譚睿陟 鐘霞 王麗 楊思進(jìn) 徐厚平
關(guān)鍵詞蛭龍活血通瘀膠囊;腦出血;炎癥;長鏈非編碼RNA;轉(zhuǎn)錄組測序
腦出血(intracerebral hemorrhage,ICH)是常見的腦卒中類型之一,發(fā)病率僅次于腦梗死,具有極高的致殘率和致死率[1]。據(jù)研究統(tǒng)計(jì),患者腦卒中后1 年的病死率接近60%,僅有20%的患者在腦卒中6 個(gè)月后能存活并獨(dú)立生活[2],且男性發(fā)病率遠(yuǎn)高于女性[3]??梢姡X卒中已嚴(yán)重威脅患者的生命安全,影響患者及其家屬的生活質(zhì)量。ICH 由腦組織出血引起,并可由高血壓、動(dòng)靜脈畸形或頭部外傷導(dǎo)致,其病理生理學(xué)特征為嚴(yán)重的炎癥、鐵毒性、水腫、氧化應(yīng)激和凝血酶形成[4]。蛭龍活血通瘀膠囊由水蛭、地龍、大血藤、黃芪、桂枝等藥材組成,是西南醫(yī)科大學(xué)附屬中醫(yī)醫(yī)院研制的院內(nèi)制劑,被廣泛用于ICH 的臨床治療,效果明顯[5-6]。此外,多項(xiàng)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)研究亦發(fā)現(xiàn),蛭龍活血通瘀膠囊能有效改善大鼠/小鼠ICH 導(dǎo)致的腦損傷,具有顯著的腦保護(hù)作用[7-9]。然而,蛭龍活血通瘀膠囊干預(yù)ICH 的具體作用機(jī)制尚不明確。近年來研究發(fā)現(xiàn),部分長鏈非編碼RNA(longnon-coding RNA,LncRNA)參與了染色體沉默、基因組印記、染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運(yùn)輸?shù)榷鄠€(gè)重要的調(diào)控過程[10-12],且在中樞神經(jīng)系統(tǒng)損傷中扮演關(guān)鍵角色,如誘導(dǎo)ICH 后細(xì)胞自噬和神經(jīng)炎癥[13]。本研究擬采用尾狀核注射膠原酶以建立ICH小鼠模型,先考察蛭龍活血通瘀膠囊對(duì)小鼠ICH的影響,再通過轉(zhuǎn)錄組測序分析差異LncRNA并進(jìn)行基因本體(gene ontology,GO)富集,預(yù)測有效LncRNA 和靶基因,最后通過體內(nèi)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證,旨在為明確蛭龍活血通瘀膠囊改善ICH后腦損傷的作用機(jī)制提供參考。
1 材料
1.1 主要儀器
本研究所用主要儀器包括LightCycler480 Ⅱ型實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)儀(瑞士Roche 公司),Mini-Protein Tetra System 型蛋白質(zhì)電泳轉(zhuǎn)印系統(tǒng)、ChemiDoc XRS+型凝膠成像系統(tǒng)(美國Bio-Rad 公司),RM2255 型組織切片系統(tǒng)(德國Leica 公司),BX61VS型全自動(dòng)虛擬切片掃描系統(tǒng)(日本Olympus 公司),NanoDrop 2000 型超微量分光光度計(jì)(美國Thermo Fisher Scientific公司)等。
1.2 主要藥品和試劑
蛭龍活血通瘀膠囊(批號(hào)20180216,規(guī)格0.4 g/粒)由西南醫(yī)科大學(xué)附屬中醫(yī)醫(yī)院制劑室制備;Ⅶ型膠原酶(批號(hào)C0773)購自美國Sigma 公司;cDNA 逆轉(zhuǎn)錄試劑(批號(hào)R323-01)、熒光定量PCR 試劑(批號(hào)Q711-03)均購自南京諾唯贊生物科技股份有限公司;蘇木精-伊紅染色試劑盒(批號(hào)C0105)和尼氏染色試劑盒(批號(hào)C0117)均購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;免疫組化試劑盒(批號(hào)PV-9000)和3,3′- 二氨基聯(lián)苯胺(批號(hào)ZLI-9017)均購自北京中杉金橋生物技術(shù)有限公司;小鼠白細(xì)胞介素1β(interleukin-1β,IL-1β)、腫瘤壞死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)單克隆抗體(批號(hào)分別為sc-52012、sc-52746、sc-365062)均購自美國Santa Cruz 公司;辣根過氧化物酶標(biāo)記的山羊抗小鼠免疫球蛋白G二抗(批號(hào)31430)和Trizol 總RNA抽提試劑(批號(hào)15596026)均購自美國Invitrogen 公司;考馬斯亮藍(lán)(批號(hào)B104237)購自上海阿拉丁生化科技股份有限公司;SuperSignalTM West Pico PLUS 高敏發(fā)光液(批號(hào)pierce34580)購自美國Thermo Fisher Scientific 公司;其余試劑均為分析純,水為蒸餾水。
1.3 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
SPF級(jí)雄性C57BL/6 小鼠33 只,8 周齡,購自成都藥康生物科技有限公司,動(dòng)物生產(chǎn)許可證號(hào)為SCXK(川)-2020-034。所有小鼠均飼養(yǎng)于西南醫(yī)科大學(xué)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中心動(dòng)物房內(nèi),溫度為20~22 ℃,相對(duì)濕度為50%~60%,12 h/12 h明暗交替。本實(shí)驗(yàn)方案已通過西南醫(yī)科大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物倫理委員會(huì)批準(zhǔn),審批編號(hào)為20211111-002。
2 方法
2.1 造模
小鼠經(jīng)腹腔注射1%戊巴比妥鈉麻醉后,頭部向上固定于腦立體定位儀上,于前囟區(qū)域備皮,用75%乙醇消毒,縱向剪開該處皮膚約1 cm,用3%過氧化氫除去骨膜并暴露前囟及右側(cè)顱骨,定位右側(cè)尾狀核(前囟右2.5mm,前囟前左側(cè)0.2 mm),鉆孔,注射0.075 U/μL Ⅶ型膠原酶溶液1 μL,進(jìn)針深度為3 mm,5 min 注射完畢,留針5 min 后以1 mm/min 緩慢出針,骨蠟封閉進(jìn)針孔,縫合皮膚并消毒。實(shí)驗(yàn)過程中保持室溫(25±2)℃。術(shù)后24 h,待小鼠清醒后進(jìn)行改良的神經(jīng)功能缺損評(píng)分(modified neurological severity score,mNSS),若mNSS評(píng)分≥7 分則提示建模成功[14]。
2.2 分組、給藥與采樣
2.2.1 藥效學(xué)觀察將24 只小鼠適應(yīng)性喂養(yǎng)1 周后,隨機(jī)分為假手術(shù)1 組、模型1 組和蛭龍活血通瘀膠囊低、高劑量組[0.35、1.40 g/kg,以水為溶劑,劑量根據(jù)成人日劑量(0.08 g/kg)換算并結(jié)合多次動(dòng)物預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果設(shè)置],每組6 只。模型1 組和各藥物組小鼠按“2.1”項(xiàng)下方法復(fù)制ICH 模型,假手術(shù)1 組小鼠除不注射膠原酶外其余操作同“2.1”項(xiàng)。術(shù)后1 h,各藥物組小鼠灌胃相應(yīng)藥液,假手術(shù)1 組和模型1 組小鼠灌胃生理鹽水,每天1 次,連續(xù)3d。末次給藥后,小鼠腹腔注射1%戊巴比妥鈉麻醉,經(jīng)心臟采血處死后迅速分離大腦,并提取ICH血腫周圍組織。血液樣品于室溫下放置1 h 后,以3 000 r/min 離心15 min,分離血清。腦組織分為兩部分,一部分用4%多聚甲醛溶液固定,用于后續(xù)形態(tài)學(xué)觀察和免疫組化實(shí)驗(yàn);另一部分凍存于-20 ℃冰箱中,用于后續(xù)RNA和蛋白表達(dá)檢測。
2.2.2 轉(zhuǎn)錄組測序?qū)⑹S嗟? 只小鼠適應(yīng)性飼養(yǎng)1 周后,隨機(jī)分為假手術(shù)2 組、模型2 組和干預(yù)組(蛭龍活血通瘀膠囊1.40 g/kg,選擇藥效學(xué)實(shí)驗(yàn)中改善效果較好的劑量),每組3 只。小鼠造模和給藥同“2.2.1”項(xiàng)。末次給藥后,小鼠腹腔注射1%戊巴比妥鈉麻醉,經(jīng)心臟采血處死后迅速分離全腦組織。將全腦組織快速凍存于液氮中,一部分用干冰保存寄往廣州基迪奧生物科技有限公司,以提取高質(zhì)量RNA并進(jìn)行測序;另一部用于實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證。
2.3 小鼠腦組織形態(tài)學(xué)觀察
取“2.2.1”項(xiàng)下固定于4%多聚甲醛溶液中的腦組織適量,常規(guī)石蠟包埋,切片(厚度4 μm),經(jīng)脫蠟、復(fù)水后用蘇木精-伊紅染料(蘇木精染色5 min,伊紅染色40 s)、尼氏染料(染色1 h)染色,晾干后用中性樹膠封片。使用全自動(dòng)虛擬切片掃描系統(tǒng)觀察各組小鼠的腦組織形態(tài)學(xué)變化。
2.4 小鼠腦組織中IL-1β、TNF-α表達(dá)的檢測
采用免疫組化法進(jìn)行檢測。取“2.2.1”項(xiàng)下固定于4%多聚甲醛溶液中的腦組織適量,常規(guī)石蠟包埋,切片(厚度4 μm),經(jīng)脫蠟后用檸檬酸鈉緩沖液(pH6.0)微波修復(fù)抗原,以5%胎牛血清室溫封閉30 min,隨后滴加IL-1β、TNF-α一抗(稀釋比例均為1 ∶ 200),4 ℃孵育過夜;再滴加生物素標(biāo)記的二抗,室溫孵育1 h 后,使用3,3′-二氨基聯(lián)苯胺(稀釋20 倍)顯色,蘇木精復(fù)染細(xì)胞核,晾干后用中性樹膠封片。使用全自動(dòng)虛擬切片掃描系統(tǒng)采集圖片并評(píng)估IL-1β、TNF-α表達(dá)情況,陽性細(xì)胞被染成棕色,棕色越深即表達(dá)越強(qiáng)。
2.5 小鼠腦組織中IL-1β、TNF-α蛋白表達(dá)的檢測
采用Western blot 法進(jìn)行檢測。取“2.2.1”項(xiàng)下凍存的腦組織適量,液氮研磨后加入RIPA裂解液冰上孵育30 min,超聲(功率200 W,頻率20 kHz)處理2 s×5 次;以13 000 r/min 離心10 min,取上清液,用考馬斯亮藍(lán)法測定蛋白濃度。取100 ℃加熱變性的蛋白70 μg 進(jìn)行十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳,100 V轉(zhuǎn)膜60 min 后將蛋白轉(zhuǎn)印至聚偏二氟乙烯膜上,用5%胎牛血清室溫封閉1 h,分別加入IL-1β、TNF-α一抗(稀釋比例均為1 ∶1 000)和GAPDH一抗(稀釋比例為1 ∶5 000),4 ℃孵育過夜;隨后加入辣根過氧化物酶標(biāo)記的山羊抗小鼠免疫球蛋白G二抗(稀釋比例為1 ∶5 000),室溫孵育1 h,用高敏發(fā)光液浸泡30 s 后置于凝膠成像系統(tǒng)下成像。使用Image J V1.8.0 軟件分析蛋白的條帶灰度值,以GAPDH為內(nèi)參計(jì)算目標(biāo)蛋白的相對(duì)表達(dá)量。
2.6 小鼠腦組織中IL-1β、TNF-α mRNA和有效LncRNA及靶基因表達(dá)的檢測
采用實(shí)時(shí)定量PCR 法進(jìn)行檢測。取“2.2.1”項(xiàng)下凍存或“2.2.2”項(xiàng)下液氮中的腦組織適量,液氮研磨后加入Trizol 總RNA抽提試劑提取總RNA。使用超微量分光光度計(jì)測定RNA濃度和純度后,每個(gè)樣本取RNA 1 μg進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄以制備相應(yīng)的cDNA。cDNA經(jīng)無酶水40 μL稀釋后,采用基于SYBR green 體系的PCR 試劑進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。PCR 反應(yīng)體系(10 μL)包含上/下游引物各0.5 μL、2×擴(kuò)增試劑5 μL、cDNA模板1 μL、無酶水3 μL。PCR反應(yīng)條件如下:95 ℃預(yù)變性10 min;95 ℃變性15 s,60 ℃退火15 s,72 ℃延伸20 s,共40 個(gè)循環(huán)。采用2-ΔΔCt法,以GAPDH為內(nèi)參計(jì)算目標(biāo)基因的相對(duì)表達(dá)量。所有引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,引物序列及產(chǎn)物長度見表1。
2.7 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)處理
為保證數(shù)據(jù)質(zhì)量,需要在信息分析之前對(duì)原始的RNA數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和過濾,以減少無效數(shù)據(jù)對(duì)結(jié)果造成的干擾。本研究利用Fastp 軟件對(duì)測序得到的原始數(shù)據(jù)(raw reads)進(jìn)行質(zhì)量分析,過濾低質(zhì)量數(shù)據(jù)[15];利用R V4.0.4 軟件“DESeq2 包”篩選高質(zhì)量數(shù)據(jù)中的差異LncRNA,標(biāo)準(zhǔn)為錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(false discovery rate,F(xiàn)DR)<0.05 且|樣品間表達(dá)量比值[log2(FC)]|>1[16];根據(jù)差異LncRNA與其鄰近蛋白編碼基因相關(guān)(順式mRNA),或差異LncRNA與其共表達(dá)的蛋白編碼基因相關(guān)(反式mRNA)分析得到與差異LncRNA 關(guān)聯(lián)的順式或反式mRNA[17];將順式或反式mRNA數(shù)據(jù)導(dǎo)入GO數(shù)據(jù)網(wǎng)站(http://geneontology.org)進(jìn)行功能分類并富集,應(yīng)用超幾何檢驗(yàn)找出與整個(gè)基因組背景相比顯著富集的GO條目;利用R V4.0.4 軟件“熱圖(heat map)包”對(duì)差異LncRNA表達(dá)模式進(jìn)行層級(jí)聚類分析,并使用熱圖呈現(xiàn)聚類結(jié)果。蛭龍活血通瘀膠囊干預(yù)相關(guān)有效LncRNA的篩選標(biāo)準(zhǔn)如下:在模型2 組中找出與假手術(shù)2 組相比有顯著差異的LncRNA,且其在干預(yù)組中的表達(dá)相對(duì)于模型組有明顯改善,此LncRNA即為蛭龍活血通瘀膠囊干預(yù)ICH相關(guān)的有效LncRNA。
2.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
采用SPSS 21.0 軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。數(shù)據(jù)以x±s 表示,多組間比較采用單因素方差分析,組間兩兩比較采用LSD-t檢驗(yàn)。檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。
3 結(jié)果
3.1 蛭龍活血通瘀膠囊對(duì)ICH模型小鼠腦組織形態(tài)的影響
蘇木精-伊紅染色結(jié)果(圖1)顯示,與假手術(shù)1 組比較,模型1 組小鼠腦組織病理損傷嚴(yán)重,細(xì)胞間隙增大、排列紊亂;與模型1 組比較,蛭龍活血通瘀膠囊低、高劑量組小鼠腦組織病理損傷均有所減輕,其中高劑量組的改善效果更明顯。尼氏染色結(jié)果(圖1)顯示,與假手術(shù)1組比較,模型1 組小鼠神經(jīng)元大量減少,腦神經(jīng)損壞嚴(yán)重;與模型1 組比較,蛭龍活血通瘀膠囊低、高劑量組小鼠神經(jīng)元均有所恢復(fù),其中高劑量組恢復(fù)更佳。
3.2 蛭龍活血通瘀膠囊對(duì)ICH模型小鼠腦組織中炎癥因子IL-1β和TNF-α表達(dá)的影響
3.2.1 免疫組化法模型1 組小鼠腦組織中IL-1 β和TNF-α的表達(dá)水平均高于假手術(shù)1 組,而蛭龍活血通瘀膠囊低、高劑量組小鼠腦組織中IL-1β和TNF-α的表達(dá)水平均低于模型1 組。結(jié)果見圖2。
3.2.2 Western blot 法與假手術(shù)1 組比較,模型1 組小鼠腦組織中IL-1β、TNF-α蛋白的相對(duì)表達(dá)量均顯著升高(P<0.05);與模型1 組比較,蛭龍活血通瘀膠囊低、高劑量組小鼠腦組織中IL-1β、TNF-α蛋白的相對(duì)表達(dá)量均顯著降低(P<0.05)。結(jié)果見圖3、圖4。
3.2.3 實(shí)時(shí)定量PCR 法與假手術(shù)1 組比較,模型1 組小鼠腦組織中IL-1β、TNF-α mRNA的相對(duì)表達(dá)量均顯著升高(P<0.05);與模型1 組比較,蛭龍活血通瘀膠囊低、高劑量組小鼠腦組織中IL-1β、TNF-α mRNA的相對(duì)表達(dá)量均顯著降低(P<0.05)。結(jié)果見圖5。
3.3 轉(zhuǎn)錄組測序樣本RNA質(zhì)量分析
除去含數(shù)據(jù)接頭(adapter)序列、含未知堿基比例大于10%序列、全部都是A堿基序列以及低質(zhì)量序列數(shù)據(jù)后,所得有效數(shù)據(jù)(clean data)占比均高于99%,表明數(shù)據(jù)質(zhì)量佳。結(jié)果見表2。
3.4 差異LncRNA分析
假手術(shù)2 組與模型2 組比較,有44 個(gè)差異LncRNA,包括顯著上升的LncRNA 25 個(gè)、顯著下降的LncRNA 19個(gè);而模型2 組與干預(yù)組比較,有16 個(gè)差異LncRNA,包括顯著上升的LncRNA 8 個(gè)、顯著降低的LncRNA 8 個(gè)。結(jié)果見圖6。
3.5 GO富集
差異LncRNA 與順式mRNA關(guān)聯(lián)的相關(guān)功能主要集中在生物調(diào)節(jié)、細(xì)胞進(jìn)程、生物進(jìn)程陽性調(diào)節(jié)、發(fā)育進(jìn)程等方面,顯著富集的GO條目見圖7A;差異LncRNA與反式mRNA關(guān)聯(lián)的相關(guān)功能主要集中在刺激響應(yīng)、代謝調(diào)節(jié)、免疫進(jìn)程等方面,顯著富集的GO條目見圖7B。
3.6 有效LncRNA分析
篩選到1 個(gè)LncRNA 在模型2 組中表達(dá)較假手術(shù)2組更高,且經(jīng)蛭龍活血通瘀膠囊干預(yù)后顯著下調(diào),經(jīng)數(shù)據(jù)庫(http://asia.ensembl.org)查詢發(fā)現(xiàn)其為LncRNADlst-211,其靶基因?yàn)閞ibosomal protein S6 kinase-like 1(Rps6kl1)。此外,還發(fā)現(xiàn)LncRNA-MSTRG.8169.4 在模型2 組中低表達(dá),而經(jīng)蛭龍活血通瘀膠囊干預(yù)后顯著上調(diào)。聚類分析結(jié)果見圖8。
3.7 有效LncRNA的PCR驗(yàn)證
與假手術(shù)2組比較,模型2組小鼠腦組織中Lnc RNADlst-211 的相對(duì)表達(dá)量顯著升高(P<0.05),Rps6kl1、LncRNA-MSTRG.8169.4 的相對(duì)表達(dá)量均顯著降低(P<0.05)。與模型2 組比較,干預(yù)組小鼠腦組織中LncRNADlst-211 的相對(duì)表達(dá)量顯著降低(P<0.05),Rps6kl1、LncRNA-MSTRG.8169.4 的相對(duì)表達(dá)量均顯著升高(P<0.05)。結(jié)果見圖9。
4 討論
ICH 是一種發(fā)病率高、致殘率高、致死率高、復(fù)發(fā)率高的腦血管疾病,好發(fā)于中老年人群,嚴(yán)重威脅人們的生命安全和生活質(zhì)量[18]。現(xiàn)有研究表明,高血壓和淀粉樣腦血管病是原發(fā)性ICH 的主要發(fā)病原因;除此以外,顱內(nèi)動(dòng)脈瘤、動(dòng)脈硬化等也是ICH 的發(fā)病原因之一[19]。ICH 發(fā)病會(huì)造成腦組織局部占位性病變,同時(shí)釋放大量凝血酶,并激活損傷相關(guān)分子模式從而釋放出大量炎癥因子和補(bǔ)體因子,進(jìn)而誘導(dǎo)腦組織炎癥反應(yīng)、免疫細(xì)胞浸潤和腦細(xì)胞凋亡[20]。盡管針對(duì)原發(fā)性ICH 損傷的手術(shù)已可以減輕神經(jīng)功能損傷并降低病死率,但是ICH患者的預(yù)后依然不佳[21]。因此,減輕ICH 誘導(dǎo)的炎癥和繼發(fā)性腦損傷成為目前ICH臨床治療的主要方向。
中醫(yī)認(rèn)為,中風(fēng)(腦卒中)發(fā)生多因風(fēng)、火、痰、瘀、氣、虛等導(dǎo)致人體氣血陰陽運(yùn)行失常、臟腑功能失調(diào),故中醫(yī)治療注重祛風(fēng)、補(bǔ)氣、化痰、活血[22-23]。根據(jù)多年臨床經(jīng)驗(yàn),我院楊思進(jìn)教授結(jié)合現(xiàn)代醫(yī)學(xué)理論提出補(bǔ)氣通絡(luò)、活血化瘀、化痰祛風(fēng)的腦血管疾病治療方法,并組方蛭龍活血通瘀膠囊。該方主要包含黃芪、水蛭、地龍、大血藤、桂枝等藥材,被廣泛用于腦卒中的臨床治療,并取得了良好的療效[24]。本研究結(jié)果也證實(shí),蛭龍活血通瘀膠囊能顯著改善ICH模型小鼠的腦損傷,促進(jìn)其腦神經(jīng)功能恢復(fù),同時(shí)能有效降低小鼠腦組織中炎癥因子IL-1β、TNF-α的表達(dá),減輕繼發(fā)性腦損傷,符合目前ICH臨床治療的抗二次損傷策略。
LncRNA 是一種不具備蛋白質(zhì)編碼能力的非編碼RNA,其長度超過200 個(gè)核苷酸[25]。已有研究證實(shí),LncRNA能參與表觀遺傳介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄、翻譯、RNA代謝、細(xì)胞自噬和細(xì)胞凋亡等進(jìn)程[26],能調(diào)節(jié)神經(jīng)元、小膠質(zhì)細(xì)胞、星形膠質(zhì)細(xì)胞等細(xì)胞炎癥[27],還與脊髓損傷以及神經(jīng)退行性疾病的發(fā)生有關(guān)[28]?;诖耍狙芯渴占锡埢钛瞿z囊干預(yù)前后的腦組織,快速提取總RNA后采用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)對(duì)各組差異LncRNA 予以甄別。結(jié)果顯示,模型2 組和假手術(shù)2 組比較,有44 個(gè)差異LncRNA;模型2組和干預(yù)組比較,有16個(gè)差異LncRNA;通過進(jìn)一步篩選發(fā)現(xiàn)了2 個(gè)有效LncRNA,即LncRNADlst-211 和LncRNA-MSTRG.8169.4。筆者通過數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),LncRNA-Dlst-211 有順式作用靶基因。順式作用靶基因預(yù)測基本原理認(rèn)為,LncRNA 的功能與其鄰近的蛋白編碼基因相關(guān),位于上游的LncRNA 可能與啟動(dòng)子或者共表達(dá)基因的其他順式作用元件有交集,進(jìn)而在轉(zhuǎn)錄時(shí)或者轉(zhuǎn)錄后對(duì)基因的表達(dá)進(jìn)行調(diào)控[29]。LncRNA-Dlst-211 的順式靶基因可能為Rps6kl1,該基因與腦神經(jīng)發(fā)育相關(guān),在腦部及中樞神經(jīng)系統(tǒng)中呈高表達(dá)[30]。本研究在假手術(shù)2 組、模型2 組和干預(yù)組小鼠腦組織中檢測這兩個(gè)差異LncRNA(LncRNA-Dlst-211 和LncRNA-MSTRG.8169.4)以及LncRNA-Dlst-211 靶基因Rps6kl1 的表達(dá)情況,結(jié)果顯示,PCR驗(yàn)證結(jié)果與測序結(jié)果一致,即LncRNA-Dlst-211 在模型2 組中的表達(dá)升高,在干預(yù)組中的表達(dá)顯著降低,其靶基因Rps6kl1 的表達(dá)與之相反;而LncRNA-MSTRG.8169.4 在模型2 組中的表達(dá)降低,在干預(yù)組中的表達(dá)顯著升高。
綜上所述,蛭龍活血通瘀膠囊能改善ICH 模型小鼠的腦損傷,并減輕炎癥反應(yīng);其作用機(jī)制可能與下調(diào)LncRNA-Dlst-211的表達(dá),上調(diào)LncRNA-MSTRG.8169.4、Rps6kl1的表達(dá)有關(guān)。本研究通過轉(zhuǎn)錄組測序分析了蛭龍活血通瘀膠囊干預(yù)后的差異LncRNA 以及其靶基因,并在體內(nèi)進(jìn)行了驗(yàn)證。后續(xù)筆者將進(jìn)一步檢測差異LncRNA在腦組織中表達(dá)的細(xì)胞種類,并探討其在蛭龍活血通瘀膠囊改善ICH 損傷中的潛在分子機(jī)制。本研究有助于從非編碼RNA 水平闡明復(fù)方蛭龍活血通瘀膠囊改善ICH 的表觀遺傳機(jī)制,為中藥干預(yù)ICH 的研究開拓了新的思路,為中藥藥理研究提供了基礎(chǔ)科學(xué)依據(jù)。