李翔,張利芳
(江蘇省蘇州市第九人民醫(yī)院,江蘇 蘇州 215200)
肺炎克雷伯菌(KP)是常見(jiàn)于人體呼吸道、消化道的革蘭陰性桿菌,也是醫(yī)院或社區(qū)獲得性感染的常見(jiàn)病原體[1?2]。碳青霉烯類抗菌藥物為治療KP的有效藥物,但臨床的不合理應(yīng)用使耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌(CRKP)的檢出率逐年遞增[3]。本研究中探討了CRKP的耐藥方式,以提高碳青霉烯類抗菌藥物的臨床合理用藥水平?,F(xiàn)報(bào)道如下。
儀器:VITEK2?Compact型全自動(dòng)微生物分析儀(法國(guó)生物梅里埃公司),配有藥物敏感性(簡(jiǎn)稱藥敏)試驗(yàn)卡片;抗菌藥物紙片(英國(guó)Oxoid公司);ABI7500型基因擴(kuò)增儀(美國(guó)ABI公司);HYDRASYS型蛋白電泳分析儀,C?880V型CO2孵箱,均購(gòu)自美國(guó)Sebia公司;HC?2062型高速冷凍離心機(jī)(安徽中科中佳科學(xué)儀器有限公司);HulaMixer?Sample Mixe型渦旋混勻器(美國(guó)賽默飛世爾科技有限公司)。
試藥:外排泵抑制劑PAβN(美國(guó)Sigma公司,批號(hào)為0001429016);瓊脂糖(批號(hào)為D31018),引物(批號(hào)為B01019),均購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司;Mueller?Hinton瓊脂(MHA)藥敏試驗(yàn)培養(yǎng)基(青島日水生物技術(shù)有限公司,批號(hào)為071123);標(biāo)志物DL 2000(批號(hào)為A1901B),Ex Taq DNA聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)試劑盒(批號(hào)為191148),均購(gòu)自北京基尼亞生物技術(shù)有限公司;細(xì)菌蛋白抽提液(美國(guó)賽默飛世爾科技有限公司,批號(hào)為2191785);肺炎克雷伯菌ATCC BAA1706(批號(hào)為491227),大腸埃希菌ATCC 25922(批號(hào)為561229),銅綠假單胞菌ATCC 27853(批號(hào)為550106),均購(gòu)自上海北諾生物科技有限公司;注射用美羅培南(日本住友商事株式會(huì)社,批號(hào)為201701023);注射用亞胺培南(默沙東<中國(guó)>有限公司,批號(hào)為S012103)。
選取我院2017年1月至2020年12月收治的非重復(fù)性CRKP感染患者的耐藥菌株97株,分別編號(hào)為1?97號(hào),均經(jīng)VITEK2?Compact型全自動(dòng)微生物分析儀分析確定對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物耐藥。
采用VITEK2?Compact型全自動(dòng)微生物分析儀對(duì)細(xì)菌進(jìn)行鑒定和分類,并對(duì)抗菌藥物的敏感性進(jìn)行初始檢測(cè),操作步驟按儀器說(shuō)明書進(jìn)行。部分抗菌藥物無(wú)藥敏試驗(yàn)卡片,參考美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)(CLSI)發(fā)布的《抗菌藥物敏感試驗(yàn)執(zhí)行標(biāo)準(zhǔn)第27版信息增刊》(簡(jiǎn)稱《標(biāo)準(zhǔn)》)中Kirby?Bauer(K?B)法進(jìn)行補(bǔ)充試驗(yàn),質(zhì)控菌株為肺炎克雷伯菌ATCC BAA1706、大腸埃希菌ATCC 25922與銅綠假單胞菌ATCC 27853[4]。
參考《標(biāo)準(zhǔn)》中瓊脂稀釋法測(cè)定分離菌的最低抑菌濃度(MIC),分別測(cè)定添加及未添加外排泵抑制劑PAβN(終質(zhì)量濃度為20 mg/L)的美羅培南和亞胺培南的MIC,兩者的測(cè)定質(zhì)量濃度均為0.06~128.00 mg/L,每個(gè)質(zhì)量濃度均接種10 000 cfu細(xì)菌。與未添加外排泵抑制劑PAβN相比,添加后的MIC提高4倍以上,即為細(xì)菌有外排泵機(jī)制[5]。
改良Hodge試驗(yàn):參考《標(biāo)準(zhǔn)》,將0.5麥?zhǔn)蠞岫鹊闹聻a性大腸埃希菌ATCC 25922用無(wú)菌生理鹽水稀釋10倍,均勻涂抹于瓊脂平板上,于中間位置貼放10 μg厄他培南紙片,接種環(huán)從紙片邊緣至平板外緣劃線接種待檢菌株,置35℃環(huán)境過(guò)夜培養(yǎng)。若次日厄他培南抑菌圈長(zhǎng)出矢狀生長(zhǎng)物,則視為待檢菌產(chǎn)碳青霉烯酶。
Carba NP試驗(yàn):取0.5%酚紅溶液2 mL,純水16.6 mL,10 mmol/L硫酸鋅溶液180 mL,置25~50 mL燒杯中,用10%鹽酸溶液或0.1 mol/L氫氧化鈉溶液調(diào)pH至7.7~7.9,作為A液;在A液中加入質(zhì)量濃度為6 mg/mL的亞胺培南溶液(無(wú)菌注射用水配制),作為B液。取2支微量離心管,分別標(biāo)記為a管和b管,均加入100μL細(xì)菌蛋白抽提液與1μL過(guò)夜培養(yǎng)的瓊脂平板接種環(huán)待測(cè)物,渦旋振蕩5 s,在a管中加入100μL A液,在b管中加入100 μL B液,渦旋,混勻,置35℃CO2孵箱中孵育2 h,每30 min查看并記錄顏色變化[6?7]。
采用煮沸法提取與純化細(xì)菌基因組DNA,以此為模板,采用PCR法擴(kuò)增碳青霉烯酶[肺炎克雷伯菌產(chǎn)碳青霉烯酶(KPC)、AmpCβ?內(nèi)酰胺酶(AmpC)類、新德里金屬β?內(nèi)酰胺酶1(NDM?1)、超廣譜β?內(nèi)酰胺酶(ESBLs)類]基因,即分別為blaKPC、blaAmpC類和blaNDM?1、blaESBls類。以1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)產(chǎn)物,經(jīng)凝膠成像系統(tǒng)分析,由生工生物工程(上海)股份有限公司專業(yè)人員測(cè)定擴(kuò)增產(chǎn)物的序列,并同GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列進(jìn)行比對(duì),以確認(rèn)擴(kuò)增的產(chǎn)物為靶基因片段及基因型[8]。
引 物 序 列:ERIC1為5′?ATGTAAGCTCCT?GGGGATTCAC?3′,ERIC2為5′?AAGTAAGTGACT?GGGGTGAGCG?3′。擴(kuò)增條件:95℃下預(yù)變性7 min,94℃下變性1 min,45℃下退火1 min,65℃下延伸4 min,30個(gè)循環(huán);65℃下延伸16 min,1個(gè)循環(huán);將擴(kuò)增的產(chǎn)物放入1.5%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,電泳條件為電壓100 V,時(shí)間100 min,Tris硼酸電泳緩沖液(20倍稀釋)[9]。
共分離出97株CRKP,且對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物的耐藥率均為100.00%;對(duì)氨基苷類、頭孢類、喹諾酮類抗菌藥物的耐藥率均超過(guò)85.00%;對(duì)四環(huán)素類抗菌藥物的耐藥率均低于25.00%。詳見(jiàn)圖1。
圖1 97株CRKP對(duì)臨床常用抗菌藥物的耐藥率Fig.1 Drug resistance rate of 97 CRKP strains to commonly used antibiotics in the clinic
93株CRKP的改良Hodge試驗(yàn)和CarbaNP試驗(yàn)結(jié)果均為陽(yáng)性,陽(yáng)性檢出率為95.88%;4株(編號(hào)分別為24,31,68,72號(hào))CRKP的CarbaNP試驗(yàn)結(jié)果為陽(yáng)性,而改良的Hodge試驗(yàn)結(jié)果為陰性;3株(編號(hào)分別為6,13,93號(hào))CRKP的改良Hodge試驗(yàn)及CarbaNP試驗(yàn)結(jié)果均為陰性。
97株CRKP中,blaKPC的檢出率為89.69%(89/97),且均為blaKPC?2型酶;blaNDM?1的檢出率為71.13%(69/97)。blaESBLs類耐藥基因中,blaSHV,bla?TEM,blaCTX?M的檢出率分別為96.00%,77.00%,61.00%;blaAmpC類耐 藥基因中,blaDHA,blaFOX,blaCTT的檢出率分別為100.00%,87.00%,61.00%;未檢出blaAAC,blaEBC,blaGES,blaMOX,blaOXA?48,blaSME,blaVEB,blaVIM。blaKPC,blaNDM?1,blaTEM在CRKP耐藥基因中更具代表性[10],其PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖見(jiàn)圖2。
M.Maker 1,4,7.陽(yáng)性菌珠2,5,8.陰性對(duì)照3,6,9.陽(yáng)性對(duì)照?qǐng)D2 CRKP部分耐藥基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果M.Maker 1,4,7.Positive strains 2,5,8.Negative control 3,6,9 Positive controlFig.2 Electrophoretogram of PCR amplification products of partial drug resistance genes of CRKP
9株CRKP(編號(hào)分別為3,18,25,30,39,58,75,86,94號(hào))有細(xì)菌外排泵機(jī)制,提示主動(dòng)外排泵參與了部分KP對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物的耐藥機(jī)制,9株菌株耐藥基因的檢出率均大于85%。
共發(fā)現(xiàn)9種類型的CRKP,參考文獻(xiàn)[11?12],判斷各菌株的基因分型,其中1型42株,4型15株,5型14株,6型、8型各6株,2型、7型各4株,3型、9型各3株。部分耐藥菌株的ERIC?PCR基因分型見(jiàn)圖3。
碳青霉烯類抗菌藥物在體內(nèi)外均對(duì)革蘭陰性桿菌有抑制作用,是臨床治療KP的首選藥物,但隨著應(yīng)用的增多,KP屬細(xì)菌對(duì)其耐藥的比例越來(lái)越高,部分治療多重耐藥KP感染有效的藥物(如亞胺培南、美羅培南等)已陸續(xù)出現(xiàn)耐藥現(xiàn)象,且呈不斷上升趨勢(shì)[7]。
本研究中從非重復(fù)性CRKP感染患者體內(nèi)分離出97株CRKP,其在對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物耐藥的同時(shí),對(duì)氨基苷類等其他抗菌藥物亦有不同程度的耐藥。雖對(duì)四環(huán)素類抗菌藥物耐藥率較低,但該類抗菌藥物毒副作用較大,長(zhǎng)期應(yīng)用可對(duì)患者的消化、泌尿、血液、中樞神經(jīng)等系統(tǒng)造成嚴(yán)重?fù)p害,并非為針對(duì)CRKP感染患者的首選藥物[13]。可見(jiàn),CRKP作為一種高耐藥、高毒力的多重耐藥菌,其有效抗菌藥物的選擇范圍較窄。
CRKP最主要的耐藥機(jī)制為產(chǎn)生碳青霉烯酶[14],水解青霉素類、頭孢類、碳青霉烯類等抗菌藥物。碳青霉烯酶在國(guó)內(nèi)以KPC常見(jiàn),也有耐亞胺培南(IPM)等。本研究中發(fā)現(xiàn),CRKP感染患者存在多重耐藥基因積聚共存及外排泵抑制現(xiàn)象,與文獻(xiàn)[15?16]中提出的高產(chǎn)碳青霉烯酶(以KPC?2型酶為主),產(chǎn)AmpC酶伴外膜孔蛋白缺失或表達(dá)下調(diào),主動(dòng)外排泵系統(tǒng)異常活躍等導(dǎo)致革蘭陰性菌對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物耐藥的論點(diǎn)類似。
M.Maker 1,7.1型2,3,6,9,10,12.2型4,5.3型8.4型11.5型圖3 CRKP部分耐藥菌株ERIC-PCR基因分型電泳結(jié)果M.Maker 1,7.Type 1 2,3,6,9,10,12.Type 2 4,5.Type 3 8.Type 4 11.Type 5Fig.3 Electrophoretogram of genotypes of ERIC-PCR of partial drug resistance strains of CRKP
本研究中采用改良的Hodge試驗(yàn)與CarbaNP試驗(yàn)檢測(cè)碳青霉烯酶表型,結(jié)果KPC?2型酶為CRKP產(chǎn)碳青霉烯酶的最主要亞型,這可能是導(dǎo)致CRKP對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物耐藥的主要機(jī)制。KPC?2型酶具有單獨(dú)致碳青霉烯類抗菌藥物耐藥形成,而不依賴于外膜孔蛋白缺失的作用,加之其基因位于質(zhì)粒轉(zhuǎn)座子上,經(jīng)可轉(zhuǎn)移的70 kb質(zhì)粒編碼,傳播高效[17]。ERIC?PCR同源性分析發(fā)現(xiàn)9種CRKP,其中1型為主要流行菌株,提示1型克隆株可能更易在本院流行傳播,醫(yī)務(wù)人員在嚴(yán)格規(guī)范使用抗菌藥物的基礎(chǔ)上,還應(yīng)加大醫(yī)院感染防控力度。