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        基于元胞自動(dòng)機(jī)的COVID-19傳播動(dòng)力學(xué)研究

        2022-08-26 09:54:02施思遠(yuǎn)蔡朝瑞杜寶良周林華孟品超
        關(guān)鍵詞:措施疫情模型

        施思遠(yuǎn),蔡朝瑞,杜寶良,周林華,孟品超

        (長(zhǎng)春理工大學(xué) 數(shù)學(xué)與統(tǒng)計(jì)學(xué)院,長(zhǎng)春 130022)

        如今,COVID-19對(duì)公共社會(huì)衛(wèi)生安全造成了嚴(yán)重的危害,人們迫切需要對(duì)COVID-19展開(kāi)更全面的研究[1],從而制定最佳的防控疫情策略。在20年2月初,一艘由日本橫濱出發(fā)的“鉆石公主號(hào)”郵輪成為了COVID-19大規(guī)模爆發(fā)的重災(zāi)區(qū),在全員人數(shù)僅僅3 700多名的情況下,感染人數(shù)達(dá)到了621例,近16%的人感染。

        在過(guò)去的一年里,研究學(xué)者們主要基于SEIR模型對(duì)傳染病傳播動(dòng)力學(xué)進(jìn)行研究。張宇[2]針對(duì)交通工具內(nèi)部空間狹小、乘客之間接觸率高等特點(diǎn)對(duì)SEIR型進(jìn)行改進(jìn),建立交通工具內(nèi)部新冠肺炎疫情的傳播模型。Wu Joseph T[3]基于人口流動(dòng)性對(duì)SEIR模型進(jìn)行改進(jìn),對(duì)人口流動(dòng)性大的城市進(jìn)行新冠肺炎病例數(shù)量預(yù)測(cè)。邱?。?]基于SEIR模型對(duì)地鐵傳染病傳播進(jìn)行仿真預(yù)測(cè),得到了較為可靠的傳染率參數(shù)。李眩[5]基于元胞自動(dòng)機(jī)建立傳染病傳播和控制仿真模型,驗(yàn)證不同疾病致死率對(duì)疫情傳播的影響。暢春玲[6]通過(guò)建立具有垂直傳播和一般接觸的元胞自動(dòng)機(jī)傳染病模型來(lái)研究不同傳播方式對(duì)疫情傳播的影響。Salathé M,Kazandjieva M[7]基于元胞自動(dòng)機(jī)模型,從行人出行交通方面出發(fā),探究其對(duì)疫情擴(kuò)散程度的影響。

        總體而言,目前對(duì)于傳染病傳播動(dòng)力學(xué)研究主要停留在傳統(tǒng)微分方程SEIR模型或是基于元胞自動(dòng)機(jī)的傳染病傳播模型上,前者是從宏觀(guān)的角度考慮傳染病傳播,對(duì)于人與人之間的接觸和人本身運(yùn)動(dòng)的隨機(jī)性無(wú)法考慮到位,后者是從微觀(guān)角度考慮傳染病傳播,未考慮人員行走路徑多樣化的問(wèn)題,只是簡(jiǎn)單地從疾病擴(kuò)散角度出發(fā)進(jìn)行研究。本文以“鉆石公主號(hào)”郵輪為例,針對(duì)其具有復(fù)雜密閉環(huán)境和人員行走路徑多樣化的特點(diǎn),分別制定了傳染病傳播演化規(guī)則、行人避讓規(guī)則以及移動(dòng)規(guī)則,基于上述規(guī)則進(jìn)行模擬仿真實(shí)驗(yàn),并通過(guò)設(shè)置隔離措施、限制人員出行和提高人員防護(hù)措施三個(gè)角度進(jìn)行實(shí)驗(yàn),得出有效合理的疫情防控策略。

        1 基于元胞自動(dòng)機(jī)的傳染病傳播模型

        1.1 元胞自動(dòng)機(jī)模型原理

        元胞自動(dòng)機(jī)(Cellular Automatio,CA)是一個(gè)空間、時(shí)間和狀態(tài)均離散且狀態(tài)隨時(shí)間不斷發(fā)生變化的動(dòng)力學(xué)系統(tǒng)[8],由元胞的空間構(gòu)型、元胞狀態(tài)、鄰居和元胞演化規(guī)則組成。每一個(gè)元胞自動(dòng)機(jī)系統(tǒng)可以描述為一個(gè)四元組:

        其中,Ld表示空間構(gòu)型為d維,空間大小為L(zhǎng)×L的網(wǎng)格空間;S表示元胞空間狀態(tài)集合;N表示以某一元胞為中心的所有元胞組合;f表示元胞狀態(tài)演化規(guī)則函數(shù)的集合。

        本文采用Moore型元胞鄰域,如圖1所示。

        圖1 Moore型元胞鄰域

        1.2 傳染病傳播演化規(guī)則

        元胞演化規(guī)則函數(shù)f是一個(gè)狀態(tài)轉(zhuǎn)移函數(shù):

        模型仿真過(guò)程,在t時(shí)刻第i個(gè)個(gè)體的狀態(tài)空間S有以下4種取值:

        (1)在t=0時(shí)刻,將n(n<

        圖2 感染示意圖

        1.3 避讓行走規(guī)則

        對(duì)于模型中的障礙物將按照以下步驟進(jìn)行賦值,賦值結(jié)果如圖3所示。

        圖3 布局圖掃描賦值結(jié)果圖(網(wǎng)格值×104)

        (1)確定場(chǎng)所出入口P(i,j),對(duì)出入口兩側(cè)元胞賦值為1,并按照離出口越遠(yuǎn),值逐漸增加的規(guī)則進(jìn)行賦值。

        (2)若障礙物以單個(gè)網(wǎng)格形式出現(xiàn),則值為1。

        (3)由出入口P(i,j)兩側(cè)所在的行(或列)開(kāi)始,對(duì)相鄰的行(或列)進(jìn)行掃描,對(duì)于墻壁的網(wǎng)格賦值為1,障礙物網(wǎng)格兩端賦值為1,且由外向內(nèi)逐漸增加。

        本文基于經(jīng)典場(chǎng)域模型[10-12],為使行人產(chǎn)生繞行的行為,現(xiàn)定義“視野距離”的概念:“視野距離”代表行人正前方的一段固定距離,將該固定距離記為dlim。

        視野距離最遠(yuǎn)點(diǎn)(虛擬點(diǎn))稱(chēng)為“決策點(diǎn)”,當(dāng)決策點(diǎn)未“觸碰”到障礙物時(shí),行人會(huì)朝著目的地方向直線(xiàn)行走;當(dāng)決策點(diǎn)“觸碰”到障礙物時(shí),如圖4(a),行人的轉(zhuǎn)向選擇取決于決策點(diǎn)左前方和右前方網(wǎng)格值的大小,左前方網(wǎng)格值為5,大于右前方的網(wǎng)格值3,則行人將偏向右方行走,反之行人將偏向左方行走;當(dāng)視野距離內(nèi)的障礙物兩端均為可繞行區(qū)域時(shí),如圖4(b)。當(dāng)決策點(diǎn)(id,jd)左前方網(wǎng)格值和右前方網(wǎng)格值相等的時(shí)候,行人將會(huì)等概率選擇往左、右轉(zhuǎn)向。

        圖4 行人在不同位置處決策點(diǎn)情況

        在繞行過(guò)程中,當(dāng)決策點(diǎn)前方存在墻壁或障礙物時(shí),決策點(diǎn)將會(huì)隨著行人移動(dòng)的方向跟著移動(dòng),且緊貼著墻壁或障礙物進(jìn)行移動(dòng),來(lái)保證決策點(diǎn)與行人在同一直線(xiàn)上(如圖4中決策點(diǎn)2′—3′過(guò)程)。而當(dāng)行人成功繞過(guò)墻壁或障礙物時(shí),決策點(diǎn)和行人的距離恢復(fù)到視野距離dlim。

        1.4 移動(dòng)規(guī)則

        行人根據(jù)其距各個(gè)目的地場(chǎng)所的歐氏距離和擁擠度兩個(gè)因素進(jìn)行選擇。在前往目的地的過(guò)程中,行人將根據(jù)Moore型鄰域空間的局部靜態(tài)場(chǎng)值和局部動(dòng)態(tài)場(chǎng)值進(jìn)行移動(dòng)[13-14]。

        1.4.1 局部靜態(tài)場(chǎng)

        對(duì)于局部靜態(tài)場(chǎng)而言,其計(jì)算公式依照以下兩種情況:

        (1)當(dāng)dlim=d時(shí),行人的移動(dòng)方向不受決策點(diǎn)的影響,保持著直線(xiàn)方向朝目標(biāo)場(chǎng)所行走(圖5),該情況下局部靜態(tài)場(chǎng)計(jì)算式如下:

        圖5 決策點(diǎn)對(duì)行人無(wú)影響

        (2)當(dāng)dlim>d時(shí),行人的移動(dòng)方向?qū)⑹艿經(jīng)Q策點(diǎn)的影響,此時(shí)行人將轉(zhuǎn)向移動(dòng)(圖6),該情況下局部靜態(tài)場(chǎng)S(i,j)計(jì)算式如下:

        圖6 決策點(diǎn)對(duì)行人產(chǎn)生影響

        1.4.2 局部動(dòng)態(tài)場(chǎng)計(jì)算公式

        對(duì)于局部動(dòng)態(tài)場(chǎng)而言,以行人在全局動(dòng)態(tài)場(chǎng)中所處位置為中心的3×3矩陣值作為局部動(dòng)態(tài)場(chǎng)值。根據(jù)經(jīng)典場(chǎng)域模型理論,當(dāng)(i,j)的元胞有行人經(jīng)過(guò)時(shí),則在下一時(shí)間步,該元胞動(dòng)態(tài)場(chǎng)值D(i,j)=D(i,j)+1,其中,記擴(kuò)散比例系數(shù)μ=0.1,衰減比例系數(shù)δ=0.2,當(dāng)某一時(shí)刻元胞的動(dòng)態(tài)場(chǎng)值D(i,j)≤ 0.1,則令D(i,j)= 0。

        如圖7所示,局部動(dòng)態(tài)場(chǎng)取值于以行人在全局動(dòng)態(tài)場(chǎng)中所處位置為中心的3×3矩陣值,為了與實(shí)際情況相結(jié)合,本模型不考慮行人后退移動(dòng)的情況,從而行人的左后(右后)和正后方網(wǎng)格取值為0,基于該情況,計(jì)算式如下:

        圖7 局部動(dòng)態(tài)場(chǎng)取值過(guò)程

        其中,D(i,j)為矩陣在全局動(dòng)態(tài)中所對(duì)應(yīng)的位置;ND為局部動(dòng)態(tài)場(chǎng)的歸一化因子,計(jì)算表達(dá)式如下:

        綜合前面計(jì)算所得的局部靜態(tài)場(chǎng)和動(dòng)態(tài)場(chǎng)值,可以得到行人的3×3移動(dòng)狀態(tài)轉(zhuǎn)移概率公式:

        其中,kS為靜態(tài)場(chǎng)敏感度參數(shù);kD為動(dòng)態(tài)場(chǎng)敏感度參數(shù);ξ(i,j)表示元胞是否被行人所占據(jù),有行人占據(jù)則值為0,反之取1;N為歸一化因子,用來(lái)保證3×3狀態(tài)轉(zhuǎn)移矩陣概率之和為1,其計(jì)算表達(dá)式如下:

        1.5 實(shí)驗(yàn)?zāi)P?/h3>

        基于上述人員行走規(guī)則和傳染病傳播模式相互交叉迭代形成最終的元胞自動(dòng)機(jī)系統(tǒng),從而實(shí)現(xiàn)復(fù)雜密閉環(huán)境下傳染病傳播過(guò)程?,F(xiàn)將建立的模型描述如下:

        (1)設(shè)置模型網(wǎng)絡(luò)空間大小,出入口坐標(biāo)集合和障礙物坐標(biāo)集合。

        (2)按照傳染病傳播演化規(guī)則模擬COVID-19傳染病傳播過(guò)程。

        (3)按照式(10)計(jì)算得到行人移動(dòng)狀態(tài)轉(zhuǎn)移概率矩陣,進(jìn)行有目標(biāo)的避讓障礙物行走。當(dāng)出現(xiàn)競(jìng)爭(zhēng)同一網(wǎng)格時(shí),將按照等概率原則隨機(jī)選取一名個(gè)體進(jìn)入目標(biāo)網(wǎng)格。

        (4)在以后的每一個(gè)離散時(shí)刻交叉迭代步驟(2)至步驟(3),模擬COVID-19在郵輪內(nèi)部個(gè)體活動(dòng)過(guò)程中的傳播過(guò)程。

        2 以“鉆石公主號(hào)”為例的實(shí)現(xiàn)

        2.1 公主號(hào)郵輪

        本文選取“鉆石公主號(hào)”郵輪第5層甲板進(jìn)行模擬仿真,該層的基本數(shù)據(jù)如表1所示。

        表1 “鉆石公主號(hào)”第5層甲板基本數(shù)據(jù)表

        通過(guò)Netlogo編程平臺(tái)[15-16],制作了可視化模擬器作為本模型的載體,包括呈現(xiàn)實(shí)時(shí)狀態(tài),實(shí)時(shí)調(diào)節(jié)可變參數(shù),實(shí)時(shí)輸出模擬數(shù)據(jù)等功能,如圖8所示。

        圖8 可視化仿真圖像

        2.2 模型參數(shù)配置

        表2 仿真參數(shù)取值表

        2.3 隔離措施對(duì)疫情傳播的影響

        為了比較采取隔離措施對(duì)疫情防控的積極影響,借助本模型制作了SEI傳染病模型下的仿真模擬。最大仿真天數(shù)設(shè)置為28天,其中,隔離措施下的隔離者被標(biāo)記為灰色,并移動(dòng)至郵輪環(huán)境外來(lái)保證仿真總?cè)藬?shù)不變且隔離者不對(duì)郵輪內(nèi)部其他人員產(chǎn)生影響。

        圖9分別表示采取隔離措施時(shí)仿真時(shí)間為第 3、7、11、15、19和 25天的 COVID-19傳播情況。圖10分別表示未采取隔離措施時(shí)仿真時(shí)間為第3、7、11、15、19和25天的COVID-19傳播情況。此外,本模型利用文獻(xiàn)[2]給出的地鐵站內(nèi)COVID-19傳染率參數(shù)進(jìn)行仿真,參數(shù)取值如表3所示。

        圖9 COVID-19隔離條件下的演化過(guò)程

        表3 傳染率參數(shù)取值表

        圖10 COVID-19自然傳播下的演化過(guò)程

        圖9—圖10中的紅色點(diǎn)代表感染者,黃色點(diǎn)代表潛伏者,綠色點(diǎn)代表健康者。通過(guò)圖9和圖10不同時(shí)刻的演化過(guò)程,發(fā)現(xiàn)自然傳播條件下,郵輪內(nèi)部的感染人群數(shù)量不斷增加,而隔離措施下的感染者和潛伏者達(dá)到一定數(shù)量便維持恒定。

        圖11(a)中表示的是未隔離情況下,三種人群不同時(shí)刻狀態(tài)曲線(xiàn)圖,從11(a)中可以看出,潛伏者在中期達(dá)到了頂峰,健康者有一個(gè)下降最快的區(qū)間,過(guò)了這段區(qū)間后下降速率減緩,感染者相反,但通過(guò)趨勢(shì)可以看出,健康者人數(shù)最終會(huì)趨于0,感染者人數(shù)將趨于總?cè)藬?shù)450。

        圖11 兩種措施下人群感染狀態(tài)趨勢(shì)圖

        圖11(b)表示的是隔離情況下,四種人群不同時(shí)刻狀態(tài)曲線(xiàn)圖,從圖11(b)中可以看出,健康者人數(shù)不像圖11(a),有一個(gè)下降最快的區(qū)間,而且潛伏者和感染者人數(shù)一直維持著一個(gè)較低的水平。但從曲線(xiàn)整體趨勢(shì)來(lái)看,健康者依舊會(huì)被全部感染,但所需要的時(shí)間將遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于圖 11(a)所示情況。

        兩幅圖對(duì)比之后可以看出,采取隔離措施能有效的減緩COVID-19傳播速度,并抑制其進(jìn)一步擴(kuò)散,而未采取隔離措施時(shí),COVID-19傳播情況等同于自然狀態(tài)下的SEI傳播特征,隨著后續(xù)仿真天數(shù)進(jìn)一步延長(zhǎng),健康者均會(huì)被感染。

        2.4 行人出行對(duì)疫情傳播的影響

        考慮當(dāng)模擬過(guò)程中出現(xiàn)第一例感染者時(shí),便限制行人出行,由原來(lái)的所有行人均可出行調(diào)整為75%、50%和25%的行人可以外出。

        對(duì)比上述采取隔離措施情形,得到不同限制條件下的行人出行數(shù)量對(duì)疫情傳播的影響,如圖12所示。其中,曲線(xiàn)表示的是健康者隨時(shí)間的數(shù)量變化。從圖12看出,限制行人出行的防控效果十分有效,且隨著限制力度的提高,即出行人數(shù)的下降,感染人數(shù)將得到有效的控制,圖中當(dāng)限制75%的行人出行時(shí),對(duì)疫情的控制效果和隔離措施條件下的控制效果相當(dāng),且在后期顯示出來(lái)的防控效果優(yōu)于采取隔離措施條件。

        圖12 限制行人出行對(duì)疫情傳播的影響

        2.5 個(gè)人防護(hù)措施對(duì)疫情傳播的影響

        考慮人群對(duì)疫情的重視,采取一定的防護(hù)措施(例如戴口罩等)降低潛伏者和感染者傳染健康人群的傳染幾率,此時(shí)對(duì)于這部分人群,傳染率參數(shù)取值調(diào)整如表4所示。

        表4 采取防護(hù)措施后傳染率取值表

        對(duì)比上述采取隔離措施情形,得到采取防護(hù)措施對(duì)疫情傳播的影響如圖13所示。從圖13看出,采取個(gè)人防護(hù)措施在一定程度上能減緩COVID-19傳播程度,但效果不如采取隔離措施好。

        圖13 防護(hù)措施對(duì)疫情傳播的影響

        2.6 仿真結(jié)果分析

        通過(guò)上述數(shù)值實(shí)驗(yàn)結(jié)果可以看出,人口流動(dòng)性會(huì)增大疫情的傳播規(guī)模,因此當(dāng)出現(xiàn)新冠肺炎疫情時(shí),行人需要盡量降低外出的頻率,此外,為了降低疫情在密閉復(fù)雜環(huán)境中的傳播概率,需要采取個(gè)人防護(hù)措施,并且盡量遠(yuǎn)離人群。最后,在進(jìn)行流行病調(diào)查時(shí),一旦發(fā)現(xiàn)確診的感染者,需要及時(shí)地采取隔離措施防止疫情繼續(xù)的擴(kuò)散。

        3 結(jié)論

        本文將復(fù)雜密閉環(huán)境下的COVID-19傳播模型通過(guò)人員行走與傳染病傳播交叉迭代的方式進(jìn)行實(shí)現(xiàn),較為真實(shí)地還原了郵輪內(nèi)部人員日常出入場(chǎng)所的行為特征,符合現(xiàn)實(shí)情況。

        從仿真結(jié)果可以看出,將元胞自動(dòng)機(jī)理論借助Netlogo仿真工具去實(shí)現(xiàn)的方法適用于各類(lèi)仿真模擬實(shí)驗(yàn),既避免了傳統(tǒng)的微分方程帶來(lái)的復(fù)雜計(jì)算量,又客觀(guān)有效地反映了疾病傳播的動(dòng)態(tài)過(guò)程,得到了是否采取隔離措施、是否采取防護(hù)措施以及限制不同出行人數(shù)對(duì)COVID-19傳播的影響,通過(guò)模型的仿真結(jié)果得到,當(dāng)疫情發(fā)生時(shí),采取個(gè)人防護(hù)措施并減少外出是防范疫情的最佳策略。

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