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        MicroRNA-218單核苷酸多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性的關(guān)系*

        2021-12-06 05:31:30李天煜龐彩蓮徐瑞梅林悠閱呂昕琪范志豪鐘展華何俊力袁朝漢魏馳譽(yù)黃舒琪謝烷頤廖日煜
        廣東醫(yī)學(xué) 2021年11期
        關(guān)鍵詞:多態(tài)易感性核苷酸

        李天煜,龐彩蓮,徐瑞梅,林悠閱,呂昕琪,范志豪,鐘展華,何俊力,袁朝漢,魏馳譽(yù),黃舒琪,謝烷頤,廖日煜

        廣東醫(yī)科大學(xué) 1外科學(xué)教研室,3公共衛(wèi)生學(xué)院,4研究生學(xué)院(廣東東莞523808);2東莞市大朗醫(yī)院檢驗(yàn)科(廣東東莞523770)

        結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)是發(fā)生于結(jié)直腸上皮的惡性腫瘤,其發(fā)病率居惡性腫瘤中的第3位,同時(shí)也是癌癥致死的第二大原因[1]。到2030年,預(yù)計(jì)CRC的全球疾病負(fù)擔(dān)將增加60%,新增病例將超過220萬,死亡人數(shù)將超過110萬[2]。結(jié)直腸癌的發(fā)生、發(fā)展是一個(gè)多要素的病理變化過程,且涉及多個(gè)基因的改變。遺傳因素在CRC發(fā)病中起重要的作用[3]。然而,CRC的發(fā)病機(jī)制尚不完全清楚,有待進(jìn)一步研究。MicroRNAs(miRNAs)是一種參與腫瘤發(fā)生、發(fā)展的調(diào)節(jié)性非編碼RNA,它通過與蛋白質(zhì)編碼mRNAs的3′端非編碼區(qū)(3′-UTR)結(jié)合,導(dǎo)致靶mRNA分子的翻譯抑制,在基因編碼轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中發(fā)揮重要作用。單個(gè)miRNA可調(diào)控多個(gè)靶mRNAs,miRNA可調(diào)控約60%的人類基因[4]。目前研究顯示miR-218 rs11134527、miR-25 rs41274221、miR-143 rs4705342、miR-106a rs137881717的基因多態(tài)性與不同類型癌癥的發(fā)生、發(fā)展相關(guān)[5]。而microRNA-218 rs11134527的GG基因型與多種癌癥的發(fā)生、發(fā)展存在密切相關(guān)性,尤其與消化道腫瘤有潛在關(guān)聯(lián)。我們初步篩選實(shí)驗(yàn)表明microRNA-218 rs11134527可能與CRC有潛在關(guān)系,并影響CRC的發(fā)生、發(fā)展。在此基礎(chǔ)上,應(yīng)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-連接酶檢測(cè)反應(yīng)技術(shù)(LDR-PCR)檢測(cè)上述基因在CRC患者血清中的表達(dá)水平,并采用二元邏輯回歸分析對(duì)miR-218 rs11134527等4個(gè)多態(tài)位點(diǎn)與CRC易感性的關(guān)聯(lián)程度進(jìn)行評(píng)估,旨在探討其多態(tài)位點(diǎn)在CRC診斷中的臨床價(jià)值,為CRC的篩查、診斷、治療及預(yù)后提供新思路。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 選取廣東醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院、江門市中心醫(yī)院、東莞市人民醫(yī)院和東莞市大朗醫(yī)院2017年8月至2019年7月確診為CRC并未作任何治療的66例患者(CRC組)。此外,選擇124例來自同期4個(gè)醫(yī)院且體檢結(jié)果均為正常的健康個(gè)體作為對(duì)照組。所有CRC患者和正常健康個(gè)體均為無血緣關(guān)系的人群。所有CRC患者均經(jīng)過組織病理學(xué)證實(shí)。本研究收集CRC患者標(biāo)本時(shí),采集患者靜脈血標(biāo)本2 mL,經(jīng)EDTA-K2抗凝,-20℃保存,進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。本研究經(jīng)嚴(yán)格審查批準(zhǔn),獲得相關(guān)4個(gè)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)的批準(zhǔn)進(jìn)行人體組織細(xì)胞采集、檢查與實(shí)驗(yàn),并與患者簽署知情同意書。

        1.2 基因組DNA的提取、分型 在受試者知情同意后,提取每個(gè)樣本的外周靜脈血,加入抗凝劑后充分混勻。用TIANGEN血液基因組DNA提取試劑盒提取各樣品的基因組DNA,并將提取的DNA保存在-80℃冰箱中,直至下一步的基因分型。對(duì)66例結(jié)直腸癌患者和124例健康對(duì)照者的microRNA-218 rs11134527、microRNA-25 rs41274221、microRNA -143 rs4705342 和 microRNA -106a rs137881717多態(tài)位點(diǎn)采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-連接酶檢測(cè)反應(yīng)技術(shù)(LDR-PCR)進(jìn)行分型。MicroRNA-218 rs11134527、microRNA-25 rs41274221、microRNA-143 rs4705342 和 microRNA-106a rs137881717四個(gè)單核苷酸多態(tài)性的基本信息在國家生物技術(shù)信息中心(National Center of Biotechnology Information,NCBI)提取,見表1。首先構(gòu)建PCR反應(yīng)體系,總體積為20μL,包括50 ng基因組DNA樣品、1×PCR緩沖液、3 mmol/LMg2+、2 mmol/L/每個(gè)dNTP、0.5 p引物混合物和1 U Taq DNA聚合酶。引物序列見表2。第二步是建立一個(gè)LDR反應(yīng)體系,該反應(yīng)體系總體積為10μL,其中包含1μL LDR緩沖液、第一步的4μL PCR產(chǎn)物、每種探針混合物2 pmol和2 U Taq DNA連接酶。探針序列見表3。在基因分型過程中,隨機(jī)選擇15%的樣品進(jìn)行重復(fù)測(cè)定,與先前測(cè)定結(jié)果一致率為100%。

        表1 rs11134527、rs41274221、rs4705342、rs137881717的基本信息

        表2 引物的信息

        表3 探針的信息

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 21.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理和統(tǒng)計(jì)分析,使用SHEsis軟件(http://analysis.bio-x.cn/myAnalysis.php)對(duì)microRNAs進(jìn)行單倍體估算和分析。對(duì)照組采用χ2檢驗(yàn)4個(gè)microRNA多態(tài)位點(diǎn)的基因型分布是否符合Hardy-Weinberg平衡原則。最后,通過二元邏輯回歸分析評(píng)估m(xù)icroRNA-218 rs11134527和其他4個(gè)單核苷酸多態(tài)性與CRC易感性的相關(guān)性,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 MicroRNA-218 rs11134527及其他3個(gè)單核苷酸多態(tài)性的基本信息 與NCBI數(shù)據(jù)庫中國受試者的最小等位基因頻率(MAF)對(duì)比,本研究對(duì)照組中4個(gè)單核苷酸多態(tài)性的MAF極為相似。結(jié)果顯示,對(duì)照組中除了rs41274221外,Hardy-Weinberg平衡測(cè)試均正常(P>0.05),見表4。因此,本研究樣本群體的基因型頻率分布大多遵循Hardy-Weinberg平衡原則。

        2.2 MicroRNA-218 rs11134527及其他3個(gè)單核苷酸多態(tài)性與CRC易感性的關(guān)聯(lián)分析 基因型關(guān)聯(lián)分析中,CRC組和對(duì)照組僅有microRNA-218 rs11134527這一單核苷酸多態(tài)性有顯著差異。二元邏輯回歸分析顯示,與AG、AA基因型相比,microRNA-218 rs11134527中GG基因型與CRC易感性增加相關(guān)(OR=2.31,95%CI:1.04~5.15,P=0.04),表明攜帶有GG基因型個(gè)體的CRC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)比攜帶AG或AA基因型個(gè)體高出2.31倍。在等位基因和基因型分析中并未發(fā)現(xiàn)其余3個(gè)單核苷酸多態(tài)性與CRC易感性有任何關(guān)聯(lián)(P>0.05)。見表4。

        表4 MicroRNA-218 rs11134527等4個(gè)單核苷酸多態(tài)性與CRC易感性的關(guān)聯(lián)分析 數(shù)量(%)

        2.3 MicroRNA-218 rs11134527和microRNA-143 rs4705342兩個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)形成的單體型與CRC易感性的關(guān)聯(lián)分析 通過進(jìn)一步的結(jié)構(gòu)分析,MicroRNA-218 rs11134527和microRNA-143 rs4705342均位于5號(hào)染色體上,這2個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)位于同一個(gè)單體型區(qū)。同時(shí),單倍體連鎖不平衡測(cè)試提示microRNA-218 rs11134527和microRNA-143 rs4705342之間存在連鎖關(guān)系。因此,本研究進(jìn)一步對(duì)比CRC組和對(duì)照組之間兩個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)形成的單體型頻率。納入本研究的2個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)的4種常見單體型(頻率>3%)幾乎占單體型變異的100%。單體型分析結(jié)果顯示,microRNA-218 rs11134527和microRNA-143 rs4705342形成的4種常見的單體型均與CRC易感性不存在任何關(guān)聯(lián)(P>0.05)。見表5。

        表5 MicroRNA-218 rs11134527和microRNA-143 rs4705342兩個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)形成的單體型與CRC易感性的關(guān)聯(lián)分析數(shù)量(%)

        3 討論

        CRC是一種多步驟、多因素、多基因疾病,由多種環(huán)境、生活方式和個(gè)體的遺傳易感因素共同作用的結(jié)果,其中個(gè)體遺傳易感性是CRC發(fā)生、發(fā)展的主要?jiǎng)右?。miRNAs在腫瘤發(fā)展過程中特異度較高,穩(wěn)定性好,因此microRNA對(duì)癌癥生物學(xué)具有重要意義,已有研究證實(shí)miRNAs可以作為乳腺癌、肺癌、腎癌等[6-8]腫瘤的生物標(biāo)志物。越來越多的研究表明,microRNA表達(dá)失調(diào)在CRC的發(fā)展和轉(zhuǎn)移中發(fā)揮著功能性的作用[9]。

        MicroRNA-218 rs11134527已被有關(guān)研究證實(shí)與肺癌[10]、宮頸癌[11]、食管鱗狀細(xì)胞癌[12]等多種癌癥的發(fā)生、發(fā)展密切關(guān)聯(lián)。然而,這些研究均提供了不同的結(jié)果。2018年Danesh等[13]報(bào)道m(xù)icroRNA-218 rs11134527單核苷酸多態(tài)性增加了患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)。此外,Chuanyin等[11]發(fā)現(xiàn),microRNA-218 rs11134527的GG基因型在宮頸上皮內(nèi)瘤樣變組和對(duì)照組中比AA和AG基因型具有更高的宮頸癌風(fēng)險(xiǎn)。在此基礎(chǔ)上,我們進(jìn)行了基因型關(guān)聯(lián)分析研究,結(jié)果表明microRNA-218 rs11134527與CRC的易感性增加有關(guān)(OR=2.31,95%CI:1.04~5.15),CRC組和對(duì)照組之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。而microRNA-25 rs41274221、microRNA-143 rs4705342和microRNA-106a rs137881717與CRC易感性卻無關(guān)聯(lián)(P>0.05)。再進(jìn)一步分析位于5號(hào)染色體同一個(gè)單體型塊上2個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)microRNA-218 rs11134527和microRNA-143 rs4705342,結(jié)果示2個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)形成的單體型與CRC易感性不存在關(guān)聯(lián)。

        目前,已有研究發(fā)現(xiàn)microRNA-218 rs11134527的AG +GG基因型與非小細(xì)胞肺癌的易感性降低有關(guān)[10];而本研究表明,與AG和AA基因型相比,攜帶有GG基因型個(gè)體的CRC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)比攜帶AG或AA基因型個(gè)體高出2.31倍。He等[14]報(bào)道m(xù)icroRNA-218 rs11134527的A>G單核苷酸多態(tài)性可降低個(gè)體罹患神經(jīng)母細(xì)胞瘤的風(fēng)險(xiǎn),這提示G等位基因可能是多種疾病發(fā)展的保護(hù)因子,但其在CRC中的作用有待進(jìn)一步研究。

        近年來有許多microRNA被報(bào)道可用于癌癥的化學(xué)治療,對(duì)降低腫瘤細(xì)胞的抵抗性有一定的作用。Nangia-Makker等[15]發(fā)現(xiàn)上調(diào)microRNA-145的表達(dá)和阻斷Wnt/β-catenin的信號(hào)可抑制CRC耐藥干細(xì)胞的增殖和克隆。目前CRC的主要化療方案是奧沙利鉑/氟尿嘧啶方案,血清中microRNA-92a-3p的高表達(dá)也與CRC的轉(zhuǎn)移和化療耐藥性高度相關(guān)[16]。microRNA-218可通過靶向Rictor增加宮頸癌患者對(duì)化療藥物雷帕霉素的敏感性[17]。通過靶向Glut1,microRNA-218也增加了膀胱癌對(duì)化療藥物順鉑的敏感性[18]。miR-218可通過下調(diào)TS的表達(dá),與5-氟尿嘧啶共同抑制CRC細(xì)胞的發(fā)生、發(fā)展,microRNA-218還可通過靶向BIRC5增強(qiáng)5-氟尿嘧啶誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡,從而增強(qiáng)藥物療效[19]。除BIRC5外,胸苷酸合酶(TS)也被發(fā)現(xiàn)與5-氟尿嘧啶的耐藥有關(guān)。奧沙利鉑作為化療的基礎(chǔ)藥物之一,其臨床發(fā)展也受到CRC細(xì)胞耐藥性的限制。Fu等[20]發(fā)現(xiàn)miR-218的高表達(dá)可以抑制CRC細(xì)胞的自噬,顯著提高腫瘤對(duì)奧沙利鉑的敏感性。此外,一些研究證實(shí)miR-218聯(lián)合MALAT1(一種長(zhǎng)鏈非編碼RNA)應(yīng)用可以抑制上皮細(xì)胞-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)過程,從而影響癌細(xì)胞對(duì)奧沙利鉑的敏感性[21]。以上結(jié)果表明,microRNA-218有望成為降低CRC細(xì)胞耐藥性的關(guān)鍵靶點(diǎn),但需要進(jìn)一步的研究來證明。

        綜上所述,本研究通過分析microRNA-218 rs11134527證明了microRNA-218 rs11134527與CRC易感性之間的關(guān)聯(lián)。然而,microRNA-218 rs11134527和microRNA-143 rs4705342單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)形成的單倍型與CRC的易感性無關(guān)。本研究的結(jié)果拓展了CRC易感基因的數(shù)據(jù)庫,并為未來的研究人員提供了研究方向。此外,microRNA-218 rs11134527有望成為未來CRC發(fā)生、發(fā)展的重要預(yù)測(cè)指標(biāo),為CRC的早期診斷和治療奠定堅(jiān)實(shí)的分子基礎(chǔ)。

        (志謝:感謝廣東醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院、東莞市人民醫(yī)院、東莞市大朗醫(yī)院、江門市中心醫(yī)院胃腸外科的醫(yī)護(hù)人員,在實(shí)驗(yàn)中尤其是標(biāo)本收集提供便利。)

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