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        基于數(shù)據(jù)挖掘和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析李恩復(fù)治療慢性萎縮性胃炎用藥規(guī)律和作用機(jī)制

        2022-03-16 10:33:40鄭蕾蕾
        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫(kù)

        鄭蕾蕾 沙 穎 李 煥 丁 輝

        1.陜西中醫(yī)藥大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,陜西咸陽(yáng) 712046;2.陜西省中醫(yī)藥研究院介入科,陜西西安 710003

        中醫(yī)傳承輔助平臺(tái)作為近年新興的數(shù)據(jù)挖掘工具,可對(duì)疾病用藥、醫(yī)案數(shù)據(jù)等進(jìn)行分析[1]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是2007 年被提出的,其基于“疾病-基因-靶點(diǎn)-藥物”相互作用,可系統(tǒng)觀察藥物對(duì)疾病的影響,從而觀察藥物如何作用[2-3]。具有整體性、動(dòng)態(tài)性、多靶點(diǎn)給藥等特點(diǎn),對(duì)中醫(yī)藥的系統(tǒng)性研究起到了重要作用。慢性萎縮性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)是一種慢性消化系統(tǒng)疾病,CAG 患者確診后5 年內(nèi)胃癌的年發(fā)病率為0.1%[4]。因其與胃癌密切關(guān)系,被列為胃癌的癌前期狀態(tài),受到廣泛重視[5]。該病治療目的主要包括緩解癥狀、去除病因及改善胃黏膜炎癥反應(yīng)[6]。CAG 屬中醫(yī)優(yōu)勢(shì)病種,多項(xiàng)研究[7-11]顯示,中醫(yī)藥治療CAG 效果顯著。

        李恩復(fù)曾任河北省中醫(yī)胃腸病研究所所長(zhǎng),河北省名中醫(yī),對(duì)胃腸病治療見(jiàn)解獨(dú)到,尤擅CAG 的治療。本文將用中醫(yī)傳承輔助平臺(tái)及網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)兩種方法探討李恩復(fù)治療CAG 的用藥規(guī)律及作用機(jī)制。

        1 資料與方法

        1.1 醫(yī)案來(lái)源

        醫(yī)案來(lái)源于《萎縮性胃炎治愈案一百例——李恩復(fù)教授醫(yī)案醫(yī)論集》[12]。

        1.2 納入標(biāo)準(zhǔn)

        ①方藥記載完整;②給藥途徑為口服;③藥物組成、用量和療效明確;④只給出處方名者,能查出藥物組成者一并納入。

        1.3 排除標(biāo)準(zhǔn)

        ①主癥無(wú)胃腸癥狀;②方藥重復(fù);③療效欠佳。

        1.4 數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化

        以2020 版《中華人民共和國(guó)藥典》[13]一部為準(zhǔn)使數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化,如“寸冬”改為“麥冬”,若該版藥典未收錄,則參考2017 版《中藥大辭典》[14]。

        1.5 數(shù)據(jù)錄入

        將規(guī)范后的藥物錄入中醫(yī)傳承輔助平臺(tái)V2.5軟件。

        1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        中醫(yī)傳承輔助平臺(tái)采用Apropri 算法、熵聚類、復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)等進(jìn)行用藥規(guī)律挖掘,利用軟件中的“統(tǒng)計(jì)報(bào)表”及“數(shù)據(jù)分析”板塊,得出李恩復(fù)治療CAG 的用藥規(guī)律。

        1.7 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究

        對(duì)李恩復(fù)治療CAG 的核心藥物進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析。應(yīng)用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)[15-16],設(shè)置口服生物利用度≥30%和類藥性≥0.18[17],檢索核心藥物活性成分及靶點(diǎn),應(yīng)用UniProt 數(shù)據(jù)庫(kù)獲取靶點(diǎn)標(biāo)準(zhǔn)基因名稱[18-19],應(yīng)用DisGeNet 數(shù)據(jù)庫(kù)獲取CAG相關(guān)靶點(diǎn)[20],應(yīng)用Draw Venn Diagram 獲取核心藥物疾病靶點(diǎn)的交集,應(yīng)用DAVID 數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)交集靶點(diǎn)進(jìn)行基因本體(gene ontology,GO)和京都基因和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析[21-22],最后利用Cytoscape 3.6.0 軟件[23]構(gòu)建藥物-成分-靶點(diǎn)圖。

        2 結(jié)果

        2.1 用藥頻次、四氣、五味、歸經(jīng)

        針對(duì)涉及的處方中藥,得到李恩復(fù)治療CAG用藥頻次較多的雞內(nèi)金、當(dāng)歸等,單味藥物使用頻次>150 次的藥物有15 味,15 味藥物使用總頻次為3512 次,使用頻次及頻率見(jiàn)表1。使用熱、溫性藥較多,見(jiàn)圖1。五味以苦、辛為主,見(jiàn)圖2。歸經(jīng)較多的有胃、肝經(jīng),見(jiàn)圖3。

        圖1 藥物四氣頻次

        圖2 藥物五味頻次

        圖3 藥物歸經(jīng)頻次

        表1 李恩復(fù)治療CAG 藥物頻次及頻率(單味藥物使用頻次>150 次)

        2.2 基于關(guān)聯(lián)規(guī)則統(tǒng)計(jì)

        進(jìn)入軟件“數(shù)據(jù)分析-組方分析-組方規(guī)律”板塊,設(shè)置支持度個(gè)數(shù)為120,置信度為0.99,挖掘到11 條關(guān)聯(lián)規(guī)則,置信度由高到低的結(jié)果如表2。復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)見(jiàn)圖4。

        圖4 149 味中藥關(guān)聯(lián)規(guī)則復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)圖

        表2 149 味中藥關(guān)聯(lián)規(guī)則及置信度

        2.3 基于熵聚類規(guī)則的聚類分析

        進(jìn)入軟件“數(shù)據(jù)分析-組方分析-新方分析”板塊,設(shè)置相關(guān)度為8,懲罰度為5,對(duì)所選處方進(jìn)行聚類分析,得到14 個(gè)核心組合及7 首新處方,見(jiàn)表3~4。網(wǎng)絡(luò)結(jié)果見(jiàn)圖5~6。

        表3 基于熵聚類規(guī)則新處方核心組合

        表4 基于熵聚類規(guī)則的新處方

        圖5 基于熵聚類規(guī)則新處方核心組合

        2.4 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)

        2.4.1 數(shù)據(jù) 依據(jù)中醫(yī)傳承輔助平臺(tái)所獲結(jié)果,得到治療CAG 的核心藥物為當(dāng)歸、白芍、川芎。查閱中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái),得到當(dāng)歸、白芍、川芎有效成分分別為2、13、7 個(gè),當(dāng)歸、白芍共有成分1 個(gè),白芍、川芎共有成分1 個(gè),藥物總靶點(diǎn)96 個(gè),CAG 靶點(diǎn)1593 個(gè),交集靶點(diǎn)16 個(gè)。

        2.4.2 GO 富集 利用DAVID 數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)交集靶點(diǎn)進(jìn)行GO 分析,得到細(xì)胞組分15 個(gè),生物過(guò)程67 個(gè),分子功能23 個(gè),前10 個(gè)結(jié)果見(jiàn)圖7。

        圖7 CAG 與藥物交集靶點(diǎn)GO 富集分析

        2.4.3 KEGG 富集 利用DAVID 數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)交集靶點(diǎn)進(jìn)行KEGG 富集分析,得到16 條通路,結(jié)果見(jiàn)圖8。

        圖8 CAG 與藥物交集靶點(diǎn)KEGG 信號(hào)通路

        2.4.4 藥物-成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò) 關(guān)鍵藥物-成分-靶點(diǎn)見(jiàn)圖8,共獲得112 個(gè)節(jié)點(diǎn),包含95 個(gè)靶點(diǎn),210 條邊,A1、B1 分別為當(dāng)歸、白芍,白芍、川芎的共有成分,四邊形為靶點(diǎn),六邊形為關(guān)鍵藥物,圓形為藥物有效成分,度值越高,連線越密集,形狀越大,表明越重要。

        3 討論

        李恩復(fù)治療CAG 用藥以補(bǔ)血養(yǎng)血為主,運(yùn)化脾胃為輔,兼以行氣利濕。有研究顯示,CAG 治療中使用補(bǔ)氣藥、補(bǔ)血活血藥、消食藥為多[24]。白芍主要用于養(yǎng)血調(diào)經(jīng)、斂陰止汗、柔肝止痛、平抑肝陽(yáng)等[25],當(dāng)歸則長(zhǎng)于補(bǔ)血活血[26]。從核心藥物組合和新處方可看出,李恩復(fù)治療CAG 時(shí),白芍與當(dāng)歸常共同出現(xiàn),兩者配伍可增強(qiáng)養(yǎng)血柔肝止痛之力。雞內(nèi)金消食化積效佳,且可健運(yùn)脾胃,廣泛用于消化類疾病,若食積較重,可配伍其他消食藥。高頻藥物除雞內(nèi)金這一味消食藥,尚有三七粉,李恩復(fù)常將這兩味消食藥配伍使用。川芎可活血行氣,為“血中氣藥”,是治氣滯血瘀諸痛證之要藥[27]。高頻藥物里使用最多的理氣藥便是川芎和香附。李恩復(fù)使用熱、溫性藥較多,寒藥用以治療熱證,反之則會(huì)使疾病加重。五味以苦、辛、甘為主,三者配伍,可發(fā)揮辛開(kāi)苦降甘和之作用。

        圖9 關(guān)鍵藥物-成分-靶點(diǎn)關(guān)系復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)

        得出新處方7 首,對(duì)診治CAG 具有參考意義。第一個(gè)由白芍、當(dāng)歸、薄荷、川芎、茯苓組成,白芍、當(dāng)歸、川芎三者配伍可養(yǎng)血柔肝、緩急止痛,薄荷可疏肝行氣止痛,茯苓健運(yùn)脾胃,整首新方以養(yǎng)血行氣止痛為主[28]。第二個(gè)由黃芩、沙參、柴胡、石斛、酸棗仁組成,柴胡善疏半表半里之邪,黃芩善清肝膽氣分之熱,二藥配伍具有和解少陽(yáng)、疏散肝膽郁熱的作用[29]。酸棗仁、石斛、沙參配伍,可養(yǎng)陰益胃止痛,整首新方以疏肝養(yǎng)陰止痛為主。

        綜上,李恩復(fù)治療CAG 用藥較多的有雞內(nèi)金、當(dāng)歸等,使用熱、溫性藥較多,五味以苦、辛為主,歸經(jīng)以胃、肝為主,藥物歸經(jīng)這一結(jié)論與陳愉等[30]研究結(jié)果相同。核心藥物為當(dāng)歸、川芎、白芍。此三味藥治療CAG 涉及的通路有:癌癥通路、AMPK 信號(hào)通路、FoxO 信號(hào)通路等,與RNA 聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、藥物反應(yīng)、DNA 模板的正調(diào)控轉(zhuǎn)錄等生物過(guò)程有關(guān)。本研究對(duì)李恩復(fù)治療CAG 的用藥規(guī)律進(jìn)行挖掘,可服務(wù)于臨床,但本研究未對(duì)藥物進(jìn)行定量分析,后續(xù)可將該研究進(jìn)一步深入,探討藥物不同用量的不同作用。

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