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        DNA損傷與修復(fù)在食管癌中的研究進展

        2021-11-30 00:57:44許海軍阮豪杰李孟祥高社干
        食管疾病 2021年3期
        關(guān)鍵詞:食管癌基因組食管

        許海軍,阮豪杰,陳 攀,李孟祥,高社干

        多種DNA損傷因素能夠引起遺傳物質(zhì)DNA的損傷,這些因素包括:外部環(huán)境中的化學致癌物,機體細胞和腸道微生物代謝所產(chǎn)生的內(nèi)源性化學致癌物,活化的免疫細胞(如單核細胞和巨噬細胞)產(chǎn)生的自由基,紫外線(ultraviolet,UV)和電離輻射,以及許多藥物等[1-6]。DNA損傷修復(fù)不全引起的基因突變和染色體損傷,是癌性轉(zhuǎn)化和腫瘤進展的重要因素[7]。為了維持基因組的穩(wěn)定性,細胞具有DNA損傷反應(yīng)途徑和DNA修復(fù)系統(tǒng),以修復(fù)或清除DNA損傷[8]。未能修復(fù)的損傷具有細胞毒性,能夠誘導細胞凋亡、壞死[9],而DNA修復(fù)的異常會引起癌癥[10]。DNA損傷引起的細胞死亡是一個主動調(diào)控的生物學過程,多種分子參與的復(fù)雜分子網(wǎng)絡(luò)決定了細胞是生存或死亡[11]。闡明DNA修復(fù)與細胞死亡的關(guān)系及其分子調(diào)控機制,對提高腫瘤化療效果有重大意義。

        食管癌(esophageal cancer,EC)是消化道最常見的惡性腫瘤之一,主要包括兩種組織學類型,即:食管鱗狀細胞癌(esophageal squamous cell cancer,ESCC)和食管腺癌(esophageal adenocarcinoma,EAC)。ESCC是目前全球最常見的組織學亞型[12-13]。盡管在食管癌的診斷方面取得了進展,但多數(shù)患者在發(fā)現(xiàn)時已處于晚期,導致整體存活率低。因此,闡明食管癌發(fā)生、發(fā)展的分子機制,鑒定分子標記物是相當重要的臨床問題。鑒于DNA損傷與修復(fù)與食管癌發(fā)生發(fā)展的密切關(guān)系,本文綜述DNA損傷與修復(fù)在食管癌發(fā)生、發(fā)展中的可能作用及其機制,供相關(guān)領(lǐng)域研究參考。

        1 DNA損傷與修復(fù)反應(yīng)

        生物體的遺傳信息儲存于DNA分子的堿基序列中。為應(yīng)對體內(nèi)外因素引起的DNA損傷,生物長期進化形成了各種DNA損傷修復(fù)機制。在人類基因組的3×109個堿基中,每個細胞每天有高達25 000個堿基通過正常的細胞過程(例如代謝和DNA復(fù)制)或在外部因素(例如紫外線)等的作用下被改變。香煙煙霧中的電離輻射、環(huán)境致癌物和化學物質(zhì)等,都可以引起DNA損傷[14]。機體通過修復(fù)這些損傷以避免基因突變、染色體斷裂和復(fù)制受阻。無法修復(fù)的DNA損傷或在修復(fù)中出錯,會誘發(fā)基因組不穩(wěn)定和遺傳畸變、癌變,同時也會通過細胞凋亡和遺傳損傷的積累,促進衰老[15]。 因此,對于有機體而言,進行無錯修復(fù)以在上述兩個極端之間取得平衡才是最有利的。

        細胞內(nèi)DNA損傷修復(fù)的類型取決于DNA損傷的性質(zhì)。檢測和修復(fù)DNA損傷還取決于細胞在細胞周期[16]中的位置,以及損傷區(qū)域基因的轉(zhuǎn)錄活躍程度[17]。此外,DNA甲基化程度和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)也影響DNA修復(fù)。如果DNA損傷嚴重,無論細胞處于哪個細胞周期,都會導致細胞周期停滯和凋亡[17]。

        由DNA損傷觸發(fā)修復(fù)機制的調(diào)控,引起細胞內(nèi)的一系列相關(guān)反應(yīng)稱為DNA損傷反應(yīng)(DNA damage response,DDR)。DNA損傷的修復(fù)途徑有4種類型:對DNA堿基和單鏈斷裂(single-strand break,SSB)氧化損傷的堿基切除修復(fù)(base excision repair,BER)、去除大量加合物的核苷酸切除修復(fù)(nucleotide excision repair,NER)、DNA發(fā)生錯誤時的錯配修復(fù)(mismatch repair,MMR)以及雙鏈斷裂修復(fù)(double-strand break repair,DSBR),DSBR又包括兩種機制:非同源末端連接(non-homologous end joining,NHEJ)和同源重組(homologous recombination,HR),NHEJ直接連接斷端而不需要模板,而HR使用完整的姐妹染色單體作為修復(fù)模板,根據(jù)細胞類型、環(huán)境和DNA損傷的性質(zhì),這兩種DSBR修復(fù)機制可能會聯(lián)合[18-19]。BER、NER、MMR和HR是無錯誤的DDR形式,它們通常產(chǎn)生天然DNA,而NHEJ是一種容易出錯或有缺陷的修復(fù)途徑,經(jīng)常會導致DNA序列改變。

        2 DNA損傷與修復(fù)相關(guān)癌突變信號

        2.1 與年齡相關(guān)信號

        癌基因組中與年齡相關(guān)的標志性突變可能在腫瘤生命周期的任何時候發(fā)生。在大多數(shù)癌癥類型中都能觀察到與年齡相關(guān)的突變特征[20]。這種突變過程的特征是CpG二核苷酸基序內(nèi)的C > T轉(zhuǎn)變,這種轉(zhuǎn)變與甲基化胞嘧啶的自發(fā)脫氨反應(yīng)相對應(yīng)[20]。

        2.2 DNA修復(fù)途徑缺陷相關(guān)信號

        失活突變的MMR基因或與HR雙鏈斷裂修復(fù)途徑相關(guān)的基因,與癌癥的形成和耐藥有關(guān)。以CpG位點的C>T轉(zhuǎn)變?yōu)樘卣鞯腗MR缺陷與核苷酸重復(fù)序列上的替代或缺失有關(guān)。這些類型的不穩(wěn)定性,也稱為“微衛(wèi)星不穩(wěn)定性”,在結(jié)直腸癌、子宮癌、肝癌、腎癌、前列腺癌、食道癌和胰腺癌中都可以觀察到[20]。

        2.3 APOBEC相關(guān)信號

        載脂蛋白BmRNA編輯酶催化多肽(apolioprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide,APOBEC)家族是一類高效的胞苷脫氨酶,其轉(zhuǎn)錄過程可被促炎癥細胞因子和趨化因子激活,并在人體的固有和獲得性免疫機制中發(fā)揮重要作用。APOBEC酶最初被確定為在抗病毒先天免疫中發(fā)揮作用,由于其使DNA脫去氨基、誘導堿基轉(zhuǎn)換的能力,最近被證明參與癌癥的突變負荷和克隆進化[21]。APOBEC酶是將胞苷轉(zhuǎn)化為尿嘧啶的胞苷脫氨基酶家族的一部分,C到T的轉(zhuǎn)化和C到G的轉(zhuǎn)化也是APOBEC酶活性的常見突變結(jié)果。APOBEC相關(guān)信號是在癌癥中觀察到的第二種最常見的突變信號。

        2.4 吸煙相關(guān)信號

        生活方式因素,如飲食、飲酒、抽煙和缺乏鍛煉,都與癌癥風險增加有關(guān)。吸煙是世界范圍內(nèi)導致癌癥的重要原因,有證據(jù)表明,吸煙與20種不同類別的癌癥有關(guān)[22]。香煙煙霧可直接誘導不同類型的DNA損傷,這些損傷可通過NER、HR、NHEJ和BER修復(fù)。雖然吸煙的特征主要是C>A轉(zhuǎn)換,這與轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)的NER去除大量的DNA加合物有關(guān),但煙草誘導的DNA損傷的多方面性質(zhì)表明,可能會出現(xiàn)其他與煙草相關(guān)的突變類型。

        2.5 紫外線相關(guān)信號

        與紫外線暴露相關(guān)的突變特征主要見于黑色素瘤,這種突變特征主要對應(yīng)于未轉(zhuǎn)錄DNA鏈上的C >T轉(zhuǎn)換,與紫外線照射誘導的環(huán)丁烷嘧啶二聚體或光產(chǎn)物的修復(fù)一致。在整個腫瘤基因組中都檢測到了紫外突變信號,但在黑色素瘤、皮膚鱗狀細胞癌和基底細胞皮膚癌中,發(fā)現(xiàn)紫外突變信號在轉(zhuǎn)錄活性啟動子的特定位置富集[23]。導致紫外線介導的啟動子復(fù)發(fā)性位點突變的機制仍不清楚,還需要進一步研究。

        3 食管癌相關(guān)的DNA損傷

        3.1 ESCC相關(guān)的DNA損傷研究

        3.1.1 DNA損傷修復(fù)與ESCC放射敏感性中國食管癌的主要類型是ESCC,占全球食管癌的70% ,患者5 a生存率不到30%。雖然目前 ESCC的診斷和治療已有改善,但預(yù)后仍然很差[24]。在ESCC中BER基因的多態(tài)性可能與ESCC的易感性有關(guān)[25-26]。NER基因的遺傳變異與ESCC患者的生存結(jié)果有關(guān)[27-28]。此外,NHEJ途徑中XRCC6和XRCC5基因的遺傳多態(tài)性與ESCC的高風險有關(guān)[29]。對于維持基因組穩(wěn)定性很重要的MMR基因MLH1的啟動子甲基化可能是男性ESCC患者預(yù)后的預(yù)測因子[30]。DNA損傷修復(fù)途徑的改變與癌癥的易感性有關(guān),并有助于癌癥的治療反應(yīng)和耐藥性反應(yīng)。DDR途徑的紊亂與腫瘤起因、發(fā)生發(fā)展和療效具有很大關(guān)聯(lián),DDR途徑的上調(diào)與DNA的放療和化療耐藥性有關(guān)[31]。ESCC在DDR通路的基因改變以基因突變和拷貝數(shù)變異(copy number variations,CNVs)為主。與其他途徑相比,兩條DNA雙鏈斷裂修復(fù)途徑同源重組(HR)和非同源末端連接(NHEJ)攜帶顯著的基因突變和CNV,尤其是基因擴增。DSB修復(fù)基因的激活也是癌癥耐放化療的原因之一[32]。在ESCC中,包括RAD54B、NBS1、RAD51B和 PRKDC在內(nèi)的大多數(shù)基因顯著擴增和過量表達,表明DSB修復(fù)途徑在ESCC上調(diào)。此外,在DSB途徑基因擴增的ESCC細胞中,分別用于HR和NHEJ的兩種抑制劑mirin和NU7441與電離輻射處理的組合顯著增強了DSBs,降低了克隆形成細胞的存活率,抑制了細胞增殖,并促進了細胞凋亡,這些發(fā)現(xiàn)表明,mirin和NU7441可以明顯提高DSB修復(fù)途徑基因擴增后的ESCC細胞的放射敏感性,揭示了在ESCC治療中的潛在臨床應(yīng)用價值[33]。

        3.1.2 DNA損傷反應(yīng)調(diào)控,促進ESCC化療敏感性眾所周知,DNA損傷修復(fù)是順鉑的重要耐藥機制。HOXB7是HOX家族基因的一員,是重要的發(fā)育調(diào)節(jié)基因,在癌癥中經(jīng)常發(fā)生調(diào)節(jié)失調(diào)。HOXB7在ESCC組織中的過度表達可促進致癌性,并預(yù)示著食管鱗癌的不良預(yù)后[34]。HOXB7參與了與Ku70/Ku80/DNA-PKC相關(guān)的NHEJ修復(fù)途徑。然而,NHEJ修復(fù)途徑容易出錯,產(chǎn)生有害突變和染色體異常,從而引發(fā)腫瘤[35-36]。HOXB7的高表達通過與Ku70、Ku80、DNA-PKcs相互作用并誘導細胞周期停滯而賦予ESCC細胞化學抗性,下調(diào)其表達或破壞其功能可增強化學敏感性。HOXB7可作為評價化療耐藥性的生物標志物[37],是有希望的治療靶點。ATM參與順鉑誘導的DNA損傷反應(yīng),并且ATM的激活誘導細胞周期檢查點和DNA修復(fù)反應(yīng)的激活[38]。研究發(fā)現(xiàn)E2F1可以通過增強ATM啟動子活性來提高ATM的表達水平。順鉑治療后,通常會激活多種DNA修復(fù)機制,對順鉑損傷的DNA進行修復(fù)。E2F1-ATM通路中通過miR-302降低ATM表達可導致腫瘤細胞對順鉑等藥物的敏感性增加[39]。ATM缺乏使細胞對順鉑誘導的凋亡敏感。miR-26b通過消除ATM激活參與DNA損傷途徑的調(diào)節(jié),最終影響DNA修復(fù)和細胞增殖。E2F1增加了順鉑在ESCC的化療敏感性,其作用可能是由于其靶基因miR-26b的上調(diào)。miR-26b作為腫瘤抑制基因調(diào)節(jié)細胞周期停滯,順鉑誘導的周期停滯依賴于ESCC的miR-26b。此外,miR-26b可能通過降低ATM的表達來干擾DNA損傷反應(yīng)[40]。

        3.1.3 DNA損傷修復(fù)應(yīng)答與ESCC耐藥性ESCC患者的預(yù)后很差,對ESCC患者進行的化學放射治療(CCRT)經(jīng)常由于耐藥而失敗。在CCRT反應(yīng)差的ESCC患者的治療前內(nèi)鏡活檢中,高DNA甲基化與SOX17的低表達一致。SOX17蛋白表達在區(qū)分差的CCRT應(yīng)答者和好的應(yīng)答者方面,表現(xiàn)出良好的預(yù)測性能。SOX17轉(zhuǎn)錄下調(diào)KYSE510抗輻射細胞中的DNA修復(fù)和損傷反應(yīng)相關(guān)基因,包括BRCA1、BRCA2、RAD51、KU80 DNAPK、p21、SIRT1、NFAT5和REV3L,以達到對抗癌治療的致敏作用。在ESCC放射耐藥細胞和異種移植細胞模型中,SOX17的CCRT增敏效應(yīng)是通過SOX17轉(zhuǎn)錄調(diào)控DNA損傷和修復(fù)應(yīng)答基因?qū)崿F(xiàn)的??偟膩碚f,通過SOX17介導的轉(zhuǎn)錄激活腫瘤抑制功能可以作為克服ESCC耐藥的關(guān)鍵靶點[41]。

        3.2 EAC相關(guān)的DNA損傷研究

        EAC的獨特危險因素之一是胃食管反流性疾病(gastro-esophageal reflux disease,GERD),這是一種慢性消化疾病,來自胃的酸性內(nèi)容物經(jīng)常與十二指腸膽汁混合,進入食管導致食管組織損傷。在細胞水平上,EAC的進展是由反流和慢性炎癥因子的持續(xù)DNA損傷引起的,這些損傷增加了突變率,促進了基因組的不穩(wěn)定性。反流對食道細胞有遺傳毒性作用,已知的與反流相關(guān)的致癌因素是DNA損傷。鹽酸和膽鹽是引起DNA損傷的反流酸的最顯著成分,在體外實驗環(huán)境中,短時間暴露于酸性pH值和膽鹽中,可誘發(fā)ROS、氧脅迫和DNA損傷[42]。線粒體和NADPH氧化酶(NADPH oxidases,NOX)都被發(fā)現(xiàn)與ROS的過量產(chǎn)生有關(guān),反流激活GERD和BE患者食管中的NOX1和NOX2酶[43]。NOX5-S是NOX5的一個階段變種,在酸性條件下也被激活[44-45],這些酶會產(chǎn)生破壞基因組DNA的超氧陰離子和過氧化氫。ROS也被認為在巴雷特上皮化生(Barrett’s metaplasia,BE)中會導致線粒體DNA突變[46]。

        EAC的病因復(fù)雜,涉及多種遺傳、飲食、行為和環(huán)境因素。胃食管反流已被確認為EAC最強烈的危險因素之一。目前公認的是GERD導致組織損傷和繼發(fā)BE,然后發(fā)展為食管-咽發(fā)育不良和浸潤性癌癥。EAC的發(fā)展是由反流引起的DNA持續(xù)損傷,促進基因組不穩(wěn)定和多種腫瘤抑制和致癌途徑的改變。新的和更先進技術(shù)的發(fā)展有助于更好地了解這種癌癥的分子和細胞基礎(chǔ),并幫助識別EAC治療的新分子靶點。

        硫氧還蛋白相互作用蛋白(thioredoxin-interacting protein,TXNIP)在正常和惡性細胞中起代謝調(diào)節(jié)劑的作用。EAC中TXNIP的表達與較高的腫瘤分化、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的缺乏和神經(jīng)周圍侵襲的減少有關(guān)。在食管癌切除術(shù)前接受蒽環(huán)類化療的EAC患者中,TXNIP高表達也與疾病特異性生存率的提高相關(guān)[47]。TXNIP是糖酵解、葡萄糖攝取和糖酵解基因表達的負調(diào)節(jié)因子,也是多種癌癥的腫瘤抑制因子。葡萄糖和谷氨酰胺對TXNIP的調(diào)節(jié),表明糖酵解和OXPHOS在EAC中緊密相連[48]。EAC中的TXNIP明顯低于正常食管。而且TXNIP的過度表達顯著降低了增殖、克隆發(fā)生和致瘤性,表明TXNIP在EACC起著腫瘤抑制作用。TXNIP過表達與增加的DNA損傷和細胞凋亡有關(guān),而敲除TXNIP對細胞凋亡有保護作用,TXNIP使EACC對順鉑敏感[49]。

        4 展望

        DNA損傷修復(fù)途徑影響食管癌的治療和耐藥性。目前晚期ESCC的治療以手術(shù)加圍手術(shù)期放化療為主,但化療耐藥是改善整體生存期的巨大挑戰(zhàn)和障礙,以順鉑為基礎(chǔ)的聯(lián)合化療仍是ESCC的重要治療手段。miR-26b可通過降低ATM的表達來干擾DNA損傷反應(yīng),E2F1增加了順鉑在ESCC中的化學致敏作用。mirin和NU7441可以通過DSB修復(fù)通路基因的擴增顯著提高ESCC細胞的放射敏感性,顯示了在ESCC治療中的潛在臨床應(yīng)用價值。抑制ROS可以預(yù)防GERD誘導的DNA損傷和致瘤性轉(zhuǎn)化是治療EAC可行策略。 DNA損傷修復(fù)的研究,有助于了解食管癌基因突變的機制、治療反應(yīng)和耐藥性的原因,為食管癌的研究和治療提供新的途徑。

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