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        雞毒支原體MG熒光定量PCR技術評估實驗室MG核酸污染方法

        2022-04-05 13:48:44張承新張鵬彭曉艷王海蘭曲秀娟姜皓盧艷慧李新郭龍宗李玉燕
        家禽科學 2022年3期
        關鍵詞:熒光定量PCR

        張承新 張鵬 彭曉艷 王海蘭 曲秀娟 姜皓 盧艷慧 李新 郭龍宗 李玉燕

        摘 要:為了評估雞毒支原體(MG)非免疫雞群的MG感染,常采用MG熒光定量PCR技術進行監(jiān)測;而在雞群的MG凈化監(jiān)控前,需要對實驗室進行MG核酸污染評估,無污染后才能進行后續(xù)的凈化檢測工作。本實驗采用MG熒光定量PCR技術評估實驗室各區(qū)域的MG核酸污染情況,如果存在核酸污染,需要采取一系列的消毒措施,直至實驗室MG核酸污染監(jiān)控為陰性。

        關鍵詞:雞毒支原體;熒光定量PCR;核酸污染

        中圖分類號:S858.31 文獻標識碼:B 文章編號:1673-1085(2022)03-0060-03

        熒光定量PCR(real-time PCR),是一種使用熒光定量PCR擴增裝置實時監(jiān)測PCR擴增產物并進行分析的方法。與常規(guī)PCR技術比較,熒光定量PCR可以對起始模板準確定量,能夠對擴增反應實時檢測;而常規(guī)PCR不能。根據(jù)熒光收集的機制,熒光定量PCR分為探針法和染料法;本研究采用探針法MG熒光定量試驗評估實驗室MG核酸污染。

        1 材料與方法

        1.1 試驗儀器及試劑

        ABI Q5熒光定量PCR儀(QuantStudioTM 5 Real-Time PCR Instrument);RealPCR 敗血性支原體/DNA檢測混合液,購自IDEXX公司,批號:44B1045,有效期至2022年8月8日。

        1.2 采樣方法

        在1.5 mL離心管中加入適量PCR級水,將植絨拭子浸入離心管中,在離心管壁上擠壓,去除多余的水,之后用拭子對實驗室各功能間環(huán)境樣品進行采樣;在取樣區(qū)旋轉擦拭2~3次,再將拭子放回離心管中,旋渦震蕩混勻,洗脫拭子上的核酸;擠壓后拭子棄掉,離心管中液體作為熒光定量PCR待檢樣品。

        1.3 采樣區(qū)域

        根據(jù)實驗室的布局和實驗區(qū)域劃分,用不同的拭子對每個待檢測污染監(jiān)控區(qū)域進行取樣,并進行編號。實驗室采樣區(qū)域見表1。

        1.4 實驗方法

        參照試劑盒說明書進行操作,總反應體系為25 μL:目標檢測預混液10 μL,DNA擴增預混液10 μL,樣品DNA 5 μL。

        擴增程序:50 ℃ 15 min,95 ℃ 1 min,95 ℃ 15 s、60 ℃ 30 s ;共45個循環(huán)。

        2 熒光定量PCR檢測結果

        實驗有效標準:陽性對照FAM Ct值<38,HEX(VIC)<38;PCR陰性對照FAM Ct值無信號,HEX(VIC)≥36。

        根據(jù)實驗室環(huán)境采樣區(qū)域熒光定量PCR檢測結果顯示:在MG疫苗株或者野毒樣品檢測后,樣品制備室和基因擴增室存在不同程度的MG陽性核酸污染,而試劑制備室為潔凈區(qū),未檢測到MG陽性核酸污染。實驗室環(huán)境采樣區(qū)域熒光定量PCR檢測結果見表2。

        3 防控措施

        3.1 核酸污染去除措施

        針對MG陽性核酸污染區(qū)域,使用84消毒液或其他含氯消毒液進行消毒處理,使用工作濃度有效氯含量高于2 000 mg/L,可以用試紙條進行濃度含量測定。

        污染工作臺處理方法:用84消毒液作用5~10 min,再用75%酒精擦拭2~3遍;污染移液器及提取儀等儀器處理方法:用75%酒精擦拭2~3遍;污染功能間與超凈臺:同時用紫外燈照射30 min。之后再按照操作1的試驗方法繼續(xù)進行環(huán)境采樣評估,若仍存在核酸污染,按照3.1措施繼續(xù)進行消毒處理,直至核酸污染徹底清除。

        3.2 核酸污染預防措施

        3.2.1 制定科學完善的操作規(guī)程 為了預防核酸污染問題,首先根據(jù)實驗室功能,進行分區(qū)管理,針對每個實驗功能區(qū)制定詳細的操作流程及技術規(guī)范。根據(jù)日常核酸污染監(jiān)控結果,對容易忽略的方面,進行及時補充修訂,確保操作規(guī)程簡單、有效且具有較強操作性。

        3.2.2 實驗室人流、物流嚴格控制 人員進入各功能區(qū)緩沖間后須更換衣服、拖鞋,每個實驗功能區(qū)的衣服顏色或款式要求不同,專人專鞋,防止交叉污染。進出各功能區(qū)需進行手部消毒,實驗前配套手套、口罩。工作服每周用84消毒液進行浸泡清洗。各實驗功能區(qū)的耗材禁止串用,各區(qū)域的垃圾桶、衛(wèi)生清潔工具、記號筆、移液器等采用顏色管理,不得混用。各功能區(qū)須配備相應的去污染消毒試劑,84消毒液、75%酒精噴壺等。工作人員在清潔時按照工作區(qū)流程進行,不得逆行。

        3.2.3 規(guī)范實驗室廢棄物處理 試驗用移液器槍頭、試驗結束后的提取及PCR耗材先用84消毒液浸泡,再進行密封后丟棄。口罩、手套等浸泡84消毒液后丟棄,丟棄物及時進行清理。

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