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        基于電化學(xué)發(fā)光和阻抗技術(shù)研究DNA 單堿基錯(cuò)配

        2021-12-02 01:09:54姚武崔朋胡曉倩
        關(guān)鍵詞:信號(hào)

        姚武,崔朋,胡曉倩

        (1.黃山學(xué)院 化學(xué)化工學(xué)院,安徽 黃山 245041;2.黃山學(xué)院 生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院,安徽 黃山 245041)

        0 引言

        人類基因研究揭示了單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP)與遺傳性疾病有直接關(guān)系。因此,DNA 單堿基錯(cuò)配的識(shí)別和穩(wěn)定性研究在疾病分子診斷、臨床預(yù)測(cè)、疾病預(yù)防和治療等領(lǐng)域有重要作用[1-3],得到國(guó)內(nèi)外研究者的持續(xù)關(guān)注。

        基于DNA 雜交、聚合酶、連接酶、內(nèi)切酶等技術(shù),結(jié)合不同信號(hào)表達(dá)方法,已有不同類型的DNA單堿基錯(cuò)配識(shí)別傳感器,包括熒光[4-6]、電化學(xué)[7-9]、電化學(xué)阻抗(EIS)[10-12]、電化學(xué)發(fā)光(ECL)[13-14]、石英晶體微天平(QCM)[15]、質(zhì)譜(MS)[16-17]、表面等離子體共振(SPR)[18]、可見(jiàn)光譜與可視化技術(shù)[19-21]等,并取得了長(zhǎng)足進(jìn)步。然而,單堿基錯(cuò)配識(shí)別仍存在巨大挑戰(zhàn),由于單堿基錯(cuò)配識(shí)別取決于其熱力學(xué)穩(wěn)定性,所以DNA 鏈中不同類型和不同位點(diǎn)的單堿基錯(cuò)配識(shí)別和穩(wěn)定性差異研究尤為重要。

        為發(fā)揮ECL 和EIS 技術(shù)的優(yōu)勢(shì),并對(duì)結(jié)果進(jìn)行相互印證,提高研究結(jié)果的可靠性,本文在同一電化學(xué)DNA 傳感器(EE-DNA 傳感器)平臺(tái)上,首次同時(shí)采用ECL 和EIS 技術(shù),研究與胞嘧啶堿基C 不同類型和不同位點(diǎn)單堿基錯(cuò)配堿基對(duì)的識(shí)別和穩(wěn)定性差異。EE-DNA 傳感器平臺(tái)的構(gòu)建參照文獻(xiàn)[13-14]并做適當(dāng)修改。傳感器表面具有莖環(huán)構(gòu)象的分子探針DNA(pDNA)與互補(bǔ)DNA(cDNA)雜交后,轉(zhuǎn)化為剛性線形的雙螺旋DNA,ECL 信號(hào)顯著減弱,EIS 信號(hào)顯著增強(qiáng)。pDNA 在與不同類型或不同位點(diǎn)的單堿基錯(cuò)配DNA 雜交時(shí),由于單堿基錯(cuò)配的穩(wěn)定性減弱程度不同,ECL 信號(hào)有不同程度的減弱,而EIS 信號(hào)有不同程度的增強(qiáng)。

        1 實(shí) 驗(yàn)

        1.1 儀器與試劑

        CHI660c 型電化學(xué)工作站(上海晨華儀器公司)用于三電極系統(tǒng)電解和EIS 信號(hào)采集。BPCL-2-KIC 型超微弱發(fā)光分析儀(中國(guó)科學(xué)院北京生物物理研究所)用于ECL 信號(hào)采集。日立U-3010 型紫外分光光度計(jì)(日本)用于測(cè)定紫外可見(jiàn)吸收光譜。

        二-(2,2'-聯(lián)吡啶)-4'-甲基-4-羧基聯(lián)吡啶釕(Ⅱ)琥珀酰胺酯-二-六氟磷酸鹽(Ru(bpy)2(cbpy)NHS)購(gòu)自Fluka 化學(xué)試劑公司,三丙基胺(TPA)(99%)購(gòu)自ACROS 化學(xué)試劑公司,三-(2-羧基乙基)膦鹽酸鹽(TCEP)和2-巰基乙醇(ME)購(gòu)自阿法埃莎(天津)化學(xué)有限公司。探針DNA(pDNA)、互補(bǔ)DNA(cDNA)和單堿基錯(cuò)配DNA(mDNA)等寡核苷酸鏈均購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司,寡核苷酸鏈序列見(jiàn)表1。pDNA 序列的兩端為6個(gè)互補(bǔ)堿基,可以形成莖環(huán)分子構(gòu)象,3'端修飾的氨基用于標(biāo)記聯(lián)吡啶釕分子,5'端修飾的巰基用于pDNA 通過(guò)Au—S 鍵在金電極上進(jìn)行自組裝。在含29 個(gè)堿基長(zhǎng)度的單堿基錯(cuò)配DNA 中,mDNA1、mDNA2、mDNA3、mDNA4、mDNA5 分別表示距5'端第1,8,13,20,27 號(hào)位點(diǎn)的C-A 單堿基錯(cuò)配的5種情形,mDNA6、mDNA7 分別表示 距5'端第13 號(hào)位點(diǎn)C-T 和C-C 單堿基錯(cuò)配的2 種情形。其他試劑均為分析純,使用時(shí)未經(jīng)純化。

        表1 寡核苷酸序列Table 1 Oligonucleotide sequences

        1.2 聯(lián)吡啶釕分子標(biāo)記pDNA

        依照文獻(xiàn)[22-23]的方法對(duì)pDNA 的聯(lián)吡啶釕發(fā)光分子標(biāo)記做適當(dāng)修改后進(jìn)行合成和表征。將0.25 mg 的Ru(bpy)2(cbpy)NHS 溶解于15 μL N,N-二甲基甲酰胺(DMF)中,然后將其加入85 μL 0.1 mol·L?1的硼砂緩沖溶液(pH 8.5)中,并將此溶液加入50 μL pDNA 水溶液(1 OD)中,振蕩搖勻,室溫下連續(xù)振蕩,過(guò)夜。此時(shí),Ru(bpy)2(cbpy)NHS 中的琥珀酰胺酯被pDNA 3'端的氨基取代,生成酰胺鍵,從而Ru(bpy)2(cbpy)被標(biāo)記到pDNA 3'端,得到發(fā)光分子聯(lián)吡啶釕標(biāo)記的pDNA(pDNARu)。振蕩過(guò)夜后,在其中加入30 μL 3 mol·L?1醋酸鈉溶液和600 μL 凍乙醇,振蕩搖勻,于?18 ℃冷凍放置24 h,在4 ℃和12 000 r·min?1條件下,進(jìn)行30 min 的冷凍離心,棄上層溶液,沉淀,用75%的凍乙醇溶液洗滌2 次,再次在4 ℃和12 000 r·min?1條件下離心,棄上層溶液,將所得沉淀物在室溫下干燥,再加37 μL 高純水溶解,作為pDNA-Ru 儲(chǔ)備液,置于4 ℃冰箱密封保存,待用。標(biāo)記產(chǎn)物用紫外可見(jiàn)吸收光譜進(jìn)行表征。

        1.3 EE-DNA 傳感器構(gòu)建

        依次用α-Al2O3粉進(jìn)行拋光,超純水和無(wú)水乙醇超聲清洗金電極,然后在0.5 mol·L?1H2SO4溶液中進(jìn)行循環(huán)伏安掃描,直至出現(xiàn)典型且穩(wěn)定的金電極循環(huán)伏安曲線。取出金電極,用超純水清洗干凈,并用高純氮?dú)獯蹈纱谩?/p>

        取一定量的pDNA-Ru 儲(chǔ)備液配制濃度為2 μmol·L?1的溶液(10 mmol·L?1PBS,0.1 mol·L?1NaCl,5 mmol·L?1MgCl2,1 mmol·L?1TCEP,pH 7.4)。將處理干凈且吹干的金電極迅速插入500 μL的上述溶液中,在室溫下浸泡4 h,pDNA-Ru 通過(guò)5'端修飾的巰基借助Au—S 鍵自組裝到金電極表面,用0.1 mol·L?1的PBS 緩沖溶液(pH 7.4)淋洗電極表面,洗去物理吸附的pDNA-Ru。將該電極浸泡于2 mmol·L?1ME 溶液(10 mmol·L?1PBS,1 mol·L?1NaCl,pH 7.4)中,鈍化30 min,除去非特異性鍵合的pDNA-Ru 和封閉未鍵合的pDNA-Ru 的金電極表面位點(diǎn)。完成EE-DNA 傳感器組裝,待用。

        1.4 EE-DNA 傳感器的ECL 和EIS 信號(hào)測(cè)量

        分別將新組裝的EE-DNA 傳感器、Ag/AgCl(飽和KCl)電極和鉑絲電極作為工作電極、參比電極和對(duì)電極,組成三電極系統(tǒng)。

        第1步,將三電極系統(tǒng)插入2.0 mL 5 mmol·L?1的[Fe(CN)6]4?/3?(0.1 mol·L?1KCl)溶液中,選擇電化學(xué)工作站交流阻抗方法測(cè)量EE-DNA 傳感器的EIS 信號(hào)(電荷轉(zhuǎn)移電阻Rct)。交流電壓振幅為5 mV,EIS 測(cè)量的頻率范圍為0.05 Hz~100 kHz。用0.1 mol·L?1的PBS 緩沖溶液(pH 7.4)清洗三電極系統(tǒng)。再將三電極系統(tǒng)插入2.0 mL 0.1 mol·L?1的TPA 溶液(0.1 mol·L?1PBS,pH 7.4)中,選擇電化學(xué)工作站循環(huán)伏安法進(jìn)行電解,同時(shí)用超微弱發(fā)光儀測(cè)量EE-DNA 傳感器的ECL 信號(hào)。循環(huán)伏安掃描電位范圍為0~0.75 V,掃描速度為100 mV·s?1。超微弱發(fā)光儀的光電倍增管偏壓設(shè)為?900 V。

        第2 步,將EE-DNA 傳感器放入cDNA 或不同單堿基錯(cuò)配DNA 溶液(10 mmol·L?1PBS,0.1 mol·L?1NaCl,5 mmol·L?1MgCl2,pH 7.4)中,于37 ℃下孵化雜交30 min,取出,用0.1 mol·L?1的PBS 緩沖溶液(pH 7.4)淋洗電極表面。重復(fù)第1步,分別測(cè)定孵化雜交后的EIS 和ECL 信號(hào)。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 pDNA-Ru 的紫外可見(jiàn)吸收光譜表征

        用紫外可見(jiàn)吸收光譜表征pDNA-Ru,如圖1 所示。圖內(nèi)插圖為pDNA-Ru 吸收光譜曲線的局部放大。450 nm 的吸收峰對(duì)應(yīng)聯(lián)吡啶釕琥珀酰胺酯452 nm 的特征吸收,是聯(lián)吡啶釕配離子中金屬釕到配體的電荷轉(zhuǎn)移特征吸收帶,說(shuō)明聯(lián)吡啶釕已被成功地標(biāo)記在pDNA 鏈上。

        圖1 pDNA、Ru(bpy)2(cbpy)NHS 和pDNA-Ru 的紫外可見(jiàn)吸收光譜Fig.1 The UV-Vis spectra of pDNA、Ru(bpy)2(cbpy)NHS and pDNA-Ru

        2.2 EE-DNA 傳感器的循環(huán)伏安表征

        電化學(xué)探針[Fe(CN)6]4?/3?的循環(huán)伏安曲線常被用于表征電極修飾過(guò)程和DNA 雜交過(guò)程。圖2 是不同修飾階段的金電極在[Fe(CN)6]4?/3?溶液中的循環(huán)伏安曲線,由圖2 中a,b 曲線可知,裸金電極用pDNA-Ru 修飾,并經(jīng) ME 溶液鈍化后,探針[Fe(CN)6]4?/3?的氧化和還原峰電流均明顯減小,峰電位差顯著增大。這是由于pDNA 通過(guò)Au—S 鍵自組裝到金電極表面后,金電極表面被一層pDNA-Ru 覆蓋,DNA 鏈中帶負(fù)電荷的磷酸基團(tuán)與帶負(fù)電荷的電化學(xué)探針[Fe(CN)6]4?/3?之間存在靜電排斥作用,減弱了探針[Fe(CN)6]4?/3?與電極表面的電荷傳遞。由圖2 中的c 和d 曲線可知,當(dāng)探針pDNA-Ru 分別與0.2 和20 nmol·L?1的目標(biāo)cDNA雜交后,探針[Fe(CN)6]4?/3?的峰電流進(jìn)一步減小,峰電位差進(jìn)一步增大。這是由于雜交形成雙鏈DNA后,金電極表面的DNA 進(jìn)一步增多,負(fù)電荷量繼續(xù)增加,進(jìn)一步阻礙了探針[Fe(CN)6]4?/3?在電極表面的電化學(xué)反應(yīng)。

        圖2 裸金電極(a),pDNA-Ru 修飾電極(b),pDNA-Ru 分別與0.2 和20 nmol·L?1 cDNA 雜交后的修飾電極((c)和(d))在5 mmol·L?1[Fe(CN)6]4?/3?(0.10 mol·L?1 KCl)溶液中的循環(huán)伏安曲線Fig.2 CVs of the modified electrode at different stages in 5 mmol·L?1[Fe(CN)6]4?/3?(0.10 mol·L?1 KCl)solution.(a)bare Au electrode;(b)pDNA-Ru modified Au electrode;(c)and(d)pDNA-Ru modified Au electrode after hybridization with 0.2 and 20 nmol·L?1 cDNA solution,respectively

        2.3 實(shí)驗(yàn)條件優(yōu)化

        探針pDNA-Ru 的自組裝時(shí)間對(duì)ECL 信號(hào)有顯著影響。當(dāng)自組裝時(shí)間低于4 h 時(shí),pDNA-Ru 組裝量不夠,ECL 信號(hào)較弱。當(dāng)自組裝時(shí)間接近4 h 時(shí),ECL 信號(hào)最強(qiáng)。當(dāng)自組裝時(shí)間大于4 h 時(shí),ECL 信號(hào)減弱,這可能是由于自組裝時(shí)間過(guò)長(zhǎng),在金電極表面非特異性吸附的pDNA-Ru 增多,在后續(xù)的鈍化過(guò)程中不能完全排除,雖然聯(lián)吡啶釕分子增加了,但電極表面的電阻也大大增加,導(dǎo)致導(dǎo)電性減弱,不利于電極表面發(fā)生電化學(xué)反應(yīng),從而使ECL 信號(hào)減弱。因此,選擇pDNA-Ru 自組裝時(shí)間為4 h。

        EE-DNA 傳感器的電解電位是影響ECL 信號(hào)強(qiáng)度和重復(fù)性的重要參數(shù),如圖3 所示。當(dāng)電位為0~0.60 V 時(shí),幾乎無(wú)ECL 信號(hào)產(chǎn)生。當(dāng)電位為0~0.70 V 時(shí),ECL 信號(hào)很弱,連續(xù)測(cè)定2 次,信號(hào)基本穩(wěn)定。當(dāng)電位為0~0.75 V 時(shí),ECL 信號(hào)顯著增強(qiáng),連續(xù)測(cè)定3 次,信號(hào)基本穩(wěn)定。當(dāng)電位為0~0.80 V時(shí),第1 次掃描測(cè)定,ECL 信號(hào)強(qiáng)度比高位為0.75 V時(shí)還高,但繼續(xù)掃描第2,3 次,ECL 信號(hào)顯著減小。繼續(xù)增高電位,ECL 信號(hào)顯著降低。產(chǎn)生這種現(xiàn)象的原因可能是電位達(dá)到0.80 V 或更高后,Au—S 鍵因氧化被破壞,探針pDNA-Ru 從金電極表面脫落,導(dǎo)致ECL 信號(hào)減弱且不穩(wěn)定。因此,選擇循環(huán)伏安電解電位為0~0.75 V。

        圖3 電解電位對(duì)EE-DNA 傳感器ECL 信號(hào)強(qiáng)度的影響Fig.3 The dependence of the ECL intensity and reproducibility on the applied potential

        pDNA-Ru 與目標(biāo)DNA 的孵化雜交時(shí)間對(duì)傳感器ECL 信號(hào)的變化也有顯著影響。隨著EEDNA 傳感器與cDNA 孵化雜交時(shí)間從10 min 增至30 min,ECL 信號(hào)逐漸減弱,當(dāng)孵化雜交時(shí)間超過(guò)30 min 后,ELC 信號(hào)基本保持穩(wěn)定??梢?jiàn)孵化30 min 可以使雜交達(dá)到飽和。因此,選擇孵化雜交時(shí)間為30 min。

        2.4 pDNA-Ru 與cDNA 和單堿基錯(cuò)配mDNA3 雜交前后ECL 和EIS 信號(hào)的變化

        在上述優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件下,pDNA-Ru 與0.2 和20 nmol·L?1的目標(biāo)cDNA 雜交前后,EE-DNA 傳感器的ECL 信號(hào)強(qiáng)度(IECL)和EIS 信號(hào)強(qiáng)度(Rct)發(fā)生了顯著變化,如圖4 所示。在pDNA-Ru 與互補(bǔ)cDNA 雜交前,其IECL為2 182 a.u.,Rct為705 Ω。在pDNA-Ru 分別與0.2 和20 nmol·L?1的cDNA 雜交后,IECL顯著降低,降至922 和365 a.u.,Rct分別增至1 381 和1 709 Ω。雜交前后的IECL變化(?ΔIECL)和電荷轉(zhuǎn)移電阻變化(ΔRct)分別為1 260,1 817 a.u.和676,1 004 Ω。

        圖4 pDNA-Ru 雜交前、分別與0.2 和20 nmol·L?1 cDNA 雜交后的ECL 曲線和EIS 曲線Fig.4 ECL spectra and EIS spectra of pDNA-Ru,pDNA-Ru after hybridization with 0.2 and 20 nmol·L?1 cDNA,respectively

        產(chǎn)生此結(jié)果的原因是,當(dāng)pDNA-Ru 與cDNA充分雜交后,莖環(huán)構(gòu)象轉(zhuǎn)變?yōu)閯傂跃€形的雙鏈DNA結(jié)構(gòu),導(dǎo)致ECL 信號(hào)分子聯(lián)吡啶釕遠(yuǎn)離電極表面,電極反應(yīng)速率下降,ECL 信號(hào)強(qiáng)度顯著降低。同時(shí),由于電極表面DNA 量增多,負(fù)電荷數(shù)增加,進(jìn)一步阻礙了電化學(xué)探針[Fe(CN)6]4?/3?在電極表面的電化學(xué)反應(yīng),電荷轉(zhuǎn)移電阻顯著增大,導(dǎo)致?ΔIECL和ΔRct較大。

        pDNA-Ru 與0.2 和20 nmol·L?1的單堿基錯(cuò)配mDNA3(距5'端第13 位點(diǎn)C-A 單堿基錯(cuò)配DNA)雜交前后,IECL和Rct變化相對(duì)較小,如圖5 所示。雜交前IECL為2 300,Rct為625 Ω,雜交后IECL分別降至1 624 和1 174 a.u.,Rct分別 增至789 和804 Ω。此時(shí),雜交前后的?ΔIECL和ΔRct分別為676,1 126 a.u.和164,179 Ω。

        圖5 pDNA-Ru 雜交前、分別與0.2 和20 nmol·L?1 mDNA3雜交后的ECL 曲線和EIS 曲線Fig.5 ECL spectra and EIS spectra of pDNA-Ru,pDNA-Ru after hybridization with 0.2 and 20 nmol·L?1 mDNA3,respectively

        當(dāng)具有莖環(huán)構(gòu)象的pDNA-Ru 與第13 位點(diǎn)的C-A 單堿基錯(cuò)配mDNA3 孵化時(shí),雜交前后的?ΔIECL和ΔRct大大減小,說(shuō)明pDNA-Ru 與mDNA3 的結(jié)合較弱,雜交穩(wěn)定性明顯降低,使得具有頸環(huán)構(gòu)象的pDNA-Ru 形成剛性線形雙鏈DNA的概率大大降低,導(dǎo)致?ΔIECL減小,ΔRct降低。

        2.5 不同類型或不同位點(diǎn)單堿基錯(cuò)配DNA 的識(shí)別和穩(wěn)定性差異

        圖6 為探針pDNA-Ru 分別與0.2 nmol·L?1的cDNA 和不同類型或不同位點(diǎn)單堿基錯(cuò)配DNA 雜交前后的?ΔIECL和ΔRct。可 知,pDNA-Ru 與cDNA 雜交前后,?ΔIECL和ΔRct分別為1 260 a.u.和676 Ω。探 針 pDNA-Ru 與 mDNA1、mDNA2、mDNA3、mDNA4、mDNA5 雜交前后,?ΔIECL和ΔRct分別為1 177,991,660,906,788 a.u.和587,365,164,295,271 Ω。探針pDNA-Ru 與mDNA6、mDNA7 雜交前后,?ΔIECL和ΔRct分別為813,594 a.u.和288,157 Ω。因此可根據(jù)?ΔIECL和ΔRct對(duì)不同類型、不同位點(diǎn)單堿基錯(cuò)配DNA 進(jìn)行識(shí)別和穩(wěn)定性差異研究。

        圖6 pDNA-Ru 與cDNA(0.2 nmol·L?1)和單堿基錯(cuò)配DNA(0.2 nmol·L?1)雜交前后的?ΔIECL(a)和ΔRct(b)Fig.6 ?ΔIECL(a)和ΔRct(b)of pDNA-Ru before and after hybridization with cDNA(0.2 nmol·L?1)and different singlebase mismatch DNAs(0.2 nmol·L?1)

        比 較 pDNA-Ru 與 mDNA1、mDNA2、mDNA3、mDNA4、mDNA5 雜交前后的?ΔIECL和ΔRct,可知在DNA 鏈中間位點(diǎn)的C-A 單堿基錯(cuò)配mDNA3 的?ΔIECL和ΔRct最小,而鏈兩端位點(diǎn)C-A單堿基錯(cuò)配DNA 的?ΔIECL和ΔRct相對(duì)較大,說(shuō)明鏈中間位點(diǎn)的C-A 單堿基錯(cuò)配的穩(wěn)定性小于鏈兩端位點(diǎn)的,該結(jié)論 與ABAD-VALLE 等[24]和LI等[25]的實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致。

        KELLEY 等[26]認(rèn)為,錯(cuò)配的單堿基對(duì)離電極表面越近,對(duì)雜交的穩(wěn)定性影響越大,而ITO 等[12]和TAWA 等[27]得到了相反的結(jié)論,認(rèn)為在DNA 雜交過(guò)程當(dāng)中,單堿基錯(cuò)配出現(xiàn)在離固體基底最遠(yuǎn)的位置,即越接近溶液的單堿基錯(cuò)配越不穩(wěn)定,越容易被識(shí)別。通過(guò)比較本文圖6 中mDNA1 和mDNA5、mDNA2 和mDNA4 的?ΔIECL和ΔRct的變化可知,靠近鍵合電極表面雙鏈鏈端的C-A 單堿基錯(cuò)配的穩(wěn)定性小于非鍵合電極表面雙鏈鏈端的,此結(jié)果與KELLEY[26]等的研究結(jié)果相同。

        WU 等[20]采用可見(jiàn)光譜與可視化技術(shù)研究了與胞嘧啶C 單堿基錯(cuò)配的識(shí)別,得到的穩(wěn)定性順序?yàn)镃-G?C-T>C-A>C-C。HUANG 等[5]用氧化石墨烯熒光淬滅技術(shù)進(jìn)行了與胞嘧啶C 單堿基錯(cuò)配的識(shí)別檢測(cè),得到的穩(wěn)定性順序?yàn)镃-G?C-A≈C-C≈C-T。本文研究了單堿基錯(cuò)配DNA 中心位點(diǎn)分別為C-A、C-T、C-C 3 種錯(cuò)配情況對(duì)雜交穩(wěn)定性的影響,通過(guò)比較研究cDNA、mDNA3、mDNA6 和mDNA7 的?ΔIECL和ΔRct變化,發(fā)現(xiàn)C-T 單堿基錯(cuò)配的穩(wěn)定性略高于C-A 和C-C 的,穩(wěn)定性順序?yàn)镃-G ?C-T>C-A≥C-C。該結(jié)果 與WU 等[20]的研究結(jié)果較接近。

        3 結(jié)論

        將具有莖環(huán)構(gòu)象、標(biāo)記有聯(lián)吡啶釕分子的DNA鏈作為探針,構(gòu)建DNA 生物傳感器,通過(guò)該pDNARu 與cDNA 和單堿基錯(cuò)配DNA 雜交前后ECL 和EIS 信號(hào)變化的差異進(jìn)行單堿基錯(cuò)配DNA 識(shí)別,并研究了不同類型和不同位點(diǎn)單堿基錯(cuò)配的穩(wěn)定性差異。結(jié)果表明,DNA 鏈中心位點(diǎn)的C-A 單堿基錯(cuò)配穩(wěn)定性小于鏈兩端的,靠近鍵合電極表面雙鏈鏈端的C-A 單堿基錯(cuò)配穩(wěn)定性小于非鍵合電極表面雙鏈鏈端的,同一中心位點(diǎn)的堿基對(duì)穩(wěn)定性順序?yàn)镃-G ?C-T>C-A≥C-C。研究結(jié)果可為核酸多態(tài)性研究提供參考。

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