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        DEFB1 基因rs11362 位點(diǎn)多態(tài)性與齲病易感性的Meta 分析

        2022-08-09 06:33:42胡曉潘周建業(yè)周海靜李志強(qiáng)劉耀新
        甘肅醫(yī)藥 2022年6期
        關(guān)鍵詞:齲病多態(tài)性異質(zhì)性

        胡曉潘 周建業(yè) 周海靜 李志強(qiáng) 劉耀新

        1.西北民族大學(xué)口腔醫(yī)學(xué)院,甘肅 蘭州730000;2.甘肅省口腔疾病研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,甘肅 蘭州730000

        齲病是一種多因素共同作用的慢性感染性疾病,是口腔的多發(fā)病和常見病,有高達(dá)60%~90%的學(xué)校適齡兒童患齲病[1]。據(jù)第四次全國口腔流行病學(xué)調(diào)查顯示,12~15 歲青少年恒牙患齲率分別為38.5%、41.2%、43.3%、44.4%,青少年患齲率隨年齡逐年遞增,防齲任務(wù)嚴(yán)峻[2]。隨著分子生物學(xué)和人類基因組學(xué)研究的深入,越來越多的證據(jù)顯示,基因遺傳因素在齲病的發(fā)生和發(fā)展中扮演著重要的角色,患齲風(fēng)險(xiǎn)與宿主易感基因的多態(tài)性有關(guān)[3-4]。目前證據(jù)顯示,與齲病易感性相關(guān)的基因主要集中在以下四類:釉質(zhì)形成基因、唾液蛋白基因、免疫應(yīng)答基因以及味覺基因[5]。β 防御素1(beta defensin 1,DEFB1)是一種小分子抗微生物多肽,其廣泛存在于唾液中,作為機(jī)體防御性物質(zhì)參與天然免疫應(yīng)答,具有明顯的抗微生物作用,研究發(fā)現(xiàn)唾液DEFB1 的表達(dá)水平與齲病的發(fā)生密切相關(guān)[6-7]。DEFB1 基因rs11362 多態(tài)性與齲病的關(guān)聯(lián)研究已有多篇文獻(xiàn)報(bào)道,但是研究結(jié)論并不完全一致[8-9]。本研究將借助Meta分析綜合評(píng)估相關(guān)研究,探究DEFB1 基因rs11362 多態(tài)性與齲病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的確切關(guān)系。

        1 資料與方法

        1.1 檢索策略 采用計(jì)算機(jī)系統(tǒng)檢索PubMed、Web of Science、Springerlink、Embace、維普、CNKI、萬方以及CBM等數(shù)據(jù)庫,以“β 防御素1,基因多態(tài)性,齲病”為中文關(guān)鍵詞,以“DEFB1/beta defensin 1,Caries,Gene polymorphism”為英文關(guān)鍵詞,收集有關(guān)DEFB1 基因rs11362多態(tài)性與齲病易感性的相關(guān)文獻(xiàn),包括學(xué)位論文。其他可利用的文獻(xiàn)均采取文獻(xiàn)追溯的方法來確定,文獻(xiàn)檢索時(shí)間截止到2020 年12 月1 日。

        1.2 納入和排除標(biāo)準(zhǔn)

        1.2.1 納入標(biāo)準(zhǔn)。①研究均為病例對(duì)照研究;②DEFB1基因rs11362 多態(tài)性與齲病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)文獻(xiàn);③各研究實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和方法相似;④文獻(xiàn)數(shù)據(jù)完整,納入文獻(xiàn)的對(duì)照組需遵循HWE 定律;⑤文章以中文或英文形式全文發(fā)表。

        1.2.2 排除標(biāo)準(zhǔn)。①無對(duì)照組或未提供病例基本信息的文獻(xiàn);②重復(fù)報(bào)道的文獻(xiàn)以及信息少、無法利用的文獻(xiàn);③綜述,會(huì)議論文或未全文發(fā)表的摘要等。

        1.3 提取數(shù)據(jù)及文獻(xiàn)質(zhì)量評(píng)價(jià) 本研究由兩名研究者進(jìn)行文獻(xiàn)篩選,交叉核對(duì),不一致時(shí)進(jìn)行討論解決或由第三位研究者協(xié)助解決。提取信息包括:第一作者、文獻(xiàn)發(fā)表時(shí)間、國家/地區(qū)、人種、基因檢測(cè)類型、樣本量及兩組人群的基因組數(shù)量等。文獻(xiàn)質(zhì)量評(píng)價(jià)采用Newcastle-Ottawa Scale(NOS)[10]量表,以病例組和對(duì)照組的選擇、組間可比性及危險(xiǎn)因素的暴露情況進(jìn)行評(píng)價(jià),當(dāng)質(zhì)量評(píng)分≥4 分時(shí),認(rèn)為質(zhì)量可靠;評(píng)分≥7 分時(shí),認(rèn)為是高質(zhì)量的研究。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 使用Stata 15.0 軟件進(jìn)行Meta 分析,計(jì)量資料利用均數(shù)差(MD)為效應(yīng)指標(biāo),分類變量采用相對(duì)危險(xiǎn)度(RR)為效應(yīng)指標(biāo)。研究的各效應(yīng)量均給出點(diǎn)估計(jì)值和95%CI,采用χ2檢驗(yàn)評(píng)估各研究結(jié)果間的統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性(檢驗(yàn)水準(zhǔn)為α=0.1),并結(jié)合I2定量判斷異質(zhì)性的大小。當(dāng)各研究間無統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性(I2<50%,P>0.1),則采用固定效應(yīng)模型進(jìn)行Meta 分析;當(dāng)各研究間存在統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性,則進(jìn)一步分析異質(zhì)性來源,在排除明顯臨床異質(zhì)性的影響后,采用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行Meta 分析。當(dāng)各研究結(jié)果存在明顯的臨床異質(zhì)性時(shí),則采用亞組分析處理。Meta 分析的檢驗(yàn)水準(zhǔn)設(shè)為α=0.05。

        2 結(jié)果

        2.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果 初檢出相關(guān)文獻(xiàn)27 篇,經(jīng)全文篩選后,發(fā)現(xiàn)DEFB1 基因rs11362 多態(tài)性與齲病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān)的病例對(duì)照研究9 篇。嚴(yán)格按照納入標(biāo)準(zhǔn)和排除標(biāo)準(zhǔn)逐次剔除4 項(xiàng)研究(1 項(xiàng)研究人群對(duì)照組不遵循HWE 定律[11],有2 項(xiàng)研究未提供詳細(xì)的基因型和等位基因頻率[12-13],1 項(xiàng)研究為會(huì)議摘要[14])。最終納入病例對(duì)照研究5 篇,其中岳海泉等[15]和Oliveira D 等[8]2 項(xiàng)研究包含兩個(gè)不同民族或地域的獨(dú)立研究,可各自視為2 項(xiàng)病例對(duì)照研究。因此,本次Meta分析共納入7 項(xiàng)病例對(duì)照研究(5 篇英文,2 篇中文)。其中有5 項(xiàng)研究對(duì)象為Caucasian,2 項(xiàng)研究為Asian,可納入的研究對(duì)象共計(jì)1 696 例(病例組905 例,對(duì)照組791 例),納入研究的基本情況見表1。

        表1 納入研究的基本特征

        2.2 Meta 分析結(jié)果 如圖1 和表2 所示,異質(zhì)性檢驗(yàn)結(jié)果顯示在顯性模型(CC+TC vs TT)中各研究間不存在統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性(Ph=0.45,I2=0.0%),故采用固定效應(yīng)模型進(jìn)行Meta 分析,結(jié)果顯示DEFB1 基因rs11362 多態(tài)性與齲病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無明顯相關(guān)性(P=0.07,OR=0.77,95%CI=0.58~1.02)。如表2 所示,異質(zhì)性檢驗(yàn)結(jié)果顯示,在顯性模型(CC vs TT)中各研究間存在統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性(Ph=0.08,I2=47.5%),故采用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行Meta 分析,結(jié)果顯示DEFB1 基因rs11362 多態(tài)性與齲病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無明顯相關(guān)性(P=0.23,OR=0.76,95%CI=0.49~1.19)。同樣的,在(C vs T)和(CC vs TC+TT)模型中各研究間均存在顯著異質(zhì)性,采用隨機(jī)模型進(jìn)行合并分析,結(jié)果顯示在等位基因C vs T 模型及隱形模型CC vs TC+TT中均未發(fā)現(xiàn)DEFB1 基因rs11362 多態(tài)性與齲病存在顯著相關(guān)性(C vs T:P=0.42,OR=0.89,95%CI=0.67~1.19;CC vs TC+TT:P=0.86,OR=0.96,95%CI=0.61~1.52)。

        圖1 DEFB1 基因rs11362 多態(tài)性與齲病易感性的關(guān)系(CC+TC vs TT)

        2.3 亞組分析結(jié)果 在各個(gè)模型下,按不同人種進(jìn)行亞組分析,結(jié)果未發(fā)現(xiàn)DEFB1 基因rs11362 多態(tài)性與齲病易感性在Caucasian 及Asian 人種中具有顯著相關(guān)性(P>0.05)。見表2。

        表2 Meta 分析結(jié)果

        2.4 發(fā)表偏倚 各模型Meta 分析未見明確的發(fā)表偏倚。以顯性模型CC+TC vs TT 為例(圖2),利用Begg's test繪制漏斗圖,結(jié)果納入的研究完整地出現(xiàn)在圖上,且以合并效應(yīng)量OR 值為中心散開分布,基本對(duì)稱,呈倒置漏斗型。進(jìn)一步采用Egger's test 進(jìn)行檢驗(yàn),結(jié)果顯示P=0.430,表明各模型納入合并分析的研究無明確的發(fā)表偏倚。

        圖2 發(fā)表偏倚分析漏斗圖(CC+TC vs TT)

        2.5 敏感性分析 在CC+TC vs TT、C vs T、CC vs TT 及CC vs TC+TT 4 種模型中分別進(jìn)行逐一剔除敏感性分析,剔除前后Meta 分析總效應(yīng)量未發(fā)生明顯變化。

        3 討論

        齲病的發(fā)生、發(fā)展與宿主因素、環(huán)境因素及其交互作用有著密切的聯(lián)系,基因遺傳、唾液、微生物以及抗菌肽等多種影響因素都扮演著重要的角色[16-17]。來源于唾液中的β 防御素是由β 防御素基因表達(dá)的一種小分子多肽,具有良好的抗微生物性能,可在生物體和環(huán)境間形成第一道免疫屏障,有研究[6,9]發(fā)現(xiàn)唾液β 防御素-1 的濃度與齲病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)呈負(fù)相關(guān),提示β 防御素-1 對(duì)抵抗齲病的發(fā)生有重要的作用。

        DEFB1 基因定位于人8p23.1,由36 個(gè)氨基酸組成,約7.0kb,存在多個(gè)基因多態(tài)性位點(diǎn),rs11362 位點(diǎn)(C/T)位于基因的啟動(dòng)子區(qū)域。2010 年,Ozturk A 等[7]首次報(bào)道了DEFB1 基因rs11362 位點(diǎn)基因多態(tài)性與齲病易感性的關(guān)系,研究發(fā)現(xiàn)基因變異使得人群患高齲的風(fēng)險(xiǎn)提高了5.4 倍(P=0.007;OR=5.4;95%CI=1.58~18.44)。2013年,在一項(xiàng)對(duì)唇腭裂兒童患齲易感性的關(guān)系研究中,研究者[18]發(fā)現(xiàn),rs11362 等位基因C 攜帶者患齲風(fēng)險(xiǎn)增加了3.16 倍(P=0.031;OR=3.16;95%CI=0.97~10.62),然而該研究對(duì)象全部為唇腭裂患兒,而非健康人群。同年,岳海泉等[15]對(duì)355 例漢族和裕固族人群患齲風(fēng)險(xiǎn)與rs11362 基因多態(tài)性進(jìn)行了關(guān)聯(lián)研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)以CC 為參照,TC 基因型使得裕固族人群患齲風(fēng)險(xiǎn)降低了2.3倍(OR=0.438;95%CI=0.201~0.783),然而研究中的漢族人群未發(fā)現(xiàn)相關(guān)性,提示遺傳變異可能與種族相關(guān)。隨后的一項(xiàng)關(guān)于土耳其2~5 歲兒童乳牙患齲風(fēng)險(xiǎn)的研究中[13]未發(fā)現(xiàn)rs11362 位點(diǎn)基因多態(tài)性與其相關(guān),而另一項(xiàng)關(guān)于意大利成人恒牙患齲風(fēng)險(xiǎn)的研究中[12],研究者卻發(fā)現(xiàn)T 等位基因攜帶者可增加人群的患齲風(fēng)險(xiǎn),與前所述的研究結(jié)論不一致,然而這兩項(xiàng)研究均未給出具體的基因型頻率,僅提供了P 值或者是OR(95%CI)值,筆者曾試圖聯(lián)系并獲得詳細(xì)的數(shù)據(jù),但最終仍無法獲得,因此,這兩項(xiàng)研究沒有出現(xiàn)在Meta 分析模型中。同樣地,2016 年,Yildiz G 等[11]對(duì)土耳其成人恒牙患齲風(fēng)險(xiǎn)的研究中,結(jié)果也發(fā)現(xiàn)T 等位基因攜帶者可使人群的患齲風(fēng)險(xiǎn)提高5.5 倍,然而令人遺憾的是,經(jīng)過反復(fù)核算,該研究人群對(duì)照組不遵循HWE 定律(P=0.001),因此,該項(xiàng)研究也未出現(xiàn)在Meta 分析模型中。2017 年,Lips A 等[9]研究發(fā)現(xiàn)巴西地區(qū)兒童β 防御素-1 的濃度與齲病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)呈負(fù)相關(guān),但該研究并沒有發(fā)現(xiàn)rs11362 位點(diǎn)基因多態(tài)性與患齲風(fēng)險(xiǎn)有顯著關(guān)聯(lián)性。隨后Oliveira D 等[8]分別對(duì)巴西地區(qū)兩組青少年人群(Manaus 和Ribeirao Preto)進(jìn)行了相關(guān)多態(tài)性研究,結(jié)果僅發(fā)現(xiàn)Ribeirao Preto 地區(qū)兒童在混合牙列組患齲風(fēng)險(xiǎn)與rs11362 基因多態(tài)性顯著關(guān)聯(lián)(P=0.02),研究結(jié)論在不同地區(qū)不同組別中存在差異。

        本研究應(yīng)用Meta 分析方法較為全面地分析了DEFB1 基因rs11362 位點(diǎn)基因多態(tài)性與齲病易感性及患齲風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系,以基因型CC 為參照,結(jié)果未發(fā)現(xiàn)二者存在明顯關(guān)聯(lián)性(P>0.05),按人種進(jìn)行亞組分析,結(jié)果同樣沒有發(fā)現(xiàn)二者存在顯著相關(guān)性(P>0.05),因此,Meta 分析結(jié)果提示DEFB1 基因rs11362 位點(diǎn)多態(tài)性可能與患齲風(fēng)險(xiǎn)無關(guān)。這與前述的某些單項(xiàng)研究結(jié)論不一致,可能與研究的樣本量大小有關(guān)。本研究對(duì)符合納入標(biāo)準(zhǔn)的多項(xiàng)獨(dú)立研究進(jìn)行合并分析,共涉及905例病例患者,791 例對(duì)照人群,在一定程度上克服了樣本量小的局限性,較大的樣本量使得研究結(jié)果可信度更高。本次研究,未發(fā)現(xiàn)明確的發(fā)表偏倚,在敏感性分析中Meta 分析總效應(yīng)量在剔除前后均未發(fā)生明顯改變,以上結(jié)果提示本次Meta 分析研究結(jié)果較為可靠。盡管如此,本研究也存在一定的不足:①齲病是一種多基因引起的基因遺傳疾病,研究單基因單位點(diǎn)基因多態(tài)性可能影響結(jié)果的全面性,提示后期需要對(duì)多個(gè)基因多個(gè)位點(diǎn)多態(tài)性進(jìn)行關(guān)聯(lián)及交互研究;②年齡是影響患齲風(fēng)險(xiǎn)的重要因素,原始研究之間年齡范圍跨度相對(duì)較大,可能影響結(jié)果的可靠性,建議后期研究要在控制年齡因素影響的前提下,進(jìn)行大樣本人群的驗(yàn)證研究;③病例對(duì)照組按照DMFT/DMFS 的分組標(biāo)準(zhǔn)不夠統(tǒng)一,飲食習(xí)慣及口腔衛(wèi)生狀況的不一致性也可能造成結(jié)果的不準(zhǔn)確性,需要后期研究加以考慮;④本研究納入的文獻(xiàn)僅限定在中英文文獻(xiàn),可能有其他語種的相關(guān)文獻(xiàn)遺失,即使未發(fā)現(xiàn)明顯的發(fā)表偏倚,但不能排除發(fā)表偏倚存在的可能。

        綜上所述,綜合現(xiàn)有證據(jù)尚未發(fā)現(xiàn)DEFB1 基因rs11362 位點(diǎn)多態(tài)性與齲病患病風(fēng)險(xiǎn)存在顯著關(guān)聯(lián)性,其與齲病發(fā)生發(fā)展的確切關(guān)系還有待后期更全面更科學(xué)的評(píng)價(jià),建議后期研究要把控好研究樣本的一致性,開展更多高質(zhì)量的大樣本人群研究,建議采用定性分析和定量分析相結(jié)合,將易感基因多態(tài)性和其他影響因素相結(jié)合,并進(jìn)行綜合分析評(píng)價(jià),為齲病的早期預(yù)防、早期診斷和早期治療提供更加科學(xué)合理的防治策略。

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