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        長(zhǎng)鏈非編碼RNA在乳腺癌中的研究進(jìn)展

        2022-01-01 02:27:32朱方園劉慧
        河南醫(yī)學(xué)研究 2022年12期
        關(guān)鍵詞:耐藥乳腺癌機(jī)制

        朱方園,劉慧

        (鄭州大學(xué)人民醫(yī)院/河南省人民醫(yī)院 乳腺外科,河南 鄭州 450003)

        乳腺癌是全球女性發(fā)病率最高的惡性腫瘤。據(jù)最新統(tǒng)計(jì),2020年全球約1 930萬癌癥新發(fā)病例,其中乳腺癌以226萬例位居新發(fā)病例之首,也是癌癥致死病例最多的惡性腫瘤之一[1],嚴(yán)重威脅著人類健康。因此,臨床上迫切需要新的生物標(biāo)志物及治療靶點(diǎn)改善患者預(yù)后。人類基因組有超過90%的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為非編碼RNA,在不同水平參與基因表達(dá)的調(diào)控,不僅調(diào)控生長(zhǎng)發(fā)育、器官功能等基本的生物學(xué)過程,也在整個(gè)人類疾病尤其是癌癥中扮演重要角色[2]。近年來越來越多的研究探索了長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在乳腺癌發(fā)生發(fā)展及診療中的作用,本文對(duì)此進(jìn)行綜述,為乳腺癌的診斷和治療提供新思路。

        1 lncRNA簡(jiǎn)介

        lncRNA是由獨(dú)立啟動(dòng)子RNA Pol Ⅱ轉(zhuǎn)錄的長(zhǎng)度大于200個(gè)核苷酸的非編碼轉(zhuǎn)錄本[2]。起初其被認(rèn)為是無功能的轉(zhuǎn)錄“噪音”,后被證明在多種生理、病理過程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用。lncRNA的來源主要有蛋白質(zhì)編碼基因的突變、染色體重排、串聯(lián)產(chǎn)生重復(fù)序列、可轉(zhuǎn)座元件的插入等。根據(jù)lncRNA相對(duì)于蛋白質(zhì)編碼基因的位置將其分為5類,即正義、反義、雙向、基因間、內(nèi)含子lncRNA。lncRNA可在轉(zhuǎn)錄前、轉(zhuǎn)錄后、翻譯、翻譯后等多個(gè)水平發(fā)揮作用。其機(jī)制主要有:(1)充當(dāng)miRNA的“海綿”,競(jìng)爭(zhēng)性阻礙其與靶mRNA的結(jié)合;(2)干擾鄰近基因的表達(dá);(3)改變蛋白質(zhì)定位從而調(diào)控基因的表達(dá);(4)激活轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控基因的表達(dá);(5)作為小RNA前體;(6)與mRNA相互作用影響相關(guān)mRNA轉(zhuǎn)錄后的翻譯;(7)產(chǎn)生內(nèi)源性siRNA[2]。

        2 lncRNA與乳腺癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)系

        2.1 致癌lncRNA

        2.1.1HOX轉(zhuǎn)錄反義RNA(HOX transcribed antisense RNA,HOTAIR) HOX轉(zhuǎn)錄反義RNA(HOTAIR)位于HOX基因上,是第1個(gè)被發(fā)現(xiàn)有反式作用的lncRNA,在乳腺癌原發(fā)灶及其轉(zhuǎn)移部位均過表達(dá)。敲除HOTAIR可抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,促進(jìn)細(xì)胞凋亡[3]。HOTAIR通過不同機(jī)制發(fā)揮促癌作用,可將多梳復(fù)合物抑制物2(PRC2)和組蛋白去甲基化復(fù)合物(LSD1/REST/CoREST)結(jié)合到基因組的特定靶基因上,從而導(dǎo)致組蛋白H3第27位賴氨酸(H3K27)三甲基化和組蛋白H3第4位賴氨酸(H3K4)二甲基化,轉(zhuǎn)移抑制基因表達(dá)下調(diào),從而促進(jìn)乳腺癌的轉(zhuǎn)移[4]。此外,HOTAIR還可作為miR-129-5p的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源性RNA降低其表達(dá),從而提高靶基因FZD的表達(dá),促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的增殖、遷移、侵襲和上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)[5]。

        2.1.2轉(zhuǎn)移相關(guān)肺腺癌轉(zhuǎn)錄本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1) MALAT1是從人染色體11q13轉(zhuǎn)錄而來長(zhǎng)度約為8 000 nt的高度保守lncRNA,最初被發(fā)現(xiàn)在轉(zhuǎn)移性非小肺癌細(xì)胞中高表達(dá),后被證明在乳腺癌、卵巢癌、宮頸癌、前列腺癌等多種癌組織中高表達(dá)。在乳腺癌細(xì)胞系和動(dòng)物模型中,使用反義寡核苷酸敲除MALAT1,細(xì)胞遷移受損,腫瘤進(jìn)展、轉(zhuǎn)移顯著下降,提示MALAT1與乳腺癌的侵襲性相關(guān)[6]。與動(dòng)物模型相同的是,MALAT1的高表達(dá)與乳腺癌腫瘤的大小、分期的增加以及不良預(yù)后相關(guān)[7]。從機(jī)制上來說,MALTA1可作為miR-182的“海綿”,調(diào)控MSLN及PIG-C的表達(dá),發(fā)揮促癌作用[8]。MALTA1可通過下調(diào)腫瘤抑制因子miR-145的表達(dá)發(fā)揮促血管生成的作用,從而促進(jìn)乳腺癌的發(fā)展[9]。Shao等[10]研究發(fā)現(xiàn),MALAT1過表達(dá)可抑制miR-101-3p,從而激活mTOR/PKM2通路,促進(jìn)乳腺癌的進(jìn)展。MALAT1可作為miR-26a/26b的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA,調(diào)節(jié)其靶基因ST8SIA4的表達(dá)從而發(fā)揮促癌作用[11]。Kim等[12]研究發(fā)現(xiàn),MALAT1通過與促轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)錄因子TEAD結(jié)合,阻止其發(fā)揮活性,發(fā)揮抑制癌轉(zhuǎn)移的作用。因此,MALAT1可通過不同機(jī)制發(fā)揮致癌、抑癌作用,需要更全面的分子生物學(xué)、體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步評(píng)估其作用,更精準(zhǔn)地應(yīng)用于乳腺癌的診治過程中。

        2.1.3H19 H19主要位于細(xì)胞質(zhì)中,其基因位于11號(hào)染色體的印跡區(qū)11p15.5,僅在母系遺傳的染色體上表達(dá),是H19基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。與正常組織相比,H19在乳腺癌組織中顯著高表達(dá),其表達(dá)水平與乳腺癌的發(fā)生、增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移和耐藥有關(guān)[13]。DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的異常表達(dá)引起了DNA高甲基化,并參與乳腺癌的發(fā)生發(fā)展,包括DNMT1、DNMT3a和DNMT3b,H19可通過與miR-152結(jié)合降低其對(duì)DNMT1的抑制,促進(jìn)了乳腺癌的侵襲和增殖[14]。H19作為miR-657的前體,可通過直接作用于miR-657降低泛素連接酶E3家族(c-Cbl和Cbl-b)的表達(dá),增加了表皮生長(zhǎng)因子受體和c-Met的激活并使其更加穩(wěn)定,導(dǎo)致Akt和Erk的持續(xù)激活,增強(qiáng)了乳腺癌細(xì)胞的增殖和遷移[15]。

        2.1.4其他類型 其他發(fā)揮促癌作用的lncRNA如lncRNA SNHG5可直接靶向作用于miR-299,增加BACH1基因的表達(dá),促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的增殖從而發(fā)揮促癌作用[16]。LINC02381可通過miR-1271-5p/FN軸激活PI3K/Akt通路促進(jìn)乳腺癌的進(jìn)展[17]。lncRNA SNHG6通過充當(dāng)miR-543的“海綿”,解除其對(duì)LAMC1/PI3K/Akt通路的抑制作用,從而促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的EMT及增殖和遷移,發(fā)揮促癌作用[18]。lncRNA PCAT7可通過激活ErbB/PI3K/Akt通路促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲[19]。

        2.2 抑癌lncRNA

        2.2.1X失活特異性轉(zhuǎn)錄本(X inactivation specific transcript,XIST) XIST長(zhǎng)約19 kb,定位于X染色體失活中心,由人類Xq13.2的Xist基因編碼,是女性細(xì)胞X染色體失活的主要調(diào)節(jié)因子,在人類細(xì)胞的分化、增殖和基因修復(fù)及腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移及侵襲等過程中發(fā)揮重要作用。研究表明,XIST在乳腺癌組織及癌細(xì)胞中表達(dá)均顯著降低,XIST的敲低可導(dǎo)致Akt磷酸化水平的升高及細(xì)胞活性的增加,且此作用可被Akt抑制劑削弱,提示XIST可通過抑制Akt的激活抑制細(xì)胞活性,從而發(fā)揮抑癌作用[20]。XIST還可作為miR-362-5p的“海綿”,調(diào)節(jié)靶基因UBAP1的表達(dá),發(fā)揮抑癌作用[21]。XIST還有抑制腦轉(zhuǎn)移的作用。Xing等[22]研究發(fā)現(xiàn),XIST的表達(dá)水平與乳腺癌患者的腦轉(zhuǎn)移呈負(fù)相關(guān),在異種移植模型中,沉默XIST促進(jìn)了XIST高表達(dá)的腦轉(zhuǎn)移灶的生長(zhǎng),進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),XIST表達(dá)的降低促進(jìn)了EMT,并且通過MSN介導(dǎo)的蛋白的穩(wěn)定性激活c-Met,從而增強(qiáng)了腫瘤細(xì)胞的干細(xì)胞特性。XIST的缺失還可增加外泌體miR-503的分泌,觸發(fā)M1-M2小膠質(zhì)細(xì)胞的極化,從而抑制T細(xì)胞增殖,促進(jìn)乳腺癌腦轉(zhuǎn)移[22]。

        2.2.2生長(zhǎng)停滯特異性轉(zhuǎn)錄物5(growth arrest specific transcript 5,GAS5) GAS5位于1q25.1,最初作為細(xì)胞生長(zhǎng)阻滯期潛在的腫瘤抑制基因從小鼠NIH 3T3細(xì)胞中分離出來。與正常組織相比,GAS5在乳腺癌組織中顯著低表達(dá)。細(xì)胞實(shí)驗(yàn)表明,GAS5可能通過自噬作用抑制細(xì)胞的增殖、侵襲和腫瘤形成[23]。GAS5還可競(jìng)爭(zhēng)性與miR-16a-5p結(jié)合,部分破壞miR-16a-5p異位表達(dá)介導(dǎo)的促癌作用,包括腫瘤的侵襲及下游FOXO1/PI3K/Akt信號(hào)通路的激活,從而抑制三陰性乳腺癌的進(jìn)展[24]。

        2.2.3其他類型 其他起抑癌作用的lncRNA如lncRNA MORT可通過下調(diào)其靶基因FGF1抑制乳腺癌的進(jìn)展[25]。lncRNA NORAD在乳腺癌組織及細(xì)胞中低表達(dá),過表達(dá)NORAD可抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,從機(jī)制上來說,NORAD可競(jìng)爭(zhēng)性抑制miR-155-5p,上調(diào)其靶基因SOCS1的表達(dá)而發(fā)揮抑癌作用[26]。Zhang等[27]研究發(fā)現(xiàn),lncRNA IGF2-AS可通過調(diào)節(jié)IGF2的活性,抑制下游PI3K/Akt/mTOR致癌信號(hào)通路,從而發(fā)揮抑癌作用。

        3 lncRNA與乳腺癌的診斷及預(yù)后判斷

        乳腺癌早期診斷、治療以及對(duì)復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移病灶的監(jiān)測(cè)是改善患者預(yù)后的主要措施。目前對(duì)早期病灶的篩查方法主要有超聲檢查、乳腺X線攝影檢查及乳腺M(fèi)RI等。血清腫瘤標(biāo)志物CA153、CA125、CEA、CA199、AFP等亦可用于乳腺癌的篩查。對(duì)復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移病灶的監(jiān)測(cè)主要有各部位彩超、CT、MRI以及上述血清腫瘤標(biāo)志物等,但敏感性及特異性差。臨床上仍需要敏感度高、特異性強(qiáng)的用于乳腺癌診斷與預(yù)后判斷的指標(biāo)。lncRNA不僅在乳腺癌的發(fā)生發(fā)展中起作用,而且在乳腺癌的診斷與預(yù)后判斷中有重要意義。El-Ashmawy等[28]研究發(fā)現(xiàn),乳腺癌患者血液中l(wèi)ncRNA-ATB的表達(dá)水平遠(yuǎn)高于對(duì)照組,提示檢測(cè)外周血lncRNA在乳腺癌的篩查中具有一定的應(yīng)用價(jià)值。Fan等[29]通過對(duì)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)分析發(fā)現(xiàn)4種lncRNA預(yù)測(cè)了乳腺癌患者的總生存情況,可作為乳腺癌患者的獨(dú)立預(yù)后標(biāo)志物。此外,研究者還利用GEO數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建了基于多種lncRNA的模型以預(yù)測(cè)乳腺癌患者的無病生存情況[30]。miRNA-155的過表達(dá)可促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的遷移和侵襲。在三陰性乳腺癌中,lncRNA-NEF的表達(dá)量低,對(duì)miRNA-155的抑制作用減弱,與乳腺癌的不良預(yù)后相關(guān)[31]。

        4 lncRNA與乳腺癌的治療

        4.1 lncRNA與乳腺癌化療MALAT1在乳腺癌細(xì)胞中高表達(dá)且與不良預(yù)后相關(guān),敲低MALAT1可增加乳腺癌細(xì)胞對(duì)紫衫類和阿霉素類化療藥物的敏感性,提示MALAT1與乳腺癌對(duì)紫衫類和阿霉素類藥物的耐藥相關(guān)[32]。GAS5可通過競(jìng)爭(zhēng)內(nèi)源RNA與miR-221-3p競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合其靶基因DDK2,進(jìn)而抑制Wnt/β-catenin通路,逆轉(zhuǎn)對(duì)阿霉素耐藥,此外GAS5過表達(dá)可誘導(dǎo)順鉑耐藥[23]。XIST可通過ceRNA機(jī)制與miR-200c-3p結(jié)合上調(diào)其靶基因ANLN的表達(dá),從而導(dǎo)致癌細(xì)胞對(duì)阿霉素耐藥[33]。lncRNA-HOTAIR的敲除通過PI3K/Akt/mTOR通路降低了乳腺癌細(xì)胞對(duì)阿霉素的耐藥性[34]。

        4.2 lncRNA與乳腺癌靶向治療Dong等[35]研究發(fā)現(xiàn),在耐曲妥珠單抗的乳腺癌細(xì)胞中TINCR的表達(dá)水平顯著上調(diào),敲低TINCR可逆轉(zhuǎn)耐藥。從機(jī)制上來說,TINCR可通過競(jìng)爭(zhēng)內(nèi)源RNA與miR-125b結(jié)合,上調(diào)靶基因HER-2的表達(dá),從而誘導(dǎo)癌細(xì)胞對(duì)曲妥珠單抗耐藥[35]。lncRNA ZNF649-AS1可通過與多聚嘧啶串結(jié)合蛋白1(polypyrimidine Tract Binding protein 1,PTBP1)結(jié)合,提高ATG5基因的轉(zhuǎn)錄活性,進(jìn)而誘導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞對(duì)曲妥珠單抗耐藥[36]。lncRNA SNHG14可通過調(diào)控H3K27的乙酰化作用而調(diào)控PABPC1基因的表達(dá),從而誘導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞耐曲妥珠單抗[37]。Dong等[38]研究發(fā)現(xiàn),lncRNA AGAP2-AS1過表達(dá)可通過激活NF-κB通路,上調(diào)MyD88基因的表達(dá),從而誘導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞耐曲妥珠單抗。

        4.3 lncRNA與乳腺癌內(nèi)分泌治療細(xì)胞周期蛋白D1(cyclin D1)是驅(qū)動(dòng)癌細(xì)胞增殖的致癌蛋白,與乳腺癌患者對(duì)他莫昔芬耐藥有關(guān)。lncRNA DILA1通過與Thr286直接作用抑制cyclin D1在Thr286的磷酸化并抑制其降解,導(dǎo)致乳腺癌患者cyclin D1蛋白過表達(dá),從而導(dǎo)致乳腺癌患者耐他莫昔芬[39]。lncRNA CYTOR作為miR-125a-5p的“海綿”,通過競(jìng)爭(zhēng)內(nèi)源RNA機(jī)制,提高血清反應(yīng)因子的表達(dá),激活Hippo及絲裂原相關(guān)蛋白激酶信號(hào)通路,促進(jìn)了乳腺癌細(xì)胞在他莫昔芬治療后的存活,誘導(dǎo)耐藥[40]。H19在耐他莫昔芬的乳腺癌細(xì)胞及乳腺癌組織中過表達(dá)。體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)均證實(shí)敲低H19可提高乳腺癌細(xì)胞對(duì)他莫昔芬的敏感性,從機(jī)制上來說,H19可通過H19/SAHH/DNMT3B軸誘導(dǎo)自噬的激活,從而誘導(dǎo)抗他莫昔芬[41]。HOTAIR還可被ER直接抑制,其過表達(dá)促進(jìn)了非配體依賴性ER的活性,導(dǎo)致他莫昔芬耐藥[42]。

        4.4 lncRNA與乳腺癌放射治療放射治療作為乳腺癌保乳術(shù)后、晚期乳腺癌中的關(guān)鍵治療方法,在乳腺癌綜合治療中扮演著重要角色。lncRNA與乳腺癌放療敏感性密切相關(guān)。邱楊等[43]研究發(fā)現(xiàn),R05532、NR-015441、NR-033374 3種lncRNA在乳腺癌細(xì)胞中的表達(dá)明顯升高,且其表達(dá)水平的升高與癌細(xì)胞的放療抵抗性相關(guān),提示lncRNA可作為放療抵抗的預(yù)測(cè)分子。HOTAIR可與miR-449b-5p結(jié)合,促進(jìn)HSPA1A的表達(dá),從而降低乳腺癌放療敏感性[44]。Lai等[45]研究發(fā)現(xiàn),CCAT1下調(diào)后,可降低miR-148b的表達(dá),提高乳腺癌對(duì)放療的敏感性。

        5 總結(jié)與展望

        lncRNA在乳腺癌發(fā)生發(fā)展的作用可分為促癌作用及抑癌作用,可通過充當(dāng)miRNA的“海綿”吸附miRNA,從而抑制其對(duì)靶基因的活性,通過與蛋白質(zhì)或其他RNA相互作用、調(diào)節(jié)基因表達(dá)、調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)發(fā)育及分化等方式影響乳腺癌的發(fā)生發(fā)展過程。lncRNA在乳腺癌的診斷、預(yù)后及復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移判斷中具有巨大潛力,但距臨床應(yīng)用仍有較大距離,需要更系統(tǒng)的研究為臨床應(yīng)用提供依據(jù)。癌細(xì)胞耐藥是乳腺癌進(jìn)展及復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的主要原因,是治療過程中的主要障礙。lncRNA不僅在化療、內(nèi)分泌治療、靶向治療等全身治療的耐藥中發(fā)揮作用,而且影響著乳腺癌患者的放療敏感性。其機(jī)制主要有競(jìng)爭(zhēng)內(nèi)源RNA、誘導(dǎo)自噬作用、調(diào)節(jié)基因表達(dá)等。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,越來越多的lncRNA被證實(shí)在乳腺癌的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用,使其有望成為乳腺癌新的治療靶點(diǎn)。但目前關(guān)于lncRNA在乳腺癌中的研究仍處于起步階段,其具體作用機(jī)制尚不明確,且對(duì)其研究仍處于基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)階段,臨床試驗(yàn)較少。在未來,對(duì)lncRNA作用機(jī)制更深入的研究及臨床試驗(yàn)的開展有望使得lncRNA真正應(yīng)用于臨床。

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