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        低深度全基因組測序在復(fù)發(fā)性流產(chǎn)患者中的臨床應(yīng)用

        2022-06-21 02:52:30鄭小蔚黃小蘭陳小青
        中國當(dāng)代醫(yī)藥 2022年14期
        關(guān)鍵詞:整倍體易位核型

        鄭小蔚 黃小蘭 陳小青

        1.福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院檢驗(yàn)科,福建泉州 362000;2.福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)科,福建泉州 362000;3.福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院免疫內(nèi)科,福建泉州 362000

        迄今為止,經(jīng)過多年的研究,復(fù)發(fā)性流產(chǎn)(recurrent spontaneous abortion,RSA)仍然是醫(yī)學(xué)的一個(gè)挑戰(zhàn)。傳統(tǒng)通常將3 次或3 次以上在孕28 周前的流產(chǎn)稱為RSA[1],但大部分研究認(rèn)為,若連續(xù)發(fā)生2 次及以上的流產(chǎn),再次出現(xiàn)流產(chǎn)的風(fēng)險(xiǎn)也隨之提高,應(yīng)加強(qiáng)重視。流行病學(xué)調(diào)查研究發(fā)現(xiàn),RSA 的發(fā)病率為1%~3%,約影響3%的孕婦,且早期約占全部RSA 的80%[1-2]。一項(xiàng)前瞻性研究結(jié)果顯示,RSA 復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)隨著流產(chǎn)次數(shù)增加而上升,既往的自然流產(chǎn)史是一個(gè)獨(dú)立危險(xiǎn)因素,每次流產(chǎn)的風(fēng)險(xiǎn)增加約11%,在3 次或3 次以上的流產(chǎn)后約占40%[3]。各種病因,無論是單獨(dú)的還是聯(lián)合的,都被認(rèn)為是導(dǎo)致流產(chǎn)的原因,包括子宮畸形、感染、母體血栓性疾病、免疫功能障礙、各種內(nèi)分泌紊亂和父母染色體異常[4]。在各種病因中,遺傳因素似乎與生殖損失高度相關(guān)[5-6]。在50%的夫婦中,沒有明確的病因,在這種情況下,他們被認(rèn)為患有特發(fā)性或無法解釋的RSA[6]。在29%~60%的病例中,RSA 可由胚胎的染色體畸變引起[7]。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        選取2018年1月至2021年10月在福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院婦產(chǎn)科收治的420 對RSA 患者夫婦作為研究對象。年齡:男性23~53 歲,平均(33.23±4.68)歲,女性23~45 歲;平均(32.51±3.89)歲;超聲評估胎停孕齡為7~15 周,納入標(biāo)準(zhǔn):①同一對夫婦連續(xù)發(fā)生2 次或者2 次以上流產(chǎn);②妊娠28 周之前的流產(chǎn);③表型和智力均正常;④非近親婚配。排除標(biāo)準(zhǔn):病毒感染及器質(zhì)性病變等因素導(dǎo)致的生殖異常。本研究取得參與研究者的知情同意,并獲得福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院倫理委員會的批準(zhǔn)。

        1.2 方法

        1.2.1 外周血染色體制備 1 ml 外周血加入5 ml 的人外周血淋巴細(xì)胞培養(yǎng)基培養(yǎng)液(廣州達(dá)暉生物公司,批號:X10Y210512)中,于培養(yǎng)箱(Thermo3110 型)內(nèi)培養(yǎng)72 h,加入濃度為100 μg/ml 的秋水仙素(杭州寶榮,批號:J190801)50 μl 繼續(xù)培養(yǎng)22 min,收獲染色體,常規(guī)染色體制片,行G 顯帶核型分析。外周血染色體核型分析:一般情況下每份標(biāo)本隨機(jī)計(jì)數(shù)20個(gè)分裂相,記錄所見的任何的數(shù)目和結(jié)構(gòu)畸變,選擇3~5 個(gè)分裂相進(jìn)行核型分析。如果是嵌合體病例,則每一細(xì)胞系至少分析1 個(gè)細(xì)胞,特殊病例應(yīng)加大分析的細(xì)胞數(shù)目至50~100 個(gè)。

        1.2.2 胚胎流產(chǎn)物染色體制備 ①采集所有行清宮手術(shù)的早期自然流產(chǎn)孕婦的絨毛組織10 g 并將其置于含有1640 培養(yǎng)液(杭州寶榮,批號:C1210701)的瓶子中。②在倒置顯微鏡(OLYMPUS,型號:IX53P1F)下挑選收集到的患者絨毛組織,選擇約5 g 左右分支明顯的絨毛。③利用1640 培養(yǎng)液對絨毛組織進(jìn)行漂洗后將其剪碎,保證整個(gè)過程在無菌條件下進(jìn)行。④將準(zhǔn)備好的絨毛組織置于含2 ml,250 U/L 膠原酶Ⅱ(CAS:9001-12-1)的離心管內(nèi)并放置于含有5%CO2的培養(yǎng)箱(Thermo3110 型)內(nèi)靜置10 min。⑤開蓋后置于40℃培養(yǎng)箱內(nèi)保存,第二天可根據(jù)細(xì)胞培養(yǎng)的方法培養(yǎng)采集的絨毛細(xì)胞并制備染色體。胚胎流產(chǎn)物染色體核型分析:一般情況下每份標(biāo)本隨機(jī)計(jì)數(shù)20 個(gè)分裂相,記錄所見的任何的數(shù)目和結(jié)構(gòu)畸變,選擇3~5個(gè)分裂相進(jìn)行核型分析。如果是嵌合體病例,則每一細(xì)胞系至少分析1 個(gè)細(xì)胞,特殊病例應(yīng)加大分析的細(xì)胞數(shù)目至50~100 個(gè)。

        1.2.3 胚胎流產(chǎn)物組織低深度全基因組測序 試劑采用華大生物科技(武漢)有限公司的染色體非整倍體檢測試劑盒(聯(lián)合探針錨定聚合測序法),儀器采用深圳華大基因生物醫(yī)學(xué)工程有限公司的基因測序儀(BGISEQ-500)。①流產(chǎn)物組織樣品準(zhǔn)備及DNA 提?。虎谖膸鞓?gòu)建打斷;③聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR);④Poolin 構(gòu)建好文庫經(jīng)Agilent2100 Bioanalyzer 及實(shí)時(shí)定量,基因擴(kuò)增熒光檢測系統(tǒng)(real-time polymerase chain reaction,QPCR)檢測合格后,將一定量的文庫按照等物質(zhì)的量混合,上機(jī)測序(BGISEQ-500)后進(jìn)行信息分析。

        1.3 觀察指標(biāo)及評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)

        觀察RSA 孕婦外周血結(jié)果、胚胎染色體結(jié)果、胚胎染色體低深度全基因組測序(copy number variation sequencing,CNV-seq)結(jié)果,分析孕婦年齡、流產(chǎn)次數(shù)與染色體異常的關(guān)系。采用染色體G 顯帶進(jìn)行外周血染色體核型分析、胚胎染色體核型分析,核型描述遵循《人類細(xì)胞遺傳學(xué)國際命名體制》(ISCN2016)[8]。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        采用SPSS 17.0 統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。采用Kolmogorov-Smirnov 檢驗(yàn)是否符合正態(tài)分布。所有計(jì)量資料進(jìn)行正態(tài)性檢驗(yàn),符合正態(tài)分布的計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,計(jì)數(shù)資料用率表示。高通量數(shù)據(jù)分析:數(shù)據(jù)分析軟件采用染色體非整倍體分析軟件來自華大生物科技(武漢)有限公司。

        2 結(jié)果

        2.1 RSA 孕婦外周血結(jié)果的分析

        420 對RSA 孕婦外周血染色體有42 對異常核型,陽性率10%,其中染色體平衡易位20 對,占47.6%,羅伯遜易位3 對,占7.1%,染色體多態(tài)性15 對,占35.7%,性染色體異常2 對,占4.8%,染色體嵌合2對,占4.8%。

        2.2 胚胎染色體結(jié)果的分析

        420 對RSA 胚胎組織染色體,成功383 對,有113 對異常核型,陽性率29.5%,其中染色體平衡易位10 對,占2.6%,羅伯遜易位8 對,占2.1%,染色體多態(tài)性15 對,占3.9%,性染色體異常20 對,占5.2%,染色體嵌合13 對,占3.4%,三體35 對,占9.1%,結(jié)果正常270 對,占70.5% 。

        2.3 胚胎染色體CNV-seq 結(jié)果的分析

        420 對胚胎染色體檢出異常結(jié)果362 對,占86.2%,陰性結(jié)果58 對,占13.8%,非整倍體中,單體以45,X 最多,三體以16 三體最多(表1)。

        表1 420 例胚胎染色體結(jié)果分析

        2.4 孕婦年齡、流產(chǎn)次數(shù)與染色體異常的關(guān)系

        420 對RSA 孕婦根據(jù)年齡分3 個(gè)亞組,年齡≥40歲組染色體異常核型發(fā)生率34.2%,占比最高;年齡20~<30 歲組的染色體異常核型發(fā)生率最低。根據(jù)流產(chǎn)次數(shù),流產(chǎn)3 次的異常核型占比最高,為37.8%,其次是流產(chǎn)3 次以上(表2)。

        表2 年齡、流產(chǎn)次數(shù)與染色體異常的關(guān)系

        3 討論

        夫婦外周血和/或胚胎染色體異常是引起早期RSA 的常見病因。國外有學(xué)者在長達(dá)20年的研究期間(1996-2016年),對627 對RSA 患者夫婦進(jìn)行細(xì)胞遺傳學(xué)分析,檢測出69 對(11.00%)夫婦存在染色體異常[9]。臨床上常見的有染色體易位,主要是相互易位(61%)和羅伯遜易位(16%)、基因多態(tài)性、臂內(nèi)倒位、臂間倒位及性染色體異常,此外還有插入、缺失等[10]。本研究對420 對RSA 患者夫婦行外周血染色體檢測,有42 例異常核型,陽性率10%,與國外的研究結(jié)果相符[11]。在3%~6%的RSA 夫婦中,一方有基因平衡的染色體結(jié)構(gòu)重排。這種平衡易位占核型異常的最大比例[12]。這種異常配子的臨床后果包括反復(fù)流產(chǎn)、死產(chǎn)、出生畸形兒童和智力殘疾兒童[13]。如果夫婦任何一方是同源羅伯遜易位攜帶者,胚胎染色體可能出現(xiàn)單體或者三倍體,那么胚胎可能早期自然流產(chǎn);如果夫婦為非同源羅伯遜易位攜帶者,胚胎染色體可能出現(xiàn)重復(fù)或缺失,大約2/3 的子代可能出現(xiàn)流產(chǎn)或畸形。如果妻子攜帶缺陷X 染色體,可能因偏斜X染色體的不對稱失活及低頻率X 單體嵌合體的異常高發(fā)率導(dǎo)致RSA[14-15]。在人類染色體中,9 號染色體為出現(xiàn)較高頻率的多態(tài)性,一般情況下,個(gè)體間出現(xiàn)1%~2%的變異遵循孟德爾遺傳定律[16]。Ueharas 等[17]報(bào)道,inv(9)與有不孕癥和多次流產(chǎn)有關(guān)。男性患者隨著年齡的上升,精子染色體異常也隨之增高,特別是非整倍體,有研究者對精子進(jìn)行核型分析,結(jié)果顯示,在RSA 患者中,男方精子的非整倍體率顯著增加[18]。近年來,國外有研究顯示中國男性攜帶復(fù)雜染色體重排者(complex chromosomal rearrangement,CCR)也會引起RSA 的增加[19]。對CCR 累及的染色體及斷裂點(diǎn)分析發(fā)現(xiàn),累及6 號、7 號、8 號、11 號和16 號染色體的CCR 多會出現(xiàn)不良妊娠結(jié)局,斷裂點(diǎn)出現(xiàn)在2q31、5q35 和8ql3 時(shí)RSA 多見。有報(bào)道稱Y 染色體微缺失與RSA 并無相關(guān)性[20]。

        研究顯示,在RSA 中胚胎染色體異常發(fā)生率較夫婦染色體異常高,胚胎染色體出現(xiàn)非整倍體是最常見的流產(chǎn)因素,尤其是在妊娠早期[21]。國外有一項(xiàng)前瞻性研究顯示,隨著女性年齡的上升,卵母細(xì)胞非整倍體和多倍體的發(fā)生率升高,尤其是高齡女性(>35歲),RSA 的發(fā)生率也明顯增加[22]。本研究結(jié)果顯示,胚胎染色體非整倍體異常的患者年齡也以高齡(>35 歲)居多。Yang 等[23]對182 例妊娠患者均進(jìn)行G 顯帶細(xì)胞遺傳學(xué)分析和新型高通量連接依賴探針擴(kuò)增(high-throughput ligation-dependent probe amplifica tion,HLPA)技術(shù),以檢測染色體異常。對74 例患者進(jìn)行低覆蓋全基因組測序(whole-genome sequencing,WGS),檢測拷貝數(shù)變異(copy number variations,CNVs)。WGS 提示RSA 組致病性CNVs 發(fā)生率高于對照組。在自然流產(chǎn)患者中,核型異常和致病性CNVs的發(fā)生率較高。周靜等[24]共發(fā)現(xiàn)1040 例異常核型,發(fā)生率為44.86%(1040/2318),占異常核型的73.24%(1040/1420),是胚胎早期停止發(fā)育的重要原因,以16三體發(fā)生頻率最高,其次是22 三體、45X 及多重非整倍體。本研究結(jié)果顯示,420 對胚胎染色體異常中以X 號染色體發(fā)生頻率最高,其次是16 染色體為多見,21 號染色體及22 號染色體最常見三體異常,CNV-seq共檢出有致病意義的有109 對,包含了一些臨床意義明確的基因組,dup(9)(p24.3p11.1)區(qū)域約47.31 Mb的重復(fù)與小耳畸形,生長遲緩有關(guān)[25],del(3)(q11.1q11.2)與常染色體顯性蛋白S 缺乏性血栓形成傾向有關(guān)[26],dup(13)(q11q21.33)主要臨床表現(xiàn)為身材矮小、智力低下、主動脈縮窄、面部畸形、共濟(jì)失調(diào)、輕度痙攣步態(tài)和大頭畸形等[27]。del(1)(p36.21p36.33)有相關(guān)綜合征“chromosome 1p36 deletion syndrome”的報(bào)道[28]。

        RSA 的患病率逐年增高,胚胎染色體異常是導(dǎo)致流產(chǎn)的主要原因,而染色體非整倍體數(shù)目異常最為常見,本研究建議,臨床診療實(shí)際工作中,應(yīng)重視遺傳學(xué)病因的篩檢,G 顯帶染色體核型分析培養(yǎng)作為流產(chǎn)查因的臨床常規(guī)檢測,但由于其培養(yǎng)過程比較繁瑣,且分辨率>5 M,應(yīng)用受到一定的限制,CNV-seq 近幾年飛速發(fā)展,將CNV-seq 應(yīng)用于臨床流產(chǎn)查因,對于不明原因的RSA 者,明確流產(chǎn)的遺傳學(xué)檢測有助于探求可能的遺傳學(xué)因素和父母雙方遺傳學(xué)異常的線索,為再次妊娠提供有針對性的孕前優(yōu)生措施,還可為再次妊娠進(jìn)行胚胎植入前診斷或產(chǎn)前診斷提供遺傳學(xué)依據(jù)。隨著輔助生殖技術(shù)發(fā)展,胚胎染色體異常導(dǎo)致的RSA 或可通過一些新技術(shù)手段進(jìn)行干預(yù),如胚胎植入前遺傳學(xué)診斷技術(shù)[29]等來降低RSA 發(fā)生的概率。為臨床精準(zhǔn)診療提供了新的思路和方法,為深入了解RSA 遺傳學(xué)病因及開展大規(guī)模臨床實(shí)際應(yīng)用提供科學(xué)依據(jù)。

        綜上所述,染色體檢測可實(shí)現(xiàn)RSA 的準(zhǔn)確診斷從而用于預(yù)防。本研究選用染色體細(xì)胞培養(yǎng)G 顯帶分析技術(shù)和CNV-seq 對絨毛細(xì)胞進(jìn)行染色體檢查,結(jié)合夫婦雙方染色體分析進(jìn)行綜合評估,明確RSA的病因,為臨床提供合適的指導(dǎo),指導(dǎo)患者安全備孕避免RSA 的再發(fā)生。

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