畢嘉成,田志剛,2
(1 中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院,深圳合成生物學(xué)創(chuàng)新研究院,廣東 深圳 518055;2 中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)免疫學(xué)研究所,安徽 合肥 230027)
近年來,免疫治療在腫瘤等重大疾病治療領(lǐng)域的應(yīng)用得到蓬勃發(fā)展,逐漸成為變革腫瘤治療的嶄新范式[1-3]。當(dāng)前免疫治療主要包括通過單克隆抗體靶向“檢查點(diǎn)分子”的“檢查點(diǎn)療法”[4-5],以及通過轉(zhuǎn)輸免疫細(xì)胞進(jìn)行腫瘤治療的免疫細(xì)胞療法[6-7]。
其中“檢查點(diǎn)療法”主要通過單克隆抗體靶向阻斷免疫細(xì)胞表面的抑制性受體,從而解除抑制性受體介導(dǎo)的免疫抑制效應(yīng),釋放免疫細(xì)胞的抗腫瘤潛能。最具代表性的PD-1/PD-L1 單克隆抗體,通過阻斷PD-1 與PD-L1 之間的相互作用,激活抗腫瘤效應(yīng)T 細(xì)胞發(fā)揮抗腫瘤效應(yīng)。隨著基于PD-1/PD-L1 抗體單藥治療腫瘤臨床試驗(yàn)的成功,PD-1/PD-L1 抗體聯(lián)合CTLA-4、TIGIT 等其他檢查點(diǎn)分子的聯(lián)合療法也相繼取得成功。作為免疫治療的重要方向之一,未來檢查點(diǎn)療法結(jié)合生物標(biāo)志物的篩查,有望使該策略的應(yīng)答水平進(jìn)一步提高。
除了檢查點(diǎn)療法之外,免疫細(xì)胞療法是免疫治療中的另一個重要方向。免疫細(xì)胞療法主要包括基于T 細(xì)胞的CAR-T 療法和TCR-T 療法,以及基于NK 細(xì)胞、γδT 細(xì)胞等固有免疫細(xì)胞療法。CAR-T 療法主要通過設(shè)計構(gòu)建嵌合抗原受體(chimeric antigen receptor,CAR),使T 細(xì)胞通過細(xì)胞外的單鏈抗體結(jié)構(gòu)域特異性地識別腫瘤抗原,并通過細(xì)胞內(nèi)的一個或多個活化性信號轉(zhuǎn)導(dǎo)結(jié)構(gòu)域觸發(fā)活化性信號,二者的結(jié)合能夠使得T細(xì)胞通過非MHC 限制性的方式特異性地識別預(yù)先設(shè)定的腫瘤抗原,并啟動T細(xì)胞的抗腫瘤效應(yīng)功能[8]。除了CAR-T 外,CAR 裝載的NK 細(xì)胞也在臨床試驗(yàn)中體現(xiàn)出較好的有效性[9],而CAR 裝載的巨噬細(xì)胞目前仍在臨床前開發(fā)階段,其臨床治療腫瘤的有效性仍有待檢驗(yàn)[10]。此外,基于T 細(xì)胞的免疫細(xì)胞療法也包括同樣在腫瘤免疫治療領(lǐng)域展現(xiàn)出潛力的TCR-T 療法[11]。TCR-T 療法主要通過對病人來源的T 細(xì)胞進(jìn)行體外的基因修飾,以使這些T細(xì)胞表達(dá)針對特定腫瘤抗原表位的TCR 分子,從而獲得特異性識別腫瘤的能力。與CAR-T 細(xì)胞相比,TCR-T療法的優(yōu)勢是能夠使T細(xì)胞特異性地識別細(xì)胞內(nèi)表達(dá)的腫瘤抗原,因而TCR-T 療法與CAR-T 療法具有一定程度的互補(bǔ)性;但TCR-T 療法具有MHC 限制性,而目前所知的能特異性識別特定抗原表位的TCR數(shù)量非常有限。
盡管腫瘤免疫治療取得了上述進(jìn)展,然而針對大多數(shù)種類的腫瘤,特別是實(shí)體瘤,當(dāng)前免疫療法的療效仍有待提高。原因主要有以下幾點(diǎn)[12]:免疫細(xì)胞對腫瘤的識別精準(zhǔn)度不足;免疫細(xì)胞對腫瘤組織的浸潤水平不足;免疫細(xì)胞受腫瘤微環(huán)境抑制;免疫細(xì)胞在腫瘤微環(huán)境中會進(jìn)入耗竭狀態(tài)。為了提高免疫治療的有效性和安全性,亟需針對上述問題進(jìn)一步發(fā)展免疫治療的技術(shù)和手段。
“合成生物學(xué)”是指設(shè)計與構(gòu)建新的生物元件、裝置或系統(tǒng),或?qū)ΜF(xiàn)有的天然生物系統(tǒng)進(jìn)行再設(shè)計和再改造,以付諸應(yīng)用[13-16]。合成生物學(xué)以理性設(shè)計、定量化、工程化和智能化等為核心理念和特征,在多個領(lǐng)域發(fā)展出一系列技術(shù)工具,為其廣泛應(yīng)用奠定了堅實(shí)的基礎(chǔ)。合成生物學(xué)的理念與技術(shù),結(jié)合日漸深入的免疫學(xué)基礎(chǔ)研究及日益豐厚的免疫治療實(shí)踐積累,驅(qū)動著一個嶄新學(xué)科的誕生與發(fā)展--合成免疫學(xué)[17-18]?!昂铣擅庖邔W(xué)”是指通過結(jié)合基礎(chǔ)免疫學(xué)知識與合成生物學(xué)技術(shù)手段,工程化構(gòu)建生物元件或裝置,通過重塑、糾偏、再造機(jī)體的免疫系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)對免疫應(yīng)答的理性操控、進(jìn)行重大疾病的免疫治療。合成免疫學(xué)的研究目標(biāo)一方面是“致知”,即旨在進(jìn)一步揭示免疫應(yīng)答的調(diào)控機(jī)制;另一方面目標(biāo)是“致用”,即通過理性設(shè)計、操控免疫應(yīng)答的若干環(huán)節(jié)來實(shí)現(xiàn)重大疾病的免疫治療。合成免疫學(xué)的誕生與發(fā)展,代表著未來免疫治療的發(fā)展路徑,即從傳統(tǒng)以定性為主的經(jīng)典免疫學(xué)理論上升為定量、可控、規(guī)模化的工程操控為主要特征的新時代;合成免疫學(xué)的重要價值在于,有望通過合成免疫學(xué)的賦能,使未來免疫療法克服當(dāng)前限制免疫治療療效的因素,從而實(shí)現(xiàn)更理想的治療有效性和安全性。NK 細(xì)胞是重要的抗腫瘤效應(yīng)細(xì)胞,并在免疫治療領(lǐng)域相比其他免疫細(xì)胞類型具有獨(dú)特的優(yōu)勢,本文將對合成免疫學(xué)驅(qū)動的NK 細(xì)胞腫瘤免疫治療在未來的潛在發(fā)展路徑進(jìn)行展望,介紹天然殺傷細(xì)胞(natural killer cell,即NK 細(xì)胞)的特性、NK 細(xì)胞在未來合成免疫細(xì)胞療法中的重要地位、合成免疫細(xì)胞及分子的設(shè)計等內(nèi)容。
NK 細(xì)胞是一種固有免疫細(xì)胞,主要通過細(xì)胞膜表面一系列活化性、抑制性受體識別泛特異性的分子模式,從而對惡性轉(zhuǎn)化或受感染的細(xì)胞進(jìn)行識別和清除[19-21]。與T 細(xì)胞不同,NK 細(xì)胞不需要經(jīng)過預(yù)先致敏即可殺傷靶細(xì)胞。NK 細(xì)胞不僅在腫瘤轉(zhuǎn)移以及血液系統(tǒng)腫瘤等的免疫監(jiān)視中發(fā)揮重要作用,而且NK 細(xì)胞在實(shí)體瘤中的水平也與病人良好的預(yù)后呈正相關(guān)[22]。更重要的是,NK細(xì)胞能在T 細(xì)胞所無法識別的MHC-I 低表達(dá)腫瘤中也發(fā)揮抗腫瘤效應(yīng)[23]。由于NK細(xì)胞具備上述特征與獨(dú)特優(yōu)勢,基于NK 細(xì)胞的免疫療法是當(dāng)前免疫治療領(lǐng)域的重要方向,其中主要包括NK 細(xì)胞療法[24-26]以及NK細(xì)胞檢查點(diǎn)療法[27-29]。
“底盤細(xì)胞”是指具備自我復(fù)制能力,能被人工修飾、改造以實(shí)現(xiàn)一定免疫學(xué)效應(yīng)的免疫細(xì)胞。對底盤細(xì)胞的選擇和研究是免疫治療及合成免疫學(xué)研究的關(guān)鍵問題。當(dāng)前的免疫治療以基于T細(xì)胞的策略占多數(shù),但基于T細(xì)胞的免疫治療存在諸多不足[30-31]:T 細(xì)胞檢查點(diǎn)療法總體應(yīng)答率偏低,腫瘤存在多種逃逸T 細(xì)胞應(yīng)答的機(jī)制;CAR-T 和TCR-T 療法則在治療實(shí)體瘤方面面臨靶標(biāo)抗原的丟失、免疫微環(huán)境抑制、免疫耗竭、較高毒性(細(xì)胞因子風(fēng)暴、神經(jīng)毒性、移植物抗宿主反應(yīng)等)、自體T 細(xì)胞質(zhì)量低下、制備時間及成本較高等問題。相比之下,NK 細(xì)胞療法則具備一系列對比優(yōu)勢,比如毒性較低、異體來源、貨架式供應(yīng)模式等[24,32-34],因而可能是未來免疫治療中更為理想的工程化底盤細(xì)胞。
例如,有研究發(fā)現(xiàn),造血干細(xì)胞移植后,供者NK 細(xì)胞輸注的患者中,HLA 不完全匹配的NK細(xì)胞輸注,使患者的預(yù)后更好[35],提示使用HLA不完全匹配的NK 細(xì)胞進(jìn)行輸注治療可能具有更好的抗腫瘤效果。因此,NK 細(xì)胞治療所用的NK 細(xì)胞來源不受限于腫瘤患者自身,而可以來自異體健康人(包括外周血、臍帶血、誘導(dǎo)的多能干細(xì)胞等等);在此基礎(chǔ)上,同一位健康人來源的NK細(xì)胞還可以用于多位不同配型的腫瘤患者的治療。這被稱為NK 細(xì)胞療法的“通用”特征[36-37]?;谶@一特征,提前將NK 細(xì)胞進(jìn)行體外誘導(dǎo)發(fā)育、分化、大量擴(kuò)增及凍存,隨時進(jìn)行供應(yīng),能為腫瘤患者大大縮短等待治療的時間窗口,即為NK 細(xì)胞療法的“貨架式”供應(yīng)模式。此外,由于NK 細(xì)胞療法毒性較小,NK 細(xì)胞療法可以施行多次反復(fù)的NK 細(xì)胞輸注,從而進(jìn)一步提高療效。2020 年,NK 細(xì)胞療法迎來兩項(xiàng)重大突破:其一是不同來源的NK 細(xì)胞能夠?qū)崿F(xiàn)規(guī)?;臄U(kuò)增生產(chǎn);其二是異體CAR-NK 療法在實(shí)現(xiàn)同等療效的情況下,避免了CAR-T 療法的毒副作用[38]。這兩項(xiàng)突破意味著NK 細(xì)胞作為一種底盤細(xì)胞,從理論上具備作為免疫細(xì)胞療法的“通用型”底盤細(xì)胞的優(yōu)勢,這種策略不僅在臨床上有效、安全,而且具備規(guī)?;a(chǎn)工藝的可行性。
為了充分發(fā)揮NK 細(xì)胞療法的上述優(yōu)勢,在下一步研究中,需結(jié)合當(dāng)前及未來合成免疫學(xué)的最新進(jìn)展,對NK 細(xì)胞進(jìn)行腫瘤感受器及基因回路等的設(shè)計與構(gòu)建,繼續(xù)發(fā)展NK 細(xì)胞的定向分化與無限量生產(chǎn)技術(shù),并開發(fā)相應(yīng)的自動化生產(chǎn)工藝。
生物大分子藥物通常被設(shè)計用于中和或觸發(fā)特定靶分子的功能;而活細(xì)胞則可以執(zhí)行復(fù)雜程度更高的應(yīng)答程序。以免疫細(xì)胞為例。免疫細(xì)胞能夠基于可精確定義的條件進(jìn)行復(fù)雜環(huán)境信息的感知,隨后觸發(fā)執(zhí)行可編程的治療性應(yīng)答。因而,免疫細(xì)胞療法在執(zhí)行智能程度較高的治療策略方面,相比生物大分子而言更具潛力,將在基于合成免疫學(xué)的未來免疫治療中扮演重要角色。下文將以NK 細(xì)胞為例,闡述其智能設(shè)計與人工合成的關(guān)鍵技術(shù)。
免疫細(xì)胞對腫瘤細(xì)胞的精準(zhǔn)識別是免疫細(xì)胞抗腫瘤療法的關(guān)鍵。裝載合成的抗原識別受體,將在NK 細(xì)胞對腫瘤細(xì)胞的固有識別方式基礎(chǔ)上,額外賦予NK 細(xì)胞以腫瘤特異性識別的能力。《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》發(fā)表的一項(xiàng)里程碑式的研究表明,針對11 個病人,轉(zhuǎn)載CAR 的NK 細(xì)胞療法在8 個病人中體現(xiàn)出應(yīng)答,而其中的7 個病人甚至在中位數(shù)13.8 個月的時間內(nèi)不再能檢測出疾病的指標(biāo)[38]。該研究顯示CAR-NK 療法的良好耐受性以及較好的抗腫瘤療效,從概念上證明合成的抗原識別受體與NK細(xì)胞療法之間的相容性。
考慮到NK 細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)規(guī)律的獨(dú)特性[39-40],為了充分調(diào)動NK細(xì)胞的效應(yīng)功能,CAR的設(shè)計需要適應(yīng)NK 細(xì)胞特有的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)規(guī)律[41-42]。比如,在CAR 的細(xì)胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)模塊設(shè)計上使用NK 細(xì)胞活化性受體的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)結(jié)構(gòu)域[43]。研究表明,DAP12(活化性受體NKG2C、NKp44、KIR3DS1等的接頭蛋白)[44]、2B4.z(2B4受體的共刺激結(jié)構(gòu)域+CD3ζ 結(jié)構(gòu)域)[45],以及DAP10.z(活化性受體NKG2D 的接頭蛋白+CD3ζ 結(jié)構(gòu)域)[46]等構(gòu)造顯示出較強(qiáng)的激活CAR-NK細(xì)胞的潛能。
合成免疫細(xì)胞療法需要制備大量免疫細(xì)胞并進(jìn)行基因改造,然而,免疫細(xì)胞作為接近于終末分化狀態(tài)的細(xì)胞,其體外擴(kuò)增能力存在瓶頸。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞技術(shù)的發(fā)展則為此提供了新的解決途徑。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞具有類似胚胎干細(xì)胞的性質(zhì),具備自我更新能力,能在體外進(jìn)行大規(guī)模擴(kuò)增,能通過基因編輯技術(shù)進(jìn)行精確修飾和改造,并在特定條件下被誘導(dǎo)分化成特定類型的免疫細(xì)胞。而通過對誘導(dǎo)多能干細(xì)胞及進(jìn)行NK 細(xì)胞定向分化的技術(shù)路線,有潛力形成“貨架式”供應(yīng)的“通用型”免疫細(xì)胞療法[47]。
NK 細(xì)胞的定向分化技術(shù)是其中的關(guān)鍵,該技術(shù)主要包含兩個環(huán)節(jié)。首先,人胚胎干細(xì)胞以及人多能干細(xì)胞在基質(zhì)細(xì)胞等的輔助下產(chǎn)生CD34+CD45+造血前體細(xì)胞;隨后,將富集或流式分選所得的造血前體細(xì)胞在IL-3、IL-7、IL-15、SCF、FLT3L 等細(xì)胞因子組合的條件下誘導(dǎo)分化成NK 細(xì)胞[48-50]。研究發(fā)現(xiàn),經(jīng)由干細(xì)胞分化所得的NK 細(xì)胞與原代分離的NK 細(xì)胞及NK92 細(xì)胞系等相比具有等同的效應(yīng)功能,表明該技術(shù)路線是可行的,能用于免疫治療用NK細(xì)胞的制備[47]。
另一方面,免疫細(xì)胞的大規(guī)模擴(kuò)增工藝也是實(shí)現(xiàn)“貨架式”供應(yīng)“通用型”免疫細(xì)胞療法的一種關(guān)鍵技術(shù)。以NK 細(xì)胞為例,其擴(kuò)增技術(shù)主要分為“使用飼養(yǎng)細(xì)胞”或“無飼養(yǎng)細(xì)胞”兩種方式。
“使用飼養(yǎng)細(xì)胞”策略通常選擇在NK 敏感靶細(xì)胞的表面過表達(dá)提供NK 細(xì)胞存活、增殖信號的細(xì)胞因子如膜型IL-15 或IL-21,以及能激活NK 細(xì)胞活化性受體的配體分子如4-1BB 等。有報道在K562-mb15-4-1BBL刺激下,NK細(xì)胞能在3周內(nèi)擴(kuò)增數(shù)萬倍,并在8 周內(nèi)擴(kuò)增至千萬倍[51];而過表達(dá)膜型IL-21的腫瘤細(xì)胞膜提取物PM21能刺激NK細(xì)胞在14天內(nèi)擴(kuò)增825倍[52];另外,經(jīng)過TERT轉(zhuǎn)染的NK 細(xì)胞可以在K562-mb15-4-1BBL 刺激下持續(xù)被擴(kuò)增超過1年[53],等等。
盡管“使用飼養(yǎng)細(xì)胞”策略已被用于多項(xiàng)腫瘤治療的臨床試驗(yàn),但“無飼養(yǎng)細(xì)胞”策略長遠(yuǎn)來說更具優(yōu)勢?!盁o飼養(yǎng)細(xì)胞”策略擴(kuò)增所得的NK 細(xì)胞避免了飼養(yǎng)細(xì)胞摻入的風(fēng)險,從而降低了質(zhì)控的難度。“無飼養(yǎng)細(xì)胞”策略擴(kuò)增NK 細(xì)胞已有多項(xiàng)研究報道。比如通過培養(yǎng)瓶包被抗CD16 抗體,將PBMC 在AIM V 培養(yǎng)基、5%自體血漿、700 IU/mL IL-2的條件下進(jìn)行培養(yǎng),經(jīng)過前24小時OK432(力爾凡,即由溶血性蓮球菌Su 株經(jīng)青霉素處理、冷凍干燥制成的菌苗)的處理,在2~3 周 之 后 能 夠 獲 得4×109、純 度95.4% 的NK 細(xì)胞[54]。還有報道使用覆蓋了抗CD2、抗NKp46 抗體的珠子(miltenyi biotec)或類似的可溶性微球(Cloudz,R&D),在10 天內(nèi)獲得超過100 倍擴(kuò)增的NK 細(xì)胞[55]。此外,使用CD34+臍帶血來源干細(xì)胞,在IL-2、IL-7、IL-15 存在的條件下也可以進(jìn)行NK細(xì)胞的定向分化及擴(kuò)增[49]。以及在細(xì)胞因子基礎(chǔ)上使用額外的輔助因子,比如曾有研究者在IL-15 和/或IL-2 基礎(chǔ)上結(jié)合煙酰胺或唑來膦酸及A類鏈球菌的使用,進(jìn)行NK細(xì)胞的擴(kuò)增[56-57]。
免疫細(xì)胞療法盡管在血液腫瘤的治療中取得較大突破,但目前對實(shí)體瘤的治療仍面臨有效性不足的問題。主要原因有以下幾方面:①免疫細(xì)胞對腫瘤細(xì)胞的識別精準(zhǔn)度不足;②免疫細(xì)胞對腫瘤組織的浸潤不足;③免疫細(xì)胞受腫瘤微環(huán)境抑制;④免疫細(xì)胞的耗竭狀態(tài);⑤免疫細(xì)胞在體內(nèi)持續(xù)存活能力不足。為了進(jìn)一步提升免疫細(xì)胞療法的有效性,未來可能從上述幾個方面入手,結(jié)合當(dāng)前及未來合成免疫學(xué)的最新進(jìn)展,對免疫細(xì)胞進(jìn)行修飾或改造,從而實(shí)現(xiàn)免疫細(xì)胞的功能增效。
首先,NK 細(xì)胞可以進(jìn)行腫瘤感受器如CAR分子的裝載,從而增強(qiáng)NK 細(xì)胞識別腫瘤細(xì)胞的特異性(3.1 節(jié)“腫瘤感受器的合成組裝”已有討論)。
其次,實(shí)體腫瘤組織中存在大量的細(xì)胞外基質(zhì)成分,阻礙著免疫細(xì)胞的遷移和浸潤[58],有報道肝素酶[59]在免疫細(xì)胞浸潤腫瘤的過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用,缺少肝素酶的NK 細(xì)胞對腫瘤浸潤水平降低、抗腫瘤能力大幅削弱[60],因此,通過使NK細(xì)胞過表達(dá)肝素酶,有可能使得NK 細(xì)胞對腫瘤細(xì)胞外基質(zhì)降解能力提高,提高浸潤腫瘤的能力。
浸潤到腫瘤微環(huán)境中的NK 細(xì)胞還會受到來自微環(huán)境的免疫負(fù)調(diào)控細(xì)胞和因子的抑制,其中最具代表性的細(xì)胞因子是腫瘤壞死因子beta(tumor growth factor beta,TGF-β)[61]。TGF-β 能通過抑制NK 細(xì)胞的mTOR 信號通路從而抑制NK 細(xì)胞的活性[62-63]。而通過在NK細(xì)胞上過表達(dá)突變型的TGFβ 顯性陰性受體(mutant TGF-β dominant-negative receptor),能使NK 細(xì)胞在TGF-β 富集的腫瘤微環(huán)境中顯示出更強(qiáng)的腫瘤殺傷活性,并延長荷瘤小鼠的生存率[64]。
NK 細(xì)胞在腫瘤微環(huán)境中往往進(jìn)入功能低下的免疫耗竭狀態(tài),這與NK 細(xì)胞在腫瘤微環(huán)境中異常表達(dá)的檢查點(diǎn)分子有關(guān)[22]。其中,檢查點(diǎn)分子TIGIT 在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中在NK 細(xì)胞表面逐漸上調(diào)表達(dá),并介導(dǎo)NK 細(xì)胞的腫瘤免疫耗竭,而通過單克隆抗體阻斷TIGIT 可以逆轉(zhuǎn)NK 細(xì)胞的免疫耗竭狀態(tài),在一定程度上恢復(fù)其抗腫瘤功能[65]。根據(jù)這一原理,對NK 細(xì)胞進(jìn)行Tigit基因的敲除,有可能增強(qiáng)NK 細(xì)胞在腫瘤微環(huán)境中抵抗免疫耗竭的能力。
在NK 細(xì)胞體內(nèi)存活能力方面,有報道對胞內(nèi)檢查點(diǎn)分子CIS[66]進(jìn)行基因敲除,獲得的臍帶血或誘導(dǎo)多能干細(xì)胞來源的NK 細(xì)胞展現(xiàn)出更強(qiáng)大的抗腫瘤效能,伴隨著更強(qiáng)的mTOR 信號通路活性、更好的代謝狀態(tài)以及更強(qiáng)的體內(nèi)存活能力[67-68]。
標(biāo)準(zhǔn)化和通用化是合成生物學(xué)的重要理念[69-72],也是合成免疫學(xué)將賦予未來免疫治療的重要特征。標(biāo)準(zhǔn)化和通用化能解決當(dāng)下免疫細(xì)胞來源不足、價格高昂等問題,同時將利于免疫治療符合監(jiān)管的要求。在該背景下,“通用型”免疫細(xì)胞療法的概念應(yīng)運(yùn)而生。
“通用型”免疫細(xì)胞療法通過提取健康人來源的免疫細(xì)胞,經(jīng)過體外基因修飾等工程化改造,然后大規(guī)模擴(kuò)增及凍存,形成可以“貨架式”供應(yīng)的工程化免疫細(xì)胞產(chǎn)品;當(dāng)有患者需要進(jìn)行治療時,根據(jù)對患者生物標(biāo)志物的篩查結(jié)果,在數(shù)據(jù)庫中匹配最有可能產(chǎn)生應(yīng)答的工程化免疫細(xì)胞產(chǎn)品,從而“定制”最合適患者的治療方案,快速地將產(chǎn)品復(fù)蘇并提供給患者進(jìn)行臨床使用。NK細(xì)胞是一種具有殺傷功能的底盤細(xì)胞,NK 細(xì)胞免疫療法的優(yōu)勢之一是天然具備在同種異體間使用的特點(diǎn),因而更容易實(shí)現(xiàn)“貨架式”供應(yīng)[73]。NK細(xì)胞免疫療法與當(dāng)前使用較多的自體免疫細(xì)胞療法[74-75](如CAR-T、TCR-T 等)不同,其細(xì)胞來源不受限于患者自身,因而可以從來源廣泛的健康人獲取,從而進(jìn)行大規(guī)模的提前制備。如此制備獲得的產(chǎn)品對不同的患者而言是“通用”的。“通用型”免疫細(xì)胞療法除了將大幅降低生產(chǎn)成本之外,還能夠執(zhí)行嚴(yán)格的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn),有助于推動監(jiān)管法規(guī)的發(fā)展,利于免疫治療行業(yè)的推廣使用及長遠(yuǎn)發(fā)展。因此,“通用型”免疫細(xì)胞療法是未來合成免疫細(xì)胞療法的關(guān)鍵之一。
合成免疫學(xué)驅(qū)動的下一代免疫治療,其核心在于免疫細(xì)胞底盤。包括化學(xué)藥和蛋白藥在內(nèi)的常規(guī)藥物是相對穩(wěn)定、均一、化學(xué)成分明確;而免疫細(xì)胞則是活的、可自我復(fù)制、會發(fā)生改變、能對環(huán)節(jié)產(chǎn)生響應(yīng)的[6]。只有在生產(chǎn)工藝上盡可能地使細(xì)胞藥物具有相對穩(wěn)定的遺傳成分與細(xì)胞狀態(tài),才能使免疫細(xì)胞治療達(dá)成目標(biāo)的有效性與安全性。因而,免疫細(xì)胞生產(chǎn)環(huán)節(jié)的標(biāo)準(zhǔn)化及嚴(yán)格的質(zhì)控非常重要[76-78]。為了實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化和嚴(yán)格的質(zhì)控,需要改革當(dāng)下集成度低、人手操作為主、產(chǎn)品質(zhì)量參差不齊的生產(chǎn)模式。
針對上述難題,工業(yè)界嘗試開發(fā)封閉式、自動化、可編程的細(xì)胞處理系統(tǒng),即“細(xì)胞工廠”[79-81]。細(xì)胞工廠通過對實(shí)驗(yàn)流程進(jìn)行軟硬件編程,實(shí)現(xiàn)全流程自動化封閉式操作,從而產(chǎn)出質(zhì)量穩(wěn)定、批次間差異小、可重復(fù)性較高的細(xì)胞產(chǎn)品。由于細(xì)胞工廠消除了人工處理的環(huán)節(jié)及在不同設(shè)備之間人工轉(zhuǎn)移中間產(chǎn)物的步驟,從而系統(tǒng)性地降低潛在的污染風(fēng)險、降低來自人工操作導(dǎo)致的批次間質(zhì)量差異。細(xì)胞工廠針對特定類型細(xì)胞產(chǎn)品進(jìn)行調(diào)試及優(yōu)化的結(jié)果還可以應(yīng)用于后續(xù)規(guī)模放大的生產(chǎn)流程。
目前“細(xì)胞工廠”主要覆蓋三個主要的生產(chǎn)工藝環(huán)節(jié):原材料加工與儲存、產(chǎn)品擴(kuò)容與增能、成品儲存與提貨。具體而言,原材料加工與儲存的環(huán)節(jié)包括有核細(xì)胞分離、凍存與復(fù)蘇;產(chǎn)品擴(kuò)容與增能環(huán)節(jié)包括目的細(xì)胞分選、細(xì)胞擴(kuò)增與分化、細(xì)胞洗滌與分裝;而成品儲存與提貨環(huán)節(jié),包含細(xì)胞凍存、儲存與復(fù)蘇環(huán)節(jié)。此外,細(xì)胞的基因修飾與改造則根據(jù)具體細(xì)胞制備工藝的要求,可以以病毒載體等可選功能模塊的形式按需整合進(jìn)入生產(chǎn)工藝流程中。目前每個實(shí)驗(yàn)步驟都已有成品儀器被研制成功;而用以銜接不同儀器的機(jī)械臂技術(shù)、管路銜接技術(shù)及相關(guān)的軟件設(shè)計,國內(nèi)外多個單位已有一定的技術(shù)積累。可以預(yù)見,經(jīng)過軟件和硬件的進(jìn)一步整合,“貨架式”供應(yīng)的免疫細(xì)胞治療產(chǎn)品的全流程“細(xì)胞工廠”生產(chǎn)線將很快能實(shí)現(xiàn)。屆時,以正常人的外周血作為起始原材料,經(jīng)過細(xì)胞工廠的擴(kuò)增,在一個月內(nèi)擴(kuò)增數(shù)千倍并規(guī)模凍存,一旦有患者需要用藥,即可在短時間內(nèi)復(fù)蘇細(xì)胞、運(yùn)輸?shù)结t(yī)院住院部或門診供患者進(jìn)行使用。
免疫細(xì)胞的細(xì)胞間通訊主要通過自分泌或旁分泌細(xì)胞因子或趨化因子來實(shí)現(xiàn)[82]。細(xì)胞間通訊調(diào)控免疫細(xì)胞的招募、增殖、分化、死亡等環(huán)節(jié),從而調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答。為了實(shí)現(xiàn)對免疫應(yīng)答的人工操控,未來免疫治療將使用比天然細(xì)胞因子功能更強(qiáng)大、更安全可控的新分子。“合成免疫分子”作為合成免疫學(xué)驅(qū)動的未來免疫治療的重要組成部分,是指免疫治療中使用的經(jīng)過工程化改造的蛋白質(zhì)分子,這種蛋白質(zhì)分子經(jīng)過理性設(shè)計(工程化)、功能模塊的組合重構(gòu)等,從而使親和力和半衰期達(dá)到目的水平(定量化);另一方面,使合成免疫細(xì)胞能夠表達(dá)、分泌經(jīng)過上述重組/重構(gòu)的免疫分子,實(shí)現(xiàn)目標(biāo)的免疫調(diào)節(jié)效應(yīng)。合成免疫分子由于具有復(fù)合的功能或條件響應(yīng)性(智能化),因而能夠執(zhí)行天然蛋白質(zhì)分子所不具備的生物學(xué)功能。
免疫組學(xué)是指免疫相關(guān)的組學(xué)技術(shù),主要包括轉(zhuǎn)錄組[83]及蛋白質(zhì)組[84],蛋白質(zhì)翻譯后修飾如磷酸化、乙?;?、泛素化等的組學(xué)分析,以及表觀遺傳學(xué)方面的基因組甲基化的全局信息等。免疫組學(xué)的發(fā)展和應(yīng)用對合成免疫分子的設(shè)計與開發(fā)具有重要意義。腫瘤微環(huán)境的屬性取決于腫瘤類型、進(jìn)展階段和“冷/熱”狀態(tài)等因素,其影響因素復(fù)雜多變,全面而準(zhǔn)確地對腫瘤微環(huán)境進(jìn)行描繪已成為當(dāng)今腫瘤免疫學(xué)研究的關(guān)鍵挑戰(zhàn)[12]。未來不同層次的組學(xué)技術(shù),特別是在單細(xì)胞水平、結(jié)合組織空間定位信息的情況下,將有機(jī)構(gòu)成完善的免疫組學(xué)系統(tǒng)分析體系。通過多學(xué)科交叉的合作,借助強(qiáng)大的生物信息學(xué)分析能力,整合不同層次的海量數(shù)據(jù),從中提取具有生物學(xué)意義的信息,將為合成免疫分子的理性設(shè)計及生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)提供重要的支撐。
首先,免疫組學(xué)可能提供免疫治療的新靶點(diǎn)及相關(guān)信息。比如,單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組可以揭示出腫瘤微環(huán)境中重要的抗腫瘤效應(yīng)細(xì)胞群體,并提示群體特異性的潛在檢查點(diǎn)分子,描繪出腫瘤微環(huán)境中檢查點(diǎn)分子及其配體分子的完整表達(dá)譜,繼而推測可能涉及的細(xì)胞間相互作用關(guān)系,為新檢查點(diǎn)療法的開發(fā)提供重要的理論依據(jù)。
另一方面,生物標(biāo)志物對包括免疫檢查點(diǎn)療法在內(nèi)的合成免疫分子的理性設(shè)計與臨床治療使用至關(guān)重要[85],而免疫組學(xué)將有可能為上述免疫療法提供新的生物標(biāo)志物。比如,PD-1/PD-L1 免疫檢查點(diǎn)療法的應(yīng)答水平高度依賴于腫瘤局部高表達(dá)的PD-L1分子,因而通過PD-L1生物標(biāo)志物的篩查,能夠預(yù)判腫瘤患者是否適用于PD-1/PD-L1免疫檢查點(diǎn)療法,從而通過腫瘤標(biāo)志物的篩查提高患者應(yīng)答療法的可能性[86]。
合成免疫分子理性設(shè)計的重要目標(biāo)是同時具備高效、減毒的特性[87-89]。比如,天然的IL-2分子在臨床使用中具有較大的毒性[90],但研究發(fā)現(xiàn)IL-2分子的毒性在IL-2 受體的高親和力亞基CD25(IL-2Rα)的基因缺失小鼠中大為減輕[91]。因此,Garcia等[92]針對性構(gòu)建出的一種IL-2 超級細(xì)胞因子(Super-2)能夠繞過CD25來發(fā)揮功能。CD25是腫瘤微環(huán)境中富集的具有免疫負(fù)調(diào)控功能的調(diào)節(jié)性T細(xì)胞標(biāo)志[93]。Super-2 的使用有可能在腫瘤微環(huán)境中激活T 細(xì)胞的應(yīng)答,同時避免刺激調(diào)節(jié)性T 細(xì)胞的擴(kuò)增。而為了在繞過CD25 的情況下同時進(jìn)一步增強(qiáng)IL-2 的活性及穩(wěn)定性,Garcia 組與Baker組[94]合作開發(fā)了一種從頭設(shè)計合成分子的計算手段,得到的Neo-2/15 具有與天然IL-2 幾乎完全不同的序列(與天然IL-2 同源性僅在20%左右),它不僅可以繞開CD25 產(chǎn)生高效低毒的免疫學(xué)效應(yīng),而且具有更高的親和力和穩(wěn)定性。除了親和力、穩(wěn)定性外,基于氨基酸序列免疫原性的預(yù)測,人工合成免疫分子還可以通過使用較低免疫原性的序列,提高在體內(nèi)長期使用時的穩(wěn)定性及治療有效性。如此類似Super-2 和Neo-2/15 的高效減毒的合成免疫分子,或單獨(dú)用于治療,或聯(lián)合合成免疫細(xì)胞療法使用,或由合成免疫細(xì)胞分泌產(chǎn)生,在未來的免疫治療策略中,是調(diào)控免疫應(yīng)答的啟動和終止的有力工具,能夠使免疫應(yīng)答更有效、更安全地達(dá)成治療目標(biāo)。
合成免疫分子的一種重要類別是雙功能抗體。
單克隆抗體藥物主要通過結(jié)合一個抗原表位產(chǎn)生生物學(xué)效應(yīng)。單克隆抗體藥物在臨床治療腫瘤、自身免疫性疾病等的成功[95],推動著抗體分子的工程化發(fā)展。與單克隆抗體相比,雙功能抗體可以同時結(jié)合兩個抗原表位,是一種代表性的合成免疫分子。雙功能抗體可以將效應(yīng)細(xì)胞直接靶向腫瘤細(xì)胞,增強(qiáng)其細(xì)胞毒性;或激活/中和超過一個免疫受體分子,從而發(fā)揮特殊的生物學(xué)功能;與兩種單抗藥物聯(lián)合使用相比,雙功能抗體減少了藥物開發(fā)和臨床試驗(yàn)的成本[96]。
目前獲批上市的具有腫瘤免疫學(xué)效應(yīng)的雙功能抗體中,Catumaxomab 能夠同時靶向腫瘤表面抗原EpCAM和T細(xì)胞標(biāo)志CD3[97],而Blinatumomab可以同時結(jié)合B 細(xì)胞瘤標(biāo)志CD19 和T 細(xì)胞標(biāo)志CD3[98]。通過這樣的方式,這些抗體激活并招募?xì)訲細(xì)胞直接對腫瘤細(xì)胞進(jìn)行攻擊,發(fā)揮抗腫瘤效應(yīng)。
除此之外,雙功能抗體還可以同時靶向兩個腫瘤抗原,或兩種細(xì)胞因子,從而起到雙重的中和效應(yīng),比 如靶 向HER2/HER3[99]、IL-17A/IL-17F[100]等的雙特異性抗體。
因而,雙/多功能抗體是一種前瞻性的合成免疫分子技術(shù),能發(fā)揮單抗藥物所不能及的生物學(xué)效應(yīng),但其產(chǎn)業(yè)化面臨的諸多挑戰(zhàn),如生產(chǎn)工藝上的錯配問題、純化問題和穩(wěn)定性問題等等,仍有待進(jìn)一步的研究投入才能解決[101-102]。
嵌合抗原受體是一類與免疫細(xì)胞療法密切相關(guān)的合成免疫分子[103-105]。前述章節(jié)中提到,免疫細(xì)胞療法的關(guān)鍵技術(shù)之一是通過“腫瘤感受器”即嵌合抗原受體的設(shè)計與構(gòu)建,使免疫細(xì)胞精準(zhǔn)識別腫瘤細(xì)胞。作為一種能區(qū)分腫瘤細(xì)胞與正常細(xì)胞的合成免疫分子,嵌合抗原受體的設(shè)計難點(diǎn)在于精準(zhǔn)地獲悉腫瘤特異性的抗原信息。在腫瘤發(fā)展過程中,腫瘤細(xì)胞會逐漸積累體細(xì)胞突變[106-107],這些突變中的一部分會發(fā)生在蛋白質(zhì)的DNA 編碼區(qū)域,從而產(chǎn)生新的腫瘤相關(guān)抗原或腫瘤新生抗原[108]。通過高外顯子測序進(jìn)行初步篩選,然后對HLA-1 親和富集所得的抗原表位肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,最后進(jìn)行計算分析,從而得到獲取腫瘤新生抗原表位的序列信息[109-110]。基于這些序列信息,就能夠精準(zhǔn)地設(shè)計具有腫瘤特異性的嵌合抗原受體,從而使免疫細(xì)胞能夠精準(zhǔn)識別腫瘤細(xì)胞。
合成免疫治療策略的優(yōu)化設(shè)計,要求更完整地認(rèn)識人類疾病的發(fā)病機(jī)制。然而,目前仍缺少能夠真實(shí)反映人類疾病發(fā)病機(jī)制的動物模型。小鼠的免疫系統(tǒng)和疾病模型與人體內(nèi)發(fā)生的真實(shí)情形有一定差距,導(dǎo)致很多在小鼠模型中觀察到的現(xiàn)象及揭示的規(guī)律無法在人類疾病中重現(xiàn)。為了解決這一問題,使 用 人 源 細(xì) 胞 在NOD(non-obese diabetic)-SCID(severe combined immunodeficient)-IL2γ-/-(即NSG 小鼠)[111]等免疫缺陷小鼠體內(nèi)重建人類免疫系統(tǒng)(HIS,humanized immune system)及人源組織器官[112]的方式,可以在小鼠體內(nèi)建立最大程度反映人類疾病發(fā)病機(jī)制的人源化小鼠模型,從而使免疫學(xué)基礎(chǔ)研究的結(jié)論更加準(zhǔn)確,以及免疫治療策略的研發(fā)成功率更高。另一方面,腫瘤組織相比普通組織器官而言具有更復(fù)雜的區(qū)域特性[113]。真實(shí)的腫瘤微環(huán)境的形成,是一個腫瘤細(xì)胞與基質(zhì)細(xì)胞、免疫細(xì)胞等多種細(xì)胞類型相互作用下時間演進(jìn)變化的結(jié)果。腫瘤患者來源的腫瘤組織可以最大程度地反映人類腫瘤微環(huán)境的屬性,因此,在免疫系統(tǒng)人源化小鼠基礎(chǔ)上,通過人源腫瘤組織來源移植瘤(PDX,patient-derived xenograft)[114]建立腫瘤模型,能夠建立最接近人類腫瘤組織區(qū)域特性的腫瘤模型。在此基礎(chǔ)上,進(jìn)行多組學(xué)比對研究(Exome-Seq、Methylomics、Proteomics、Metabolomic、scRNA-Seq、CyTOF等等),可獲知接近于人類腫瘤微環(huán)境的全景信息,從而可以動態(tài)了解其抗腫瘤免疫應(yīng)答,所獲取的海量信息將有助于設(shè)計更有效的合成免疫療法。
在前文中,我們對腫瘤免疫治療的現(xiàn)狀及未來可能的發(fā)展趨勢進(jìn)行了描繪??傮w而言,當(dāng)代免疫治療已經(jīng)成為繼手術(shù)、放療、化療之后的又一重要范式,繼代表性的PD-1/PD-L1 檢查點(diǎn)療法和靶向CD19的CAR-T細(xì)胞療法之后,隨著越來越多適應(yīng)證的一線治療方案獲批,免疫治療將在腫瘤治療等領(lǐng)域發(fā)揮越來越重要的作用,并將吸引越來越多研究資源的投入。此時更需要仔細(xì)分析免疫治療手段所處的發(fā)展階段,從而前瞻性地對關(guān)鍵突破方向進(jìn)行布局。毋庸置疑,免疫治療近年來在腫瘤治療等領(lǐng)域取得了突破性的進(jìn)展,然而有效性和安全性仍需進(jìn)一步提高;盡管CAR-T療法等在一些血液系統(tǒng)腫瘤的治療中取得了較高的治愈率,但考慮到更多的腫瘤屬于實(shí)體瘤范疇,而CAR-T 療法及檢查點(diǎn)療法等對此的應(yīng)答率仍偏低,因而免疫治療離治愈大多數(shù)腫瘤的目標(biāo)仍有很大的距離。這種差距的內(nèi)在原因之一是我們對免疫細(xì)胞和分子的工程化改造仍處在早期階段,僅僅初步展現(xiàn)了人工操控免疫應(yīng)答的潛力。而未來只有充分掌握免疫細(xì)胞和分子工程化改造的規(guī)律,才能充分調(diào)動免疫應(yīng)答的潛力;而為了更好地揭示免疫細(xì)胞和分子工程化改造的規(guī)律,更根本的手段是進(jìn)一步認(rèn)識免疫應(yīng)答的調(diào)控原理,特別是在作為工程學(xué)基礎(chǔ)的定量研究方面。
而此時合成生物學(xué)的發(fā)展則適逢其時地助推了這一發(fā)展趨勢。合成生物學(xué)更講究理性設(shè)計、定量化、工程化,正符合免疫治療從定性研究為主過渡到定量研究、工程化改造的發(fā)展階段。基于SynNotch“與門”設(shè)計的雙抗原識別型CAR-T[115]、高效減毒“超級細(xì)胞因子”Super-2等[94]的從頭設(shè)計或理性設(shè)計等,正是合成生物學(xué)應(yīng)用到免疫細(xì)胞或分子工程化改造的典范。除此之外,工程化改造免疫細(xì)胞及分子的“合成免疫學(xué)”領(lǐng)域正在揭示免疫治療在未來更多的可能性:免疫細(xì)胞療法將逐漸走向“通用型”的“貨架式”供應(yīng)模式;NK 細(xì)胞作為免疫細(xì)胞治療行業(yè)的“后起之秀”,以其獨(dú)特的優(yōu)勢,將在“通用型”免疫細(xì)胞療法中嶄露頭角;精準(zhǔn)設(shè)計的嵌合抗原受體及基因回路將賦予免疫細(xì)胞更高的“智能”和更強(qiáng)的療效;封閉式、自動化、可編程的“細(xì)胞工廠”將顛覆細(xì)胞治療行業(yè)“小作坊”式的普遍亂象,為行業(yè)的規(guī)模化、規(guī)范化發(fā)展鋪平道路;免疫組學(xué)及人源化小鼠模型將提供更貼近人類疾病狀況的海量數(shù)據(jù),為理性設(shè)計減毒增效的合成免疫分子奠定基礎(chǔ),而合成免疫分子的使用,將結(jié)合合成免疫細(xì)胞療法,為人工操控免疫應(yīng)答提供了更多的可能性??梢灶A(yù)期,合成免疫學(xué)將大大拓寬我們對免疫學(xué)基礎(chǔ)理論的認(rèn)識,在更充分揭示免疫細(xì)胞及分子的工程化改造規(guī)律基礎(chǔ)上,將驅(qū)動未來免疫治療走上更高的舞臺。