謝 巖 王 暉 李 娜 賈漫麗 黃 露 孫志超 李季生
(承德醫(yī)學(xué)院蠶業(yè)研究所,河北省高校特產(chǎn)蠶桑應(yīng)用技術(shù)研發(fā)中心,承德067000)
家蠶(Bombyxmori)為寡食性昆蟲,通過(guò)與其宿主桑樹(MorusalbaL.)的自然選擇和長(zhǎng)期協(xié)同進(jìn)化,對(duì)桑葉表現(xiàn)出偏好的采食性和桑葉營(yíng)養(yǎng)成分消化吸收的適應(yīng)性[1-3]。人工飼料可以克服桑樹生長(zhǎng)期對(duì)蠶業(yè)生產(chǎn)季節(jié)性的限制,通過(guò)人為調(diào)配營(yíng)養(yǎng)成分來(lái)提高生產(chǎn)的標(biāo)準(zhǔn)化程度[4-5],現(xiàn)已成為蠶業(yè)科學(xué)發(fā)展的一個(gè)研究熱點(diǎn)。但由于家蠶的攝食性和營(yíng)養(yǎng)需求受到品種、地域、飼養(yǎng)環(huán)境的諸多影響,難以形成統(tǒng)一人工飼料用于大規(guī)模推廣和全齡期飼用,而且全齡人工飼料飼育效果難以達(dá)到桑葉的飼育效果[6]。因此,桑葉仍然是家蠶的最適宜食物來(lái)源。桑葉營(yíng)養(yǎng)成分含量直接影響家蠶的生長(zhǎng)和經(jīng)濟(jì)性能[7-8],適宜的優(yōu)質(zhì)桑葉的選擇是家蠶健康生長(zhǎng)和蠶繭生產(chǎn)的保障。桑葉成熟度是桑葉營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)變動(dòng)的重要因素,其與家蠶生長(zhǎng)和經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)系研究較多[9-12],但鮮有深入揭示其分子機(jī)制的研究,難以為實(shí)際生產(chǎn)應(yīng)用提供準(zhǔn)確的理論指導(dǎo)。家蠶是重要的經(jīng)濟(jì)昆蟲,也是基礎(chǔ)生物學(xué)研究的優(yōu)良模式動(dòng)物[13-14]。全基因組計(jì)劃的完成和遺傳圖譜的構(gòu)建奠定了其在現(xiàn)代生命科學(xué)領(lǐng)域的優(yōu)勢(shì)地位,并促進(jìn)了家蠶功能基因組學(xué)研究的發(fā)展。蛋白質(zhì)組學(xué)是功能基因組學(xué)的重要組成部分,通過(guò)研究參與特定生理或試驗(yàn)處理狀態(tài)的所有的蛋白質(zhì)種類及其變化闡述生命活動(dòng)機(jī)理,相對(duì)和絕對(duì)定量同位素標(biāo)記(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技術(shù)因其高通量、高重現(xiàn)性、高靈敏性的特點(diǎn)成為蛋白質(zhì)組定性和定量研究的有效工具,近年來(lái)被廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)功能注釋、生物標(biāo)記篩選、藥物效應(yīng)驗(yàn)證等生命科學(xué)領(lǐng)域[15-16],已在家蠶免疫、性別分化和滯育等機(jī)制的研究中發(fā)揮重要作用。
家蠶5齡食桑量占全齡食桑量的80%以上[17],該齡期飼喂不同成熟度桑葉,蠶體會(huì)發(fā)生明顯差異[10,18-19],家蠶脂肪體具有類似哺乳動(dòng)物肝臟和腎臟的功能,存在大量與合成、代謝、免疫和繁殖相關(guān)的蛋白[20-21],是研究家蠶對(duì)攝食物質(zhì)響應(yīng)的關(guān)鍵器官[22-23]。本試驗(yàn)在測(cè)定秋季老、嫩桑葉營(yíng)養(yǎng)和活性物質(zhì)含量的基礎(chǔ)上,采用iTRAQ結(jié)合質(zhì)譜檢測(cè)技術(shù)高效捕獲5齡蠶脂肪體對(duì)2種成熟度桑葉營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)變動(dòng)反應(yīng)的差異表達(dá)蛋白,并應(yīng)用生物信息方法對(duì)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行功能聚類和互作分析,以揭示桑葉成熟度與其營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)含量的聯(lián)系,攝食2種成熟度桑葉的家蠶脂肪體蛋白質(zhì)組差異程度,蠶體攝食2種成熟度桑葉后其脂肪體細(xì)胞內(nèi)差異表達(dá)蛋白的功能分類和表達(dá)模式,蠶體對(duì)攝食物質(zhì)質(zhì)量變動(dòng)作出響應(yīng)的關(guān)鍵蛋白,篩選出的桑葉主要差異營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和蠶體響應(yīng)功能蛋白,為進(jìn)一步揭示單一營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)變動(dòng)對(duì)蠶體生長(zhǎng)和生產(chǎn)影響的關(guān)聯(lián)機(jī)制奠定基礎(chǔ),以期豐富飼養(yǎng)家蠶營(yíng)養(yǎng)組分的合理選擇和調(diào)配的理論依據(jù)。
家蠶品種:菁松×皓月。1~4齡家蠶幼蟲相同條件(25 ℃,同質(zhì)葉片)下飼喂,5齡幼蟲眠起,隨機(jī)挑選200頭分為2組(每組100頭),測(cè)定總重并分別飼喂9月桑樹老葉(春伐抽條基部4片葉)和嫩葉(春伐抽條頂部完全展開葉片4片),每天定量飼喂3次,次日清晨飼喂前(排出腸道糞便)稱重并記錄。
連續(xù)飼喂3 d后,解剖蠶體采集脂肪體組織,每個(gè)組設(shè)置2個(gè)重復(fù),每個(gè)重復(fù)為6個(gè)個(gè)體(雌雄各占1/2)脂肪體混合樣品,共計(jì)4個(gè)樣品(C1、C2、T1、T2),C1、C2為老葉組(C組)樣品,T1、T2為嫩葉組(T組)樣品。
飼蠶用老、嫩新鮮桑葉真空低溫凍干,在45 ℃烘箱內(nèi)烘至恒重,測(cè)定失水量,失水量和鮮葉重的比值作為水分含量值。凍干樣品研磨成粉末,過(guò)80目篩。粗脂肪和粗蛋白質(zhì)含量分別采用索氏抽提法和凱氏定氮法測(cè)定(青島科創(chuàng)質(zhì)量檢測(cè)有限公司承擔(dān))。可溶性糖含量采用植物可溶性糖含量檢測(cè)試劑盒(北京索萊寶科技有限公司,貨號(hào):BC0030)測(cè)定,還原性糖含量采用3,5-二硝基水楊酸(DNS)比色法測(cè)定,多糖含量采用蒽酮-硫酸比色法測(cè)定,總黃酮含量采用Al(NO3)3-NaNO2-NaOH比色法測(cè)定,總多酚含量采用福林酚比色法測(cè)定,上述指標(biāo)均由紫外可見分光光度計(jì)(普析通用,中國(guó))檢測(cè)。1-脫氧野尻霉素(1-DNJ)含量采用高效液相色譜(HPLC)法,使用LC-2030高效液相色譜儀(島津,日本)測(cè)定。除水分外,其余物質(zhì)均采用測(cè)定物質(zhì)重量和干物質(zhì)重量的比值作為含量值。每種成熟度均采集3個(gè)生物學(xué)重復(fù)樣品用于物質(zhì)測(cè)定,數(shù)據(jù)用平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)形式表示,含量數(shù)據(jù)用SPSS 19.0軟件進(jìn)行描述統(tǒng)計(jì)量計(jì)算和單因素方差分析。
取適量樣品加入液氮研磨,采用三氯乙酸(TCA)/丙酮沉淀法去除雜質(zhì),預(yù)冷純丙酮洗滌沉淀3~5次。裂解液[8 mol/L尿素、30 mmol/L 4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、1 mmol/L苯甲基磺酰氟(PMSF)、2 mmol/L乙二胺四乙酸(EDTA)、10 mmol/L二硫蘇糖醇(DTT)]重懸蛋白后,進(jìn)行還原烷基化處理。再加入4倍體積的預(yù)冷丙酮,沉淀蛋白,用含0.1%(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù))十二烷基磺酸鈉(SDS)的50%(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù))三乙醇胺(TEA)復(fù)溶后離心,保留上清。分別使用Bradford法和十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)對(duì)提取的蛋白進(jìn)行定量和完整性檢測(cè)。
樣本總蛋白的iTRAQ標(biāo)記與質(zhì)譜分析委托華大基因科技有限公司進(jìn)行。每個(gè)樣品取100 μg,加入等量適宜的胰蛋白酶(trypsin)將蛋白酶解為肽段,進(jìn)行標(biāo)記,標(biāo)記方法和步驟參照iTRAQ?Reagent-8 Plex Multiplex Kit(應(yīng)用生物系統(tǒng)公司,美國(guó))說(shuō)明書,1個(gè)樣品標(biāo)記1種同位素標(biāo)記,真空抽干標(biāo)記肽段用于后續(xù)試驗(yàn)。
各標(biāo)記肽段樣品等量混合后通過(guò)Agilent 1100高效液相色譜儀(安捷倫,美國(guó))和SCX 100強(qiáng)陽(yáng)離子交換柱(飛諾美,美國(guó))進(jìn)行預(yù)分級(jí),通過(guò)梯度洗脫分離30個(gè)組分,合并為16個(gè),再使用Acclaim PepMap C18 100(賽默飛,美國(guó))反相色譜除鹽。脫鹽組分依次通過(guò)納升液相系統(tǒng)Dionex ultimate 3000 nano LC system(賽默飛,美國(guó))的Strata-X C18 300色譜柱(艾杰尓,美國(guó))進(jìn)行梯度洗脫分離。質(zhì)譜檢測(cè)采用Q-Exactiv質(zhì)譜儀(賽默飛,美國(guó)),檢測(cè)參數(shù):正離子模式,母離子掃描范圍350~2 000 Da,二級(jí)分辨率17 500,離子源電壓1 800 V,毛細(xì)管溫度320 ℃,碎裂模式為高能碰撞解離(higher collision energy dissociation,HCD)。
將質(zhì)譜掃描的原始文件輸入到Proteome Discoverer 1.3軟件(賽默飛,美國(guó))進(jìn)行提取和篩選質(zhì)譜譜圖[母離子質(zhì)量范圍:350~6 000 Da,二級(jí)質(zhì)譜圖中最小峰數(shù):10,信噪比(S/N)域值:1.5]。提取后的譜圖用Mascot 2.3.0軟件在Bom_mori_uni數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行蛋白質(zhì)的定性和定量分析。
篩選差異表達(dá)倍數(shù)(fold change,F(xiàn)C)>1.25或<0.80,即|log2FC|>0.33且P<0.05的蛋白進(jìn)行功能信息注釋、富集分析和互作分析。采用蛋白索引號(hào)(UniProtKB AC)在UniProt(http://www.uniprot.org)獲取蛋白名稱和基本功能,無(wú)信息的蛋白注釋其氨基酸序列在AmiGO2(http://wiki.geneontology.org/index.php/AmiGO_2)和NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中比對(duì)到最高同源序列(相似性大于80%)的信息;通過(guò)QuickGO(http://www.ebi.ac.uk/QuickGO/)和WEGO2.0(http://wego.genomics.org.cn)對(duì)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行GO注釋和功能富集分析,通過(guò)KEGG(https://www.kegg.jp/)獲取差異表達(dá)蛋白參與的代謝通路;使用STING(https://string-db.org/)和Cytoscape 3.9.1軟件繪制差異表達(dá)蛋白互作關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖。
分別以老、嫩桑葉定量飼喂100頭5齡眠起蠶,每天調(diào)查1次蠶體總重和存活數(shù),共投食3 d,測(cè)定數(shù)據(jù)4次(包括眠起采食前的測(cè)定,即第0天),其中老葉組家蠶4次平均體重分別為0.66、1.37、1.61、2.13 g,嫩葉組家蠶4次平均體重分別為0.65、1.38、1.72、2.37 g。如圖1所示,飼喂不同成熟度葉片第2天開始,嫩葉組家蠶體重明顯高于老葉組,并且在第3天差異趨勢(shì)愈加明顯。
圖1 家蠶飼喂老、嫩桑葉的體重增長(zhǎng)趨勢(shì)
依次測(cè)定老、嫩桑葉營(yíng)養(yǎng)成分含量:水分、粗蛋白質(zhì)、可溶性糖、粗脂肪和還原性糖;活性物質(zhì)含量:多糖、總黃酮、總多酚、1-DNJ。其中糖類均采用無(wú)水葡萄糖配制梯度濃度標(biāo)準(zhǔn)品,總黃酮、總多酚和1-DNJ分別采用蘆丁、沒(méi)食子酸、1-DNJ標(biāo)準(zhǔn)品配制適宜梯度濃度標(biāo)準(zhǔn)品,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,各測(cè)定成分標(biāo)準(zhǔn)曲線線性程度良好,R2均高于0.99,結(jié)果見表1。除水分和多糖外,老、嫩桑葉的各物質(zhì)含量均存在顯著或極顯著差異(P<0.05或P<0.01)。嫩桑葉的粗脂肪、粗蛋白質(zhì)、還原性糖、總黃酮、總多酚、1-DNJ含量均高于老桑葉,可溶性糖含量則低于老桑葉。
表1 桑葉物質(zhì)含量
Bradford法繪制的標(biāo)準(zhǔn)曲線為y=0.183x-0.023,R2=0.993,提取的總蛋白濃度為1.09~1.52 μg/μL,總量為654~912 μg,取等量各樣品進(jìn)行SDS-PAGE,結(jié)果如圖2,蛋白質(zhì)電泳條帶清晰完整,無(wú)降解。
1~4泳道分別為家蠶脂肪體樣本C1、C2、T1、T2,泳道M為蛋白質(zhì)marker(14~94 kDa)。
通過(guò)質(zhì)譜掃描、PD篩選和Mascot 2.3.0匹配,共鑒定到:總譜圖數(shù)344 774,匹配譜圖數(shù)81 713,肽段種類數(shù)16 170和蛋白數(shù)2 172。設(shè)置FC>1.20或<0.83且P<0.05為篩選條件,共獲得173個(gè)差異表達(dá)蛋白,見表2,相對(duì)于老葉組,嫩葉組上調(diào)表達(dá)蛋白為85個(gè),下調(diào)表達(dá)蛋白為88個(gè)。
表2 家蠶脂肪體差異表達(dá)蛋白數(shù)(嫩葉組相對(duì)于老葉組)
選取FC>1.25或<0.80的58個(gè)上調(diào)蛋白和53個(gè)下調(diào)蛋白用于功能聚類分析,通過(guò)UNIPROTKB、NCBI和STRINGS等獲取的綜合信息對(duì)上述蛋白的基本信息和功能進(jìn)行注釋,除9個(gè)蛋白外,102個(gè)蛋白均能注釋到蛋白名稱、基因名稱和功能概述中的至少1條信息。
差異表達(dá)蛋白在細(xì)胞組分、生物學(xué)過(guò)程和分子功能3個(gè)方面的GO分析,共注釋到38個(gè)上調(diào)表達(dá)蛋白和43個(gè)下調(diào)表達(dá)蛋白,見圖3。分析發(fā)現(xiàn):1)差異表達(dá)蛋白參與9種細(xì)胞組分,細(xì)胞內(nèi)組分多于細(xì)胞膜和細(xì)胞外區(qū),組成細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞器的蛋白最多;2)差異表達(dá)蛋白參與14個(gè)分子功能,綁定、離子綁定、蛋白綁定、催化活性富集到的蛋白較多;3)差異表達(dá)蛋白參與16個(gè)生物學(xué)過(guò)程,參與細(xì)胞過(guò)程、代謝過(guò)程、有機(jī)物代謝過(guò)程、初級(jí)代謝過(guò)程、氮化合物代謝過(guò)程的蛋白數(shù)量明顯高于其他過(guò)程,其次富集到蛋白較多的過(guò)程為生物過(guò)程的調(diào)節(jié)、發(fā)展過(guò)程、對(duì)刺激的反應(yīng)、對(duì)應(yīng)激的反應(yīng)。
圖3 家蠶脂肪體差異表達(dá)蛋白GO注釋
111個(gè)差異表達(dá)蛋白中的53個(gè)通過(guò)KEGG的BlastKOALA得到通路注解,共有34個(gè)蛋白映射到84個(gè)三級(jí)通路,三級(jí)通路根據(jù)功能相似性歸納為30個(gè)二級(jí)通路,進(jìn)一步概括為6個(gè)一級(jí)功能集合:代謝、遺傳信息過(guò)程、環(huán)境信息過(guò)程、細(xì)胞過(guò)程、機(jī)體系統(tǒng)和人類疾病,見圖4。其中代謝、人類疾病和機(jī)體系統(tǒng)注釋到的蛋白和通路最多,分別為11個(gè)蛋白、38個(gè)通路,12個(gè)蛋白、20個(gè)通路和15個(gè)蛋白、13個(gè)通路。差異表達(dá)蛋白具體聚類到KEGG各個(gè)三級(jí)通路和功能信息見圖5。
圖4 家蠶脂肪體差異表達(dá)蛋白KEGG功能分類
圖5 家蠶脂肪體差異表達(dá)蛋白KEGG通路注釋
結(jié)合GO和KEGG分析富集到參與物質(zhì)代謝、免疫、發(fā)育、繁殖、對(duì)刺激反應(yīng)的功能相似蛋白集合,根據(jù)基因功能注釋信息,進(jìn)行匯總和分類統(tǒng)計(jì),結(jié)果見圖6。在功能聚類中按差異表達(dá)蛋白數(shù)量由多到少依次為:物質(zhì)能量代謝、發(fā)育過(guò)程、對(duì)刺激的反應(yīng)、免疫和感染類疾病、信號(hào)分子轉(zhuǎn)導(dǎo)和互作、細(xì)胞死亡和循環(huán)、繁殖。同時(shí)還統(tǒng)計(jì)到一些結(jié)構(gòu)和功能相似的家族蛋白,如表皮蛋白、低分子30K蛋白、核糖體蛋白、氧化或還原蛋白和熱應(yīng)激蛋白。注釋的代謝相關(guān)蛋白有46個(gè),占參與分析的差異表達(dá)蛋白總數(shù)(111個(gè))的41.44%,包括已知的糖、脂和能量代謝蛋白:蘋果酸脫氫酶1(MDH1)、ATP結(jié)合轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白G超家族成員(ABCG)、酸性脂肪酶1(PGLIP1)、天門冬酰胺合成酶活性蛋白(ASNS)等。注釋的發(fā)育相關(guān)蛋白有23個(gè),占參與分析的差異表達(dá)蛋白總數(shù)的20.72%,包括表皮、肌肉、神經(jīng)、壽命等組織發(fā)育相關(guān)蛋白:CPR4、CPR5、EDG91、CPR68、肌鈣蛋白T(TNNT)、肌侵蛋白(MTPN)、肌球蛋白-2必需輕鏈(MLC-C)、腦星形細(xì)胞源性神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子(MANF)、神經(jīng)前體細(xì)胞表達(dá)發(fā)育下調(diào)蛋白8(NEDD8)、GLAZ/NLAZ[24]等。注釋的刺激響應(yīng)相關(guān)蛋白有23個(gè),占參與分析的差異表達(dá)蛋白總數(shù)的20.72%,包括應(yīng)激和刺激感受蛋白:熱應(yīng)激相關(guān)的熱應(yīng)激蛋白20.8(HSP20.8)和熱應(yīng)激蛋白20.4(HSP20.4)、氧化應(yīng)激相關(guān)的γ-干擾素誘導(dǎo)溶酶體硫醇還原酶2(GILT2)和銅伴侶抗氧化劑1(ATOX1)、化學(xué)感受蛋白7(CSP7)等。注釋的免疫、感染相關(guān)蛋白有12個(gè),占參與分析的差異表達(dá)蛋白總數(shù)的10.81%,主要包括天然免疫相關(guān)蛋白和抗菌肽:蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶(ERP57)、鈣網(wǎng)蛋白(CALR)、GILT2、巨噬細(xì)胞遷移抑制因子(MIF)、免疫誘導(dǎo)蛋白(B6TOX)、抗菌肽(ATTA)等。
圖6 家蠶脂肪體差異表達(dá)蛋白功能注釋
111個(gè)差異表達(dá)蛋白通過(guò)STINGDE的多序列搜索(multiple sequences search)獲得49個(gè)蛋白,組成78對(duì)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互作(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)的PPI富集P值為7.61×10-10。將互作信息文件導(dǎo)入到Cytoscape中構(gòu)建可視網(wǎng)絡(luò)圖和計(jì)算各節(jié)點(diǎn)(網(wǎng)絡(luò)中各個(gè)蛋白)特征,結(jié)果如圖7所示。通過(guò)MCODE插件的k核解析設(shè)定閾值為4獲取2個(gè)子網(wǎng)絡(luò):7個(gè)節(jié)點(diǎn)[核糖體蛋白S17(RPS17)、核糖體蛋白L23(RPL23)、核糖體蛋白L4(RPL4)、核糖體蛋白L24(RPL24)、核糖體蛋白S28(RPS28)、信號(hào)識(shí)別顆粒蛋白19(SRP19)、NEDD8]的21對(duì)互作關(guān)系;4個(gè)節(jié)點(diǎn)[網(wǎng)格蛋白輕鏈(CLC)、促進(jìn)海藻糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(TRET1)、脂蛋白受體1(LPR1)和脂蛋白受體2(LPR2)]的6對(duì)互作關(guān)系。通過(guò)CentiScape插件3個(gè)統(tǒng)計(jì)量——點(diǎn)度中心性(degree centrality)、接近中心性(closeness centrality)和中介中心性(betweenness centrality)對(duì)各節(jié)點(diǎn)中心度進(jìn)行分析,獲得12個(gè)高中心度的關(guān)鍵蛋白——脂肪酸綁定蛋白(FABP)、ERP57、鈣網(wǎng)蛋白(CALR)、10 kDa熱應(yīng)激蛋白(HSP10)、ATP合酶亞基O(ATPsynO)、RPS17、RPL23、RPL4、RPL24、NEDD8、CLC、紫色酸性磷酸酶(PAP)。子網(wǎng)絡(luò)分析和網(wǎng)絡(luò)中心度分析均顯示RPS17、RPL23、RPL4、RPL24和NEDD8處于蛋白網(wǎng)絡(luò)中心,與其他蛋白互作關(guān)系多。
MLC-C:肌球蛋白-2必需輕鏈 myosin Ⅱ essential light chain;TSP29Fb:四次穿膜蛋白29Fb tetraspanin 29Fb;ASNS:天冬酰胺合成酶 asparagine synthetase;CCDC124:含有卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域蛋白124 coiled-coil domain containing 124;SURF4:過(guò)量位點(diǎn)蛋白4 surfeit locus protein 4 homolog;ALDH:醛脫氫酶 aldehyde dehydrogenase;ERP57:蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶 protein disulfide-isomerase;FABP:脂肪酸綁定蛋白 fatty acid binding protein;LSD1/2:脂質(zhì)儲(chǔ)存液滴表面結(jié)合蛋白1/2 lipid storage droplets surface-binding protein 1/2;PGLIP1:酸性脂肪酶1 acid lipase 1;ACBP2:乙酰輔酶A結(jié)合蛋白2 acyl-CoA binding protein 2;ATPsyndelta:ATP合酶delta亞基 ATP synthase delta subunit;ATPsynO:ATP合酶亞基O ATP synthase subunit O;MDH1:蘋果酸脫氫酶1 malate dehydrogenase 1;MANF:中腦星形細(xì)胞來(lái)源的神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子 mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor;FKBP13:肽基脯氨酰異構(gòu)酶 peptidylprolyl isomerase;RPS17:核糖體蛋白S17 ribosomal protein S17;HSP10:10 kDa熱應(yīng)激蛋白 10 kDa heat shock protein;CALR:鈣網(wǎng)蛋白 calreticulin;MCFD2:多重凝血因子缺乏蛋白2 multiple coagulation factor deficiency protein 2;METAP1:甲硫氨酸胺基肽酶1 methionine aminopeptidase 1;RPL23:核糖體蛋白L23 ribosomal protein L23;RPL4:核糖體蛋白L4 ribosomal protein L4;RPL24:核糖體蛋白L24 ribosomal protein L24;RPS28:核糖體蛋白S28 ribosomal protein S28;SRP19:信號(hào)識(shí)別顆粒蛋白19 signal recognition particle protein 19;MTPN:肌侵蛋白 myotrophin;NEDD8:神經(jīng)前體細(xì)胞表達(dá)發(fā)育下調(diào)蛋白8 neural precursor cell-expressed developmentally down-regulated protein 8;NLP:核質(zhì)蛋白類似蛋白 nucleoplasmin-like protein;dUTPase:脫氧尿苷三磷酸酶 deoxyuridine triphosphatase; apyrase isoform X1:三磷酸腺苷同型X1;PAP:紫色酸性磷酸酶 purple acid phosphatase;MIOX:肌醇加氧酶 inositol oxygenase;BJSP-2:基礎(chǔ)幼年激素抑制蛋白2 basic juvenile hormone-suppressible protein 2;TRET1:促進(jìn)海藻糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白1 facilitated trehalose transporter 1;CLC:網(wǎng)格蛋白輕鏈 calreticulin;LPR1/2:脂蛋白受體1/2 lipophorin receptor 1/2;MSBP:膜類固醇綁定蛋白 membrane steroid binding protein;GLB1:β-半乳糖苷酶1 beta-galactosidase 1;GLAZ/NLAZ:載脂蛋白D同源蛋白Glial Lazarillo/Neural Lazarillo apolipoprotein D homolog protein Glial Lazarillo/Neural Lazarillo;CPR68:假定表皮蛋白68 putative cuticle protein 68;MP20:肌肉蛋白20 muscle protein 20;TNNT:肌鈣蛋白T troponin T;HSP20.8:熱應(yīng)激蛋白20.8 heat shock protein 20.8;SPARC:分泌蛋白、酸性、富含半胱氨酸 secreted protein, acidic, cysteine-rich;ApoLp-Ⅲ:載脂蛋白III apolipophorin Ⅲ。
為了明確食入組分變化和家蠶體重增加的聯(lián)系,我們測(cè)定了老、嫩桑葉的主要營(yíng)養(yǎng)成分和活性物質(zhì)含量。在營(yíng)養(yǎng)成分上,嫩桑葉中粗脂肪、粗蛋白質(zhì)含量高于老桑葉,尤其是粗蛋白質(zhì)。李瑞等[18]采用秋季不同成熟度葉片飼喂5齡蠶,檢測(cè)到嫩桑葉粗蛋白質(zhì)含量高于老桑葉,盛食期蠶體重與飼喂桑葉的成熟度呈顯著負(fù)相關(guān)。Alebiosu等[10]用不同成熟度(嫩、成熟、老、混合)桑葉飼喂2個(gè)品種家蠶,分析確定嫩桑葉的粗蛋白質(zhì)含量顯著高于其他成熟度葉片,粗蛋白質(zhì)含量與幼蟲體重顯著正相關(guān)。這些研究結(jié)果與我們測(cè)定的物質(zhì)含量和家蠶體重變化趨勢(shì)一致。此外,我們測(cè)定出老桑葉中可溶性糖的含量顯著高于嫩桑葉,但還原性糖含量則相反,與呂順霖等[25]發(fā)現(xiàn)單糖在嫩桑葉中含量高于老桑葉結(jié)果一致??扇苄钥偺前▎翁恰㈦p糖、寡聚糖、部分多糖,除蔗糖外,水溶性單糖和雙糖都有還原性,為可溶性還原糖。單糖和雙糖更易于5齡家蠶吸收,吸收效率在92%~94%,并且單糖>雙糖[25],可為細(xì)胞生長(zhǎng)快速供能。結(jié)合本試驗(yàn)結(jié)果與相關(guān)研究報(bào)道表明,桑葉成熟度顯著影響其粗蛋白質(zhì)和低分子糖類含量,是家蠶體重增長(zhǎng)的原因之一。另外,給家蠶添飼適量的藥用植物提取物或特定黃酮、多酚物質(zhì)會(huì)提高家蠶的體重和壽命[26-29],嫩桑葉本身黃酮、多酚、1-DNJ等活性物質(zhì)的含量高也是家蠶體重增加的重要因素。因此,秋季嫩桑葉的物質(zhì)含量特征促進(jìn)壯蠶期家蠶增重。
綜合以往的飼養(yǎng)研究來(lái)看,大蠶期建議飼喂適熟桑葉(第6~7葉位葉片或生長(zhǎng)期為30~35 d的葉片),而嫩桑葉或老桑葉飼喂蠶在發(fā)育速度、抗逆性、存活率、繭量、繭重量、繭絲率、產(chǎn)卵量和良卵率等部分指標(biāo)弱于適熟桑葉的飼喂效果[10,18-19,30]。相對(duì)于攝食適熟桑葉的蠶,一般攝食嫩桑葉的蠶體重和蠶繭生產(chǎn)性能高,而健康程度和存活率低,原因?yàn)椋耗凵H~相對(duì)蛋白質(zhì)含量高而糖含量低使蠶體氨累積而中毒,嫩桑葉含水多干物質(zhì)少使得蠶攝食營(yíng)養(yǎng)不足[18,31]。相對(duì)于攝食適熟桑葉的蠶,攝食老桑葉的蠶則發(fā)育、抗逆性低,產(chǎn)卵量和良卵質(zhì)量高,蠶繭生產(chǎn)性能低,原因?yàn)椋豪仙H~含水少而粗纖維含量高導(dǎo)致蠶體消化利用率低,總糖含量高而蛋白質(zhì)含量低導(dǎo)致蠶體糖供給充足而蛋白質(zhì)供給短缺[16]。因此,桑葉的成熟度與其物質(zhì)含量差異密切相關(guān),從而影響家蠶發(fā)育、抗病、繭質(zhì)和繁殖等多方面性能。
在本研究中,食入秋季嫩桑葉的家蠶脂肪體相對(duì)于攝入老桑葉的蠶:1)細(xì)胞周期和凋亡相關(guān)蛋白死亡相關(guān)蛋白1(DAP1)[32]、硫磺內(nèi)酯(ENDOS)[33]、NEDD8[34]、含有卷曲螺旋(coiled-coil)結(jié)構(gòu)域蛋白124(CCDC124)[35]、MIF[36]下調(diào),而細(xì)胞增殖促進(jìn)蛋白ASNS[37]、富含天冬氨酸的TNF同源物(TNFSF13)[38]上調(diào),由此可見,攝入適宜營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)后蠶體通過(guò)抑制細(xì)胞凋亡、調(diào)節(jié)細(xì)胞周期和促進(jìn)細(xì)胞增殖增加細(xì)胞體積和數(shù)量導(dǎo)致體重增長(zhǎng);2)營(yíng)養(yǎng)儲(chǔ)存蛋白TRET1、低分子30K蛋白、載脂蛋白、貯存蛋白1(SP1)、芳基蛋白質(zhì)亞基β、堿性保幼激素抑制蛋白-2(BJSP-2)均上調(diào)[39-41],家蠶蛹化后不再進(jìn)食,其所需物質(zhì)能量均來(lái)源于幼蟲,營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的增加儲(chǔ)備會(huì)影響家蠶的產(chǎn)絲和產(chǎn)卵成績(jī);3)氧化應(yīng)激蛋白肌醇加氧酶(MIOX)[42]下調(diào),抗氧化應(yīng)激相關(guān)蛋白ERP57[43]、醛脫氫酶(ALDH)[44]、ATOX1[45]下調(diào),抗氧化應(yīng)激保護(hù)性蛋白HSP20.4、HSP20.8[46]、GLAZ/NLAZ[47]、ATP結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白G家族成員(ABCG)[48]上調(diào),動(dòng)物體的生命活動(dòng)都涉及到物質(zhì)和能量利用,嫩葉組家蠶氧化應(yīng)激水平低于老葉組,免疫水平也是如此,說(shuō)明機(jī)體應(yīng)激和免疫消耗降低,可以將更多物質(zhì)和能量用于生長(zhǎng)發(fā)育。綜上所述,家蠶對(duì)短期(3 d)食入的不同成熟度的桑樹葉片在脂肪體內(nèi)會(huì)做出復(fù)雜和綜合性反應(yīng),可發(fā)掘出一批與家蠶體與攝入桑葉物質(zhì)成分變化聯(lián)系的候選蛋白,可為發(fā)掘有利于家蠶生長(zhǎng)、經(jīng)濟(jì)性狀改善的物質(zhì)和分子標(biāo)記奠定基礎(chǔ)。
通過(guò)蛋白質(zhì)互作中的子網(wǎng)絡(luò)分析和網(wǎng)絡(luò)中心度分析,顯示NEDD8和4個(gè)核糖體蛋白R(shí)PS17、RPL23、RPL4、RPL24與其他蛋白的聯(lián)系度高,說(shuō)明它們處在蠶體對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)變化響應(yīng)上的核心位置。
核糖體蛋白組成核糖體,在細(xì)胞內(nèi)與RNA結(jié)合行使蛋白質(zhì)翻譯合成功能,此外,核糖體蛋白展示出多樣的核糖體外功能[49]。本研究共發(fā)現(xiàn)11個(gè)核糖體蛋白——RPS17、RPS18、RPS21、RPS28、RPS30、RPL4、RPL7Ae、RPL6、RPL23、RPL24、RPL34在嫩葉組和老葉組間存在顯著差異,除了RPS28、RPS30、RPL7Ae在嫩葉組下調(diào)外,其余在嫩葉組均上調(diào)。核糖體蛋白-MDM2-P53通路在感應(yīng)細(xì)胞應(yīng)激、整合營(yíng)養(yǎng)壓力方面起關(guān)鍵作用[50-51]。攝入營(yíng)養(yǎng)的質(zhì)量改變核糖體生物發(fā)生,引起核糖體蛋白作為營(yíng)養(yǎng)變動(dòng)的二級(jí)信使,通過(guò)與小鼠雙微粒體2(MDM2)結(jié)合使細(xì)胞發(fā)生物質(zhì)和能量代謝的適應(yīng)性變動(dòng)[52]。已發(fā)現(xiàn)14個(gè)核糖體蛋白可以綁定到MDM2酸域(central acidic domain,CAD),負(fù)向調(diào)控MDM2對(duì)P53蛋白泛素化,起到活化或穩(wěn)定P53蛋白的作用[53]。真核生物存在80種基本核糖體蛋白,不斷有新的核糖體蛋白與MDM2-P53互作被證實(shí),如RPL4[54]、RPL6[55]和RPL34[56]。P53是總新陳代謝分子網(wǎng)絡(luò)中的重要節(jié)點(diǎn)[57-58],可以在非靜態(tài)或低脅迫條件下改變細(xì)胞代謝程序[59],在本研究中,飼喂不同成熟度的桑葉也是一種溫和的、持續(xù)的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)差異刺激,PRL23、RPL4、RPL6、RPL34的蛋白量變化與組間處理的聯(lián)系,說(shuō)明它們可能通過(guò)核糖體蛋白-MDM2-P53通路發(fā)揮代謝調(diào)控作用。非單一的核糖體蛋白變動(dòng)可能是由于不同的刺激誘導(dǎo)特定核糖體蛋白與MDM2結(jié)合,核糖體蛋白需要形成多聚復(fù)合物才能有效調(diào)節(jié)MDM2,核糖體蛋白之間存在互作等原因[53]。
NEDD8是類泛素蛋白的一種,通過(guò)類泛素化調(diào)控靶定基因發(fā)揮生物學(xué)作用。在本研究中,NEDD8在攝取嫩葉組下調(diào)。NEDD8和泛素蛋白參與脂肪細(xì)胞分化和脂肪代謝[34,60]。Park等[63]發(fā)現(xiàn)分化中的3T3-L1脂肪細(xì)胞,過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體γ(peroxisome proliferator-activated receptor γ,PPARγ)(機(jī)體物質(zhì)能量代謝的重要調(diào)控因子)[61-62]的含量正向依賴于NEDD8的表達(dá)量,NEDD8類泛素化通過(guò)與泛素化競(jìng)爭(zhēng)抑制PPARγ2降解,從而調(diào)控PPARγ2靶定基因的轉(zhuǎn)錄。于潔[64]在2017年克隆到家蠶NEDD8基因,在家蠶BmN細(xì)胞中篩選和鑒定到28個(gè)NEDD8修飾底物蛋白,其中24%的蛋白富集到代謝功能,5個(gè)蛋白注釋到氨基酸代謝通路,因此,家蠶NEDD8蛋白量變化可從調(diào)節(jié)氨基酸和脂肪合成或代謝蛋白質(zhì)的功能和效應(yīng)方面調(diào)控蠶體物質(zhì)代謝。
本研究和相關(guān)文獻(xiàn)初步支持核糖體蛋白-MDM2-P53通路蛋白和類泛素蛋白NEDD8在蠶體對(duì)持續(xù)的、溫和的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)質(zhì)量差異響應(yīng)上敏感,是研究營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)變動(dòng)和動(dòng)物機(jī)體變化機(jī)制的切入點(diǎn),具體攝入營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)含量差異和特異蛋白的確定聯(lián)系、響應(yīng)機(jī)制和效應(yīng)通路有待于進(jìn)一步發(fā)掘和驗(yàn)證。
本研究通過(guò)分析秋季老、嫩2種成熟度的桑葉基本物質(zhì)含量差異和短期(3 d)采食它們的5齡家蠶脂肪體總體蛋白質(zhì)相對(duì)變化水平,揭示了家蠶體重增長(zhǎng)與桑葉內(nèi)物質(zhì)組成的聯(lián)系和作用機(jī)制,發(fā)現(xiàn):秋季嫩桑葉中粗蛋白質(zhì)、低分子糖、總黃酮、總多酚、1-DNJ含量高,促進(jìn)蠶體增重;攝食2種成熟度桑葉的家蠶脂肪體細(xì)胞共鑒定出173個(gè)差異表達(dá)蛋白,功能涉及代謝、發(fā)育、健康、抗性、生產(chǎn)和繁殖等生理作用;差異表達(dá)蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析篩選出NEDD8和核糖體蛋白是蠶體對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)變動(dòng)響應(yīng)的關(guān)鍵候選蛋白。這些發(fā)現(xiàn)為進(jìn)一步探索營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)配比對(duì)家蠶生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)節(jié)和控制的分子機(jī)制提供了數(shù)據(jù)。