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        基于16S rRNA測序技術(shù)分析HLAP患者腸道微生態(tài)變化及與IL-1、TNF-α的關(guān)聯(lián)性

        2022-07-18 13:28:32黃奕森曾以琳張長青陳雅妮王育斌
        江西醫(yī)藥 2022年6期
        關(guān)鍵詞:生態(tài)

        黃奕森,曾以琳,張長青,陳雅妮,王育斌

        (福建醫(yī)科大學(xué)附屬泉州第一醫(yī)院消化內(nèi)科,泉州 362000)

        高脂血癥性急性胰腺炎(Hyperlipidemic Acute Pancreatitis,HLAP)是由高三酰甘油血癥而誘發(fā)的急性胰腺炎,患者臨床上可出現(xiàn)胰腺局部炎性反應(yīng),更嚴(yán)重者甚至出現(xiàn)全身炎性反應(yīng)綜合征及器官功能衰竭。伴隨著我國生活方式以及飲食習(xí)慣的變化,高三酰甘油血癥已經(jīng)成為了急性胰腺炎的主要發(fā)病因素,同時其發(fā)病率也正逐年升高,但目前對于其發(fā)病機制并不清楚,且主要治療手段也不理想[2]。有文獻記載,當(dāng)腸道出現(xiàn)細菌易位,脂多糖等一系列毒素入侵體內(nèi)時,免疫細胞識別后會分泌大量的炎性因子,促進機體進入低炎性狀態(tài),所以對于患者機體炎性反映的檢測也是較為重要的[3]。腸道菌群變化是腸道微環(huán)境以及腸道結(jié)構(gòu)功能的重要影響成分,有研究發(fā)現(xiàn),急性胰腺炎患者需要較長時間的禁食,這會導(dǎo)致腸道菌群失衡以及腸道屏障功能受到破壞[4]。但目前對于腸道微生態(tài)變化是否促進HLAP的發(fā)生與發(fā)展還有待考究[5]。因此本研究選取我院收治的60例急性胰腺炎患者以及同期61例健康體檢者臨床資料進行分析,研究基于16S rRNA測序技術(shù)分析HLAP患者腸道微生態(tài)變化及與IL-1、TNF-α的關(guān)聯(lián)性。

        1 資料與方法

        1.1一般資料 選取2020年6月至2020年12月泉州市第一醫(yī)院收治的60例急性胰腺炎患者以及同期61例健康體檢者作為研究對象,將其中高脂血癥性急性胰腺炎列入HLAP組(n=33),非高脂血癥性急性胰腺炎列入非HLAP組(n=27),健康體檢者作為對照組(n=61)。HALP組33例,男性16例,女性17例,年齡38~61歲,平均年齡(53.23±5.98)歲,BMI指數(shù)19~23 kg/m2,平均BMI指數(shù)(22.41±1.01)kg/m2;非HALP組患者27例,男性14例,女性13例,年齡37~61歲,平均年齡(53.08±5.46)歲,BMI指數(shù)19~23 kg/m2,平均BMI指數(shù)(22.31±1.12)kg/m2,對照組61例,男性31例,女性30例,年齡37~61歲,平均年齡(53.11±5.61)歲,BMI指數(shù)19~23 kg/m2,平均BMI指數(shù)(22.24±1.07)kg/m2,兩組患者一般資料差異比較無統(tǒng)計學(xué)意義,具有可比性(P>0.05)(見表1)。納入標(biāo)準(zhǔn):患者符合《急性胰腺炎的診斷和治療》[6]中急性胰腺炎診斷標(biāo)準(zhǔn);HALP組患者伴有靜脈乳糜血且TG 5.65~11.3 mmol/L或血清三酰甘油 (TG)>11.3 mmol/L;患者未合并其他系統(tǒng)性疾病,如高血壓、糖尿病、心臟病、腎病、肝病等;患者精神意志正??膳浜现委煛E懦龢?biāo)準(zhǔn):患者合并惡性腫瘤、白血病等重大疾??;患者半年內(nèi)曾使用免疫抑制劑;患者胃腸功能障礙,入院2天內(nèi)腸功能未恢復(fù)者;入選者資料不完整;懷孕和哺乳期女性。

        1.2方法 腸道檢查微生態(tài)檢查方法:病例組患者均在入院第一時間提取糞便并進行檢測,對照組時間一致。收集糞便2 g,將其分裝于無菌干燥小瓶內(nèi),同時標(biāo)記后放于-80℃冰箱內(nèi)保存。采用16S rRNA測序技術(shù)分析HLAP患者腸道菌群,將標(biāo)本給予深圳華大基因股份有限公司進行數(shù)據(jù)分析和對比。糞便內(nèi)DNA提取以及16S rDNA擴增方法:糞便細菌的總DNA嚴(yán)格按照購自翌圣生物上??萍加邢薰镜腗olPureStool DNA Kit糞便DNA提取試劑盒進行檢測;樣本使用前以及高通量測序方法:將擴增子片段回收,同時采用T4 DNA聚合酶、Klenow DNA聚合酶以T4多核苷酸激酶把黏性末端恢復(fù)為平末端,隨后將堿基A加于3端,促進DNA片段與3端具有T堿基的特殊接頭相連,設(shè)計合成具有測序接頭的雙探針融合引物,將基因組DNA設(shè)置為模板,隨后開始融合引物PCR,運用磁珠篩選目的擴增子片段,隨后采用合適的文庫開始制備簇以及測序。16S rDNA V4可變區(qū)引物序列:正向引物為5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3',反向引物3'-GGACTACHV GGGTWTCT-AAT-5'。在98℃下反應(yīng)2 min,在95℃下反應(yīng)20 s,在50℃下反應(yīng)30 s,在72℃下反應(yīng)30 s,以此順序反復(fù)進行30次,再次在72℃下反應(yīng)30 s,使用Ampure XP beads排除掉非目產(chǎn)物。平均分子長度以上海安捷倫科技有限公司的2100生物分析工具進行測量。數(shù)據(jù)分析:采取條碼序列以內(nèi)部所制作的程序?qū)悠凡鸱?。條碼序列和測序的比對不允許有錯誤配對。在Hiseq2500,測序長度為P250,模式為PE250+8+8+250的平臺開始雙末端測序,下機數(shù)據(jù)將低質(zhì)量序列去除,剩下的高質(zhì)量數(shù)據(jù)運用在后期的分析中;將序列間相重疊的序列拼接為標(biāo)簽;在所獲得相似度下將標(biāo)簽換做為運算分類單位,隨后采用運算分類單位和數(shù)據(jù)庫進行比對,對運算分類單位進行物種注釋;在運算分類單位的基礎(chǔ)上與物種注釋結(jié)構(gòu)進行樣品物種復(fù)雜度的對比分析以及組間物種差異分析。樣本組間差異分析:采用統(tǒng)計學(xué)方法對兩組樣本間的微生物豐度差異性進行測量,同時使用錯誤發(fā)現(xiàn)率對差異性顯著性進行評估。在門綱目科屬種之間差異性進行評價。采用Metastats軟件對組間差異性進行分析。

        血清學(xué)檢測方法:血清學(xué)抽取時間與糞便樣品收集時間一致。抽取患者空腹靜脈血5 mL,并取2 mL放置于未加入抗凝劑的試管內(nèi),在常溫下靜置1 h,隨后以轉(zhuǎn)速為3500轉(zhuǎn)/min,持續(xù)離心5 min,分離血清并冷藏于-80℃的冰箱內(nèi),送至檢驗科。IL-1選取上海雙贏生物科技有限公司的IL-1 ELISA定量檢測試劑盒并采用酶聯(lián)免疫吸附定量檢測法進行檢測;TNF-α選取上??道噬锛夹g(shù)有限公司的TNF-α檢測試劑盒并采用雙抗體夾心酶聯(lián)免疫吸附法定量檢測。

        1.3觀察指標(biāo) 對比三組入選者腸道微生態(tài)以及血清IL-1、TNF-α水平;對比HALP組和非HLAP組患者腸道微生態(tài)?;颊呶⑸鷳B(tài)以chao指數(shù)和shannon指數(shù)進行表達,chao指數(shù):樣本內(nèi)群落的豐度,也就是樣本中物種的數(shù)量,但并不指群落內(nèi)每個物種豐度。shannon指數(shù):指的是群落內(nèi)多樣性,群落內(nèi)物種的豐富度和均勻度能夠?qū)ζ湓斐捎绊憽?/p>

        1.4方法 SPSS 20.0進行統(tǒng)計分析。年齡計量資料以(±s)的形式表示,組間采用獨立樣本t檢驗、組內(nèi)均采用配對樣本t檢驗;計數(shù)資料以[n(%)]表示,組間比較采用χ2檢驗,記P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1三組入選者糞便微生態(tài)對比 與對照組相比,HLAP組和非HLAP組運算分類單位、chao指數(shù)和shannon指數(shù)顯著更低;與非HLAP組相比,HLAP組運算分類單位、chao指數(shù)和shannon指數(shù)顯著更低,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見表1。

        2.2三組入選者IL-1和TNF-α水平對比 與對照組相比,HLAP組和非HLAP組IL-1和TNF-α水平顯著更高;與非HLAP組相比,HLAP組IL-1和TNF-α水平顯著更高,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見表2。

        表1 三組入選者糞便微生態(tài)對比(±s)

        表1 三組入選者糞便微生態(tài)對比(±s)

        注:與對照組相比a P<0.05;與非HLAP組相比b P<0.05。

        組別 運算分類單位 chao指數(shù) shannon指數(shù)HLAP組(n=33)非HLAP組(n=27)對照組(n=61)2.51±0.18ab 2.78±0.26a 3.19±0.22 90.58<0.001 FP 182.23±5.65ab 210.19±5.45a 224.23±5.89 575.29<0.001 187.53±5.11ab 201.23±5.31a 218.77±5.12 409.01<0.001

        表2 三組入選者IL-1和TNF-α水平對比(±s)

        表2 三組入選者IL-1和TNF-α水平對比(±s)

        注:與對照組相比a P<0.05;與非HLAP組相比b P<0.05。

        組別 IL-1(pg/L) TNF-α(pg/L)HLAP組(n=33)非HLAP組(n=27)對照組(n=61)108.21±10.08ab 64.52±10.31a 15.09±10.49 895.80<0.001 FP 69.43±3.65ab 60.23±3.42a 40.51±3.39 823.98<0.001

        2.3 HLAP組和非HLAP組糞便菌群門豐度水平對比 相比于非HLAP組患者,HLAP組患者厚壁菌門、擬桿菌門顯著更低,變形菌門、梭桿菌門以及放線菌門顯著更高,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見表3。

        2.4 HLAP組和非HLAP組糞便菌群屬豐度水平對比 相比于非HLAP組患者,HLAP組患者雙歧桿菌屬、鏈球菌屬、薩特菌屬和艾克曼菌屬顯著更高,擬桿菌屬、瘤胃球菌、梭菌屬、戴阿利斯特菌屬以及巨球菌屬顯著更低,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見表4。

        表3 HLAP組和非HLAP組糞便菌群門豐度水平對比(±s)

        表3 HLAP組和非HLAP組糞便菌群門豐度水平對比(±s)

        組別 厚壁菌門 變形菌門 擬桿菌門 梭桿菌門 放線菌門HLAP組(n=33)非HLAP組(n=27)t P 41.56±5.43 48.08±3.42 5.417<0.001 19.52±3.28 10.23±3.41 7.724<0.001 21.56±3.51 40.12±3.38 20.717<0.001 2.89±0.57 0.57±0.49 16.691<0.001 3.56±0.43 1.23±0.59 17.675<0.001

        3 討論

        隨著我國生活水平的提升以及不良飲食習(xí)慣的變法,我國高三酰甘油血癥的發(fā)病率日益增加[7]。HALP又被稱為高三酰甘油血癥性胰腺炎,高三酰甘油血癥是急性胰腺炎的常見致病因素[8-9]。有研究統(tǒng)計,HALP占到急性胰腺炎的40%左右,且發(fā)病率有升高的趨勢[10]。腸道微生態(tài)是人類微生態(tài)中最大的組成部分,研究發(fā)現(xiàn)腸道微生態(tài)在急性胰腺炎的發(fā)生和發(fā)展中發(fā)揮著關(guān)鍵作用[11-12]。但目前對于HALP患者腸道微生態(tài)學(xué)研究較少,因此本次研究對其展開研究并檢測患者血清炎性指標(biāo)進行分析,為臨床的診治提供參考。

        16S rRNA(16S核糖體RNA)測序技術(shù)是細菌編碼rRNA所對應(yīng)的DNA序列,在所有的細菌基因組內(nèi)均存在,具有準(zhǔn)確、快速和靈敏的特點,可全方位表達腸道菌群的種類、分布以及豐度[13]。本次研究則采用分析HLAP患者和同期健康體檢者患者腸道菌群顯示,與對照組相比,HLAP組和非HLAP組運算分類單位、chao指數(shù)和shannon指數(shù)顯著更低;與非HLAP組相比,HLAP組運算分類單位、chao指數(shù)和shannon指數(shù)顯著更低。這說明,HLAP在患者發(fā)病中存在較為明顯的腸道微生態(tài)異常。研究過程中發(fā)現(xiàn),急性胰腺炎發(fā)生時機體受刺激而釋放出多種細胞因子和炎性介質(zhì),而IL-1作為一種細胞因子,是活化單核巨噬細胞所生成,可促進淋巴細胞抗體的大量生成,具有調(diào)節(jié)炎性反應(yīng)的作用,在HLAP的進展中發(fā)揮著重要作用[14]。而TNF-α在HLAP的發(fā)生過程中具有始動作用,其作為一種促炎性細胞因子,是炎性反應(yīng)的敏感指標(biāo),誘導(dǎo)IL-1等基因表達,導(dǎo)致炎癥介質(zhì)失控性釋放,并促進和調(diào)節(jié)細胞因子、黏附分子以及一氧化氮等炎癥介質(zhì)分泌,且與疾病嚴(yán)重程度呈正相關(guān)[15]。在脂肪酶的促進下,三酰甘油會被分解為游離脂肪酸,而游離脂肪酸對于胰腺腺泡細胞以及毛細血管內(nèi)皮細胞造成影響[16-17]。本研究發(fā)現(xiàn),與對照組相比,HLAP組和非HLAP組IL-1和TNFα水平顯著更高;與非HLAP組相比,HLAP組IL-1和TNF-α水平顯著更高。筆者推測由于IL-1和TNF-α的生物膜細胞毒作用可對生物膜直接造成損傷,進而引發(fā)細胞和細胞器的腫脹異變,通透性也會隨之升高,且其作為能夠介導(dǎo)機體感染、創(chuàng)傷和炎癥反應(yīng)的重要細胞因子,參與了機體免疫系統(tǒng)的調(diào)節(jié)和炎癥反應(yīng)的發(fā)生發(fā)展過程,因此其水平越高表明患者病情越嚴(yán)重[18-19]。厚壁菌門、變形菌門、擬桿菌門、梭桿菌門以及放線菌門都是消化道內(nèi)較為多見的細菌。本次研究發(fā)現(xiàn),相比于非HLAP組患者,HLAP組患者厚壁菌門、擬桿菌門顯著更低,變形菌門、梭桿菌門以及放線菌門顯著更高。這表明,HLAP組患者比非HLAP組急性胰腺炎患者腸道失衡更為明顯。在菌屬中,擬桿菌變化并不大,而其他菌屬均出現(xiàn)明顯的變化。其中對人體有害的擬桿菌屬、瘤胃球菌、梭菌屬、戴阿利斯特菌屬以及巨球菌屬出現(xiàn)明顯的降低,而雙歧桿菌屬、鏈球菌屬、薩特菌屬和艾克曼菌屬明顯增加,這可能是因為機體對于菌群失衡以及腸道菌群移位的阻止形式[20-21]。本次研究通過對比性研究發(fā)現(xiàn),HLAP患者腸道微生態(tài)以及炎性反應(yīng)均出現(xiàn)明顯的失衡,存在相關(guān)性。但本次研究可能因為病例收集的因素,導(dǎo)致實驗存在一定偏差,以后因彌補此不足。

        綜上所述,腸道微生態(tài)的失衡與HLAP患者存在明顯的相關(guān)性,在其發(fā)展過程中扮演著重要的角色,同時患者伴隨著炎性因子的升高。日后,我們需加強對高三酰甘油患者的管理,以預(yù)防和減少急性胰腺炎尤其是重癥急性胰腺炎的發(fā)生。

        表4 HLAP組和非HLAP組糞便菌群屬豐度水平對比(±s)

        表4 HLAP組和非HLAP組糞便菌群屬豐度水平對比(±s)

        組別 擬桿菌屬 雙歧桿菌屬 瘤胃球菌屬 梭菌屬 鏈球菌屬HLAP組(n=33)非HLAP組(n=27)t P 19.43±5.08 22.14±5.12 2.041 0.045 2.45±0.51 0.43±0.28 21.945<0.001 2.53±0.42 3.61±0.38 10.338<0.001 5.41±1.42 11.87±1.54 16.877<0.001 5.65±0.42 0.32±0.24 58.530<0.001

        續(xù)表4 HLAP組和非HLAP組治療后糞便菌群屬豐度水平對比(±s)

        續(xù)表4 HLAP組和非HLAP組治療后糞便菌群屬豐度水平對比(±s)

        組別 薩特菌屬 艾克曼菌屬 戴阿利斯特菌屬 巨單胞菌屬 巨球菌屬HLAP組(n=33)非HLAP組(n=27)t P 3.89±0.43 1.24±0.46 23.015<0.001 3.75±0.48 1.15±0.42 22.064<0.001 0.88±0.43 2.78±0.31 19.221<0.001 3.65±1.54 8.79±1.68 12.344<0.001 0.54±0.28 3.89±0.41 37.484<0.001

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