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        廣東省東莞地區(qū)漢族人群20個STR基因座多態(tài)性及與22個群體FST遺傳距離的分析

        2021-12-02 11:04:28李雪蕾袁健彪林漢光
        中國保健營養(yǎng) 2021年31期

        李雪蕾 袁健彪 林漢光

        1.廣東正航司法鑒定中心,廣東 東莞 523000;2.東莞市公安局大嶺山分局,廣東 東莞 523000;3.廣東醫(yī)科大學(xué) ,廣東 東莞 523000

        人類的遺傳與變異使每一個體的遺傳信息與他的親代、子代具有相似性,但每一個體又具備自身的遺傳特征。將這些遺傳學(xué)參數(shù)進行調(diào)查、統(tǒng)計、分析,為該地區(qū)的漢族人群的相關(guān)研究和司法鑒定提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1樣本 1681例無關(guān)個體的樣本為廣東正航司法鑒定中心的2019-2020年案件的樣本,已征得當(dāng)事人的同意,樣本類型為血樣或口腔拭子。

        1.2設(shè)備與方法 所有樣本均采用Chelex法進行DNA提取。樣本中加入10% Chelex-100的混懸液 200μL, 置于eppendorf恒溫混勻儀上設(shè)置56℃恒溫震蕩孵育30min;劇烈振蕩5-10sec,98℃加熱8min; 12,000r/min離心3 min。取上清液用PowerPlex? 21 System人類熒光標(biāo)記STR復(fù)合擴增檢測試劑(Promega公司)進行復(fù)合PCR擴增。用ABI3100遺傳分析儀(ABI公司)進行毛細管電泳和基因型分析。

        1.3統(tǒng)計學(xué)分析 采用Arlequin v3.5、Powerstates軟件計算各基因座的隨機匹配概率(Pm)、個體識別率(DP)、多態(tài)性信息含量(PIC)、非父排除率(PE)、雜合度(He)、哈溫平衡P值(HWE-P)、遺傳距離矩陣。

        2 結(jié) 果

        2.1東莞地區(qū)漢族人群的STR基因座遺傳多態(tài)性及法醫(yī)遺傳學(xué)參數(shù) 用上述方法對1681位來自廣東東莞地區(qū)的漢族無關(guān)個體,進行20個常染色體STR基因座分析(含D3S1358、D1S1656、D6S1043、D13S317、Penta E、D16S539、D18S51、D2S1338、CSF1PO、Penta D、TH01、vWA、D21S11、D7S820、D5S818、TPOX、D8S1179、D12S391、D19S433、FGA),獲得等位基因頻率分布、隨機匹配概率(Pm)、個體識別率(DP)、多態(tài)性信息含量(PIC)、非父排除率(PE)、雜合度(He)、哈溫平衡P值(HWE-P)、FST遺傳距離矩陣等參數(shù)(表1)。

        表1 東莞地區(qū)漢族人群20個STR基因座的法醫(yī)遺傳學(xué)參數(shù)

        2.2東莞地區(qū)漢族人群與22個群體FST遺傳距離分析(表2)

        表2 本群體與22個群體FST遺傳距離矩陣各群體FST遺傳距離

        3 結(jié)果討論

        STR是人類基因組中存在的一類具有長度多態(tài)性的DNA序列,其具有信息量大、可選擇性強等特點,在法醫(yī)學(xué)的的個體識別與親子鑒定中應(yīng)用價值十分高。本文研究了廣東省東莞地區(qū)1681例無關(guān)個體的20個STR基因座的多態(tài)性分布情況,經(jīng)計算,此群體中的各基因座的基因型分布符合哈溫平衡定律(p>0.05);本研究的20個基因座中,DP>0.8,而除D3S1358、TH01、TPOX外,其余17個基因座均具有高度多態(tài)性,具有較高的應(yīng)用價值。

        由于STR具有高度的多態(tài)性及穩(wěn)定性,在進行不同民族或種族間的群體遺傳結(jié)構(gòu)分析時,認為DP>0.8,PE>0.5時則具有較高的應(yīng)用價值,而遺傳距離是評價群體間或者物種間的遺傳差異或者遺傳分化的最重要參數(shù)。表3清晰地列明東莞地區(qū)漢族人群與22個群體FST遺傳距離,從中可以看出不同的民族和地區(qū)相同的基因座的等位基因分布具有一定的差異性,因此,在日常鑒定工作中不同的人群之間的基因頻率數(shù)據(jù)不建議混用。

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