guān)鍵詞集作為優(yōu)化測試方案。由于決策樹結(jié)構(gòu)特點(diǎn),被藥物關(guān)鍵詞識別的陽性病例,不會進(jìn)入分支2的診斷關(guān)鍵詞識別,故需統(tǒng)計(jì)各方案中僅由診斷關(guān)鍵詞可識別的陽性病例數(shù),以此評估診斷關(guān)鍵詞集的適用性,各方案設(shè)置詳見表4。結(jié)果顯示,方案D報(bào)警人數(shù)為739例,可識別45例陽性病例;與方案D相比,方案E報(bào)警人數(shù)636例,但僅可識別27例陽性病例;方案F報(bào)警人數(shù)698例,可識別34例陽性患者,詳見表5。

        表4 診斷關(guān)鍵詞集設(shè)置方案Tab 4 Diagnosis keywords setting scheme

        表5 診斷關(guān)鍵詞集優(yōu)化方案測試結(jié)果Tab 5 Optimization test results of diagnostic keywords setting

        2.2.3 電子病歷標(biāo)題屏蔽設(shè)置電子病歷包含部分結(jié)構(gòu)化文本,如知情同意書等,存在大量假陽性報(bào)警信息。借助ADE-ASAS-Ⅱ的標(biāo)題屏蔽功能,屏蔽以下文件中包含的關(guān)鍵詞報(bào)警,各方案設(shè)置可見表6,屏蔽后測試結(jié)果見表7。

        表6 標(biāo)題屏蔽設(shè)置方案Tab 6 Title shielding setting scheme

        表7 標(biāo)題屏蔽關(guān)鍵詞設(shè)置測試結(jié)果Tab 7 Test results of title shielding keywords setting

        2.3 癲癇發(fā)作自動監(jiān)測模塊的最佳設(shè)置

        經(jīng)過預(yù)實(shí)驗(yàn)和各關(guān)鍵詞集的優(yōu)化以及標(biāo)題屏蔽設(shè)置,模塊PPV從2.66%提升至13.86%,R均為100.00%。最終確定7個(gè)藥物關(guān)鍵詞、13個(gè)癲癇關(guān)鍵詞、9個(gè)癥狀關(guān)鍵詞、8個(gè)腦電圖關(guān)鍵詞以及屏蔽12個(gè)標(biāo)題關(guān)鍵詞為模塊最佳設(shè)置,詳見表8。

        表8 模塊最佳設(shè)置條件Tab 8 Module optimal setting conditions

        3 癲癇發(fā)作自動監(jiān)測模塊的驗(yàn)證

        利用優(yōu)化后的模塊,監(jiān)測某院2021年5月共14 549例住院患者,共報(bào)警617人,經(jīng)人工甄別得到癲癇發(fā)作患者90例,其中急性癥狀性癲癇發(fā)作53例,其人口學(xué)特點(diǎn)及發(fā)作類型分布見表9。發(fā)作病因包括神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤手術(shù)、卒中后癲癇發(fā)作、自身免疫性腦炎及藥品不良反應(yīng)等,詳見表10。

        表9 癲癇發(fā)作病例的人口學(xué)特點(diǎn)及發(fā)作類型分布. n = 90Tab 9 Demographic characteristics and distribution of seizure types. n = 90

        表10 急性癥狀性癲癇發(fā)作病因分布. n = 53Tab 10 Causes distribution of acute symptomatic seizures. n = 53

        4 討論

        4.1 文本挖掘聯(lián)合決策樹分類可實(shí)現(xiàn)住院患者癲癇發(fā)作自動監(jiān)測

        模塊的報(bào)警規(guī)則是利用文本分類技術(shù)結(jié)合決策樹實(shí)現(xiàn)的,可同時(shí)監(jiān)測醫(yī)囑信息、電子病程、檢查記錄,通過決策樹迭代劃分,逐層挖掘目標(biāo)病例[9]。首先將住院人群中出現(xiàn)癲癇發(fā)作的人群按照是否使用抗癲癇藥物分類,使用抗癲癇藥物的人群可通過決策樹分支1設(shè)置的藥物關(guān)鍵詞識別;對于未使用抗癲癇藥物的癲癇發(fā)作人群,如代謝紊亂或藥物導(dǎo)致的癲癇發(fā)作,臨床可能通過糾正電解質(zhì)紊亂或停用可疑藥物處理,此類人群可通過分支2設(shè)置的診斷關(guān)鍵詞集識別;若患者僅出現(xiàn)疑似癲癇發(fā)作的癥狀,則需結(jié)合腦電圖檢查做出判斷[10],故分支3與分支4的關(guān)鍵詞設(shè)置可同時(shí)檢測其癥狀表現(xiàn)與腦電圖信號,從而實(shí)現(xiàn)此類人群的監(jiān)測。使用決策樹設(shè)置報(bào)警關(guān)鍵詞可從癲癇發(fā)作的解救藥物、診斷評估、臨床癥狀以及腦電圖表現(xiàn)等多角度全方位監(jiān)測疑似癲癇發(fā)作的人群,經(jīng)過多層篩選分類,最大程度避免了陽性病例的丟失。

        4.2 關(guān)鍵詞集優(yōu)化與電子病歷標(biāo)題屏蔽顯著提升監(jiān)測效率

        模塊的優(yōu)化思路是在盡量保證其敏感性的前提下,降低假陽性報(bào)警例數(shù)。由于苯妥英鈉目前臨床使用率普遍較低;卡馬西平有多種臨床適應(yīng)證;咪達(dá)唑侖注射液是癲癇持續(xù)狀態(tài)的一線解救藥物[11],但在臨床更多用于手術(shù)前用藥[12],故將這三種藥物刪除。診斷關(guān)鍵詞測試實(shí)驗(yàn)中,需考慮癲癇發(fā)作類型與病歷書寫習(xí)慣的多樣性,故增加“突發(fā)癲癇”等病歷中常見的癲癇發(fā)作同義詞作為最終設(shè)置。模塊通過藥物關(guān)鍵詞與診斷關(guān)鍵詞可挖掘98%以上的陽性病例,癥狀關(guān)鍵詞與腦電圖關(guān)鍵詞設(shè)置可根據(jù)實(shí)際情況靈活增減,旨在查漏補(bǔ)缺,保證模塊敏感性。此外,通過ADE-ASAS-Ⅱ的標(biāo)題屏蔽功能,實(shí)現(xiàn)對部分結(jié)構(gòu)化文件的屏蔽,降低假陽性報(bào)警例數(shù)。最終,模塊的PPV從預(yù)實(shí)驗(yàn)的2.66%上升至優(yōu)化后的13.86%,顯著降低了工作量,提升了監(jiān)測效率。

        4.3 基于非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)智能監(jiān)測獲得精準(zhǔn)大樣本癲癇發(fā)作真實(shí)世界證據(jù)

        目前,國內(nèi)外學(xué)者對癲癇相關(guān)的大數(shù)據(jù)研究多利用腦電圖或神經(jīng)影像相關(guān)數(shù)據(jù)[13],此類數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化程度較高,獲取相對容易。本研究利用文本分類技術(shù)開展對住院人群癲癇發(fā)作的主動監(jiān)測,其優(yōu)勢在于,可以全面、靈活的挖掘癲癇發(fā)作病例信息,更貼合臨床實(shí)際。因在臨床實(shí)踐中,并非所有癲癇發(fā)作的患者都會被診斷為癲癇癥[14],尤其對于急性癥狀性癲癇發(fā)作的患者,在糾正繼發(fā)性病因或應(yīng)用抗癲癇藥物后好轉(zhuǎn)。研究[15]顯示,僅45%的繼發(fā)性癲癇發(fā)作患者在首次腦電圖檢查中檢測出癲癇樣放電,故此類人群的電子病歷中的文本信息對癲癇發(fā)作的評估尤為重要。但其劣勢在于電子病歷中的自由文本屬于非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),采集利用耗時(shí)耗力[16]。為克服這一缺陷,本研究首次采用決策樹將報(bào)警關(guān)鍵詞分類預(yù)設(shè),對目標(biāo)人群分層預(yù)警,高效全面挖掘目標(biāo)人群。癲癇發(fā)作自動監(jiān)測模塊目前作為單中心的研究成果,有待在不同醫(yī)療機(jī)構(gòu)驗(yàn)證,而ADE-ASA-Ⅱ自定義功能與靈活的決策樹設(shè)置可為癲癇發(fā)作多中心真實(shí)世界研究提供有利條件[17]。

        4.4 住院患者癲癇發(fā)作病例的特點(diǎn)分析

        在90例癲癇發(fā)作病例中,患者年齡分布呈兩極化,多見于男性,這與Hauser等[18]的研究類似。隨著腦電圖及神經(jīng)影像技術(shù)的發(fā)展,部分癲癇發(fā)作的病因得以明確[19]。急性癥狀性癲癇發(fā)作是指在全身性損害時(shí)發(fā)生的或明確與腦損傷有密切時(shí)間關(guān)聯(lián)的癲癇發(fā)作[20],本研究53例急性癥狀性癲癇發(fā)作病例中,神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤術(shù)后、卒中后癲癇及自身免疫性腦炎是最常見的致病因素,與國內(nèi)相關(guān)研究基本一致[21]。隨著人口老齡化,老年人共患疾病增多,藥物聯(lián)用頻率增加,藥物所致癲癇發(fā)作日益增加,應(yīng)引起重視[22]。研究表明,急性癥狀性癲癇發(fā)作發(fā)生率為0.03% ~0.04%[18],明顯低于本研究中的0.36%,可能是本研究的研究對象為住院患者,多合并基礎(chǔ)疾病,癲癇發(fā)作的風(fēng)險(xiǎn)因素更多。鑒于本研究監(jiān)測樣本量較小,住院人群癲癇發(fā)作的發(fā)生率及風(fēng)險(xiǎn)因素仍需進(jìn)一步的大樣本真實(shí)世界研究驗(yàn)證。

        本研究借助ADE-ASAS-Ⅱ建立的癲癇發(fā)作自動監(jiān)測模塊,能夠高效、全面、快捷的挖掘住院人群中的癲癇發(fā)作病例,模塊的PPV在13.86% ~ 14.59%,R可達(dá)到100.00%,雖仍需人工甄別報(bào)警病例中的癲癇發(fā)作患者,但應(yīng)用此模塊可剔除95%以上的無關(guān)病例,極大程度上提高了工作效率,可為癲癇發(fā)作的大樣本真實(shí)世界研究提供有力的技術(shù)支撐。

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