蔣淑萍 劉昌偉 李斌 徐小琴 羅文基 余柏林 張?jiān)?/p>
目前,診斷肺結(jié)核主要依靠細(xì)菌學(xué)檢測(cè),方法有多種,如萋-尼抗酸染色法(acid-fast stain,AFS),此方法操作簡單、快捷及經(jīng)濟(jì),但敏感度較低,容易漏檢;培養(yǎng)法是檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)的金標(biāo)準(zhǔn),但耗時(shí)較長,需1~2個(gè)月才能出結(jié)果,且極易受環(huán)境、人為操作等影響,同時(shí)后期還可能需要繼續(xù)進(jìn)行菌種鑒定,影響結(jié)核病的早期診斷;組織病理學(xué)檢查雖有較高的準(zhǔn)確性,但有創(chuàng)傷性;分子生物學(xué)技術(shù)能直接檢測(cè)MTB特有的核酸序列,且操作方便、快速及敏感度和特異度高,是目前結(jié)核病診斷的發(fā)展趨勢(shì),但其價(jià)格昂貴,不適合基層醫(yī)院普遍開展[1-3]。因此,探索一種更合適的早期診斷方法至關(guān)重要。交叉引物核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(cross-priming amplification,CPA)是一種新型恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù),具有操作簡單、報(bào)告快速及相對(duì)便宜等特點(diǎn),具有廣泛應(yīng)用前景[4-5]。以固體培養(yǎng)法為參照對(duì)CPA技術(shù)檢測(cè)效能評(píng)價(jià)已見報(bào)道,但以液體培養(yǎng)法為參照進(jìn)行評(píng)價(jià)罕見報(bào)道。為此,本研究通過以BACTEC MGIT 960(簡稱“MGIT 960”)液體培養(yǎng)法為參照,與AFS 法比較,評(píng)估CPA技術(shù)在MTB檢測(cè)中的效能。
1.一般資料:收集2020年1月至2021年5月在深圳市龍華區(qū)慢性病防治中心就診的初診疑似肺結(jié)核患者2507例,排除99例非結(jié)核分枝桿菌感染者,共納入2408例進(jìn)行分析。其中男1607例,女801例;年齡6~93歲,中位年齡[M(Q1,Q3)]為32(26~45)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)咳嗽、咳痰時(shí)間>2周,自愿到院接受各項(xiàng)相關(guān)檢查;(2)初診疑似肺結(jié)核;(3)未經(jīng)抗結(jié)核治療;(4)能送檢至少1份合格痰標(biāo)本;(5)患者及家屬知情并簽訂知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)未同時(shí)進(jìn)行3種方法檢測(cè)者;(2)非結(jié)核分枝桿菌感染或定植者;(3)不自愿配合者;(4)檢測(cè)期間,由于技術(shù)原因?qū)е陆Y(jié)果缺失者;(5)任一方法檢測(cè)結(jié)果為無效者。(6)AFS陽性而MPB64抗原陰性者。
2.倫理:本研究經(jīng)深圳市龍華區(qū)慢性病防治中心倫理委員會(huì)批準(zhǔn)同意([2020]03號(hào))。
4%氧氧化鈉(廣東汕頭西隴化工有限公司);p H值6.8的磷酸緩沖鹽溶液(無錫傲銳東源生物科技有限公司);萋-尼抗酸染色試劑(上海皓信生物科技有限公司);MGIT 960液體培養(yǎng)試劑(美國BD公司);MTB抗原試劑盒(杭州創(chuàng)新生物檢控技術(shù)有限公司);CPA檢測(cè)試劑(杭州優(yōu)思達(dá)生物技術(shù)有限公司)。
1.標(biāo)本采集:對(duì)患者進(jìn)行留痰宣教后,患者自行留取就診當(dāng)日及時(shí)痰、夜間痰及就診次日清晨痰共3份,每份2~5 ml,及時(shí)送檢。收到標(biāo)本后將3份標(biāo)本混合成1份,然后同時(shí)采用AFS法、MGIT 960液體培養(yǎng)法及CPA技術(shù)進(jìn)行檢測(cè)。
2.AFS法:參照《結(jié)核病實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)規(guī)程》[6]抗酸桿菌顯微鏡檢查標(biāo)準(zhǔn)化操作程序進(jìn)行。藍(lán)色背景下抗酸桿菌呈紅色,連續(xù)觀察300個(gè)不同視野,未發(fā)現(xiàn)抗酸桿菌為陰性;發(fā)現(xiàn)3~9個(gè)/300個(gè)視野或更多為陽性。
3.MGIT 960 液體培養(yǎng)法:嚴(yán)格按照MGIT 960系統(tǒng)操作說明書進(jìn)行操作,培養(yǎng)時(shí)間設(shè)定為42 d。儀器報(bào)告陽性后,即取培養(yǎng)液進(jìn)行抗酸染色及MPB64抗原檢測(cè)。若抗酸染色和MPB64抗原檢驗(yàn)均陽性者則為培養(yǎng)陽性;若二者全部為陰性或抗酸染色陰性和MPB64抗原陽性者,判為污染菌,需將培養(yǎng)液當(dāng)標(biāo)本消化處理后再培養(yǎng);若抗酸染色陽性而MPB64抗原陰性者則疑似非結(jié)核分枝桿菌,本研究予以排除。儀器培養(yǎng)42 d后報(bào)陰性者則為培養(yǎng)陰性。
4.MPB64抗原檢測(cè)方法:取待鑒定的液體培養(yǎng)液100μl滴至檢測(cè)板樣本檢測(cè)區(qū),15~60 min內(nèi)觀察檢測(cè)結(jié)果。檢測(cè)線(T)和質(zhì)控線(C)均出現(xiàn)紫紅色條帶者為陽性,檢測(cè)線(T)沒出現(xiàn)紫紅色條帶而質(zhì)控線(C)出現(xiàn)紫紅色條帶者為陰性,質(zhì)控線(C)沒出現(xiàn)紫紅色條帶者均需重新檢測(cè)。
5.CPA 技術(shù):采用Easy NAT 恒溫?cái)U(kuò)增-試紙條法試劑盒及核酸提取試劑對(duì)MTB-DNA 進(jìn)行提取,操作均嚴(yán)格按照說明書要求進(jìn)行。若痰液標(biāo)本黏稠度較高,取適量標(biāo)本以4%NaOH 消化(根據(jù)黏稠度加入1~2倍),然后進(jìn)行離心、生理鹽水洗滌、加核酸提取試劑及100℃金屬浴等處理,得到上清DNA模板,然后取DNA模板液于玻璃化反應(yīng)體系管中進(jìn)行核酸恒溫?cái)U(kuò)增,完成后取出反應(yīng)管置入一次性防污染檢測(cè)裝置,扣緊進(jìn)行檢測(cè),1~2 min讀取結(jié)果。結(jié)果判斷標(biāo)準(zhǔn):(1)陽性:質(zhì)控線(C)和檢測(cè)線(T)同時(shí)顯色,或僅出現(xiàn)T線顯色,這表明樣本中含有MTB,且含菌量已達(dá)到或超出了試劑盒的最低檢出限。(2)陰性:僅C線顯色,這表明樣本中并不含有MTB 或其含菌量未達(dá)到試劑盒最低檢出限。(3)無效:C線和T線均未顯色,這表明操作有誤、試劑盒受損或有擴(kuò)增抑制物,如遇此情況,需要查明導(dǎo)致結(jié)果無效的原因,重新檢測(cè)。
6.相關(guān)指標(biāo)計(jì)算:敏感度=真陽性例數(shù)/(真陽性例數(shù)+假陰性例數(shù))×100%;特異度=真陰性例數(shù)/(真陰性例數(shù)+假陽性例數(shù))×100%;陽性預(yù)測(cè)值=真陽性例數(shù)/(真陽性例數(shù)+假陽性例數(shù))×100%;陰性預(yù)測(cè)值=真陰性例數(shù)/(真陰性例數(shù)+假陰性例數(shù))×100%;符合率=(真陽性例數(shù)+真陰性例數(shù))/患者總例數(shù)×100%。
7.質(zhì)量控制:痰檢質(zhì)量室間質(zhì)量評(píng)價(jià)由北京結(jié)核病診斷技術(shù)創(chuàng)新聯(lián)盟以及深圳市慢性病防治中心組織進(jìn)行,質(zhì)評(píng)結(jié)果全部合格。室內(nèi)質(zhì)控2020年涂陽培陰率為0.25%,液體培養(yǎng)污染率為7.93%,CPA檢測(cè)無效率0。
8.觀察指標(biāo):不同方法MTB陽性檢出率、敏感度、一致性及培養(yǎng)陽性時(shí)間與敏感度的相關(guān)性。
應(yīng)用SPSS 21.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件處理數(shù)據(jù)。計(jì)數(shù)資料采用“百分率(%)”描述,差異性比較采用χ2檢驗(yàn);非正態(tài)性計(jì)量資料以”中位數(shù)(四分位數(shù))”描述;結(jié)果一致性采用Kappa檢驗(yàn),Kappa值≥0.75為一致性很好,0.40≤Kappa值<0.75為一致性較好,Kappa值<0.40時(shí)為一致性較差;相關(guān)性采用卡方趨勢(shì)性檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
AFS法、MGIT 960液體培養(yǎng)法及CPA技術(shù)MTB陽性檢出率分別為8.89%(214/2408)、27.99%(674/2408)及15.49%(373/2408),不同方法之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=314.619,P=0.000),其中MGIT 960液體培養(yǎng)法明顯高于CPA技術(shù)和AFS法,而CPA 技術(shù)高于AFS法,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=110.572,P=0.000;χ2=292.158,P=0.000;χ2=49.046,P=0.000)。
以MGIT 960 液體培養(yǎng)結(jié)果作為參照標(biāo)準(zhǔn),CPA檢測(cè)MTB的敏感度、特異度、陽性預(yù)測(cè)值、陰性預(yù)測(cè)值及符合率分別為52.37%、98.85%、94.64%、84.23%及85.84%(2067/2408),而AFS法分別為31.45%、99.88%、99.07%、78.94%及80.73%(1944/2408),其中CPA技術(shù)的敏感度明顯高于AFS 法,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=108.290,P=0.000)。以MGIT 960液體培養(yǎng)結(jié)果為參照標(biāo)準(zhǔn),CPA技術(shù)與MGIT 960液體培養(yǎng)法一致性較好(Kappa=0.592),而AFS法較差(Kappa=0.395)。同時(shí)AFS法陽培陰率為0.08%(2/2408),培養(yǎng)污染率為5.40%(130/2408),而CPA 檢測(cè)無效例數(shù)為0(表1)。
表1 以MGIT 960液體培養(yǎng)結(jié)果為參照評(píng)估CPA技術(shù)檢測(cè)MTB效能
MGIT 960液體培養(yǎng)報(bào)陽時(shí)間為3~42 d,中位數(shù)(四分位數(shù))為14(10,19)d,其中68.10%的標(biāo)本報(bào)陽在7~19 d,而CPA 檢測(cè)敏感度隨培養(yǎng)報(bào)陽時(shí)間增加而降低。經(jīng)趨勢(shì)性卡方檢驗(yàn),CPA 敏感度隨培養(yǎng)報(bào)陽時(shí)間的增加而呈下降趨勢(shì)(Z趨勢(shì)=257.788,P=0.000),兩者呈負(fù)相關(guān)(r=-0.988,P=0.000)(表2)。
表2 CPA檢測(cè)敏感度與MGIT 960液體培養(yǎng)報(bào)陽時(shí)間相關(guān)性
結(jié)核病是由MTB感染,并經(jīng)呼吸道傳播的一種嚴(yán)重慢性傳染性疾病。隨著人們?cè)陲嬍沉?xí)慣和作息時(shí)間的改變及社會(huì)壓力劇增等因素的共同影響下,人體免疫力下降,從而導(dǎo)致近年來結(jié)核病發(fā)病率呈持續(xù)上升趨勢(shì),且年輕化。MTB感染潛伏期長達(dá)4~8周,早期無任何臨床癥狀或癥狀輕微,易被疏忽,確診時(shí)病情已發(fā)展到活動(dòng)階段,錯(cuò)過了最佳的治療時(shí)機(jī),嚴(yán)重影響患者及時(shí)診斷、治療及傳播防控[7-9]。因此,加強(qiáng)結(jié)核病早期診斷對(duì)控制病情發(fā)展及傳播至關(guān)重要。
CPA是我國自主研發(fā)的第一個(gè)具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的體外核酸擴(kuò)增技術(shù),主要包括玻璃引物、交叉引物、探針及具有鏈置換功能的DNA 聚合酶,針對(duì)MTB特異性基因片段進(jìn)行擴(kuò)增,然后利用免疫層析乳膠標(biāo)記的試紙條進(jìn)行檢測(cè),能排除非結(jié)核分枝桿菌的影響,而AFS法則不能,從而提高CPA 技術(shù)檢測(cè)效能[10-12]。本研究結(jié)果顯示,以MGIT 960液體培養(yǎng)結(jié)果為參照,CPA 技術(shù)MTB 陽性檢出率(15.49%)明顯高于AFS法(8.89%),但CPA 技術(shù)的MTB陽性檢出率明顯低于MGIT 960液體培養(yǎng)法(27.99%),而特異度高,這可能與CPA技術(shù)最低檢測(cè)下限和檢測(cè)原理有關(guān)。同時(shí)CPA 技術(shù)檢測(cè)MTB的敏感度(52.37%)明顯高于AFS法(31.45%),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,與劉蘭瑞等[2]的研究結(jié)果基本一致,且CPA技術(shù)與MGIT 960液體培養(yǎng)法檢查結(jié)果一致性(Kappa=0.592)明顯好于AFS法(Kappa=0.395),這表明CPA 技術(shù)在初診疑似肺結(jié)核診斷中與AFS法比較有較高的敏感度和一致性,可提高M(jìn)TB陽性檢出率。另外結(jié)果顯示,AFS法陽培陰率為0.08%及MGIT 960液體培養(yǎng)法培養(yǎng)污染率為5.40%,但未發(fā)現(xiàn)CPA 技術(shù)檢測(cè)無效案例,且CPA技術(shù)檢測(cè)全過程只需要2 h,可與AFS法相媲美。
有研究表明,以固體培養(yǎng)法結(jié)果為參照,CPA技術(shù)檢測(cè)MTB的敏感度約為84.1%~100%。本研究結(jié)果顯示,以MGIT 960液體培養(yǎng)結(jié)果為參照,CPA技術(shù)檢測(cè)MTB的敏感度僅有52.37%,明顯低于以固體培養(yǎng)法結(jié)果為參照的CPA 技術(shù)的敏感度,這可能與MGIT 960液體培養(yǎng)法的培養(yǎng)敏感度比固體培養(yǎng)法檢出能力更高,能將MTB含菌量更低的標(biāo)本培養(yǎng)出陽性等有關(guān)[13-16]。另外,有研究表明,液體培養(yǎng)檢出陽性結(jié)果時(shí)間與痰中分枝桿菌的數(shù)量有關(guān),標(biāo)本含菌量越低,報(bào)陽時(shí)間越長[17]。本研究結(jié)果顯示,MGIT 960液體培養(yǎng)中位報(bào)陽天數(shù)為14 d,68.10%的標(biāo)本在7~19 d內(nèi)報(bào)陽,與其他報(bào)道存在一定差異[18-21],這可能與不同地區(qū)標(biāo)本中MTB含量不同有關(guān)。同時(shí)CPA敏感度隨培養(yǎng)報(bào)陽時(shí)間的增加而呈下降趨勢(shì)(Z趨勢(shì)=257.788,P=0.000),且兩者呈負(fù)相關(guān)(r=-0.988,P=0.000),這表明CPA技術(shù)檢測(cè)MTB的敏感度與標(biāo)本中的MTB含菌量有關(guān)。此外,本研究收集了49 份MGIT 960液體培養(yǎng)陽性而CPA 陰性標(biāo)本,逐級(jí)增加標(biāo)本量進(jìn)行檢測(cè),其中14份標(biāo)本由陰性轉(zhuǎn)變?yōu)殛栃裕行┥踔撂盗吭黾拥? ml才出現(xiàn)陽性,從而可以推測(cè)對(duì)于CPA技術(shù)結(jié)果陰性而又高度懷疑結(jié)核病患者,可通過增大檢測(cè)標(biāo)本量,并對(duì)其進(jìn)行消化和梯隊(duì)濃縮的方案在一定程度上能提高CPA 技術(shù)檢出效能。
綜上所述,CPA 作為一種新型分子檢測(cè)方法,在初診疑似肺結(jié)核診斷中與AFS法比較有較高的陽性檢出率、敏感度、特異度和一致性。同時(shí)CPA技術(shù)不需價(jià)格高昂的特殊設(shè)備,檢測(cè)過程中不會(huì)產(chǎn)生有害物質(zhì)造成二次污染,且操作簡單方便、快速及經(jīng)濟(jì),具有較高的臨床應(yīng)用價(jià)值,但其試劑盒檢測(cè)下限有待提高。
利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突
作者貢獻(xiàn)蔣淑萍:實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、實(shí)施研究、采集數(shù)據(jù)、分析/解釋數(shù)據(jù)、統(tǒng)計(jì)分析、起草文章及審閱、獲取研究經(jīng)費(fèi)、技術(shù)支持;劉昌偉:實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、分析/解釋數(shù)據(jù)、審閱、統(tǒng)計(jì)分析、行政及技術(shù)支持與指導(dǎo);李斌:實(shí)施研究、采集數(shù)據(jù)、分析/解釋數(shù)據(jù)、審閱、行政及材料支持;徐小琴、羅文基、余柏林及張?jiān)拢簩?shí)施研究、采集數(shù)據(jù)、分析/解釋數(shù)據(jù)及審閱