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        根癌農(nóng)桿菌Atu4856 基因原核表達(dá)載體的構(gòu)建

        2022-07-21 06:13:44劉嘯宇后夢情程安琪胡傳俊
        農(nóng)產(chǎn)品加工 2022年11期
        關(guān)鍵詞:體系

        劉嘯宇,后夢情,程安琪,胡傳俊,姚 坤,吳 蕭

        (宿州學(xué)院生物與食品工程學(xué)院,安徽宿州 234200)

        農(nóng)桿菌介導(dǎo)法是目前轉(zhuǎn)化雙子葉植物最為廣泛使用的方法之一,該方法簡單,轉(zhuǎn)化機(jī)制明確、周期短,同時因轉(zhuǎn)入基因的拷貝數(shù)少,因此大大地降低了因同源抑制而產(chǎn)生基因沉默的可能性[1]。同時,該技術(shù)具有轉(zhuǎn)育周期較短、遺傳性狀較為穩(wěn)定、變異幅度較小、對農(nóng)藝和經(jīng)濟(jì)性狀干擾較少等特點(diǎn),已成為我國農(nóng)作物進(jìn)行外源基因?qū)霑r最常用的技術(shù)手段[2-3]。但同時也面臨一些重要的技術(shù)問題,如轉(zhuǎn)化效率低和轉(zhuǎn)化結(jié)果的未知性和不可控性等。為了進(jìn)一步了解根癌農(nóng)桿菌T-DNA 轉(zhuǎn)運(yùn)的分子機(jī)制,探討是否可以通過提高T- 復(fù)合物招募蛋白VBP 在農(nóng)桿菌細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)量來提高T-DNA 的轉(zhuǎn)化效率,這在植物轉(zhuǎn)基因方面的應(yīng)用具有重要意義。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        1.1.1 所用菌株

        Agrobacterium tumefaciensC58,E.coliDH5α,實(shí)驗(yàn)室保存,菌液與70%的甘油等體積保存在凍存管中,凍存于-75 ℃冰箱中。

        1.1.2 所用質(zhì)粒

        Prset-a,具有T7 啟動子,實(shí)驗(yàn)室保存;pegfp-n1,含有egfp基因的質(zhì)粒,實(shí)驗(yàn)室保存;prset-agfp1,Atu4856 基因上游495 bp 序列,帶上標(biāo)記基因gfp,插入啟動子已除去的prset-a 質(zhì)粒,構(gòu)建。

        1.1.3 所用引物

        所使用的引物信息(劃線部分為酶切位點(diǎn)) 見表1。

        表1 所使用的引物信息(劃線部分為酶切位點(diǎn))

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增帶有標(biāo)記基因的Atu4856啟動子序列

        (1) 擴(kuò)增495 bp 的啟動子序列。以Pv1、Pv2 為引物,BamHⅠ酶切位點(diǎn)在引物Pv1 上,配制反應(yīng)體系進(jìn)行PCR 反應(yīng),結(jié)束后,進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,并回收產(chǎn)物[4-5]。

        (2) 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增標(biāo)記基因——gfp。以Pgfp2,Pg2 為引物,以質(zhì)粒pegfp-n1 為模板,BamHⅠ酶切位點(diǎn)在引物Pg2 上,待反應(yīng)結(jié)束后,回收PCR產(chǎn)物,步驟同1.2.1 步驟(1)。

        (3) 擴(kuò)增Atu4856 啟動子帶標(biāo)記基因的全長序列。將1.2.1 中(1) (2) 步驟的產(chǎn)物混合,以Pv1 和Pg2 為引物,配置反應(yīng)體系進(jìn)行擴(kuò)增[6-7],產(chǎn)物回收,步驟同1.2.1 步驟(1)。

        重疊延伸PCR 的過程和體系見圖1,PCR 反應(yīng)的體系見表2。

        圖1 重疊延伸PCR 的過程和體系

        表2 PCR 反應(yīng)的體系/μL

        1.2.2 提取大腸桿菌prset- a 質(zhì)粒

        構(gòu)建啟動子探針載體的基本質(zhì)粒prset-a 見圖2。

        1.2.3 PCR 擴(kuò)增得到不含T7 啟動子的prset- a 質(zhì)粒

        在T7 啟動子基因序列的兩端設(shè)計(jì)引物P1 和P2,均含有BamHⅠ限制性位點(diǎn)。同時,以prset-a質(zhì)粒為擴(kuò)增模板,從prset-a 質(zhì)粒中去除T7 啟動子,反應(yīng)體系如表2 所述。PCR 反應(yīng)結(jié)束后,PCR 產(chǎn)物回收步驟同1.2.1 步驟(1)。

        1.2.4 DNA 的酶切、連接、轉(zhuǎn)化及重組子的篩選

        (1) 酶切以綠色熒光基因(gfp) 為報告基因的Atu4856 啟動子序列。用BamHⅠ酶切含gfp的Atu4856 啟動子序列。按照酶供應(yīng)商提供的說明進(jìn)行消化。按照表3 添加消化反應(yīng)系統(tǒng)。消化反應(yīng)體系置于37 ℃恒溫水浴中水浴加熱3 h。以非酶切序列為對照,用0.8%瓊脂糖凝膠電泳鑒定酶產(chǎn)物,用試劑盒回收產(chǎn)物,并將其保存在-20 ℃條件下備用[8]。

        酶切體系見表3。

        表3 酶切體系/μL

        (2) 去磷酸化和空載體酶切。用BamHⅠ酶切無T7 啟動子prset-a 的PCR 產(chǎn)物。消化反應(yīng)體系按表3混合,37 ℃下保溫3.5 h。電泳后回收1% (m/V)瓊脂糖凝膠,以防出現(xiàn)載體自連的現(xiàn)象[9],將按照表4 中體系進(jìn)行載體去磷酸化。

        載體去磷酸化體系見表4。

        表4 載體去磷酸化體系/μL

        (3) 連接。按照表5 所示的連接體系,將BamHⅠ酶切后的目的序列用T4 DNA Ligase 連接到BamHⅠ酶切后并去除磷酸化的載體上,于4 ℃下過夜連接,用于轉(zhuǎn)化。

        連接體系見表5。

        表5 連接體系/μL

        (4) 轉(zhuǎn)化。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)胞。

        (5) 重組子的篩選。挑取單菌落,用LB 培養(yǎng)基37 ℃下培養(yǎng),提取質(zhì)粒,接著用BamHⅠ酶切、鑒定[10]。將與目的條帶大小相同的陽性克隆片段進(jìn)行測序,命名含有Atu4856 啟動子的重組質(zhì)粒,即prsetagfp1,并將此菌種進(jìn)行保存。

        (6) 檢測探針載體的轉(zhuǎn)錄活性。挑取單菌落,用LB 培養(yǎng)基培養(yǎng),在對數(shù)生長期時,對菌液進(jìn)行離心、沉淀清洗,制片,在放大倍數(shù)為×400 的倒置熒光顯微鏡下觀察是否有熒光。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 帶有g(shù)fp 基因的Atu4856 啟動子序列擴(kuò)增

        以pegfp-n1 質(zhì)粒為模板,經(jīng)PCR 特異性擴(kuò)增獲得大小約750 bp 的綠色熒光蛋白基因(gfp) (圖2)。設(shè)計(jì)搭橋PCR 引物,通過重疊延伸PCR,將gfp基因連接到Atu4856 啟動子序列(圖3),形成大小約1 225 bp 的嵌合基因片段,作為其是否具有啟動子基因轉(zhuǎn)錄活性的報告基因。

        PCR 擴(kuò)增gfp基因電泳圖見圖2,PCR 擴(kuò)增帶有g(shù)fp的Atu4856 啟動子電泳圖見圖3。

        圖2 PCR 擴(kuò)增gfp 基因電泳圖

        圖3 PCR 擴(kuò)增帶有g(shù)fp 的Atu4856 啟動子電泳圖

        2.2 PCR 擴(kuò)增無T7 啟動子的質(zhì)粒(prset-a)

        模板采用質(zhì)粒prset-a,采用引物P1 和P2,通過PCR 擴(kuò)增得到不含T7 啟動子的質(zhì)粒prset-a,大小約2.7 kb(圖4),用于重組表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建。

        PCR 擴(kuò)增去除T7 啟動子的prset-a 質(zhì)粒電泳圖見圖4。

        圖4 PCR 擴(kuò)增去除T7 啟動子的prset-a 質(zhì)粒電泳

        2.3 酶切鑒定prset-agfp1 重組質(zhì)粒

        將BamHⅠ酶切后帶有綠色熒光基因(gfp) 的Atu4856 啟動子連接在BamHⅠ酶切后的prset-a 載體上,該載體無T7 啟動子,接著轉(zhuǎn)化到DH5α 大腸桿菌,培養(yǎng)過夜。經(jīng)過提質(zhì)粒、酶切、瓊脂糖凝膠電泳等一系列過程,驗(yàn)證與PCR 產(chǎn)物一致(圖5),同時將質(zhì)粒測序,測序結(jié)果表明prset-a 質(zhì)粒上成功插入了標(biāo)記基因(gfp) 的Atu4856 啟動子序列,載體構(gòu)建成功。

        酶切鑒定prset-agfp1 重組質(zhì)粒電泳圖見圖5。

        圖5 酶切鑒定prset-agfp1 重組質(zhì)粒電泳圖

        2.4 驗(yàn)證Atu4856 啟動子在探針載體中的活性

        取菌液制片,在倒置熒光顯微鏡下觀察。結(jié)果顯示,發(fā)射藍(lán)光時有熒光,而只帶prset-a 載體的大腸桿菌沒有熒光現(xiàn)象(圖6)。說明與gfp基因融合的載體已被成功構(gòu)建,帶有熒光基因(gfp) 的Atu4856啟動子序列被證明具有轉(zhuǎn)錄活性。

        未突變的含有495 bp Atu4856 上游序列重組質(zhì)粒E.coli(prset-agfp1) 的熒光觀察結(jié)果見圖6。

        圖6 未突變的含有495 bp Atu4856 上游序列重組質(zhì)粒E.coli(prset-agfp1) 的熒光觀察結(jié)果

        3 結(jié)論

        啟動子是構(gòu)建基因表達(dá)載體的重要因素,對外源基因的表達(dá)水平具有著重要的影響。查閱大量文獻(xiàn)、進(jìn)行理論分析和試驗(yàn)工作,通過PCR 方法,獲得了編碼VBP3 蛋白Atu4856 基因的全長啟動子序列。將prset-a 載體的T7 啟動子與GFP 基因重組后,用Atu4856 啟動子序列取代,成功構(gòu)建了能在大腸桿菌中表達(dá)的啟動子探針載體,并利用熒光蛋白研究農(nóng)桿菌Atu4856 基因在大腸桿菌中的表達(dá)調(diào)控機(jī)制。

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