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        河南省新鄉(xiāng)市禽腺病毒的分離鑒定

        2022-07-23 08:08:40王俊娜李凌薇王秋霞劉興友姜金慶裴大偉
        河南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年5期
        關(guān)鍵詞:新鄉(xiāng)市毒株測序

        王俊娜,李凌薇,王秋霞,師 雯,張 新,劉興友,姜金慶,裴大偉

        (1. 河南科技學(xué)院 動(dòng)物科技學(xué)院,河南 新鄉(xiāng) 453003;2. 新鄉(xiāng)學(xué)院 生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院,河南 新鄉(xiāng) 453003;3. 厚德食品股份有限公司,吉林 遼源 136200 )

        禽腺病毒(Fowl adenovirus,F(xiàn)AdV)為無囊膜的雙鏈DNA病毒,為腺病毒科、腺病毒屬的成員,是家禽和野禽常見的病原之一。FAdV 包括Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ等3 個(gè)群,其中Ⅱ群FAdV 主要引起火雞出血性腸炎;Ⅲ群FAdV 主要引起減蛋綜合征[1];而臨床上常見的心包積水(Hydropericardium syndrome,HPS)、包涵體肝炎(Inclusion body hepatitis,IBH)和心包積水-肝 炎 綜 合 征(Hydropericardium hepatitis syndrome,HHS)多為Ⅰ群引起[2]。HHS 最早于1987 年發(fā)生在巴基斯坦安哥拉地區(qū),隨后逐漸傳入多個(gè)國家,成為嚴(yán)重危害家禽業(yè)的傳染病之一。2012 年起,我國山東、河北、遼寧等地陸續(xù)出現(xiàn)HHS 病例。2015 年夏季,Ⅰ群FAdV 在山東、河南等多個(gè)省份肆虐[3],給家禽業(yè)造成了重大的經(jīng)濟(jì)損失。目前,Ⅰ群中FAdV-4 可以單獨(dú)引起發(fā)病,而其他毒株往往需要免疫抑制因素的協(xié)同作用才能致病[4]。

        FAdV 外殼蛋白主要由240 個(gè)六鄰體蛋白(Hexon)、12 個(gè)五鄰體蛋白(Penton)和纖維蛋白(Fiber)等構(gòu)成,其中Hexon 蛋白是主要的結(jié)構(gòu)蛋白,也是病毒表面含量最高的蛋白質(zhì),帶有主要的屬和亞屬特異性抗原決定簇,可用于FAdV 基因分型[5-6]。2020 年6—8 月,河南省新鄉(xiāng)市周邊地區(qū)多個(gè)養(yǎng)雞場發(fā)生疑似FAdV 感染類疫病,感染雞多為4~6 周齡的雛雞。為了解新鄉(xiāng)市周邊養(yǎng)殖場FAdV流行情況,采集4個(gè)規(guī)模化養(yǎng)殖場送檢的疑似FAdV感染的15份雞肝臟病料,針對(duì)FAdV-4Hexon基因保守區(qū)設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行PCR 檢測,對(duì)獲得的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測序和序列分析,以期了解FAdV 新鄉(xiāng)株的遺傳進(jìn)化關(guān)系,為研究其分子流行病學(xué)奠定基礎(chǔ)。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        1.1.1 病料樣品 對(duì)4個(gè)養(yǎng)雞場送檢的病雞進(jìn)行剖檢,隨機(jī)采集15 份疑似FAdV 感染雞肝臟病料。

        1.1.2 試驗(yàn)動(dòng)物 SPF雞胚購自北京勃林格殷格翰維通生物技術(shù)有限公司,SPF雞由SPF雞胚孵化。

        1.1.3 主要試劑 rTaq DNA 聚合酶、DL2000 Marker、pMD18-T 載體、病毒DNA 提取試劑盒等購自寶生物工程(大連)有限公司;瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購自O(shè)mega 公司;其他常規(guī)試劑均為分析純?cè)噭?/p>

        1.2 方法

        1.2.1 引物設(shè)計(jì) 參考GenBank 中FAdV-4 SDSX

        株基因序列(GenBank 登錄號(hào)為KT899325),利用Oligo(Version 6.0)軟件,針對(duì)Hexon基因設(shè)計(jì)2對(duì)特異性引物,引物序列和擴(kuò)增長度見表1。引物由生工生物工程(上海)有限公司合成。

        表1 試驗(yàn)中所用PCR擴(kuò)增引物Tab.1 Primers used for PCR in this study

        1.2.2 組織病料DNA 的提取 取采集的病雞肝組織,研磨后加入含青鏈霉素的PBS 制成懸液,反復(fù)凍融3 次,8 000 r/min 離心10 min,取上清液使用試劑盒按說明書提取病毒DNA。

        1.2.3Hexon基因的PCR 檢測 以提取的DNA 為模板,先使用設(shè)計(jì)的第1對(duì)引物進(jìn)行擴(kuò)增,再使用第2 對(duì)引物進(jìn)行檢測。PCR 反應(yīng)體系:模板DNA 2 μL,dNTP 2 μL,10×Buffer 2.5 μL,上、下游引物各1 μL,rTaq 聚合酶0.5 μL,補(bǔ)水至25 μL;以去離子水為空白對(duì)照。擴(kuò)增程序:95 ℃2 min;95 ℃1 min,55 ℃30 s,72 ℃20 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃10 min;4 ℃終止。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳分析。

        1.2.4 擴(kuò)增產(chǎn)物測序及序列分析 擴(kuò)增產(chǎn)物回收后送生工生物工程(上海)有限公司進(jìn)行測序鑒定,并對(duì)所得序列進(jìn)行分析。與GenBank 中FAdV-4Hexon基因核苷酸序列進(jìn)行比對(duì)分析,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。參考病毒株包括印度、韓國和國內(nèi)的一些分離株,具體信息見表2。

        表2 同源性分析所參考毒株信息Tab.2 Strain information referenced for homology analysis

        續(xù)表2 同源性分析所參考序列信息Tab.2(Continued) Sequence information referenced for homology analysis

        1.2.5 動(dòng)物回歸試驗(yàn) 根據(jù)測序結(jié)果,選取鑒定為陽性的病雞肝臟組織,液氮研磨后,加入無菌PBS充分混勻溶解,10 000 r/min 離心10 min,收集上清液,經(jīng)0.22 μm 微孔濾膜過濾除菌后,經(jīng)卵黃囊接種9日齡SPF雞胚;收集48 h后死亡和未死亡雞胚尿囊液,盲傳7 代進(jìn)行純繁;收集尿囊液,過濾除菌,按0.2 mL/只的劑量(含103EID50病毒)接種3 周齡SPF雞(對(duì)照組接種同體積的無菌PBS),每日觀察臨床癥狀。對(duì)病死雞剖檢,觀察病理變化,并取肝臟組織制備石蠟切片,HE染色觀察。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 Hexon基因片段PCR擴(kuò)增結(jié)果

        將采集的15份病死雞肝臟組織研磨,提取病毒DNA 作為模板,使用設(shè)計(jì)的Hexon-F1/R1 引物對(duì)進(jìn)行擴(kuò)增,并使用Hexon-F2/R2 引物對(duì)進(jìn)一步驗(yàn)證。Hexon-F1/R1 引物對(duì)電泳結(jié)果顯示,有8 個(gè)樣品在約300 bp 處出現(xiàn)明顯特異性條帶,有4 個(gè)樣品出現(xiàn)弱條帶,與預(yù)期擴(kuò)增片段長度相符;另有3個(gè)樣品未出現(xiàn)明顯條帶(圖1)。進(jìn)一步使用Hexon-F2/R2 引物對(duì)進(jìn)行驗(yàn)證擴(kuò)增,結(jié)果與Hexon-F1/R1 引物對(duì)擴(kuò)增結(jié)果一致,表明設(shè)計(jì)的引物能夠特異性擴(kuò)增Hexon基因片段。

        圖1 不同樣品Hexon基因片段的PCR擴(kuò)增Fig.1 PCR amplification of Hexon gene fragment in different samples

        2.2 Hexon基因擴(kuò)增片段序列比對(duì)結(jié)果

        將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行切膠純化,回收產(chǎn)物送公司進(jìn)行測序。測序結(jié)果經(jīng)NCBI BLAST 分析顯示,擴(kuò)增的部分Hexon基因序列均與FAdV-4 GDMZ 株(MG856954) 、 FAV-C CH/GDHZ-S7/2017 株(MK875249)、FAV-C GX-1 株(MH454598)等序列高度同源。測序結(jié)果進(jìn)一步證實(shí),本研究設(shè)計(jì)的引物具有較高的特異性,擴(kuò)增得到特異性的部分Hexon基因片段。

        2.3 Hexon基因片段序列分析結(jié)果

        根據(jù)BLAST 比對(duì)結(jié)果,擴(kuò)增的基因片段為FAdVHexon基因2 個(gè)不同位置的序列,將毒株命名為XX。將XX 與GenBank 參考毒株的Hexon基因核苷酸序列進(jìn)行同源性分析(圖2),結(jié)果顯示,XX 與FAdV-4Hexon高度同源,相似性大于95%;而與FAV-1 代 表 株CELO(U46933)同 源 性 較 低,為71.3%;與鴨FAdV-Ⅰ型代表株EDS(Y09598)同源性為15.9%。

        圖2 FAdV核苷酸序列同源性比對(duì)結(jié)果Fig.2 Homology alignment results of nucleotide sequences of FAdV Hexon gene

        根據(jù)同源性分析結(jié)果,利用Mega軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖3)。從圖3 可以看出,本研究分離的XX株與FAdV-4 毒株處于同一個(gè)分支,有較近的親緣關(guān)系,而與FAdV-1 代表株CELO 和鴨FAdV-Ⅰ型代表株EDS 位于不同的分支,親緣關(guān)系較遠(yuǎn),進(jìn)一步表明分離的毒株為FAdV-4型毒株。

        圖3 FAdV-4型XX株的遺傳進(jìn)化分析Fig.3 Phygenetic analysis of FAdV-4 XX strain

        2.4 動(dòng)物回歸試驗(yàn)結(jié)果

        將純繁后的病毒感染3 周齡SPF 雞,感染后前2 d,SPF 雞無明顯臨床癥狀,僅略有精神沉郁現(xiàn)象;3 d 后病雞出現(xiàn)明顯的精神沉郁、食欲減退現(xiàn)象,部分雞出現(xiàn)腹瀉情況;4 d后有雞只開始死亡,7 d后死亡逐漸停止;觀察至10 d,病雞死亡率達(dá)60%。剖檢可見死亡雞出現(xiàn)與臨床采集病例相似的癥狀,肝臟質(zhì)脆易碎,表面出現(xiàn)大小不等的出血點(diǎn);心臟有明顯的心包積液,呈淡黃色透明狀(圖4)。

        圖4 FADV-4 XX株感染雞組織病變Fig.4 Tissue lesions of SPF chicken infected by FADV-4 XX strain

        將采集的肝臟進(jìn)行組織病理學(xué)分析,與對(duì)照組雞的肝臟切片比較,結(jié)果顯示,感染組病雞的肝臟細(xì)胞核固縮,胞質(zhì)溶解,有淋巴細(xì)胞浸潤,出現(xiàn)明顯的壞死灶,在壞死灶的中心可看到包涵體(圖5)。

        圖5 FADV-4 XX株感染雞組織病理學(xué)觀察Fig.5 Histopathologic observation of SPF chicken infected by FADV-4 XX strain

        3 結(jié)論與討論

        2012 年以來,禽心包積水-包涵體肝炎綜合征在我國時(shí)有發(fā)生;2015 年在我國多個(gè)地方暴發(fā)流行,給我國養(yǎng)禽業(yè)造成了重大的經(jīng)濟(jì)損失[3]。該病主要由FAdV-4引起,具有高度傳染性,導(dǎo)致高死亡率[7],世界各地均有發(fā)生[8-10]。目前,禽心包積水-包涵體肝炎綜合征在我國仍然零星散發(fā),新鄉(xiāng)市周邊多個(gè)雞場出現(xiàn)疑似病例,死亡率較之前有所下降。

        新鄉(xiāng)市畜牧業(yè)比較發(fā)達(dá),據(jù)新鄉(xiāng)市統(tǒng)計(jì)局統(tǒng)計(jì),2018 年底,全市生豬存欄272.90 萬頭,家禽存欄3 159.16 萬只[11],一旦發(fā)生病毒性疾病,將會(huì)給養(yǎng)殖業(yè)帶來巨大的經(jīng)濟(jì)損失。為了解目前FAdV-4在新鄉(xiāng)市的流行情況,本研究參照GenBank 中FAdV-4Hexon基因序列,設(shè)計(jì)2 對(duì)引物,對(duì)新鄉(xiāng)市周邊4 個(gè)養(yǎng)雞場采集的16份疑似FAdV感染的肝臟組織樣品進(jìn)行檢測,檢出12份陽性樣品,樣品陽性率占75%,確定該病依然存在,對(duì)該病的防控仍需重視。

        從測序結(jié)果來看,本研究擴(kuò)增得到的幾個(gè)序列片段完全一致,判斷為同一個(gè)毒株,命名為XX 株。XX 株與FAdV-4 型參考毒株高度同源。測序結(jié)果表明,新鄉(xiāng)市流行的FAdV 主要為FAdV-4,同時(shí)也說明Hexon基因比較保守,能夠用于FAdV毒株的進(jìn)化分析[12-16]。由于本研究僅擴(kuò)增了Hexon基因的部分片段,其余部分是否存在變異或缺失,還需要進(jìn)一步擴(kuò)增Hexon基因的全長序列確定。

        本研究分離的FAdV-4 XX 株能夠引起SPF 雞精神沉郁、食欲減退、閉眼嗜睡甚至死亡等臨床癥狀,剖檢可見典型的心包積液,病雞肝臟腫大、質(zhì)脆、有明顯的壞死灶,這些癥狀和病理變化與其他人分離毒株感染動(dòng)物的結(jié)果一致[17-18]。本研究中,感染雞只死亡率可達(dá)60%,表明分離毒株毒力較強(qiáng)。根據(jù)動(dòng)物回歸試驗(yàn)結(jié)果,結(jié)合測序和序列分析結(jié)果,進(jìn)一步證實(shí)分離的病毒為FAdV-4。本研究依據(jù)Hexon基因序列對(duì)分離的毒株進(jìn)行分型,與以往FAdV 分離鑒定的依據(jù)一致[19-23]。這些結(jié)果為進(jìn)一步研究禽腺病毒分子流行情況和防控提供了技術(shù)支持。

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