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        長鏈非編碼RNA KUCG1通過MAGEA11調(diào)節(jié)PTEN/AKT/mTOR途徑促進ccRCC舒尼替尼的耐藥性①

        2022-02-21 05:57:28汪浩洋毛正發(fā)鄒元章盧俅董迪姚勤陳兵海
        中國免疫學(xué)雜志 2022年2期
        關(guān)鍵詞:舒尼腎癌癌細胞

        汪浩洋 毛正發(fā) 鄒元章 盧俅董迪 姚勤 陳兵海

        (江蘇大學(xué)附屬醫(yī)院,鎮(zhèn)江 212001)

        近年腎癌發(fā)病率逐年遞增,且腎癌發(fā)病率與年齡增長密切相關(guān)[1]。2018年全球腎癌病死人數(shù)超過175 000例[2]。腎透明細胞癌(clear cell carcinoma of kidney,ccRCC)占 成 人 腎 細 胞 癌70%以 上[3]。ccRCC對放化療均不敏感,手術(shù)治療是其主要治療方式,但ccRCC缺乏早期臨床特征,導(dǎo)致部分患者就診時已失去根治性手術(shù)的機會[4]。即使切除腫瘤,仍有20%~30%患者出現(xiàn)復(fù)發(fā)或遠處轉(zhuǎn)移[5]。

        分子靶向藥物的出現(xiàn)給腫瘤治療提供了新的視角[6]。舒尼替尼是一種血管內(nèi)皮生長因子受體(VEGFR)靶向抑制劑,可通過抑制血管生成而抑制腫瘤細胞生長,明顯改善晚期腎癌患者預(yù)后[7-8]。但長期使用舒尼替尼會誘導(dǎo)腫瘤耐藥,加上部分患者先天性耐藥,限制了該藥物的應(yīng)用[9]。腫瘤旁路信號激活可導(dǎo)致舒尼替尼耐藥,但耐藥機制尚不明確[10]。因此,揭示舒尼替尼耐藥的潛在機制并逆轉(zhuǎn)耐藥性迫在眉睫。

        隨著基因測序技術(shù)發(fā)展,發(fā)現(xiàn)了數(shù)以萬計的長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。研究顯示,lncRNA在調(diào)控細胞功能、疾病和腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮重要作用[11-12]。但lncRNA影響舒尼替尼耐藥的分子機制鮮有報道。

        KUCG1是新近發(fā)現(xiàn)的lncRNA,又名LINC00850,最初由TRAN等[13]在杜氏肌營養(yǎng)不良患者中發(fā)現(xiàn),KUCG1下調(diào)可能與精神發(fā)育遲滯相關(guān)。但目前尚無相關(guān)文獻闡釋KUCG1的具體功能。而KUCG1表達、臨床意義和對舒尼替尼耐藥性的影響尚無相關(guān)研究。本研究通過體外試驗研究KUCG1對ccRCC細胞增殖、侵襲及凋亡的影響,研究KUCG1對ccRCC細胞舒尼替尼耐藥性的作用,并探討其可能分子機制。

        1 材料與方法

        1.1 材料769-P和786-O腎癌細胞株購自ATCC;293-T細胞株購自漢恒生物科技有限公司(上海);RNA提取試劑盒購自超研生物科技有限公司(上海);逆轉(zhuǎn)錄試劑盒、qPCR試劑盒購自諾維贊生物科技有限公司(南京);凋亡試劑盒購自福麥斯生物技術(shù)有限公司(南京);酶標儀(Multiskan GO)購自Thermo公司;流式細胞分析儀購自美國BD公司。

        1.2 方法

        1.2.1 細胞培養(yǎng)769-P和786-O腎癌細胞培養(yǎng)于RPMI1640培 養(yǎng)基,293-T細胞 培養(yǎng) 于DMEM培養(yǎng)基,所有培養(yǎng)基均含10%胎牛血清(FBS)、100 U/ml青霉素、100μg/ml鏈霉素,培養(yǎng)條件:37℃、5%CO2。

        1.2.2 qPCR檢測提取細胞總RNA,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,qPCR試劑盒檢測基因表達,以2μl cDNA作為qPCR反應(yīng)模板,以GAPDH為內(nèi)參,KUCG1正向引物序列:5'-TGCCTTCATCCCATTGTCCT-3',反向引 物 序 列:5'-AGACATGGCACCACTGATGA-3';MAGEA11正向引物序列:5'-ATGCTGGGGAGTGT?CATCAA-3',反向引物序列:5'-ATGCAGTTCCCCTCCATGAA-3';GAPDH正向引物序列:5'-GAGTCAACGGATTTGGTCGT-3',反向引物序列:5'-TTGATTTTGGAGGGATCTCG-3'。2-ΔΔCt法計算,實驗重復(fù)3次。

        1.2.3 慢病毒感染慢病毒感染試驗參考文獻[14]。采用REV、GAG、VAVG 3種質(zhì)粒構(gòu)建慢病毒系統(tǒng),包裝CRISPR/Cpf1-KUCG1基因序列的質(zhì)粒后感染293-T細胞獲取病毒液。病毒液感染腎癌769-P和786-O細 胞,構(gòu) 建 穩(wěn) 定 低 表 達KUCG1的769-P和786-O腎癌細胞株KUCG1(-)-1、KUCG1(-)-2。感染后培養(yǎng)24 h更換為含10%FBS的完全培養(yǎng)基。

        1.2.4 細胞轉(zhuǎn)染采用吉瑪制藥技術(shù)有限公司(上海)的siRNA轉(zhuǎn)染試劑向穩(wěn)定低表達KUCG1的769-P和786-O腎癌細胞轉(zhuǎn)染siRNA-MAGEA11和陰性對照(NC),轉(zhuǎn)染6 h后更換為含10%FBS的完全培養(yǎng)基。siRNA-MAGEA11正向引物序列:5'-GCACUACUUUCCUGAGAUATT-3',反向引物序列:5'-UAUCUCAGGAAAGUAGUCCTT-3';NC正向引物序列:5'-UUCUCCGAACGUGUCACGUTT-3',反向引物序列:5'-ACGUGACACGUUCGGAGAATT-3'。

        1.2.5 CCK-8將細胞接種至96孔板,100μl/孔,密度為5 000個/孔。孵育4 h,加入舒尼替尼(10μmol/L)分別處理769-P和786-O細胞72 h和120 h,每48 h更換1次培養(yǎng)基。加入CCK-8試劑37℃孵育2 h,酶標儀測量各孔450 nm處吸光度值。實驗重復(fù)3次。

        1.2.6 侵襲實驗將細胞懸浮于500 μl不含F(xiàn)BS的培養(yǎng)基,添加至小室上室(5 000個/室)。將500μl含10%FBS的完全培養(yǎng)基添加至小室下室,37℃孵育24 h,棉簽擦拭過濾器上側(cè),冷甲醇固定過濾器,0.1%結(jié)晶紫染色30 min。隨機選擇多個區(qū)域進行細胞計數(shù)和拍照。

        1.2.7 流式細胞術(shù)分析細胞凋亡采用凋亡試劑盒分析細胞凋亡,冷的PBS洗滌細胞,采用250μl結(jié)合緩沖液重新懸?。?×106個/ml)。取100 μl加入2.5 μl Annexin V/Alexa Flour 488和5 μl碘化丙啶避光孵育15 min,流式細胞儀測量樣品熒光強度,F(xiàn)lowJo_V10軟件分析數(shù)據(jù)。

        1.2.8 Western blot收集細胞,加入含磷酸化酶抑制劑和PMSF的RIPA裂解液冰上裂解30 min,4℃、13 000 r/min離心10 min,取上清,采用蛋白標準曲線測定蛋白濃度,-80℃儲存。SDS-PAGE凝膠電泳分離蛋白,轉(zhuǎn)至PVDF膜,3%BSA封閉1 h,加入一抗4℃孵育過夜。TBST洗滌3次,加入二抗孵育2 h,TBST洗滌3次,化學(xué)發(fā)光成像儀獲取圖像,Image J軟件分析條帶灰度,以GAPDH為內(nèi)參。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)分析采用SPSS18.0軟件進行統(tǒng)計學(xué)分析,數(shù)據(jù)采用方差分析(ANOVA),以±s表示。GraphPad Prism8軟件繪圖,P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 KUCG1表達下調(diào)與ccRCC舒尼替尼耐藥相關(guān)本研究建立一個包括244個lncRNA的gRNA文庫,采用CRISPR/cas9技術(shù)將244個lncRNA gRNA文庫感染769-P細胞,得到下調(diào)244個lncRNA的769-P細胞文庫,舒尼替尼(10μmol/L)作用6 d后得到舒尼替尼耐藥的769-P細胞,對244個lncRNA進行qPCR檢測,結(jié)果顯示,與未處理的769-P細胞相比,處理后細胞KUCG1表達明顯下降(P=0.004,圖1A、B、D)。推測KUCG1與腎癌細胞舒尼替尼耐藥有關(guān),其位于染色體Xq28區(qū)域,長度為54 092個核苷酸(圖1C)。TCGA數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn),與正常組織相比,腎癌組織中KUCG1表達明顯下調(diào)(圖1E)。

        圖1 KUCG1(LINC00850)與舒尼替尼耐藥有關(guān)Fig.1 KUCG1(LINC00850)is related to sunitinib resis?tance

        2.2 KUCG1表達下調(diào)誘導(dǎo)ccRCC對舒尼替尼的耐藥性為研究KUCG1對ccRCC細胞舒尼替尼耐藥性的影響,以769-P和786-O ccRCC細胞建立穩(wěn)定低表達KUCG1的細胞株(圖2A),CCK-8結(jié)果顯示,舒尼替尼以時間依賴的方式抑制腎癌細胞活力,而KUCG1低表達顯著提高兩種細胞對舒尼替尼的耐藥性,提高769-P和786-O細胞生存能力(圖2B)。舒尼替尼處理48 h后,對照組比KUCG1下調(diào)組出現(xiàn)明顯形態(tài)學(xué)改變,包括細胞極性消失、細胞膜收縮、細胞質(zhì)空泡化(圖2C)。提示KUCG1下調(diào)可促進腫瘤細胞增殖和生長,降低腫瘤細胞對舒尼替尼的敏感性。

        圖2 KUCG1表達下調(diào)誘導(dǎo)ccRCC細胞舒尼替尼耐藥性(×400)Fig.2 Down-regulation of KUCG1 expression induced sunitinib resistance in ccRCC cells(×400)

        2.3 KUCG1表達下調(diào)促進腎癌細胞侵襲,抑制其凋亡侵襲實驗結(jié)果顯示,KUCG1下調(diào),腎癌細胞侵襲細胞數(shù)明顯多于對照組(圖3A),提示KUCG1表達下調(diào)促進腫瘤細胞侵襲。采用流式細胞儀分析KUCG1下調(diào)對ccRCCs細胞凋亡的影響,結(jié)果顯示,KUCG1下調(diào),腎癌細胞凋亡率明顯下降(圖3B),提示KUCG1下調(diào)可抑制腎癌細胞凋亡。

        圖3 KUCG1表達下調(diào)增強腎癌細胞侵襲及抗凋亡能力(×400)Fig.3 Down-expression of KUCG1 enhanced invasion and anti-apoptosis ability of renal carcinoma cells(×400)

        2.4 KUCG1表 達 下 調(diào) 可 調(diào) 節(jié)PTEN/AKT/mTOR信號通路Western blot檢測KUCG1下調(diào)對PTEN/AKT/mTOR信號通路相關(guān)蛋白表達的影響,結(jié)果顯示,KUCG1下調(diào),腎癌細胞mTOR和p-AKT表達增加,PTEN表達降低(圖4)。KUCG1通過調(diào)節(jié)相關(guān)蛋白表達增強腎癌細胞增殖和侵襲,并增強其耐藥性。

        圖4 KUCG1下調(diào)后PTEN/AKT/mTOR信號通路相關(guān)蛋白表達Fig.4 Expressions of PTEN/AKT/mTOR signal-related proteins after KUCG1 down-regulation

        2.5 KUCG1通過上調(diào)MAGEA11表達促進腫瘤細胞增殖KUCG1前后1 Mb基因表達情況分析結(jié)果顯示,與未處理的腎癌769-P細胞相比,舒尼替尼耐藥的腎癌細胞MAGEA11表達明顯升高且變化最為顯著,786-O細胞株同樣表現(xiàn)出相同結(jié)果(圖5A),推測KUCG1可能通過調(diào)控MAGEA11表達影響腎癌細胞生物學(xué)行為。Western blot結(jié)果顯示,實驗組相比對照組細胞MAGEA11蛋白水平明顯升高(圖5B)。為進一步研究KUCG1基因下調(diào)后促進腫瘤細胞增殖的分子機制,采用siRNA下調(diào)實驗組細胞MAGEA11表達,并采用qPCR和Western blot驗證其MAGEA11下調(diào)結(jié)果(圖5B、C)。STRING數(shù)據(jù)庫查詢發(fā)現(xiàn),MAGEA11可通過調(diào)控AKT/mTOR信號通路影響腫瘤細胞生物學(xué)行為。Western blot檢測PTEN/AKT/mTOR信號通路發(fā)現(xiàn),MAGEA11下調(diào)后mTOR和p-AKT表達下降,PTEN表達上升(圖6)。表明KUCG1下調(diào)通過上調(diào)MAGEA11表達增強細胞活力,促進細胞增殖,并增強其耐藥性。

        圖5 KUCG1調(diào)控MAGEA11表達Fig.5 KUCG1 regulates expression of MAGEA11

        圖6 MAGEA11影響PTEN/AKT/mTOR信號通路相關(guān)蛋白表達Fig.6 MAGEA11 affects expressions of PTEN/AKT/mTOR signaling pathway related proteins

        2.6 MAGEA11表達下調(diào)腎癌細胞增殖、侵襲減弱,凋亡增強為驗證MAGEA11對腎癌細胞生物學(xué)行為的影響,采用siRNA-MAGEA11下調(diào)769-P腎癌細胞KUCG1下調(diào)組MAGEA11表達,CCK-8、侵襲和凋亡實驗結(jié)果顯示,MAGEA11表達下調(diào)后腎癌細胞增殖和侵襲能力較處理前明顯降低,凋亡明顯增強(圖7)。

        圖7 MAGEA11表達下調(diào)影響腎癌細胞生物學(xué)行為(×400)Fig.7 Down-regulation of MAGEA11 expression affects biological behavior of renal cell carcinoma(×400)

        3 討論

        本研究顯示,舒尼替尼以劑量依賴的方式抑制腫瘤細胞生存能力。KUCG1表達下調(diào)增強腫瘤細胞活力和對舒尼替尼的耐藥性。流式細胞術(shù)結(jié)果顯示,KUCG1下調(diào)后抑制腎癌細胞凋亡,可能依賴于細胞周期激活。G1/S期轉(zhuǎn)換過程中,周期蛋白依賴激酶(CDK)和細胞周期蛋白D和E結(jié)合維持細胞循環(huán)正常進行[15]。KUCG1下調(diào)可能促進細胞周期蛋白D和E表達,或與細胞周期蛋白/CDK復(fù)合物抑制劑表達降低有關(guān),促進細胞循環(huán)及細胞生長。

        KUCG1下調(diào)促進腫瘤細胞侵襲。顯微鏡下觀察細胞形態(tài)變化,表明藥物誘導(dǎo)細胞損傷。KUCG1下調(diào)可抵抗舒尼替尼殺傷效應(yīng)。舒尼替尼可通過抑制上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transi?tion,EMT)過程抑制腫瘤細胞增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移。EMT過程中,由于上皮鈣黏蛋白表達減少導(dǎo)致上皮細胞極性喪失,細胞間黏附減少,誘導(dǎo)腎癌細胞侵襲和轉(zhuǎn)移[16]。同時腫瘤細胞耐藥性與EMT密切相關(guān)。KUCG1可能通過促進EMT促進腫瘤細胞增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移和耐藥。

        晚期腎癌患者對靶向藥物產(chǎn)生耐藥性,目前臨床無有效治療方法。腫瘤對一線TKI藥物產(chǎn)生耐藥的可能機制包括:血管生成信號激活后血管再生;增加覆蓋的被膜細胞保護脈管系統(tǒng);改變腫瘤微環(huán)境及增強腫瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移加強脈管系統(tǒng)再生以及其他旁路信號激活[17-18]。因此,探索舒尼替尼耐藥的分子機制,尋找新的作用靶點是臨床研究重點。腫瘤細胞生長抑制是由于藥物介導(dǎo)的AKT、MAPK、STAT等信號通路被抑制[19]。PTEN低表達與舒尼替尼耐藥密切相關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn),KUCG1在舒尼替尼耐藥腎癌細胞中低表達。KUCG1表達下調(diào),PTEN表達被抑制,AKT/mTOR信號通路被激活,ccRCCs舒尼替尼的耐藥性增強。AKT/mTOR是經(jīng)典生存信號通路,與細胞活力密切相關(guān),而PTEN表達可抑制此通路。

        KUCG1對臨近編碼基因MAGEA11可能通過Cis調(diào)控機制進行調(diào)控,即KUCG1通過順式作用元件,包括增強編碼基因啟動子、增強子活性、調(diào)控序列和可誘導(dǎo)元件等激活轉(zhuǎn)錄和調(diào)控基因表達[20]。KUCG1可能通過形成多個RNP復(fù)合物或編碼微肽參與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控。lncRNA還可增強RNA聚合酶Ⅱ活性,此外,lncRNA調(diào)節(jié)miRNA表達,反過來抑制編碼基因和miRNA靶向結(jié)合[21]。lncRNA還可通過lncRNA-mRNA/miRNA相互作用調(diào)節(jié)腎細胞癌MAGEA11表達[22]。MAGEA11是腫瘤種系抗原,通過介導(dǎo)DNA低甲基化、血管形成和腫瘤轉(zhuǎn)移等多種途徑促進腫瘤細胞增殖生長及對多種化療藥物耐藥,并在黑色素瘤、前列腺癌和食管癌等多種腫瘤細胞中高表達[23-25]。且MAGEA11表達對于細胞自噬至關(guān)重要[26]。本研究發(fā)現(xiàn)KUCG1下調(diào)后兩種腎癌細胞株中MAGEA11表達明顯增加。為驗證MAGEA11表達對腎癌細胞特性的影響,直接利用siRNA敲減MAGEA11表達,MAGEA11表達下調(diào)后腫瘤細胞增殖、侵襲受抑制,表明KUCG1表達下調(diào)通過促進MAGEA11上調(diào)增強腎癌細胞活性,增強腎癌細胞耐藥性。

        KUCG1通過磷酸化和促進AKT信號傳導(dǎo)抑制細胞凋亡。KUCG1正向調(diào)節(jié)PTEN表達,反向調(diào)節(jié)p-AKT水平,而p-AKT和mTOR通過MAGEA11表達升高,因此,KUCG1通過調(diào)節(jié)MAGEA11表達影響PTEN/AKT/mTOR信號通路。而mTOR又可正向調(diào)節(jié)細胞周期蛋白D和E表達,從而促進細胞周期進展,促進細胞增殖[27]。因此,KUCG1通過MAGEA11調(diào)節(jié)PTEN/AKT/mTOR信號通路促進腫瘤細胞耐藥性。

        綜上,KUCG1通過促進細胞周期、抑制凋亡和促進AKT信號通路促進腎癌細胞增殖和侵襲,本研究證明KUCG1下調(diào)可降低腎透明癌細胞對舒尼替尼藥物的敏感性,降低藥物治療效果。KUCG1通過MAGEA11上調(diào)影響PTEN/AKT/mTOR信號通路。本研究證實,KUCG1可降低晚期腎癌患者臨床治療效果,為尋找耐藥靶點提供了新的思路,將通過臨床研究進一步驗證。

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