李中源 曾忠秀 李夢(mèng)霜 姜夢(mèng)柯 楊林美 杜 欣 李淑英
(玉溪師范學(xué)院化學(xué)生物與環(huán)境學(xué)院,云南玉溪 653100)
無(wú)花果(Ficus carica Linn.)又名奶漿果、映日果、蜜果等,為桑科榕屬落葉灌木或小喬木,現(xiàn)全國(guó)各地均有栽培,新疆南部尤多[1]。無(wú)花果具有極高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值和食用價(jià)值,可作食用,亦可作藥用[2-3]。植物內(nèi)生菌因具有作為新型抗菌藥物篩選源的巨大潛力而備受關(guān)注,關(guān)于內(nèi)生菌的研究也成為近年來(lái)的熱點(diǎn)。內(nèi)生細(xì)菌在與宿主長(zhǎng)期協(xié)同進(jìn)化的過(guò)程中,逐漸形成了對(duì)抗、互惠等多種關(guān)系,能夠直接或間接調(diào)節(jié)宿主的生長(zhǎng)發(fā)育、協(xié)助宿主抵抗病蟲(chóng)害及環(huán)境脅迫等。內(nèi)生細(xì)菌在與宿主互作的過(guò)程中能夠產(chǎn)生豐富多樣的次級(jí)代謝產(chǎn)物,逐漸成為新型天然產(chǎn)物開(kāi)發(fā)研究的資源庫(kù)。近年來(lái),內(nèi)生細(xì)菌及其次級(jí)代謝產(chǎn)物廣泛應(yīng)用于新藥研發(fā)、生物防治等領(lǐng)域,展現(xiàn)出巨大的研究與開(kāi)發(fā)價(jià)值[4-5]。
本試驗(yàn)從無(wú)花果汁中分離出內(nèi)生細(xì)菌19株,用金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、大腸桿菌(Escherichia coli)、變形桿菌(Proteus vulgaris)采用平板對(duì)峙法篩選到4株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌,活性檢測(cè)后選擇活性最強(qiáng)的2株觀察其形態(tài),研究生長(zhǎng)條件及Cr6+對(duì)其生長(zhǎng)的影響,以期為無(wú)花果活性?xún)?nèi)生細(xì)菌的深入開(kāi)發(fā)利用提供依據(jù)。
供試材料為無(wú)花果(Ficus carica Linn.),于超市購(gòu)買(mǎi)。
供試菌種為金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),于湖北省工業(yè)微生物菌種保藏與研究中心購(gòu)買(mǎi);大腸桿菌(Escherichia coli)和變形桿菌(Proteus vulgaris),為我校微生物實(shí)驗(yàn)室保存。
供試培養(yǎng)基為L(zhǎng)B培養(yǎng)基和發(fā)酵培養(yǎng)基。LB培養(yǎng)基配方為胰蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,NaCl 10 g,瓊脂20 g,蒸餾水1 000 mL;發(fā)酵培養(yǎng)基配方為黃豆粉10g,甘露醇10g,蒸餾水1000mL,pH值7.0~7.5。2種培養(yǎng)基均于121℃條件下滅菌30 min備用。
1.2.1 無(wú)花果內(nèi)生細(xì)菌的分離及純化。取新鮮無(wú)花果用無(wú)菌水沖洗后用75%乙醇浸泡2 min,然后用無(wú)菌水沖洗3次,再用3%NaClO浸泡3 min,之后用無(wú)菌水沖洗3次。沖洗消毒后的無(wú)花果用無(wú)菌刀切為小塊后轉(zhuǎn)入研缽,加100 mL無(wú)菌水與滅菌石英砂充分研磨。取0.5 mL菌液加入有4.5 mL無(wú)菌水的試管中,稀釋10倍,吹打均勻。同樣方法制成稀釋1 000倍的菌懸液,靜置15 min。取這兩種菌懸液的上清液各0.5 mL涂布LB平板,每個(gè)濃度涂3個(gè)LB平板,35℃恒溫培養(yǎng)24~48 h,挑選生長(zhǎng)良好的單菌落純化2~3次保存于4℃冰箱備用。同時(shí),將最后一遍沖洗無(wú)花果的無(wú)菌水涂布于LB培養(yǎng)基上作對(duì)照,35℃培養(yǎng)24~48 h。
1.2.2 無(wú)花果活性?xún)?nèi)生細(xì)菌的篩選。用金黃色葡萄球菌、大腸桿菌、變形桿菌和分離純化得到的內(nèi)生細(xì)菌于LB固體培養(yǎng)基平板上劃線(xiàn)(平板對(duì)峙法),于35℃下培養(yǎng)24~48 h后觀察抑菌線(xiàn),篩選出活性?xún)?nèi)生細(xì)菌。
1.2.3 活性?xún)?nèi)生細(xì)菌細(xì)胞DAN提取、PCR擴(kuò)增及測(cè)序。采用改良的CTAB法[6-7]提取DNA,經(jīng)電泳檢測(cè)后進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
(1)PCR 擴(kuò)增。 采用 30 μL 體系:提取所得 DNA 1 μL、前引物和后引物各 1 μL(細(xì)菌通用引物:前引物 27F5′-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3′和后引物1525R5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′)、Taq 酶5.5 μL(Ex Taq 0.1 μL、10×Ex Taq Buffer 3 μL、dNTP mixture 2.4 μL)。
擴(kuò)增程序:94℃預(yù)變性 4 min,94℃變性 30 s,57℃退火 30 s,72℃延伸 1 min,33個(gè)循環(huán),最后72℃延伸10 min。
(2)堿基序列測(cè)序。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后送至上海捷瑞生物工程有限公司進(jìn)行堿基測(cè)序,將測(cè)序得到的16S rDNA基因序列在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行BLAST比對(duì),與數(shù)據(jù)庫(kù)中的已知序列進(jìn)行同源性比較。
1.2.4 活性?xún)?nèi)生細(xì)菌革蘭氏染色及芽孢染色。革蘭氏染色及芽孢染色參照文獻(xiàn)[8]進(jìn)行?;钚?xún)?nèi)生細(xì)菌培養(yǎng)至24 h進(jìn)行革蘭氏染色;培養(yǎng)至16 h開(kāi)始進(jìn)行芽孢染色[9],時(shí)間間隔為2 h,培養(yǎng)至24 h后每隔0.5 h進(jìn)行一次芽孢染色,最初出現(xiàn)芽孢的時(shí)間即為產(chǎn)芽孢時(shí)間。
1.2.5 無(wú)花果活性?xún)?nèi)生細(xì)菌活性檢測(cè)。采用牛津杯瓊脂擴(kuò)散法來(lái)檢測(cè)內(nèi)生菌抑菌效果,取活化的3株檢測(cè)指示菌分別制成菌懸液(5 mL無(wú)菌水洗脫3次),分別取0.5 mL傾注法接種于牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基上,倒置培養(yǎng)24 h;篩選出的內(nèi)生細(xì)菌分別接種到發(fā)酵培養(yǎng)基中,37℃恒溫120 r/min搖床培養(yǎng)48 h,取發(fā)酵培養(yǎng)液置于無(wú)菌離心管中,在轉(zhuǎn)速4 000 r/min下離心30 min,得到無(wú)細(xì)胞上清液;將接種了檢測(cè)指示菌的平板等分為3份,用口徑與牛津杯接近的打孔器在培養(yǎng)基上打孔后放入無(wú)菌牛津杯中,加無(wú)細(xì)胞上清液20 μL于牛津杯中,37℃培養(yǎng)48 h后測(cè)量其抑菌圈大小。
1.2.6 無(wú)花果活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)條件優(yōu)化。將2株有活性的無(wú)花果內(nèi)生細(xì)菌斜面轉(zhuǎn)接2~3次,35℃下培養(yǎng)24 h備用;用5 mL無(wú)菌水洗脫斜面,重復(fù)3次,轉(zhuǎn)入無(wú)菌試管中備用?;罨N及制備菌懸液后測(cè)定培養(yǎng)時(shí)間、初始pH值、溫度和重金屬離子(Cr6+)對(duì)活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響。
(1)培養(yǎng)時(shí)間對(duì)2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響。取LB液體培養(yǎng)基100 mL,加入1 mL菌懸液,每株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌設(shè)3個(gè)平行,置于35℃、轉(zhuǎn)速120 r/min下恒溫振蕩培養(yǎng),選用光電比濁法[8]制作細(xì)菌生長(zhǎng)曲線(xiàn)。培養(yǎng)過(guò)程(96 h)中每隔12 h取樣1次,于可見(jiàn)分光光度計(jì)600 nm下測(cè)其吸光度,繪制2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌的生長(zhǎng)曲線(xiàn)。
(2)初始pH值對(duì)2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響。將LB液體培養(yǎng)基pH值分別調(diào)節(jié)為5、6、7、8,每種pH值分別接入不同菌株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌,100 mL培養(yǎng)基接入1 mL菌懸液,不同菌株各pH值均設(shè)3個(gè)平行,置于35℃、轉(zhuǎn)速120 r/min下恒溫振蕩培養(yǎng)48 h,于可見(jiàn)分光光度計(jì)600 nm下測(cè)其吸光度。
(3)溫度對(duì)2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響。取LB液體培養(yǎng)基,分別加入不同菌株菌懸液,100 mL培養(yǎng)基加 1 mL菌懸液,分別置于 16、30、37、45℃,轉(zhuǎn)速120 r/min下恒溫振蕩培養(yǎng)48 h,不同菌株同一溫度下各設(shè)3個(gè)平行,于可見(jiàn)分光光度計(jì)600 nm下測(cè)其吸光度。
(4)重金屬離子(Cr6+)對(duì)2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響。取LB液體培養(yǎng)基配成Cr6+濃度分別為5、10、20、40、60、80 mg/L 的培養(yǎng)基,100 mL 培養(yǎng)基接入1 mL菌懸液,不同菌株同一Cr6+濃度各設(shè)3個(gè)平行,置于35℃、轉(zhuǎn)速120 r/min下恒溫振蕩培養(yǎng)48 h,于可見(jiàn)分光光度計(jì)600 nm下測(cè)其吸光度。
根據(jù)菌落形態(tài)、顏色、濕潤(rùn)度等特征從無(wú)花果汁中分離得到19株內(nèi)生細(xì)菌,經(jīng)金黃色葡萄球菌、大腸桿菌和變形桿菌篩選后得到2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌,編號(hào)分別為3251、3252。其中:3251單菌落為圓形,表面潤(rùn)滑,菌落隆起,呈乳白色不透明狀;3252單菌落為圓形,表面潤(rùn)滑,菌落隆起,呈淡黃色不透明狀。二者均為典型的細(xì)菌菌落特征。革蘭氏染色發(fā)現(xiàn),2株內(nèi)生菌均為革蘭氏陽(yáng)性菌,桿狀。
2株無(wú)花果活性?xún)?nèi)生細(xì)菌的16S rDNA序列片段大小均為1 500 bp左右(圖1),獲得序列號(hào)分別為KJ499776和KJ499777,經(jīng)過(guò)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)BLAST比對(duì),二者均為芽孢桿菌屬細(xì)菌,16S rDNA同源性比對(duì)結(jié)果如表1所示。經(jīng)過(guò)生理生化特征試驗(yàn),依據(jù)芽孢桿菌命名規(guī)則,分別命名為Bacillus WHG3251和Bacillus WHG3252。
表1 16S rDNA同源性比對(duì)結(jié)果
芽孢染色發(fā)現(xiàn),Bacillus WHG3251芽孢形成時(shí)間為25 h,Bacillus WHG3252芽孢形成時(shí)間為26 h。譚麗雪等[9]研究發(fā)現(xiàn),1株簡(jiǎn)單芽孢桿菌芽孢形成時(shí)間為16 h,1株枯草芽孢桿菌芽孢形成時(shí)間為43 h。很多因素都會(huì)影響芽孢形成,比如營(yíng)養(yǎng)缺乏、高濃度礦物元素、高細(xì)胞密度和輻射等都可引發(fā)營(yíng)養(yǎng)體細(xì)胞的分化并形成芽孢。對(duì)特定的微生物而言,需要探索其合適的條件控制其芽孢的形成。本試驗(yàn)2株來(lái)自無(wú)花果汁的芽孢桿菌產(chǎn)芽孢時(shí)間有一定差異,具體機(jī)制還需要進(jìn)一步深入研究。
由表2可知,從無(wú)花果汁中分離篩選到的2株內(nèi)生細(xì)菌經(jīng)過(guò)48 h發(fā)酵培養(yǎng)后都能產(chǎn)生活性物質(zhì),確定2株芽孢桿菌是有活性的內(nèi)生細(xì)菌。根據(jù)抑菌圈直徑大小,Bacillus WHG3251對(duì)3株檢測(cè)菌種的抑菌效果明顯強(qiáng)于Bacillus WHG3252。說(shuō)明無(wú)花果汁內(nèi)存在可產(chǎn)生豐富多樣的次級(jí)代謝產(chǎn)物的活性?xún)?nèi)生細(xì)菌,可考慮作為新型天然產(chǎn)物開(kāi)發(fā)研究的菌種來(lái)源,為新藥研發(fā)提供依據(jù),本試驗(yàn)篩選到的Bacillus WHG3251更具有藥物開(kāi)發(fā)價(jià)值。
表2 無(wú)花果活性菌株發(fā)酵液活性成分抑菌效果 單位:cm
2.5.1 培養(yǎng)時(shí)間對(duì)2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)曲線(xiàn)的影響。如圖2所示,2株無(wú)花果活性?xún)?nèi)生細(xì)菌在LB培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)周期較長(zhǎng),并且生長(zhǎng)變化有一定差異。其中:Bacillus WHG3251在0~60 h生長(zhǎng)緩慢,表現(xiàn)為生長(zhǎng)環(huán)境適應(yīng)調(diào)整期,60 h后增長(zhǎng)迅速,96 h時(shí)生長(zhǎng)達(dá)到較高水平;Bacillus WHG3252對(duì)生長(zhǎng)環(huán)境的適應(yīng)時(shí)間相對(duì)較長(zhǎng)、衰亡時(shí)間較早,72 h后生長(zhǎng)迅速,84 h時(shí)達(dá)到生長(zhǎng)最高水平,96 h時(shí)已經(jīng)進(jìn)入衰亡狀態(tài)。細(xì)菌生長(zhǎng)與細(xì)菌類(lèi)型有關(guān)[10-11],同時(shí)受生長(zhǎng)環(huán)境的影響。盡管細(xì)菌生長(zhǎng)曲線(xiàn)沒(méi)有明顯的衰亡期,但這并不影響生長(zhǎng)曲線(xiàn)的趨勢(shì)以及對(duì)菌株對(duì)數(shù)期和穩(wěn)定期的判斷[12]。
2.5.2 pH值對(duì)2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響。培養(yǎng)基初始pH值是影響細(xì)菌生長(zhǎng)及細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的重要因素,不同細(xì)菌適宜初始pH值有差異。研究發(fā)現(xiàn),大部分植物內(nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)最適pH值為7.0[13-14]。陳正培等[15]從百香果果漿中分離得到的3株內(nèi)生細(xì)菌最適pH值均為5.5,認(rèn)為與它們的存在環(huán)境有關(guān)。由圖3可知:初始pH值分別為7和6時(shí),Bacillus WHG3251和Bacillus WHG3252這2株無(wú)花果內(nèi)生細(xì)菌菌液吸光度最高,生長(zhǎng)最旺盛;而pH值為8時(shí),2株內(nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)受到明顯影響。說(shuō)明Bacillus WHG3251和Bacillus WHG3252這2株內(nèi)生細(xì)菌對(duì)堿性環(huán)境比較敏感,弱酸條件也不利于其生長(zhǎng),初始pH值分別以7和6最利于其生長(zhǎng)。
2.5.3 培養(yǎng)溫度對(duì)2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響。溫度對(duì)細(xì)菌生長(zhǎng)影響顯著,培養(yǎng)溫度通過(guò)影響細(xì)胞內(nèi)酶活力和細(xì)胞膜的通透性進(jìn)而影響細(xì)菌的生長(zhǎng)繁殖。由圖4可知:Bacillus WHG3251和Bacillus WHG3252這2株無(wú)花果內(nèi)生細(xì)菌在30℃時(shí)生長(zhǎng)較好,說(shuō)明2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌屬于中溫型細(xì)菌;隨著培養(yǎng)溫度升高(37℃和45℃),2株無(wú)花果內(nèi)生細(xì)菌的生長(zhǎng)受到一定影響,溫度越高影響程度越大;低溫(16℃)條件下,無(wú)花果內(nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)較緩慢。
2.5.4 重金屬離子(Cr6+)對(duì)2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響。微生物能吸收和轉(zhuǎn)化重金屬及其化合物,但是當(dāng)環(huán)境中重金屬濃度增加到一定程度時(shí),就會(huì)抑制微生物的生長(zhǎng)代謝作用甚至引起微生物死亡[16]。研究者一般認(rèn)為,微生物抗金屬的機(jī)制主要有生物吸附、胞外沉淀、生物轉(zhuǎn)化、生物累積和外排作用[17]。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)很多微生物對(duì)金屬鉻尤其對(duì)六價(jià)鉻有抗性,其中有些微生物可以把鉻從高毒的六價(jià)還原成低毒的三價(jià),具有巨大的應(yīng)用潛力[18]。由圖5可以看出:培養(yǎng)基Cr6+濃度為10 mg/L時(shí),對(duì)Bacillus WHG3251、Bacillus WHG3252的生長(zhǎng)有促進(jìn)作用,且對(duì)Bacillus WHG3252的促進(jìn)作用較明顯;當(dāng)Cr6+濃度超過(guò)20 mg/L時(shí),對(duì)2株無(wú)花果內(nèi)生細(xì)菌的生長(zhǎng)都有抑制作用,高濃度Cr6+條件下2株無(wú)花果活性?xún)?nèi)生細(xì)菌有微弱生長(zhǎng)。重金屬促進(jìn)微生物生長(zhǎng)的能力稱(chēng)為毒物興奮效應(yīng)[19]。鉻誘導(dǎo)可使SOD等含量顯著增加,提高活性?xún)?nèi)生細(xì)菌抗氧化能力,降低鉻脅迫導(dǎo)致的活性氧傷害[20],因而一定濃度的重金屬離子處理會(huì)表現(xiàn)出對(duì)活性?xún)?nèi)生細(xì)菌的生長(zhǎng)有促進(jìn)作用。
本試驗(yàn)從無(wú)花果汁中篩選到2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌,通過(guò)提取DNA和PCR擴(kuò)增后堿基測(cè)序、NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),發(fā)現(xiàn)2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌均為芽孢桿菌屬細(xì)菌;經(jīng)生理生化驗(yàn)證后,將2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌分別命名為Bacillus WHG3251和Bacillus WHG3252;芽孢染色后發(fā)現(xiàn),Bacillus WHG3251芽孢形成時(shí)間為25 h,Bacillus WHG3252芽孢形成時(shí)間為 26 h;革蘭氏染色結(jié)果表明,2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌均為革蘭氏陽(yáng)性菌,桿狀;發(fā)酵培養(yǎng)后,2株無(wú)花果活性?xún)?nèi)生細(xì)菌均有活性物質(zhì)產(chǎn)生,可作為新藥物開(kāi)發(fā)研究的資源庫(kù),其中Bacillus WHG3251產(chǎn)生的活性物質(zhì)的抑菌效果強(qiáng)于Bacillus WHG3252。對(duì)2株無(wú)花果活性?xún)?nèi)生細(xì)菌進(jìn)行生長(zhǎng)條件優(yōu)化研究發(fā)現(xiàn):2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)時(shí)間有一定差異,Bacillus WHG3251在96 h時(shí)生長(zhǎng)達(dá)到較高水平,Bacillus WHG3252在84h達(dá)到最高水平、96 h時(shí)已經(jīng)進(jìn)入衰亡期;Bacillus WHG3251和Bacillus WHG3252這2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)最適pH值分別為7和6;2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌均為中溫菌,最適生長(zhǎng)溫度為30℃;重金屬離子(Cr6+)對(duì)2株活性?xún)?nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響較明顯,Cr6+濃度為10 mg/L時(shí)對(duì)其生長(zhǎng)表現(xiàn)出較強(qiáng)的促進(jìn)作用,Cr6+濃度大于20 mg/L時(shí)表現(xiàn)為抑制作用。