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        運(yùn)用多重PCR技術(shù)建立一種田螺的基因檢測(cè)方法

        2022-05-16 03:09:54胡江如韓素素徐帥磊粟金嶺陳正培
        現(xiàn)代食品 2022年7期
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        ◎ 胡江如,蔣 艷,韓素素,胡 爽,徐帥磊,粟金嶺,陳正培

        (1.柳州工學(xué)院 招標(biāo)采購(gòu)中心,廣西 柳州 545616;2.柳州工學(xué)院 食品與化學(xué)工程學(xué)院,廣西 柳州 545616;3.柳州工學(xué)院 機(jī)械工程學(xué)院,廣西 柳州 545616)

        螺螄粉是廣西壯族自治區(qū)柳州市的特色小吃之一,具有辣、爽、鮮、酸和燙的獨(dú)特風(fēng)味。湯料是螺螄粉的核心,對(duì)螺螄粉的風(fēng)味及營(yíng)養(yǎng)有重要的影響,其中的田螺是螺螄粉湯料風(fēng)味獨(dú)特的必備原料,當(dāng)其在湯料中比例過(guò)小時(shí),會(huì)嚴(yán)重影響螺螄湯的色澤及風(fēng)味,讓其平淡無(wú)奇,沒(méi)有特色[1]。PCR技術(shù)在食品檢驗(yàn)中具有十分明顯的優(yōu)越性,通過(guò)高溫變性、低溫退火及中溫延伸3步循環(huán)操作實(shí)現(xiàn)目的基因的擴(kuò)增,從而對(duì)目標(biāo)物種進(jìn)行鑒定[2-4]。本研究基于PCR技術(shù)建立一種田螺的基因檢測(cè)方法,在推動(dòng)螺螄粉標(biāo)準(zhǔn)化生產(chǎn)、提高監(jiān)督效率、降低監(jiān)督成本和維護(hù)消費(fèi)者權(quán)益方面具有重要意義[5-7]。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        1.1.1 材料

        石螺、田螺、花甲和車螺,均購(gòu)于廣西柳州雒容綜合市場(chǎng)。

        1.1.2 試劑與藥品

        乙二胺四乙酸(分析純),廣東省化學(xué)試劑工程技術(shù)研究開發(fā)中心;硼酸(分析純),廣東省化學(xué)試劑工程技術(shù)研究開發(fā)中心;三(羥甲基)氨基甲烷TRIS,北京索萊科技有限公司;瓊脂糖,北京萊博潤(rùn)科生物科技有限公司;PCR酶制劑,北京博邁德生物科技有限公司;DL 107-01組織/細(xì)胞基因組DNA快速提取試劑盒(50次),北京博邁德生物科技有限公司。

        1.1.3 儀器與設(shè)備

        T100 PCR擴(kuò) 增 儀,BIO-RAD;GenoSens 1880凝膠成像分析系統(tǒng),上海勤翔科學(xué)儀器有限公司;DYY-6D型電泳儀,北京六一生物科技有限公司;Eppendorf 5425型離心機(jī),德國(guó)艾本德股份公司;移液槍,德國(guó)艾本德股份公司。

        1.2 PCR引物的選擇

        利用田螺DNA序列設(shè)計(jì)5對(duì)引物,具體如表1。

        表1 特征性引物表

        1.3 基因組DNA的提取與引物的組合

        每種動(dòng)物活體解剖去殼后,取前端軟體組織,利用液氮將其磨碎成粉,參照試劑盒說(shuō)明書提取DNA,用1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA的純度和濃度。提取出DNA后,利用單細(xì)胞PCR技術(shù)得到擴(kuò)增結(jié)果較好的引物組別,并將其排列組合后進(jìn)行多重PCR的擴(kuò)增。得到最佳組合后對(duì)其進(jìn)行田螺的特異性檢驗(yàn)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 基因組DNA的提取

        運(yùn)用柱層析法提取DNA,采用1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)出車螺、石螺、田螺和花甲。由圖1可知,4種樣品的DNA均被提取出來(lái),與預(yù)期結(jié)果相符。

        圖1 4種基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果圖

        2.2 田螺DNA的單引物擴(kuò)增結(jié)果

        用5對(duì)引物分別對(duì)田螺基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,同時(shí)進(jìn)行退火溫度的優(yōu)化,PCR產(chǎn)物采用1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。由圖2可知引物3、引物4、引物5的F及R進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),田螺出現(xiàn)相應(yīng)的擴(kuò)增產(chǎn)物,且擴(kuò)增效率較好,退火溫度以60 ℃最佳;利用引物2擴(kuò)增時(shí),擴(kuò)增效率較差;利用引物1進(jìn)行擴(kuò)增時(shí)沒(méi)有獲得擴(kuò)增產(chǎn)物。

        圖2 田螺基因組DNA的5組引物擴(kuò)增結(jié)果圖

        2.3 田螺DNA的雙重引物擴(kuò)增結(jié)果

        將擴(kuò)增效率較好的引物3、引物4和引物5進(jìn)行組合,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物采用1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。由圖3可知,組合②④即F4+R4、F4+R5,F(xiàn)3+R4、F3+R5的擴(kuò)增效果較好。

        圖3 雙重引物對(duì)田螺DNA的擴(kuò)增結(jié)果圖

        2.4 驗(yàn)證雙重引物對(duì)田螺DNA擴(kuò)增的特異性

        用優(yōu)化的雙重引物F4+R4/F4+R5分別對(duì)石螺、田螺、花甲和車螺4種樣品的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,采用1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。由圖4可知,田螺出現(xiàn)擴(kuò)增產(chǎn)物,其他樣品沒(méi)有出現(xiàn),說(shuō)明優(yōu)化的雙重引物只對(duì)田螺的DNA片段具有較好的特異性。

        圖4 雙重引物對(duì)4種軟體動(dòng)物DNA的擴(kuò)增結(jié)果圖

        3 結(jié)論與討論

        PCR技術(shù)作為一種體外酶促合成、擴(kuò)增特定DNA片段的方法,因其具有特異性強(qiáng)、靈敏度高、檢測(cè)速度快和準(zhǔn)確性好等優(yōu)點(diǎn),已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于水產(chǎn)、微生物檢測(cè)、臨床微生物和食品中各種動(dòng)物源性成分的檢測(cè)等,而多重PCR是可以同時(shí)針對(duì)幾個(gè)目標(biāo)片段進(jìn)行檢測(cè)的PCR技術(shù)。國(guó)內(nèi)外研究者利用多重PCR技術(shù)進(jìn)行了很多研究,但研究多集中在螺螄以外的畜肉及禽肉,螺螄和畜肉的組合研究及螺螄和禽肉的組合研究很少有報(bào)道[8-11]。本文通過(guò)運(yùn)用多重PCR技術(shù)建立了一種高效的田螺目的基因檢測(cè)方法,為螺螄粉湯料真?zhèn)舞b定提供了技術(shù)支持。

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