丁 蕾,李晨楚,符彩珠,林 旭,戴 芃,Rajaofera Mamy Jayne Nelly*
(1.海南醫(yī)學(xué)院 第二臨床學(xué)院,海南 ???571100;2.海南醫(yī)學(xué)院 熱帶醫(yī)學(xué)與檢驗醫(yī)學(xué)院 熱帶生物醫(yī)學(xué)技術(shù)實驗室,海南 ???571100)
耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(methicillin-resistantStaphylococcus aureus,MRSA)是引起醫(yī)院感染的多重耐藥菌[1-3],自首次分離出MRSA以來,其臨床檢出率逐年上升,MRSA能引起心內(nèi)膜炎、腦膜炎和敗血癥等危重的致死性疾病[2-5],MRSA感染已被公認(rèn)為世界三大最難解決的感染性疾病之一。隨著抗生素的濫用,MRSA耐藥率不斷升高,唐克文等[6]研究表明,MRSA對克林霉素和紅霉素的耐藥率逐漸增高,因此,MRSA的多重耐藥性一直受到密切關(guān)注。雖然不斷有新的抗MRSA感染藥物被發(fā)現(xiàn)和研究,體外藥敏試驗也顯示出較好的抗MRSA活性,但其療效和安全性尚需驗證[7-8],這使得人類需更加重視抗耐藥菌株的藥物開發(fā)研究。
微生物是藥物先導(dǎo)化合物最重要的來源[9],有研究從廣西潿洲島礁棲珊瑚、海綿和海藻等樣品中分離獲得5種具有豐富代謝產(chǎn)物及抗MRSA活性的菌株[10]。還有研究篩選到一株對MRSA具有較強(qiáng)的抑制作用且穩(wěn)定性好的枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)SC-2,并提取到對耐藥鮑曼不動桿菌、大腸桿菌、幽門螺旋桿菌等常見的致病菌具有抗菌活性的化合物[11]。這些抗菌活性物質(zhì)的發(fā)現(xiàn)為本研究提供了理論依據(jù)。紅樹林因其特殊的生態(tài)環(huán)境、周期性的海水侵襲、河口有機(jī)質(zhì)的沉積和落葉的腐敗作用而富含有機(jī)質(zhì)和腐殖質(zhì),蘊(yùn)含了豐富的微生物資源[12]。有研究從南海海桑根際土壤篩選出一株抗MRSA活性較強(qiáng)的真菌,并追蹤分離到具有顯著抗菌活性的天然產(chǎn)物嗜氮酮[13]。因此,本研究從紅樹林根部土壤中篩選出具有抗MRSA活性的菌株,根據(jù)形態(tài)學(xué)觀察、生理生化試驗及16S rDNA基因序列分析對其進(jìn)行鑒定,采用不同的培養(yǎng)基優(yōu)選抑菌物質(zhì)生成條件;以有機(jī)溶劑分離純化抑菌物質(zhì)物質(zhì),采用氣相色譜-質(zhì)譜(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)分析抑菌物質(zhì)化學(xué)成分,以期獲得抗MRSA活性物質(zhì),為開發(fā)治療MRSA感染的藥物提供新的思路。
1.1.1 樣品和菌株
土壤樣品:海南省紅樹林根部土壤;指示菌株耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(methicillin-resistantStaphylococcus aureus,MRSA):本實驗室提供。
1.1.2 化學(xué)試劑
革蘭氏染色液試劑盒HB8278:青島高科技工業(yè)園海博生物有限公司;細(xì)菌脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)試劑盒(D3350-01)、淀粉酶、胰凝乳蛋白酶、胰蛋白酶、胃蛋白酶、鏈霉蛋白酶、蛋白酶K(酶活均為1 mg/mL):上海古朵生物科技有限公司。
1.1.3 培養(yǎng)基
LB(Luria-Bertani)液體培養(yǎng)基:蛋白胨10 g/L,酵母粉5 g/L,NaCl 10 g/L。LB固體培養(yǎng)基:LB液體培養(yǎng)基中加瓊脂16 g/L。
淀粉培養(yǎng)基:蛋白胨10 g/L,牛肉膏5 g/L,NaCl 5 g/L,可溶性淀粉10 g/L。
緩沖葡萄糖蛋白胨培養(yǎng)基:蛋白胨5 g/L,葡萄糖5 g/L,NaCl 5 g/L。
尿素培養(yǎng)基:蛋白胨1 g/L,NaCl 5 g/L,葡萄糖1 g/L,磷酸二氫鉀2 g/L,0.4%酚紅溶液3 mL,瓊脂20 g/L,20%尿素溶液100 mL。
克氏雙糖鐵瓊脂培養(yǎng)基(g/L):乳糖10 g/L,葡萄糖1 g/L,氯化鈉5 g/L,檸檬酸鐵銨0.5 g/L,硫代硫酸鈉0.5 g/L,瓊脂12 g/L,酚紅0.025 g/L。
營養(yǎng)瓊脂(nutrient agar,NA)培養(yǎng)基:牛肉浸膏3g/L,酵母浸膏1 g/L,胰蛋白胨5 g/L,葡萄糖20 g/L。
水解酪蛋白(Mueller-Hinton,MH)培養(yǎng)基:牛肉膏5 g/L,淀粉1.5 g/L,酪蛋白水解物17.5 g/L。
ZS培養(yǎng)基:蛋白胨10 g/L,酵母粉5 g/L,NaCl 10 g/L,牛肉膏5 g/L。
葡萄糖酵母牛肉膏(ager yeast dextrose,AYDA)培養(yǎng)基:葡萄糖10 g/L,牛肉膏80 g/L,酵母粉5 g/L。
Landy培養(yǎng)基:葡萄糖20 g/L,L-谷氨酸5 g/L,KH2PO41 g/L,KCl 0.5 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,酵母抽提物1 g/L,MnSO45mg/L,CuSO4·5H2O0.16mg/L,F(xiàn)eSO4·7H2O0.15mg/L,L-苯丙氨酸2 mg/L。
金氏培養(yǎng)基(Kings Medium B,KMB):蛋白胨20 g/L,MgSO4·7H2O2.5g/L,K2HPO4·3H2O1.5g/L,甘油20g/L。
牛肉蛋白胨酵母(beef peptone yeast,BPY)培養(yǎng)基:牛肉膏5 g/L,胰蛋白胨10 g/L,酵母浸膏5 g/L,葡萄糖5 g/L,NaCl 5 g/L。
酵母浸出粉胨葡萄糖(yeast extract peptone dextrose,YPD)培養(yǎng)基:酵母膏10 g/L,蛋白胨20 g/L,葡萄糖20 g/L。
胰蛋白胨大豆瓊脂培養(yǎng)基(trypcasein soy agar,TSA):胰蛋白胨17 g/L,大豆蛋白胨3 g/L,NaCl 5g/L,K2HPO4·3H2O 2.5 g/L,葡萄糖2.5 g/L。
上述培養(yǎng)基滅菌條件均為121 ℃、20 min。
明膠培養(yǎng)基:牛肉膏蛋白胨液100 mL,明膠15 g/L。112.6 ℃滅菌30 min。
GI54DS型全自動高壓滅菌鍋:南京傲然生物科技有限公司;Microfuge 20R型高速離心機(jī):美國Beckman Coulter Inc公司;HF-safe-1500LC(A2)型生物安全柜:上海力申科學(xué)儀器有限公司;JAN-26臺式高速冷凍離心機(jī):美國BECKMAN COULTER公司;Core ML型旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀:德國Heidolph Hei-VAP公司;ME204E型電子分析天平:METTLER TOLEDO集團(tuán);TONE 96G型梯度聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)儀:德國耶拿Biomentra公司;BSD-YX 2400型溫控回旋立式雙層搖床:上海博訊實業(yè)有限公司;JY04S-3E型凝膠成像分析系統(tǒng):北京君意東方電泳設(shè)備有限公司;Ni-U+DS-Ri2型正置熒光顯微鏡:日本Nikon公司。
1.3.1 抗MRSA活性菌株的篩選
從平板挑取一環(huán)指示菌MRSA接種于5mL LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、180 r/min條件下振蕩培養(yǎng)18~24 h,采用平板傾注法[14],將MRSA病原菌種子液接種至LB 固體培養(yǎng)基中,倒平板,晾干備用。
從海南省紅樹林根部土壤隨機(jī)取9份樣品,每份土樣分別取11 g與10 mL無菌水混合,37 ℃、180 r/min條件下振蕩15 min,靜置5 min后,吸取上層清液按10倍梯度稀釋法稀釋至10-2、10-3、10-4倍濃度,各取100 μL涂布于上述混有MRSA菌液的培養(yǎng)皿中,37 ℃恒溫培養(yǎng)5 d,觀察各土壤樣品菌株有無抑菌圈,測量并比較抑菌圈大小,以抑菌圈直徑大小評判抑菌活性強(qiáng)弱,篩選出抑菌圈最大即抗MRSA活性強(qiáng)的菌株。
1.3.2 篩選菌株鑒定
形態(tài)學(xué)觀察及生理生化反應(yīng)測定:參考東秀珠等[15]編著的《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊》,觀察、分析菌落形態(tài)、生長特性,通過革蘭氏染色、鞭毛染色、芽孢染色和各生化試驗對菌株進(jìn)行檢測、鑒定,方法參考《微生物學(xué)實驗》[16]。
分子生物學(xué)鑒定:利用16S rDNA基因序列分析的方法對篩選菌株進(jìn)一步鑒定。以篩選菌株基因組DNA為模板,采用通用引物27F(5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3')和1492R(5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3')擴(kuò)增16S rDNA。PCR擴(kuò)增體系:EXTaq酶0.25 μL,10×Buffer 5 μL,脫氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleoside triphosphate,dNTP)4 μL,MgCl24 μL,模板DNA 2 μL,27F 1 μL,1492R 1 μL,雙蒸水(ddH2O)32.75 μL。PCR擴(kuò)增條件為:95 ℃5 min;94 ℃60 s;55 ℃60 s;72 ℃90 s;循環(huán)30次,延伸72 ℃10 min。PCR擴(kuò)增完成后通過1%瓊脂糖凝膠檢測擴(kuò)增產(chǎn)物,將獲得的特異性DNA送往華大基因科技股份有限公司進(jìn)行測序,提交序列至GenBank數(shù)據(jù)庫,獲得序列號。將測序結(jié)果在美國國家生物技術(shù)信息中心(national center of biotechnology information,NCBI)網(wǎng)站進(jìn)行基本局部比對搜索工具(basic local alignment search tool,BLAST)比對,使用Mega7.0建立發(fā)育樹獲得親緣遠(yuǎn)近關(guān)系。
1.3.3 篩選菌株產(chǎn)抑菌物質(zhì)培養(yǎng)基的優(yōu)選
配制LB、MH、NA、Landy、ZS、KMB、BPY、AYDA、YPD、TSA培養(yǎng)基,從平板挑取篩選抗MRSA活性菌株分別接種至裝液量為50 mL/250 mL的上述培養(yǎng)基中,每組設(shè)3個重復(fù),37 ℃,200 r/min 振蕩培養(yǎng)24 h。將培養(yǎng)液于12 000 r/min離心10 min,取上清液,用0.22 μm膜過濾,收集濾液備用。采用平板傾注法,將MRSA病原菌種子液接種至LB 固體培養(yǎng)基中,在上述平板上分別均勻打孔,孔徑為8 mm,每孔分別接入200 μL的上述各種備用濾液,每組設(shè)3個重復(fù),37 ℃恒溫箱培養(yǎng)24 h,以上述培養(yǎng)基作為相應(yīng)培養(yǎng)基培養(yǎng)菌株NEL-002后發(fā)酵液濾液為抑菌對照組,利用抑菌物質(zhì)不斷溶解經(jīng)瓊脂擴(kuò)散形成不同濃度梯度,在擴(kuò)散過程中濃度逐漸減少,直到抑菌物質(zhì)濃度與細(xì)菌對該種抑菌物質(zhì)的最高耐受濃度相同,此時抑菌物質(zhì)不再擴(kuò)散,即形成抑菌圈,以顯示其抑菌作用[17-18],通過抑菌圈大小以判斷其是否具有抑菌能力,判定標(biāo)準(zhǔn):抑菌圈≤7 mm為無抑菌作用,抑菌圈直徑>7 mm為有抑菌作用,抑菌圈直徑7~10 mm為鈍敏,抑菌圈直徑11~20 mm為中敏,抑菌圈直徑>20 mm為高敏。比較不同孔徑中濾液抗MRSA活性的敏感性差異,確定篩選抗MRSA活性菌株的最適發(fā)酵培養(yǎng)基。
1.3.4 抑菌物質(zhì)的分離純化
從平板挑取1環(huán)篩選抗MRSA活性菌株接種至裝液量為50 mL/250 mL LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)24 h,發(fā)酵液于12 000 r/min 離心10 min,取上清液,分別用乙酸乙酯、石油醚、正丁醇對上清液進(jìn)行反復(fù)3次的萃取,分別將得到的有機(jī)相減壓蒸干,得到的沉淀1 mL加入二甲基亞砜(dimethyl sulfoxide,DMSO)充分溶解,通過0.22 μm細(xì)菌過濾器除菌,收集濾液備用。采用平板傾注法,將MRSA病原菌種子液接種至LB 固體培養(yǎng)基中,倒平板,晾干備用,再在上述平板上分別均勻打孔,孔徑為8 mm,每孔分別接入200 μL的上述各種備用濾液,每組設(shè)3個重復(fù),37 ℃培養(yǎng)24 h,以乙酸乙酯、石油醚、正丁醇、DMSO為對照組,測量抑菌圈大小,比較不同孔徑中濾液抗MRSA活性的差異,確定篩選抗MRSA活性菌株抑菌物質(zhì)的分離純化方法,并以此方法粗提發(fā)酵液,用二甲基亞砜充分溶解,作為樣液,4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.5 抑菌物質(zhì)的化學(xué)成分分析
抗MRSA活性菌株抑菌物質(zhì)GC-MS分析[19-20]。GC條件:DB25 交聯(lián)石英毛細(xì)管柱(30 m×0.25 mm),柱溫為40 ℃,進(jìn)樣溫度為250 ℃,柱壓為49.7 kPa,載氣為高純度氦氣(He),柱流量為1 mL/min,載氣流量3 mL/min,進(jìn)樣量0.5 μL,分流比20∶1。MS條件:電子電離(electronic ionization,EI)源,電子能量70 eV,離子源溫度為230 ℃,四級桿溫度為150 ℃,傳輸線溫度250 ℃,掃描質(zhì)量范圍為20~500 amu。定性定量方法:將各組分的相對保留指數(shù)與文獻(xiàn)[21-22]中真實化合物的相對保留指數(shù)進(jìn)行比較,并與美國國家標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)研究所(national institute of standards and technology,NIST)98文獻(xiàn)數(shù)據(jù)中的相對保留指數(shù)進(jìn)行比較進(jìn)行定性,采用面積歸一法對各組分進(jìn)行定量。
1.3.6 抑菌物質(zhì)穩(wěn)定性研究
熱穩(wěn)定性:將1.3.4中制備的抑菌物質(zhì)粗提液,在40 ℃、50 ℃、60 ℃、70 ℃、80 ℃、90 ℃、100 ℃、121 ℃的不同溫度下處理20 min,對照組在37℃溫度下處理20 min,每處設(shè)置3個重復(fù),過濾后用圓盤擴(kuò)散法[23]測定其抑菌活性,37 ℃避光恒溫培養(yǎng)48 h后測量抑菌圈直徑,以對照組(CK)的抑菌圈大小為活性100%,計算各溫度下的相對活性。
酸堿穩(wěn)定性:將1.3.4中制備的抑菌物質(zhì)粗提液,調(diào)節(jié)pH值至1~12,對照組為原液pH值,每處設(shè)置3個重復(fù),過濾后采用圓盤擴(kuò)散法測定其抑菌活性,37 ℃恒溫培養(yǎng)48 h后測量抑菌圈大小,以對照組(CK)的抑菌圈大小為活性100%,計算各pH組的相對活性。
蛋白酶穩(wěn)定性:將1.3.4中制備的抑菌物質(zhì)粗提液,分別加入淀粉酶、胰凝乳蛋白酶、胰蛋白酶、胃蛋白酶、鏈霉蛋白酶、蛋白酶K,酶的終質(zhì)量濃度為1 mg/mL,對照組不加任何蛋白酶,每處設(shè)置3個重復(fù),過濾后采用圓盤擴(kuò)散法測定其活性,37 ℃的恒溫培養(yǎng)48 h后測量抑菌圈大小。以對照組的抑菌圈大小為活性100%,計算各蛋白酶處理組的相對活性,通過對蛋白酶敏感性判斷抑菌物質(zhì)是否含有蛋白類化合物,其活性是否容易被蛋白酶破壞[24]。
1.3.7 最低抑菌濃和最低殺菌濃度測定
最低抑菌濃度(minimal inhibitory concentration,MIC)和最低殺菌濃度(minimal bactericidal concentration,MBC)測定:將1.3.4中制備的抑菌物質(zhì)粗提液,用LB液體培養(yǎng)基稀釋至質(zhì)量濃度為2 000 μg/mL,再依次稀釋為1 000 μg/mL、500 μg/mL、250 μg/mL、125 μg/mL、62.5 μg/mL、31.25 μg/mL、15.62 μg/mL、7.81 μg/mL。采用96孔板法,設(shè)置3個重復(fù),以含等量DMSO(5%)的LB液體培養(yǎng)基作對照,37 ℃恒溫靜置培養(yǎng)24 h后,觀察并統(tǒng)計結(jié)果,陰性孔顯示清亮,陽性孔顯示混濁,MIC值為96孔板上橫排中未有混濁的最后一孔所對應(yīng)的濃度。
讀取MIC值結(jié)果后,分別移取各組藥物陰性孔液體50 μL,涂布于LB固體培養(yǎng)基,37 ℃恒溫靜置培養(yǎng)24 h;讀取菌落個數(shù),分別計算對應(yīng)孔內(nèi)細(xì)菌數(shù)量,能夠殺死>99.9%初始細(xì)菌含量(<100 CFU/mL)的最低藥物濃度為MBC。
37 ℃恒溫靜置培養(yǎng)5 d后,結(jié)果見圖1。由圖1可知,篩選出5株抗MRSA活性菌株,得到抗MRSA生長能力最強(qiáng)的菌株,編號NEL-002,抑菌圈直徑約為(28.77±0.42)mm,其他4株抗MRSA活性菌株的抑菌圈直徑<10 mm,抑菌活性較弱,不作為后續(xù)研究對象。
圖1 菌株NEL-002抗耐甲氧西林金黃色葡萄球菌活性Fig.1 Activity of methicillin-resistant Staphylococcus aureus of strain NEL-002
2.2.1 形態(tài)學(xué)觀察
菌株NEL-002在LB固體培養(yǎng)基,37 ℃恒溫靜置培養(yǎng)18 h,菌株NEL-002的形態(tài)特征見圖2。
由圖2A可知,菌落生長茂盛,似圓形、乳白色,不透明,邊緣形態(tài)不規(guī)則,表面粗糙、較干燥。由圖2B可知,經(jīng)革蘭染色,在顯微鏡下觀察到菌體呈紫色,為革蘭陽性菌。由圖2C可知,經(jīng)鞭毛染色,在顯微鏡下觀察發(fā)現(xiàn)菌體端生鞭毛1根。由圖2D可知,經(jīng)芽孢染色,在顯微鏡下觀察到紅色的菌體和綠色的芽孢。
圖2 菌株NEL-002的形態(tài)特征Fig.2 Morphological characteristics of strain NEL-002
2.2.2 菌株NEL-002生理生化特征
菌株NEL-002其生理生化特征結(jié)果見表1。由表1可知,V-P試驗陽性、M.R.試驗陰性說明該菌株分解利用葡萄糖產(chǎn)生乙酰甲基甲醇,過氧化氫酶試驗陽性符合革蘭陽性菌特征,淀粉酶試驗、尿素酶試驗陽性,說明該菌株不產(chǎn)生淀粉酶和尿素酶,不能分解利用淀粉和尿素,明膠液化試驗、硫化氫試驗陰性,說明該菌株不能分解氨基酸。
表1 菌株NEL-002的部分生理生化特征Table 1 Some physiological and biochemical characteristics of strain NEL-002
2.2.3 菌株NEL-002分子生物學(xué)鑒定
菌株NEL-002的16S rDNA PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳分析,結(jié)果如圖3所示,擴(kuò)增條帶在1 000~2 000 bp之間,說明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功,可回收擴(kuò)增產(chǎn)物,連接轉(zhuǎn)化,篩選陽性克隆,進(jìn)行測序和序列分析。經(jīng)基因測序,提交序列數(shù)據(jù)至Genbank,序列號為MN640828。使用Mega 7.0建立發(fā)育樹結(jié)果如圖4所示,綜合NCBI的BLAST搜索,細(xì)菌的16S rDNA 進(jìn)行比對,結(jié)果顯示菌株NEL-002與萎縮芽孢桿菌同源性達(dá)到99%,菌株NEL-002被鑒定為萎縮芽孢桿菌(Bacillus atrophiae)。
圖3 菌株NEL-002基于16S rDNA序列PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果Fig.3 PCR amplification product electrophoresis results of strain NEL-002 based on 16S rDNA sequence
圖4 菌株NEL-002基于16S rDNA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.4 Phylogenetic tree of strain NEL-002 based on 16S rDNA sequences
2.3.1 最適發(fā)酵培養(yǎng)基的篩選
用不同培養(yǎng)基對菌株NEL-002培養(yǎng),觀察其抗菌活性,結(jié)果見圖5。
由圖5可知,菌株NEL-002在TSA、YPD培養(yǎng)基上抑菌圈直徑<7 mm無抑菌活性,在BPY、AYDA培養(yǎng)基上抑菌圈直徑在7~10 mm,為鈍敏,有微弱抑菌活性,在KMB、ZS、Landy、NA培養(yǎng)基上抑菌圈直徑在11~20 mm,為中敏,抑菌活性較強(qiáng),在MH、LB培養(yǎng)基上抑菌圈直徑>20 mm,為高敏,抑菌活性強(qiáng),其中在LB液體培養(yǎng)基抑菌圈直徑為(25.91±0.38)mm,較其他培養(yǎng)基抗菌活性最強(qiáng),對照組未出現(xiàn)抑菌圈,無抑菌活性。因此,選用LB液體培養(yǎng)基培養(yǎng)菌株NEL-002。
圖5 不同發(fā)酵培養(yǎng)基對菌株NEL-002抑菌活性的影響Fig.5 Effects of different fermentation media on antibacterial activity of strain NEL-002
2.3.2 抗菌活性物質(zhì)的分離純化
分別采用石油醚、乙酸乙酯、正丁醇3種有機(jī)溶劑對菌株NEL-002發(fā)酵上清液進(jìn)行萃取,石油醚萃取物抗菌活性最強(qiáng),抑菌圈直徑為(25.48±0.01)mm,正丁醇萃取物抑菌圈直徑為(17.70±0.00)mm,乙酸乙酯萃取物抑菌圈直徑為(17.70±0.02)mm抗菌活性較低,對照組各有機(jī)溶劑及DMSO未出現(xiàn)抑菌圈,無抑菌活性。因此,選用石油醚粗提物進(jìn)行后續(xù)實驗。
2.3.3 菌株NEL-002抑菌物質(zhì)化學(xué)成分分析
采用氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(GC-MS)分析了該菌株粗提物中可能具有抗MRSA活性的化合物,結(jié)果見表2。由表2可知,在粗提物中共鑒定出3種已知化合物,包括鄰苯二甲酸二丁酯、十甲基環(huán)戊硅氧烷和十二甲基環(huán)六硅氧烷,與文獻(xiàn)[25-26]報道的鄰苯二甲酸二丁酯、十甲基環(huán)戊硅氧烷和十二甲基環(huán)六硅氧烷相關(guān)信息基本一致。
表2 菌株NEL-002抑菌物質(zhì)粗提物主要成分Table 2 Main components of crude extract of antibacterial material from strain NEL-002
2.3.4 菌株NEL-002活性物質(zhì)穩(wěn)定性分析
由圖6可知,粗提物經(jīng)不同溫度處理20 min后,在40~80 ℃的溫度范圍內(nèi)隨著溫度的升高,抑菌活性無明顯差異,抑菌圈直徑均在18.00 mm以上,90 ℃開始抑菌活性隨溫度升高開始降低,加熱至121℃,抑菌圈直徑為(9.26±0.05)mm,相對活性49.34%。說明石油醚粗提物不耐高溫,但在溫度40~80 ℃范圍內(nèi)粗提物熱穩(wěn)定性良好。
圖6 菌株NEL-002粗提活性物質(zhì)熱穩(wěn)定性Fig.6 Thermal stability of the crude extracts from strain NEL-002
由圖7可知,粗提物經(jīng)不同pH值處理后,pH值在5~10時,抑菌圈直徑較大,在堿性條件pH值為8時抑菌圈直徑最大,約為(17.87±0.02)mm,pH值在1~4抑菌圈直徑較小,與對照組相比抑菌活性降低,相對活性均在62.27%以上,而pH值在11~12條件下無抑菌活性,說明提取菌株NEL-002的粗提物在pH值在5~10范圍內(nèi)穩(wěn)定性良好。
圖7 菌株NEL-002粗提活性物質(zhì)酸堿穩(wěn)定性Fig.7 Acid and alkali stability of the crude extracts from strain NEL-002
由圖8可知,分別用淀粉酶、胰凝乳蛋白酶、胰蛋白酶、胃蛋白酶、鏈霉蛋白酶、蛋白酶K處理30 min培養(yǎng)后,抗菌活性均較穩(wěn)定,說明菌株NEL-002產(chǎn)生的抗菌物質(zhì)對上述蛋白酶不敏感,不易被酶破壞其活性。
圖8 不同蛋白酶對菌株NEL-002發(fā)酵液抑菌活性的影響Fig.8 Effect of different protease on antibacterial activity of strain NEL-002
采用微量稀釋法測定,菌株NEL-002粗提活性物質(zhì)的MIC和MBC,結(jié)果如圖9所示。在96孔板上橫排陰性孔中最后一孔所對應(yīng)的濃度即最低抑菌濃度(MIC)為62.5 μg/mL。菌落計數(shù)為0的平板所對應(yīng)的陰性孔濃度,即菌株NEL-002粗提活性物質(zhì)能夠拮抗MRSA菌生長的最低殺菌濃度(MBC)為500 μg/mL。
圖9 菌株NEL-002粗提活性物質(zhì)最低抑菌濃度及最低殺菌濃度Fig.9 Minimum inhibitory concentration and minimum bactericidal concentration of the crude extracts from strain NEL-002
本研究對紅樹林根部土壤拮抗微生物進(jìn)行研究,對土壤懸浮液處理、分離篩選得到具有抗MRSA活性的菌株NEL-002,經(jīng)細(xì)菌形態(tài)觀察、生理生化特性及16S rDNA 序列分析等方法鑒定該菌株為萎縮芽孢桿菌(Bacillusatrophiae)。菌株NEL-002采用LB液體培養(yǎng)基得到發(fā)酵液經(jīng)石油醚萃取粗體物抗MRSA菌活性最強(qiáng),且在40~80 ℃、pH在5~10較穩(wěn)定,對多種蛋白酶不敏感;最低抑菌質(zhì)量濃度為62.5 μg/mL,最低殺菌質(zhì)量濃度為500 μg/mL。GC-MS鑒定出抗菌活性物質(zhì)為十甲基環(huán)戊硅氧烷、十二甲基環(huán)六硅氧烷及鄰苯二甲酸二丁酯。