孫嘉宏,譚曉冬,楊欣婷,趙桂蘋,文 杰,劉冉冉
(中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所,動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,農(nóng)業(yè)農(nóng)村部動(dòng)物遺傳育種與繁殖(家禽)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100193)
脂肪是動(dòng)物重要的儲(chǔ)能與供能組織,當(dāng)動(dòng)物能量過(guò)剩時(shí),脂肪以中性脂質(zhì)的形式儲(chǔ)存在體內(nèi);當(dāng)能量缺乏時(shí),脂肪則通過(guò)脂解的方式為機(jī)體提供能量。畜禽許多重要經(jīng)濟(jì)性狀與脂代謝密切相關(guān),如背膘厚、肌內(nèi)脂肪含量和腹脂率等。以肉雞生產(chǎn)為例,肌內(nèi)脂肪含量提高有利于肉品質(zhì)提高,而腹部脂肪過(guò)度沉積會(huì)影響胴體品質(zhì)和經(jīng)濟(jì)效益,并造成環(huán)境污染。因此,研究機(jī)體脂代謝的精準(zhǔn)調(diào)控機(jī)制將為體脂性狀的遺傳技術(shù)研發(fā)奠定必要基礎(chǔ)。
長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long noncoding RNAs,lncRNA)是一類長(zhǎng)度大于200nt、不編碼蛋白質(zhì)的RNA,廣泛存在于動(dòng)植物中。在很長(zhǎng)一段時(shí)間內(nèi),lncRNA 被看作是“轉(zhuǎn)錄噪聲”,不被人們重視。但近些年研究已充分證明,lncRNA 在生物體代謝調(diào)控過(guò)程中發(fā)揮著重要作用,如lncRNA 在肌細(xì)胞分化和細(xì)胞周期過(guò)程中具有調(diào)控作用,并直接參與卵子成熟、精子形成、胎盤形成、妊娠、性腺激素應(yīng)答、胚胎發(fā)育等過(guò)程。lncRNA 在脂肪代謝中同樣起重要調(diào)控作用,lncRNA 與棕色脂肪生成、白色脂肪生成、血漿高密度脂蛋白濃度、血漿甘油三酯濃度有關(guān)。lncRNA 在小鼠和人上的相關(guān)研究較為豐富,在肝臟中,LNCLSR 直接與TDP-43 結(jié)合并抑制的表達(dá)以下調(diào)甘油三酯水平,APOA1-AS 在體內(nèi)外均對(duì)的表達(dá)有負(fù)調(diào)控作用,以抑制高密度脂蛋白形成,在脂肪發(fā)育過(guò)程中,SRA 通過(guò)調(diào)節(jié)PPAR和P38/JNK 磷酸化促進(jìn)體外脂肪生成,促進(jìn)前脂肪細(xì)胞分化,ADINR 通過(guò)轉(zhuǎn)錄激活C/EBPa 促進(jìn)脂肪生成,Blnc1 結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子EBF2 促進(jìn)棕色和米色脂肪細(xì)胞分化。在畜禽脂代謝研究中,lncRNA 調(diào)控機(jī)制解析也成為研究熱點(diǎn)之一。因此,本文就lncRNA 及其在畜禽脂代謝上的相關(guān)研究進(jìn)展做一綜述,為相關(guān)工作提供科學(xué)依據(jù)。
lncRNA 的種類繁多,功能復(fù)雜,在不同的物種間保守性較低,有組織和發(fā)育階段特異性,在不同的亞細(xì)胞區(qū)域發(fā)揮作用。由于lncRNA 結(jié)構(gòu)和功能的多樣性,為利于開(kāi)展研究,通常根據(jù)lncRNA 與功能基因的相對(duì)位置對(duì)其進(jìn)行分類。根據(jù)其與鄰近蛋白質(zhì)編碼基因的相對(duì)位置可將lncRNA 分為六類,包括:①基因內(nèi)lncRNA:來(lái)源于內(nèi)含子的二次轉(zhuǎn)錄;②基因間lncRNA:位于2 個(gè)基因的間隔區(qū)域內(nèi),構(gòu)成最大的非編碼RNA 家族;③正義lncRNA:由蛋白質(zhì)基因編碼的正義鏈轉(zhuǎn)錄;④反義lncRNA:由蛋白質(zhì)基因編碼的反義鏈轉(zhuǎn)錄,大約70%的lncRNA 是自然反義轉(zhuǎn)錄本(Natural Antisense Transcripts,NAT);⑤雙向lncRNA:由蛋白質(zhì)編碼基因的反向互補(bǔ)鏈轉(zhuǎn)錄,其功能與蛋白質(zhì)編碼基因相似;⑥增強(qiáng)子lncRNA:通過(guò)向特定的基因啟動(dòng)子募集染色質(zhì)重塑復(fù)合物來(lái)增強(qiáng)基因活性。
已知的lncRNA 實(shí)現(xiàn)生物學(xué)功能的分子機(jī)制包括(圖1):①lncRNA 作為信號(hào)分子,對(duì)來(lái)自細(xì)胞內(nèi)或細(xì)胞外的各種刺激做出回應(yīng),作為特定時(shí)間、地點(diǎn)、生理狀態(tài)、基因調(diào)控的標(biāo)志物;②lncRNA 作為誘餌分子,誘導(dǎo)某些蛋白質(zhì)、RNA 或MicroRNA(miRNA)分子離開(kāi)特定的區(qū)域;③lncRNA 作為引導(dǎo)分子,通過(guò)與目標(biāo)分子結(jié)合,指引核糖核蛋白復(fù)合體定位至目標(biāo)區(qū)域,進(jìn)而影響鄰近基因或遠(yuǎn)距離基因的表達(dá);④lncRNA 作為支架分子,為多個(gè)不同類型大分子組件的裝配提供一個(gè)中心平臺(tái),在生物信號(hào)傳導(dǎo)過(guò)程中發(fā)揮調(diào)控作用。
圖1 lncRNA 實(shí)現(xiàn)生物學(xué)功能的分子機(jī)制[22]
lncRNA 能夠在染色質(zhì)、轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后等水平影響基因表達(dá),從而發(fā)揮生物學(xué)功能(圖2):①染色質(zhì)水平:通過(guò)介導(dǎo)染色質(zhì)重構(gòu)以及組蛋白修飾來(lái)調(diào)控下游基因的表達(dá),lncRNA HOTAIR等可以將核心蛋白復(fù)合體招募到特定位點(diǎn),在那里將組蛋白H3 的賴氨酸27 殘基3(me3K27)甲基化以誘導(dǎo)異染色質(zhì)的形成和抑制基因表達(dá)(圖2-a);②轉(zhuǎn)錄水平:與上游啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合,干擾下游基因的表達(dá)。lncRNA 募集RNA 結(jié)合蛋白TLS(translocatedinliposarcoma)來(lái)調(diào)節(jié)CREB 結(jié)合蛋白(CBP)和p300 的組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶活性,以抑制基因轉(zhuǎn)錄(圖2-b);一種超保守的增強(qiáng)子被轉(zhuǎn)錄為一個(gè)lncRNA,Evf2 作為轉(zhuǎn)錄因子DLΧ2 的共同激活因子可調(diào)節(jié)Dlx6 基因的轉(zhuǎn)錄(圖2-c);lncRNA可以在主要啟動(dòng)子處形成一個(gè)三聯(lián)體以阻斷一般轉(zhuǎn)錄因子TFIID 的結(jié)合,從而使基因表達(dá)沉默[26](圖2-d);③轉(zhuǎn)錄后修飾:反義lncRNA 通過(guò)與mRNA 形成互補(bǔ)雙鏈,干擾mRNA 的剪切或者生成內(nèi)源性Small interfering RNA(siRNA)來(lái)調(diào)控基因的表達(dá)(圖2-e)。
圖2 lncRNA 的功能[29]
2.1 lncRNA 在肝脂代謝過(guò)程中的作用 肝臟在脂肪的消化、吸收、分解、合成及運(yùn)輸?shù)却x過(guò)程中發(fā)揮重要作用,是機(jī)體脂代謝的樞紐。肝臟從血液中攝取游離脂肪酸,合成甘油三酯,隨后以極低密度脂蛋白的形式將甘油三酯轉(zhuǎn)運(yùn)出肝。正常情況下,肝臟僅儲(chǔ)存少量脂肪酸,當(dāng)機(jī)體營(yíng)養(yǎng)過(guò)剩時(shí),肝脂代謝加劇會(huì)引起代謝性綜合征。大量研究表明,畜禽肝脂代謝受表觀遺傳調(diào)控,包括lncRNA 作用。
對(duì)家禽而言,由于脂肪細(xì)胞不能或僅能合成微量脂類,肝臟成為其內(nèi)源性脂類合成的主要部位。Tan 等利用實(shí)驗(yàn)室前期建立的持續(xù)5 個(gè)世代的雞脂肪肝父系遺傳模型為素材,通過(guò)對(duì)肝臟進(jìn)行DNA 甲基化和lncRNA 測(cè)序研究脂肪肝發(fā)生后肝臟表觀修飾的變化,發(fā)現(xiàn)易感系公雞83 個(gè)脂肪和葡萄糖相關(guān)基因中有72%上調(diào);通過(guò)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析鑒定到與脂代謝相關(guān)的重要新lncRNA(LNC_006756、LNC_012355 等);此外,脂肪肝發(fā)生后肝臟甲基化水平顯著降低,并發(fā)現(xiàn)23 個(gè)甲基化與lncRNA 的共同靶點(diǎn)基因(等)。Li 等通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序比較20 周齡和30 周齡預(yù)產(chǎn)蛋雞和產(chǎn)蛋高峰雞的肝臟中l(wèi)ncRNA 表達(dá)差異,鑒定了一系列與雞肝脂代謝相關(guān)的lncRNA,分析了產(chǎn)前和產(chǎn)蛋母雞之間在肝臟中存在顯著差異表達(dá)的lncRNA 即lncLTR 的表達(dá)調(diào)控方式,lncLTR 受雌激素通過(guò)ERbeta 信號(hào)調(diào)節(jié),并與雞胴體性狀和血液甘油三酯含量有關(guān)?;蚪M功能注釋是彌合基因型和表型之間差距的關(guān)鍵,Muret 等通過(guò)RNA-Seq 對(duì)雞肝臟和脂肪組織中l(wèi)ncRNA 轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析,在雞肝臟和脂肪組織中提供了一個(gè)完整的lncRNA 庫(kù),該庫(kù)顯示了mRNA 和lncRNA 之間共表達(dá)的有趣模式,很多在其他物種上驗(yàn)證的lncRNA 在雞上不具有參考意義,在肝臟和脂肪沉積中,相較于mRNA,lncRNA 表達(dá)量更低、組織特異性更強(qiáng),他們還強(qiáng)調(diào)了參與脂質(zhì)代謝的新型lncRNA 候選物lnc_DHCR24,它與編碼膽固醇生物合成關(guān)鍵酶的基因表達(dá)量高度相關(guān)。Ning 等在構(gòu)建了4 個(gè)發(fā)育階段(60、133、220、400 日齡)肝臟組織的12 個(gè)RNA 文庫(kù),鑒定的lncRNA 中一半以上是lincRNA(long intergenic ncRNAs),功能富集與脂質(zhì)代謝有關(guān),通過(guò)結(jié)合加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)構(gòu)建DE-lncRNA(Differentially expressed lncRNA)和DEG(Differentially expressed gene)之間的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),功能富集結(jié)果也與脂質(zhì)代謝有關(guān),表明DE-lncRNA 具有調(diào)節(jié)肝臟脂質(zhì)代謝的生物學(xué)功能。
Liang 等使用HiSeq 平臺(tái)對(duì)3 只荷斯坦奶 牛在干乳期、泌乳早期和泌乳高峰期的9 份肝臟樣品的cDNA 和sRNA 文庫(kù)進(jìn)行了測(cè)序,構(gòu)建了一個(gè)大型的可能影響牛乳脂合成的內(nèi)源競(jìng)爭(zhēng)RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)調(diào)控網(wǎng)絡(luò),找到12 個(gè)可能會(huì)通過(guò)胰島素、PI3K-Akt、MAPK、AMPK、mTOR和PPAR 信號(hào)傳導(dǎo)途徑影響肝臟脂質(zhì)代謝的候選基因。
綜上,由于物種間差異,已驗(yàn)證的lncRNA 對(duì)其他物種參考意義有限,研究者們?nèi)灾铝τ跇?gòu)建肝臟組織lncRNA 和mRNA 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)以及篩選出有參考價(jià)值的lncRNA。
2.2 lncRNA 在脂肪沉積中的作用 動(dòng)物體內(nèi)脂肪沉積程度取決于血漿中甘油三酯水平,脂肪沉積與畜禽繁殖、生長(zhǎng)、產(chǎn)肉性狀有關(guān),且脂肪對(duì)肉品質(zhì)及其加工特性有重要影響。機(jī)體內(nèi)脂肪沉積主要取決于合成代謝和分解代謝之間的動(dòng)態(tài)平衡,lncRNA 對(duì)畜禽脂肪沉積有著重要作用。
Chen 等使用來(lái)自白色杜洛克和二花臉雜交的兩個(gè)F全同胞雌性個(gè)體240 日齡的肝臟、腹脂和背最長(zhǎng)肌的數(shù)據(jù)以鑒定581 個(gè)與豬肌肉生長(zhǎng)和脂肪沉積相關(guān)的lincRNAs,從預(yù)測(cè)的lincRNAs 中篩選了一些靶基因,與肌肉生長(zhǎng)有關(guān),和與脂肪沉積有關(guān),和與肌肉生長(zhǎng)和脂肪沉積均有關(guān)。這些lincRNAs 可能通過(guò)靶基因的穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)參與豬肌肉生長(zhǎng)或脂肪沉積有關(guān)的生物學(xué)過(guò)程。lncRNA 雖然有組織特異性,但仍可能同時(shí)參與不同的生物學(xué)過(guò)程。脂肪沉積研究中可以將lncRNA 和性激素研究結(jié)合,Wang 等對(duì)閹割和未閹割的全同胞淮南公豬皮下脂肪組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,共鑒定出343 個(gè)lncRNAs,其中18 個(gè)lncRNAs 在2 個(gè)組中差異表達(dá),功能分析表明這18 種lncRNAs 及其靶基因參與脂肪酸、胰島素和脂肪細(xì)胞因子信號(hào)通路,去勢(shì)豬的脂肪酸合成和代謝更為活躍。Li 等在雞上也發(fā)現(xiàn)lncLTR受雌激素調(diào)節(jié)。Zhang 等對(duì)嘉興黑豬和長(zhǎng)白豬皮下脂肪的lncRNAs 和mRNAs 表達(dá)譜進(jìn)行比較,鑒定到221 個(gè)lncRNAs 和958 個(gè)mRNAs,對(duì)DEG 進(jìn)行功能分析,其主要參與免疫應(yīng)答、PI3K-Akt 信號(hào)通路和MARK 信號(hào)通路等與脂肪形成和脂質(zhì)代謝相關(guān)通路,其中LTCONS_00055593 可能通過(guò)調(diào)節(jié)其靶基因在脂肪代謝和沉積中起關(guān)鍵作用。
羊的“脂尾”可以在遷徙期間和牧場(chǎng)處于休眠狀態(tài)或干物質(zhì)較少的季節(jié)為機(jī)體提供能量。綿羊的尾脂是人類用作膳食脂肪的重要來(lái)源。為鑒定與尾脂沉積和發(fā)育相關(guān)的lncRNA 和mRNA,Ma 等對(duì)蘭州肥尾羊、小尾寒羊和藏羊的尾脂進(jìn)行高通量測(cè)序,對(duì)篩選的mRNA-lncRNA 對(duì)構(gòu)建共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)4個(gè)lncRNA(TCONS_00372767、TCONS_00171926、TCONS_00054953 和TCONS_00373007)與超過(guò)50 個(gè)mRNA 相互作用,對(duì)其靶基因進(jìn)行功能富集可發(fā)現(xiàn)這些基因廣泛參與脂肪酸代謝和脂肪酸延伸相關(guān)途徑,均有助于脂肪沉積,可能作為核心lncRNA 在尾部脂肪沉積過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用,并且mRNA 和lncRNA 可能主要通過(guò)正調(diào)控發(fā)揮作用;組學(xué)分析說(shuō)明mRNA 和lncRNA 在脂代謝中可能通過(guò)同向表達(dá)發(fā)揮作用。
肉雞的生長(zhǎng)速度通過(guò)遺傳選擇可實(shí)現(xiàn)持續(xù)性提高,但對(duì)快速生長(zhǎng)的選擇會(huì)伴隨腹脂過(guò)量,會(huì)影響飼料轉(zhuǎn)化率,降低腹脂沉積已成為肉雞育種目標(biāo)之一。Zhang 等以14 日齡京海黃雞腹部脂肪組織的前脂肪細(xì)胞為樣本,通過(guò)對(duì)不同分化階段的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序,鑒定出1 336個(gè)lncRNA 和1 759 個(gè)mRNA 差異表達(dá),且在分化過(guò)程中各個(gè)階段差異表達(dá)基因數(shù)下降,這些基因涉及與前脂肪細(xì)胞分化相關(guān)途徑,包括丙酸脂代謝、脂肪酸代謝、氧化磷酸化途徑等。杜志強(qiáng)等指出lncRNA 基因可抑制活化T 細(xì)胞核因子(),且和在東北農(nóng)業(yè)大學(xué)肉雞腹脂雙向選擇系和愛(ài)拔益加肉雞群體腹部脂肪組織中的表達(dá)水平隨周齡增加而顯著升高,提示基因可能影響肉雞肌肉和脂肪組織生長(zhǎng)發(fā)育。李富原等研究發(fā)現(xiàn)隨填飼時(shí)間的增加,lncRNA LOC106047490 在朗德鵝肝臟、腹脂和胸肌中的表達(dá)量明顯下降,該基因受高葡萄糖、胰島素和不飽和脂肪酸的誘導(dǎo)且該基因在成年鵝腹脂中的表達(dá)量最高,提示LOC106047490 與脂肪代謝有關(guān)。
在牛上的相關(guān)研究主要關(guān)注脂肪組織的發(fā)育及分化。劉宇利用高通量測(cè)序等技術(shù)在秦川牛成年母牛皮下脂肪組織、內(nèi)臟脂肪組織和6 月齡犢牛皮下脂肪組織中分別獲得了大量差異表達(dá)的lncRNA,并對(duì)犢牛皮下脂肪組織特異性表達(dá)的lncRNA TCONS_00596625進(jìn)行了生物信息學(xué)分析及雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)其存在bta-miR-125b 結(jié)合位點(diǎn)。有研究發(fā)現(xiàn)btamiR-125b 參與牛肉嫩度調(diào)節(jié),并且在健康奶牛和患乳房炎奶牛的乳腺組織中差異表達(dá),提示該lncRNA TCONS_00596625 可能通過(guò)與bta-miR-125b 的結(jié)合參與到上述生物學(xué)過(guò)程中。Li 等通過(guò)Ribo-Zero RNAseq 研究體外培養(yǎng)的牛前脂肪細(xì)胞和分化的脂肪細(xì)胞中PolyA+lncRNA 和PolyA-lncRNA,共確定了2 882 個(gè)lncRNA,其中l(wèi)ncRNA ADNCR 作為miR-204 的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(ceRNA),增強(qiáng)miR-204 靶基因的表達(dá),通過(guò)與NCoR 和SMART 作用來(lái)抑制PPAR的活動(dòng),從而抑制脂肪細(xì)胞分化和脂肪合成基因表達(dá)。肖航等對(duì)肉牛肌肉和脂肪組織lncRNA 組學(xué)測(cè)序分析發(fā)現(xiàn)的lncRNA TCONS-585 進(jìn)行熒光定量PCR 驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)其在脂肪組織中表達(dá)水平顯著高于其他組織,干擾lncRNA TCONS-585 能下調(diào)具有抑食作用、參與脂肪分化的基因的表達(dá),從而可能影響牛脂肪組織的分化。
2.3 lncRNA 在肌內(nèi)脂肪沉積中的作用 肌內(nèi)脂肪(Intramuscular Fat,IMF)分布在肌外膜、肌束膜、肌內(nèi)膜,主要由甘油三酯、磷脂和游離脂肪酸組成。IMF 含量增加可提高肉的風(fēng)味、嫩度和多汁性。IMF 沉積使肌肉組織的交織結(jié)構(gòu)松散,增加肌肉嫩度;其中的磷脂可以通過(guò)美拉德反應(yīng)產(chǎn)生香味;食物中的IMF 還可以通過(guò)刺激人類唾液分泌來(lái)增加咀嚼時(shí)的適口性。IMF 是畜禽肉品質(zhì)選育的重要指標(biāo)之一。
不同的脂肪組織具有不同的生化特性和肌內(nèi)表達(dá)模式,為研究lncRNA 在雞IMF 和腹脂形成中的功能,Zhang 等采用Ribo-Zero RNA-Seq 技術(shù)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,鑒定到1 624 個(gè)差異lncRNAs,其中l(wèi)ncAD 與PPAR 信號(hào)通路的多個(gè)基因共表達(dá),且其下調(diào)會(huì)以順式調(diào)控的方式抑制的表達(dá),從而減少肌內(nèi)前脂肪細(xì)胞的成脂分化,并促進(jìn)細(xì)胞增殖。Χing 等以高IMF 肉雞品系的胸肌和腹脂轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),通過(guò)WGCNA(Weighted Correlation Network Analysis)分析對(duì)發(fā)育過(guò)程中影響胸肌、腹脂沉積的功能基因模塊及其樞紐基因進(jìn)行鑒定,并且篩選到了可能與胸肌IMF 沉積相關(guān)的核心lncRNA ENSGALG00000041996、ENSGALG00 000053368、LOC107050564、ENSGALG00000048510等,其中可能與胸肌早期發(fā)育階段IMF 沉積相關(guān)的lncRNA ENSGALG00000041996,它可能通過(guò)調(diào)控與脂肪酸轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)的和與催化線粒體脂肪酸氧化有關(guān)的發(fā)揮作用。
Abu-Elheiga 等研究發(fā)現(xiàn)基因敲除小鼠可以防止肥胖和高脂肪誘發(fā)的糖尿病,Zou 等推測(cè)可以促進(jìn)脂質(zhì)合成或沉積,并且發(fā)現(xiàn)皖南花豬中l(wèi)incRNA TCONS_00061360 的高表達(dá)可以正向調(diào)節(jié)脂肪酸氧化途徑的必需調(diào)節(jié)劑——的表達(dá),從而促進(jìn)脂質(zhì)合成或沉積,在背最長(zhǎng)肌中形成更高的IMF 含量。Huang 等對(duì)脂肪沉積差異顯著的萊蕪豬和大白豬之間IMF 基因表達(dá)譜進(jìn)行比較分析,共鑒定出54 個(gè)lncRNAs 和482 個(gè)mRNAs,研究表明ΧLOC_046142、ΧLOC_004398 和ΧLOC_015408 可能分別靶向和,并在豬IMF 形成和脂質(zhì)蓄積中起關(guān)鍵的調(diào)節(jié)作用。ΧLOC_064 871 和ΧLOC_011001 可能通過(guò)調(diào)節(jié)和在脂質(zhì)代謝相關(guān)疾病中起作用。Sun 等對(duì)脂肪型和瘦肉型豬種各3 頭仔豬的肌內(nèi)前脂肪細(xì)胞分化過(guò)程分4 個(gè)階段進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組分析,鑒定出1 932 個(gè)差異lncRNAs,其中l(wèi)nc_000414 與脂肪合成密切相關(guān),該lncRNA 可作為豬IMF 細(xì)胞增殖的抑制劑。
在牛上,Wang 等構(gòu)建了0.5 歲和2.5 歲2 個(gè)發(fā)育階段背最長(zhǎng)肌以及其肌內(nèi)脂肪的整個(gè)轉(zhuǎn)錄組圖譜差異表達(dá)概況,并且根據(jù)2 個(gè)組織中共表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本構(gòu)建了ceRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò),推測(cè)3 個(gè)ceRNA 子網(wǎng)(miR-381-y-TCONS-00016416-SIRT1、miR-122-x-TCONS-000617 98-PRKCA、miR-499-y-TCONS-00084092-LPL)可能在IMF 沉積調(diào)節(jié)中起關(guān)鍵作用。
目前,lncRNA 在畜禽脂肪代謝方面的研究仍處于起步階段,已有研究集中在挖掘新lncRNA 以及l(fā)ncRNA 與miRNA 的相互作用機(jī)制。雖然已有研究解析了部分lncRNA 在脂代謝過(guò)程中的調(diào)控機(jī)制,但是由于lncRNA 具有保守性低、作用方式多樣的特點(diǎn),且畜禽個(gè)體間差異大,其功能解析成為研究難點(diǎn)。將挖掘到的lncRNA 進(jìn)行功能解析和調(diào)控機(jī)制的研究,最終實(shí)現(xiàn)通過(guò)靶向調(diào)節(jié)lncRNA 對(duì)畜禽脂代謝進(jìn)行定向調(diào)控,將是相關(guān)研究領(lǐng)域的重要方向之一。