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        致對(duì)蝦肝胰腺壞死病副溶血弧菌熒光定量PCR 檢測(cè)方法的建立

        2021-12-15 13:57:40陳平亞張亮亮吳少榮黃紀(jì)徽王綏家吳山楠
        廣東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年11期
        關(guān)鍵詞:弧菌對(duì)蝦探針

        陳平亞,張亮亮,吳少榮,黃紀(jì)徽,王綏家,吳山楠

        (??诤jP(guān)技術(shù)中心,海南 ???570311)

        【研究意義】對(duì)蝦急性肝胰腺壞死?。ˋcute Hepatopancreatic Necrosis Disease,AHPND)是一種細(xì)菌性病害,通常在放苗35 d 左右暴發(fā),病死率高,曾造成我國(guó)海南、廣東、福建和廣西對(duì)蝦養(yǎng)殖場(chǎng)大面積發(fā)病。該病一般在高溫干旱季節(jié)的高鹽、高堿養(yǎng)殖池中具有較高的發(fā)病幾 率[1]。斑節(jié)對(duì)蝦(Penaeus monodon)、凡納濱對(duì)蝦(Litopenaeus vannamei)和中國(guó)對(duì)蝦(Fenneropenaeus chinensis)都是 AHPND 的易感種群[2]。患病對(duì)蝦出現(xiàn)空腸空胃或腸斷節(jié),肝胰腺萎縮或腫大、呈紅褐色或發(fā)白,甲殼變軟等癥狀,死亡率極高。AHPND 的組織學(xué)病理特征是肝胰腺上皮細(xì)胞脫落,由于血細(xì)胞活動(dòng)形成黑色素沉積,在該病晚期肝胰腺內(nèi)的黑點(diǎn)更加明顯,并有大量血細(xì)胞聚集[3-4]。AHPND 病原菌是一種攜帶PVA1 毒素質(zhì)粒的嗜鹽海洋性副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus,VpAHPND)。嗜鹽海洋性副溶血性弧菌與已知的副溶血性弧菌分離株的基因不同,這種新菌株攜帶一個(gè)或多個(gè)染色體外PVA1 質(zhì)粒。并非所有副溶血弧菌都表現(xiàn)出AHPND 致病性[5],PVA1 質(zhì)粒攜帶編碼毒素蛋白的基因卻能夠?qū)е翧HPND。因此依據(jù)PVA1 質(zhì)粒設(shè)計(jì)特異性引物和探針對(duì)嗜鹽海洋性副溶血性弧菌的檢測(cè)十分必要。

        【前人研究進(jìn)展】對(duì)VpAHPND全基因組測(cè)序發(fā)現(xiàn),其攜帶了約 69 kb 大小的毒力質(zhì)粒,包含一組共軛轉(zhuǎn)移基因和兩個(gè)質(zhì)粒啟動(dòng)基因,是一種自傳遞的質(zhì)粒[6-7]。毒力質(zhì)粒具備質(zhì)粒解離后致死系統(tǒng),可防止質(zhì)粒在后代細(xì)胞中發(fā)生丟失,這種毒性質(zhì)??赏ㄟ^(guò)接合傳播,并可在受體中永久遺傳[8]?;蚯贸蜃匀蝗狈ir毒素基因,可使菌株明顯喪失致病能力,因此推斷Pir 毒素可能是AHPND 的主要致病因子。該質(zhì)粒能編碼表達(dá)轉(zhuǎn)座酶、類病毒蛋白PirA、pirB等毒素蛋白質(zhì),pirB毒素主要決定副溶血弧菌的毒力,PirA致病力相對(duì)較弱[9]。AHPND 質(zhì)粒攜帶株的質(zhì)??截悢?shù)在很低的情況下分泌的毒素對(duì)對(duì)蝦的致病性很高,說(shuō)明毒素蛋白的分泌不取決于該質(zhì)粒的拷貝數(shù)[10]。具有pirB基因但缺失PirA基因的突變菌不會(huì)引起AHPND 病害,但對(duì)對(duì)蝦仍有40%的致病性[11-12]。

        【本研究切入點(diǎn)】本研究針對(duì)pirB基因設(shè)計(jì)特異性引物和探針,對(duì)AHPND 進(jìn)行檢測(cè)。由于甲殼動(dòng)物缺乏特異性免疫機(jī)制,AHPND 缺乏有效的防治措施[13],因此及早檢測(cè)和診斷水產(chǎn)動(dòng)物是否被感染,并采取相應(yīng)措施防止該病毒繼續(xù)擴(kuò)散,是水產(chǎn)養(yǎng)殖減少損失的有效途徑?!緮M解決的關(guān)鍵問(wèn)題】AHPND 的常規(guī) PCR 檢測(cè)方法是以pirAvp毒力基因?yàn)榘谢騺?lái)檢測(cè)VpAHPND,通過(guò)檢測(cè)pirA毒力基因拷貝數(shù)實(shí)現(xiàn)對(duì)VpAHPND的定量檢測(cè),從而分析病原菌的侵染途徑,但pirA毒力基因的分子檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性強(qiáng)度低,本試驗(yàn)以pirB毒力基因?yàn)榘谢蚪?shí)時(shí)熒光PCR 方法,以期有效檢測(cè)VpAHPND。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        供試菌株由海口海關(guān)技術(shù)中心動(dòng)物實(shí)驗(yàn)室分離保存,包括VpAHPND-HK190423 株、單增李斯特菌Listeria monocytogenes、糞 腸球菌Enterococcus faecalis、金黃色葡萄球菌Staphylococcus aureus、福氏志賀氏菌Shigella flexneri、副溶血性弧菌Vibrio parahaemolyticus、大腸埃希氏菌Escherichia coli、阪崎腸桿菌Enterobacter sakazakii、傷寒沙門(mén)氏菌Salmonella enteritidis、溶藻弧菌Vibrio alginolyticus、河流弧菌Vibrio fluvialis、創(chuàng)傷弧菌Vibrio vulnificus、哈氏弧菌Vibrio harveyi等。對(duì)蝦樣品從??谑兄苓厡?duì)蝦養(yǎng)殖場(chǎng)采集,包括45 份凡納濱對(duì)蝦、57 份斑節(jié)對(duì)蝦和42 份中國(guó)對(duì)蝦。

        試驗(yàn)主要試劑:Taq酶、dNTP 等試劑購(gòu)自TaKaRa(大連)公司;細(xì)菌基因組DNA 提取試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒和膠回收試劑盒購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司;感受態(tài)細(xì)胞DH5α、Pmd18-T-Simple Vector、限制性內(nèi)切酶和T4 連接酶購(gòu)自大連寶生物公司;3%APW 培養(yǎng)基、TCBS、營(yíng)養(yǎng)瓊脂購(gòu)于北京陸橋技術(shù)公司。試驗(yàn)主要儀器:ABI ViiATM7 實(shí)時(shí)定量 PCR 儀、北京六一DYY-6C 型電泳儀、英國(guó)UVItec 公司凝膠成像系統(tǒng)。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1pirB基因特異性引物、探針設(shè)計(jì) 從GenBank 上獲得VpAHPND菌株pirB基因序列,應(yīng)用Oligo6.0 軟件設(shè)計(jì)引物和探針。引物pirBF:5'-TTCATATTCACCTGCTGTTGG-3',pirBR:5'-ACGATTTCGACGTTCCCCAA-3';TaqMan 探針:5'-FAM-ACTATATTGCTACAGGTACGG AAGATGA-TAMRA-3'。引物和探針由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

        1.2.2 巢式PCR擴(kuò)增 質(zhì)粒AP4-1引物:F1:5'-ATGAGTAACAATATAAAACATGAAAC-3';R1:5'-ACGATTTCGACGTTCCCCAA-3'。質(zhì)粒AP4-2引物:F2:5'-TTGAGAATACGGGACGTGG G-3';R2:5'-GTTAGTCATGTGAGCACCTTC-3'。反應(yīng)體系為:10×PCR buffer 2.0 μL,AP4-1上下游引物(10 μmol/L)各2 μL,dNTP(10 mmol/L)4 μL,TaqDNA聚合酶 1.0 μL,模板DNA 4 μL,加ddH2O補(bǔ)至25 μL。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃ 3 min;95 ℃ 30 s、56 ℃ 30 s、71 ℃ 90 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃ 4 min。取第一步的PCR產(chǎn)物,進(jìn)行第二步nested-PCR。反應(yīng)體系為:10×PCR buffer 3.0 μL,AP4-2上下游引物(10 μmol/L)各1 μL,dNTP(10 mmol/L)4 μL,TaqDNA聚合酶0.5 μL,第一步PCR產(chǎn)物 4 μL,加ddH2O補(bǔ)至25 μL。擴(kuò)增程序?yàn)椋?5 ℃ 3 min;95 ℃ 30 s、56℃30 s、72 ℃ 90 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃ 2 min。

        1.2.3pirB基因標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒構(gòu)建 根據(jù)pirB基因序列,設(shè)計(jì)特異性引物克隆pirB基因。采用 Primer 6.0引物設(shè)計(jì)軟件,設(shè)計(jì)帶酶切位點(diǎn)的特異性引 物,F(xiàn):5'-CGGGATCCATGACTAACGAATACG TTGTAAC-3'(下劃線部分為BamHⅠ酶切位點(diǎn)),R:5'-CCGCTCGAGCTACTTTTCTGTACCAAATTC ATCG-3'(下劃線部分為XohⅠ酶切位點(diǎn))。以提取的VpAHPND菌株 DNA 為模板,使用上述引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,反應(yīng)體系(25 μL):2 ×PremixTaq12.5 μL,上、下游引物各1.0 μL(10 μmol/L),模板2.0 μL,ddH2O 8.5 μL。擴(kuò)增程序:94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,57 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃ 5 min。將含有目的基因片段的PCR 產(chǎn)物和載體用BamH Ⅰ和XohⅠ酶切,T4 連接酶連接到pMD18-T 載體中制備重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化到感受態(tài)大腸埃希菌DH5α,涂在含有氨芐青霉素鈉的LB瓊脂平板上,挑單個(gè)獨(dú)立菌落接種至LB培養(yǎng)基中,搖床震蕩培養(yǎng)14 h。經(jīng)質(zhì)粒提取試劑盒回收、純化,送生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。將測(cè)序結(jié)果正確的重組質(zhì)粒作為陽(yáng)性外參對(duì)照。質(zhì)粒拷貝數(shù)按照公式計(jì)算:拷貝數(shù)(拷貝/μL)=質(zhì)粒濃度(g/μL)× 6.02 × 1023/質(zhì)粒分子量,質(zhì)粒分子量=堿基對(duì)平均分子量(660)×重組質(zhì)粒總長(zhǎng)度(2692+1172),測(cè)得拷貝數(shù)為2.3×107拷貝/μL。

        1.2.4pirB基因?qū)崟r(shí)熒光PCR 反應(yīng)條件優(yōu)化以2.3×107拷貝/μL 標(biāo)準(zhǔn)品DNA 為模板,在56~65 ℃范圍內(nèi),以1 ℃梯度進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增,以獲得最低循環(huán)數(shù)(Ct)值和較高的相對(duì)熒光強(qiáng)度增加值(ΔRn)時(shí)的退火溫度。采用引物不同終濃度(0.1~0.6 μmol/L)與探針不同終濃度(0.10~0.50 μmol/L)組合進(jìn)行熒光定量PCR,以獲得最低的Ct 值和較高的ΔRn 時(shí)的引物和探針濃度組合。反應(yīng)體系補(bǔ)充ddH2O 至25 μL。擴(kuò)增程序:94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s、57 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃ 5 min。選取ΔRn 值最大且所用引物和探針濃度最小為反應(yīng)體系。

        1.2.5 熒光定量PCR 的特異性、靈敏度、重復(fù)性試驗(yàn) 以VpAHPND菌株、單增李斯特菌、糞腸球菌、金黃色葡萄球菌、福氏志賀氏菌、副溶血性弧菌、大腸埃希氏菌、阪崎腸桿菌、傷寒沙門(mén)氏菌、溶藻弧菌、河流弧菌、創(chuàng)傷弧菌、哈氏弧菌等病原體作為陰性對(duì)照菌株,并用ddH2O 作為無(wú)模板空白對(duì)照驗(yàn)證熒光PCR 法檢測(cè)副溶血性弧菌pirB基因的特異性。

        對(duì)已知拷貝數(shù)含有目的擴(kuò)增片段的PMD18-pirB重組質(zhì)粒進(jìn)行10 倍梯度稀釋,以各梯度質(zhì)粒為模板進(jìn)行熒光PCR 檢測(cè),確定該方法對(duì)靶基因的最低檢出限。

        設(shè)計(jì)4 組樣品,分別取108、107、106、105濃度的VpAHPND菌株P(guān)MD18-pirB重組質(zhì)粒進(jìn)行PCR 試驗(yàn),每組4 次組內(nèi)重復(fù),測(cè)Ct 值求其平均值和標(biāo)準(zhǔn)差S,計(jì)算各組變異系數(shù)CV,以檢測(cè)的Ct 值變異系數(shù)(標(biāo)準(zhǔn)偏差/重復(fù)值的平均數(shù))初步評(píng)估該方法的重復(fù)性。

        1.3 對(duì)蝦樣品熒光RT-PCR 方法的應(yīng)用

        分別取3 種對(duì)蝦0.5 g 鰓和肝胰腺組織于1.5 mL 離心管中,加入0.5 mL 滅菌生理鹽水后研磨勻漿,按照基因組DNA 快速提取試劑盒按說(shuō)明書(shū)提取總DNA 作為模板。用建立的TaqMan 探針熒光定量PCR 進(jìn)行檢測(cè),同時(shí)采用世界動(dòng)物衛(wèi)生組織(OIE)推薦的套式PCR 法檢測(cè)樣品,檢測(cè)結(jié)果與熒光探針?lè)ㄟM(jìn)行比較。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 克隆載體的構(gòu)建

        以VpAHPND菌株提取的DNA 為模板,經(jīng)PCR獲得的目的片段用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),獲得pirB基因的特異性條帶(1 172 bp,圖1)?;厥占兓瘮U(kuò)增PCR 產(chǎn)物并與pMD18-T 克隆載體連接獲得重組克隆質(zhì)粒pMD18-T-pirB,目的基因和重組克隆質(zhì)粒同時(shí)用BamH Ⅰ和XohⅠ進(jìn)行酶切、T4 連接酶連接后轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞DH5α中進(jìn)行擴(kuò)增,篩選陽(yáng)性克隆子pMD18-T-pirB,并對(duì)陽(yáng)性克隆載體進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證,經(jīng)BamH Ⅰ/XohⅠ雙酶切鑒定,有一條大小約1 200 bp的片段,與目的片段大小一致,另一條大小約2 600 bp 的載體片段,與克隆載體pMD18-T 大小一致(圖2)。

        圖1 pirB 基因擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.1 PCR amplification products of pirB gene

        圖2 pMD18-T-pirB 質(zhì)粒酶切鑒定Fig.2 Identification of pMD18-T-pirB plasmid

        2.2 熒光定量PCR 反應(yīng)條件的優(yōu)化

        引物和探針濃度篩選試驗(yàn)結(jié)果表明,采用0.5 μmol/L 引物和0.2 μmol/L 探針進(jìn)行檢測(cè),獲得的Ct 值最小且熒光增加值較大,因此確定引物和探針的最佳濃度分別為0.5、0.2 μmol/L。對(duì)熒光定量PCR 反應(yīng)體系中其余各組分濃度進(jìn)行優(yōu)化,最終確定優(yōu)化后的副溶血性弧菌pirB熒光PCR 反應(yīng)體系(25 μL)為:Probe qPCR Mix 10 μL,上、下游引物各1.0 μL,探針1.0 μL,模板2 μL,用滅菌ddH2O 補(bǔ)足至25 μL。反應(yīng)程序:94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s、57 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃ 5 min。在每次延伸結(jié)束時(shí)收集熒光信號(hào)。

        2.3 熒光定量PCR 特異性分析

        用所建立的RT-PCR 檢測(cè)方法對(duì)VpAHPND菌株、單增李斯特菌、糞腸球菌、金黃色葡萄球菌、福氏志賀氏菌、副溶血性弧菌、大腸埃希氏菌、阪崎腸桿菌、傷寒沙門(mén)氏菌、溶藻弧菌、河流弧菌、創(chuàng)傷弧菌、哈氏弧菌等病原菌進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果顯示只有VpAHPND菌株出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,而其他對(duì)照菌株和空白對(duì)照均未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線。說(shuō)明建立的熒光定量PCR 法對(duì)VpAHPND的檢測(cè)具有很強(qiáng)的特異性(圖3)。

        圖3 TaqMan PCR 方法特異性分析Fig.3 Specific analysis of TaqMan PCR method

        2.4 pMD18-T-pirB 質(zhì)粒RT-PCR 靈敏度分析

        用ddH2O將2.3×107拷貝/μL的pMD18-TpirB質(zhì)粒作10倍系列稀釋,取各個(gè)稀釋度作熒光PCR檢測(cè)確定其最低檢出限,結(jié)果顯示在pMD18-T-pirB質(zhì)??截悢?shù)為2.3×101時(shí),Ct值為34.27,表明該檢測(cè)方法至少能檢測(cè)到2.3個(gè)質(zhì)??截悢?shù)(圖4)。為保證檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,在實(shí)際檢測(cè)中以 Ct值 35為界限,若檢測(cè)樣品的Ct值≤35,且有擴(kuò)增曲線,則判為VpAHPND陽(yáng)性;Ct值>35,且有擴(kuò)增曲線,則重復(fù)1次,如結(jié)果一致判為VpAHPND陽(yáng)性;Ct 值>35,重復(fù)結(jié)果未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,判為VpAHPND陰性。

        圖4 TaqMan PCR 方法靈敏性分析Fig.4 Sensitivity analysis of TaqMan PCR method

        2.5 pMD18-T-pirB 質(zhì)粒RT-PCR 重復(fù)性分析

        對(duì)樣品進(jìn)行組間重復(fù)性試驗(yàn),組內(nèi)重復(fù)性分析分別選取108、107、106、105/μL 濃度的pMD18-T-pirB質(zhì)粒,按照程序進(jìn)行PCR 試驗(yàn),結(jié)果見(jiàn)圖5。根據(jù)4 次組內(nèi)重復(fù)計(jì)算其平均值和標(biāo)準(zhǔn)差,變異系數(shù)CV介于0.45 %~0.69 %之間(表1),組內(nèi)重復(fù)性良好,穩(wěn)定性強(qiáng)。

        圖5 熒光定量PCR 組間重復(fù)試驗(yàn)分析Fig.5 Intra repeatability test analysis of real-time PCR

        表1 熒光定量PCR 組間重復(fù)試驗(yàn)分析Table 1 Intra repeatability test analysis of real-time PCR

        2.6 熒光定量PCR 方法的應(yīng)用

        應(yīng)用建立的RT-PCR 方法對(duì)采集的45 份凡納濱對(duì)蝦、57 份斑節(jié)對(duì)蝦和42 份中國(guó)對(duì)蝦樣品進(jìn)行VpAHPND檢測(cè),分別檢出陽(yáng)性樣品19、7、6 份,陽(yáng)性率分別為24.4%、12.3%、14.2%。檢測(cè)結(jié)果與OIE 推薦的套式PCR 法檢測(cè)結(jié)果一致,說(shuō)明該方法檢測(cè)實(shí)際樣本具有較高可靠性。

        3 討論

        通過(guò)基因組測(cè)序發(fā)現(xiàn),一些非副溶血性弧菌屬的AHPND 致病原被確定攜帶PVA1 質(zhì)粒,如哈維氏弧菌(Vibrio harveyi)、歐文斯氏弧菌(Vibrio owensii)和坎貝氏弧菌(Vibrio campbellii)[14-15],說(shuō)明這些毒力基因能夠被傳播到不同的弧菌種類中,并且質(zhì)?;虻慕Y(jié)構(gòu)表明pirA和pirB基因的缺失或獲得可通過(guò)水平基因轉(zhuǎn)移的轉(zhuǎn)位或同源重組而發(fā)生流動(dòng),因此AHPND 可能不僅可由副溶血弧菌引起,也能由攜帶 PVA1 質(zhì)粒的其他弧菌屬引起[16],因此根據(jù)PVA1 質(zhì)粒設(shè)計(jì)特異性引物和探針減少了檢測(cè)結(jié)果出現(xiàn)假陰性的概率。

        試驗(yàn)取病蝦肝胰腺組織在3%APW 培養(yǎng)肉湯中增菌后,提取DNA 后擴(kuò)增不出陽(yáng)性條帶,而直接取病蝦肝胰腺組織提取DNA 后,能夠擴(kuò)增出陽(yáng)性條帶。副溶血弧菌廣泛存在于環(huán)境中,推測(cè)可能是樣品中的其他副溶血弧菌在增菌過(guò)程中逐漸取代了VpAHPND菌株成為優(yōu)勢(shì)菌株,致使毒素基因很難再被檢測(cè)到[17]。本試驗(yàn)在對(duì)病蝦臨床樣品的VpAHPND檢測(cè)時(shí)選擇直接對(duì)肝胰腺組織提取DNA 作為模板。對(duì)本試驗(yàn)擴(kuò)增的所有陽(yáng)性片段經(jīng)過(guò)測(cè)序,所得序列有98.7%同源性,因此這些菌株可能都起源于一個(gè)單一克隆。應(yīng)用建立的RTPCR 方法對(duì)采集的45 份凡納濱對(duì)蝦、57 份斑節(jié)對(duì)蝦和42 份中國(guó)對(duì)蝦樣品進(jìn)行VpAHPND檢測(cè),檢出陽(yáng)性樣品32 份,檢測(cè)結(jié)果與OIE 推薦的套式PCR 法檢測(cè)結(jié)果一致。

        開(kāi)展AHPND 診斷,最精確的采樣部位是腸道等器官[18],但發(fā)病前鰓可能有更靈敏的病原菌檢出,發(fā)病高死亡率期間,肝胰腺是最靈敏的可檢測(cè)組織,而在發(fā)病后期,除了肝胰腺和腸道外,也可選擇肌肉組織作為樣本[19]。本試驗(yàn)針對(duì)蝦鰓、肝胰腺、腸胃等不同部位取樣進(jìn)行檢測(cè),鑒別在水體傳播AHPND 過(guò)程中不同部位的感染過(guò)程。

        AHPND 的常規(guī)PCR 檢測(cè)方法是以pirA毒力基因?yàn)榘谢騺?lái)檢測(cè)VpAHPND,通過(guò)檢測(cè)pirA毒力基因拷貝數(shù)實(shí)現(xiàn)對(duì)VpAHPND的定量檢測(cè)[20],從而分析病原菌的侵染途徑,但pirA毒力基因的分子檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性強(qiáng)度低,本試驗(yàn)以pirB毒力基因?yàn)榘谢蚪?shí)時(shí)熒光PCR 方法,結(jié)果表明該方法能有效檢測(cè)VpAHPND。

        4 結(jié)論

        本試驗(yàn)針對(duì)對(duì)蝦急性肝胰腺壞死病病原菌副溶血性弧菌建立了PCR 擴(kuò)增方法,根據(jù)其質(zhì)粒保守序列設(shè)計(jì)了特異性引物及探針,優(yōu)化了PCR 反應(yīng)的退火溫度、引物及探針濃度等參數(shù),能夠有效檢測(cè)目標(biāo)基因。當(dāng)pirB基因標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒濃度范圍為 2.3×101~2.3×107拷貝/μL 時(shí),標(biāo)準(zhǔn)曲線具有良好的線性關(guān)系。該方法靈敏度高,最低檢測(cè)限為2.3 拷貝/μL;特異性強(qiáng),與對(duì)蝦其他病原菌無(wú)交叉反應(yīng);重復(fù)性好,重復(fù)試驗(yàn)變異系數(shù)為0.45%~0.69%。可在1 h 內(nèi)完成對(duì)蝦樣品的實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè),臨床檢測(cè)結(jié)果與世界動(dòng)物衛(wèi)生組織推薦的套式PCR 法檢測(cè)結(jié)果一致,可用于臨床對(duì)蝦樣品的VpAHPND檢測(cè)。及早檢測(cè)和診斷水產(chǎn)動(dòng)物是否感染急性肝胰腺壞死病并采取相應(yīng)措施防止該病菌擴(kuò)散,有利于水產(chǎn)養(yǎng)殖疾病的提前預(yù)警,是水產(chǎn)養(yǎng)殖減少損失的有效途徑。

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