金科華
(1.湖北科技學院醫(yī)學部醫(yī)藥研究院,湖北 咸寧 437100;2.湖北科技學院醫(yī)學部基礎醫(yī)學院)
有氧糖酵解是很多腫瘤細胞的重要特征之一,抑制有氧糖酵解是富有前景的抗腫瘤策略[1]。磷酸甘油酸變位酶(phosphoglycerate mutase 1,PGAM1)是糖酵解途徑的重要酶,催化3-磷酸甘油酸和2-磷酸甘油酸之間的互變,協(xié)調糖酵解、絲氨酸生成和磷酸戊糖途徑[2],研究表明PGAM1高表達與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關[3-4],可抑制PGAM1的活性[5-9]或降低其表達水平[10],阻礙腫瘤細胞生長。本研究利用重組DNA技術,在大腸桿菌中表達和純化PGAM1,為后續(xù)抑制劑的篩選和其他研究奠定基礎。
大腸桿菌、HiFi DNA Polymerase、DNA marker購自北京全式金生物技術公司。PGAM1 cDNA由廈門大學韓家淮院士饋贈??敲顾亍PTG、質粒提取試劑盒、膠回收試劑盒購自生工生物工程(上海)股份有限公司。限制性核酸內切酶購自NEB公司。DNA連接試劑盒購自TaKaRa公司。His-Tag蛋白純化試劑盒(可溶性)購自康為世紀生物科技有限公司。BCA蛋白質定量測定試劑盒購自Bio-sharp公司。截流分子量10kd超濾管(15mL)購自Millipore公司。
設計引物。利用SnapGene軟件設計擴增PGAM1 cDNA的引物。正向引物PF序列為:CGACATATGATGGCCGCCTACAAACTGG;反向引物PR序列為:AGTCTCGAGTCACTTCTTGGCCTTGCCC。下劃線標記的序列分別為Nde I和Xho I位點。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
獲取cDNA模板。將含PGAM1 cDNA的菌液按1∶100接種于含100μg/mL氨芐青霉素的LB,37℃,220r/min培養(yǎng)24h,按質粒抽提試劑盒提取含PGAM1 cDNA的未知質粒。
PCR擴增cDNA。PCR體系:cDNA模板1μL,引物PF(10μmol/L)和PR(10μmol/L)各1μL,10×HiFi Buffer Ⅱ 5μL,2.5mmol/L dNTPs 4μL,HiFi DNA Polymerase 0.5μL,H2O 37.5μL。PCR參數(shù):95℃預變性3min;94℃變性30s,60℃退火30s,72℃延長1min,循環(huán)30次;72℃延長10min。擴增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定后,膠回收試劑盒純化。
按表1酶切cDNA與pET-28a。酶切產(chǎn)物行瓊脂糖凝膠電泳分離、膠回收純化。取酶切純化的cDNA、pET-28a 各2.5μL與DNA連接試劑I 5μL,混勻,于16℃連接1h。按DH5α感受態(tài)細胞說明書,將連接產(chǎn)物進行熱激轉化,并于含卡那霉素的LB平板(LBK平板)篩選抗性菌落。
表1 DNA的酶切
重組質粒pET-28a-PGAM1(記為28a-PAM)按表1酶切,產(chǎn)物于0.8%瓊脂糖凝膠電泳分離鑒定。酶切鑒定與預期相符重組質粒送華大基因測序。
按1.3的方法,將28a-PAM轉化BL21(DE3)細胞,挑抗性單菌落接種于5mL LBK培養(yǎng)基,37℃ 220r/m培養(yǎng)過夜。取過夜培養(yǎng)的菌液1mL接種于100mL LBK培養(yǎng)基,37℃ 220r/m培養(yǎng)至OD600為0.86,加入終濃度0.1mmol/L IPTG,16℃誘導培養(yǎng)24h。12 000r/min,4℃離心收集菌體。加10mL細菌蛋白抽提緩沖液(含1mmol/L PMSF)重懸細胞,以260W超聲10s停10s的程序,超聲1h裂解細胞。細胞裂解液于12 000r/min,4℃離心10min。將上清與等體積的不含咪唑的Binding Buffer混勻,得混合液。取1.5mL Ni2+填料,裝入重力純化柱,按說明書洗滌與平衡。在4℃冰箱純化PGAM1:將混合液加入純化柱,純化柱出口連接一次性輸液器管,調節(jié)流速至0.5mL/min,流出未結合蛋白。分別用含20、40mmol/L咪唑的Binding Buffer各40mL洗滌填料上的非特異性結合蛋白,再用20mL Elution Buffer洗脫PGAM1。
將純化的PGAM1裝入截留分子量10KD的超濾管,4℃ 4 000×g離心濃縮至1mL,加入9mL不含咪唑的Binding Buffer稀釋濃縮液,再次離心濃縮至1mL,重復稀釋—濃縮6次,徹底降低PGAM1溶液中的咪唑濃度。
取10μL濃縮的PGAM1,用PBS稀釋10倍,按BCA蛋白質濃度測定試劑盒測定PGAM1濃度。向剩余PGAM1中加入終濃度2mmol/L PMSF后與等體積的甘油混勻,分裝后保存于-20℃,備用。
PCR產(chǎn)物電泳結果如圖1,PCR擴增后有略大于750bp的條帶,與PGAM1 cDNA分子量(765bp)相符(泳道1),陰性對照無擴增條帶(泳道2)。
M:DL2000 DNA marker;1:PGAM1 cDNA PCR產(chǎn)物;2:陰性對照PCR產(chǎn)物
2.2.1 酶切鑒定
重組質粒28a-PAM經(jīng)NdeI+Xho I酶切后出現(xiàn)兩種DNA片段。大片段與pET-28a經(jīng)相同酶切的產(chǎn)物(圖2泳道1)相符,小片段(圖2泳道2)與PGAM1 cDNA分子量(765bp)吻合。可知PCR產(chǎn)物已插入pET-28a質粒中。
M1:1kb DNA marker;1:pET-28a Nde I+Xho I酶切產(chǎn)物;2:pET-28a-PGAM1 Nde I+Xho I酶切產(chǎn)物;M2:DL2000 DNA marker
2.2.2 測序鑒定
重組質粒DNA測序結果表明連入pET-28a中的序列與cDNA序列一致,讀碼正確,正向測序的部分信號峰如圖3所示。藍色下劃線序列為pET-28a Nde I位點,紅色箭頭序列為PGAM1的起始密碼子編碼序列。
圖3 pET-28a-PGAM1部分測序峰圖
PGAM1表達產(chǎn)物如圖4所示。0.1mmol/L IPTG誘導的28a-PAM-BL21(DE3)裂解液上清中有一條介于25~35Ku粗帶(泳道2),與PGAM分子量(29Ku)相符,未經(jīng)IPTG誘導的菌體無此條帶(泳道1),可見PGAM獲得了可溶性表達,經(jīng)Ni2+純化的PGAM1雜帶少,純度高。PGAM1經(jīng)超濾濃縮和緩沖液交換后,測定其濃度約為12mg/mL,可知PGAM的表達量約120mg/mL。
M:蛋白質Marker;1:28a-PAM-BL21(DE3)未經(jīng)IPTG誘導的上清;2:28a-PAM-BL21(DE3)0.2mmol/L IPTG誘導的上清;3:純化的PGAM1
PGAM1在多種腫瘤細胞中高表達,宋宜鵬等[11]發(fā)現(xiàn)PGAM1在胃癌組織的表達水平明顯高于癌旁組織,與胃癌臨床病理特征相關。近年已有研究認為PGAM有望成為腫瘤治療的靶點在[1]。Wang等[12]合成了一系列基于N-氧雜蒽酮酰胺基苯磺酰胺母核的PGAM1的抑制劑,其中編號為15h的化合物對PGAM1抑制活性最強,IC50約2.1μmol/L,細胞實驗表明,15h能有效抑制人非小細胞肺癌H1299細胞的增值。Liang等[6]發(fā)現(xiàn)小分子化合物HBK99通過別構抑制PGAM1,能逆轉非小細胞肺癌細胞對埃羅替尼的抗性。
本研究構建了PGAM1的原核表達載體pET28a-PGAM1,并在宿主菌BL21(DE3)中獲得了可溶性PGAM,產(chǎn)量達120mg/mL。通過大體積低濃度咪唑溶液的反復洗滌,有效去除雜蛋白,保證PGAM1的高純度。為避免咪唑對PGAM1濃度測定及酶活性的影響,本文采用反復超濾—緩沖液交換的策略,徹底降低PGAM1溶液中殘存咪唑的濃度,為后續(xù)酶活性的測定、抑制劑的篩選、蛋白質結晶和其它功能的研究奠定了堅實的基礎。
PGAM1在LKB培養(yǎng)基中,通過低濃度IPTG(0.1mmol/L),16℃誘導培養(yǎng)24h,產(chǎn)量已達到120mg/mL,足夠后續(xù)研究對酶量的需求,無需進一步優(yōu)化其它表達條件。