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        STK40在腦膠質(zhì)瘤中的表達(dá)及其臨床意義的生信分析

        2022-06-10 11:36:08張萬宏劉關(guān)政吳恒浩張圣旭
        臨床神經(jīng)外科雜志 2022年4期
        關(guān)鍵詞:級(jí)別膠質(zhì)膠質(zhì)瘤

        馬 壯 張萬宏 劉關(guān)政 吳恒浩 張圣旭

        膠質(zhì)瘤是顱內(nèi)最常見的原發(fā)性腫瘤[1],惡性程度 高,預(yù)后差[2,3]。目前標(biāo)準(zhǔn)的治療以手術(shù)為主,輔以放療和化療(替莫唑胺),但術(shù)后復(fù)發(fā)率高[4]。目前,靶向治療是一種有潛力的治療腫瘤的方法,因此,尋找新的治療靶點(diǎn),有助于開發(fā)靶向藥物、改善病人的預(yù)后。絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(serine/threonine proteinkinase,STK)與多種惡性腫瘤有關(guān),例如慢性淋巴細(xì)胞白血病[6]、結(jié)直腸癌[7]、黑色素瘤[8]、乳腺癌[9]等。有文獻(xiàn)報(bào)道STK40高表達(dá)是低級(jí)別膠質(zhì)瘤預(yù)后的獨(dú)立影響因素[10]。本文采用生信分析方法探討STK40在膠質(zhì)瘤中的表達(dá)及意義。

        1 資料和方法

        1.1 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索 運(yùn)用GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)(整合腫瘤細(xì)胞全基因組信息的TGGA數(shù)據(jù)庫(kù)和正常組織全基因信息的GTEx 數(shù)據(jù)庫(kù)),分析STK40 在膠質(zhì)瘤組織及正常腦組織中的表達(dá)差異。檢索CGGA 數(shù)據(jù)庫(kù)(www.cgga.org.cn),收集膠質(zhì)瘤693 例,分析相關(guān)基因信息及臨床資料,其中36 例未追蹤到生存時(shí)間;追蹤到總生存時(shí)間的657 例中,男374 例,女283 例;年齡11~76 歲;WHO 分級(jí)Ⅱ級(jí)172 例,Ⅲ級(jí)284 例,Ⅳ級(jí)237例;初發(fā)404例,復(fù)發(fā)253例。

        1.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 26 軟件和GraphPad-Prism9 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析;計(jì)量資料用±s表示,采用t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn);利用多因素Cox比例回歸風(fēng)險(xiǎn)模型分析生存影響因素;采用Pearson相關(guān)系數(shù)分析相關(guān)性;應(yīng)用Kaplan-Meier 法進(jìn)行生存分析;P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 膠質(zhì)瘤STK40 表達(dá)變化 膠質(zhì)母細(xì)胞瘤STK40表達(dá)水平明顯高于正常腦組織(P<0.05,圖1)。

        圖1 STK40在GBM和正常組織中的表達(dá)(來自GEPIA)

        2.2 STK40表達(dá)與膠質(zhì)瘤病理級(jí)別的關(guān)系STK40表達(dá)水平與膠質(zhì)瘤病理級(jí)別呈正相關(guān),隨膠質(zhì)瘤病理級(jí)別增高,STK40 表達(dá)水平明顯增高(P<0.0001,圖2)。對(duì)于WHO 分級(jí)Ⅱ級(jí)、Ⅲ級(jí)膠質(zhì)瘤,復(fù)發(fā)膠質(zhì)瘤STK40 表達(dá)水平較初發(fā)膠質(zhì)瘤明顯增高(P<0.0001;圖2);而對(duì)于WHO 分級(jí)Ⅳ級(jí)膠質(zhì)瘤,復(fù)發(fā)與初發(fā)無明顯差異(P>0.05;圖2)。

        圖2 STK40表達(dá)與膠質(zhì)瘤病理級(jí)別的關(guān)系

        2.3 STK40 表達(dá)水平與膠質(zhì)瘤病理類型的關(guān)系 按2021 年WHO 中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分型,星型細(xì)胞瘤(IDH 突變型)、少突膠質(zhì)細(xì)胞瘤(IDH 突變型和1p/19q 共缺失型)和膠質(zhì)母細(xì)胞腫瘤(IDH 野生型);結(jié)果表明,星形細(xì)胞瘤和膠質(zhì)母細(xì)胞瘤STK40 表達(dá)水平明顯高于少突膠質(zhì)細(xì)胞瘤(P<0.0001,圖3)。

        圖3 STK40表達(dá)水平與膠質(zhì)瘤病理類型的關(guān)系

        2.4 腦膠質(zhì)瘤生存預(yù)后的影響因素 多因素Cox風(fēng)險(xiǎn)比例回歸模型分析結(jié)果顯示,STK40 表達(dá)水平、年齡、IDH 突變及1p/19q 聯(lián)合共缺失是腦膠質(zhì)瘤生存預(yù)后的獨(dú)立影響因素(P<0.05;表1)。

        表1 腦膠質(zhì)瘤生存預(yù)后影響因素的多因素Cox 比例回歸風(fēng)險(xiǎn)模型分析

        2.5 STK40 表達(dá)水平與腦膠質(zhì)瘤生存預(yù)后的關(guān)系Kaplan-Meier 生存曲線分析顯示,以STK40 表達(dá)水平中位數(shù)為界限,分為高表達(dá)組和低表達(dá)組,結(jié)果表明STK40低表達(dá)組中位總生存期明顯長(zhǎng)于高表達(dá)組(P<0.0001;圖4)。

        圖4 生存曲線分析STK40表達(dá)水平與膠質(zhì)瘤生存預(yù)后的關(guān)系

        2.6 STK40 表達(dá)水平與放療、化療的療效的關(guān)系 接受化療(以替莫唑胺為主)或放療的腦膠質(zhì)瘤,STK40 低表達(dá)組生存時(shí)間均明顯長(zhǎng)于高表達(dá)組(P<0.0001;圖5)。

        圖5 生存曲線分析STK40表達(dá)水平與膠質(zhì)瘤放化療敏感性的關(guān)系

        2.7 STK40 表達(dá)水平與ERK/MAPK 信號(hào)通路、JNK/MAPK的相關(guān)性Pearson相關(guān)性分析顯示,ERK下游產(chǎn) 物SRF 與STK40 呈 明 顯 正 相 關(guān)(r=0.45;P<0.0001),JNK下游產(chǎn)物ATF2與STK40表達(dá)水平呈明顯負(fù)相關(guān)(r=-0.167;P<0.0001)。

        3 討論

        STK 存在于各類真核細(xì)胞中,其序列結(jié)構(gòu)呈高度保守。研究表明STK過表達(dá)可能與腦膠質(zhì)瘤的進(jìn)展有關(guān)[11,12]。本文分析CGGA 數(shù)據(jù)庫(kù)中657 例腦膠質(zhì)瘤的臨床資料,發(fā)現(xiàn)STK40 在腦膠質(zhì)瘤中呈高表達(dá),且病理級(jí)別越高,表達(dá)水平越高;STK40 表達(dá)水平與膠質(zhì)瘤放化療敏感性有關(guān);STK40 表達(dá)水平越高,膠質(zhì)瘤病人預(yù)后越差。

        本文發(fā)現(xiàn)ERK下游產(chǎn)物SRF與STK40呈明顯正相關(guān)(r=0.45;P<0.0001),JNK 下游產(chǎn)物ATF2 與STK40 表 達(dá) 水 平 呈 明 顯 負(fù) 相 關(guān)(r=-0.167;P<0.0001)。提示STK40 的作用機(jī)制可能與ERK/MAPK、JNK/MAPK 信號(hào)通路有關(guān)。研究發(fā)現(xiàn),STK40 可提高M(jìn)APK 信號(hào)通路調(diào)控細(xì)胞增殖、分化與凋亡[13~15]。因此,STK40可能通過調(diào)控MAPK信號(hào)通路促進(jìn)膠質(zhì)瘤增殖,但具體機(jī)制仍需深入研究。

        綜上所述,本文結(jié)果顯示STK40 表達(dá)水平是影響膠質(zhì)瘤生存預(yù)后的獨(dú)立影響因素,STK40 可能是膠質(zhì)瘤靶向治療的潛在靶點(diǎn)。

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