路暢，郭玉龍，郭艷博，劉婷，高鵬飛，李步高，郭曉紅

（山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 動(dòng)物科學(xué)學(xué)院，山西 晉中 030801）

哺乳動(dòng)物胃腸道是一個(gè)多功能器官，擁有復(fù)雜的動(dòng)態(tài)微生物群落，是營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)消化、吸收和代謝的主要場(chǎng)所，同時(shí)在生理、免疫等方面發(fā)揮重要作用［1-2］。腸道微生物的早期定殖是動(dòng)物生長(zhǎng)發(fā)育及后期生產(chǎn)性能充分發(fā)揮保障的基礎(chǔ)［3］。豬腸道菌群定殖過(guò)程受諸多因素影響，斷奶、飼料更換以及環(huán)境的改變均會(huì)導(dǎo)致群落結(jié)構(gòu)發(fā)生顯著變化，很容易影響腸道發(fā)育及黏膜免疫系統(tǒng)的形成［4-6］。預(yù)先了解仔豬腸道群落形成特點(diǎn)，分析影響腸道健康發(fā)育的菌群，有助于制定促進(jìn)早期腸道內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài)發(fā)展的策略，及時(shí)對(duì)仔豬腸道菌群進(jìn)行有效干預(yù)，改善仔豬腸道健康，提高生長(zhǎng)速度和后期生產(chǎn)性能。

動(dòng)物在出生前腸道屬于無(wú)菌狀態(tài)，出生后受到母體及周?chē)h(huán)境影響，各種微生物快速在腸道定殖［7］。仔豬階段是腸道微生物早期定殖的關(guān)鍵時(shí)期，由于仔豬各腸段功能不同，微生物菌群結(jié)構(gòu)具有顯著差異，小腸和大腸之間以及管腔和粘膜之間微生物分布都不相同，而且糞便與腸道菌群組成也存在差異［8-10］。研究發(fā)現(xiàn)，梭菌屬、乳酸菌、幽門(mén)螺桿菌等作為厚壁菌門(mén)的主要成員在回腸中大量富集，擬桿菌在盲腸及結(jié)腸的腔內(nèi)和黏膜中豐度顯著增加，在不同發(fā)育階段菌群豐度及多樣性隨年齡增長(zhǎng)而增加［11-14］。此外，腸道微生物能夠通過(guò)其代謝產(chǎn)物促進(jìn)腸干細(xì)胞增殖，如乳酸菌可促進(jìn)仔豬早期腸黏膜結(jié)構(gòu)發(fā)育，同時(shí)能使Wnt/βcatenin 通路活化導(dǎo)致腸上皮細(xì)胞再生，最終維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)［15-16］。

目前雖然圍繞腸道菌群對(duì)宿主的影響開(kāi)展了許多研究，但仔豬階段微生物對(duì)腸道結(jié)構(gòu)發(fā)育的作用還未明確。馬身豬作為山西地方豬種，具有產(chǎn)仔多、肉品質(zhì)好、耐粗飼、抗逆性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn)，但其生長(zhǎng)速度較慢，脂肪沉積嚴(yán)重且瘦肉率低；晉汾白豬是以馬身豬、二花臉豬、長(zhǎng)白豬和大白豬為親本選育而成的新品種，具有生長(zhǎng)發(fā)育速度快、肉質(zhì)好等特點(diǎn)［17］。本研究將馬身豬（地方品種）和晉汾白豬（培育品種）仔豬作為研究對(duì)象，對(duì)初生（1 日齡）、哺育末期（28 日齡）、保育末期（70 日齡）3 個(gè)關(guān)鍵時(shí)期空腸和回腸微生物菌群結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析，探究不同豬種腸道微生物特點(diǎn)及小腸結(jié)構(gòu)發(fā)育與微生物多樣性的關(guān)系，以期發(fā)現(xiàn)仔豬腸道發(fā)育過(guò)程中重要的微生物，旨在為后期仔豬健康飼養(yǎng)提供理論依據(jù)。

1 材料和方法

1.1 試驗(yàn)動(dòng)物和樣品采集

本研究于2018 年8-11 月在山西省大同市種豬場(chǎng)進(jìn)行，每個(gè)品種各選擇3 頭健康母豬，圍產(chǎn)期飼料中不添加抗生素或其它藥物以及益生菌等影響腸道微生物結(jié)構(gòu)的物質(zhì)。選擇第4 胎次的仔豬，在喂養(yǎng)28 d 斷奶后單窩喂養(yǎng)。在出生第1 天、28 天（哺育結(jié)束）和70 天（保育結(jié)束）時(shí)，分別在各窩隨機(jī)選擇3 頭公豬進(jìn)行屠宰，取空腸、回腸內(nèi)容物收集于1.5 mL 凍存管中，液氮保存。每頭豬分別采集1 cm 的空腸與回腸組織，去除內(nèi)容物并放入多聚甲醛固定液保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2 小腸絨毛結(jié)構(gòu)測(cè)定

按常規(guī)步驟將取樣組織制作成石蠟塊，在室溫下切出厚度為7 μm 的空腸、回腸組織石蠟切片（每頭豬各做2 張），并用伊紅-蘇木精（HE）試劑染色。后對(duì)切片中方向相同的5 根絨毛測(cè)量其絨毛長(zhǎng)度（Vlength）和隱窩深度（Cdepth），并計(jì)算絨隱比（V/C）［17］。

1.3 DNA 抽提、PCR 擴(kuò)增和測(cè)序

按照天根試劑盒說(shuō)明書(shū)的方法與步驟，分別對(duì)200 mg 空腸與回腸內(nèi)容物提取DNA。利用引物 對(duì) 微 生 物 的V3-V4 區(qū) 進(jìn) 行 擴(kuò) 增（341F：5’-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3’和 806R：5’-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3’）。具體步驟同郭曉紅等已發(fā)表論文方法與材料部分［17］?；厥赵噭┖袑?duì)微生物PCR 產(chǎn)物切膠回收，并用濃度為2%的瓊脂糖凝膠電泳對(duì)仔豬腸道微生物DNA 檢測(cè)。隨后將微生物樣品在Miseq PE300 平臺(tái)進(jìn)行建庫(kù)并測(cè)序。下機(jī)數(shù)據(jù)得到Clean Data 使用FLASH 軟件組裝讀段（reads）。

1.4 OTU 聚類(lèi)分析

使用UPARSE 軟件將高質(zhì)量的reads 從頭拼接并富集成OTU（operational taxonomic units）代表序列。將優(yōu)化序列與OTU 代表序列比對(duì)，進(jìn)行序列分類(lèi)，以相似度97%作為分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)。

1.5 腸道微生物多樣性分析

利用Mothur 軟件（v.1.34.0）計(jì)算α 多樣性指數(shù)［18］，分析仔豬腸道菌群多樣性，并繪制OUT 稀疏曲線和Rank 豐度曲線。利用R（v.3.0.2）基于加權(quán)的UniFrac 距離進(jìn)行主成分分析（posterior cerebral artery，PCA）。

1.6 樣本組成及差異分析

將步驟1.5 中得到的OTU 序列進(jìn)行分類(lèi)（比對(duì)SILVA 數(shù)據(jù)庫(kù)），分別在門(mén)（Phylum）和屬（Genus）水平統(tǒng)計(jì)馬身豬和晉汾白豬仔豬空腸與回腸微生物構(gòu)成，并繪制Venn 圖。

1.7 環(huán)境因子相關(guān)分析

使用R 軟件中vegan 包對(duì)環(huán)境因子（包括腸道絨毛結(jié)構(gòu)和血清免疫指標(biāo)）與腸道微生物在門(mén)和屬的相關(guān)性分析。計(jì)算菌群微生物與腸道絨毛結(jié)構(gòu)和血清免疫指標(biāo)的Spearman 相關(guān)性系數(shù)，選擇前15 個(gè)相關(guān)性最高的微生物繪制相關(guān)性熱圖。

2 結(jié)果與分析

2.1 仔豬回腸與空腸形態(tài)結(jié)構(gòu)比較分析

2.1.1 腸道組織切片結(jié)果分析

由圖1 組織切片可見(jiàn)，隨著日齡增加，2 品種仔豬空腸與回腸絨毛長(zhǎng)度逐漸變短，但橫切面呈現(xiàn)逐漸變寬的趨勢(shì)。晉汾白豬仔豬初生（1 d）時(shí)小腸已經(jīng)出現(xiàn)腸道褶皺，而在馬身豬仔豬腸道中未發(fā)現(xiàn)此現(xiàn)象；此外，馬身豬仔豬初生（1 d）時(shí)空腸與回腸絨毛較長(zhǎng)，而在哺育與保育末期（28 d 和70 d）晉汾白豬的腸絨毛長(zhǎng)度大于馬身豬（圖1）。

圖1 馬身豬和晉汾白豬空腸與回腸組織切片（200×）Fig.1 Jejunum and ileum biopsy of Mashen and Jinfen White piglets（200×）

2.1.2 仔豬腸絨毛高度和隱窩深度比較

從初生到70 日齡，2 品種豬（除馬身豬回腸）空腸和回腸絨毛呈逐漸降低趨勢(shì)，且初生時(shí)的回腸絨毛高度極顯著高于28 日齡和70 日齡（圖2A、圖2D，P＜0.01）。此外，2 品種豬空腸隱窩深度隨仔豬生長(zhǎng)發(fā)育也不斷加深，70 日齡的小腸隱窩深度最高（圖2B、圖2E）?？漳c和回腸的絨隱比（Villus/Crypt）隨日齡增加呈極顯著遞減趨勢(shì)（圖2C、圖2F）。

通過(guò)品種間進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn)，馬身豬仔豬空腸絨毛長(zhǎng)度在1 日齡和28 日齡時(shí)極顯著高于晉汾白豬（圖2A，P＜0.01）。2 品種仔豬回腸絨毛長(zhǎng)度在初生時(shí)沒(méi)有差異，但在28 日齡時(shí)馬身豬回腸絨毛高度極顯著高于晉汾白豬（P＜0.01），在70 日齡時(shí)卻顯著低于晉汾白豬（圖2D，P＜0.05）。比較隱窩深度發(fā)現(xiàn)，馬身豬仔豬空腸隱窩深度極顯著高于晉汾白豬（除28 日齡回腸），但在保育末期（70 日齡）卻顯著低于晉汾白豬（圖2B，P＜0.05）。與空腸不同，1 日齡和70 日齡馬身豬仔豬回腸隱窩深度顯著高于晉汾白豬（P＜0.05），28 日齡卻無(wú)顯著差異（圖2E）。馬身豬在哺育末期空腸與回腸組織的絨隱比顯著高于晉汾白豬（圖2C、圖2F，P＜0.05）。

圖2 馬身豬和晉汾白豬小腸絨毛結(jié)構(gòu)Fig.2 The intestinal morphology of Mashen and Jinfen White piglets

2.2 樣本物種注釋與評(píng)估

對(duì)馬身豬和晉汾白豬仔豬腸道內(nèi)容物樣品進(jìn)行測(cè)序，共檢測(cè)到1 872 432 個(gè)高質(zhì)量序列，得到2032 個(gè)OUTs，其中2 個(gè)品種共有核心OTU 840個(gè)，940 個(gè)為晉汾白豬所特有，252 個(gè)為馬身豬特有，核心OTUs 占晉汾白豬（馬身豬）總OTUs 的47.19%（76.92%）。將97%相似水平的OTU 代表序列匹配到已知細(xì)菌的序列，在晉汾白豬中檢測(cè) 到28 個(gè) 門(mén)，55 個(gè) 綱，106 個(gè)目，205 個(gè) 科 和518 個(gè)屬，在馬身豬中檢測(cè)到19 個(gè)門(mén)，35 個(gè)綱，66 個(gè)目，124 個(gè) 科 和325 個(gè) 屬。

2.3 腸道群落多樣性分析

對(duì)腸道微生物主成分分析，發(fā)現(xiàn)2 品種仔豬腸道整體菌群相似且區(qū)分不明顯（圖3A），與之前結(jié)腸中的研究結(jié)果一致［17］。馬身豬空腸、回腸3 個(gè)發(fā)育時(shí)期菌群結(jié)構(gòu)差異明顯能夠完全區(qū)分，而空腸與回腸菌群結(jié)構(gòu)相似不能完全區(qū)分，說(shuō)明晉汾白豬腸道菌群與馬身豬相似（圖3B）。通過(guò)對(duì)腸道微生 物α 多 樣 性分 析 發(fā) 現(xiàn)，除Simpson 以 外，ACE、Chao、Shannon 變化趨勢(shì)較相似（圖3C）。晉汾白豬28 日齡時(shí)空腸菌群多樣性顯著減少，70 日齡時(shí)顯著增加，馬身豬仔豬3 個(gè)發(fā)育階段腸道菌群變化穩(wěn)定，無(wú)顯著差異。此外，晉汾白豬仔豬回腸菌群多樣性隨日齡逐漸增加，而馬身豬回腸菌群多樣性在70 日齡時(shí)顯著減少（P＜0.05），并在保育結(jié)束（70 日齡）時(shí)微生物多樣性極顯著低于晉汾白豬（圖3C，P＜0.01）。

圖3 馬身豬和晉汾白豬空腸、回腸微生物多樣性分析Fig.3 Microbial diversity in jejunum and ileum of Mashen and Jinfen White piglets

2.4 腸道菌群組成分析

通過(guò)微生物組成分析，發(fā)現(xiàn)晉汾白豬和馬身豬仔豬腸道微生物主要包括厚壁菌門(mén)（Firmicutes）、變形菌門(mén)（Proteobacteria）和擬桿菌門(mén)（Bacteroidetes）。其中，厚壁菌門(mén)隨仔豬發(fā)育豐度逐漸增加，保育結(jié)束（70 日齡）所占比例最大。2 品種仔豬回腸厚壁菌門(mén)豐度均高于空腸，而且晉汾白豬腸道該菌比例（32.29%～54.92%）顯著低于馬身豬（61.34%～87.67%）。變形菌門(mén)在哺育結(jié)束（28 日齡）時(shí)豐度達(dá)到最高，在70 日齡時(shí)急劇減少，初生時(shí)晉汾白豬該菌豐度（72.29%）顯著高于馬身豬（15.60%）。兩品種仔豬腸道中擬桿菌門(mén)豐度變化與厚壁菌門(mén)相反，空腸中擬桿菌門(mén)所占比例均高于回腸，晉汾白豬腸道中所占比例（0.70%～3.89%）高于馬身豬（0.11%～1.9%）（圖4A）。

晉汾白豬和馬身豬仔豬腸道微生物群中共鑒定出518 和325 個(gè)屬，晉汾白豬腸道菌屬多樣性顯著高于馬身豬（圖4B）。乳酸桿菌（Lactobacillus）、假單胞菌（Pseudomonas）、狹義梭菌屬1（Clostridium_sensu_stricto_1）在2 品種仔豬腸道中所占比例較高。馬身豬仔豬腸道中的乳酸菌在初生和保育結(jié)束時(shí)豐度比較高，該菌在空腸這2 階段豐度平均占比分別為46.76%、95.25%，回腸中分別占37.37%、86.75%，且晉汾白豬乳酸桿菌含量均顯著低于馬身豬。假單胞菌作為變形菌門(mén)中的主要菌屬，晉汾白豬仔豬腸道中其豐度占比是馬身豬仔豬的2 倍，哺育結(jié)束時(shí)該菌含量顯著增加。分析發(fā)現(xiàn)，狹義梭菌屬在馬身豬仔豬初生時(shí)豐度較高，隨后很快消失，1 日齡馬身豬仔豬該菌豐度是晉汾白豬的1.7 倍；晉汾白豬腸道中該菌在各個(gè)時(shí)期均存在且豐度較高。2 個(gè)品種保育結(jié)束（70 日齡）時(shí)鏈球菌屬（Streptococcus）出現(xiàn)較高豐度，在晉汾白豬中的含量是馬身豬的3～4 倍（圖4B）。

圖4 馬身豬和晉汾白豬小腸微生物組成Fig.4 The composition of intestinal microbes between Mashen and Jinfen White piglet

2.5 空腸和回腸特有腸道菌群分析

對(duì)2 個(gè)品種仔豬空腸和回腸特異菌屬進(jìn)行分析，在晉汾白豬空腸和回腸中分別檢測(cè)到453 種和373 種菌屬，而在馬身豬空腸和回腸中僅發(fā)現(xiàn)307種和183 種菌屬。其中，晉汾白豬特有菌屬221種，馬身豬特有菌屬僅25 種，說(shuō)明晉汾白豬腸道微生物多樣性顯著高于馬身豬（圖5）。

圖5 馬身豬和晉汾白豬仔豬空腸與回腸微生物數(shù)量（屬水平）Fig.5 The number of microbiota in the jejunum and ileum of two breeds at genus level

通過(guò)對(duì)小腸特有菌群分析，發(fā)現(xiàn)空腸與回腸特有菌屬所屬門(mén)類(lèi)差異較大。在門(mén)水平，晉汾白豬腸道特異菌群主要集中在放線菌門(mén)、厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)、酸桿菌門(mén)（Acidobacteria）、Parcubacteria、綠彎菌門(mén)（Chloroflexi）等8 個(gè)菌門(mén)；而馬身豬腸道特有菌群主要分布于變形菌門(mén)、厚壁菌門(mén)、疣微菌門(mén)、擬桿菌門(mén)、綠菌門(mén)、綠彎菌門(mén)、藍(lán)藻門(mén)（Cyanobacteria）等9 個(gè)菌門(mén)（圖6）。在屬水平，Quinella、游動(dòng)放線菌（Actinoplanes）、氣微菌屬（Aeromicrobium）、動(dòng)膠菌屬（Zoogloea）等菌屬特異性富集于在晉汾白豬仔豬回腸與空腸中（圖6A）；馬身豬仔豬空腸和回腸特有菌屬主要包括粘螺旋藻（Mucispirillum）、Thiopseudomonas、Sinibacillus、索 氏菌屬（Thauera）、氣斯氏菌屬（Aerisardovi）、Anaerofilum等（圖6B）。

圖6 晉汾白豬和馬身豬空腸、回腸特有微生物組成Fig.6 The component of peculiar microorganisms in jejunum and ileum of Jinfen White and Mashen piglets

2.6 微生物與腸道指標(biāo)關(guān)聯(lián)分析結(jié)果

通過(guò)對(duì)腸道微生物菌群與腸絨毛結(jié)構(gòu)和血清生化指標(biāo)進(jìn)行相關(guān)性分析（圖7），發(fā)現(xiàn)馬身豬仔豬血清中脂多糖（LPS）、二胺氧化酶（DAO）、絨毛長(zhǎng)度（Vlength）關(guān)聯(lián)的菌群與D 乳酸（D-LA）、白介素6（IL-6）、腫瘤壞死因子α（TNF-α）、隱窩深度（Cdepth）關(guān)聯(lián)的菌群相關(guān)性結(jié)果相反，但在晉汾白豬仔豬中區(qū)分度不明顯。其中，馬身豬仔豬的腸道絨毛長(zhǎng)度和隱窩深度與15 個(gè)菌屬的相關(guān)性呈現(xiàn)相反的趨勢(shì)，絨毛長(zhǎng)度與鏈球菌、unclassfied_o_Lactobacillales極顯著正相關(guān)，但隱窩深度與二者極顯著負(fù)相關(guān)（P＜0.001）。D-LA 與4 種菌顯著負(fù)相關(guān)（P＜0.05），但僅與乳酸桿菌顯著正相關(guān)（圖7A，P＜0.01）。對(duì)于晉汾白豬而言，鏈球菌、北里孢菌（Kitasatospora）、羅氏菌（Rothia）、莫拉 氏 菌（Moraxella）和 魏 斯 氏 菌（Weissella）與TNF-α 和隱窩深度顯著正相關(guān)，但與D-LA、IL-6以及LPS 顯著負(fù)相關(guān)（圖7B，P＜0.05）。此外，鏈球菌在2 品種仔豬中均與DAO 和LPS 負(fù)相關(guān)，與TNF-α 和Cdepth 顯著正相關(guān)（P＜0.05）。乳酸桿菌與DAO 在馬身豬中極顯著正相關(guān)卻在晉汾白豬中極顯著負(fù)相關(guān)（P＜0.001），但與LPS 在2 品種豬中顯著負(fù)相關(guān)（P＜0.05）。

圖7 馬身豬和晉汾白豬腸道微生物與指標(biāo)相關(guān)性分析（屬水平）Fig.7 Spearman correlation analysis between microbiota and environmental variables in two pig breeds at genus level

3 討論

中國(guó)地方豬種在抵抗外界壓力和疾病的能力得到廣泛認(rèn)可［19-20］，其中腸道微生態(tài)在維持健康和抵抗疾病方面發(fā)揮不容忽視的作用［21］。研究表明，仔豬腸道微生物多樣性會(huì)隨日齡增加發(fā)生顯著變化，此過(guò)程受飼料及遺傳等多種因素影響［6，22］。本研究發(fā)現(xiàn)，晉汾白豬與馬身豬仔豬小腸微生物結(jié)構(gòu)相似，但3 個(gè)時(shí)間點(diǎn)的腸道微生物多樣性差異顯著，說(shuō)明腸道微生物的形成受到飼料、環(huán)境等因素的影響較大。其中，日齡和飲食是引起菌群差異的重要驅(qū)動(dòng)因素，而馬身豬仔豬的腸道菌群分類(lèi)比晉汾白豬少，更穩(wěn)定，也可能是地方品種對(duì)環(huán)境改變有較強(qiáng)的適應(yīng)能力的原因。

有研究指出，豬腸道中有大量的厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)和變形菌門(mén)微生物，本研究結(jié)果與以上相符［23-24］。厚壁菌門(mén)具有獲取食物能量的潛力［25-26］，馬身豬仔豬腸道厚壁菌門(mén)豐度顯著高于晉汾白豬，高豐度的厚壁菌門(mén)可能促進(jìn)了馬身豬脂肪積累。此外，乳酸桿菌是哺乳動(dòng)物腸道中的主要菌屬，在母乳及植物性食物的代謝中發(fā)揮著重要的作用［27］。在本研究中馬身豬仔豬腸道中的乳酸桿菌豐度較高，這對(duì)于維護(hù)腸道健康及營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的消化吸收有重要作用。Romboutsia能夠降低血漿中促炎細(xì)胞因子水平，而假單胞菌屬、狹義梭菌屬等是腸道潛在致病菌［28］。本研究中這些菌屬在2品種仔豬各時(shí)期均有較高豐度，提示仔豬階段要注意環(huán)境和飼料等外界因素的影響，應(yīng)加強(qiáng)仔豬護(hù)理防止腸道疾病的發(fā)生。從整體來(lái)看，馬身豬有益菌群豐度占比高于晉汾白豬，說(shuō)明馬身豬腸道微生物在其抗逆性方面發(fā)揮重要作用。

本研究分析表明，腸道菌群與腸道發(fā)育以及機(jī)體免疫之間存在相關(guān)性，其中血清DAO、D-LA和LPS 含量可以改變腸道通透性腸黏膜功能［29-30］。乳酸桿菌的代謝產(chǎn)物具有抑菌、屏障保護(hù)作用，可以競(jìng)爭(zhēng)致病菌的黏附位置并減少致病菌的黏附侵害，減少致病菌LPS 的產(chǎn)生［31-32］。此外，魏斯氏菌對(duì)腸黏膜具有抗炎和保護(hù)作用，在小鼠中可抑制脂多糖誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞產(chǎn)生NO 和IL-6，而在人中主要抑制上皮細(xì)胞產(chǎn)生IL-8［33］。本研究通過(guò)關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)狹義梭菌屬、假單胞菌屬等微生物與這些指標(biāo)顯著正相關(guān)，而乳酸桿菌、魏斯氏菌等有益菌是負(fù)相關(guān)，所以在實(shí)際生產(chǎn)中應(yīng)注意對(duì)仔豬腸道微生物調(diào)控，促進(jìn)有益菌大量富集，維護(hù)腸道健康。

4 結(jié)論

本研究通過(guò)比較馬身豬和晉汾白豬仔階段小腸微生物多樣性，分析了仔豬關(guān)鍵生長(zhǎng)階段的菌屬變化情況，與晉汾白豬相比，馬身豬仔豬腸道菌群組成更加保守，微生物多樣性顯著小于晉汾白豬。乳酸桿菌、Ferruginibacter、Thiopseudomonas、索氏菌屬、粘螺旋藻等是馬身豬的特異菌群，可能對(duì)馬身豬抗逆性能具有影響。Quinella、Haliangium、動(dòng)膠菌屬、Anoxybacillus、毛螺菌科等為晉汾白豬特異菌屬，對(duì)營(yíng)養(yǎng)吸收代謝具有重要作用。微生物對(duì)仔豬健康及后期生產(chǎn)性能的發(fā)揮具有重要作用，本研究結(jié)果可為不同品種仔豬腸道微生態(tài)的調(diào)控研究及仔豬健康飼養(yǎng)提供參考。