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        基于VGG 網(wǎng)絡(luò)與深層字典的低劑量CT 圖像去噪算法

        2022-04-18 10:56:44周博超韓雨男桂志國(guó)李郁峰
        計(jì)算機(jī)工程 2022年4期
        關(guān)鍵詞:字典深層原子

        周博超,韓雨男,桂志國(guó),2,李郁峰,張 權(quán),2

        (1.中北大學(xué)電子測(cè)試技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,太原 030051;2.中北大學(xué)生物醫(yī)學(xué)成像與影像大數(shù)據(jù)山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,太原 030051;3.中北大學(xué) 軍民融合協(xié)同創(chuàng)新研究院,太原 030051)

        0 概述

        計(jì)算機(jī)斷層掃描(Computed Tomography,CT)成像技術(shù)是現(xiàn)代臨床醫(yī)療影像學(xué)診斷的常用手段。然而,常規(guī)X 射線CT 掃描的放射性較高,會(huì)對(duì)人體造成一定的危害。低劑量CT(Low-Dose CT,LDCT)[1]通過(guò)降低X 射線管電壓或管電流,以減弱放射性造成的傷害,但同時(shí)也降低成像質(zhì)量。如何改善LDCT 的成像質(zhì)量成為醫(yī)學(xué)影像處理的研究熱點(diǎn)。

        目前,改善LDCT 圖像質(zhì)量的研究方法主要分為投影域去噪算法、改進(jìn)重建算法和圖像域去噪算法[2]。其中圖像域去噪算法是基于稀疏表示的K-SVD(K-Singular Value Decomposition)算法[3-4],在去除輕度噪聲偽影方面取得了良好的效果,但是基于質(zhì)量退化嚴(yán)重的LDCT 圖像學(xué)習(xí)到的字典原子中包含較多的噪聲原子,無(wú)法有效地去除噪聲[5]。針對(duì)上述問(wèn)題,文獻(xiàn)[6]提出分類字典的概念,通過(guò)對(duì)字典原子進(jìn)行區(qū)分,提升K-SVD 算法的去噪性能。文獻(xiàn)[7]提出一種基于正則化方法的K-SVD 算法,通過(guò)在字典原子更新時(shí)引入正則項(xiàng),改善去噪效果。文獻(xiàn)[8]提出一種深層字典學(xué)習(xí)算法,能夠更好地保留圖像邊緣和細(xì)節(jié)信息,但在去除噪聲偽影方面表現(xiàn)一般。文獻(xiàn)[9]提出一種基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的LDCT 圖像去噪方法,通過(guò)學(xué)習(xí)LDCT 圖像與其噪聲圖像之間的映射關(guān)系,從而改進(jìn)去噪效果。然而,LDCT 圖像與正常劑量的CT 圖像難以對(duì)應(yīng)。

        為改善LDCT 圖像質(zhì)量,本文將改進(jìn)的VGG[10-12]網(wǎng)絡(luò)與深層字典相結(jié)合,提出一種LDCT 圖像去噪算法。構(gòu)建適合字典原子分類的VGG 網(wǎng)絡(luò)模型,并將其應(yīng)用于學(xué)習(xí)到深層字典的第一層字典原子中,同時(shí)根據(jù)分類結(jié)果將稀疏矩陣中噪聲原子對(duì)應(yīng)的元素設(shè)置為零,從而降低噪聲原子對(duì)圖像去噪效果的影響。

        1 K-SVD 算法

        K-SVD 算法是在最優(yōu)方向算法(MOD)[13]的基礎(chǔ)上提出的。MOD 算法的目標(biāo)函數(shù)如式(1)所示:

        其中:D為字典原子;Y為樣本數(shù)據(jù)集;X={xi}為字典D對(duì)應(yīng)的稀疏矩陣;ε為稀疏度,即稀疏表示系數(shù)中非零元素的個(gè)數(shù)。

        MOD 算法通過(guò)實(shí)現(xiàn)表征誤差最小化來(lái)更新字典,即在公式兩端對(duì)D求偏導(dǎo)。整個(gè)字典的更新過(guò)程如式(2)所示:

        該運(yùn)算需要對(duì)矩陣求逆,會(huì)耗費(fèi)大量的計(jì)算資源。K-SVD 算法每次只更新一個(gè)字典原子和對(duì)應(yīng)的稀疏編碼向量,直至更新完所有的字典原子。本文假設(shè)圖像Y可以描述為Y=DX,其中D∈RN×M,X為D對(duì)應(yīng)的稀疏矩陣。K-SVD 算法分為以下兩個(gè)階段:

        1)稀疏編碼階段

        稀疏編碼階段可以描述為求解模型,其過(guò)程如式(3)所示:

        其中:||X||0是l0范數(shù),為X中非零元素的個(gè)數(shù);T0為非零元素個(gè)數(shù)的最大值。字典D可以初始化為一個(gè)離散余弦變換(Discrete Cosine Transform,DCT)字典[14],通過(guò)正交匹配追蹤(Orthogonal Matching Pursuit,OMP)[15]算法計(jì)算得到稀疏編碼矩陣X。

        2)字典學(xué)習(xí)階段

        字典學(xué)習(xí)階段主要是根據(jù)稀疏矩陣X迭代更新字典D中的原子。字典學(xué)習(xí)過(guò)程可以描述為求解模型,其過(guò)程如式(4)和式(5)所示:

        其中:||Xi||0是Xi的l0范數(shù)。K-SVD 算法的主要原理是先固定字典D,利用OMP 算法求解稀疏矩陣X,然后再固定X,根據(jù)X更新字典D,如此交替進(jìn)行,直到求出字典D和稀疏矩陣X的最優(yōu)解。

        2 基于改進(jìn)VGG 網(wǎng)絡(luò)的字典原子分類模型

        2.1 VGG 網(wǎng)絡(luò)

        深度學(xué)習(xí)[16]已發(fā)展出眾多網(wǎng)絡(luò)模型,其中適用于圖像識(shí)別與分類的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)是一種專門用來(lái)處理具有相似網(wǎng)格結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)[17-18]。VGG-16 網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖1 所示。

        圖1 VGG-16 網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)Fig.1 Structure of VGG-16 network

        VGG 網(wǎng)絡(luò)是輕量級(jí)卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中分類性能表現(xiàn)較優(yōu)的網(wǎng)絡(luò)模型之一。與AlexNet[19]網(wǎng)絡(luò)相比,VGG網(wǎng)絡(luò)最主要的特點(diǎn)是采用多個(gè)堆疊的3×3 卷積核代替AlexNet 網(wǎng)絡(luò)中較大的單個(gè)卷積核,如5×5、7×7、11×11。對(duì)于相同的感受野,相比單個(gè)大卷積核,VGG網(wǎng)絡(luò)采用堆疊的小卷積核,能夠以更小的參數(shù)代價(jià)獲得更優(yōu)的非線性。VGG 網(wǎng)絡(luò)全部采用相同大小的卷積核(3×3)和最大池化層(2×2),保證網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的簡(jiǎn)潔性,同時(shí)通過(guò)對(duì)VGG 網(wǎng)絡(luò)的不同層數(shù)進(jìn)行比較分析,驗(yàn)證了加深網(wǎng)絡(luò)層數(shù)可以提高網(wǎng)絡(luò)性能的有效性。隨著網(wǎng)絡(luò)層數(shù)的加深,需要求解的參數(shù)數(shù)目也隨之增加,其中大部分參數(shù)來(lái)自于全連接層。

        2.2 改進(jìn)VGG 網(wǎng)絡(luò)

        本文在VGG-16 網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上,通過(guò)去掉池化層和部分全連接層,并引入直連通道[20]構(gòu)建區(qū)分噪聲原子和信息原子的網(wǎng)絡(luò)模型,如圖2 所示。

        圖2 改進(jìn)的VGG 網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)Fig.2 Structure of improved VGG network

        該模型主要包含5 個(gè)卷積段、1 個(gè)全連接層以及2 個(gè)標(biāo)簽的Softmax 層。5 個(gè)卷積段總共包含13 個(gè)卷積層,卷積核尺寸均為3×3,每段內(nèi)卷積核數(shù)量一致,越靠后段的卷積核數(shù)量越多,分別為64、128、256、512、512,滑動(dòng)步長(zhǎng)為1,采用邊界填充確保前后數(shù)據(jù)維數(shù)相同,激活函數(shù)采用ReLu。由于字典原子圖像僅為8×8 像素,因此去除全部池化層。經(jīng)典VGG 網(wǎng)絡(luò)是為1 000 個(gè)分類類別設(shè)計(jì)的,而本文只有2 個(gè)分類類別,且需要求解的參數(shù)大部分來(lái)自于全連接層,因此僅保留1 個(gè)全連接層。同時(shí)在經(jīng)典VGG 網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上加入直連通道,將原始輸入的信息直接傳入到后面的網(wǎng)絡(luò)層中,以抑制梯度消失且加快網(wǎng)絡(luò)收斂速度。本文考慮到改進(jìn)的VGG 網(wǎng)絡(luò)共有13 個(gè)卷積層,并且過(guò)多的直連通道會(huì)增加網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜度,因此分別在卷積層的第1 層和第4 層、第5層和 第7 層、第8 層和第10 層、第11 層和第13 層設(shè)置直連通道。

        3 改進(jìn)的深層字典

        3.1 深層字典

        SNIGDHA 等通過(guò)將字典學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)的概念相結(jié)合,基于K-SVD 算法提出了深層字典學(xué)習(xí)的概念。但是,單層字典的收斂條件并不適用于深層字典,并且在學(xué)習(xí)深層字典時(shí),需要求解的參數(shù)增多,由于訓(xùn)練數(shù)據(jù)有限,會(huì)導(dǎo)致過(guò)擬合現(xiàn)象。為此,深層字典采用貪婪方式[21]學(xué)習(xí)字典,并將第1 層學(xué)習(xí)到的特征作為第2 層的輸入。字典的求解可以是稠密或者稀疏的,稠密求解模型如式(6)所示:

        其中:Y為輸入圖像;D為學(xué)到的 字典;X為字典D對(duì)應(yīng)的稀疏矩陣。式(6)可以采用交替最小化[22]的方法求解,如式(7)所示:

        其中:k為深層字典的層數(shù),k=1,2,…,n。在稀疏求解中需加入L1 范數(shù)進(jìn)行正則化,即求解如式(8)所示:

        式(8)也可以通過(guò)交替最小化來(lái)求解,如式(9)所示:

        若字典層數(shù)為N層,求解如 式(10)~式(13)所示:

        此時(shí)Y可以表示為:

        其中:Dk、Xk為第k層學(xué)習(xí)到的字典及對(duì)應(yīng)的稀疏矩陣,k=0,1,…,N。

        深層字典通過(guò)學(xué)習(xí)多層字典來(lái)提取數(shù)據(jù)的特征,但對(duì)于LDCT 圖像而言,深層字典無(wú)法區(qū)分圖像中的結(jié)構(gòu)信息和噪聲信息。因此,深層字典學(xué)習(xí)到的字典原子中仍含有較多的噪聲原子,導(dǎo)致深層字典在處理LDCT 圖像時(shí),雖然能夠較好地保留圖像的結(jié)構(gòu)信息,但是無(wú)法有效抑制噪聲對(duì)LDCT 圖像質(zhì)量的影響。

        3.2 改進(jìn)的深層字典學(xué)習(xí)算法

        盡管深層字典可以學(xué)習(xí)到更多的圖像細(xì)節(jié)信息,但深層字典的去噪能力較差,而LDCT 圖像通常噪聲強(qiáng)度較高。為提高深層字典的去噪性能和改善LDCT圖像質(zhì)量,本文通過(guò)改進(jìn)的VGG 網(wǎng)絡(luò)對(duì)深層字典學(xué)習(xí)算法進(jìn)行相應(yīng)的改進(jìn),算法結(jié)構(gòu)如圖3 所示。

        圖3 改進(jìn)的深層字典學(xué)習(xí)算法結(jié)構(gòu)Fig.3 Structure of improved deep dictionary learning algorithm

        本文所提的算法采用3 層結(jié)構(gòu)。第1 層采用稀疏求解,字典大小設(shè)置為64×144,稀疏度為1,利用改進(jìn)的VGG 網(wǎng)絡(luò)將學(xué)習(xí)到的第1 層字典D1中的字典原子區(qū)分為噪聲原子和信息原子,如圖4 所示,并將稀疏矩陣中噪聲原子所對(duì)應(yīng)的元素設(shè)置為0,降低噪聲原子對(duì)圖像去噪效果的影響,得到一個(gè)新的稀疏矩陣X′1,如圖5 所示。

        圖4 區(qū)分字典原子示意圖Fig.4 Schematic diagram of distinguishing dictionary atomic

        圖5 稀疏矩陣中噪聲原子所對(duì)應(yīng)元素置零示意圖Fig.5 Schematic diagram of zeroing elements corresponding to noise atoms in sparse matrix

        這個(gè)過(guò)程如式(15)所示:

        為保留圖像中更多結(jié)構(gòu)和邊緣信息,字典的第2層和第3 層均采用稠密求解,字典大小分別設(shè)置為144×256、256×441,如式(16)和式(17)所示:

        本文算法主要分為以下7 個(gè)步驟:

        1)輸入原始LDCT 圖像Y;

        2)利用式(7)得到字典D1和稀疏矩陣X1;

        3)利用改進(jìn)的VGG 網(wǎng)絡(luò)將字典D1中的字典原子區(qū)分為噪聲原子和信息原子;

        4)將稀疏矩陣X1中噪聲原子所對(duì)應(yīng)的元素置零,得到新的稀疏矩陣

        5)利用式(16)得到字典D2和稀疏矩陣X2;

        6)利用式(17)得到字典D3和稀疏矩陣X3;

        7)利用式(18)輸出去噪圖像Y。

        4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析

        4.1 數(shù)據(jù)集

        本文采用的數(shù)據(jù)集是原始LDCT 仿真圖像,通過(guò)K-SVD 算法學(xué)習(xí)字典原子圖像塊,字典大小設(shè)置為64×256,稀疏度設(shè)置為1。一幅原始LDCT 仿真圖像可以得到256 幅8×8 像素的單個(gè)字典原子圖像塊,并利用labelme 軟件進(jìn)行標(biāo)注。利用20 幅原始LDCT 仿真圖像得到5 120 幅字典原子圖像塊組成的數(shù)據(jù)集。為保證數(shù)據(jù)集中正負(fù)樣本數(shù)的一致性,本文篩選5 000 幅字典原子圖像塊,并經(jīng)過(guò)鏡像、翻轉(zhuǎn)操作擴(kuò)展至10 000 幅。

        4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析

        本文實(shí)驗(yàn)將256×252 像素的骨盆體模LDCT仿真圖像作為輸入圖像,將處理結(jié)果與K-SVD 算法、正則化K-SVD 算法、深層字典學(xué)習(xí)算法的處理結(jié)果進(jìn)行對(duì)比分析。為定量評(píng)價(jià)各算法的處理結(jié)果,本文選用結(jié)構(gòu)相似性(Structural Similarity,SSIM)、峰值信噪比(Peak Signal to Noise Ratio,PSNR)、平均絕對(duì)誤差(Mean Absolute Error,MAE)作為客觀評(píng)價(jià)指標(biāo)。

        圖6 為在迭代訓(xùn)練100 次時(shí),改進(jìn)VGG 網(wǎng)絡(luò)模型在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集上的損失值和準(zhǔn)確率的變化,最終在字典原子數(shù)據(jù)集上的準(zhǔn)確率達(dá)到97.7%。

        圖6 在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集上改進(jìn)VGG 網(wǎng)絡(luò)的損失值和準(zhǔn)確率變化Fig.6 Change of loss value and accuracy rate of improved VGG network on training set and validation set

        圖7從直觀上給出了改進(jìn)的VGG網(wǎng)絡(luò)模型對(duì)字典原子的分類結(jié)果,如圖中箭頭所示,只有個(gè)別字典原子分類錯(cuò)誤。

        圖7 改進(jìn)VGG 網(wǎng)絡(luò)對(duì)字典原子分類結(jié)果Fig.7 Classification result of improved VGG network to the dictionary atomic

        圖8 為不同算法的去噪結(jié)果圖及局部放大圖。從圖中可以看出,傳統(tǒng)的K-SVD 算法在處理LDCT圖像時(shí),仍殘留較多的噪聲偽影,同時(shí)損失了邊緣和細(xì)節(jié)信息。正則化K-SVD 算法雖然提高了去噪性能,但與傳統(tǒng)K-SVD 算法相似,損失了較多的細(xì)節(jié)和邊緣信息。傳統(tǒng)的深層字典學(xué)習(xí)算法能夠保留較多的細(xì)節(jié)信息,但仍含有明顯的噪聲偽影。本文算法在提高去噪性能的同時(shí)保留了更多的邊緣和細(xì)節(jié)信息。因此,本文算法在視覺(jué)效果上明顯優(yōu)于其他同類算法。

        圖8 不同算法的去噪結(jié)果及局部放大圖Fig.8 Denoising results of different algorithms and local enlargement images

        表1 為不同算法處理LDCT 圖像后的評(píng)價(jià)指標(biāo)對(duì)比。從表中可以看出,本文算法在結(jié)構(gòu)相似性、峰值信噪比和平均絕對(duì)誤差方面均優(yōu)于其他同類對(duì)比算法。

        表1 不同算法處理LDCT 圖像后的評(píng)價(jià)指標(biāo)Table 1 Evaluation indexes of LDCT images processed with different algorithms

        表2 為本文算法在稀疏度為1,字典原子圖像塊大小為8×8 的情況下,不同字典大小對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響,其中ki表示深層字典第i層字典大小,i=1,2,…,n。從表2 可以看出,當(dāng)字典尺寸較大時(shí),算法的去噪效果較好,其主要原因是字典尺寸越大,能夠包含的圖像信息越多,有利于對(duì)噪聲圖像進(jìn)行稀疏重構(gòu)。但是當(dāng)字典尺寸過(guò)大時(shí),去噪效果反而下降了,這是因?yàn)長(zhǎng)DCT 圖像包含較多的噪聲偽影信息,字典尺寸過(guò)大時(shí),會(huì)將較多的噪聲偽影信息引入字典中,從而導(dǎo)致去噪效果下降。本文所采用的字典大小是經(jīng)過(guò)多次實(shí)驗(yàn)得到的,但這種方法選取的字典大小為經(jīng)驗(yàn)值,而非最優(yōu)解。

        表2 不同字典大小對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響Table 2 Influence of different dictionary sizes on experimental results

        5 結(jié)束語(yǔ)

        為提高LDCT 圖像質(zhì)量,本文提出一種基于VGG網(wǎng)絡(luò)和深層字典的去噪算法,通過(guò)改進(jìn)的VGG 網(wǎng)絡(luò)將深層字典的第一層字典原子區(qū)分為信息原子和噪聲原子,并將稀疏矩陣中噪聲原子所對(duì)應(yīng)的元素置零,從而彌補(bǔ)深層字典學(xué)習(xí)算法去噪能力的不足。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,相比K-SVD、正則化K-SVD 和深層字典學(xué)習(xí)算法,本文算法在提高圖像去噪能力的同時(shí)保留了較多的邊緣和細(xì)節(jié)信息。后續(xù)將通過(guò)自適應(yīng)選取字典大小的最優(yōu)解,進(jìn)一步提高算法的去噪效果。

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