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        基于隨機(jī)森林模型的動態(tài)動脈血管硬化指數(shù)估計方法*

        2022-04-21 07:50:28張???/span>程云章張?zhí)煲?/span>
        生物醫(yī)學(xué)工程研究 2022年1期
        關(guān)鍵詞:子集收縮壓彈性

        張??担淘普?,張?zhí)煲?/p>

        (上海理工大學(xué) 上海介入醫(yī)療器械工程技術(shù)研究中心,上海 200093)

        引言

        根據(jù)世界衛(wèi)生組織發(fā)布的《2020世界衛(wèi)生統(tǒng)計報告》,僅在2016年,全球因非傳染性疾病(noncommunicable diseases,NCDs)導(dǎo)致的死亡就達(dá)到了4 100萬,約占當(dāng)年全球總死亡人數(shù)的71%。心血管疾病(cardiovascular diseases,CVDs),作為NCDs中主要疾病之一,每年造成的死亡數(shù)量約為1 700萬[1]。動脈粥樣硬化心血管疾病(atherosclerotic cardiovascular disease)和動脈纖維性硬化性心血管疾病(arterioscleroticcardiovasculardisease)是心血管疾病中造成諸多臟器障礙甚至病變的重要原因之一。在動脈粥樣硬化早期,其臨床癥狀不明顯。若能在早期及時發(fā)現(xiàn)并對患者進(jìn)行有效地治療,可顯著減緩病情惡化的程度[1-2]。

        傳統(tǒng)的大動脈彈性功能檢測的方法包括:動脈脈搏波傳導(dǎo)速度 (pulse wave velocity, PWV)和超聲檢測內(nèi)膜-中層厚度 (intima-media thickness, IMT)。動脈的脈搏波傳導(dǎo)速度能間接反映大動脈的擴(kuò)張性。高分辨率超聲既可以通過觀察動脈某一橫斷面壓力和動脈內(nèi)徑的變化關(guān)系反映動脈彈性的改變,又可以檢測頸動脈內(nèi)膜-中層的厚度,是早期診斷動脈粥樣硬化的重要依據(jù)。但是,以上兩種檢測手段都需要昂貴的檢測設(shè)備及專業(yè)的操作人員,在大規(guī)模的臨床實踐和流行病學(xué)研究中難以廣泛推廣。因此,研究更為簡單有效的檢測手段具有現(xiàn)實意義[4]。

        2006年,李燕等[3-4]首次提出了AASI這個能反映動脈血管彈性的指數(shù),并與傳統(tǒng)的反映動脈血管彈性的指標(biāo)進(jìn)行了相關(guān)性分析,包括了脈搏波傳導(dǎo)速度、中心增強(qiáng)指數(shù)、外圍增強(qiáng)指數(shù)。之后,開展了一些關(guān)于AASI的研究。Palmas等[5]比較了AASI和24 h脈壓尿液白蛋白排泄的相關(guān)性。Daolan等[6]比較AASI以及脈壓對心臟性死亡以及中風(fēng)的預(yù)測表現(xiàn)。結(jié)果顯示,AASI作為對中風(fēng)的預(yù)測因子優(yōu)于脈壓差,在心臟性死亡的預(yù)測上,脈壓要優(yōu)于AASI,而在正常血壓區(qū)間內(nèi),兩者都無法作為獨(dú)立的心臟性死亡或者中風(fēng)的預(yù)測因子。Eniksen等[7]發(fā)現(xiàn)AASI對于中年人群的腎小球濾過率 (glomerular filtration rate, GFR)下降是一個重要的獨(dú)立因素。Obata等[8]研究了腦血流自動調(diào)節(jié)下限(lower limit of cerebral autoregulation,LLA)與AASI之間的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)LLA與AASI關(guān)系顯著,AASI可以作為術(shù)中預(yù)測LLA閾值的重要工具。

        盡管學(xué)者們對AASI做了大量的研究,但大部分的研究都停留在臨床數(shù)據(jù)統(tǒng)計與對AASI表征生理信息的驗證上。AASI作為一個獲取難度相對較低的能反映心血管健康狀況的生理指標(biāo),對于AASI的實際應(yīng)用成果卻不多。因此,本研究基于動態(tài)動脈硬化指數(shù) (ambulatory arterial stiffness index, AASI),提出了一種新的測量患者動脈硬化程度的方法。作為一種動脈硬化的早篩方法,該方法能有效地降低測量成本,并對后續(xù)的臨床診斷和檢測具有一定的參考意義。與傳統(tǒng)的血管彈性探測方法相比,基于機(jī)器學(xué)習(xí)得到的AASI估計值無需超聲診斷裝置或者侵入式探測,降低了重要生理信息獲取的難度,對心血管疾病的早篩有重要意義。

        1 材料與方法

        基于機(jī)器學(xué)習(xí)的動態(tài)動脈血管彈性指數(shù)的估計流程圖,見圖1。

        圖1 AASI估計系統(tǒng)流程圖

        1.1 動態(tài)動脈硬化指數(shù)(AASI)

        早在20世紀(jì)初,一些研究已經(jīng)注意到收縮壓和舒張壓的變化可以反映動脈血管的彈性功能。當(dāng)一個人的動脈血管健康有彈性時,收縮壓升高,舒張壓也相應(yīng)地升高;當(dāng)血管彈性降低后,收縮壓增高,而舒張壓增高不明顯、甚至降低。這說明收縮壓和舒張壓兩者之間的動態(tài)變化關(guān)系在一定程度上反映動脈的彈性功能。收縮壓和舒張壓的對應(yīng)數(shù)值,可以分析舒張壓和收縮壓這之間的回歸關(guān)系。李燕等把一段時間內(nèi)采集得到的收縮壓與舒張壓做回歸分析,其中收縮壓作為自變量,舒張壓作為因變量。AASI的計算方式為1減去回歸斜率b。動脈彈性好,則AASI趨近于0;動脈彈性僵硬,則AASI趨近于1[3-4]。AASI的數(shù)學(xué)表達(dá)式見式⑴、式⑵:

        DBP=a+b×SBP

        (1)

        AASI=1-b

        (2)

        其中,DBP代表一個心動周期的舒張壓,SBP代表一個心動周期的收縮壓。a、b是回歸方程的回歸系數(shù)。

        1.2 數(shù)據(jù)源

        本研究所用公共數(shù)據(jù)庫來自于UCI機(jī)器學(xué)習(xí)資料檔案庫(UCI Machine Learning Repository)中的無袖帶式血壓估計數(shù)據(jù)集。該數(shù)據(jù)集實質(zhì)上是經(jīng)過去噪處理后的MIMICII(multi-parameter intelligent monitoring intensive careII)數(shù)據(jù)集[9-10]。數(shù)據(jù)集包含125 Hz的從指尖獲取的光電容積脈搏波(PPG)信號、125 Hz的有創(chuàng)動脈血壓(ABP)信號、125 Hz的心電信號(ECG)。其中,由于MIMICII數(shù)據(jù)庫自身帶有相當(dāng)可觀的危重患者的數(shù)據(jù),血壓處于極高值或極低值的病例被移除(SBP≥180 mmHg,DBP≥130 mmHg)∩(SBP≤80 mmHg,DBP≤60 mmHg)。此研究所使用的數(shù)據(jù)集基本信息見表1。在本研究中,80%的樣本(共計2 036例患者數(shù)據(jù))被用于模型的訓(xùn)練;20%的樣本(共計510例患者)被用于模型的測試。

        表1 所用數(shù)據(jù)集的基礎(chǔ)信息

        1.3 特征提取

        特征提取是機(jī)器學(xué)習(xí)中最重要的部分之一。根據(jù)Sharifi等所做的研究[11-15],本研究一共選用了13個特征。由于源信號PPG和ECG是時域信號而AASI則相對是一個常值,因此,本研究中所有的時域信號皆以在整個時軸上的均值呈現(xiàn),以此使輸入信號與被估計值得以匹配。整個特征提取過程在Matlab R2020a平臺上實現(xiàn)。表2是所用全部特征名,圖2—圖4是對信號的提取特征過程。

        注:A和B作為周期內(nèi)的最大值和最小值,被定義為是一個心動周期內(nèi)的收縮壓以及舒張壓。

        表2 特征名及其定義

        注:C和E是一個心動周期內(nèi)的PPG最大值和PPG最小值; D是PPG信號這個周期的均值;F和G是FDPPG和SDPPG的均值。圖3 PPG信號及其衍生的FDPPG和SDPPGFig.3 PPG, FDPPG and SDPPG

        1.4 隨機(jī)森林回歸

        隨機(jī)森林(random forest ,RF)回歸是由決策樹學(xué)習(xí)衍生而來的。即使特征與目標(biāo)呈非線性關(guān)系,RF也能有效地估計輸出。RF算法采用bootstrap分類器來估計響應(yīng)變量。它將每一組決策樹模型都與數(shù)據(jù)集進(jìn)行匹配。每棵樹都使用訓(xùn)練數(shù)據(jù)不同的bootstrap樣本訓(xùn)練,以此作為自己的回歸函數(shù),由回歸給出的最終輸出與各個決策樹輸出的平均值對應(yīng),即為RF糾正決策樹算法常見的過擬合現(xiàn)象的過程。而未進(jìn)入bootstrap分類器的樣本被稱為out-of-bag (OOB)樣本,它們被用來測試決策樹的準(zhǔn)確性和評估整體模型的性能[16-20]。

        注:H和I是ECG信號的最大值以及最小值。M和N是

        整個回歸過程在Matlab平臺上使用Treebagger函數(shù)完成。其形式見式(3):

        B=Treebagger(NumTrees,X,y)

        (3)

        其中,AASI作為響應(yīng)y,不同形式的特征組合作為輸入X,樹的數(shù)量(NumTrees)設(shè)置為100。

        1.5 遺傳算法

        表2中的13個特征的組合將被作為RF模型的輸入。但若使用遍歷思路解決該特征篩選問題,將會有213-1輪RF模型計算。考慮到整個數(shù)據(jù)集大小,該思路是不可取的。因此,引入遺傳算法(geneticalgorithm,GA)進(jìn)行特征篩選,以此找到最優(yōu)特征子集組合[21-25]。

        在本研究中,RF模型的平均絕對誤差(MAE)作為GA的適應(yīng)度函數(shù)。同時,所有的13個特征均以“0”、“1”的形式表明其被選擇與否(“0”代表該特征不被選擇?!?”代表該特征被選擇),它們共同組成13位二進(jìn)制數(shù)字作為其特征子集組合編碼,以此量化特征篩選問題,見圖5。

        圖5 特征子集編碼過程

        2 實驗結(jié)果

        本研究所用衡量方法的指標(biāo)是均方根誤差(root mean squared error, RMSE)、絕對平均誤差(mean absolute error, MAE)、皮爾森相關(guān)系數(shù)(pearson correlation coefficient,r)和組內(nèi)相關(guān)系數(shù)(Intraclass correlation coefficient, ICC)。實驗結(jié)果,見表3。

        表3種挑選了四種經(jīng)典回歸模型進(jìn)行AASI的估計,全特征輸入代表了未經(jīng)篩選的特征子集組合。其中,脊回歸損失函數(shù)的正則項系數(shù)設(shè)定為α=5。由表3可知,隨機(jī)森林模型在估計AASI問題時誤差最小(MAE、RMSE)、估計值與真實值的線性相關(guān)程度最高(r)。為了進(jìn)一步提高本研究方法的性能,引入GA對綜合性能表現(xiàn)最好的隨機(jī)森林模型進(jìn)行特征子集篩選。

        2.1 遺傳算法特征篩選

        引入GA進(jìn)行特征篩選,GA的迭代過程見圖6。

        表3 四種回歸模型估計結(jié)果

        圖6 尋找最優(yōu)特征子集的GA過程

        由GA獲得的最優(yōu)特征子集見表4,其估計結(jié)果表現(xiàn)見表5。

        表4 由GA獲得的最優(yōu)特征子集

        2.2 在血壓以及心率維度下AASI估計分布情況

        為了分析進(jìn)行過特征篩選后的RF模型對于不同患者的準(zhǔn)確度,本研究從血壓、心率兩個維度對所有樣本進(jìn)行了誤差統(tǒng)計,見圖7。

        圖7的橫坐標(biāo)軸代表每個樣本的平均動脈血壓,縱坐標(biāo)軸代表每個樣本的心率,色塊代表絕對誤差大小:由淺入深代表絕對誤差由大至小。一個黑點(diǎn)代表一個病例,為了使統(tǒng)計結(jié)果方便可視,且能展現(xiàn)出總體樣本的趨勢,在此引入了局部加權(quán)回歸使圖像完整且平滑。

        表5 RF模型下經(jīng)過GA特征篩選與未經(jīng)過GA篩選的結(jié)果對比

        3 討論與總結(jié)

        由表3可知,隨機(jī)森林模型在估計AASI時,其綜合性能顯著優(yōu)于表中的其他三種模型。由表5可知,當(dāng)引入GA完成特征篩選后,RF模型估計AASI的能力提高,誤差明顯減小。

        在本研究中,RF模型的最優(yōu)特征子集為Max of PPG、Min of PPG、FDPIR、HR和RR。

        2.2節(jié)分析了在最優(yōu)特征子集和隨機(jī)森林模型下,AASI的絕對誤差在血壓和心率維度上的分布情況。由圖7可知,AASI估計值的絕對誤差在樣本平均動脈血壓突破了100 mmHg以后,與其呈正相關(guān),在圖7表現(xiàn)為色塊在橫軸上由深入淺地變化,而另一維度心率與估計AASI誤差的關(guān)系在圖7上尚不顯著。產(chǎn)生此現(xiàn)象的原因可能為:(1)訓(xùn)練回歸模型的樣本中,高血壓的樣本數(shù)要低于正常血壓的樣本數(shù),因此,模型對高血壓樣本產(chǎn)生的誤差大于正常血壓區(qū)間的樣本;(2)AASI對高血壓患者的表現(xiàn)要弱于對正常血壓患者。根據(jù)李燕等[4]的研究,AASI與頸動脈-股動脈PWV的相關(guān)系數(shù)在面對正常血壓患者時為0.51,而面對高血壓患者時僅為0.28[26]。

        圖7 在最優(yōu)特征子集下AASI誤差分布圖

        為對抗心血管疾病早發(fā)的態(tài)勢,本研究基于動態(tài)動脈硬化指數(shù)與隨機(jī)森林模型,完成了動態(tài)動脈硬化指數(shù)的初步估計,并且優(yōu)化了在估計過程中的特征選擇問題,同時分析了動態(tài)動脈硬化指數(shù)的估計絕對誤差在血壓和心率維度上的分布情況。但是模型的可靠性仍需要多中心的外部資料進(jìn)行驗證,并在推廣過程中不斷優(yōu)化和提高其性能。

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