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        河南省白靈側(cè)耳菌株遺傳多樣性分析

        2022-02-14 10:50:44孔維威袁瑞奇康源春張玉亭周舒浩常曉超劉洋洋
        食藥用菌 2022年1期
        關(guān)鍵詞:白靈側(cè)耳種質(zhì)

        孔維威 袁瑞奇 康源春 張玉亭 周舒浩 常曉超 劉洋洋

        (河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物營養(yǎng)與資源環(huán)境研究所,河南 鄭州 450002)

        農(nóng)業(yè)種質(zhì)資源是保障國家糧食安全和重要農(nóng)副產(chǎn)品有效供給的戰(zhàn)略性資源。2020年,國務(wù)院辦公廳出臺“關(guān)于加強農(nóng)業(yè)種質(zhì)資源保護與利用的意見”,提出開展系統(tǒng)收集保護,實現(xiàn)應(yīng)保盡保,要強化鑒定評價,提高利用效率等。2021年河南省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳印發(fā)《河南省農(nóng)業(yè)種質(zhì)資源普查總體方案》,計劃利用3年時間在全省組織開展農(nóng)業(yè)種質(zhì)資源普查,摸清河南省農(nóng)作物、畜禽、水產(chǎn)和食用菌種質(zhì)資源家底。2019年河南省食用菌各類品種生產(chǎn)量折合55億袋以上,鮮菇產(chǎn)量達到540.94萬噸,產(chǎn)值397.70億元,產(chǎn)量和產(chǎn)值繼續(xù)居全國第一位[1]。出口創(chuàng)匯14.9億美元,占2019年全省農(nóng)產(chǎn)品出口額的69.63%[2]。

        白靈側(cè)耳(Pleurotus tuoliensis)[3,4]商品名為白靈菇,是我國具有自主知識產(chǎn)權(quán)和明確原產(chǎn)地的品種,也是最早被列入我國植物新品種保護名錄(第六批)的食用菌品種(2005年5月20日農(nóng)業(yè)部令第51號公布施行)。2019年全國白靈側(cè)耳產(chǎn)量為5.7881萬噸,比2018年增長3.67%[1,5]。白靈側(cè)耳雖已人工栽培多年,但工廠化栽培菌株的農(nóng)藝性狀和商品性狀還有待改進,原基誘導(dǎo)難、一致性低和生產(chǎn)周期較長是目前產(chǎn)業(yè)發(fā)展遇到的主要瓶頸問題。因此,加快選育白靈側(cè)耳工廠化生產(chǎn)優(yōu)良性狀新品種是當(dāng)務(wù)之急。

        菌株遺傳多樣性是育種改良的基礎(chǔ)。菌株遺傳多樣性分析的方法較多,張金霞等[6]研究發(fā)現(xiàn)白靈側(cè)耳的IGS1區(qū)域較保守,菌株間沒有多態(tài)性;IGS2區(qū)域較廣、變異多,是種內(nèi)遺傳多樣性分析和菌株鑒定的有效標記區(qū)域,IGS2結(jié)合限制性片段長度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)分析,準確性和可重復(fù)性好,是白靈側(cè)耳種內(nèi)遺傳多樣性和菌株鑒定鑒別的有效方法。本文廣泛收集河南省內(nèi)的白靈側(cè)耳菌株32個,采用拮抗反應(yīng)和IGS2-RFLP方法對其遺傳多樣性進行分析,以期為雜交選育白靈側(cè)耳新品種的親本選擇提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        供試材料見表1?,F(xiàn)保藏于河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物營養(yǎng)與資源環(huán)境研究所河南省食用菌種質(zhì)資源庫(Henan Mushroom Germplasm Resources Bank,HMGRB)。

        表1 白靈側(cè)耳供試菌株

        1.2 方法

        (1)拮抗反應(yīng)。不同菌株間區(qū)別性鑒定采用拮抗法[7]。

        (2)DNA提取。將低溫保存的菌種連續(xù)活化2次后接種于PDA培養(yǎng)基平板上培養(yǎng)10天,然后使用孔徑5 mm的打孔器打取10個菌種塊轉(zhuǎn)移至裝有100 mL PD液體培養(yǎng)基的250 mL三角瓶中,25 ℃下150 r/min培養(yǎng)7天。10 000 r/min離心收集菌絲,液氮速凍后-80 ℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆?。采用真菌基因組DNA快速抽提試劑盒(上海生工生物公司)提取DNA。

        (3)IGS2-PCR。擴增體系采用2X高保真PCR Mix預(yù)混液(上海生工生物公司)和Primer各1.5μL,Template約25 ng,用ddH2O補齊至50 μL。上游引物:5'-ACTGGCAGAATCAACCAGGTA-3',下游引物:5'-ACCGCATCCCGTCTGAT-3'。反應(yīng)條件:94 ℃變性4 min;94 ℃變性1 min,56 ℃復(fù)

        2 結(jié)果與分析

        2.1 親和性反應(yīng)

        不同菌株間存在拮抗反應(yīng),交界處菌絲一般呈現(xiàn)隆起型、溝型和隔離型3種反應(yīng)類型。本試驗結(jié)果表明,大部分白靈側(cè)耳菌株間都為隆起型,少部分菌株間是溝型,極少數(shù)出現(xiàn)隔離型的現(xiàn)象。Pt1、Pt5和Pt22這3個菌株相互間無拮抗反應(yīng)。

        2.2 IGS2-PCR分析

        由圖1可知,應(yīng)用IGS2片段的特異引物進行擴增,不同酶對供試菌株的IGS2-PCR產(chǎn)菌株間IGS2片段大小不同,數(shù)量在2~8條之間。

        圖1 白靈側(cè)耳供試菌株IGS2-PCR擴增圖譜

        2.3 IGS2-RFLP及聚類分析

        用HpaII、RsaⅠ和HaeIII等3個限制性內(nèi)切物進行酶切,結(jié)果(圖2)顯示每個菌株均存在3種酶的酶切位點,但酶切位點不同,各菌株電泳后產(chǎn)生的帶型圖譜也不同。3種限制性內(nèi)切酶酶切一共產(chǎn)生36個片段,其中有差異性的片段28個,占總帶數(shù)的77.8%。采用最遠鄰法進行聚類分析,構(gòu)建分子系統(tǒng)樹(圖3)。

        圖2 白靈側(cè)耳不同菌株IGS2-RFLP 電泳圖譜

        圖3 供試菌株的IGS2-RFLP聚類樹狀圖

        基于HpaII酶切的電泳圖譜聚類分析結(jié)果為,在相對距離10下,可以將32個菌株分為3組,其中1、2、3、4、5、6、7、10、11、13、14、15、16、18、23、25、27、28、31、32號菌株為I組,9、17、19、20、22、24、26、29、30號菌株為II組,8、12、21號菌株為III組?;赗saⅠ酶切和HaeIII酶切的電泳圖譜聚類分析結(jié)果表明,這2個酶切后I組菌株與HpaII酶切的聚類結(jié)果完全一致,差別在于29號菌株是屬于II組(RsaⅠ酶切),還是III組(HaeIII酶切)。組內(nèi)各菌株的聚類關(guān)系也略有差異。

        3 結(jié)論與討論

        目前我國已選育出一些白靈側(cè)耳栽培種,其中通過國審的有4個品種。從子實體形態(tài)上主要分為掌狀、扇狀、匙狀、馬蹄狀等。由于各單位引種途徑不一,引種后又自行命名,造成名稱比較混亂,在河南省尤為嚴重。IGS序列是核糖體RNA(rRNA)的重要組成元件,包括IGS(intergenic sparer)1和IGS2 這2個區(qū)域[8]。IGS序列的多態(tài)性研究發(fā)現(xiàn),白靈菇和香菇不同菌株或不同品種之間存在多態(tài)性,可以用于菌株鑒別[6,9]。趙夢然等[10]比較白靈側(cè)耳野生菌株的遺傳多樣性后發(fā)現(xiàn),多態(tài)性檢測效率最高的標記為ISSR,其次是IGS2-RFLP,最后是SCoT。3種標記中,SCoT和ISSR標記的聚類結(jié)果極其相似,均能較為準確地反映樣本的地理來源;IGS2-RFLP的標記效率較高,準確性和可重復(fù)性好,可用于菌株標準圖譜的制作,更適用于品種權(quán)保護中的菌株鑒定鑒別。

        本研究共收集河南省內(nèi)白靈側(cè)耳菌株32個,應(yīng)用拮抗反應(yīng)和IGS2-RFLP法對這些菌株進行遺傳多樣性分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)大多數(shù)菌株間具有拮抗反應(yīng),僅Pt1、Pt5和Pt22等3個菌株相互間無拮抗反應(yīng)。IGS2-RFLP法采用3種限制性內(nèi)切酶,對白靈側(cè)耳的IGS2擴增產(chǎn)物進行酶切,均具有良好的特異性、穩(wěn)定性和可重復(fù)性,酶切圖譜具豐富的多態(tài)性,不同菌株間有差異?;谏鲜鼋Y(jié)果對收集到的白靈側(cè)耳菌株遺傳多樣性進行分析,最終將這些菌株分為親緣關(guān)系較遠的3組,其中25號(國審品種中農(nóng)翅鮑)和32號(許白2號)菌株位于第I組,24號(國審品種中農(nóng)1號)菌株位于第II組,其余菌株分屬于三組之中。而菌株29號經(jīng)3個酶酶切后的聚類分析分組位于第II組或第III組。此結(jié)論為今后新品種雜交選育親本的選擇提供參考和選擇依據(jù)。

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