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        克隆單子葉植物啟動(dòng)子及功能驗(yàn)證

        2022-02-02 08:49:56盧凌霄高珊于洋王銀月鄒春野于鴻雪呂小飛
        種子科技 2022年24期
        關(guān)鍵詞:酶切位點(diǎn)原生質(zhì)擬南芥

        盧凌霄,高珊,于洋,王銀月,鄒春野,于鴻雪,呂小飛

        (遼源市農(nóng)業(yè)科學(xué)院,吉林 遼源 136200)

        1 材料

        1.1 植物材料

        常規(guī)水稻、哥倫比亞生態(tài)型(Columbia,Col)擬南芥(Arabidopsis thaliana)種子均由本實(shí)驗(yàn)室保存。

        1.2 質(zhì)粒與菌株

        中間載體pUC-19、黃色熒光融合瞬時(shí)表達(dá)載體pSAT6-EYFP 均由本實(shí)驗(yàn)室保存,pEASY-T5 cloning vector 購(gòu)于北京Transgen 公司,大腸桿菌Trans1-T1 感受態(tài)細(xì)胞購(gòu)于北京Transgen 公司。

        1.3 試劑盒

        PCR 擴(kuò)增所需引物均在上海生工生物工程公司合成,KOD FX 及rTaq 購(gòu)買(mǎi)于TOYOBO 生物技術(shù)公司,各種DNA 限制性?xún)?nèi)切酶、T4 連接酶均購(gòu)買(mǎi)于美國(guó)New England Biolabs(北京)公司,DNA Marker 和蛋白Marker 購(gòu)買(mǎi)于TaKaRa 公司。

        質(zhì)粒提取試劑盒購(gòu)于GeneStar 公司,DNA 膠回收試劑盒購(gòu)于Omega 公司。

        2 試驗(yàn)方法

        2.1 克隆啟動(dòng)子

        1)Act2-1啟動(dòng)子克隆。CTAB法提取水稻總DNA,NCBI檢索Os Actin2-1 序列(GenBank:EU259512.1 1 008 bp),設(shè)計(jì)引物,分段PCR 法擴(kuò)增目標(biāo)片段P1(880 bp)、P2(120 bp),膠回收片段P1、P2,T4 DNA 連接酶連接兩片段得到完整Actin2-1 啟動(dòng)子,克隆載體測(cè)序與目標(biāo)序列比對(duì)。啟動(dòng)子序列中存在一個(gè)PstI 酶切位點(diǎn),影響后續(xù)載體構(gòu)建,設(shè)計(jì)引物突變掉克隆所得片段中的PstI 酶切位點(diǎn),見(jiàn)表1。

        表1 設(shè)計(jì)引物序列

        2)Ubi 啟動(dòng)子改造。玉米Ubiquitin 啟動(dòng)子為實(shí)驗(yàn)室保存,序列中有一個(gè)EcoR I 酶切位點(diǎn),影響后續(xù)載體構(gòu)建,需設(shè)計(jì)引物將酶切位點(diǎn)鈍化,改造后的Ubi 啟動(dòng)子需進(jìn)行功能驗(yàn)證。

        2.2 啟動(dòng)子功能驗(yàn)證

        2.2.1 黃色熒光瞬時(shí)表達(dá)載體構(gòu)建

        利用 In-Fusion 方法構(gòu)建瞬時(shí)表達(dá)載體pACT-EYFP 和pUBI-EYFP,利用AgeI 和EcoR V 酶切位點(diǎn)以In-Fusion 無(wú)縫克隆方法將35S 啟動(dòng)子分別替換為克隆并改造得到的Act2-1 和Ubi 啟動(dòng)子,利用QIAGEN 大提質(zhì)粒試劑盒提取質(zhì)粒。

        2.2.2 原生質(zhì)體制備及瞬時(shí)轉(zhuǎn)化所需母液

        配制200 mL 0.8 mol/L 甘露醇,0.2 mol/L MES,1 mol/L CaCl2,1 mol/L KCl,2 mol/L MgCl2,5 mol/L NaCl,50 mL 10%BSA,滅菌室溫保存。

        2.2.3 配制工作液

        1)酶解液(20 mL):取0.2 mol/L MES 母液20 mL于70 ℃預(yù)熱3 min后,加入1.5%Cellulase R10、0.4%Macerozyme R10、0.4 mol/L mannitol、1 mol/L KCl 母液0.4 mL,55 ℃水浴10 min,冷卻后加入1 mol/L CaCl2200 μL、10%BSA 200 μL。

        2)W5 溶液(100 mL):取0.2 mol/LMES 1 mL、5 mol/L NaCl 6.16 mL、1 mol/L CaCl212.5 mL、1 mol/L KCl 500μL,加入滅菌的ddH2O 至100 mL。

        3)MMG 溶液(100 mL):取0.2 mol/L MES 2 mL、0.8mol/L mannitol 50 mL、2 mol/L MgCl21.5 mL,加入滅菌的ddH2O 至100 mL。

        4)WI 溶液(100 mL):取0.2 mol/L MES 2 mL、0.8 mol/L mannitol 62.5 mL、1 mol/L KCl 2 mL,加入滅菌的ddH2O 至100 mL。

        5)PEG 溶液(10 mL):稱(chēng)取PEG4 g、0.2 mol/Lmannitol 1 mL、1 mol/L CaCl21 mL,加入滅菌的ddH2O 8 mL,55 ℃水浴促進(jìn)溶解,提前1 h 配制。

        2.2.4 制備擬南芥原生質(zhì)體,并瞬時(shí)轉(zhuǎn)化表達(dá)載體

        1)剪取21 d 左右的未抽薹擬南芥葉片,用刀片將葉片切成細(xì)條,浸于5 mL 酶解液中,輕輕搖晃。

        2)放入25 ℃培養(yǎng)箱中,用錫箔紙包住避光酶解3 h 后形成綠色酶/原生質(zhì)體溶液,期間可以汲取少量液體在顯微鏡下觀察原生質(zhì)體狀態(tài)。

        3)加入W5 溶液5 mL,用75 μm 過(guò)濾篩過(guò)濾到圓底離心管中。

        4)使用水平低速離心機(jī),配平后100 rpm 離心2 min,小心吸出上清液。

        5)加入W5 溶液2 mL 重懸,冰上放置30 min,原生質(zhì)體會(huì)沉降至管底。

        6)小心吸出清液,加入MMG 溶液2 mL 重懸,按轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒數(shù)均勻地分到無(wú)菌的離心管中。

        7)按每100 μL 原生質(zhì)體細(xì)胞轉(zhuǎn)化1 μg 質(zhì)粒,將質(zhì)粒稀釋后加到原生質(zhì)體細(xì)胞中,輕輕混勻后,緩慢加入PEG 溶液110 μL(邊加邊混勻),避光放置10 min。

        8)加入W5 溶液400 μL,輕輕混勻后,終止轉(zhuǎn)化反應(yīng)。

        9)以離心力100 g 離心2 min,吸出上清液,加入WI 溶液1 mL 重懸,轉(zhuǎn)移到培養(yǎng)板中。

        10)25 ℃避光過(guò)夜孵育。

        11)取100 μL 溶液于激光共聚焦顯微鏡下觀察啟動(dòng)子啟動(dòng)表達(dá)熒光蛋白的情況。

        3 結(jié)果與分析

        3.1 Act2-1 啟動(dòng)子的克隆、改造及測(cè)序結(jié)果分析

        PCR 擴(kuò)增出的P1、P2 片段進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,見(jiàn)圖1(a),HindⅢ和BamHⅠ雙酶切中間載體pUC-19,與酶切處理過(guò)的P1、P2 片段連接,獲得pUC-Act,菌落PCR 和雙酶切驗(yàn)證,見(jiàn)圖1(b)和圖1(c)。

        使用突變PstI 位點(diǎn)引物PCR 擴(kuò)增,可分別得到830 bp 和210 bp 的兩個(gè)片段,見(jiàn)圖1(d),回收兩個(gè)片段作為模板擴(kuò)增得到突變了酶切位點(diǎn)的完整Act2-1啟動(dòng)子片段,回收片段連接到克隆載體pEASY-Blunt Zero上,進(jìn)行菌落PCR 和雙酶切驗(yàn)證,經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證獲得突變了PstI 位點(diǎn)完整Act2-1 啟動(dòng)子,見(jiàn)圖2。

        圖1 Act2-1 啟動(dòng)子的克隆

        圖2 Act2-1 啟動(dòng)子序列

        3.2 Ubi 啟動(dòng)子的改造及測(cè)序結(jié)果分析

        Ubi 啟動(dòng)子全長(zhǎng)2 035 bp,使用鈍化酶切位點(diǎn)EcoR I 引物擴(kuò)增兩片段大小分別為1 415 bp、651 bp,回收兩個(gè)片段作為模板,使用上下游引物第二輪擴(kuò)增出Ubi 啟動(dòng)子全長(zhǎng),連接到克隆載體上挑選陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序,獲得突變EcoR I 酶切位點(diǎn)的Ubi 啟動(dòng)子。

        3.3 黃色熒光瞬時(shí)表達(dá)載體構(gòu)建及啟動(dòng)子啟動(dòng)熒光蛋白表達(dá)能力觀察

        利用In-Fusion 方法構(gòu)建表達(dá)載體pACT-EYFP和pUBI-EYFP,大提質(zhì)粒。與攜帶35s 啟動(dòng)子的對(duì)照載體一起瞬時(shí)轉(zhuǎn)化到擬南芥原生質(zhì)體,激光共聚焦顯微鏡下觀察啟動(dòng)子是否能正常啟動(dòng)黃色熒光蛋白表達(dá)。對(duì)照35S::YFP 能夠正常表達(dá)熒光蛋白,經(jīng)克隆改造得到的Act2-1 和Ubi 啟動(dòng)子也均觀測(cè)到黃色熒光蛋白,見(jiàn)圖3,證明試驗(yàn)所得啟動(dòng)子具有啟動(dòng)蛋白表達(dá)功能。

        圖3 擬南芥原生質(zhì)體瞬時(shí)表達(dá)黃色熒光蛋白

        4 結(jié)論

        根據(jù)NCBI 檢索Os Actin2-1 序列,PCR 法克隆得到Actin2-1 啟動(dòng)子,與檢索序列同源性達(dá)100%,在此基礎(chǔ)上突變掉礙于下一步載體構(gòu)建的酶切位點(diǎn),得到新的Act2-1 啟動(dòng)子;在已有的玉米Ubiquitin 啟動(dòng)子基礎(chǔ)上使用PCR 法突變掉EcoR I 酶切位點(diǎn),使其便于下一步自有載體構(gòu)建體系的應(yīng)用。

        使用擬南芥原生質(zhì)體瞬時(shí)轉(zhuǎn)化Act2-1、Ubiquitin啟動(dòng)子構(gòu)建的黃色熒光瞬時(shí)表達(dá)載體,以黃色熒光蛋白基因作為報(bào)告基因,激光共聚焦顯微鏡下觀察瞬時(shí)轉(zhuǎn)化的原生質(zhì)體,可觀測(cè)到黃色熒光蛋白的表達(dá),證明克隆得到的新啟動(dòng)子具有啟動(dòng)功能,可以用于單子葉植物表達(dá)載體的構(gòu)建。

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