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        醌氧化還原酶的異源表達及其在偶氮染料脫色方面的研究

        2021-11-19 03:07:28劉謙謙唐梓靜李天真李寶庫朱蕾蕾
        生物技術(shù)通報 2021年10期
        關(guān)鍵詞:介體偶氮染料剛果紅

        劉謙謙 唐梓靜 李天真 李寶庫 朱蕾蕾

        (1. 河北大學藥學院,保定 071002;2. 中國科學院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所 工業(yè)酶國家工程實驗室,天津 300308)

        隨著現(xiàn)代化工行業(yè)的發(fā)展,染料在紡織廠、印染廠和造紙廠中被廣泛使用[1]。今天大多使用的染料都是經(jīng)還原、氧化、縮合、硝化或者磺酸化等合成得到,通常含有復(fù)雜的芳香環(huán)結(jié)構(gòu)[2]。全球每年大約有8×105-9×105t不同的染料被生產(chǎn),并在紡織品、皮革、紙張、塑料、化妝品和食物染色中廣泛使用[3-4]。偶氮染料以一個或多個R1-N=N-R2鍵存在,其中偶氮染料在每年生產(chǎn)的染料中所占比例為60%-70%,是使用比較廣泛的一類染料[5-6]。大約有90%的染料進入污水處理場,存在未處理完全的染料排放到河流中,不僅污染水質(zhì),而且破壞光線的穿透等,對水體及周邊的生態(tài)系統(tǒng)造成危害,并威脅人類的生命健康[2,7]。利用安全、低成本的高效脫色微生物來處理染料廢水變得越來越受人們關(guān)注[8]。氧化還原酶類對染料分子有破壞作用,能夠達到脫色的效果。

        NAD(P)H∶醌氧化還原酶1(NAD(P)H∶quinone oxidoreductase,NQO1,EC 1.6.99.2)是一種黃素腺嘌呤二核苷酸(flavin adenine dinucleotide,F(xiàn)AD)依賴型蛋白,可以利用NAD(P)H作為輔因子催化包括醌類、醌亞胺類、硝基化合物和偶氮類染料等一系列底物的雙電子還原[9-11]。其還原反應(yīng)以乒乓機制進行,NAD(P)H和底物交替占據(jù)相同的結(jié)合位點的重疊區(qū)域,并參與雙氫離子的轉(zhuǎn)移,首先NAD(P)H進入活性位點還原FAD形成FADH2,然后底物進入活性位點被FADH2還原[12]。NQO1在抗氧化防御中發(fā)揮至關(guān)重要的作用,其通過還原內(nèi)源性醌類如維生素E、輔酶Q10產(chǎn)生穩(wěn)定的氫醌類化合物而發(fā)揮重要的抗氧化作用[13-14]。其次NQO1也是一個20S蛋白酶體相關(guān)的蛋白,其可以穩(wěn)定腫瘤抑制因子p53、p73,從而發(fā)揮抗腫瘤作用[15-16]。同時,NQO1還能激活醌類化療藥物,成為治療癌癥的潛在藥物靶點[17]。有報道稱,來自大腸桿菌(E. coli)的偶氮還原酶(AzoR)和來自渾球紅細菌(R. sphaeroides)的偶氮還原酶(AZR)能夠催化偶氮染料的還原,且同時具有醌還原酶活性。也有研究表明,添加醌類氧化還原介質(zhì),如2-羥基-1,4-萘 醌(2-hydroxy-1,4-naphthoquinone,HNQ)、 蒽醌-2-磺酸鹽(anthraquinone-2-sulfonate,AQS)、蒽醌 -2,6-二 磺 酸 鹽(anthraquinone-2,6-disulfonate,AQDS)能促進偶氮染料的還原[18-19]。Cui等[20]在有氧情況下利用E. coli CD-2的全細胞,在不添加氧化還原介質(zhì)條件下,只有8.5%甲基橙被脫色;而在甲萘醌存在的情況下,8 h時的脫色率達到40%以上。利用NQO1在體外進行偶氮染料的脫色研究較少。

        本研究將人來源的NAD(P)H∶醌氧化還原酶(hNQO1)在大腸桿菌中成功進行異源表達,并進行蛋白純化,考察hNQO1對3種偶氮染料剛果紅和莧菜紅及活性黑5的脫色研究,旨為偶氮染料的脫色及降解提供一種新的研究思路。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌 株 大 腸 桿 菌E.coli BL21 Gold(DE3)pET28a-hNQO1;大腸桿菌 E.coli BL21 Gold(DE3)pET28a均由所在實驗室保存。

        1.1.2 主要試劑和培養(yǎng)基 主要試劑:酵母粉(yeast extract),胰蛋白胨(tryptone)購自英國 OXOID公司;異丙基 -β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-β-dthiogalactoside,IPTG)購自天津樂寶生物科技有限公司;BCA蛋白質(zhì)濃度測定試劑盒購自上海生工生物工程股份有限公司;硫酸卡那霉素(kanamycin sulfate),甲萘醌(menadione)購自上海阿拉丁生化科技股份有限公司;剛果紅(Congo red)購自上海源葉生物公司;莧菜紅(amaranth)購自北京國納宸宇科技有限公司;活性黑5(reactive black 5)購自Sigma Aldrich;1,4-二羥基蒽醌(1,4-Dihydroxyanthracene-9,10-dion),甲基對苯醌(2-Methlcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione)購自上海畢得醫(yī)藥科技有限公司;1,4-萘醌(1,4-Naphthoquinone)購自上海邁瑞爾化學技術(shù)有限公司;蒽醌(anthraquinone)購自國藥集團化學試劑有限公司;蒽醌-2-磺酸鈉鹽(sodium anthraquinone-2-sulfonate)購自上海吉至生化科技有限公司。其他常規(guī)試劑均為國產(chǎn)分析純。

        LB培養(yǎng)基:10 g NaCl,5 g酵母粉,10 g胰蛋白胨,121℃ 20 min滅菌使用;固體培養(yǎng)基添加1.5%的瓊脂糖。

        1.1.3 主要儀器和設(shè)備 低溫高速離心機;移液槍;TeCan酶標儀;搖床;微孔板振蕩器;超聲破碎儀等。

        1.2 方法

        1.2.1 菌體培養(yǎng) 將E. coli pET28a-hNQO1劃線于LB固體平板(含50 μg/mL硫酸卡那霉素),挑單克隆接種于3 mL/管的LB培養(yǎng)基(含50 μg/mL硫酸卡那霉素)中,37℃,220 r/min過夜培養(yǎng)16-20 h。將種子液以1%接種量接種至100 mL LB液體培養(yǎng)基(含50 μg/mL 硫酸卡那霉素)中,37℃,220 r/min條件下培養(yǎng)至OD600為0.7-0.8,添加0.5 mmol/L IPTG,10℃,220 r/min,培養(yǎng)24 h誘導(dǎo)蛋白表達。4℃,4 000 r/min離心20 min,棄掉上清液收集菌體,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 蛋白純化 用磷酸鈉緩沖液(0.1 mol/L Na2HPO4-NaH2PO4,pH 6.2)重懸菌體,冰浴條件下超聲破碎細胞,12 000 r/min離心30 min,收集上清液并于0.22 μm濾膜過濾,使用Ni Sepharose 6 Fast Flow His標簽蛋白純化填料自填裝鎳柱純化。

        蛋白純化步驟:用5倍柱體積的去離子水沖洗Ni2+填充層析柱,再用5倍柱體積含有20 mmol/L咪唑的裂解緩沖液(150 mmol/L NaCl,50 mmol/L Hepes,pH 7.0)平衡Ni2+層析柱,隨即將過膜后的破碎上清加入層析柱中,使目的蛋白與層析柱充分結(jié)合;先用5倍柱體積含有20 mmol/L咪唑的裂解緩沖液(150 mmol/L NaCl,50 mmol/L Hepes,pH 7.0)進行洗脫雜蛋白,再用5倍柱體積含有50 mmol/L咪唑的洗雜緩沖液(150 mmol/L NaCl,50 mmol/L Hepes,pH 7.0)洗脫雜蛋白,最后用含有300 mmol/L咪唑的洗脫緩沖液(150 mmol/L NaCl,50 mmol/L Hepes,pH 7.0)洗脫目的蛋白得到hNQO1純酶。利用10 kD超濾管去除咪唑并濃縮置換磷酸鈉 緩 沖 液(0.1 mol/L Na2HPO4-NaH2PO4,pH 6.2),去除咪唑后,將hNQO1蛋白加入0.6 mmol/L FAD冰上孵育1 h,再使用超濾管置換緩沖溶液,并去掉表面游離的FAD,超濾結(jié)束后備用。

        1.2.3 hNQO1純化后的蛋白濃度測定 以牛血清白蛋白(bovine albumin,BSA)為標準蛋白,按照BCA蛋白濃度測定試劑盒說明書測定蛋白濃度。

        1.2.4 hNQO1熱穩(wěn)定的測定 用磷酸鈉緩沖液將hNQO1蛋白稀釋到0.165 mg/mL,取出50 μL hNQO1分別在30、35、40、50和60℃條件下加熱30 min,加熱完成后,冷卻到室溫,離心再分別加入100 μL 100 mmol/L pH 6.2磷酸鈉緩沖液,以及50 μL 4 mmol/L NADH,于波長340 nm處室溫下測定吸光度(反應(yīng)機理:hNQO1催化NADH→NAD+,在波長340 nm處檢測NADH的下降來進一步表征酶的活性)。以最高酶活為100%,計算相對酶活力。

        1.2.5 不同的介體小分子對剛果紅脫色影響的反應(yīng)體系 在200 μL反應(yīng)體系中分別加入0.07 mg/mL hNQO1純酶,0.5 mmol/L NADH、0.2 mmol/L剛果紅,0.05 mmol/L介體小分子(1,4-萘醌、蒽醌-2-磺酸鈉鹽、甲基對苯醌、1,4-二羥基蒽醌、蒽醌、甲萘醌),100 mmol/L pH6的Tris-HCl緩沖液。在30℃條件下反應(yīng)6 h,反應(yīng)0 h和6 h分別使用酶標儀在434 nm處檢測吸光度值。以0 h測得的吸光度值作為起始值,計算剛果紅的脫色率。

        1.2.6 不同濃度的1,4-二羥基蒽醌對剛果紅脫色影響的反應(yīng)體系 在300 μL反應(yīng)體系中分別加入0.075 U/mL hNQO1、0.5 mmol/L NADH、2 mmol/L剛果紅,不同濃度的1,4-二羥基蒽醌(0.02 mmol/L、0.05 mmol/L、0.1 mmol/L、0.15 mmol/L、0.2 mmol/L、0.5 mmol/L),100 mmol/L pH6的 Tris-HCl緩沖液。在30℃條件下反應(yīng)2 h,取反應(yīng)液20 μL加180 μL Tris-HCl緩沖液于96孔板中,使用酶標儀在434 nm處檢測吸光度值,計算剛果紅的脫色率。

        1.2.7 hNQO1全細胞對剛果紅脫色影響的反應(yīng)體系 在400 μL反應(yīng)體系中加入菌體密度(OD600)約為10的hNQO1全細胞或pET28a空載體全細胞,2 mmol/L剛果紅,0.1 mmol/L 1,4-二羥基蒽醌,0.1 mol/L的醋酸鈉作為反應(yīng)緩沖液。在40℃下反應(yīng)6 h,反應(yīng)完成后12 000 r/min離心2 min,取出200 μL在96孔板中使用酶標儀在434 nm下檢測吸光度值的變化。反應(yīng)結(jié)束檢測完后,去除上清溶液,加入相同濃度的上述各溶液,在同樣條件下進行第二和第三次反應(yīng)。

        1.2.8 hNQO1全細胞對莧菜紅脫色影響的反應(yīng)體系 在500 μL反應(yīng)體系中加入菌體密度(OD600)約為10的hNQO1全細胞或pET28a空載體全細胞,2 mmol/L莧菜紅,0.1 mmol/L 1,4-二羥基蒽醌,0.1 mol/L的醋酸鈉作為反應(yīng)緩沖液。在40℃下反應(yīng)6 h,反應(yīng)完成后12 000 r/min離心5 min,取出20 μL反應(yīng)液加180 μL 0.1 mol/L醋酸鈉緩沖液于96孔板中使用酶標儀在520 nm處檢測吸光度值的變化。

        1.2.9 hNQO1全細胞對活性黑5脫色影響的反應(yīng)體系 在500 μL反應(yīng)體系中加入菌體密度(OD600)約為10的hNQO1全細胞或pET28a空載體全細胞,2 mmol/L活性黑5,0.1 mmol/L 1,4-二羥基蒽醌,0.1 mol/L的醋酸鈉作為反應(yīng)緩沖液。在40℃下反應(yīng)6 h,反應(yīng)完成后12 000 r/min離心5 min,取出20 μL反應(yīng)液加180 μL 0.1 mol/L醋酸鈉緩沖液于96孔板中使用酶標儀在596 nm處檢測吸光度值的變化。

        1.2.10 hNQO1對剛果紅、莧菜紅、活性黑5等偶氮染料脫色率的計算 以不加菌體的吸光度值為起始值,觀察染料脫色的情況,根據(jù)下列公式計算脫色率。

        式中:R為染料脫色率(%);A0、A1為脫色反應(yīng)前后溶液的吸光度值。

        2 結(jié)果

        2.1 hNQO1的表達和純化

        對E. coli BL21(DE3)pET28a-hNQO1挑取單克隆,進行誘導(dǎo)表達后,利用SDS-PAGE檢測hNQO1蛋白的表達情況。結(jié)果如圖1-A所示,在全細胞和破碎上清液中均含有目的蛋白條帶,說明hNQO1經(jīng)IPTG誘導(dǎo)后,在E.coli BL21(DE3)中能夠大量地表達,蛋白質(zhì)實際分子量約為30.8 kD。采用鎳柱親和層析純化hNQO1蛋白,其SDS-PAGE結(jié)果如圖1-B所示,純酶樣品在35 kD-25 kD處出現(xiàn)明顯條帶,與理論分子質(zhì)量30.8 kD結(jié)果相一致。

        圖1 異源表達 hNQO1 的 SDS-PAGEFig.1 SDS-PAGE of hNQO1 heterologously expressed

        2.2 hNQO1熱穩(wěn)定的測定

        將hNQO1在一系列溫度下(30、35、40、50和60℃)加熱30 min后,進行殘余酶活測定,結(jié)果如圖2所示,在30-40℃內(nèi),hNQO1較穩(wěn)定,進一步升高溫度,其酶活迅速下降。所以,后續(xù)實驗在30℃或40℃條件下進行。

        圖2 熱穩(wěn)定性對酶活力的影響Fig. 2 Influence of thermal stability on enzyme activity

        2.3 偶氮染料及醌類小分子化合物的選擇

        為研究hNQO1對偶氮染料的脫色作用,選擇了剛果紅、莧菜紅及活性黑5等偶氮染料進行脫色研究(表1)。以醌類小分子化合物(表2)作為介體,輔助醌氧化還原酶對偶氮染料的脫色。介體小分子可以加速初級電子供體向終極電子受體傳遞,在偶氮染料的脫色過程中起到橋梁作用。具體作用機理為:醌類小分子化合物通過醌還原酶還原成氫醌,氫醌在經(jīng)過純化學作用使偶氮染料還原,實現(xiàn)偶氮化合物的脫色。

        表1 染料名稱及其最大吸收波長Table 1 Dye names and their maximum absorption wavelengths

        表2 小分子介體的名稱及結(jié)構(gòu)Table 2 Names and structures of small molecular mediators

        2.4 不同的小分子對hNQO1純酶脫色剛果紅的影響

        首先選擇0.05 mmol/L為介體小分子(1,4-萘醌、蒽醌-2-磺酸鈉鹽、甲基對苯醌、1,4-二羥基蒽醌、蒽醌、甲萘醌)在反應(yīng)體系中的濃度。在反應(yīng)體系中,分別添加0.05 mmol/L的上述不同的介體小分子,分別以加酶與不加酶作為對照,在30℃條件下反應(yīng)6 h后,使用酶標儀在434 nm處檢測吸光度的變化,記錄在不同介體小分子下,hNQO1對剛果紅染料的脫色情況(圖3)。介體小分子為1,4-二羥基蒽醌時,hNQO1(0.07 mg/mL)對剛果紅脫色率為35.5%。所以,與其它介體小分子相比,1,4-二羥基蒽醌輔助hNQO1使剛果紅染料脫色效果較好。

        圖3 不同介體小分子對hNQO1脫色剛果紅影響Fig. 3 Influence of different medium small molecules on the decolorization of hNQO1 Congo red

        2.5 不同濃度的1 4-二羥基蒽醌對hNQO1純酶脫色剛果紅的影響

        在上述5種介體小分子對hNQO1脫色剛果紅染料的影響中,選擇以1,4-二羥基蒽醌為目標在反應(yīng)體系中測試其不同濃度(0.02 mmol/L、0.05 mmol/L、0.1 mmol/L、0.15 mmol/L、0.2 mmol/L、0.5 mmol/L) 對脫色率的影響,在30℃條件下反應(yīng)2 h,使用酶標儀在434 nm處檢測吸光度的變化。如圖4所示,介體小分子1,4-二羥基蒽醌在0.1 mmol/L時,hNQO1對剛果紅脫色率為29.2%,脫色效果較好,隨著小分子濃度的增加可能會存在析出,脫色率差別不大。因此,選擇0.1 mmol/L 1,4-二羥基蒽醌進行后續(xù)試驗。

        2.6 重復(fù)利用hNQO1全細胞對剛果紅進行脫色的研究

        經(jīng)過上述的研究,成功篩選出最佳的介體小分子—1,4-二羥基蒽醌。在1,4-二羥基蒽醌小分子的存在下,pET28a全細胞作為對照,與hNQO1全細胞分別對剛果紅進行脫色,我們首先選擇了菌體密度(OD600)為2、2.5和10進行剛果紅脫色,在434 nm處檢測吸光度,相比較菌體密度為10條件下最好(數(shù)據(jù)未顯示)。所以,我們進一步嘗試在1,4-二羥基蒽醌存在的反應(yīng)體系中重復(fù)多次利用hNQO1全細胞(菌體密度為10)對偶氮染料進行脫色。如圖5所示,在40℃反應(yīng)6 h后,hNQO1全細胞對剛果紅的脫色率為94.0%,而pET28a全細胞對剛果紅的脫色率為62.6%。第一次反應(yīng)結(jié)束后,離心去除上清液,二次加入剛果紅及介體小分子進行脫色,再次在40℃下反應(yīng)6 h發(fā)現(xiàn),pET28a全細胞對剛果紅的脫色率只有9.5%,而hNQO1全細胞對剛果紅的脫色率為79.7%。第三次加入剛果紅進行脫色,40℃條件下反應(yīng)6 h后,發(fā)現(xiàn)pET28a全細胞對剛果紅的脫色率為5.1%,hNQO1全細胞對剛果紅的脫色率為20.3%。菌體3次利用的結(jié)果顯示,hNQO1全細胞對剛果紅的脫色效果較好。

        圖5 重復(fù)利用hNQO1全細胞對剛果紅染料脫色的研究Fig. 5 Decolorization of Congo red dye by reusing whole cells of hNQO1

        2.7 hNQO1對莧菜紅及活性黑5進行脫色的研究

        為進一步探究hNQO1對偶氮類染料的脫色效果,選擇了其他兩種染料:莧菜紅、活性黑5進行脫色實驗。如圖6所示,在1,4-二羥基蒽醌小分子的存在下,pET28a全細胞作為對照,與hNQO1全細胞(菌體密度為10)分別對莧菜紅、活性黑5進行脫色,在40℃反應(yīng)6 h后,hNQO1全細胞對莧菜紅染料的脫色率為18.8%,對活性黑5染料的脫色率為16.4%。

        圖6 hNQO1全細胞對莧菜紅、活性黑5等兩種偶氮染料的脫色Fig. 6 Decolorization of two azo dyes such as amaranth and reactive black 5 by whole cells of hNQO1

        3 討論

        偶氮染料因分子結(jié)構(gòu)含有一個或多個R1-N=N-R2鍵而命名,因其復(fù)雜的結(jié)構(gòu),很難利用傳統(tǒng)的污水處理系統(tǒng)去降解,本研究利用NAD(P)H∶醌氧化還原酶對3種偶氮類染料(剛果紅、莧菜紅和活性黑5)進行脫色實驗,測試不同介體小分子對脫色的影響,選出最佳介體小分子1,4-二羥基蒽醌。hNQO1全細胞對偶氮染料剛果紅的脫色率最高為94.0%,且全細胞多次利用后仍存在20.3%的脫色效果。此外,初步探索了hNQO1對莧菜紅、活性黑5的脫色,為偶氮類染料的脫色降解提供了一種新的思路。Hong等[21]利用AQS和ADQS作為氧化還原介體考察了Shewanella decolorationis S12對莧菜紅的脫色,在8 h后脫色率75%左右。Rahman等[22]利用假單胞菌Pseudomonas euroginosa在好氧情況下對剛果紅染料進行脫色,在pH 9,溫度為26℃的情況下,反應(yīng)5 d脫色率達87.64%。上述研究分別對偶氮染料莧菜紅及剛果紅進行了脫色研究發(fā)現(xiàn),文獻中所提到的對剛果紅進行的脫色,反應(yīng)5 d脫色率達87.64%,與本文中對剛果紅的脫色率有所差別,本研究通過反應(yīng)體系的優(yōu)化最終實現(xiàn)hNQO1全細胞對剛果紅最高為94.0%的脫色率,且hNQO1具有較好的穩(wěn)定性,其全細胞多次利用后對剛果紅仍有20.3%的脫色效果。

        周覓等[5]在考察E.coli JM109和E.coli YB全細胞對莧菜紅的脫色時,48 h脫色率為12%。Wang等[23]在一家紡織廠周圍的土壤樣品中分離得到Bacillus sp. YZU1菌株(具有偶氮還原酶特性)對多種活性染料具有較強脫色能力(包括偶氮染料),在40℃,pH 7.0條件下對活性黑5的脫色效果最佳。本研究初步探索了在1,4-二羥基蒽醌存在下,反應(yīng)6 h后,hNQO1全細胞對莧菜紅染料的脫色為18.8%,對活性黑5的脫色率為16.4%。一方面后續(xù)通過對反應(yīng)體系的優(yōu)化,希望能夠進一步提高其脫色率;另一方面,與剛果紅脫色相比,hNQO1對莧菜紅、活性黑5的脫色效果不是十分明顯,原因可能是莧菜紅、活性黑5與剛果紅在結(jié)構(gòu)方面有差異,莧菜紅、活性黑5等偶氮染料的脫色與苯環(huán)上的取代基的性質(zhì)、位置、數(shù)量有關(guān),甲氧基、磺酸基、硝基、甲基和羧基等基團的存在可能會使染料分子更難脫色[1],同時,高極性取代的磺化偶氮染料較難進入胞內(nèi)被還原[24]。

        4 結(jié)論

        本研究成功將hNQO1在大腸桿菌中異源表達,并進行蛋白純化,通過對酶的熱穩(wěn)定性分析發(fā)現(xiàn),其在30-40℃范圍內(nèi)穩(wěn)定性很好。篩選了6種不同的介體小分子對hNOQ1脫色剛果紅的影響發(fā)現(xiàn),1,4-二羥基蒽醌具有最佳的輔助hNQO1對偶氮染料剛果紅的脫色效果,hNQO1對偶氮染料莧菜紅及活性黑5有微弱的脫色作用。

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