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        肺泡微結(jié)石癥1例家系基因分析

        2022-04-13 02:17:42胡秋芳盛天昕楊小東陳司漢
        中國當(dāng)代醫(yī)藥 2022年7期
        關(guān)鍵詞:基因突變

        胡秋芳 張 娟 盛天昕 楊小東 陳司漢

        1.樂山職業(yè)技術(shù)學(xué)院醫(yī)護系,四川樂山 614000;2.四川省德陽市人民醫(yī)院呼吸內(nèi)科,四川德陽 618000;3.四川大學(xué)華西醫(yī)院呼吸內(nèi)科,四川成都 614000

        肺泡微結(jié)石癥是(pulmonary alveolar microlithiasis,PAM)以兩肺肺泡內(nèi)鈣、磷微小結(jié)石沉積及繼發(fā)肺間質(zhì)纖維化改變?yōu)樘卣鞯囊环N罕見肺部疾病。該病有家族遺傳傾向,多以常染色體隱性方式遺傳,其發(fā)病與SLC34A2(solute carrier family 34 member 2)基因突變有關(guān)[1]。該基因編碼Na 依賴的Pi 轉(zhuǎn)運蛋白NaPi-Ⅱb,該蛋白主要表達于肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞,主要作用是從肺泡液中吸收無機磷用于肺泡表面活性物質(zhì)的合成。SLC34A2 基因突變后使NaPi-Ⅱb 蛋白質(zhì)形成異常,導(dǎo)致肺泡內(nèi)鈣磷轉(zhuǎn)運失調(diào),無機磷積累,進而引發(fā)磷酸鈣鹽沉積[2-3]。隨著近年來對該病認(rèn)識的增加,至今為止已有30 種不同的SLC34A2 基因變異被報道[3]。我國報道的SLC34A2 基因突變多為外顯子8 突變[4]。現(xiàn)報道1例PAM 患者的SLC34A2 基因突變特點。

        1 病例資料

        1.1 一般資料

        患者男,30 歲,自幼常因“感冒”于當(dāng)?shù)蒯t(yī)院就診,行胸片檢查考慮“肺結(jié)核”,未進一步檢查及規(guī)律抗結(jié)核治療,一般予以輸液治療幾天后癥狀緩解。3年前患者反復(fù)出現(xiàn)咳嗽、咳痰,活動及感冒后感氣緊,行胸部CT 檢查提示雙肺彌漫顆粒狀結(jié)節(jié)影,余無特殊?;颊吒改笩o近親關(guān)系,家系中父親所有弟弟均未婚,父親妹妹與母親弟弟結(jié)婚,第三代包括先證者共4 人(家系圖譜見圖1)。其他家系成員無類似癥狀。

        圖1 病例家系系譜圖

        1.2 體格檢查

        查體:體重62 kg,身高168 cm,唇無發(fā)紺,無杵狀指,心界正常,心律齊,各瓣膜區(qū)未聞及雜音。雙肺呼吸音稍低,未聞及干濕啰音,雙下肢無水腫。

        1.3 輔助檢查

        血鈣:2.07 mmol/L,肺功能:①FVC 為4.01 L(與預(yù)計值之比為87.9%);②FEV1為13.76 L(預(yù)計值之比為97.4%);③FEV1/FVC 為94%;④BR 輕度降低,DLCO 中度下降,VEDA>10 L;⑤患者彌散功能中度降低,通氣儲備功能輕度下降,過度通氣,肺功能中度受損。胸部CT 檢查提示:雙肺彌漫高密度結(jié)節(jié)影,以中下肺為主,呈“暴風(fēng)雪”或“沙暴”樣改變,提示肺泡微結(jié)石癥;雙肺間質(zhì)改變,雙肺胸膜增厚、粘連、鈣化;縱膈淋巴結(jié)增大(圖2)。在排除粟粒型肺結(jié)核、塵肺、肺含鐵血黃素沉著癥等疾病,根據(jù)患者病史、典型臨床表現(xiàn)及實驗室檢查結(jié)果,擬診為PAM。

        圖2 患者胸部CT 肺窗及縱膈窗

        1.4 基因檢測資料

        經(jīng)知情同意后,患者及在世家族4 名成員均用乙二胺四乙酸(Ethylene diaminetetraacetic acid,EDTA)抗凝管抽取外周靜脈血4 ml,DNA 提取采用基因組DNA 提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)。DNA抽提后用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度儀檢測純度及含量。對SLC34A2 基因13 個外顯子中的12 個外顯子設(shè)計引物進行PCR 擴增,將PCR 擴增產(chǎn)物送至上海生工生物公司進行測序分析。首先檢測患者12 個外顯子的編碼區(qū)和剪接位點的突變,確定可能的突變位點,然后針對突變位點再檢測突變在其家族成員中的分布情況。另取100 例無關(guān)正常人外周血DNA 作為對照。

        1.4.1 PCR 擴增結(jié)果 SLC34A2 基因2-13 號外顯子成功擴增(圖3)。

        圖3 SLC34A2 基因2-13 號外顯子擴增產(chǎn)物

        1.4.2 基因檢測結(jié)果 該PAM 家系成員基因經(jīng)雙向測序發(fā)現(xiàn),患者SLC34A2 基因突變?yōu)橥怙@子8 突變c.910A>T(p.K304X)(圖4);SNP 位點有2 個突變即內(nèi)含子12 的rs199563183 (p.Y455H)(圖5)和外顯子13 的rs3733545(圖6)同時出現(xiàn)突變。其父親外顯子8 c.910A>T(p.K304X)存在突變,母親SNP 位點也有以上2 個突變。家系中患者舅舅無突變位點。

        圖4 外顯子8 突變位點測序圖

        圖5 內(nèi)含子12∶rs 199563183 突變位點測序圖

        圖6 外顯子13∶rs3733545 突變位點測序圖

        2 討論

        PAM 是一種罕見的以磷酸鈣鹽顆粒在雙肺肺泡內(nèi)沉積為特征的疾病,由SLC34A2 基因變異引起。于1868年最早由Marcello 報道描述,之后全世界各大洲均有陸續(xù)報道,目前報道的病例數(shù)不到1100 例[5-6],其中以土耳其和歐洲多見。PAM 患者早期癥狀不明顯,多在30~40 歲逐漸出現(xiàn)干咳、呼吸困難、咯血、氣胸及肺心病等癥狀。臨床上主要結(jié)合X 線、胸部CT及肺活檢對PAM 進行確診,患者雙肺可見彌漫性砂粒樣鈣化結(jié)節(jié)影,且隨病情進展鈣化灶逐漸增多并出現(xiàn)聚集融合,呈現(xiàn)“暴風(fēng)雪”改變。近年來很多研究證實PAM 具有家族遺傳傾向是一種常染色體隱性遺傳病,其家族史報道頻率為32%~61%[2,7]。遺傳病例報道中不存在性別傾向,但散發(fā)病例以男性為主(57.7%)[7-8]。

        PAM 發(fā)病與SLC34A2 基因突變有關(guān),該基因?qū)儆谌苜|(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白家族SLC34 的成員之一,位于染色體4p15.31-p15.2,全長21033bp,包括13 個外顯子[9-10],除第1 個外顯子是非編碼,其余12 個均為編碼外顯子。SLC34A2 在Ⅱ型肺泡上皮細(xì)胞高表達,其編碼的轉(zhuǎn)運蛋白NaPi-Ⅱb 含有690 個氨基酸的多次跨膜蛋白,至少有8 個跨膜α 螺旋區(qū)組成,研究推測胞質(zhì)內(nèi)側(cè)和外側(cè)各有一短環(huán)具有轉(zhuǎn)運通路的重要功能區(qū)域[11],其主要作用是從肺泡液中吸收無機磷用于肺泡表面活性物質(zhì)的合成。當(dāng)SLC34A2 基因突變后會導(dǎo)致該轉(zhuǎn)運蛋白形成異常,從而使肺泡內(nèi)鈣磷轉(zhuǎn)運失調(diào),磷酸鹽堆積無法清除,從而為微結(jié)石的形成提供條件。Saito 等[12]通過小鼠模型研究發(fā)現(xiàn)Ⅱ型肺泡上皮細(xì)胞缺少NaPi-Ⅱb 可導(dǎo)致肺泡內(nèi)微結(jié)石形成及進行性限制性肺疾病的發(fā)生。

        目前有許多關(guān)于SLC34A2 基因突變的文獻報道,其突變位點有外顯子1、2、3、4、6、7、8、11、12 和13,且分布具有種族或地域傾向[13]。如土耳其病例報道中除外顯子7 和8 未發(fā)現(xiàn)突變,其他的外顯子均有突變,日本病例中主要是外顯子7 或8 突變,而在中國的病例報道中多在外顯子8 出現(xiàn)突變,僅有1例突變在外顯子6[14-15]。本病例也呈外顯子8 突變,但與以往報道不同的是該患者SNP 出現(xiàn)新的兩個突變位點即內(nèi)含子12、外顯子13。其中外顯子8 的突變位點c.910A>T 來源于父系,即cDNA 的第910 號密碼子由A→T,從而使氨基酸AAA(賴氨酸)→TAA,提前出現(xiàn)終止密碼子,以致不能產(chǎn)生正常功能蛋白從而導(dǎo)致肺泡微結(jié)石的形成?;驒z測發(fā)現(xiàn)新突變的位點內(nèi)含子12 及外顯子13 的3′-UTR 區(qū)來源于母系,該位點的突變類型尚未報道過。進一步分析發(fā)現(xiàn)rs3733545 位于13 號外顯子3′-UTR 區(qū),等位基因二元狀態(tài)為G/T,G 為祖先型等位基因,本例患者的等位基因G 來自母親,T 來自父親。由于該SNP 位點的兩種等位基因頻率相近,因此推測其致病的可能性較小。而rs199563183位于12 號內(nèi)含子第26 位堿基,等位基因二元狀態(tài)為G/A,G 為祖先型等位基因,等位基因A 存在極低的群體頻率,有潛在致病的可能,患者該位點的等位基因A 來自母親,與c.910A>T 來源于不同的單體型,存在致病的可能性。通過家系基因分析看出,父親有外顯子8 的突變,母親有內(nèi)含子12 的突變,但父親與母親均未發(fā)病,而患者完全符合PAM 的特點,由此可見p.K304X 和p.Y455H 的突變可能共同引起了蛋白功能的改變,導(dǎo)致患者自幼發(fā)病,病情呈進行性發(fā)展的特點。

        3 結(jié)論

        PAM 是一種罕見的肺部疾病,以磷酸鈣鹽顆粒在雙肺肺泡內(nèi)沉積為特征,有家族遺傳傾向,多呈常染色體隱性遺傳方式發(fā)病。其中SLC34A2 在PAM 的發(fā)病過程中發(fā)揮著重要的作用,對SLC34A2 基因的研究可能成為PAM 精準(zhǔn)基因診治的突破點,其是否存在復(fù)合雜合突變致病的可能有待進一步探索。中國PAM 患者突變位點更傾向于外顯子8,而外顯子8 的c.910A>T 突變可能用于中國可疑PAM 患者的臨床基因篩查或治療靶點。

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