程新杰,岳洪亮,張夢龍,施 偉,朱國永,代金英
(江蘇沿海地區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,江蘇 鹽城 224000)
稻瘟病被稱為水稻“癌癥”[1],是由稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)引起的真菌性病害,是最為嚴(yán)重的水稻病害之一,且稻瘟病的危害面積和危害程度較大,發(fā)病時(shí)會影響糧食產(chǎn)量甚至造成絕收[2]。全球每年由稻瘟病導(dǎo)致的經(jīng)濟(jì)損失約為660億美元[3]。因發(fā)病時(shí)期和部位不同,稻瘟病被分為苗瘟、葉瘟、節(jié)瘟和穗頸瘟等,其中尤以穗頸瘟對水稻生產(chǎn)的危害最大[4]。根據(jù)稻瘟病的發(fā)病條件,主要有以下防治方法:掌握防治適期,噴施相應(yīng)的藥劑;處理帶病稻草和種子消毒,減少菌源;稀疏播種,培育無病壯秧苗;種植不過于密集;合理施肥、灌水,適時(shí)烤田;選用抗病良種等。在稻瘟病發(fā)病時(shí),化學(xué)防治是最為快速有效的方法,但該方法對于環(huán)境危害巨大,不符合當(dāng)今生態(tài)農(nóng)業(yè)的發(fā)展目標(biāo)。
目前在水稻新品種審定中,稻瘟病抗性是不可或缺的評定標(biāo)準(zhǔn)。由于稻瘟病的生理小種具有高度變異的潛力,其新基因型的產(chǎn)生不可避免地降低對水稻中抗性基因的敏感度[5],同時(shí),稻瘟病菌會產(chǎn)生抗藥性,進(jìn)而使得化學(xué)農(nóng)藥的防治效果不斷降低,這也是優(yōu)良抗性品種在種植3~5年后抗性會逐漸喪失的原因[6]。因此,目前防治稻瘟病最安全有效且對環(huán)境友好的措施是挖掘新的抗稻瘟病基因,用來選育新的抗稻瘟病品種[7]。基于水稻稻瘟病的研究現(xiàn)狀與成果,本文主要總結(jié)了近年來水稻稻瘟病抗病機(jī)制的研究進(jìn)展,對該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)和難點(diǎn)進(jìn)行討論,并對未來的防控方向提供一定的思路,為今后的抗病育種工作提供一定的理論基礎(chǔ)。
隨著科技的進(jìn)步,科研人員對稻瘟病菌侵染過程的了解更為深入,侵染路徑也已被解析[8]。稻瘟病菌是半活體的營養(yǎng)型真菌,其侵染過程有2個(gè)階段:在侵染水稻的初期處于活體營養(yǎng)階段,在這一時(shí)期主要是抑制寄主的免疫反應(yīng),進(jìn)而定植在寄主細(xì)胞內(nèi);接著進(jìn)入死體營養(yǎng)階段,在這一時(shí)期會導(dǎo)致寄主細(xì)胞壞死。
在協(xié)同進(jìn)化過程中,水稻也同樣進(jìn)化出復(fù)雜的防衛(wèi)機(jī)制來應(yīng)對稻瘟病菌的侵染,其主要有2層先天免疫系統(tǒng),分別是病原菌相關(guān)模式分子誘發(fā)的免疫機(jī)制(PAMP-triggered immunity,PTI)與病原菌效應(yīng)分子誘發(fā)的免疫機(jī)制(effector-triggered immunity,ETI)[9]。這2種免疫系統(tǒng)均能夠誘導(dǎo)水稻產(chǎn)生稻瘟病抗病性,且這一免疫過程又被細(xì)分為3個(gè)步驟:首先是信號感知,病原菌中的PAMPs(pathogenassociated molecular patterns)或效應(yīng)分子被各種受體識別;第2階段是通過G蛋白、Ca2+流等將信號傳遞并放大之后,能夠進(jìn)一步激活絲裂原活化蛋白激酶和NADPH(還原性輔酶Ⅱ)氧化酶,進(jìn)而釋放活性氧;第3階段是誘導(dǎo)防衛(wèi)基因表達(dá),并且積累抗病原物的次級代謝產(chǎn)物,使得細(xì)胞壁加厚,最終導(dǎo)致侵入位點(diǎn)的細(xì)胞程序性死亡等[10-12]。
1.2.1 稻瘟病PTI天然免疫系統(tǒng)。PTI天然免疫系統(tǒng)又被稱為基礎(chǔ)抗性[13],稻瘟病菌分泌的PAMPs主要是被水稻細(xì)胞表面的模式識別受體(patternrecognition receptors,PRRs)識別。目前在擬南芥中,對于PTI防御機(jī)制已經(jīng)有了較為系統(tǒng)的研究。近年來研究人員對于水稻PTI機(jī)制的研究也取得了極大的突破。如flg22與flg22的受體OsFLS2,包括其介導(dǎo)的內(nèi)部信號通路等方面的研究均有所突破。flg22是一種細(xì)菌鞭毛蛋白,它的蛋白終端是由22個(gè)氨基酸組成的保守多肽,這一肽段具有很強(qiáng)的抗菌性,是鞭毛蛋白誘導(dǎo)植物產(chǎn)生抗性的重要結(jié)構(gòu)[14]。flg22與其受體OsFLS2結(jié)合之后,能夠有效地激活抗病結(jié)構(gòu),這不僅提高了水稻的抗病性,同樣也能夠從根本上減少水稻稻瘟病的發(fā)生[15]。
1.2.2 稻瘟病ETI天然免疫系統(tǒng)。這一系統(tǒng)被分為2個(gè)部分,一部分是稻瘟病抗性基因的有效克隆,另一部分是抗性基因R與無毒蛋白Avr作為介質(zhì)的ETI激活機(jī)制。將已克隆的抗性基因與無毒基因組合在一起后,能夠不斷調(diào)整ETI防御機(jī)制[16],不僅能夠使得水稻稻瘟病防御機(jī)制更好地發(fā)生,還能有效減少病蟲害的發(fā)生,提高稻米產(chǎn)量。闡述稻瘟病抗性基因與其對應(yīng)的無毒基因間的互作關(guān)系,是解析稻瘟病ETI防御機(jī)制的關(guān)鍵。
近年來,國內(nèi)外研究人員通過對水稻稻瘟病抗性基因進(jìn)行大量系統(tǒng)化的研究,使用分子標(biāo)記等方法定位了100余個(gè)稻瘟病主效抗性基因,目前已經(jīng)被克隆的基因有36個(gè),如表1所示。其中已克隆的稻瘟病抗性基因大部分位于第6和第11號染色體上,少量位于第1、第9、第12染色體上,同時(shí)第2、第4、第8號染色體上還各有1個(gè)抗性基因。第6號染色體上的抗性基因主要有Piz、Pi2、Pi9、Pizt、Pid2、Pid3、pigm、Pi5、Pi26等[17],第11號染色體上的抗性基因主要有Pia、Pik、Pi1、Pikm、Pikp、Pb1等。
表1 已克隆的抗稻瘟病基因信息
這些抗性基因不僅表型特征不同,其來源與抗病地區(qū)也不同,不同的抗性基因抗性譜也不同。而稻瘟病菌的高度多樣性和變異性等特點(diǎn),也是抗性基因多樣性的原因。Pigm是一個(gè)位于第6號染色體的廣譜性稻瘟病抗性基因,供體親本為谷梅4號,其與Pi2、Pi9、Piz-t、Pi26等基因同屬于一個(gè)基因家族或是互為復(fù)等位基因,但彼此之間的抗譜具有明顯差異。Pigm基因在粳稻中基本不存在,但對江蘇、安徽、湖北、廣東等地區(qū)的代表性稻瘟病菌種均有較好的抗性,統(tǒng)計(jì)表明,其對于來自世界各地的50余種菌株均表現(xiàn)出抗性[18]。Pi2抗菌譜也相當(dāng)廣,對來自我國13個(gè)地區(qū)的790余種菌株均表現(xiàn)出抗性[19]。Pi9同樣也是一個(gè)稻瘟病廣譜抗性基因,對21個(gè)稻瘟病小種具有抗性[20]。
穗頸瘟對于水稻危害最為嚴(yán)重,而Pb1所介導(dǎo)的抗性是持久性的,并且是成株期抗性和穗頸瘟抗性[21],這種抗性已被用于許多優(yōu)良品種中[22]。研究表明,在育種工作當(dāng)中,可通過選擇合適的基因組合來更好地達(dá)到對稻瘟病的抗性作用,如Pita+Pia或Pita+Pi3/5/i雙基因聚合的水稻品種均有高抗病的特性[4]。
目前已克隆的36個(gè)稻瘟病抗性基因?qū)τ诘疚敛‘a(chǎn)生抗性的生物學(xué)過程各有不同,根據(jù)蛋白結(jié)構(gòu)的不同被細(xì)分為4類:一是NBS-LRR(nucleotidebinding site and leucin-rich repeat)類蛋白,如Pi1、Pib、Pi9等29個(gè)抗性基因;二是RLK(receptor like kinases)類蛋白,如Pid2,主要通過單個(gè)氨基酸差異來區(qū)別抗感病基因;三是富含脯氨酸結(jié)構(gòu)域蛋白,如Pi21,主要通過蛋白功能的失活來產(chǎn)生抗性;四是富含ARM重復(fù)序列蛋白,如Ptr,其抗性與Pita相關(guān),且是單子葉植物所特有的基因[23]。
無毒基因作為一類能夠誘導(dǎo)植物產(chǎn)生抗病性的病原物遺傳因子,在稻瘟病菌與水稻植株產(chǎn)生相互作用的過程中,能夠轉(zhuǎn)錄翻譯成無毒蛋白,接著水稻中的R基因能夠識別相對應(yīng)的無毒蛋白,進(jìn)而產(chǎn)生抗性[45]。目前從稻瘟病菌中鑒定并克隆的無毒基因有12個(gè),分別是AvrPita、PWL1、PWL2、ACE1、AvrPiz-t、Avr-Pik/km/kp、Avrpi9、Avr-Pii、Avr-Pia、Avr-Pib、AvrPi54、AvrPi-CO39。已被克隆的無毒基因中,除ACE1外都編碼分泌蛋白,而ACE1不分泌但編碼聚酮合成酶[46]。
目前已成對的抗性基因和無毒基因有Pi-ta/AVR-Pita[47]、Piz-t/AvrPiz-t、Pi9/Avrpi9、Pi-33/ACE1、Pia/Avr-Pia、Pib/Avr-Pib、Pii/Avr-Pii、Pik/km/kp/Avr-Pik/km/kp、Pi-CO39/AvrPi-CO39、Pi54/AvrPi54。除Pi9/Avrpi9、Pi-33/ACE1、Pib/Avr-Pib互作關(guān)系未知外,絕大部分水稻稻瘟病抗性蛋白與無毒蛋白間的互作關(guān)系已被解析,可分為直接互作與間接互作。Piz-t/AvrPiz-t、Pii/Avr-Pii屬于間接互作,Pi-ta/AVR-Pita、Pia/Avr-Pia、Pik/km/kp/Avr-Pik/km/kp、Pi-CO39/AvrPi-CO39、Pi54/AvrPi54則屬于直接互作。
抗性蛋白與無毒蛋白直接互作有3種方式:一是符合經(jīng)典“基因?qū)驅(qū)W說”的一個(gè)抗病蛋白對應(yīng)一種無毒蛋白,Pi-ta與AVR-Pita[48]對應(yīng)這種互作關(guān)系;二是2種抗病蛋白成對出現(xiàn),且只對應(yīng)一種無毒蛋白,Pik-1和Pik-2與AVR-Pik之間對應(yīng)這一互作關(guān)系;三是2種抗病蛋白成對出現(xiàn),與多個(gè)無毒蛋白互作,如Os11gRGA4和Os11gRGA5對Pia的抗性都是必需的[49],但在防御反應(yīng)的過程中,僅RGA5-A與AVR-Pia或AVR1-CO39互作,并起到重要作用。
近些年來,由于分子生物學(xué)與生物信息學(xué)這2個(gè)學(xué)科的急速發(fā)展,水稻抗性基因的發(fā)掘鑒定、克隆及互作機(jī)制等方面的研究得到巨大進(jìn)步。通過分子標(biāo)記育種技術(shù)育成的抗病品種已經(jīng)成功應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)當(dāng)中。但是,隨著病原菌生理小種的不斷變異和種植環(huán)境的變化,單一稻瘟病抗性品種不足以應(yīng)對這些問題,因此需要不斷培育新的水稻稻瘟病抗性品種?;谝陨蠁栴},稻瘟病新基因的挖掘仍是水稻稻瘟病抗性分子研究的重要基礎(chǔ)?;谀壳暗难芯亢陀N現(xiàn)狀,筆者認(rèn)為還存在5個(gè)方面需要更深入的研究。1)分子育種缺乏廣泛的有效抵抗多種稻瘟病菌的抗性基因。雖然近年來分子育種發(fā)展迅速,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)并克隆了大量的抗性基因,但這些基因在田間的抗性作用難以預(yù)測,導(dǎo)致在育種過程中,難以將這些抗性基因運(yùn)用到相對應(yīng)的致病菌株上。2)還需要開發(fā)創(chuàng)制更高效、且能夠與抗性基因緊密連鎖的分子標(biāo)記,這對于育種工作中進(jìn)行抗性基因的應(yīng)用具有極大的幫助,能夠?qū)⒎肿佑N真正運(yùn)用到實(shí)際育種工作當(dāng)中。3)進(jìn)一步開展抗性基因與無毒基因互作的分子機(jī)理研究,挖掘新的抗稻瘟病基因,并通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)、基因編輯技術(shù)、單倍體技術(shù)等作物育種技術(shù),培育具有廣譜抗性的水稻新品種。4)對調(diào)控水稻稻瘟病抗性的不同路徑進(jìn)行深入研究,尋找更多安全有效的防治方法。5)在育種工作當(dāng)中,可嘗試選擇合適的基因組合進(jìn)行應(yīng)用,以達(dá)到事半功倍的效果,但對其抗病的廣譜性與持久性仍需要進(jìn)一步研究。