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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學的膽黃潤腸丸治療慢傳輸型便秘作用機制研究※

        2022-09-06 02:59:46楊洪元高素琴
        中醫(yī)藥通報 2022年8期
        關(guān)鍵詞:潤腸靶點數(shù)據(jù)庫

        金 瑩 居 羚 黃 瑋 楊洪元 高素琴

        慢傳輸型便秘(slow transit constipation,STC)約占便秘的16%~40%,是功能性便秘的常見類型,多見于老年人和女性患者[1]。隨著社會人口的老齡化,飲食結(jié)構(gòu)的改變以及精神心理和社會因素的影響[2],STC發(fā)病率呈上升趨勢。由于STC病因復雜多樣,臨床癥狀頑固,西醫(yī)對癥、手術(shù)治療效果欠佳[3]。中醫(yī)治療便秘歷史悠久,經(jīng)驗豐富。便秘之癥始見于《黃帝內(nèi)經(jīng)》,稱之為“后不利”“大便難”。相關(guān)研究[4]發(fā)現(xiàn),STC的中醫(yī)證型以氣虛腸燥證、氣陰兩虛證和脾腎陽虛證為主,對STC的中醫(yī)治療具有指導意義?,F(xiàn)代中醫(yī)臨床治療STC 多以通下為主,并輔以生津潤腸、益氣健脾等藥進行綜合調(diào)理[5]。國內(nèi)一些學者采用雙盲、隨機、安慰劑對照法對中藥治療STC的療效和安全性進行了驗證,并得到了國際業(yè)內(nèi)人士的肯定[6-8]。

        膽黃潤腸丸(蘇藥制字Z04001225)由大黃和豬膽膏兩味中藥組成,為江蘇省常州市中醫(yī)醫(yī)院全國名老中醫(yī)周玉祥教授遵循“六腑以通為用”“六腑以通為補”的治則而擬的臨證經(jīng)驗方,具有潤腸通便、清熱解毒的功效,臨床適用于痔瘡手術(shù)及便秘等病癥,對老年功能性便秘效果尤佳[9]。該院內(nèi)制劑已有50 余年的創(chuàng)方史及臨床應(yīng)用基礎(chǔ),因處方組成精練、制劑工藝簡易、患者服用方便,有著良好的臨床療效和應(yīng)用前景。江蘇省常州市中醫(yī)醫(yī)院前期雖對該特色制劑開展了一系列的臨床療效觀察、質(zhì)量標準提高和藥理實驗等研究工作[10-16],但獲得的信息較為片面,無法系統(tǒng)全面地闡明膽黃潤腸丸的作用機制。本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學方法,對膽黃潤腸丸所含藥物的多成分、多靶點和疾病之間復雜的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系進行研究,為揭示膽黃潤腸丸治療STC的作用機制提供參考。

        1 資料與方法

        1.1 膽黃潤腸丸活性成分的篩選用關(guān)鍵詞“大黃”檢索中藥系統(tǒng)藥理數(shù)據(jù)庫和分析平臺TCMSP(https://tcmsp-e.com),以口服利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18作為大黃活性成分的篩選標準[17],采集大黃活性成分的基本屬性信息,點擊活性成分結(jié)構(gòu)式獲得mol2文件備用。在中國知網(wǎng)CNKI(https://www.cnki.net)檢索豬膽粉相關(guān)文獻[18-19]獲得主要成分化學名,利用有機小分子生物活性數(shù)據(jù)庫PubChem(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)確定豬膽粉主要成分的結(jié)構(gòu)式及基本參數(shù),依據(jù)Lipinski五規(guī)則[20]:分子量(MW)<500、氫鍵給體數(shù)目(Hdon)<5、氫鍵受體數(shù)目(Hacc)<10、脂水分配系數(shù)(AlogP)<5、可旋轉(zhuǎn)鍵的數(shù)量(RBN)<10篩選出豬膽粉的活性成分,并下載有效化合物的sdf 文件備用。

        1.2 膽黃潤腸丸活性成分潛在靶點預(yù)測匯總大黃活性成分的mol 2文件與豬膽粉活性成分的sdf文件,借助藥效團匹配與潛在識別靶標平臺PharmMapper(http://lilab-ecust.cn/pharmmapper/)預(yù)測膽黃潤腸丸活性成分的潛在靶點。靶標選擇“Human Protein Targets Only”,獲取大黃與豬膽粉活性成分的csv文件后,以Norm Fit>0.9作為有效靶點的篩選條件,并通過蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫Uniprot(https://www.uniprot.org)進一步規(guī)范靶點基因名,將其校正為官方名。

        1.3 構(gòu)建膽黃潤腸丸“藥物-活性成分-靶點”網(wǎng)絡(luò)將大黃和豬膽粉有效靶點的基因信息整理為膽黃潤腸丸的network文件和type文件,利用生物信息分析軟件Cytoscape 3.7.1 構(gòu)建膽黃潤腸丸的“藥物-活性成分-靶點”網(wǎng)絡(luò)。根據(jù)節(jié)點度值(Degree)調(diào)整圖標尺寸和顏色深淺,并將活性成分節(jié)點按度值大小順序排列。

        1.4 慢傳輸型便秘關(guān)聯(lián)靶點與“藥物-疾病”交集靶點篩選用關(guān)鍵詞“slow transit constipation”檢索在線《人類孟德爾遺傳》數(shù)據(jù)庫OMIM(https://omim.org)和人類基因綜合數(shù)據(jù)庫Genecards(https://www.genecards.org),兩庫篩選得到的靶點進一步整合去重即為STC 的關(guān)聯(lián)靶點。將膽黃潤腸丸和慢傳輸型便秘關(guān)聯(lián)靶點上傳在線平臺Venny 2.1(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny),獲得“藥物-疾病”交集靶點及韋恩圖。

        1.5 構(gòu)建“化合物-疾病”交集靶點互作網(wǎng)絡(luò)(PPI)應(yīng)用蛋白互作數(shù)據(jù)庫STRING(https://www.string-db.org)構(gòu)建交集靶點的互作網(wǎng)絡(luò)(PPI),“Multiple proteins”菜單欄輸入“藥物-疾病”交集靶點列表,“Organism”項選擇“Homo sapiens”,“medium confidence”設(shè)置為0.4,獲得“化合物-疾病”交集靶點PPI。將下載的tsv 文件導入Cytoscape 3.7.1 軟件,根據(jù)靶點相互作用的度值重新布局“化合物-疾病”交集靶點互作網(wǎng)絡(luò)。

        1.6 GO 和KEGG 通路富集分析應(yīng)用Metascape(https://www.metascape.org)數(shù)據(jù)庫進行基因本體(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)的富集分析,輸入“藥物-疾病”交集靶點列表,“Input as species”選擇“H.sapiens”,點擊“Custom Analysis”進入Enrichment 菜單頁,“P Value Cutoff”設(shè)置為0.01,分別對KEGG 和GO 進行富集分析?!癆nalysis Report Page”頁截取GO 通路信息,借助生信結(jié)果作圖網(wǎng)站微生信(http://www.bioinformatics.com.cn)制作GO 富集BP、MF、CC三合一柱狀圖,以及KEGG富集氣泡圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 膽黃潤腸丸活性成分篩選結(jié)果TCMSP數(shù)據(jù)庫共檢索到大黃成分92個,以O(shè)B≥30%、DL≥0.18為篩選標準,獲得大黃活性成分16 個,詳見表1。因TCMSP數(shù)據(jù)庫尚未收載豬膽粉品種信息,故采用自主建庫模式篩選該中藥的活性成分。檢索文獻發(fā)現(xiàn),豬膽粉含有結(jié)合型膽酸、游離型膽酸、膽色素和氨基酸等19種主要成分。依據(jù)Lipinski五規(guī)則篩選PubChem數(shù)據(jù)庫內(nèi)豬膽粉成分基本參數(shù),共獲得豬膽粉活性成分8個,詳見表2。

        表1 大黃有效化合物基本信息表

        表2 豬膽粉有效化合物基本信息表

        2.2 膽黃潤腸丸活性成分靶點預(yù)測結(jié)果以Norm Fit>0.9 為篩選標準,借助PharmMapper 平臺共得到大黃潛在靶點421 個、豬膽粉潛在靶點189 個。通過蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫Uniprot 的Retrieve/ID mapping 功能進一步規(guī)范潛在靶點的基因名,去重后最終獲得膽黃潤腸丸活性成分潛在靶點97個。

        2.3 構(gòu)建膽黃潤腸丸“藥物-活性成分-靶點”網(wǎng)絡(luò)利用Cytoscape 3.7.1構(gòu)建膽黃潤腸丸的“藥物-活性成分-靶點”網(wǎng)絡(luò),如圖1所示,該網(wǎng)絡(luò)共包含123個節(jié)點(2個藥物節(jié)點、24個活性成分節(jié)點和97個靶點節(jié)點)和634 條邊。其中,正方形為藥物圖標,圓形為活性成分圖標,菱形為靶點圖標。節(jié)點度值(degree)越大,圖標越大,顏色越深,度值前五的靶點分別為CA2(degree=22)、PIM1(degree=18)、STS(degree=18)、TTR(degree=18)、PPIA(degree=17)。

        圖1 膽黃潤腸丸“藥物-化合物-靶點”網(wǎng)絡(luò)圖

        2.4 慢傳輸型便秘關(guān)聯(lián)靶點與“藥物-疾病”交集靶點篩選結(jié)果用關(guān)鍵詞“slow transit constipation”檢索OMIM和Genecards數(shù)據(jù)庫,去重后得到STC相關(guān)靶點1005個。借助在線平臺Venny 2.1繪制膽黃潤腸丸與STC 交集靶點韋恩圖,共得到“藥物-疾病”交集靶點38個,詳見圖2。與交集靶點密切相關(guān)的藥物活性成分主要為原花青素B-5,3'-O-沒食子酸酯、番瀉甙D、大黃素甲醚雙葡萄糖甙和豬膽酸等。

        圖2 膽黃潤腸丸-慢傳輸型便秘交集靶點圖

        2.5 構(gòu)建“藥物-疾病”交集靶點蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(PPI)應(yīng)用STRING 數(shù)據(jù)庫構(gòu)建“藥物-疾病”交集靶點互作網(wǎng)絡(luò),可知該網(wǎng)絡(luò)由38 個節(jié)點、211 條邊組成,平均節(jié)點度值為11.1。借助Cytoscape 3.7.1 重新布局交集靶點互作網(wǎng)絡(luò),如圖3所示,度值(degree)越大則節(jié)點圖標越大,相互作用越強則節(jié)點連線越粗。由圖可見,該互作網(wǎng)絡(luò)中的核心靶點分別為:ALB(degree=32)、EGFR(degree=26)、CASP3(degree=25)、ESR1(degree=23)、HSP90AA1(degree=20)。

        圖3 膽黃潤腸丸-慢傳輸型便秘交集靶點互作網(wǎng)絡(luò)圖

        2.6 “藥物-疾病”交集靶點GO 和KEGG 通路富集分析結(jié)果應(yīng)用Metascape 數(shù)據(jù)庫進行膽黃潤腸丸與慢傳輸型便秘38 個交集靶點的GO 和KEGG 富集分析,并通過微生信可視化平臺在線作圖。由GO 富集分析圖(圖4)可見,生物過程(Biological process,BP)包括類固醇激素的反應(yīng)、對無機物的反應(yīng)、對營養(yǎng)水平的反應(yīng)等;細胞組分(Cellular component,CC)包括囊泡腔、膜筏、軸突等;分子功能(Molecular function,MF)包括蛋白激酶結(jié)合、蛋白域特異性結(jié)合、核受體活性等。由KEGG 氣泡圖(圖5)可見,膽黃潤腸丸治療STC主要涉及癌癥通路、IL-17信號通路、雌激素信號通路等。

        圖4 膽黃潤腸丸-慢傳輸型便秘交集靶點GO富集分析圖

        圖5 膽黃潤腸丸-慢傳輸型便秘交集靶點KEGG氣泡圖

        3 討論

        大黃始載于《神農(nóng)本草經(jīng)》,歷來為通下要藥,因其藥性“勁利”“駿快”,被陶弘景譽為“將軍”[21]?,F(xiàn)代研究發(fā)現(xiàn),大黃致瀉成分主要為蒽醌類和蒽酮類。未被小腸吸收的結(jié)合型蒽醌被大腸內(nèi)細菌酶水解為蒽酮或蒽酚,一方面通過刺激大腸黏膜和腸壁肌層內(nèi)神經(jīng)叢,促進腸道平滑肌收縮而導瀉;另一方面通過抑制腸細胞膜上Na+-K+-ATP酶,使腸內(nèi)滲透壓升高,而引起容積性瀉下。同時,部分蒽苷由小腸吸收后轉(zhuǎn)化為苷元,再經(jīng)大腸或膽囊分泌入腸腔而致瀉[22-24]。另外,扶埡東等[25]研究發(fā)現(xiàn),生大黃的結(jié)合型蒽醌及縮合鞣質(zhì)均可引起瀉下作用。豬膽粉為豬膽汁的干燥品,性微寒,能清熱潤燥而通熱秘。豬膽汁入藥首見于《傷寒論》,仲景有云:“和少許法醋,以灌谷道內(nèi),如一食頃,當大便出宿食惡物甚效?!盵26]現(xiàn)代研究證實,豬膽汁能作用于M膽堿與α腎上腺素受體,促進腸縱肌收縮,加強腸蠕動。膽鹽類成分能抑制結(jié)腸吸收鹽分和水分,刺激副交感神經(jīng),增加結(jié)腸積液。膽汁酸類成分口服能刺激膽汁分泌,促進脂類吸收和膽固醇代謝,并產(chǎn)生輕瀉作用[27-29]。以上諸多研究進一步驗證了筆者的網(wǎng)絡(luò)藥理分析結(jié)果,即膽黃潤腸丸治療STC的主要活性成分為原花青素B-5,3'-O-沒食子酸酯、番瀉甙D、大黃素甲醚雙葡萄糖甙和豬膽酸。

        筆者構(gòu)建“藥物-疾病”交集靶點PPI 時發(fā)現(xiàn),ALB、EGFR、CASP3、ESR1、HSP90AA1 等為PPI 核心靶點。ALB 是血清白蛋白,有研究發(fā)現(xiàn),便秘癥狀緩解患者的ALB水平顯著提高,與患者營養(yǎng)狀況改善有關(guān)[30]。EGFR 是表皮生長因子受體,有研究[31]證實,缺乏EGFR 信號傳導標志物的小鼠有排泄增加的現(xiàn)象,并有機構(gòu)由此研發(fā)治療便秘的藥物。CASP3 是參與細胞凋亡的半胱天冬酶,臨床研究[32]表明,與慢傳輸便秘等消化道疾病有關(guān)的“rhEGC 表型”會導致CASP3 的信使RNA 轉(zhuǎn)錄發(fā)生一定程度上調(diào),提示CASP3 可能通過影響腸神經(jīng)膠質(zhì)細胞(EGC)來調(diào)節(jié)胃腸動力。ESR1是雌激素受體α(ERα)基因,定位于腸神經(jīng)節(jié)和平滑肌細胞,是介導腸道運動的成分,動物實驗[33]發(fā)現(xiàn),腸道發(fā)育過程中ERα 表達增加。HSP90AA1是熱休克蛋白,Li Pengpeng等[34]發(fā)現(xiàn),表達HSP90AA1 的大腸桿菌細胞表現(xiàn)出更好的膜完整性,推測該蛋白對維護腸道菌群平衡和腸道正常功能起到一定輔助作用。GO富集結(jié)果涉及類固醇激素的反應(yīng)、對營養(yǎng)水平的反應(yīng)、囊泡腔、膜筏、蛋白激酶結(jié)合、蛋白域特異性結(jié)合等,與PPI核心靶點作用基本一致。

        由KEGG 富集結(jié)果可見,膽黃潤腸丸治療STC 主要涉及癌癥、IL-17、雌激素等信號通路。Cajal間質(zhì)細胞(ICC)是胃腸道慢波起搏細胞,平滑肌張力感受器,可傳導腸神經(jīng)與平滑肌間的神經(jīng)信號。鄭宏群等[35]發(fā)現(xiàn),腹腔注射TNF-α(腫瘤壞死因子α)的鼠小腸ICC 及細胞網(wǎng)絡(luò)均有不同程度損傷,推測TNF-α 與ICC 線粒體損傷存在一定關(guān)聯(lián)性,也是導致消化道動力障礙的誘因。IL-17 由T 輔助細胞Th17 產(chǎn)生,可直接或間接誘導多種細胞因子、趨化因子、炎癥因子和抗微生物蛋白。曹蕾等[36]研究證實,IL-17A mRNA和蛋白在功能性便秘患者的結(jié)腸黏膜中具有高表達,說明IL-17A參與了功能性便秘的發(fā)病或病理過程。李敏等[37]發(fā)現(xiàn),術(shù)后腸梗阻的小鼠出現(xiàn)菌群失調(diào)、炎癥反應(yīng)、胃腸動力障礙一系列癥狀,血清IL-17等炎癥細胞因子水平顯著升高,推測小鼠因腸道5-HT 和HIS釋放異常,5-HT無法與受體結(jié)合,從而導致胃腸道平滑肌張力減弱。一方面,雌激素可使NO 合成酶(NOS)的mRNA 高表達,通過合成NO、升高cGMP 來抑制結(jié)腸運動。另一方面,腸內(nèi)雌激素受體ERβ阻斷后c-kit mRNA 表達降低,影響ICC 的正常生理功能,也會造成胃腸道動力不足[38]。此外,雌激素可阻滯H+-K+-ATP 酶,作用于神經(jīng)內(nèi)分泌細胞,抑制胃酸分泌,導致功能性消化不良。同時,雌激素阻止胰腺腺泡蛋白酶和淀粉酶的分泌,在胃排空延遲、缺少足夠食物、胃酸刺激的情況下,膽囊收縮素釋放減少,胰酶和膽汁的分泌減少均會對胃腸道運化功能造成一定影響[39]。

        綜上,筆者運用網(wǎng)絡(luò)藥理學初步探究了膽黃潤腸丸治療STC 的主要活性成分、核心靶點以及作用機制,為今后開展相關(guān)臨床研究提供參考。該研究還比較局限,如:膽黃潤腸丸由大黃和豬膽粉經(jīng)混合粉碎泛制而成,而飲片粉碎和噴灑黏合劑(水或乙醇)的過程中可能會產(chǎn)生一些新的化合物,這些化合物的生物活性和作用機理還是個未知數(shù),有待進一步研究和探討。

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