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        思茅松毛蟲2齡幼蟲腸道可培養(yǎng)細(xì)菌的多樣性

        2022-01-28 07:31:08包書軍李雕益李選文熊忠平
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年1期
        關(guān)鍵詞:思茅松毛蟲菌落

        包書軍, 熊 智, 李雕益, 李選文, 熊忠平, 羅 曼

        (1.西南林業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,云南昆明 650224;2.西南林業(yè)大學(xué)繼續(xù)教育學(xué)院,云南昆明 650224;3.西南林業(yè)大學(xué)生物多樣性學(xué)院,云南昆明 650224;4.西南林業(yè)大學(xué)林學(xué)院,云南昆明 650224)

        我國松毛蟲可分為7個(gè)屬82種,分別是松毛蟲屬()、云毛蟲屬、大毛蟲屬、小毛蟲屬、丫毛蟲屬、雜毛蟲屬、櫟毛蟲屬,而思茅松毛蟲屬于松毛蟲屬(),因最早在云南思茅地區(qū)發(fā)現(xiàn)而被命名為思茅松毛蟲,主要分布在我國四川、云南、廣東、江西、臺(tái)灣、安徽等省份,一年發(fā)生1~2代,以幼蟲危害最大,是我國南方重要松樹害蟲,主要危害松樹有思茅松、云南松、海南松、云南油杉、馬尾松和短葉松等,嚴(yán)重時(shí)可造成毀滅性災(zāi)害。

        思茅松毛蟲的防治方法主要包括:生物防治、物理防治、化學(xué)防治等。生物防治是近年常用效果較好的方法,主要是利用微生物、激素等方法進(jìn)行防治;萬鷹等利用白僵菌粉噴灑于有思茅松毛蟲的樹上,研究白僵菌對(duì)思茅松毛蟲的防治效果,結(jié)果顯示,白僵菌的防治效果相對(duì)于其他3種藥劑要慢,但防治效果持久。物理防治是利用燈光誘集成蟲使其接觸高壓電而死亡,或利用人工摘繭除卵等的方法?;瘜W(xué)防治是指利用化學(xué)藥劑殺滅害蟲的方法,通常使用的化學(xué)藥劑有50%馬拉硫磷乳劑、殺螟松乳劑等,每年的4—6月在大面積防治中使用濃度為20%殺滅菊酯較為適用。

        微生物研究一直是人們研究的熱點(diǎn),其中,昆蟲腸道微生物也是人們的研究焦點(diǎn)之一,且隨著測(cè)序技術(shù)的不斷提升和發(fā)展,對(duì)于微生物的識(shí)別更加迅速和準(zhǔn)確。昆蟲腸道微生物的數(shù)量和種類均非常多,且腸道微生物對(duì)機(jī)體的發(fā)育、生理、營養(yǎng)吸收等均有巨大影響。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        試驗(yàn)時(shí)間:2018年10月至2019年5月。試驗(yàn)地點(diǎn):云南省安寧市草鋪鎮(zhèn)森林地區(qū)(24°31′~25°6′ N,102°8′~102°37′ E),平均海拔1 968 m。

        試驗(yàn)樣本為思茅松毛蟲2齡幼蟲,根據(jù)安寧市森林的情況在采集地方圓1 km范圍內(nèi)隨機(jī)挑選10個(gè)樣品點(diǎn),每個(gè)樣品點(diǎn)采集10頭健康的2齡幼蟲,總計(jì)100頭,采集樣本的同時(shí)將樣本所在的樹枝帶回實(shí)驗(yàn)室,用于2齡幼蟲飼養(yǎng),為后續(xù)研究做準(zhǔn)備。

        1.2 分離培養(yǎng)基與試劑、儀器

        分離培養(yǎng)基:牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(NA):牛肉膏3 g,蛋白胨10 g,氯化鈉5 g,瓊脂15~20 g,蒸餾水定容至1 000 mL,pH值7.0~7.2,121 ℃滅菌20 min。

        主要試劑:培養(yǎng)基及生理生化鑒定所用分析純、化學(xué)試劑(西隴化工股份有限公司),Ezup 柱式細(xì)菌基因組DNA 抽提試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司],PCR擴(kuò)增體系試劑(碩擎生物科技有限公司)。

        主要儀器:YXQ-LS立式壓力蒸汽滅菌器(上海博訊實(shí)業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠)、AL204電子天平(Mettler-Toledo Group)、SW-CI超凈工作臺(tái)(上海博訊實(shí)業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠)、HHB11電熱恒溫培養(yǎng)箱(上海躍進(jìn)科技儀器廠)、Haier冷藏柜、HH-2數(shù)顯電子恒溫水浴鍋(金壇市丹瑞電器廠)DHG-9053A型、電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱(上海一恒科學(xué)儀器有限公司)、ZHWY-200B恒溫培養(yǎng)振蕩器(上海智城分析儀器制造有限公司)、Galanz微波爐、Midea電磁爐、70型離子交換純水器(上海南華醫(yī)療器械廠)、SZ-96自動(dòng)純水器(上海亞榮生化儀器廠)、FM130制冰機(jī)(GRANT)、微量移液器(2.5、10.0、50.0、200.0、1 000 μL)(芬蘭Finnpipette)、HBA-1960 PCR擴(kuò)增儀(MJ RESEARCH)、DYY-8C電泳儀及電泳槽(北京市六一儀器廠)、凝膠成像分析儀(美國Bio-Rad公司,Gel-Doc XR+)。

        1.3 腸道細(xì)菌的分離純化

        選取100頭健康的2齡幼蟲,試驗(yàn)前饑餓處理40 h即在恒溫22~24 ℃、恒濕80%~85%條件下,無菌水喂養(yǎng)幼蟲,40 h后待其排空體內(nèi)食物殘?jiān)筮M(jìn)行試驗(yàn)。將試驗(yàn)幼蟲置于冰上3~5 min,待其昏迷;采用70%乙醇擦拭幼蟲體表30 s,無菌水沖洗 2~3遍,0.1%HgCl棉球擦拭幼蟲體表10 s,無菌水沖洗4~5次,在超凈工作臺(tái)中將體表消毒好的幼蟲固定于無菌蠟盤上,使用滅菌后的細(xì)尖鉗將幼蟲腹部剖開,取出整個(gè)腸道,并立即用0.9%無菌NaCl溶液沖洗表面2次,然后將腸道取出放入無菌離心管中,并向離心管中加入1 mL PBS緩沖液研磨成勻漿,備用。

        吸取上述腸道勻漿1 mL置于9 mL PBS緩沖液中,稀釋成10,按照10倍梯度稀釋至10,吸取每個(gè)濃度稀釋液100 μL分別涂布于NA培養(yǎng)基中,每個(gè)梯度涂3個(gè)平板,作為試驗(yàn)組。取最后一次清洗的無菌水100 μL涂布于NA培養(yǎng)基上,作為試驗(yàn)空白對(duì)照組。將涂布均勻的培養(yǎng)平板倒置于37 ℃培養(yǎng)箱內(nèi),培養(yǎng)72 h后觀察空白對(duì)照是否有菌落形成,若無菌落長出,則選擇單菌落數(shù)在30~300的培養(yǎng)皿,根據(jù)涂有腸道內(nèi)容物懸液培養(yǎng)皿上單菌落的不同形態(tài)特征,挑選單菌落移至新的NA培養(yǎng)基平板上,采用分三區(qū)的劃線法進(jìn)行菌株純化,直至菌株形態(tài)基本一致,得到純菌株。將得到的菌種保藏于NA斜面培養(yǎng)基中,4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.4 2齡幼蟲腸道可培養(yǎng)菌株的形態(tài)觀察

        將經(jīng)分離純化得到的純菌株用平板劃線法接種于新的NA平板上,在37 ℃下培養(yǎng)24~48 h,待菌落長成后,對(duì)菌落進(jìn)行染色并參考《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》對(duì)菌落特征進(jìn)行描述。

        1.5 2齡幼蟲腸道可培養(yǎng)菌株的生理生化鑒定

        按照《現(xiàn)代微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)》、《微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)教程》等微生物生理生化鑒定的方法,對(duì)2齡幼蟲腸道細(xì)菌進(jìn)行生理生化鑒定。

        1.6 2齡幼蟲腸道細(xì)菌16S rDNA分子鑒定

        1.6.1 腸道細(xì)菌基因組DNA提取及PCR擴(kuò)增 在NA培養(yǎng)基上活化分離得到的純菌株,然后接種至液體培養(yǎng)基擴(kuò)大培養(yǎng)、離心、收集菌體,利用Ezup柱式細(xì)菌基因組DNA抽提試劑盒提取2齡幼蟲腸道細(xì)菌基因組DNA。用1.0%的瓊脂糖凝膠檢測(cè)提取出的細(xì)菌基因組DNA,得到的片段大小符合細(xì)菌基因組DNA后,再將檢測(cè)合格的DNA產(chǎn)物作為16S rDNA序列擴(kuò)增模板。擴(kuò)增引物選擇:正向引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和反向引物1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)。PCR擴(kuò)增體系為:25.0 μL的2×PCR MasterMix;3.0 μL的模板DNA;10.0 μmol/L 正向引物27F和反向引物1492R各1.0 μL;雙蒸水補(bǔ)充至50.0 μL。PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性1 min,56 ℃退火1 min,72 ℃延伸3 min,30 個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸5 min,-20 ℃保存。取 4.0 μL PCR擴(kuò)增后的產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè),將檢測(cè)合格的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。

        1.6.2 2齡幼蟲腸道細(xì)菌系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建 通過DNA MAN6.0軟件進(jìn)行矯正及拼接測(cè)得的序列,然后將拼接完成的16S rDNA序列在http://www.ncbi.nlm.nih.gov/中與GenBank數(shù)據(jù)庫中的序列進(jìn)行BLAST同源性比對(duì),選出與菌株相似度最高的序列,運(yùn)用軟件MEGA 7.0構(gòu)建Neighbor-Joining系統(tǒng)發(fā)育樹,判定其分類學(xué)關(guān)系。

        1.7 分離率與群落結(jié)構(gòu)多樣性分析

        (1)分離率與相對(duì)分離率,分別衡量的是2齡幼蟲腸道細(xì)菌豐富度和某種2齡幼蟲腸道細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)度。分離率指從樣品中分離純化得到的菌株數(shù)與全部樣本蟲數(shù)的比值;相對(duì)分離率指分離到的某種2齡幼蟲腸道細(xì)菌株數(shù)占分離到的總菌株數(shù)的百分率。

        (2)群落結(jié)構(gòu)多樣性分析

        多樣性指數(shù)的計(jì)算公式如下:

        ③Margalef豐富度指數(shù):=(-1)/ln;

        上述3個(gè)公式中,表示某個(gè)2齡幼蟲腸道細(xì)菌的種類數(shù),表示某個(gè)2齡幼蟲腸道細(xì)菌的總量,表示某種2齡幼蟲腸道細(xì)菌的相對(duì)分離率。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 2齡幼蟲腸道細(xì)菌的分離結(jié)果

        從100頭2齡幼蟲腸道中共分離得到115株細(xì)菌,分離率達(dá)115.00%。根據(jù)菌落的形態(tài)特征共有8個(gè)類群,整理編號(hào)得:N201~N208。

        2.2 2齡幼蟲腸道細(xì)菌形態(tài)特征

        對(duì)分離得到的8株細(xì)菌的菌落特征與革蘭氏染色結(jié)果進(jìn)行觀察,結(jié)果(表1)表明,8株菌株中多數(shù)菌株的革蘭氏染色結(jié)果呈陽性,僅有1株呈陰性。且大部分菌株為桿狀,僅有N207、N208為球狀,N202為擬球狀;大部分菌株邊緣整齊且不透明,只有N206、N207半透明;多數(shù)菌株表面光滑濕潤。

        表1 2齡幼蟲腸道細(xì)菌的菌落形態(tài)特征

        2.3 2齡幼蟲腸道細(xì)菌生理生化鑒定及多樣性分析

        經(jīng)過對(duì)生理生化指標(biāo)(表2)的聚類分析可知,在歐氏距離4.8左右處,可將8個(gè)細(xì)菌類群劃分為2個(gè)遺傳聚類組,N204自成一類,其他7個(gè)細(xì)菌類群為一類,其中,N201、N206屬于一類,N202、N203、N205、N207、N208屬于另一類(圖1)。

        表2 2齡幼蟲腸道可培養(yǎng)細(xì)菌的生理生化特征

        結(jié)合生理生化指標(biāo)、細(xì)菌的形態(tài)特征、菌落及顯微形態(tài)特征,查詢細(xì)菌鑒定手冊(cè)后,將分離到的8種細(xì)菌形態(tài),初步鑒定為,N201、N206均屬于腸桿菌屬sp.,N202、N207、N208為葡萄球菌屬sp.,N203、N203為芽孢桿菌屬sp.,N204為棒狀桿菌屬sp.,部分菌株因?yàn)榫N形態(tài)過于相似,需進(jìn)一步進(jìn)行后續(xù)分子生物學(xué)鑒定。

        由表1可知,115株2齡幼蟲腸道細(xì)菌中,葡萄球菌屬sp.(N202、N207和N208)相對(duì)分離率為48.00%,是思茅松毛蟲2齡幼蟲腸道細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)菌群。另外,思茅松毛蟲2齡幼蟲腸道細(xì)菌的Shannon多樣性指數(shù)、Simpson優(yōu)勢(shì)度指數(shù)、Margalef豐富度指數(shù)分別為2.052 6、0.868 2、1.475 3,說明思茅松毛蟲2齡幼蟲腸道細(xì)菌具有豐富的多樣性。

        2.4 2齡幼蟲腸道可培養(yǎng)細(xì)菌16S rDNA分析結(jié)果

        將所獲8種細(xì)菌形態(tài)2齡幼蟲腸道細(xì)菌16S rDNA序列在GenBank中注冊(cè),獲得GenBank登錄號(hào)。由表3可知,分離到的2齡幼蟲腸道細(xì)菌與相應(yīng)菌株的16S rDNA序列相似度在97%~99%。115株細(xì)菌隸屬于4個(gè)屬、8個(gè)類群,初步鑒定為,N201為阿氏腸桿菌,N202為木糖葡萄球菌,N203為枯草芽孢桿菌,N204為嗜甘氨酸棒狀桿菌,N205為阿氏芽孢桿菌,N206為腸桿菌屬sp,N207為科氏葡萄球菌,N208為表皮葡萄球菌,這些思茅松毛蟲2齡幼蟲腸道細(xì)菌均不能確定其真正的種屬地位,需要做進(jìn)一步研究以鑒定其分類學(xué)地位。

        表3 2齡幼蟲腸道細(xì)菌GenBank登錄號(hào)及最大相似菌株

        2.5 系統(tǒng)發(fā)育樹

        將2齡幼蟲腸道細(xì)菌的16S rDNA序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。由圖2可知,思茅松毛蟲2齡幼蟲腸道可培養(yǎng)細(xì)菌歸屬于3個(gè)大類,第一大類為厚壁菌門,分別為:芽孢桿菌屬sp.、葡萄球菌屬sp.;第二大類為變形菌門,為腸桿菌屬sp.;第三大類為放線菌門,為棒狀桿菌屬sp.。

        3 結(jié)論與討論

        思茅松毛蟲對(duì)思茅松等松科植物有嚴(yán)重危害,由于對(duì)松科植物的危害而對(duì)林業(yè)造成巨大的損失,對(duì)生態(tài)環(huán)境和人類生產(chǎn)生活造成巨大影響。本研究以思茅松毛蟲2齡幼蟲為研究材料,通過對(duì)2齡幼蟲腸道中的可培養(yǎng)細(xì)菌進(jìn)行菌落觀察、生理生化實(shí)驗(yàn)和16S rDNA同源性分析,共分離得到115株腸道可培養(yǎng)細(xì)菌,初步推測(cè)隸屬于4個(gè)屬、8個(gè)類群。通過對(duì)腸道細(xì)菌的相對(duì)分離率進(jìn)行分析,葡萄球菌屬的相對(duì)分離率最高,為48.00%,是2齡幼蟲腸道細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)菌屬。通過對(duì)其多樣性做一步分析,得到腸道可培養(yǎng)細(xì)菌具有豐富的多樣性。

        不同地域的思茅松毛蟲腸道細(xì)菌種類存在一定差異。本次試驗(yàn)樣品2齡思茅松毛蟲幼蟲采集地為云南安寧地區(qū),結(jié)果顯示2齡思茅松毛蟲腸道可培養(yǎng)細(xì)菌有115株,屬于sp.、sp.、sp.、sp.;張武先等利用傳統(tǒng)培養(yǎng)法從采自云南思茅地區(qū)的思茅松毛蟲2齡幼蟲腸道內(nèi)分離出了5株好氧細(xì)菌屬于sp.。

        同一區(qū)域不同齡期思茅松毛蟲腸道微生物種類不盡相同。李選文等從云南安寧采集的思茅松毛蟲6齡幼蟲,從腸道內(nèi)分離出104株菌,隸屬于芽孢桿菌屬、類芽孢桿菌屬、蒼白桿菌屬、短芽孢桿菌屬、微球菌屬、莫拉菌屬、棲水菌屬、土壤芽孢桿菌屬、葡萄球菌屬、普羅威登斯菌屬。康柳等從云南昆明采集健康的松毛蟲,實(shí)驗(yàn)室人工飼養(yǎng)至3齡然后在其腸道內(nèi)分離出11株細(xì)菌,分別屬于sp.、sp.、sp.、sp.、sp.。孫佑赫等從采自普洱地區(qū)的4齡幼蟲腸道內(nèi)分離出11株細(xì)菌,分別屬于sp.、sp.、sp.、sp.、sp.、sp.。王金華等從采自普洱的5齡幼蟲腸道內(nèi)分離出10株細(xì)菌,分別屬于sp.、sp.、sp.、sp.。孫佑赫等從采自普洱市的6齡幼蟲腸道內(nèi)分離出6株細(xì)菌,分別屬于sp.,sp.。馬艷芳等從采自普洱市的7齡幼蟲腸道內(nèi)分離出14株細(xì)菌,分別屬于sp.、sp.、sp.、sp.。

        昆蟲通常通過環(huán)境和食物獲取各類微生物,所以不同的生長環(huán)境及食物使幼蟲攝入體內(nèi)的細(xì)菌不同,從而影響幼蟲腸道細(xì)菌的種類。研究發(fā)現(xiàn)極端堿性條件不利于絕大多數(shù)細(xì)菌的生長,也有些細(xì)菌能在極端堿性條件下生活,如腸球菌能在pH值卻高達(dá)11~12的鱗翅目幼蟲中腸里生活,說明腸球菌可能以某種方式緩沖腸道極端pH值。本研究通過對(duì)2齡幼蟲的腸道細(xì)菌分離得到了包含球菌在內(nèi)的8個(gè)類群細(xì)菌,這為防治思茅松毛蟲提供了依據(jù)。

        隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,可以通過宏基因?qū)W技術(shù)直接提取腸道細(xì)菌的總DNA,進(jìn)而分析出整個(gè)腸道的細(xì)菌種類,使得對(duì)昆蟲的腸道微生物的研究更加方便。本次試驗(yàn)通過純培養(yǎng)技術(shù)分離得到的2齡幼蟲腸道細(xì)菌只是腸道細(xì)菌中很少的一部分,需要結(jié)合宏基因組技術(shù),才能得到較為全面的細(xì)菌類群。

        思茅松毛蟲是林業(yè)重要的害蟲,尤其是對(duì)松科植物危害十分嚴(yán)重,對(duì)其腸道微生物進(jìn)行研究,不僅可以補(bǔ)充昆蟲腸道微生物資源庫,還可以據(jù)此進(jìn)一步分析腸道細(xì)菌對(duì)昆蟲生長發(fā)育的影響,最終得到防治思茅松毛蟲的生物制劑,從而減少林業(yè)害蟲的危害。

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