譚慧萍, 王惠國, 王林會, 趙增彤, 程楊好, 劉晨光, 王 亮*, 李 倩*
1.大連大學生命科學與技術(shù)學院,遼寧大連 116622;
2.大連賽姆生物工程技術(shù)有限公司,遼寧大連 116620;
3.大連工業(yè)大學生物工程學院,遼寧大連 116034;
4.微生物代謝國家重點實驗室上海交通大學生命科學與技術(shù)學院,上海 200240
上世紀末,學術(shù)界相繼提出了高濃度(High gravity,HG)和超高濃度(Very high gravity,VHG)發(fā)酵的概念,并成功將其應(yīng)用到乙醇發(fā)酵中,使發(fā)酵終點乙醇濃度從6%~8%(v/v)提高到10%~21%(v/v)[1,2]。VHG乙醇發(fā)酵技術(shù)不僅能夠降低下游精餾分離和廢水處理成本,而且不需要增加額外的設(shè)備投入,是降低燃料乙醇生產(chǎn)成本的有效方案[3,4]:(1)燃料乙醇生產(chǎn)成本中,能耗成本居第二,僅次于原料成本;(2)市場上存在多種廉價高效的酶制劑,如α-淀粉酶、糖化酶和蛋白酶等,這使得超高濃度底物易獲得。
周期性的振蕩行為在微生物細胞連續(xù)培養(yǎng)和發(fā)酵過程中時常發(fā)生,如Saccharomyces cerevisiae[5,6]、Zymomonas mobilis[7]、Escherichia coli[8]和Clostridium butyricum[9]等培養(yǎng)過程都曾觀察到這一現(xiàn)象。對于釀酒酵母S.cerevisiae低糖連續(xù)培養(yǎng)過程中的振蕩行為已經(jīng)研究得較為透徹,主要分為糖酵解振蕩和代謝振蕩行為,其振蕩參數(shù)包括葡萄糖-6-磷酸、果糖-6-磷酸、ATP、NADPH等胞內(nèi)代謝物濃度,以及溶氧濃度(DO)、耗氧速率、二氧化碳釋放率等發(fā)酵參數(shù),振蕩周期在幾分鐘到幾小時之間。然而,BAI等在釀酒酵母VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵體系中報道了另一種振蕩行為(VHG振蕩)[3,10-11],明顯不同于糖酵解振蕩和代謝振蕩,這種振蕩行為的振幅更大(可達50%)、周期更長(5 d~7 d),振蕩的特征參數(shù)包括殘?zhí)?、乙醇和生物量濃度等。隨后,BAI等在研究稀釋速率(0.015 h-1~0.08 h-1)對VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵影響時,發(fā)現(xiàn)改變稀釋速率可以獲得振蕩和穩(wěn)態(tài)兩種不同發(fā)酵狀態(tài)[12],并提出VHG振蕩行為的產(chǎn)生與操作條件和系統(tǒng)的初始狀態(tài)有關(guān)。
雖然后續(xù)研究顯示,木塊固定化細胞[10,13]和發(fā)酵偶聯(lián)氣提實時移除部分乙醇[14,15]可以有效弱化VHG振蕩行為,然而,除稀釋速率外,缺乏對VHG振蕩行為直接誘發(fā)因素的研究。本研究基于前期研究基礎(chǔ),研究菌種、培養(yǎng)基成分、氧供應(yīng)等對VHG振蕩行為的影響,進一步探究了比生長速率、比死亡速率、稀釋速率和細胞乙醇耐受性對釀酒酵母VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵的調(diào)控作用。
實驗室釀酒酵母S.cerevisiae S288c和工業(yè)釀酒酵母S.cerevisiae 4126均由本實驗室保藏;自絮凝酵母S.cerevisiae BHL01,由工業(yè)釀酒酵母S.cerevisiae 4126經(jīng)染色體整合絮凝基因FLOI得到[16],由本實驗室保藏。
搖瓶種子培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖30,酵母粉5,蛋白胨3,121℃滅菌15 min。
發(fā)酵罐種子培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖120,酵母粉5,蛋白胨3,121℃滅菌15 min。
YPD發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖280,酵母粉5,蛋白胨3。為減少在高溫滅菌過程中的糖損失,發(fā)酵培養(yǎng)基滅菌條件為110℃,15 min,滅菌完成后立即用自來水冷卻至室溫。
合成培養(yǎng)基:氮磷鎂成分(g/L)(NH4)2SO45,KH2PO43,MgSO4·7 H2O 0.5,121℃滅菌15 min。微量鹽成分(mg/L)EDTA 15,ZnSO4·7 H2O 4.5,CoCl2·6 H2O 0.3,MnCl2·4H2O 1,CuSO4·7 H2O 0.3,CaCl2·2 H2O 4.5,F(xiàn)eSO4·7 H2O 3,NaMoO4·2 H2O 0.4,H3BO31,KI 0.1,121℃滅菌15 min。維生素成分(mg/L)生物素0.05,泛酸鈣1.0,煙酸1.0,肌醇25.0,維生素B11.0,維生素B61.0,對氨基苯甲酸0.2,0.45μm膜濾除菌。厭氧發(fā)酵過程培養(yǎng)基中添加15μL麥角固醇和660μg/L Tween-80,為酵母細胞膜合成提供前體,115℃滅菌15 min。各組分配制成高濃度母液,并單獨進行滅菌,4℃避光保存,使用前配制成所需終濃度,添加到葡萄糖溶液中。
搖瓶種子培養(yǎng):從4℃冰箱中取菌種保存試管,接種到170 mL種子培養(yǎng)基中進行活化,在30℃,150 r/min條件下培養(yǎng)20 h。將活化后種子轉(zhuǎn)接到新鮮的種子培養(yǎng)基中,30℃,150 r/min培養(yǎng)18 h。
發(fā)酵罐批次種子培養(yǎng):搖瓶種子以10%(v/v)的接種量接入裝液量為1.7 L的攪拌式發(fā)酵罐(KBT-2.5 L,韓國)中進行培養(yǎng),通過流加2 mol/L NaOH控制pH在(4.50±0.02),通氣速率、溫度、攪拌速率分別設(shè)定為0.05 vvm、30℃、300 r/min。
連續(xù)乙醇發(fā)酵:連續(xù)攪拌反應(yīng)裝置如圖1所示,當培養(yǎng)基中的殘?zhí)菨舛鹊陀? g/L,分批種子培養(yǎng)結(jié)束,開啟蠕動泵3以0.027 h-1的稀釋速率向發(fā)酵罐4中流加發(fā)酵培養(yǎng)基,同時打開發(fā)酵罐的溢流口,通過溢流口控制有效發(fā)酵體積為1.7 L,溫度、pH、通氣、攪拌速率等操作條件與發(fā)酵罐種子培養(yǎng)時相同。
圖1 乙醇連續(xù)發(fā)酵系統(tǒng)示意圖
1.4.1 生物量測定
選用細胞干重法進行測定[3]。
1.4.2 葡萄糖、乙醇和甘油的測定
選用Waters高效液相色譜測定,選用色譜柱(Aminex HPX287H,300 mm×7.8 mm);檢測器選用Waters410示差檢測器;流動相用5 mmol/L的H2SO4;流速設(shè)為0.5 mL/min,柱溫設(shè)為50℃。
1.4.3 酵母乙醇耐受性實驗[17]
將斜面菌種進行搖瓶活化后,用生理鹽水(0.9%NaCl,w/v)配制成相同OD600的菌懸液,分別用12%和16%(v/v)的乙醇溶液沖擊2 h,涂平板,30℃培養(yǎng)24 h后,計細胞菌落數(shù),與0 h的對照菌落數(shù)對比計算存活率。
2.1.1 酵母菌株的乙醇耐性比較
本實驗選取三株釀酒酵母S.cerevisiae 4126、S.cerevisiae S288c和S.cerevisiae BHL01,分別進行了乙醇沖擊實驗,比較其乙醇耐受性,結(jié)果如圖2所示。經(jīng)12%(v/v)乙醇沖擊2 h后,酵母細胞S.cerevisiae 4126和S.cerevisiae BHL01的存活率分別為81.5%和88.1%,而S.cerevisiae S288c只有66.1%;經(jīng)16%(v/v)乙醇沖擊2 h后,只有S.cerevisiae BHL01的存活率能夠維持在43.3%,而S.cerevisiae 4126和S.cerevisiae S288c的存活率則分別降至27.2%和16.3%??梢姡@三株酵母菌株的乙醇耐性由高到低依次為S.cerevisiae BHL01、S.cerevisiae 4126及S.cerevisiae S288c。
圖2 酵母菌株的乙醇耐受性比較
2.1.2 不同乙醇耐性菌株的VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵
S.cerevisiae 4126、S.cerevisiae S288c和S.cerevisiae BHL01三株乙醇耐性不同的酵母菌的VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵參數(shù)(殘?zhí)恰⒁掖?、甘油和生物量濃度等)如圖3所示,發(fā)現(xiàn)S.cerevisiae 4126及S.cerevisiae BHL01連續(xù)發(fā)酵體系中發(fā)酵參數(shù)均呈現(xiàn)周期性振蕩行為(圖3a、3b),而類似振蕩行為未在S.cerevisiae S288c連續(xù)發(fā)酵體系中觀察到,隨發(fā)酵時間延長S.cerevisiae S288c體系逐漸發(fā)展成高底物濃度(136.4 g/L~149.8 g/L)、低產(chǎn)物濃度(46.5 g/L~56.8 g/L)的擬穩(wěn)態(tài)狀態(tài)(圖3c),表明VHG振蕩行為的產(chǎn)生與菌種有關(guān)。
圖3 三株不同乙醇耐受性酵母菌的VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵
如表1所示,S.cerevisiae BHL01、S.cerevisiae 4126和S.cerevisiae S288c VHG連續(xù)發(fā)酵體系的最大乙醇濃度分別為88.4 g/L、71.3 g/L和56.8 g/L,可見S.cerevisiae BHL01和S.cerevisiae 4126的乙醇生產(chǎn)能力要強于S.cerevisiae S288c,這與其乙醇耐受性數(shù)據(jù)一致。另外,三株酵母菌的VHG體系中乙醇濃度變化幅度也是S.cerevisiae BHL01最大(31.6 g/L)、S.cerevisiae 4126其次(20.0 g/L)、S.cerevisiae S288c最?。?.2 g/L),同樣其乙醇生成速率也具有這樣的大小關(guān)系。高乙醇生成速率會造成胞內(nèi)乙醇積累,胞內(nèi)的高濃度乙醇會嚴重損傷和破壞細胞器和酶,導(dǎo)致細胞活力下降甚至死亡[18]。以發(fā)酵參數(shù)的振幅而言,S.cerevisiae BHL01發(fā)酵體系的參數(shù)波動要明顯強于S.cerevisiae 4126體系,而S.cerevisiae 4126體系要強于S.cerevisiae S288c體系,這種強弱關(guān)系與三株酵母菌的乙醇耐受性強弱一致,表明VHG振蕩的強弱可能與酵母細胞的乙醇耐受性有關(guān)。
表1 三株酵母菌的VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵參數(shù)
S.cerevisiae BHL01、S.cerevisiae 4126和S.cerevisiae S288c VHG發(fā)酵體系的參數(shù)變化顯示,S.cerevisiae BHL01和S.cerevisiae 4126體系的乙醇濃度都超過了其最大乙醇耐受濃度,發(fā)酵體系中的高濃度乙醇對細胞的生長和代謝產(chǎn)生了抑制作用;而S.cerevisiae S288c的乙醇發(fā)酵生產(chǎn)能力弱,在VHG連續(xù)發(fā)酵過程中,當乙醇濃度達到46.5 g/L~56.8 g/L時(低于其最大乙醇耐受濃度),同時細胞的乙醇生產(chǎn)能力達到極限,發(fā)酵液中乙醇濃度不會繼續(xù)增加,不會對酵母細胞的生長代謝和乙醇合成代謝產(chǎn)生明顯抑制作用,乙醇生成速率維持在恒定水平。此時,細胞乙醇生成與細胞乙醇耐性之間達到了一定平衡,最終發(fā)酵體系達到了含有約150 g/L的殘?zhí)菨舛鹊臄M穩(wěn)態(tài)。S.cerevisiae BHL01、S.cerevisiae 4126和S.cerevisiae S288c VHG發(fā)酵體系的參數(shù)變化表明,酵母細胞的乙醇耐受性對VHG振蕩行為具有重要影響,在同一發(fā)酵體系中菌株乙醇耐受能力越強,其誘發(fā)的振蕩行為越劇烈。
基于上述研究結(jié)果,本實驗以低糖穩(wěn)態(tài)體系[15]為對照體系,向其中流加含50 g/L或70 g/L乙醇的低糖發(fā)酵培養(yǎng)基,考察外源乙醇脅迫對VHG連續(xù)發(fā)酵過程的影響(見圖4)。這里的對照體系指以S.cerevisiae 4126為實驗菌株、流加含有低濃度葡萄糖(120 g/L)的培養(yǎng)基進行乙醇連續(xù)發(fā)酵可達到穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)。
圖4 外源乙醇添加對酵母細胞低糖乙醇連續(xù)發(fā)酵體系的影響
圖4顯示,外源流加50 g/L乙醇能夠誘發(fā)低糖穩(wěn)態(tài)體系產(chǎn)生周期性振蕩行為,殘?zhí)恰⒁掖己蜕锪浚―CW)濃度分別在(39.0~99.1)g/L、(49.5~84.4)g/L和(0.4~3.8)g/L范圍振蕩,平均濃度分別為67.7 g/L、66.7 g/L和1.9 g/L,振蕩周期約為105 h。此外,添加30 g/L或40 g/L乙醇時,均能夠誘導(dǎo)周期性振蕩行為,且高濃度外源乙醇能夠誘導(dǎo)更長周期、更大振幅的振蕩行為[15]。然而,當添加更高濃度乙醇(70 g/L)時,發(fā)酵參數(shù)變化卻并不顯著,殘?zhí)?、乙醇和生物量濃度分別在106.0 g/L~114.1 g/L、62.8 g/L~73.8 g/L和0.03 g/L~0.6 g/L范圍波動。生物量平均濃度不到0.5 g/L,表明此時細胞生長幾乎被完全抑制,而且流加培養(yǎng)基中底物葡萄糖僅消耗10 g/L左右,揮發(fā)損失使得發(fā)酵液中乙醇濃度(62.8 g/L)甚至低于流加培養(yǎng)基中初始濃度(70 g/L),表明外源70 g/L乙醇施加的抑制程度超過了連續(xù)發(fā)酵體系中酵母細胞的乙醇耐受性。
研究結(jié)果表明,在酵母細胞可耐受范圍內(nèi),通過向低糖穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)中外源添加乙醇,對細胞施加抑制,可誘發(fā)穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)的發(fā)酵參數(shù)出現(xiàn)周期性振蕩行為,且施加的乙醇抑制越強,誘發(fā)的振蕩行為振幅越大、周期越長,而當外源添加乙醇解除時,發(fā)酵體系會逐漸恢復(fù)到穩(wěn)態(tài)狀態(tài)。
前期研究表明,乙醇連續(xù)發(fā)酵體系振蕩行為是一種復(fù)雜生物行為,是胞外以及胞內(nèi)因素共同作用的結(jié)果[15],基于S.cerevisiae 4126 VHG連續(xù)振蕩體系,本實驗選取了對細胞生長狀態(tài)有影響的培養(yǎng)基組成和通氣供應(yīng)來考察振蕩行為受到的影響。
如圖5所示VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵,使用營養(yǎng)豐富的YPD培養(yǎng)基時,發(fā)酵參數(shù)呈現(xiàn)大幅度、周期性振蕩行為。然而,將流加培養(yǎng)基切換成合成培養(yǎng)基后,雖然200 h內(nèi)也觀察到了較為明顯的參數(shù)振蕩行為,但運行約300 h后發(fā)酵參數(shù)的振蕩幅度逐漸變小,最后趨于穩(wěn)定,維持在高殘?zhí)牵ā?60 g/L)、低乙醇(~50 g/L)濃度水平,這種振蕩行為類似阻尼振蕩。
圖5 培養(yǎng)基組成對酵母細胞VHG振蕩行為的影響
YPD培養(yǎng)基能夠給酵母細胞提供足夠養(yǎng)分,維持細胞合成以及分解代謝,在無乙醇抑制條件下,能夠使細胞獲得高比生長速率和高乙醇比生成速率。然而,合成培養(yǎng)基中營養(yǎng)匱乏,無法提供滿足酵母細胞生物量積累及乙醇發(fā)酵的充足營養(yǎng),限制了細胞生長和乙醇生成速率,隨著連續(xù)發(fā)酵的進行,發(fā)酵液中的乙醇濃度和細胞濃度不斷被稀釋,最后維持在一個低乙醇濃度的環(huán)境下,避免了發(fā)酵體系中出現(xiàn)高濃度乙醇以及乙醇濃度動態(tài)變化產(chǎn)生的抑制作用。
圖6所示,停止通氣對發(fā)酵體系參數(shù)振蕩行為影響顯著,通氣停止后酵母細胞生物量積累以及乙醇生成受到了明顯抑制,濃度逐漸減少,同時發(fā)酵液中殘?zhí)菨舛炔粩嗌?,振蕩行為逐漸消失。供氧對細胞生長非常重要,氧分子參與細胞中氧化磷酸化過程產(chǎn)生大量ATP,為細胞代謝活動提供能量,而在厭氧條件下1分子葡萄糖通過糖酵解途徑僅能產(chǎn)生2分子的ATP,能量供應(yīng)相對不足。雖然VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵過程中通氣速率較小,僅0.05 vvm,但溶解氧被細胞利用后使糖酵解產(chǎn)物丙酮酸進入TCA循環(huán)得到進一步氧化,為酵母細胞代謝提供足夠ATP。因此,供氧或能量供應(yīng)有助于酵母細胞VHG連續(xù)振蕩行為的維持,表明這是一個耗能過程。
圖6 供氧對酵母細胞振蕩行為的影響
VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵過程中,酵母細胞遭受高濃度底物的滲透壓脅迫以及高濃度產(chǎn)物乙醇的抑制作用,周期性振蕩行為的產(chǎn)生是環(huán)境和細胞因素綜合作用的結(jié)果[15,19,20]。前期研究表明,高濃度底物的滲透壓脅迫以及細胞周期變化與VHG振蕩行為無直接關(guān)聯(lián)[15,19],通過木塊固定化提高酵母細胞乙醇耐受能力[10,13]和發(fā)酵偶聯(lián)氣提操作實時移除發(fā)酵液中部分乙醇[14,15]都能夠有效弱化VHG振蕩行為,且通過改變VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵的稀釋速率可以切換穩(wěn)態(tài)和振蕩狀態(tài)[12]。本研究結(jié)果表明,細胞乙醇耐受性差異(與菌種、外源乙醇脅迫等有關(guān))和細胞生長和能量狀態(tài)(與培養(yǎng)基組成、供氧等有關(guān))對VHG振蕩行為有顯著影響。
每株酵母菌都存在一個臨界乙醇耐受濃度Ecrit,當發(fā)酵體系中乙醇濃度E超過Ecrit時,會對細胞生長和代謝產(chǎn)生抑制作用。在底物葡萄糖過量(280 g/L)和營養(yǎng)充足(YPD培養(yǎng)基)的VHG乙醇連續(xù)發(fā)酵體系中(無限制性基質(zhì)存在),細胞濃度變化率和乙醇濃度變化率滿足:及稀釋速率。
當發(fā)酵體系中乙醇濃度E低于Ecrit時,產(chǎn)物乙醇對細胞生長和代謝的影響可忽略(無限制性產(chǎn)物存在),此時細胞比生長速率達到最大μmax,遠大于稀釋速率D(此時細胞比死亡速率α可忽略不計),發(fā)酵體系中細胞不斷積累。厭氧或微氧條件下,釀酒酵母的乙醇積累與細胞生長相關(guān),發(fā)酵體系中乙醇濃度隨細胞生長而不斷積累。當發(fā)酵液中乙醇濃度E超過臨界乙醇耐受濃度Ecrit時,高濃度乙醇會抑制細胞生長使其比生長速率μ逐漸減小,此時比死亡速率α不斷增加。在細胞比生長速率μ逐漸減小的過程中,細胞生長速率d X/d t和乙醇生成速率d E/d t隨之發(fā)生著變化,從式(1)和(2)可知d X/d t和d E/d t的變化趨勢并不一致,這與VHG振蕩周期中觀察到生物量濃度和乙醇濃度曲線的相位差吻合[3,15,19],文獻顯示生物量濃度較乙醇濃度先出現(xiàn)下降,在S.cerevisiae 4126 VHG連續(xù)振蕩體系中這種相位差約24 h,這種差異正是由于細胞生長和乙醇生成對乙醇脅迫的響應(yīng)不同造成的,這可能是誘導(dǎo)周期性VHG振蕩行為的關(guān)鍵。基于此,VHG振蕩行為的調(diào)控與μ,D和α相關(guān),而α與細胞乙醇耐受性(Ethanol tolerance,Et)密切相關(guān),本研究提出VHG振蕩調(diào)控與μ,D和Et存在一定函數(shù)關(guān)系。除稀釋速率D外[12,21],本研究結(jié)果證實比生長速率μ(與培養(yǎng)基組成、供氧狀態(tài)等相關(guān))以及乙醇耐受性Et(菌種差異、外源乙醇脅迫等相關(guān))是VHG振蕩行為產(chǎn)生的另外兩個關(guān)鍵因素。
其中,X、S0、S、E、μ、qeth、α及D分別表示細胞濃度、流加培養(yǎng)基中初始糖濃度、殘?zhí)菨舛?、乙醇濃度、細胞比生長速率、乙醇比生成速率、細胞比死亡速率
(1)VHG振蕩行為的產(chǎn)生與酵母細胞的乙醇耐受性有關(guān),且乙醇耐受性越強的酵母菌的振蕩行為越顯著;在酵母細胞可耐受范圍內(nèi),向低糖穩(wěn)態(tài)系統(tǒng)中施加外源乙醇脅迫,可誘發(fā)周期性振蕩行為,且施加的乙醇抑制作用越強,誘發(fā)的振蕩行為越劇烈,而當外源乙醇脅迫解除時,發(fā)酵體系可恢復(fù)到穩(wěn)態(tài)狀態(tài)。
(2)VHG振蕩行為的產(chǎn)生與培養(yǎng)基組成以及氧供應(yīng)相關(guān),營養(yǎng)和能量供應(yīng)是維持周期性VHG振蕩的重要因素。
(3)VHG振蕩行為的產(chǎn)生與比生長速率μ、比死亡速率α、稀釋速率D以及乙醇耐受性Et相關(guān),且細胞生長和乙醇生成對乙醇脅迫的響應(yīng)不同可能是誘發(fā)VHG振蕩行為的關(guān)鍵。