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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討十一味參芪制劑治療腫瘤作用機制研究

        2022-08-27 02:31:56黃博威劉啟鴻溫勁羽張慧玲趙紅佳
        福建中醫(yī)藥 2022年7期
        關(guān)鍵詞:信號分析

        黃博威,劉啟鴻,溫勁羽,張慧玲,趙紅佳*

        (1.福建中醫(yī)藥大學(xué)附屬人民醫(yī)院,福建福州 350004;2.福建中醫(yī)藥大學(xué)附屬第二人民醫(yī)院,福建福州 350003)

        流行病學(xué)資料顯示,惡性腫瘤是我國病死率最高的一種疾病,嚴重危害著人們的生命健康[1],至今還被WTO 確定為是一種慢性消耗性疾病。腫瘤的治療一直都是醫(yī)學(xué)界極為迫切需要解決的問題,但由于腫瘤的類型較為繁多,所反映出來的病理表現(xiàn)與臨床癥狀各不相同。近些年來,眾多研究者通過臨床試驗研究發(fā)現(xiàn)中醫(yī)藥在腫瘤防治中發(fā)揮了不可小覷的作用,主要以扶正祛邪為原則,達到“正氣存內(nèi),邪不可干”的效果。十一味參芪制劑是臨床上治療腫瘤常用的中成藥,由人參、黃芪、天麻、菟絲子等11 味中藥加工制成,具有抗癌扶正祛邪、健脾補氣養(yǎng)血、益腎填精生髓的作用。前期通過系統(tǒng)評價顯示,十一味參芪制劑能有效提高腫瘤患者臨床療效穩(wěn)定率,改善骨髓抑制和腎功能,降低化療的胃腸道不良反應(yīng),提高患者生活質(zhì)量,治療安全性較好[2]。但是,該制劑防治腫瘤的作用機制并未明晰。由于中藥復(fù)方具有綜合整體調(diào)節(jié)的作用,通過傳統(tǒng)的單藥研究難以反映出中藥復(fù)方的療效,而網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)正好能彌補這一不足,借助對生物網(wǎng)絡(luò)進行分析,將藥物作用靶點的網(wǎng)絡(luò)進行整合,是一種綜合研究藥物作用機制的新技術(shù)[3]。因此,本研究借助網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,探索十一味參芪制劑干預(yù)治療腫瘤的可能作用機制,為推動中醫(yī)藥的傳承與發(fā)展做貢獻。

        1 資料與方法

        1.1 篩選活性成分及靶點 通過中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析工具TCMSP(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php),以人參、黃芪、天麻、當歸、熟地黃、澤瀉、決明子、菟絲子、枸杞子、細辛為關(guān)鍵詞,查找這10 味藥的化學(xué)成分,將口服生物利用度(OB≥30%)與類藥性(DL≥0.18)作為篩選標準,對所檢索到的活性成分進行分析[4]。利用BATMAN-TCM 數(shù)據(jù)庫(http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/)查找TCMSP 未收錄的鹿角化學(xué)成分,由此建立十一味參芪制劑的成分數(shù)據(jù)庫。利用TCMSP 和BATMAN-TCM 查找十一味參芪制劑化合物對應(yīng)的靶標蛋白,將靶標蛋白通過Unitprot 數(shù)據(jù)庫(http://www.Unitprot.org/)查詢相應(yīng)的基因ID。

        1.2 腫瘤靶點獲取 采用GeneCards數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org/)以“Cancer”作為檢索詞,進行相關(guān)靶基因的獲取,從而構(gòu)建腫瘤的靶基因庫。

        1.3 藥物與疾病交集靶點的獲取 借助Venny 2.1工具繪制十一味參芪制劑藥物靶標基因與腫瘤靶點的韋恩圖,并獲得二者交集靶點信息,即為十一味參芪制劑治療腫瘤的作用靶點。

        1.4 可視化網(wǎng)絡(luò)體系的構(gòu)建 將交集靶點輸入STRING 數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/),設(shè)置物種為“homo sapiens”,作用閾值“>0.9”[5],繪制蛋白互作的PPI 網(wǎng)絡(luò)圖。再將得到的結(jié)果CSV 文件導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2 軟件進行網(wǎng)絡(luò)拓撲分析,得到目標靶點之間的連接圖,運用R 語言軟件對其結(jié)果進行分析整理。同時進一步可視化地構(gòu)建“藥物-靶點-疾病”相互作用的網(wǎng)絡(luò)圖。

        1.5 功能與通路富集分析 利用Metascape 平臺對交集靶點進行GO 與KEGG 富集分析。通過GO 分析基因靶點的生物學(xué)功能,包括細胞成分、分子功能和生物過程3 個方面的作用。借助KEGG 通路分析獲得參與的相關(guān)通路,從分子生物學(xué)角度闡釋十一味參芪制劑治療腫瘤的作用機制。

        2 結(jié) 果

        2.1 十一味參芪制劑有效成分與腫瘤靶點 運用TCMSP、BATMAN-TCM 數(shù)據(jù)庫中搜索十一味參芪制劑各味藥的有效成分,共有175 個化合物,其中人參22 個、黃芪21 個、天麻23 個、當歸2 個、熟地黃2 個、澤瀉10 個、決明子14 個、菟絲子11 個、鹿角2 個、枸杞子60 個、細辛8 個,其中各味藥的主要成分見表1。將有效成分進一步分析,共得到潛在有效靶點856 個。借助GeneCards 數(shù)據(jù)庫中檢索到26 151 個腫瘤相關(guān)靶點基因。通過繪制韋恩圖,得到藥物-疾病交互靶點821 個。見圖1。

        表1 十一味參芪制劑的主要化學(xué)成分

        圖1 藥物-疾病交互靶點韋恩圖

        2.2 可視化網(wǎng)絡(luò)體系及其關(guān)鍵靶點的獲取 將821 個交集靶標導(dǎo)入STRING 數(shù)據(jù)庫繪制PPI 網(wǎng)絡(luò),獲得蛋白間的相互作用信息,再將網(wǎng)絡(luò)圖導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2 軟件進行網(wǎng)絡(luò)拓撲分析,得到靶點連接圖,見圖2。發(fā)現(xiàn)該網(wǎng)絡(luò)中包含了184 個節(jié)點和592 條邊,217 個潛在核心靶點,節(jié)點平均度值為8.811,其中視黃醇X 受體α(retinoid X receptor alpha,RXRA)、CREB結(jié)合蛋白(CREB-binding protein,CREBBP)、核受體輔激活蛋白1(nuclear receptor coactivator 1,NCOA1)、轉(zhuǎn)錄中介體亞基1(MED1)、視黃醇X受體β(retinoid X receptor beta,RXRB)、視黃醇X 受體γ(retinoid X receptor gamma,RXRG)、核受體輔激活蛋白2(nuclear receptor coactivator 2,NCOA2)等82 個節(jié)點度值高于平均值,即為十一味參芪制劑干預(yù)腫瘤的核心靶點,見圖3。

        圖2 共同靶點PPI 網(wǎng)絡(luò)

        圖3 核心靶點

        2.3 藥物-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò) 運用Cytoscape 3.7.2軟件,導(dǎo)入相應(yīng)文件后構(gòu)建“藥物-靶點-疾病”相互作用網(wǎng)絡(luò)。網(wǎng)絡(luò)中有217 個疾病靶點,每條連線代表十一味參芪制劑與藥物、藥物與作用靶點、作用靶點與腫瘤之間的作用關(guān)系。見圖4。

        2.4 GO 功能富集分析 GO 分析分別取前10 條目錄進行條形圖展示,見圖5。GO 分析結(jié)果顯示,十一味參芪制劑的活性成分影響的相關(guān)蛋白基因主要富集在分子功能中的氧化還原酶活性、維生素結(jié)合、羧酸結(jié)合、陽離子跨膜轉(zhuǎn)運蛋白活性等方面;生物過程中的細胞對無機物、有毒物質(zhì)和脂多糖以及化學(xué)刺激的反應(yīng),對活性氧代謝、細胞凋亡的調(diào)節(jié)等方面;細胞組分中的樹突、突觸后、軸突、離子通道復(fù)合物等方面。

        圖4 “藥物-靶點-疾病”相互作用網(wǎng)絡(luò)

        圖5 十一味參芪制劑GO 基因功能富集分析

        2.5 KEGG 富集結(jié)果分析 篩選前20 條通路進行部分展示,根據(jù)結(jié)果可以看出主要涉及與腫瘤相關(guān)通絡(luò)(pathways in cancer)、神經(jīng)活性配體-受體相互作用(neuroactive ligand-receptor interaction)、化學(xué)致癌通路(chemical carcinogenic-receptor activation)、cGMP-PKG 信號通路、MAPK 信號通路、PI3K-Akt信號通路等。見圖6。

        3 討 論

        在中醫(yī)學(xué)中,腫瘤作為一種通常以機體局部病變?yōu)橹饕憩F(xiàn)的惡性疾病,尤其是惡性腫瘤,其根本病機在于正氣虛損,氣血陰陽失調(diào),致邪實亢盛,故治療上應(yīng)以扶正祛邪為主。正如《黃帝內(nèi)經(jīng)》所云:“有胃氣則生,無胃氣則亡”,顧護胃氣和補益氣血是扶正祛邪的關(guān)鍵和前提,其在抗腫瘤治療中的作用不可忽視。十一味參芪制劑是臨床上常用于補氣扶正的中成藥,方以黃芪和人參為君,黃芪可補氣固表,益衛(wèi)升陽,具有托毒生肌之功;人參大補元氣,復(fù)脈固脫,健脾益肺,使五臟之氣得以充實。當歸補血、活血止痛,熟地黃滋陰補血,二者為臣以滋陰生血、填精生髓。佐以菟絲子、枸杞子、澤瀉、決明子、鹿角、天麻,可滋補肝腎、益精生髓。全方補血與補氣藥配伍巧妙,共奏氣血雙補、健脾補腎的功效?,F(xiàn)代藥理學(xué)研究也證實,方中主要成分人參中含有的皂苷和多糖,具有提高白細胞數(shù)量,增強人體細胞免疫功能,抑制腫瘤細胞生長和誘導(dǎo)凋亡的作用;黃芪同樣可以提高機體免疫功能,維持內(nèi)環(huán)境的平衡穩(wěn)定[6-7]。

        圖6 十一味參芪制劑KEGG 通路分析

        本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),十一味參芪制劑干預(yù)腫瘤的主要活性化學(xué)成分包括山柰酚(kaempferol)、槲皮素(quercetin)、β-谷甾醇(Beta-sitosterol)、豆甾醇(Stigmasterol)、異鼠李素(isorhamnetin)、芝麻素(sesamin)、蘆薈大黃素(aloe-emodin)、芒柄花黃素(formononetin)等。其中山柰酚、槲皮素、異鼠李素為黃酮類化合物,黃酮類物質(zhì)具有多重抗腫瘤效應(yīng)和廣泛的生物學(xué)活性。藥理學(xué)研究表明,山柰酚、槲皮素具有抗炎、抗氧化作用,可通過誘導(dǎo)癌細胞凋亡、增強抑癌基因活性及抑制癌基因表達等方面起到抗癌作用[8-9]。而異鼠李素不僅可以通過調(diào)控PI3K/Akt/mTOR、Ras/MAPK、Wnt/β-catenin 等 信號通路發(fā)揮抗癌作用,還可以增強包含鉑類化合物、5-氟尿嘧啶、卡培他濱等多種化療藥物的抗癌活性[10]。β-谷甾醇和豆甾醇均為植物甾醇,可抑制消化道腫瘤生長。研究表明,β-谷甾醇可使胃癌細胞中AMPK、PTEN 蛋白表達增加,HS90 蛋白表達下調(diào),進而誘導(dǎo)腫瘤細胞凋亡及抑制其生長[11]。王凱等[12]發(fā)現(xiàn)β-谷甾醇可通過抑制CDC25B 蛋白的表達,促進肝癌細胞凋亡和抑制細胞增殖。豆甾醇可通過阻滯細胞分裂周期及ROS 的氧化、鈣離子濃度上升的級聯(lián)反應(yīng),從而誘導(dǎo)人肝癌細胞SMMC-7721 凋亡[13]。芝麻素作為一種常見的天然木脂類化合物,可在抗增殖、抗轉(zhuǎn)移、促凋亡和促進自噬等方面起到抗癌作用,研究表明這可能與芝麻素選擇性參與NF-κB、STAT3、JNK、ERK1/2、p38 MAPK、PI3K/Akt、胱天蛋白酶-3 以及p53 信號通路有關(guān)[14]。蘆薈大黃素在作用于肝癌細胞時可以通過抑制Src/STAT3 信號通路抑制其增殖與遷移[15]。芒柄花黃素作為十一味參芪制劑中君藥黃芪的主要活性化學(xué)成分,已被研究證實其對肺癌、乳腺癌、胃癌、卵巢癌都有明顯的抑制作用[16]。

        通過對PPI 網(wǎng)絡(luò)的深入研究發(fā)現(xiàn),十一味參芪制劑治療腫瘤的主要核心靶點有RXRA、CREBBP、NCOA1、MED1、RXRB 和RXRG 等。RXRA、RXRB、RXRG 屬于類視黃醇X 受體(retinoid X receptors,RXRs)的3 種不同亞型,屬于配體依賴性核受體,在細胞增殖、分化、代謝、炎癥等生理功能方面發(fā)揮廣泛的調(diào)控作用,其異常表達在癌癥的發(fā)生、發(fā)展過程中可能發(fā)揮促進作用[17]。研究報道,CREBBP能夠抑制炎性腸病相關(guān)結(jié)直腸進展,同時也是一種能夠維持人體正常造血功能的重要腫瘤抑制基因[18]。NCOA1 具有促炎、促血管生成的作用,促使細胞的侵襲和增殖[19]。研究表明,MED1 基因在乳腺癌中高表達,能夠促進癌細胞的增殖,沉默該MED1 基因后增殖現(xiàn)象明顯受到抑制[20]。

        為進一步研究核心靶點在基因功能和信號通路的作用,本研究進行GO 生物學(xué)功能富集分析,發(fā)現(xiàn)上述核心靶點基因可以通過影響活性氧代謝、細胞凋亡氧化還原酶活性、維生素結(jié)合、羧酸結(jié)合、陽離子跨膜轉(zhuǎn)運蛋白活性等途徑起到抗腫瘤的作用。KEGG 通路分析顯示,十一味參芪制劑干預(yù)腫瘤的靶標基因主要富集的通路涉及與腫瘤相關(guān)通路、神經(jīng)活性配體-受體相互作用、化學(xué)致癌作用通路、cGMP-PKG 信號通路、PI3K-Akt 信號通路、MAPK 通路等,這些通路等與癌癥間接相關(guān),可起到抗癌作用。研究表明,cGMP-PKG 信號通路對維持血管穩(wěn)態(tài)具有重要的作用,激活cGMP-PKG 信號通路可抑制腫瘤細胞的血管新生,提示十一味參芪制劑可能通過激活該通路調(diào)控腫瘤[21]。PI3K-Akt信號通路參與腫瘤細胞增殖、凋亡、侵襲與遷移的調(diào)控,該通路在癌細胞中呈過度激活狀態(tài),其通路中的節(jié)點是靶向藥物治療的核心靶點[22]。MAPK信號通路是調(diào)節(jié)各種細胞過程的關(guān)鍵信號通路,能夠抑制細胞增殖,誘導(dǎo)細胞凋亡,導(dǎo)致細胞周期阻滯[23]。

        本研究應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,挖掘了十一味參芪制劑作用于腫瘤的重要活性成分及核心靶點基因,并借助KEGG 富集分析闡釋其信號通路及分子作用機制,可為十一味參芪制劑干預(yù)腫瘤的臨床應(yīng)用提供依據(jù),為進一步的實驗研究奠定基礎(chǔ)和提供新方向,但以上研究仍然需要通過體內(nèi)、外實驗針對某種具體腫瘤開展進一步驗證。

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