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        訓(xùn)練免疫在相關(guān)疾病中的研究進(jìn)展

        2021-12-11 04:40:08王經(jīng)琳任昊楨施曉雷
        關(guān)鍵詞:糖酵解表觀編程

        蘇 可,王經(jīng)琳,任昊楨,施曉雷

        南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬鼓樓醫(yī)院肝膽外科,江蘇 南京 210008

        傳統(tǒng)觀點認(rèn)為只有適應(yīng)性免疫才能建立免疫記憶,但近幾年發(fā)現(xiàn)固有免疫也具備這種特征。在缺乏適應(yīng)性免疫的生物體中,先天免疫系統(tǒng)可增強(qiáng)對再感染的抵抗力,這種現(xiàn)象被稱為“訓(xùn)練免疫(trained immunity,TI)”或“先天免疫記憶”[1-2]。TI是由外源性或內(nèi)源性損傷引起的先天免疫細(xì)胞的長期功能性重編程,并導(dǎo)致在細(xì)胞恢復(fù)到非激活狀態(tài)后,對非特異性刺激的次級反應(yīng)發(fā)生增強(qiáng)或減弱的改變,進(jìn)而產(chǎn)生環(huán)境、時間調(diào)節(jié)的反應(yīng)。重要的是,TI 代表了先天免疫細(xì)胞而不是特定的轉(zhuǎn)錄或功能程序的長期適應(yīng)的概念[3],它基于兩個主要支柱,細(xì)胞的表觀遺傳重新編程和新陳代謝重新編程,通過表觀遺傳重編程來調(diào)控基因表達(dá)和細(xì)胞生理上的持續(xù)變化[4],不涉及突變和重組等永久性遺傳變化,而這些變化對定義TI的性質(zhì)和影響至關(guān)重要[5]。最近研究表明,不同免疫信號誘導(dǎo)的細(xì)胞代謝重組是確定TI 表觀遺傳學(xué)變化的關(guān)鍵一步,如糖酵解、三羧酸循環(huán)中的谷氨酰胺補(bǔ)充和富馬酸鹽的積累以及甲羥戊酸途徑等在其中起著至關(guān)重要的作用[6]。本文主要介紹TI 的訓(xùn)練激活物、訓(xùn)練相關(guān)細(xì)胞、代謝和表觀遺傳重組的機(jī)制以及在疾病中的重要作用。

        1 訓(xùn)練激活物

        以往研究證明能夠促進(jìn)TI 的因素包括致病信號(真菌、細(xì)菌、病毒)以及非致病信號,如胰島素、細(xì)胞因子、脂肪因子或激素。

        1.1 脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)

        革蘭氏陰性細(xì)菌外膜中發(fā)現(xiàn)的LPS,在生物學(xué)中執(zhí)行各種功能。長時間暴露于LPS 等的免疫細(xì)胞,可誘導(dǎo)一種先天免疫記憶,并隨后鈍化對不相關(guān)病原體的反應(yīng),即LPS耐受,后者通過LPS持續(xù)刺激骨髓源性巨噬細(xì)胞(bone marrow?derived macro?phage,BMDM)實現(xiàn)。巨噬細(xì)胞的這種功能性重編程(耐受),是由于LPS誘導(dǎo)大多數(shù)基因被轉(zhuǎn)錄沉默[7],當(dāng)耐受的巨噬細(xì)胞被LPS 再刺激后,轉(zhuǎn)錄沉默的同時不能對耐受基因啟動子上的組蛋白進(jìn)行標(biāo)記[8]。但是,TI 相關(guān)的造血過程增加又表現(xiàn)出LPS 再刺激后的有益一面,比如其保護(hù)小鼠免受化療誘導(dǎo)的骨髓抑制[9]。部分?jǐn)?shù)據(jù)表明,經(jīng)LPS 訓(xùn)練誘導(dǎo)造血干細(xì)胞的變化,可顯著改善對繼發(fā)性細(xì)菌(如銅綠假單胞菌感染)的反應(yīng)[10]。

        1.2 幾丁質(zhì)

        釀酒酵母天然存在于哺乳動物的皮膚和腸道中,同白色念珠菌一樣,在宿主定殖的真菌物種中具有普遍的保護(hù)特性[11],并且可能影響宿主的免疫。幾丁質(zhì),是真菌細(xì)胞壁的主要成分,Jiang 等[12]證實了其可以訓(xùn)練先天免疫,經(jīng)過訓(xùn)練的單核細(xì)胞第2 次接觸病原體時腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)?α和白介素(interleukin,IL)?6的產(chǎn)生增加。同時,組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑可削弱幾丁質(zhì)對單核細(xì)胞的TI,這表明組蛋白甲基化水平的表觀遺傳變化在幾丁質(zhì)TI的重編程中起著重要作用。

        1.3 β?葡聚糖

        β?葡聚糖(一種真菌衍生的TI 典型激動劑)預(yù)處理小鼠可導(dǎo)致腫瘤生長減弱,與其誘導(dǎo)TI介導(dǎo)粒細(xì)胞生成和中性粒細(xì)胞的表觀遺傳重編程導(dǎo)致抗腫瘤表型改變有關(guān),并且該過程需要I型干擾素(in?terferon,IFN)信號,而與宿主的獲得性免疫無關(guān)。將中性粒細(xì)胞從β?葡聚糖訓(xùn)練的小鼠過繼轉(zhuǎn)移到幼稚荷瘤受體,則是以一種活性氧依賴的方式抑制后者的腫瘤生長[13]。亦有報道β?葡聚糖可通過抑制免疫反應(yīng)基因1的表達(dá)從而減弱人類內(nèi)毒素血癥模型誘導(dǎo)的耐受性,這突出了β?葡聚糖誘導(dǎo)TI逆轉(zhuǎn)免疫耐受的潛力[14]。

        1.4 卡介苗(bacille calmette?guerin,BCG)

        作為世界上應(yīng)用最多的疫苗[15],卡介苗能保護(hù)兒童免受不相關(guān)的感染,特別是呼吸道感染和新生兒敗血癥。研究表明BCG 接種可能是一種有效的預(yù)防新型冠狀病毒(severe acute respiratory syn?drome coronavirus 2,SARS?CoV?2)感染的措施,它可作為開發(fā)針對SARS?CoV?2 的特異性疫苗的橋梁,從而控制大流行趨勢[16-17]。此外,BCG 接種在造血干細(xì)胞水平上引起的轉(zhuǎn)錄變化可以“傳遞”給多能祖細(xì)胞和骨髓源性巨噬細(xì)胞,從而增強(qiáng)對結(jié)核分枝桿菌感染的保護(hù)能力。該過程主要通過Ⅱ型IFN或IL?1 反應(yīng)對骨髓中的造血干細(xì)胞進(jìn)行重新編程,從而提供針對結(jié)核桿菌的保護(hù)性TI。但有文章發(fā)現(xiàn),與BCG 不同,結(jié)核分枝桿菌通過IFN?I 反應(yīng)對造血干細(xì)胞進(jìn)行再編程,結(jié)果顯示造血干細(xì)胞轉(zhuǎn)錄譜的改變持續(xù)了至少1 年,這表明結(jié)核分枝桿菌對造血干細(xì)胞TI產(chǎn)生持久的影響[18]。

        1.5 乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)

        HBV 是慢性感染者導(dǎo)致肝臟炎癥和癌癥的主要原因,也能夠引發(fā)一種TI狀態(tài)。由于新生兒免疫系統(tǒng)不成熟,HBV 從受感染的母親傳染給新生兒,通過誘導(dǎo)免疫耐受狀態(tài)促進(jìn)HBV 持續(xù)存在[19]。與之相反,胎兒在子宮內(nèi)暴露于HBV會觸發(fā)TI,不僅促進(jìn)先天免疫細(xì)胞成熟和1 型輔助性T 細(xì)胞(T helper 1 cell,Th1)發(fā)育,還增強(qiáng)了臍帶血免疫細(xì)胞體外對細(xì)菌感染的反應(yīng)能力。這些TI 效應(yīng)與細(xì)胞微環(huán)境有關(guān),以低IL?10、高IL?12p40和IFN?α2為特征。相關(guān)數(shù)據(jù)亦揭示了相似的TI狀態(tài)[20]。

        1.6 各類代謝產(chǎn)物

        胰島素抵抗的巨噬細(xì)胞基礎(chǔ)哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)復(fù)合物1活性增加從而具有M2樣表型,可降低LPS反應(yīng),同時又表現(xiàn)出糖酵解增加和關(guān)鍵糖酵解酶的表達(dá)增加[21]。因此,引起巨噬細(xì)胞對病原體的反應(yīng)減弱和代謝改變的胰島素抵抗本質(zhì)上是一種TI。此外,臨床證據(jù)強(qiáng)調(diào)了胰島素抵抗患者中巨噬細(xì)胞對病原體或代謝產(chǎn)物反應(yīng)的改變,這與細(xì)胞培養(yǎng)和動物模型研究一致[22]。Du等[23]發(fā)現(xiàn)低氧預(yù)處理的人間充質(zhì)干細(xì)胞可分泌胰島素樣生長因子(insulin like growth factor,IGF)?2,訓(xùn)練正在成熟的小鼠巨噬細(xì)胞向M2 樣表型,從而抑制自身免疫性炎癥。從嗜鉻細(xì)胞瘤/副神經(jīng)節(jié)瘤患者分離的單核細(xì)胞,長期暴露于高兒茶酚胺水平可能對其功能、轉(zhuǎn)錄和表觀遺傳學(xué)具有很大影響[24]。再刺激后醛固酮通過鹽皮質(zhì)激素受體,可增加單核細(xì)胞來源的巨噬細(xì)胞中促炎因子、活性氧的產(chǎn)生。脂肪酸合成是誘導(dǎo)TI 的關(guān)鍵途徑,對該途徑的藥理抑制可削弱醛固酮誘導(dǎo)的TI[25]。持續(xù)性高膽固醇血癥誘導(dǎo)單核細(xì)胞具有TI表型,造成個體患心血管疾病的風(fēng)險增加,即便他汀類藥物也不能逆轉(zhuǎn)這種促炎癥表型[26]。

        1.7 各類受體激活劑

        研究表明,先天免疫細(xì)胞通過激活模式識別受體(pattern recognition receptor,PRR)識別病原體相關(guān)分子模式后,其功能重編程可在隨后的微生物接觸時產(chǎn)生增強(qiáng)的非特異性抗菌反應(yīng)[27-28]。肝臟X受體(liver X receptor,LXR)是膽固醇和脂肪酸穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,LXR 激動劑的激活伴隨著TI 的特征,如激活炎癥基因啟動子上的組蛋白標(biāo)記和代謝重編程,從而增加乳酸產(chǎn)生和降低耗氧率[29]。CL429 是一種嵌合Toll 樣受體(toll?like receptors,TLR)?2/核苷酸寡聚化結(jié)構(gòu)域(nucleotide binding oligomerization domain,NOD)?2 激動劑,可模擬乳桿菌的調(diào)節(jié)作用,并減輕由先天免疫記憶引起的鉤端螺旋體病的急性期反應(yīng)[30]。波形蛋白是C型凝集素受體(Dectin?1)的內(nèi)源性激活配體,有助于動脈粥樣硬化中的脂質(zhì)氧化和膽固醇積累。TLR4 是激活天然免疫和細(xì)胞因子釋放的關(guān)鍵受體,它是依賴高遷移率族蛋白B1(high mobility group box 1 protein,HMGB1)激活巨噬細(xì)胞TNF釋放所必需的。在同種異體移植排斥反應(yīng)中,波形蛋白和HMGB1 通過Dectin?1 和TLR4 激活的局部巨噬細(xì)胞可以驅(qū)動TI相關(guān)細(xì)胞因子的產(chǎn)生[31]。此外,雖然TLR10介導(dǎo)先天免疫與炎癥抑制,但相關(guān)研究卻顯示其在BCG與β葡聚糖訓(xùn)練中影響甚微[32]。

        2 訓(xùn)練細(xì)胞

        TI可發(fā)生于固有免疫細(xì)胞,如單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、自然殺傷細(xì)胞(natural killer cell,NK)等和非免疫細(xì)胞,如成纖維細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞等[33]。

        2.1 吞噬細(xì)胞

        專業(yè)吞噬細(xì)胞包括中性粒細(xì)胞、單核/巨噬細(xì)胞,通過PRR 對入侵微生物進(jìn)行識別和應(yīng)答。已在包括單核[24]/巨噬細(xì)胞[34]、中性粒細(xì)胞[13]的幾種細(xì)胞群中研究先天免疫記憶特性,而初步觀察表明,類似的特性也存在于其他類型細(xì)胞中,如先天淋巴樣細(xì)胞(innate lymphoid cell,ILC)或多形核白細(xì)胞等。

        2.2 NK細(xì)胞

        已發(fā)表的數(shù)據(jù)表明NK 細(xì)胞免疫記憶是復(fù)雜的。首先,與T、B 細(xì)胞相似,NK 細(xì)胞在遇到半抗原或病毒等刺激后可形成免疫記憶,從而產(chǎn)生抗原特異性記憶NK細(xì)胞[35]。其次,NK細(xì)胞可記憶炎性細(xì)胞因子環(huán)境,而這些環(huán)境會影響非抗原特異性NK細(xì)胞效應(yīng)器的長期功能[36-37]。此外,最近研究表明NK 細(xì)胞的記憶也受表觀遺傳變化的調(diào)控[38]。因此,NK 細(xì)胞可表現(xiàn)為抗原依賴(在某些情況下抗原特異性)記憶,以及TI中所見的表觀遺傳重編程。

        2.3 ILC

        最近研究表明,ILC 能夠?qū)υ俑腥井a(chǎn)生有效的記憶[39],而第二組天然淋巴樣細(xì)胞(ILC2)是定義最明確的ILC,其雖不直接識別過敏原,但能被細(xì)胞因子(如IL?33)所激活[40],進(jìn)而產(chǎn)生IL?5 和IL?13。在過敏反應(yīng)的背景下[41],ILC2以非特異性方式對過敏原產(chǎn)生免疫記憶,表現(xiàn)出與記憶T 細(xì)胞相似的特征。因此,有研究者建議修改免疫記憶的定義,即記憶先前被激活的能力,并在重新激活時做出更有效的反應(yīng),而不考慮抗原的特異性。

        2.4 非經(jīng)典免疫細(xì)胞

        TI 不僅存在于先天免疫細(xì)胞,也存在于非經(jīng)典免疫細(xì)胞中。目前研究最多的是造血干細(xì)胞維持免疫細(xì)胞的終身產(chǎn)生[10,42-43]。亦有報道骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞介導(dǎo)的免疫調(diào)節(jié)包括先天免疫系統(tǒng)和適應(yīng)性免疫系統(tǒng)[44]。此外,上皮細(xì)胞[33,45]及上皮干細(xì)胞[46]的TI均有報道。

        3 TI的機(jī)制

        TI 主要基于細(xì)胞的表觀遺傳和代謝重編程。相關(guān)研究探討TI誘導(dǎo)背后的表觀遺傳學(xué)機(jī)制,以及不同細(xì)胞代謝物和代謝網(wǎng)絡(luò)在TI誘導(dǎo)、調(diào)節(jié)和維持中的作用[5]。但要破譯TI 誘導(dǎo)背后的表觀遺傳機(jī)制,還需要先了解特定代謝物和代謝網(wǎng)絡(luò)在該過程中的作用(圖1)。

        圖1 訓(xùn)練免疫的機(jī)制[6]Figure 1 The mechanism of trained immunity[6]

        3.1 代謝重組機(jī)制

        TI 的誘導(dǎo)和維持涉及多種代謝途徑,包括有氧糖酵解、谷氨酰胺分解、膽固醇代謝和脂肪酸合成[5,47],例如在人類巨噬細(xì)胞炎癥驅(qū)動下,Dectin?1、蛋白激酶B(Akt)、mTOR 和缺氧誘導(dǎo)因子(hypoxia inducible factor,HIF)?1α介導(dǎo)細(xì)胞從氧化磷酸化到有氧糖酵解的代謝轉(zhuǎn)換(沃伯格效應(yīng))[2,48]。糖酵解的增加和三羧酸循環(huán)中間代謝物的積累,如富馬酸鹽和谷氨酸鹽,形成β?葡聚糖誘導(dǎo)TI的代謝基礎(chǔ)[3]。但當(dāng)未成熟巨噬細(xì)胞經(jīng)IGF?2訓(xùn)練后表現(xiàn)M2極化時,會發(fā)生氧化磷酸化偏向性進(jìn)而產(chǎn)生抗炎作用[23]。除了葡萄糖代謝,膽固醇合成途徑中幾種關(guān)鍵酶的表達(dá)增加亦是誘導(dǎo)TI的先決條件[49],例如甲羥戊酸的積累上調(diào)了IGF?1R?mTOR途徑和糖酵解的代謝轉(zhuǎn)換[50]。除了熟知的代謝途徑外,Ji 等[51]揭示了細(xì)胞內(nèi)L?精氨酸?肌酸代謝對IFN?γ、IL?4 介導(dǎo)的巨噬細(xì)胞活化中的重要影響。

        3.2 表觀遺傳重編程機(jī)制

        不同的代謝途徑作為持續(xù)的能量來源和構(gòu)建模塊,為細(xì)胞表觀遺傳的主動重塑提供燃料,但也為改變?nèi)旧|(zhì)和基因組相應(yīng)區(qū)域的結(jié)構(gòu)提供必要的底物。表觀遺傳變化表現(xiàn)為組蛋白的化學(xué)修飾(甲基化和乙?;?,導(dǎo)致染色質(zhì)可及性增強(qiáng),并使抗菌反應(yīng)中的重要基因更易轉(zhuǎn)錄和改善細(xì)胞功能[52]。先天免疫細(xì)胞暴露于刺激(包括β?葡聚糖、BCG 和白色念珠菌)下,顯示了表觀遺傳標(biāo)記的全基因組變化,包括組蛋白第3 亞基4 號賴氨酸的單甲基化(histone H3 lysine 4 monomethylation,H3K4me1)、組蛋白第3 亞基4 號賴氨酸的三甲基化(histone H3 lysine 4 trimethylation,H3K4me3)和組蛋白第3 亞基27 號賴氨酸的乙?;╤istone H3 lysine 27 acetyla?tion,H3K27ac)[3,5]。例如Set7 通過在增強(qiáng)子的一個子集上寫入一個持久的H3 K4me1 信號從而調(diào)節(jié)TI[5,53];H3K27ac在參與巨噬細(xì)胞M1激活的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子如Mir155的啟動子和增強(qiáng)子中顯著減少[54],而在一些基因(如Mecp2)中增強(qiáng),已知其抑制巨噬細(xì)胞的炎癥[23]。雖然這些只是部分反映了巨噬細(xì)胞極化與組織微環(huán)境相關(guān)的表型復(fù)雜性,在該組織微環(huán)境中,許多促炎和促穩(wěn)態(tài)信號可能同時存在[55]。此外,研究發(fā)現(xiàn)一些長鏈非編碼RNA在TI基因啟動子上建立表觀遺傳標(biāo)記的機(jī)制[56-57]。幼稚、效應(yīng)和記憶性NK 細(xì)胞具有不同的染色質(zhì)可及性狀態(tài),由ATAC?seq 和H3K4me3 染色質(zhì)免疫沉淀和測序確定,這揭示了鼠巨細(xì)胞病毒感染后記憶性NK 細(xì)胞階段的“平衡”調(diào)節(jié)程序[39,58-59]。

        4 TI在相關(guān)疾病中的進(jìn)展

        了解TI 的特性將有助于更好地理解宿主防御機(jī)制和免疫介導(dǎo)疾病的發(fā)病機(jī)制,這一新興科學(xué)領(lǐng)域的概念和機(jī)理進(jìn)展將為疫苗接種以及疾病預(yù)防和治療的臨床應(yīng)用開辟新的途徑[3]。

        4.1 炎癥疾病

        與100多年前“細(xì)菌感染時代”不同,如今,西方生活方式等引起的無菌性炎癥反應(yīng)誘導(dǎo)TI 是慢性炎癥疾病發(fā)展的基礎(chǔ)[60]。在家族性高膽固醇血癥患者中,單核細(xì)胞產(chǎn)生細(xì)胞因子的能力明顯增強(qiáng),其啟動子上H3K4me3富集,即使降膽固醇他汀治療3個月后仍存在[26]。嚴(yán)重冠狀動脈粥樣硬化患者的循環(huán)單核細(xì)胞在細(xì)胞因子產(chǎn)生能力、糖酵解代謝和組蛋白甲基化水平的表觀遺傳重編程方面亦表現(xiàn)訓(xùn)練免疫表型[33]。另一種由單核細(xì)胞來源誘導(dǎo)TI的臨床無菌性炎癥是器官移植,Braza等[31]用特異性抑制髓樣細(xì)胞mTOR的高密度脂蛋白納米生物制劑進(jìn)行短期治療,能夠防止有氧糖酵解和TI基礎(chǔ)上的表觀遺傳修飾,從而提高了同種異體移植物的存活率。

        4.2 神經(jīng)系統(tǒng)疾病

        在阿爾茨海默病小鼠模型中,外周炎性持續(xù)刺激可導(dǎo)致小膠質(zhì)細(xì)胞的長期訓(xùn)練,并加劇了腦β?淀粉樣變性[61],這是由于小膠質(zhì)細(xì)胞的功能變化伴隨著HIF1A基因位點的活化表觀遺傳變化。在另一種與全身炎癥及癡呆相關(guān)的大腦小血管疾病的患者中[62],外周血來源的單核細(xì)胞顯示出TI特征,例如在體外刺激后IL?6、IL?8的產(chǎn)生增加,這也與疾病的嚴(yán)重程度和進(jìn)展有關(guān)[63]。綜上表明慢性而非急性炎癥狀態(tài),與TI以及其誘導(dǎo)神經(jīng)炎癥和神經(jīng)退行性變有關(guān)。

        4.3 新型冠狀病毒肺炎

        新型冠狀病毒肺炎是一種新型呼吸道感染,可并發(fā)嚴(yán)重肺炎和急性呼吸窘迫綜合征[64]。研究發(fā)現(xiàn)BCG能夠增強(qiáng)先天免疫反應(yīng),有助于新型冠狀病毒肺炎疫苗的研發(fā)[65]。事實上,目前正在荷蘭、澳大利亞和希臘評估BCG 接種人群的試驗效果,美國、英國、法國等也計劃進(jìn)行其他試驗。雖然免疫衰老可能會導(dǎo)致老年人接種后效果減弱,但最近一項研究表明,老年群體中很大程度上保留先天免疫功能,而適應(yīng)性免疫反應(yīng)(特別是IFN γ/IL?22 的產(chǎn)生)缺乏。因此,通過全微生物疫苗誘導(dǎo)TI 可能是降低SARS?CoV?2 易感性和嚴(yán)重性的重要工具[16],但不建議在對照臨床試驗之外使用BCG 治療新型冠狀病毒肺炎[66]。

        5 結(jié)論及展望

        本文闡述了TI 的訓(xùn)練激活物、訓(xùn)練細(xì)胞、代謝和表觀遺傳重編程機(jī)制,以及在不同疾病方面的最新進(jìn)展,但仍有許多問題和重要的研究方向需要繼續(xù)探索,介導(dǎo)TI 的分子機(jī)制需要更深入詳細(xì)的研究。未來一個重要領(lǐng)域是利用TI 誘導(dǎo)機(jī)制設(shè)計新一代療法和疫苗,將經(jīng)典適應(yīng)性免疫記憶的誘導(dǎo)和TI相結(jié)合。此外,未來最關(guān)鍵的研究方向之一是探索TI對疾病的影響:一方面,TI如何促進(jìn)免疫介導(dǎo)疾病的發(fā)病機(jī)制;另一方面,如何將TI作為治療目標(biāo),利用TI在健康和疾病中發(fā)揮作用。

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